| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 3,571,720:1 | +G | 7.5% | coding (706/867 nt) | yneJ → | LysR family DNA‑binding transcriptional regulator |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 3,571,720 | 1 | . | G | 7.5% | 255.8 / 15.4 | 67 | coding (706/867 nt) | yneJ | LysR family DNA‑binding transcriptional regulator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (28/34); new base G (3/2); total (31/36) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.56e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.58e-01 | |||||||||||
ACGCCTTCCGCGCCAACTGTTCATACCGCCATCACTTCGAAAACTGGTTCGTGCAGGACCAGGCGGTACCGGGCAAGATTCACGAAATGGAGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGC‑GCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAGCACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGACTTCCGCTATCTGAAAACCTGGCTGGTATGGCGACGAGGTACGGTCTCGCGCAGTTTGAGCATGTTCGTGAAGTTGCTTGAAGAAGG > NC_002947/3571571‑3571868 | aCGCCTTCCGCGCCAACTGTTCATACCGCCATCACTTCGAAAACTGGTTCGTGCAGGACCAGGCGGTACCGGGCAAGATTCACGAAATGGAGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCcgc > 2:1977786/1‑150 (MQ=255) gCCTTCCGCGCCAACTGTTCATACCGCCATCACTTCGAAAACTGGTTCGTGCAGGACCAGGCGGTACCGGGCAAGATTCACGAAATGGAGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCgc‑gc < 1:267765/150‑1 (MQ=255) gCCTTCCGCGCCAACTGTTCATACCGCCATCACTTCGAAAACTGGTTCGTGCAGGACCAGGCGGTACCGGGCAAGATTCACGAAATGGAGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCgc‑gc > 2:267765/1‑150 (MQ=255) tCCGCGCCAACTGTTCATACCGCCATCACTTCGAAAACTGGTTCGTGCAGGACCAGGCGGTACCGGGCAAGATTCACGAAATGGAGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGC‑gcagcc > 2:992427/1‑149 (MQ=255) cgcgCCAACTGTTCATACCGCCATCACTTCGAAAACTGGTTCGTGCAGGACCAGGCGGTACCGGGCAAGATTCACGAAATGGAGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCGCG‑GCAGCATg < 1:720099/150‑1 (MQ=255) gcgcCAACTGTTCATACCGCCATCACTTCGAAAACTGGTTCGTGCAGGACCAGGCGGTACCGGGCAAGATTCACGAAATGGAGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGC‑GCAGCATGc > 1:263285/1‑150 (MQ=255) ttCATACCGCCATCACTTCGAAAACTGGTTCGTGCAGGACCAGGCGGTACCGGGCAAGATTCACGAAATGGAGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGC‑GCAGCATGCTCGACAatat < 2:1419850/150‑1 (MQ=255) cATCACTTCGAAAACTGGTTCGTGCAGGACCAGGCGGTACCGGGCAAGATTCACGAAATGGAGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTTGGTGCAGTTGCTGGCCTGGCCATGCTGCCGC‑GCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTgc < 2:809925/150‑1 (MQ=255) cATCACTTCGAAAACTGGTTCGTGCAGGACCAGGCGGTACCGGGCAAGATTCACGAAATGGAGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGC‑GCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTgc < 2:428351/150‑1 (MQ=255) aTCACTTCGAAAACTGGTTCGTGCAGGACCAGGCGGTACCGGGCAAGATTCACGAAATGGAGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGC‑GCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGTTgca < 2:221450/150‑1 (MQ=255) tCACTTCGAAAACTGGTTCGTGCAGGACCAGGCGGTACCGGGCAAGATTCACGAAATGGAGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGC‑GCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTgcag > 2:1949248/1‑150 (MQ=255) ttCGAAAACTGGTTCGTGCAGGACCAGGCGGTACCGGGCAAGATTCACGAAATGGAGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTG‑CGCGGCAGCATg < 1:1610456/123‑1 (MQ=255) ttCGAAAACTGGTTCGTGCAGGACCAGGCGGTACCGGGCAAGATTCACGAAATGGAGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTG‑CGCGGCAGCATg > 2:1610456/1‑123 (MQ=255) aaaaCTGGTTCGTGCAGGACCAGGCGGTACCGGGCAAGATTCACGAAATGGAGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGC‑GCAGCATGCTCGa > 1:1514733/1‑124 (MQ=255) aaaaCTGGTTCGTGCAGGACCAGGCGGTACCGGGCAAGATTCACGAAATGGAGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGC‑GCAGCATGCTCGa < 2:1514733/124‑1 (MQ=255) gTTCGTGCAGGACCAGGCGGTACCGGGCAAGATTCACGAAATGGAGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGC‑GCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAGCACCGTCAGCGCCTg > 1:2024956/1‑150 (MQ=255) tCGTGCAGGACCAGGCGGTACCGGGCAAGATTCACGAAATGGAGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGC‑GCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAGCACCGTCAGCGCCTGGc > 1:1219543/1‑150 (MQ=255) tGCAGGACCAGGCGGTACCGGGCAAGATTCACGAAATGGAGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGTGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGC‑GCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAGCACCGTCAGCGCCTGGCCaa < 1:865318/150‑1 (MQ=255) gCAGGACCAGGCGGTACCGGGCAAGATTCACGAAATGGAGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGC‑GCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAGCACCGTCAGCGCCTGGCCAAt < 1:1442567/150‑1 (MQ=255) gACCAGGCGGTACCGGGCAAGATTCACGAAATGGAGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGC‑GCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAGCACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCg > 1:2386172/1‑150 (MQ=255) ccAGGCGGTACCGGGCAAGATTCACGAAATGGAGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGC‑GCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAGCACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCgga > 1:340771/1‑150 (MQ=255) ccAGGCGGTACCGGGCAAGATTCACGAAATGGAGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGC‑GCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAGCACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCgga < 2:340771/150‑1 (MQ=255) aGGCGGTACCGGGCAAGATTCACGAAATGGAGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGC‑GCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAGCACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCgga < 1:1711474/148‑1 (MQ=255) aGGCGGTACCGGGCAAGATTCACGAAATGGAGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGC‑GCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAGCACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCgga > 2:1711474/1‑148 (MQ=255) ggCGGTACCGGGCAAGATTCACGAAATGGAGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGC‑GCAGCATGCTCGa < 1:53605/102‑1 (MQ=255) ggCGGTACCGGGCAAGATTCACGAAATGGAGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGC‑GCAGCATGCTCGa > 2:53605/1‑102 (MQ=255) tACCGGGCAAGATTCACGAAATGGAGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGC‑GCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAGCACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGACTTcc < 1:313120/150‑1 (MQ=255) gggCAAGATTCACGAAATGGAGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGC‑GCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAGCACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGACTTCCGCTa > 1:2237147/1‑150 (MQ=255) ggCAAGATTCACGAAATGGAGTCGTACCACGGCATGTTGGCATCCGTAACTAGAGGCGCCATCCTGGCCATGCGGCCGC‑GCAGCATGCTCGACAAGATGCCCGGGTGCAGCACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGACTTCCGCTAt > 1:648073/1‑150 (MQ=255) gCAAGATTCACGAAATGGAGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGC‑GCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAGCACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGACTTCCGCTATc < 2:1459625/150‑1 (MQ=255) gATTCACGAAATGGAGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGC‑GCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAGCACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGACTTCCGCTATCTGaa > 1:1322539/1‑150 (MQ=255) tCACGAAATGGAGTCGTACCACGGGATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGC‑GCATCATGCTCGACAATATGCCCGGGt < 2:1185941/98‑1 (MQ=255) tCACGAAATGGAGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGC‑GCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGt > 1:1185941/1‑98 (MQ=255) aCGAAATGGAGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGGCATGCTGCGCG‑GCAGCATggcca < 1:573342/81‑5 (MQ=37) aCGAAATGGAGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGGCATGCTG‑CGCGGCAGCATggcca > 2:573342/1‑77 (MQ=37) gAAATGGAGTCGTACCACGGCCTGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGC‑GCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAGCACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGACTTCCGCTATCTGAAAACctgg < 1:1820481/150‑1 (MQ=255) gAAATGGAGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGC‑GCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAGCACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGACTTCCGCTATCTGAAAACctgg < 2:495549/150‑1 (MQ=255) tGGAGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGC‑GCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAGCACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGACTTCCGCTATCTGAAAACctggctgg < 1:1538995/150‑1 (MQ=255) tCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGC‑GCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAGCACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGACTTCCGCTATCTGAAAACCTGGCTGGTATgg > 1:152590/1‑150 (MQ=255) cGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGC‑GCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAGCACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGACTTCCGCTATCTGAAAACCTGGCTGGTATGGc < 2:2237147/150‑1 (MQ=255) gTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGC‑GCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAGCACCGTCAGCGCATGGCCAATGTCGGAGGACGTCCGCTATCTGAAAACCTGGCTGGTATGGcg > 2:1249288/1‑150 (MQ=255) tACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGC‑GCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAGCACCGTCAGCGCCTg < 1:774776/101‑1 (MQ=255) tACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGC‑GCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAGCACCGTCAGCGCCTg > 2:774776/1‑101 (MQ=255) cACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGC‑GCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAGCACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGACTTCCGCTATCTGAAAACCTGGCTGGTATGGcgacga > 1:965789/1‑150 (MQ=255) cACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGC‑GCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAGCACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGACTTCCGCTATCTGAAAACCTGGCTGGTATGGcgacga > 1:1626954/1‑150 (MQ=255) aCGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGC‑GCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAGCACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGACTTCCGCTATCTGAAAACCTGGCTGGTATGGCGACGAg < 1:37677/150‑1 (MQ=255) ggCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGC‑GCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAGCACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGACTTCCGCTATCTGAAAACCTGGCTGGTATGGCGACGAGGt < 2:2024956/150‑1 (MQ=255) cATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGC‑GCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAGCACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGACTTCCGCTATCTGAAAACCTGGCTGGTATGGCGACGAGGTAc < 2:965789/150‑1 (MQ=255) aTGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGC‑GACGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAGCACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGACTTCCGCTATCTGAAAACCTGGCTGGTATGGCGACGAGGTACg < 1:1968304/150‑1 (MQ=255) tGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGC‑GCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAGCACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGACTTCCGCTATCTGAAAACCTGGCTGGTATGGCGACGAGGTACgg < 2:1626954/150‑1 (MQ=255) gCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGC‑GCAGCATGCTCGACAatat > 2:1358764/1‑59 (MQ=255) gCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGC‑GCAGCATGCTCGACAatat < 1:1358764/59‑1 (MQ=255) cTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGC‑GCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAGCACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGACTTCCGCTATCTGAAAACCTGGCTGGTATGGCGACGAGGTACGGTCTcgcg > 1:1518229/1‑150 (MQ=255) cAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGC‑GCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAGCACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGACTTCCGCTATCTGAAAACCTGGCTGGTATGGCGACGAGGTAc < 1:1289788/135‑1 (MQ=255) cAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGC‑GCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAGCACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGACTTCCGCTATCTGAAAACCTGGCTGGTATGGCGACGAGGTAc > 2:1289788/1‑135 (MQ=255) gTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGC‑GCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAGCACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGACTTCCGCTATCTGaa > 2:869394/1‑106 (MQ=255) gTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGC‑GCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAGCACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGACTTCCGCTATCTGaa < 1:869394/106‑1 (MQ=255) gggTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGC‑GCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAGCACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGACTTCCGCTATCTGAAAACCTGGCTGGTATGGCGACGAGGTACGGTCTCGCGCAGTTTGANCAt < 2:1518229/150‑1 (MQ=255) ggTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGC‑GCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAGCACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGACTTCCGCTATCTGAAAACCTGGCTGGTATgg > 1:1067712/1‑117 (MQ=255) ggTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGC‑GCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAGCACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGACTTCCGCTATCTGAAAACCTGGCTGGTATgg < 2:1067712/117‑1 (MQ=255) gCCGGCCTGGCCATGCTGCCGC‑GCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAGCACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGACTTCCGCTATCTGAAAACCTGGCTGGTATGGCGACGAGGTACGGTCTCGCGCAGTTTGAGCATGTTc < 1:1977786/150‑1 (MQ=255) gCCTGGCCATGCTGCCGC‑GCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAGCACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGACTTCCGCTATCTGAAAACCTGGCTGGTATGGCGACGAGGTACGGTCTCGCGCAGTTTGAGCATGTTCGTGa < 1:992427/150‑1 (MQ=255) ccTGGCCATGCTGCCGC‑GCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAGCACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGACTTCCGCTATCTGAAAACCTGGCTGGTATGGCGACGAGGTACGGTCTCGCGCAGTTTGAGCATGTTCGTGaa > 1:822093/1‑150 (MQ=255) cTGGCCATGCTGCCGC‑GCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAGCACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGACTTCCGCTATCTGAAAACCTGGCTGGTATGGCGACGAGGTACGGTCTCGCGCAGTTTGAGCATGTTCGTGAAg > 2:119654/1‑150 (MQ=255) cTGGCCATGCTGCCGC‑GCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAGCACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGACTTCCGCTATCTGAAAACCTGGCTGGTATGGCGACGAGGTACGGTCTCGCGCAGTGTGAGCATGTTCGTGAAg > 1:213173/1‑150 (MQ=255) cATGCTG‑CGCGGCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAGCACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGACTTCCGCTATCTGAAAACCTGGCTGGTATGGCGACGAGGTACGGTCTCGCGCAGTTTGAGCATGTTCGTGAAGTTGCt < 1:1366338/150‑1 (MQ=255) cATGCTG‑CGCGGCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAGCACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGACTTCCGCTATCTGAAAACCTGGCTGGTATGGCGACGAGGTACGGTCTCGCGCAGTTTGAGCATGTTCGTGAAGTTGCt > 2:1366338/1‑150 (MQ=255) aTGCTGCCGC‑GCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAGCACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGACTTCCGCTATCTGAAAACCTGGCTGGTATGGCGACGAGGTACGGTCTCGCGCAGTTTGAGCATGTTCGTGAAGTTGCtt > 1:1201583/1‑150 (MQ=255) tgctgcCGC‑GCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAGCACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGACTTCCGCTATCTGAAAACCTGGCTGGTATGGCGACGAGGTACGGTCTCGCGCAGTTTGAGCATGTTCGTGAAGTTGCTTg > 2:101957/1‑150 (MQ=255) ccGC‑GCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAGCACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGACTTCCGCTATCTGAAAACCTGGCTGGTATGGCGACGAGGTACGGTCTCGCGCAGTTTGAGCATGTTCGTGAAGTTGCTTgaagaa < 2:1201583/150‑1 (MQ=255) ccGC‑CCAGCATGATCTACAATAGGCTCGGGTGCAGCACCTTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGACTTCCGCTATCTGAAAACCTGTCTGGTATGGCGACGAGGTACGGTCTCGCGCAGTTTGAGCATGTTCGTGAAGTTGCTTgaagaa < 2:1322539/150‑1 (MQ=255) gc‑gcAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAGCACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGACTTCCGCTATCTGAAAACCTGGCTGGTATGGCGACGAGGTACGGTCTCGCGCAGTTTGAg < 1:1387494/123‑1 (MQ=255) gc‑gcAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAGCACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGACTTCCGCTATCTGAAAACCTGGCTGGTATGGCGACGAGGTACGGTCTCGCGCAGTTTGAg > 2:1387494/1‑123 (MQ=255) gc‑gcAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAGCACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGACTTCCGCTATCTGAAAACCTGGCTGGTATGGCGACGAGGTACGGTCTCGCGCAGTTTGAGCATGTTCGTGAAGTTGCTTGAAGAAgg > 1:276947/1‑150 (MQ=255) | ACGCCTTCCGCGCCAACTGTTCATACCGCCATCACTTCGAAAACTGGTTCGTGCAGGACCAGGCGGTACCGGGCAAGATTCACGAAATGGAGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGC‑GCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAGCACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGACTTCCGCTATCTGAAAACCTGGCTGGTATGGCGACGAGGTACGGTCTCGCGCAGTTTGAGCATGTTCGTGAAGTTGCTTGAAGAAGG > NC_002947/3571571‑3571868 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |