| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 3,926,157:1 | +T | 13.5% | coding (378/1629 nt) | peaA ← | quinohemoprotein amine dehydrogenase subunit alpha |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 3,926,157 | 1 | . | T | 13.5% | 234.2 / 38.3 | 74 | coding (378/1629 nt) | peaA | quinohemoprotein amine dehydrogenase subunit alpha |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (26/38); new base T (5/5); total (31/43) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.33e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.28e-01 | |||||||||||
CCAAGGTGGAAGTGGACCAGGTGTTCCCACTCCTTGGCCGGGCGCCGTTGCAAGGCGACACGGGCACCCGAGTGGCAACGGCCACAGGTCTCGCTGAGCTGGGTGTCGAAGTGCTCGACAGTATTGAGCCGACGCTCCATGGCGTAGCGC‑ACGCCATCGGTTTCGCTGGGCGCCAGGCCCTGTTTGTCGGCCAGGTATTTGACCAGCGTGCGACGATCGTCGTCGCTGATCTGAAGGCCATGCATCACCTGCATGCGGGCGATGCTCATCAGCCAGCCTTCCGGTGTCTTGCGCTGGT > NC_002947/3926008‑3926305 | ccAAGGTGGAAGTGGACCAGGTGTTCCCACTCCTTGGCCGGGCTCCGTTGCAAGGCGACACGGGCACCCGAGTGGCAACGGCCACAGGTCTCGCTGAGCTGGGTGTCGAAGTGCTCGACAGTATTGAGCCGACGCTCCATGGCGTAgcgc > 1:1109063/1‑150 (MQ=255) cAAGGTGGAAGTGGACCAGGTGTTCCCACTCCTTATCCGGGCGCCGTTGCAAGGCGACACGGGCACCCGAGTGGCAACGGCCACAGGTCTCGCTGAGCTGGGTGTCGAAGTGCTCGACAGTATTGAGCCGACGCTCCATGGCGTAGCGC‑a > 1:564495/1‑150 (MQ=255) aaGTGGACCAGGTGTTCCCACTCCTTGGCCGGGCGCCGTTGCAAGGCGACACGGGCACCCGAGTGGCAACGGCCACAGGTCTCGCTGAGCTGGGTGTCGAAGTGCTCGACAGTATTGAGCCGACGCTCCATGGCGTAGCGC‑ACGCCATCg < 1:381256/150‑1 (MQ=255) aaGTGGACCAGGTGTTCCCACTCCTTGGCCGGGCGCCGTTGCAAGGCGACACGGGCACCCGAGTGGCAACGGCCACAGGTCTCGCTGAGCTGGGTGTCGAAGTGCTCGACAGTATTGAGCCGACGCTCCATGGCGTAGCGC‑ACGCCATCg > 2:5653/1‑150 (MQ=255) aGTGGACCAGGTGTTCCCACTCCTTGGCCGGGCGCCGTTGCAAGGCGACACGGGCACCCGAGTGGCAACGGCCACAGGTCTCGCTGAGCTGGGTGTCGAAGTGCTCGACAGTATTGAGCCGACGCTCCATGGCGT‑GCGCTACGCCAtgga < 2:1874499/150‑4 (MQ=255) aGTGGACCAGGTGTTCCCACTCCTTGGCCGGGCGCCGTTGCAAGGCGACACGGGCACCCGAGTGGCAACGGCCACAGGTCTCGCTGAGCTGGGTGTCGAAGTGCTCGACAGTATTGAGCCGACGCTCCATGGCGT‑GCGCTACGCCAtgga < 2:657825/150‑4 (MQ=255) aGTGGAACAGCGGTTCCCACTCCTTGGCCGGGCGCGGTTGCAAGGCGACACGGGCACCCGAGTGGCAACGGCCACAGGTCTCGCTGAGCTGGGTGTCGAAGTGCTCGACAGTATTGAGCCGACGCTCCATGGCGTAGCGC‑ACGCCATCgg > 2:691876/1‑150 (MQ=255) tGGACCAGGTGTTCCCACTCCTTGGCCGGGCGCCGTTGCAAGGCGACACGGGCACCCGAGTGGCAACGGCCACAGGTCTCGCTGAGCTGGGTGTCGAAGTGCTCGACAGTATTGAGCCGACGCTCCATGGCGT‑GCGCTACGCCAtggagc < 2:1980266/150‑6 (MQ=255) aCCAGGTGTTCCCACTCCTTGGCCGGGCGCCGTTGCAAGGCGACACGGGCACCCGAGTGGCAACGGCCACAGGTCTCGCTGAGCTGGGTGTCGAAGTGCTCGACAGTATTGAGCCGACGCTCCATGGCGTAGCGC‑ACGCCATCGGTTTCg > 2:2345452/1‑150 (MQ=255) cAGGTGTTCCCACTCCTTGGCCGGGCGCCGTTGCAAGGCGACACGGGCACCCGAGTGGCAACGGCCACAGGTCTCGCTGAGCTGGGTGTCGAAGTGCTCGACAGTATTGAGCCGACGCTCCATGGCGTAGCGC‑ACGCCATCGGTTTCGCt > 1:238653/1‑150 (MQ=255) aGGTGTTCCCACTCCTTGGCCGGGCGCCGTTGCAAGGCGACACGGGCACCCGAGTGGCAACGGCCACAGGTCTCGCTGAGCTGGGTGTCGAAGTGCTCGACAGTATTGAGCCGACGCTCCATGGCGTAGCGC‑ACGCCATCGGTTTCGCTg < 1:2345452/150‑1 (MQ=255) ggTGTTCCCACTCCTTGGCCGGGCGCCGTTGCAAGGCGACACGGGCACCCGAGTGGCAACGGCCACAGGTCTCGCTGAGCTGGGTGTCGAAGTGCTCGACAGTATTGAGCCGACGCTCCATGGCGTAGCGC‑ACGCCATCGGTTTCGCTgg < 1:2146796/150‑1 (MQ=255) gtgtTCCCGCTCCTTGGCCGGGCGCCGTTGCAAGGCGACACGGGCACCCGAGTGGCAACGGCCACAGGTCTCGCTGAGCTGGGTGTCGAAGTGCTCGACAGTATTGAGCCGACGCTCCATGGCGTAGCGC‑ACGCCATCGGTTTCGCTggg > 1:1024676/1‑150 (MQ=255) gtgtCCCCACTCCTTGGCCGGGCGCCGTTGCAAGGCGACACGGGCACCCGAGTGGCAACGGCCACAGGTCTCGCTGAGCTGGGTGTCGAAGTGCTCGACAGTATTGAGCCGACGCTCCATGGCGTAGCGC‑ACGCCATCGGTTTCGCTggg < 1:903442/150‑1 (MQ=255) tgtTCCCACTCCTTGGCCGGGCGCCGTTGCAAGGCGCCGCGGGCACCCGAGTGGCAACGGCCACAGGTCTCGCTGAGCTGGGTGTCGAAGTGCTCGACAGTATTGAGCCGACGCTCCATGGCGTAGCGC‑ACGCCATCGGTTTCGCTGGgc < 2:564495/150‑1 (MQ=255) tgtTCCCACTCCTTGGCCGGGCGCCGTTGCAAGGCGACACGGGCACCCGAGTGGCAACGGCCACAGGTCTCGCTGAGCTGGGTGTCGAAGTGCTCGACAGTATTGAGCCGACGCTCCATGGCGTAGCGC‑ACGCCATCGGTTTCGCTGGgc < 2:2387167/150‑1 (MQ=255) ttCCCACTCCTTGGCCGGCCGCCGTTGCAAGGCGACACGGGCACCCGAGTGGCAACGGCCACAGGTCTCGCTGAGCTGGGTGTCGAAGTGCTCGACAGTATTGAGCCGACGCTCCATGGCGTAGCGC‑ACGCCATCGGTTTCGCTGGgcgc > 2:1818283/1‑150 (MQ=255) ccACTCCTTGGCCGGGCGCCGTTGCAAGGCGACACGGGCACCCGAGTGGCAACGGCCACAGGTCTCGCTGAGCTGGGTGTCGAAGTGCTCGACAGTATTGAGCCGACGCTCCATGGCGTAGCGC‑ACGCCATCGGTTTCGCTGGGCGCCAg > 2:1487793/1‑150 (MQ=255) ccACTCCTTGGCCGGCCGCCGTTGCAAGACGACACGGGCACCCGAGTGGCAACGGCCACAGGTCTCGCTGAGCTGGGTGTCGAAGTGCTCGACAGTATTGAGCCGACGCTCCATGGCGTAGCGC‑ACGCCATCGGTTTCGCTGGGCGCCAg < 1:1818283/150‑1 (MQ=255) cACTCCTTGGCCGGGCGCCGTTGCAAGGCGACACGGGCACCCGAGTGGCAACGGCCACAGGTCTCGCTGAGCTGGGTGTCGAAGTGCTCGACAGTATTGAGCCGACGCTCCATGGCGTAGCGC‑ACGCCATCGGTTTCGCTGGGCGCCAgg < 1:1529186/150‑1 (MQ=255) cTTGGCCGGGCGCCGTTGCAAGGCGACACGGGCACCCGAGTGGCAACGGCCACAGGTCTCGCTGAGCTGGGTGTCGAAGTGCTCGACAGTATTGCGACGGCACGCGATGGCGTAGCGC‑ACGCCATCGGTTTCGCTGGGCGCCAGGCCCTg > 2:1880411/1‑150 (MQ=255) cTTGGCCGGGCGCCGTTGCAAGGCGACACGGGCACCCGAGTGGCAACGGCCACAGGTCTCGCTGAGCTGGGTGTCGAAGTGCTCGACAGTATTGAGCCGACGCTCCATGGCGTAGCGC‑GCGCCATCGGTTTCGCTGGGCGCCAGGCCCTg > 1:1053620/1‑150 (MQ=255) ccGGGCGCCGTTGCAAGGCGACACGGGCACCCGAGTGGCAACGGCCACAGGTCTCGCTGAGCTGGGTGTCGAAGTGCTCGACAGTATTGAGCCGACGCTCCATGGCGTAGCGC‑ACGCCATCGGTTTCGCTGGGCGCCAGGCCCTGTTTGt < 2:2374101/150‑1 (MQ=255) cGGGCGCCGTTGCAAGGCGACACGGGCACCCGAGTGGCAACGGCCACAGGTCTCGCTGAGCTGGGTGTCGAAGTGCTCGACAGTATTGAGCCGACGCTCCATGGCGTAGCGC‑ACGCCATCGGTTTCGCTGGGCGCCAGGCCCTGTTTGTc < 1:320621/150‑1 (MQ=255) gggCGCCGTTGCAAGGCGACACGGGCACCCGAGTGGCAACGGCCACAGGTCTCGCTGAGCTGGGTGTCGAAGTGCTCGACAGTATTGAGCCGACGCTCCATGGCGTAGCGC‑ACGCCATCGGTTTCGCTGGGCGCCAGGCCCTGTTTGTCg < 1:2372628/150‑1 (MQ=255) gcCGTTGCAAGGCGACACGGGCACCCGAGTGGCAACGGCCACAGGTCTCGCTGAGCTGGGTGTCGAAGTGCTCGACAGTATTGAGCCGACGCTCCATGGCGTAGCGC‑ACGCCATCGGTTTCGCTGGGCGCCAGGCCCTGTTTGTCGGCCa > 1:2192360/1‑150 (MQ=255) gcCGTTGCAAGGCGACACGGGCACCCGAGTGGCAACGGCCACAGGTCTCGCTGAGCTGGGTGTCGAAGTGCTCGACAGTATTGAGCCGACGCTCCATGGCGTAGCGC‑ACGCCATCGGTTTCGCTGGGCGCCAGGCCCTGTTTGTCGGCCa < 2:539708/150‑1 (MQ=255) ccGTTGCAAGGCGAGACGGGCACCCGAGTGGCAACGGCCACAGGTCTCGCTGAGCTGGGTGTCGAAGTGCTCGACAGTATTGAGCCGACGCTCCATGGCGTAGCGC‑ACGCCATCGGTTTCGCTGGGCGCCAGGCCCTGTTTGTCGGCCAg < 2:2035358/150‑1 (MQ=255) gTTGCAAGGCGACACGGGCACCCGAGTGGCAACGGCCACAGGTCTCGCTGAGCTGGGTGTCGAAGTGCTCGACAGTATTGAGCCGACGCTCCATGGCGT‑GCGCTACGCCAt < 2:2262144/111‑1 (MQ=255) gTTGCAAGGCGACACGGGCACCCGAGTGGCAACGGCCACAGGTCTCGCTGAGCTGGGTGTCGAAGTGCTCGACAGTATTGAGCCGACGCTCCATGGCGT‑GCGCTACGCCAt > 1:2262144/1‑111 (MQ=255) gCAAGGCGACACGGGCACCCGAGTGGCAACGGCCACAGGTCTCGCTGAGCTGGGTGTCGAAGTGCTCGACAGTATTGAGCCGACGCTCCATGGCGTAGCGC‑ACGCCATCGGTTTCGCTGGGCGCCAGGCCCTGTTTGTCGGCCAGGTAtt > 1:1581044/1‑150 (MQ=255) cAAGGCGCCACGGGCACCCGAGTGGCAACGGCCACAGGTCTCGCTGAGCTGGGTGTCGAAGTGCTCGACAGTATTGAGCCGACGCTCCATGGCGTAGCGC‑ACGCCATCGGTTTCGCTGGGCGCCAGGCCCTGTTTGTCGGCCAGGTAttt < 1:5653/150‑1 (MQ=255) cAAGGCGACACGGGCACCCGAGTGGCAACGGCCACAGGTCTCGCTGAGCTGGGTGTCGAAGTGCTCGACAGTATTGAGCCGACGCTCCATGGCGTAGCGC‑ACGCCATCGGTTTCGCTGGGCGCCAGGCCCTGTTTGTCGGCCAGGTAttt < 2:1572592/150‑1 (MQ=255) cAAGGCGACACGGGCACCCGAGTGGCAACGGCCACAGGTCTCGCTGAGCTGGGTGTCGAAGTGCTCGACAGTATTGAGCCGACGCTCCATGGCGTAGCGC‑ACGCCATCGGTTTCGCTGGGCGCCAGGCCCTGTTTGTCGGCCAGGTAttt < 1:1534563/150‑1 (MQ=255) aaGGCGACACGGGCACCCGAGTGGCAACGGCCACAGGTCTCGCTGAGCTGGGTGTCGAAGTGCTCGACAGTATTGAGCCGACGCTCCATGGCGTAGCGC‑ACGCCATCGGTTTCGCTGGGCGCCAGGCCCTGTTTGTCGGCCAGGTATTTg > 1:2019870/1‑150 (MQ=255) aaGGCGACACGGGCACCCGAGTGGCAACGGCCACAGGTCTCGCTGAGCTGGGTGTCGAAGTGCTCGACAGTATTGAGCCGACGCTCCATGGCGTAGCGC‑ACGCCATCGGTTTCGCTGGGCGCCAGGCCCTGTTTGTCGGCCAGGTATTTg > 2:620368/1‑150 (MQ=255) aaGGCGACACGGGCACCCGAGTGGCAACGGCCACAGGTCTCGCTGAGCTGGGTGTCGAAGTGCTCGACAGTATTGAGCCGACGCTCCATGGCGT‑GCGCTACGCCAtg < 2:831089/107‑2 (MQ=255) aaGGCGACACGGGCACCCGAGTGGCAACGGCCACAGGTCTCGCTGAGCTGGGTGTCGAAGTGCTCGACAGTATTGAGCCGACGCTCCATGGCGT‑GCGCTACGCCAtg > 1:831089/1‑106 (MQ=255) aGGCGACACGGGCACCCGGGTGGCCACGGCTGCTGTTCCCGCTTAGCTGGGTGTCGAAGTAATCACCAATCCAGTTCCGACGCTCCATGGCGTAGCGC‑ACGCCATCGGTTTCGCTGGGCGCCAGGCCCTGTTTGTCGGCCAGGTATTTGa < 1:1224564/150‑1 (MQ=255) aGGCGACACGGGCACCCGAGTGGCAACGGCCACAGGTCTCGCTGAGCTGGGTGTCGAAGTGCTCGACAGTATTGAGCCGACGCTCCATGGCGTAGCGC‑ACGCCATCGGTTTCGCTGGGCGCCAGGCCCTGTTTGTCGGCCAGGTATTTGa < 2:1143139/150‑1 (MQ=255) acGGGCACCCGAGTGGCAACGGCCACAGGTCTCGCTGAGCTGGGTGTCGAAGTGCTCGACAGTATTGAGCCGACGCTCCATGGCGTAGCGC‑ACGCCATCGGTTTCGCTGGGCGCCAGGCGCCTTCTGTCGGCCAGGTATTTGACCAGCGt < 1:1880411/150‑1 (MQ=255) gTGGCAACGGCCACAGGTCTCGCTGAGCTGGGTGTCGAAGTGCTCGACAGTATTGAGCCGACGCTCCATGGCGTAGCGC‑ACGCCATCGGTTTCGCTGGGCGCCAGGCCCTGTTTGTCGGCCAGGTATTTGACCAGCGTGCGACGAtcgtc < 1:620368/150‑1 (MQ=255) gTGGCAACGGCCACAGGTCTCGCTGAGCTGGGTGTCGAAGTGCTCGACAGTATTGAGCCGACGCTCCATGGCGTAGCGC‑ACGCCATCGGTTTCGCTGGGCGCCAGGCCCTGTTTGTCGGCCAGGTATTTGACCAGCGTGCGACGAtcgtc < 1:1478447/150‑1 (MQ=255) aaCGGCCACAGGTCTCGCTGAGCTGGGTGTCGAAGTGCTCGACAGTATTGAGCCGACGCTCCATGGCGTAGCGC‑ACGCCATCGGTTTCGCTGGGCGCCAGGCCCTGTTTGTCGGCCAGGTATTTGACCAGCGTGCGACGATCGTCGTCGc > 2:2370305/1‑150 (MQ=255) ggCCACAGGTCTCGCTGAGCTGGGTGTCGAAGTGCTCGACAGTATTGAGCCGACGCTCCATGGCGTAGCGC‑ACGCCATCGGTTTCGCTGGGCGCCAGGCCCTGTTTGTCGGCCAGGTATTTGACCAGCGTGCGACGATCGTCGTCGCTGa < 2:1581044/150‑1 (MQ=255) aGGTCTCGCTGAGCTGGGTGTCGAAGTGCTCGACAGTATTGAGCCGACGCTCCATGGCGTAGCGC‑ACACCATCGGTTTCGCTGGGCGCCAGGCCCTGTTTGTCGGCCAGGTATTTGACCAGCGTGCGACGATCGTCGTCGCTGATCTGaa > 1:1767391/1‑150 (MQ=255) gTCTCGCTGAGCTGGGTGTCGAAGTGCTCGACAGTATTGAGCCGACGCTCCATGGCGTAGCGC‑ACGCCATCGGTTTCGCTGGGCGCCAGGCCCTGTTTGTCGGCCAGGTATTTGACCAGCGTGCGACGATCGTCGTCGCTGATCTGAAgg > 1:1867740/1‑150 (MQ=255) cGCTGAGCTGGGTGTCGAAGTGCTCGACAGTATTGAGCCGACGCTCCATTGCGTAGCGC‑ACGCCATCGGTTTCGCTGGGCGCCAGGCCCTGTTTGTCGGCCACGTATTTGACCAGCGTGCGACGATCGTCGTCGCTGACCTGAAGGCCAt < 2:1230015/150‑1 (MQ=255) gCTGAGCTGGGTGTCGAAGTGCTCGACAGTATTGAGCCGACGCTCCATGGCGTAGCGC‑ACGCCATCGGTTTCGCTGGGCGCCAGGCCCTGTTTGTCGGACAGGTATTTGACCAGCGTGCGACGATCGTCGTCGCTGATCTGAAGGCCATg > 2:1771789/1‑150 (MQ=255) cTGGGTGTCGACGTGCTCGACAGTATTGAGCCGACGCTCCATGGCGTAGCGC‑ACGCCATCGGTTTCGCTGGGCGCCAGGCCCTGTTTGTCGGCCAGGTATTTGACCAGCGTGCGACGATCGTCGTCGCTGATCTGAAGGCCATGCATCAc < 1:1228804/150‑1 (MQ=255) cTGGGTGTCGAAGTGCTCGACAGTATTGAGCCGACGCTCCATGGCGTAGCGC‑ACGCCATCGGTTTCGCTGGGCGCCAGGCCCTGTTTGTCGGCCAGGTATTTGACCAGCGTGCGACGATCGTCGTCGCTGATCTGAAGGCCATGCATCAc < 2:1867740/150‑1 (MQ=255) tgtCGAAGTGCTCGACAGTATTGAGCCGACGCTCCATGGCGTAGCGC‑ACGCCATCGGTTTCGCTGGGCGCCAGGCCCTGTTTGTCGGCCAGGTATTTGACCAGCGTGCGACGATCGTCGTCGCTGATCTGAAGGCCATGCATCACCTGCa > 1:165710/1‑150 (MQ=255) tgtCGAAGTGCTCGACAGTATTGAGCCGACGCTCCATGGCGTAGCGC‑ACGCCATCGGTTTCGCTGGGCGCCAGGCCCAGTTTGTCGGCCAGTTCCTTTTCCAGCGTGCGACGATCGTCGTCGCTGATCTGAAGGCCATGCATCACCTGCa < 1:1487793/150‑1 (MQ=255) gAAGTGCTCGACAGTATTGAGCCGACGCTCCATGGCGTAGCGC‑ACGCCATCGGTTTCGCTGGGCGCCAGGCCCTGTTTGTCGGCCAGGTATTTGACCAGCGTGCGACGATCGTCGTCGCTGATCTGAAGGCCATGCATCACCTGCATGCg > 2:1935427/1‑150 (MQ=255) tCGACAGTATTGAGCCGACGCTCCATGGCGTAGCGC‑ACGCCATCGGTTTCGCTGGGCGCCAGGCCCTGTTTTTCGGCCAGGTATTTGACCAGCGTGCGACGAtcgtcgtc > 1:1749653/1‑110 (MQ=255) tCGACAGTATTGAGCCGACGCTCCATGGCGTAGCGC‑ACGCCATCGGTTTCGCTGGGCGCCAGGCCCTGTTTGTCGGCCAGGTATTTGACCAGCGTGCGACGAtcgtcgtc < 2:1749653/110‑1 (MQ=255) 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gCCGACGCTCCATGGCGTAGCGC‑ACGCCATCGGTTTCGCTGGGCGCCAGGCCCTGTTTGTCGGCCAGGTATTTGACCAGCGTGCGACGAtcgtcgtc > 2:1937895/1‑97 (MQ=255) gCCGACGCTCCATGGCGTAGCGC‑ACGCCATCGGTTTCGCTGGGCGCCAGGCCCTGTTTGTCGGCCAGGTATTTGACCAGCGTGCGACGAtcgtcgtc < 1:1937895/97‑1 (MQ=255) gCCGACGCTCCATGGCGTAGCGC‑ACGCCATCGGTTTCGCTGGGCGCCAGGCCCTGTTTGTCGGCCAGGTATTTGACCAGCGTGCGACGATCGTCGTCGCTGATCTGAAGGCCATGCATCACCTGCATGCgg < 2:886655/131‑1 (MQ=255) gCCGACGCTCCATGGCGTAGCGC‑ACGCCATCGGTTTCGCTGGGCGCCAGGCCCTGTTTGTCGGCCAGGTATTTGACCAGCGTGCGACGATCGTCGTCGCTGATCTGAAGGCCATGCATCACCTGCATGCgg > 1:886655/1‑131 (MQ=255) ccGACGCTCCATGGCGTAGCGC‑ACGCCATCGGTTTCGCTGGGCGCCAGGCCCTGTTTGTCGGCCAGGTATTTGACCAGCGTGCGACGATCGTCGTCGCTGATCTGAAGGCCATGCATCACCTGCATGCGGGCGATg > 2:2443998/1‑136 (MQ=255) ccGACGCTCCATGGCGTAGCGC‑ACGCCATCGGTTTCGCTGGGCGCCAGGCCCTGTTTGTCGGCCAGGTATTTGACCAGCGTGCGACGATCGTCGTCGCTGATCTGAAGGCCATGCATCACCTGCATGCGGGCGATg < 1:2443998/136‑1 (MQ=255) gCTCCATGGCGTAGCGC‑ACGCCATCGGTTTCGCTGGGCGCCAGGCCCTGTTTGTCGGCCAGGTATTTGACCAGCGTGCGACGATCGTCGTCGCTGATCTGAAGGCCATGCATCACCTGCATGCGGGCGATGCTCATCAGCCAGCCTTCCg < 2:179486/150‑1 (MQ=255) gCTCCATGGCGTAGCGC‑ACGCCATCGGTTTCGCTGGGCGCCAGGCCCTGTTTGTCGGCCAGGTATTTGACCAGCGTGCGACGATCGTCGTCGCTGATCTGAAGGCCATGCATCACCTGCATGCGGGCGATGCTCATCAGCCAGCCTTCCg < 2:644581/150‑1 (MQ=255) tCCATGGCGTAGCGC‑ACGCCATCGGTTTCGCTGGGCGCCAGGCCCTGTTTGTCGGCCAGGTATTTGACCAGCGTGCGACGATCGTCGTCGCTGATCTGAAGGCCATGCATCACCTGCATGCGGGCGATGCTCATCAGCCAGCCTTCCGgt > 2:489226/1‑150 (MQ=255) cgaTGGCGT‑GCGCTACGCCATGGGTTTCGCTGGGCGCCAGGCCCTGTTTGTCGGCCAGGTATTTGACCAGCGTGCGACGATCGTCGTCGCTGATCTGAAGGCCATGCATCACCTGCATGCGGGCGATGCTCATCAGCCAGCCTTCCGgtg > 2:1927403/3‑150 (MQ=255) gaTGGCGT‑GCGCTACGCCATCGGTTTCGCTGGGCGCCAGGCCCTGTTTGTCGGCCAGGTATTTGACCAGCGTGCGACGATCGTCGTCGCTGATCTGAAGGCCATGCATCACCTGCATGCGGGCGATGCTCATCAGCCAGCCTTCCGgtgt > 2:135910/2‑150 (MQ=255) gaTGGCGT‑GCGCTACGCCATCGGTTTCGCTGGGCGCCAGGCCCTGTTTGTCGGCCAGGTATTTGACCAGCGTGCGACGATCGTCGTCGCTGATCTGAAGGCCATGCATCACCTGCATGCGGGCGATGCTCATCAGCCAGCCTTCCGgtgt > 1:459507/2‑150 (MQ=255) aTGGCGTAGCGC‑ACGCCATCGGTTTCGCTGGGCGCCAGGCCCTGTTTGTCGGCCAGGTATTTGACCAGGGTGCGTCTTTCGTCGTCGCTGATCTGAAGGCCATGCATCACCTGCATGCGGGCGATGCTCATCAGCCAGCCTTCCGGTGTc < 2:2019870/150‑1 (MQ=255) ggCGTAGCGC‑ACGCCATAGGGTCCGCTGGGCGCCAGGCCCTGTTTGTCGGCCAGGTATTTGCCCAGCGTGCGACGATCGTCGTCGCTGATCTGAAGGCCATGCATCACCTGCATGCGGGCGATGCTCATCAGCCAGCCTTCCGGTGTCtt < 1:1305704/150‑1 (MQ=255) gc‑ACGCCATCGGTTTCGCTGGGCGCCAGGCCCTGTTTGTCGGCCAGGTATTTGACCAGCGTGCGACGATCGTCGTCGCTGATCTGAAGGCCATGCATCACCTGCATGCGGGCGATGCTCATCAGCCAGCCTTCCGGTGTCTTGCGCtggt < 1:1096077/150‑1 (MQ=255) | CCAAGGTGGAAGTGGACCAGGTGTTCCCACTCCTTGGCCGGGCGCCGTTGCAAGGCGACACGGGCACCCGAGTGGCAACGGCCACAGGTCTCGCTGAGCTGGGTGTCGAAGTGCTCGACAGTATTGAGCCGACGCTCCATGGCGTAGCGC‑ACGCCATCGGTTTCGCTGGGCGCCAGGCCCTGTTTGTCGGCCAGGTATTTGACCAGCGTGCGACGATCGTCGTCGCTGATCTGAAGGCCATGCATCACCTGCATGCGGGCGATGCTCATCAGCCAGCCTTCCGGTGTCTTGCGCTGGT > NC_002947/3926008‑3926305 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |