| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 3,610,309:1 | +C | 7.0% | intergenic (‑34/+22) | PP_3183 ← / ← mcoA | SCO1/SenC family protein/Mn(II) copper oxidase A |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 3,610,309 | 1 | . | C | 7.0% | 339.1 / 19.0 | 86 | intergenic (‑34/+22) | PP_3183/mcoA | SCO1/SenC family protein/Mn(II) copper oxidase A |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (41/39); new base C (3/3); total (44/42) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.33e-01 | |||||||||||
CCCCCAGGGAGAGGCCGCTGCTTCGGCCACCGTTCGTTGGGGTTGCAACGGCCAGAACGGAATGCTGGCGGCGAACAACGCCAGTACCAGCAGGAATCGCCATGAGCCGGGCATGATGCGGTCCTCGTGGGTTGGCTGATGGGGGCCG‑CATGGCGGCCCCGCTTTGCACTCACTTGTATGTGACTGGCGCTGTCACCGTCTGGCCCAGCGTCGATTTCACCGTGACCGTCGCTGGCGTGGCCGGGCCAAAGCCGGTGGTGGTCACCGCTACCCGCCAACGGGCCCCCGTAGTCGTGG > NC_002947/3610162‑3610458 | cccgcAGGGAAAGGCCGCTGATTCGGCCACCGTACGGTGGGGTTGCAACTGGGAGTACGGAATGCTGGCGGCGAACAACGCCAGTACCAGCAGGAATGACCATGAGCCGCACAGAATGCAGTCCTCGTGGGGTGGCTGATGGGGGCCG‑Ca > 2:522030/1‑150 (MQ=255)cccccAGGGAGAGGCCGCTGCTTCGGCCACCGTTCGTTGGGGTTGCAACGGCCAGAACGGAATGCTGGCGGCGAACAACGCCAGTACCAGCAGGAATCGCCATGAGCCGGGCATGATGCGGTCCTCGTGGGTTGGCTGATGGGGGCCG‑Ca > 1:270848/1‑150 (MQ=255) ccAGGGAGAGGCCGCTGCTTCGGCCACCGTTCGTTGGGGTTGCAACGGCCAGAACGGAATGCTGGCGGCGAACAACGCCAGTACCAGCAGGAATCGCCATGAGCCGGGCATGATGCGGTCCTCGTGGGTTGGCTGATGGGGGCCG‑CATgg > 1:2307764/1‑150 (MQ=255) cAGGGAGAGGCCGCTGCTTCGGCCACCGTTCGTTGGGGTTGCAACGGCCAGAACGGAATGCTGGCGGCGAACAACGCCAGTACCAGCAGGAATCGCCATGAGCCGGGCATGATGCGGTCCTCGTGGGTTGGCTGATGGGGGCCG‑CATggc < 1:904502/150‑1 (MQ=255) gagaGGCCGCTGCTTCGGCCACCGTTCGTTGGGGTTGCAACGGCCAGAACGGAATGCTGGCGGCGAACAACCACAGTACCAGCAGGAATCGCGATGCGCCAAGAGAGAGGCGGTGCTCGTGGGTTGGCTGATGTGGGCCG‑CATGGCGGcc > 1:1984582/1‑150 (MQ=255) gagGCCGCTGCTTCGGCCACCGTTCGTTGGGGTTGCAACGGCCAGAACGGAATGCTGGCGGCGAACAACGCCAGTACCAGCAGGAATCGCCATGAGCCGGGCATGATGCGGTCCTCGTGGGTTGGCTGATGGGGGCCGCCAT‑GCGGcccc < 1:2040623/150‑1 (MQ=255) agGCCGCTGCTTCGGCCACCGTTCGTTGGGGTTGCAACGGCCAGAACGGAATGCTGGCGGCGAACAACGCCAGTACCAGCAGGAATCGCCATGAGCCGGGCATGATGCGGTCCTCGTGGGTTGGCTGATGGGGGCCGCCAT‑GCGGccccc < 1:320088/150‑2 (MQ=255) gCCGCTGCTTCGGCCACCGTTCGTTGGGGTTGCAACGGCCAGAACGGAATGCTGGCGGCGAACAACGCCAGTACCAGCAGGAATCGCCATGAGCCGGGCATGATGCGGTCCTCGTGGGTTGGCTGATGGGGGCCG‑CATGGCGGCCCCGCt > 2:2159667/1‑150 (MQ=255) ccGCTGCTTCGGCCACCGTTCGTTGGGGTTGCAACGGCCAGAACGGAATGCTGGCGGCGAACAACGCCAGTACCAGCAGGAATCGCCATGAGCCGGGCATGATGCGGTCCTCGTGGGTTGGCTGATGGGGGCCG‑CATGGCGGCCCCGCtt < 2:1584042/150‑1 (MQ=255) cGCTGCTTCGGCCACCGTTCGTTGGGGTTGCAACGGCCAGAACGGAATGCTGGCGGCGAACAACGCCAGTACCAGCAGGAATCGCCATGAGCCGGGCATGATGCGGTCCTCGTGGGTTGGCTGATGGGGGCCG‑CATGGCGGCCCCGCttt < 1:673578/150‑1 (MQ=255) gctgctTCGGCCACCGTTCGTTGGGGTTGCAACGGCCAGAACGGAATGCTGGCGGCGAACAACGCCAGTACCAGCAGGAATCGCCATGAGCCGGGCATGATGCGGTCCTCGTGGGTTGGCTGATGGGGGCCG‑CATGGCGGCCCCGCTTTg > 2:1389463/1‑150 (MQ=255) ctgctTCGGCCACCGTTCGTTGGGGTTGCAACGGCCAGAACGGAATGCTGGCGGCGAACAACGCCAGTACCAGCAGGAATCGCCATGAGCCGGGCATGATGCGGTCCTCGTGGGTTGGCTGATGGGGGCCG‑CATGGCGGCCCCGCttt > 1:1257468/1‑148 (MQ=255) ctgctTCGGCCACCGTTCGTTGGGGTTGCAACGGCCAGAACGGAATGCCGGCGGCGAACAACGCCAGTACCAGCAGGAATCGCCATGAGCCCGGCATGATGCGGTCCTCGTGGGTTGGCTGATGGGGGCCG‑CATGGCGGCCCCGCttt < 2:1257468/148‑1 (MQ=255) gctTCGGCCACCGTTCGTTGGGGTTGCAACGGCCAGAACGGAATGCTGGCGGCGAACAACGCCAGTACCAGCAGGAATCGCCATGAGCCGGGCATGATGCGGTCCTCGTGGGTTGGCTGATGGGGGCCG‑CATGGCGGCCCCGCTTTGcac > 1:134257/1‑150 (MQ=255) gctTCGGCCACCGGTCGTTGGGGTTGCAACGGCCAGAACGGAATGCTGGCGGCGAACAACGCCAGTACCAGCAGGAAGCGCTATGAGCCGTGCATGATGCGGTCCTCGTGGGTTGGCTGATGGGGGCCG‑CATGGGGGGCCCGCTTTGcac < 2:953403/150‑1 (MQ=255) cACCGTTCGTTGGGGTTGCAACGGCCAGAACGGAATGCTGGCGGCGAACAACGCCAGTACCAGCAGGAATCGCCATGAGCCGGGCATGATGCGGTCCTCGTGGGTTGGCTGATGGGGGCCGCCAT‑GCGGcccccatca < 2:1517726/138‑6 (MQ=255) cACCGTTCGTTGGGGTTGCAACGGCCAGAACGGAATGCTGGCGGCGAACAACGCCAGTACCAGCAGGAATCGCCATGAGCCGGGCATGATGCGGTCCTCGTGGGTTGGCTGATGGGGGCCGCCAT‑GCGGcccccatca > 1:1517726/1‑133 (MQ=255) cACCGTTCGTTGGGGTTGCAACGGCCAGAACGGAATGCTGGCGGCGAACAACGCCAGTACCAGCAGGAATCGCCATGAGCCGGGCATGATGCGGTCCTCGTGGGTTGGCTGATGGGGGCCG‑CATGGCGGCCCCGCTTTGCACTCACTTGt > 1:341967/1‑150 (MQ=255) ccGTTCGTTGGGGTTGCAACGGCCAGAACGGAATGCTGGCGGCGAACAACGCCAGTACCAGCAGGAATCGCCATGAGCCGGGCATGATGCGGTCCTCGTGGGTTGGCTGATGGGGGCCG‑CATGGCGGCCCCGCTTTGCACTCACTTGTAt < 2:2307764/150‑1 (MQ=255) ccGTTCGTTGGGGTTGCAACGGCCAGAACGGAATGCTGGCGGCGAACAACGCCAGTACCAGCAGGAATCGCCATGAGCCGGGCATGATGCGGTCCTCGTGGGTTGGCTGATGGGGGCCG‑CATGGCGGCCCCGCTTTGCACTCACTTGTAt < 2:134257/150‑1 (MQ=255) ttcgttGGGGTTGCAACGGCCAGAACGGAATGCTGGCGGCGAACAACGCCAGTACCAGCAGGAATCGCCATGAGCCGGGCATGATGCGGTCCTCGTGGGTTGGCTGATGGGGGCCG‑CATGGCGGCACAGCTTTGCAGTTACTTGTAtgtg > 2:733893/1‑150 (MQ=255) ttGGGGTTGCAACGGCCAGAACGGAATGCTGGCGGCGAACAACGCCAGTACCAGCAGGAATCGCCATGAGCCGGGCATGATGCGGTCCTCGTGGGTTGGCTGATGGGGGCCG‑CATGGCGGCCCCGCTTTGCACTCACTTGTATGTGACTg < 2:341967/150‑1 (MQ=255) ttGGGGTTGCAACGGCCAGAACGGAATGCTGGCGGCGAACAACGCCAGTACCAGCAGGAATCGCCATGAGCCGGGCATGATGCGGTCCTCGTGGGTTGGCTGATGGGGGCCG‑CATGGCGAGGGCTTTGTGCACTCACTTGTATGTGACTg > 1:603007/1‑150 (MQ=255) ttGGGGTTGCAACGGCCAGAACGGAATGCTGGCGGCGAACAACGCCAGTACCAGCAGGAATCGCCATGAGCCGGGCAAGATGCGGTCCTCGTGGGTTGGCTGATGGGGGCCG‑CATGGCGGCCCCGCTTTGCACTCACTTGTATGTGACTg > 2:172509/1‑150 (MQ=255) tGGGGTTGCAACGGCCAGAACGGAATGCTGGCGGCGAACAACGCCAGTACCAGCAGGAATCGCCATGAGCCGGGCATGATGCGGTCCTCGTGGGTTGGCTGATGGGGGCCG‑CATGGCGGCCCCGCTTTGCACTCACTTGTATGTGACTgg < 1:1303408/150‑1 (MQ=255) gggTTGCAACGGCCAGAACGGAATGCTGGCGGCGAACAACGCCAGTACCAGCAGGAATCGCCATGAGCCGGGCATGATGCGGTCCTCGTGGGTTGGCTGATGGGGGCCG‑CATGGCGGCCCCGCTTTGCACTCACTTGTATGTGACTGgcg < 1:1777677/150‑1 (MQ=255) gggTTGCAACGGCCAGAACGGAATGCTGGCGGCGAACAACGCCAGTACCAGCAGGAATCGCCATGAGCCGGGCATGATGCGGTCCTCGTGGGTTGGCTGATGGGGGCCG‑CATGGCGGCCCCGCTTTGCACTCACTTGTATGTGACTGgcg < 1:1389463/150‑1 (MQ=255) gTTGCAACGGCCAGAACGGAATGCTGGCGGCGAACAACGCCAGTACCAGCAGGAATCGCCATGAGCCGGGCATGATGCGGTCCTCGTGGGTTGGCTGATGGGGGCCG‑CATGGCGGCCCCGCTTTGCACTCACTTGTATGTGACTGGCGCt < 1:733893/150‑1 (MQ=255) cAACGGCCAGAACGGAATGCTGGCGGCGAACAACGCCAGTACCAGCAGGAATCGCCATGAGCCGGGCATGATGCGGTCCTCGTGGGTTGGCTGATGGGGGCCG‑CATGGCGGCCCCGCtt < 1:668256/119‑1 (MQ=255) cAACGGCCAGAACGGAATGCTGGCGGCGAACAACGCCAGTACCAGCAGGAATCGCCATGAGCCGGGCATGATGCGGTCCTCGTGGGTTGGCTGATGGGGGCCG‑CATGGCGGCCCCGCtt > 2:668256/1‑119 (MQ=255) aaCGGCCAGAACGGAATGCTGGCGGCGAACAACGCCAGTACCAGCAGGAATCGCCATGAGCCGGGCATGATGCGGTCCTCGTGGGTTGGCTGATGGGGGCCG‑CATGGCGGCCCCGCTTTGCACTCACTTGTATGTGACTGGCGCTGTCAc > 2:341826/1‑150 (MQ=255) aaCGGCCAGAACGGAATGCTGGCGGCGAACAACGCCAGTACCAGCAGGAATCGCCATGAGCCGGGCATGATGCGGTCCTCGTGGGTTGGCTGATGGGGGCCG‑CATGGCGGCCCCGCTTTGCACTCACTTGTATGTGACTGGCGCTGTCAc > 1:2005470/1‑150 (MQ=255) aCGGCCAGAACGGAATGCTGGCGGCGAACAACGCCAGTACCAGCAGGAATCGCCATGAGCCGGGCATGATGCGGTCCTCGTGGGTTGGCTGATGGGGGCCG‑CATGGCGGCCCCGCTTTGCACTCACTTGTATGTGACTGGCGCTGTCAcc < 2:1712334/150‑1 (MQ=255) aCGGCCAGAACGGAATGCTGGCGGCGAACAACGCCAGTACCAGCAGGAATCGCCATGAGCCGGGCATGATGCGGTCCTCGTGGGTTGGCTGATGGGGGCCG‑CATGGCGGCCCCGCTTTGCACTCACTTGTATGTGACTGGCGCTGTCAcc > 2:1927783/1‑150 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cTGGCGGCGAACAACGCCAGTACCAGCAGGAATCGCCATGAGCCGGGCATGATGCGGTCCTCGTGGGTTGGCTGATGGGGGCCG‑CATGGCGGCCCCGCTTTGCACTCACTTGTATGTGACTGGCGCTGTCACCGGCTGGCCCAGCGTCGa > 1:2150459/1‑150 (MQ=255) tGGCGGCGAACAACGCCAGTACCAGCAGGAATCGCCATGAGCCGGGCATGATGCGGTCCTCGTGGGTTGGCTGATGGGGGCCG‑CATGGCGGCCCCGCTTTGCACTCACTTGTATGTGACTGGCGCTGTCACCGTCTGGCCCAGCGTCGAt < 2:595353/150‑1 (MQ=255) tGGCGGCGAACAACGCCAGTACCAGCAGGAATCGCCATGAGCCGGGCATGATGCGGTCCTCGTGGGTTGGCTGATCGGGGCCG‑CATGGCGGCCCCGCTTTGCACTCACTTGTATGTGACATCCACTGTCACCGTCTCGCCCAGCGTCGAt > 1:2342235/1‑150 (MQ=255) ggcgAACAACGCCAGTACCAGCAGGAATCGCCATGAGCCGGGCATGATGCGGTCCTCGTGGGTTGGCTGATGGGGGCCG‑CATGGCGGCCCCGCTTTGCACTCACTTGTATGTGACTGGCGCTGTCACCGTCTGGCCCAGCGTCGATTTCa > 1:1196047/1‑150 (MQ=255) gAACAACGCCAGTACCAGCAGGAATCGCCATGAGCCGGGCATGATGCGGTCCTCGTGGGTTGGCTGATGGGGGCCG‑CATGGCGGCCCCGCTTTGCACTCACTTGTATGTGACTGGCGCTGTCACCGTCTGGCCCAGCGTCGa < 2:1567844/142‑1 (MQ=255) gAACAACGCCAGTACCAGCAGGAATCGCCATGAGCCGGGCATGATGCGGTCCTCGTGGGTTGGCTGATGGGGGCCG‑CATGGCGGCCCCGCTTTGCACTCACTTGTATGTGACTGGCGCTGTCACCGTCTGGCCCAGCGTCGa > 1:1567844/1‑142 (MQ=255) aacGCCAGTACCAGCAGGAATCGCCATGAGCCGGGCATGATGCGGTCCTCGTGGGTTGGCTGATGGGGGCCG‑CATGGCGGCCCCGCTTTGCACTCACTTGTATGTGACTGGCGCTGTCACCGTCTGGCCCAGCGTCGATTTCACCGTGAc > 2:2145354/1‑150 (MQ=255) aacGCCAGTACCAGCAGGAATCGCCATGAGCCGGGCATGATGCGGTCCTCGTGGGTTGGCTGATGGGGGCCG‑CATGGCGGCCCCGCTTTGCACTCACTTGTATGTGACTGGCGCTGTCACCGTCTGGCCCAGCGTCGATTTCACCGTGAc > 2:611373/1‑150 (MQ=255) aacGCCAGTACCAGCAGGAATCGCCATGAGCCGGGCATGATGCGGTCCTCCTGGGTTGGCTGATGGGGGCCG‑CATGGCGGCCCCGCTTTGCACTCACTTGTATGTGACTGGCGCTGTCACCGTCTGGCCCAGCGTCGATTTCACCGTGAc > 2:1046853/1‑150 (MQ=255) cAGTACCAGCAGGAATCGCCATGAGCCGGGCATGATGCGGTCCTCATGGGTTGGCTGATGGGGGCCG‑CATGGCGGCCCCGCTTTGCACTCACTTGTATGTGACTGGCGCTGTCACCGTCTGGCCCAGCGTCGATTTCACCGTGACCGTCg < 1:377085/150‑1 (MQ=255) 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ggCATGATGCGGTCCTCGTGGGTTGGCTGATGGGGGCCG‑CATGGCGGCCCCGCTTTGCAGTCCCTTGGATGTGACTGGCGCTGTCACCGTCTGGCCCAGCGTCGATTTCACCGTGACCGTCACTTGCGTGGCCGGGACAAAGCCggtggt > 2:802789/1‑150 (MQ=255) ggCATGATGCGGTCCTCGTGGGTTGGCTGATGGGGGCCG‑CATGGCGGCCCCGCTTTGCACTCACTTGTATGTGACTGGCGCTGTCACCGTCTGGCCCAGCGTCGATTTCACCGTGACCGTCGCTGGCGTGGCCGGGCCAAAGCCggtggt > 1:804025/1‑150 (MQ=255) gCATGATGCGGTCCTCGTGGGTTGGCTGATGGGGGCCG‑CATGGCGGCCCCGCTTTGCACTCACTTGTATGTGACTGGCGCTGTCACCGTCTGGCCCAGCGTCGATTTCACCGTGACCGTCGCTGGCGTGGCCGGGCCAAAGCCggtggtg < 2:464540/150‑1 (MQ=255) gCATGATGCGGTCCTCGTGGGTTGGCTGATGGGGGCCG‑CATGGCGGCCCCGCTTTGCACTCACTTGTATGTGACTGGCGCTGTCACCGTCTGGCCCAGCGTCGATTTCACCGTGACCGTCGCTGGCGTGGCCGGGCCAAAGCCggtggtg < 2:2005470/150‑1 (MQ=255) gCATGATGCGGTCCTCGTGGGTTGGCTGATGGGGGCCG‑CATGGCGGCCCCGCTTTGCACTCACTTGTATGTGACTGGCGCTGTCACCGTCTGGCCCAGCGTCGATTTCACCGTGACCGTCGCTGGCGTGGCCGGGCCAAAGCCggtggtg < 1:341826/150‑1 (MQ=255) gCATGATGCGGTCCTCGTGGGTTGGCTGATGGGGGCCG‑CATGGCGGCCCCGCTTTGCACTCACTTGTATGTGACTGGCGCTGTCACCGTCTGGCCCAGCGTCGATTTCACCGTGACCGTAGCTGGCGTGGCCGGGCCAAAGCCggtggtg < 1:1025829/150‑1 (MQ=255) cGGTCCTCGTGGGTTGGCTGATGGGGGCCG‑CATGGCGGCCCCGCTTTGCACTCACTTGTATGTGACTGGCGCTGTCACCGTCTGGCCCAGCGTCGATTTCACCGTGACCGTCGCTGGCGTGGCCGGGCCAAAGCCGGTGGTGGTCACCGc < 2:2087606/150‑1 (MQ=255) tCCTCGTGGGTTGGCTGATGGGGGCCG‑CATGGCGGCCCCGCTTTGCACTCACTTGTATGTGACTGGCGCTGTCACCGTCTGGCCCAGCGTCGATTTCACCGTGACCGTCGCTGGCGTGGCCGGGCCAAAGCCGGTGGTGGTCACCGCTAc > 2:1597155/1‑150 (MQ=255) gTTGGCTGATGGGGGCCG‑CATGGCGGCCCCGCTTTGCACTCACTTGTATGTGACCGGCGCTGTCACCGTCTGGCCCAGCGTCGATTTCACCGTGACCGTCGCTGGCGTGGCCGGGCCAAAGCCgg > 1:1362051/1‑125 (MQ=255) gTTGGCTGATGGGGGCCG‑CATGGCGGCCCCGCTTTGCACTCACTTGTATGTGACCGGCGCTGTCACCGTCTGGCCCAGCGTCGATTTCACCGTGACCGTCGCTGGCGTGGCCGGGCCAAAGCCgg < 2:1362051/125‑1 (MQ=255) ttGGCTGATGGGGGCCG‑CATGGCGGCCCCGCTTTGCACTCACTTGTATGTGACTGGCGCTGTCACCGTCTGGCCCAGCGTCGATTTCACCGTGACCGTCGCTGGCGTGGCCGGGCCAAAGCCGGTGGTGGTCACCGCTACCCGCCAACgg > 1:1783879/1‑150 (MQ=255) ttGGCTGATGGGGGCCG‑CATGGCGGCCCCGCTTTGCACTCACTTGTATGTGACTGGCGCTGTCACCGTCTGGCCCAGCGTCGATTTCACCGTGACCGTCGCTGGCGTGGCCGGGCCAAAGCCGGTGGTGGTCACCGCTACCCGCCAACgg > 1:34316/1‑150 (MQ=255) tGATGGGGGCCG‑CATGGCGGCCCCGCTTTGCACTCACTTGTATGTGACTGGCGCTGt < 1:841846/57‑1 (MQ=255) tGATGGGGGCCG‑CATGGCGGCCCCGCTTTGCACTCACTTGTATGTGACTGGCGCTGt > 2:841846/1‑57 (MQ=255) tGATGGGGGCCG‑CATGGCGGCCCCGCTTTGCACTCACTTGTATGTGACTGGCGCTGTCACCGTCTGGCCCAGCGTCGATTTCACCGTGACCGTCGCTGGCGTGGCCgg > 2:1502039/1‑108 (MQ=255) tGATGGGGGCCG‑CATGGCGGCCCCGCTTTGCACTCACTTGTATGTGACTGGCGCTGTCACCGTCTGGCCCAGCGTCGATTTCACCGTGACCGTCGCTGGCGTGGCCgg < 1:1502039/108‑1 (MQ=255) agcggggCCGCCAT‑GCGGCCCCGCTTTGCACTCACTTGTATGTGACTGGCGCTGTCACCGTCTGGCCCAGCGTCGATTTCACCGTGACCGTCGCTGGCGTGGCCGGGCCAAAGCCGGTGGTGGTCACCGCTACCCGCCAACGGGCCCCCg > 1:682791/4‑150 (MQ=255) aTGGGGGCCG‑CATGGCGGCCCCGCTTTGCACTCACTTGTATGTGACTGGCGCTGTCACCGTCTGGCCCAGCGTCGATTTCACCGTGACCGTCGCTGGCGTGGCCGGGCCAAAGCCGGTGGTGGTCACCGCTACCCGCCAACGGGCCCCCg < 2:225690/150‑1 (MQ=255) gcggggCCGCCAT‑GCGGCCCCGCTTTGCACTCACTTGTATGTGACTGGCGCTGTCACCGTCTGGCCCAGCGTCGATTTCACCGTGACCGTCGCTGGCGTGGCCGGGCCAAAGCCGGTGGTGGTCACCGCTACCCGCCAACGGGCCCCCGt > 2:1427121/3‑150 (MQ=255) gggCCG‑CATGGCGGCCCCGCTTTGCACTCACTTGTATGTGACTGGCGCTGTCACCGTCTGGCCCAGCGTCGATTTCACCGTGACCGTCGCTGGCGTGGCCGGGCCAAAGCCGGTGGTGGTCACCGCTACCCGCCAACGGGCCCCCGTAGt < 2:2066894/150‑1 (MQ=255) gCCG‑CATGGCGGCCCCGCTTTGCACTCACTTGTATGTGACTGGCGCTGTCACCGTCTGGCCCAGCGTCGATTTCACCGTGACCGTCGCTGGCGTGGCCGGGCCAAAGCCGGTGGTGGTCACCGCTACCCGCCAACGGGCCCCCGTAGTCg < 1:1705204/150‑1 (MQ=255) ccG‑CATGGCGGCCCCGCTTTGCACTCACTTGTATGTGACTGGCGCTGTCACCGTCTGGCCCAGCGTCGATTTCACCGTGACCGTCGCTGGCGTGGCCGGGCCAAAGCCGGTGGTGGTCACCGCTACCCGCCAACGGGCCCCCGTAGTCGt < 2:1783879/150‑1 (MQ=255) g‑CATGGCGGCCCCGCTTTGCACTCACTTGTATGTGACTGGCGCTGTCACCGTCTGGCCCAGCGTCGATTTCACCGTGACCGTCGCTGGCGTGGCCGGGCCAAAGCCGGTGGTGGTCACCGCTACCCGCCAACGGGCCCCCGTAGTCGTgg < 1:2145354/150‑1 (MQ=255) | CCCCCAGGGAGAGGCCGCTGCTTCGGCCACCGTTCGTTGGGGTTGCAACGGCCAGAACGGAATGCTGGCGGCGAACAACGCCAGTACCAGCAGGAATCGCCATGAGCCGGGCATGATGCGGTCCTCGTGGGTTGGCTGATGGGGGCCG‑CATGGCGGCCCCGCTTTGCACTCACTTGTATGTGACTGGCGCTGTCACCGTCTGGCCCAGCGTCGATTTCACCGTGACCGTCGCTGGCGTGGCCGGGCCAAAGCCGGTGGTGGTCACCGCTACCCGCCAACGGGCCCCCGTAGTCGTGG > NC_002947/3610162‑3610458 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |