| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 5,574,838:1 | +T | 5.3% | coding (507/1041 nt) | motB ← | flagellar motor rotation protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,574,838 | 1 | . | T | 5.3% | 384.5 / 14.1 | 95 | coding (507/1041 nt) | motB | flagellar motor rotation protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (39/51); new base T (3/2); total (42/53) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.52e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.81e-01 | |||||||||||
CCCAGTTACCGTATTCGCCAGTGCCGGCATACGGCTTGGCATCGGTATGGCCGCTGATGCTGACCTTGTTCGGCACCGCCTTGATGGTGTCAGCCATGGCCAGCAGGATATCTTCGAAGTAGGGCTGCAGGCGCGCGCTACCGATG‑TCGAACATCGGTCGGTTCTCGGCATCCATGATCTGGATACGCAGGCCGTCCTGAGTGATCTCGAACAGGATCTGGTCCTTGAACTTCTGCAGCTGCGGGTTCTCTTCCACCTTGTTCTGCAGTTCCTGCAGCAACAGCTCCAGAC > NC_002947/5574693‑5574983 | cccAGTTACCGTATTCGCCAGTGCCGGCATACGGCTTGGCATCGGTATGGCCGCTGATGCTGACCTTGTTCGGCACCGCCTTGATGGTGTCAGCCATGGCCAGCAGGATATCTTCGAAGTAGGGCTGCAGGCGCGCGCTACCGATG‑TCGa > 2:708071/1‑150 (MQ=255) ccAGTTCCCGTATTCGCCAGTTCCCGCATACGGCTTGGCATCGGTATGGCCGCTGATGCTGACCTTGTTCGGCACCGCCTTGATGGTGGCAGCCATGGCCAGCAGGATATCTTCCAAGTAGGGCTGCAGGCGCGCGCTACCGATG‑TCGaa < 1:1110170/150‑1 (MQ=255) ccAGTTACCGTATTCGCCAGTGCCGGCATACGGCTTGGCATCGGTATGGCCGCTGATGCTGACCTTGTTCGGCACCGCCTTGATGGTGTCAGCCATGGCCAGCAGGATGCGGTCTAAGTAGGGCTGCAGGCGCGCGCTACCGATG‑TCGaa > 2:1774034/1‑150 (MQ=255) ccAGTTACCGTATTCGCCAGTGCCGGCATACGGCTTGGCATCGGTATGGCCGCTGATGCTGACCTTGTTCGGCACCGCCTTGATGGTGTCAGCCATGGCCAGCAGGATATCTTCGAAGTAGGGCTGCAGGCGCGCGCTACCGATG‑TCGaa < 2:1778025/150‑1 (MQ=255) ccAGTTACCGTATTCGCCAGTGCCGGCATACGGCTTGGCATCGGTATGGCCGCTGATGCTGACCTTGTTCGGCACCGCCTTGATGGTGTCAGCCATGGCCAGCAGGATATCTTCGAAGTAGGGCTGCAGGCGCGCGCTACCGATG‑TCGaa < 1:880315/150‑1 (MQ=255) aGTTACCGTATTCGCCAGTGCCGGCATACGGCTTGGCATCGGTATGGCCGCTGATGCTGACCTTGTTCGGCACCGCCTTGATGGTGTCAGCCATGGCCAGCAGGATATCTTAGCGGTAGGGCTGCAGGCGCGCGCTACCGATG‑TCGAACa < 1:1774034/150‑1 (MQ=255) tACCGTATTCGCCAGTGCCGGCATACGGCTTGGCATCGGTATGGCCGCTGATGCTGACCTTGTTCGGCACCGCCTTGATGGTGTCAGCCATGGCCAGCAGGATATCTTCGAAGTAGGGCTGCAGGCGCGCGCTACCGATG‑TCGAACCtcg < 2:938619/150‑1 (MQ=255) cGTATTCGCCAGTGCCGGCATACGGCTTGGCATCGGTATGGCCGCTGATGCTGACCTTGTTCGGCACCGCCTTGATGGTGTCAGCCATGGCCAGCAGGATATCTTCGAAGTAGGGCTGCAGGCGCGCGCTACCGATGTTCG‑ACAtcggta < 2:1424415/150‑2 (MQ=255) cGTATTCGCCAGTGCCGGCATACGGCTTGGCATCGGTATGGCCGCTGATGCTGACCTTGTTCGGCACCGCCTTGATGGTGTCAGCCATGGCCAGCAGGATATCTTCGAAGTAGGGCTGCAGGCGCGCGCTACCGATGTTCG‑ACAtcggta > 1:1424415/1‑149 (MQ=255) cGTATTCGCCAGTGCCGGCATACGGCTTGGCATCGGTATGGCCGCTGATGCTGACCTTGTTCGGCACCGCCTTGATGGTGTCAGCCATGGCCAGCAGGATATCTTCGAAGTAGGGCTGCAGGCGCGCGCTACCGATG‑TCGAACAtcggtc < 2:2209558/150‑1 (MQ=255) gTATTCTCCAGTGCCGGCATACGGCTTGGCATCGGTATGGCCGCTGATGCTGACCTTGTTCGGCACCGCCTTGATGGTGTCAGCCATGGCCAGCAGGATATCTTCGAAGTAGGGCTGCAGGCGCGCGCTACCGATG‑TCGAACAtcggtcg > 1:1920676/1‑150 (MQ=255) gTATTCGCCAGTGCCGGCATACGGCTTGGCATTGGTATGGCCGCTGATGCTGACCTTGTTCGGCACCGCCTTGATGGTGTCAGCCATGGCCAGCAGGATATCTTCGAAGTAGGGCTGCAGGCGCGCGCTACCGATG‑TCGAACAtcggtcg < 1:1660745/150‑1 (MQ=255) gTATTCGCCAGTGCCGGCATACGGCTTGGCATCGGTATGGCCGCTGATGCTGACCTTGTTCGGCACCGCCTTGATGGTGTCAGCCATGGCCAGCAGGATATCTTCGAAGTAGGGCTGCAGGCGCGCGCTACCGATG‑TCGAACAtcggtcg < 2:1314501/150‑1 (MQ=255) tATTCGCCAGTGCCGGCATACGGCTTGGCATCGGTATGGCCGCTGATGCTGACCTTGTTCGGCACCGCCTTGATGGTGTCAGCCATGGCCAGCAGGATATCTTCGAAGTAGGGCTGCAGGCGCGCGCTACCGATG‑TCGAACAtcggtcgg < 1:1870285/150‑1 (MQ=255) ttCGCCAGTGCCGGCATACGGCTTGGCATCGGTATGGCCGCTGATGCTGACCTTGTTCGGCACCGCCTTGATGGTGTCAGCCATGGCCAGCAGGATATCTTCGAAGTAGGGCTGCAGGCGCGCGCTACCGATG‑TCGAACATcggtcggtg > 1:2434080/1‑149 (MQ=255) gCCAGTGCCGGCATACGGCTTGGCATCGGTATGGCCGCTGATGCTGACCTTGTTCGGCACCGCCTTGATGGTGTCAGCCATGGCCAGCAGGATATCTTCGAAGTAGGGCTGCAGGCGCGCGCTACCGATG‑TCGAACATCGGTCGGTtctc > 2:77120/1‑150 (MQ=255) gCCAGTGCCGGCATACGGCTTGGCATCGGTATGGCCGCTGATGCTGACCTTGTTCGGCACCGCCTTGATGGTGTCAGCCATGGCCAGCAGGATATCTTCGAAGTAGGGCTGCAGGCGCGCGCTACCGATG‑TCGAACATCGGTCGGTnctc < 2:1496876/150‑1 (MQ=255) ccAGTGCCGGCATACGGCTTGGCATCGGTATGGCCGCTGATGCTGACCTTGTTCGGCACCGCCTTGATGGTGTCAGCCATGGCCAGCAGGATATCTTCGAAGTAGGGCTGCAGGCGCGCGCTACCGATG‑TCGAACATCGGTCGGTTCTCg > 1:821048/1‑150 (MQ=255) ccAGTGCCGGCATACGGCTTGGCATCGGTATGGCCGCTGATGCTGACCTTGTTCGGCACCGCCTTGATGGTGTCAGCCATGGCCAGCAGGATATCTTCGAAGTAGGGCTGCAGGCGCGCGCTACCGATG‑TCGAACATCGATCGGTTCTCg < 2:2205509/150‑1 (MQ=255) cAGTGCCGGCATACGGCTTGGCATCGGTATGGCCGCTGATGCTGACCTTGTTCGGCACCGCCTTGATGGTGTCAGCCATGGCCAGCAGGATATCTTCGAAGTAGGGCTGCAGGCGCGCGCTACCGATG‑TCGaa > 2:720372/1‑133 (MQ=255) cAGTGCCGGCATACGGCTTGGCATCGGTATGGCCGCTGATGCTGACCTTGTTCGGCACCGCCTTGATGGTGTCAGCCATGGCCAGCAGGATATCTTCGAAGTAGGGCTGCAGGCGCGCGCTACCGATG‑TCGaa < 1:720372/133‑1 (MQ=255) ggCATACGGCTTGGGATCGGTATGGCCGCTGATGCTGACCTTGTTCGGCACCGCCTTGATGGTGTCAGCCATGGCCAGCAGGATATCTTCGAAGTAGGGCTGCAGGCGCGCGCTACCGATG‑TCGAACATCGGTCGGTTCTCGGCATCCAt < 2:106289/150‑1 (MQ=255) gCATACGGCTTGGCATCGGTATGGCCGCTGATGCTGACCTTGTTCGGCACCGCCTTGATGGTGTCAGCCATGGCCAGCAGGATATCTTCGAAGTAGGGCTGCAGGCGCGCGCTACCGATG‑TCGAACATCGGTCGGTTCTCGGCATCCacg < 1:708071/150‑3 (MQ=255) cATACGGCTTGACATCGGTATGGCCGCTGATGCTGACCTTGTTCTGCACCGCCTTGATGGTGTCAGCCATGGCCAGCAGGATATCTTCGAAGTAGGGCTGCAGGCGCGCGCTACCGATG‑TCGAACATCGGTCGGTTCTCGGCATCCATGa < 1:1499012/150‑1 (MQ=255) aTACGGCTTGGAATCGGTATGGCCGATGATGCTGACCTTGTTCGGCACCGCCTTGATGGTGTCAGCCATGGCCAGCAGGATATCTTCGAAGTAGGGCTGCAGGCGCGCGCTACCGATG‑TCGAACATCGGTCGGTTCTCGGCATCCATGAt > 2:2334428/1‑150 (MQ=255) cTTGGCATCGGTATGGCCGCTGATGCTGACCTTGTTCGGCACCGCCTTGATGGTGTCAGCCATGGCCAGCAGGATATCTTCGAAGTAGGGCTGCAGGCGCGCGCTACCGATG‑TCGAACATCGGTCGGTTCTCGGCATCCATGATCTGGAt < 2:477264/150‑1 (MQ=255) cTTGGCATCGGTATGGCCGCTGATGCTGACCTTGTTCGGCACCGCCTTGATGGTGTCAGCCATGGCCAGCAGGATATCTTCGAAGTAGGGCTGCAGGCGCGCGCTACCGATG‑TCGAACATCGGTCGGTTCTCGGCATCCATGATCTGGAt > 2:713943/1‑150 (MQ=255) aTCGGTATGGCCGCTGATGCTGACCTTGTTCGGCACCGCCTTGATGGTGTCAGCCATGGCCAGCAGGATATCTTCGAAGTAGGGCTGCAGGCGCGCGCTACCGATG‑TCGAACATCGGTCGGTTCTCGGCATCCATGATCTGGATACGCAg > 1:1274816/1‑150 (MQ=255) aTCGGTATGGCCGCTGATGCGGACCGGGTTCGGCAGCGGGTTGATGGTGTCAGCCATGGCCAGGAGGATATCTTCGAAGGAGGGCGGCAGGCGGGCGCTGCCGATG‑TCGAACATCGGTCGGTTCTCGGCATCCATGATCTGGATACGCAg < 1:77120/150‑1 (MQ=255) tCGGTATGGCCGCTGATGCTGACCTTGTTCGGCACCGCCTTGATGGTGTCAGCCATGGCCAGCAGGATATCTTCGAAGTAGGGCTGCAGGCGCGCGCTACCGATG‑TCGaa < 2:411613/110‑1 (MQ=255) tCGGTATGGCCGCTGATGCTGACCTTGTTCGGCACCGCCTTGATGGTGTCAGCCATGGCCAGCAGGATATCTTCGAAGTAGGGCTGCAGGCGCGCGCTACCGATG‑TCGaa < 2:411586/110‑1 (MQ=255) tCGGTATGGCCGCTGATGCTGACCTTGTTCGGCACCGCCTTGATGGTGTCAGCCATGGCCAGCAGGATATCTTCGAAGTAGGGCTGCAGGCGCGCGCTACCGATG‑TCGaa > 1:411586/1‑110 (MQ=255) tCGGTATGGCCGCTGATGCTGACCTTGTTCGGCACCGCCTTGATGGTGTCAGCCATGGCCAGCAGGATATCTTCGAAGTAGGGCTGCAGGCGCGCGCTACCGATG‑TCGaa > 1:411613/1‑110 (MQ=255) tATGGCCCCTGATGCTGCCCTTGTCCGCCCCCGCTTTGATGGTGTCAGCAATGGCCAGCAGGATATCTTCGAAGTA‑GGCTGCAGGCGCGCGCTACCGATG‑TCGAACATCGGTCGGTTCTCGGCATCCATGATCTGGATACGCAGGCCGTc < 1:977698/150‑1 (MQ=255) ccGCTGATGCTGAACTTGTTCGGCCCCGCCTTGATGGTGTCAGCCATGGCCAGTAGGATATCTTCGAAGTAGGGCTGCAGGCGCGCGCTACCGATG‑TCGAACATCGGTCGGTTCTCGGCATCCATGATCTGGATACGCAGGCCGTCCTGa < 2:1295202/150‑1 (MQ=255) cGCTGATGCTGACCTTGTTCGGCACCGCCTTGATGGTGTCAGCCATGGCCAGCAGGATATCTTCGAAGTAGGGCTGCAGGCGCGCGCTACCGATGTTCG‑ACAtcggta < 2:1655641/108‑2 (MQ=255) cGCTGATGCTGACCTTGTTCGGCACCGCCTTGATGGTGTCAGCCATGGCCAGCAGGATATCTTCGAAGTAGGGCTGCAGGCGCGCGCTACCGATGTTCG‑ACAtcggta > 1:1655641/1‑107 (MQ=255) aTGCTGACCTTGTTCGGCACCGCCTTGATGGTGTCAGCCATGGCCAGCAGGATATCTTCGAAGTAGGGCTGCAGGCGCGCGCTACCGATG‑TCGAACATCGGTCGGTTCTCGGCATCCATGATCTGGATACGCAGGCCGTCCTGAGTGAtc < 1:2334428/150‑1 (MQ=255) tGCTGACCTTGTTCGGCACCGCCTTGATGGTGTCAGCCATGGCCAGCAGGATATCTTCGAAGTAGGGCTGCAGGCGCGCGCTACCGATG‑TCGAACATCGGTCGGTTCTCGGCATCCATGATCTGGATACGCAGGCCGTCCTGAGTGAtct > 1:1110131/1‑150 (MQ=255) cTGACCTTGTTCGGCACCGCCTTGATGGTGTCAGCCATGGCCAGCAGGATATCTTCGAAGTAGGGCTGCAGGCGCGCGCTACCGATG‑TCGAACATCGGTCGGTTCTCGGCATCCATGATCTGGATACGCAGGCCGTCCTGAGTGATCTCg > 1:2369483/1‑150 (MQ=255) gACCTTGTTCGGCACCGCCTTGATGGTGTCAGTCATGGCCAGCAGGATATCTTCGAAGTAGGGCTGCAGGCGCGCGCTACCGATG‑TCGAACATCGGTCGGTTCTCGGCATCCATGATCTGGATACGCAGGCCGTCCTGAGTGATCTCGaa < 1:2044328/150‑1 (MQ=255) gACCTTGTTCGGCACCGCCTTGATGGTGTCAGCCATGGCCAGCAGGATATCTTCGAAGTAGGGCTGCAGGCGCGCGCTACCGATG‑TCGAACATCGGTCGGTTCTCGGCATCCATGATCTGGATACGCAGGCCGTCCTGAGTGATCTCGaa < 1:713943/150‑1 (MQ=255) gACCTTGTTCGGCACCGCCTTGATGGTGTCAGCCATGGCCAGCAGGATATCTTCGAAGTAGGGCTGCAGGCGCGCGCTACCGATG‑TCGAACATCGGTCGGTTCTCGGCATCCATGATCTGGATACCCAGGCCGTCCTGAGTGATCTCGaa < 1:75398/150‑1 (MQ=255) aCCTTGTTCGGCACCGCCTTGATGGTGTCAGCCATGGCCAGCAGGATATCTTCGAAGTAGGGCTGCAGGCGCGCGCTACCGATG‑TCGAACATCGGTCGGTTCTCGGCATCCATGATCTGGATACGCAGGCCGTCCTGAGTGATCTCGaaa > 1:1395369/1‑149 (MQ=255) cTTGTTCGGCACCGCCTTGATGGTGTCAGCCATGGCCAGCAGGATATCTTCGAAGTAGGGCTGCAGGCGCGCGCTACCGATG‑TCGAACATCGGTCGGTTCTCGGCATCCAt > 2:764225/1‑111 (MQ=255) cTTGTTCGGCACCGCCTTGATGGTGTCAGCCATGGCCAGCAGGATATCTTCGAAGTAGGGCTGCAGGCGCGCGCTACCGATG‑TCGAACATCGGTCGGTTCTCGGCATCCAt < 1:764225/111‑1 (MQ=255) cTTGTTCGGCACCGCCTTGATGGTGTCAGCCATGGCCAGCAGGATATCTTCGAAGTAGGGCTGCAGGCGCGCGCTACCGATG‑TCGAACATCGGTCGGTTCTCGGCATCCATGATCTGGATACGCAGGCCGTCCTGAGTGATCTCGAACAg > 2:226609/1‑150 (MQ=255) cTTGTTCGGCACCGCCTTGATGGTGTCAGCCATGGCCAGCAGGATATCTTCGAAGTAGGGCTGCAGGCGCGCGCTACCGATG‑TCGAACATCGGTCGGTTCTCGGCATCCATGATCTGGATACGCAGGCCGTCCTGAGTGATCTCGAACAg > 2:51776/1‑150 (MQ=255) cTTGTTCGGCACCGCCTTGATGGTGTCAGCCATGGCCAGCAGGATATCTTCGAAGTAGGGCTGCAGGCGCGCGCTACCGATG‑TCGAACATCGGTCGGTTCTCGGCATCCATGATCTGGATACGCAGGCCGTCCTGAGTGATCTCGAACAg > 1:1136782/1‑150 (MQ=255) gCACCGCCTTGATGGTGTCAGCCATGGCCAGCAGGATATCTTCGAAGTAGGGCTGCAGGCGCGCGCTACCGATG‑TCGAACATCGGTCGGTTCTCGGCATCCATGATCTGGATACGCAGGCCGTCCTGAGTGATCTCGAACAGGATCTGGt > 2:873318/1‑150 (MQ=255) gCACCGCCTTGATGGTGTAAGCCATGGACAGCAGGATATCTGTGCTGTAGGGCTGCAGGCGCGCGCTACCGATG‑TCGAACATCAGTCGGTTCTCGGTCGCCATGATCTCGCTACGCAGGCCGTCCTGAGTGACCTTGAATTTGATCTGGt < 2:690787/150‑1 (MQ=255) cACCGCCTTGATGGTGTCAGCCATGGCCAGCAGGATATCTTCGAAGTAGGGCTGCAGGCGCGCGCTACCGATG‑TCGAACATCGGTCGGTTCTCGGCATCCATGATCTGGATACGCAGGCCGTCCTGAGTGATCTCGAACAGGATCTGGTc < 2:679270/150‑1 (MQ=255) gCCTTGATGGTGTCAGCCATGGCCAGCAGGATATCTTCGAAGTAGGGCTGCAGGCGCGCGCTACCGATG‑TCGAACAtcg < 1:2373964/79‑1 (MQ=255) gCCTTGATGGTGTCAGCCATGGCCAGCAGGATATCTTCGAAGTAGGGCTGCAGGCGCGCGCTACCGATG‑TCGAACAtcg > 2:2373964/1‑79 (MQ=255) ccTTGATGGTGTCAGCCATGGCCAGCAGGATATCTTCGAAGTAGGGCTGCAGGCGCGCGCTACCGATG‑TCGAACATCGGTCGGTTCTCGGCATCCATGATCTGGATACGCAGGCCGTCCTGAGTGATCTCGAACAGGATCTGGTCCTTGa > 2:2155388/1‑150 (MQ=255) ttGATGGTGTCAGCCATGGCCAGCAGGATATCTTCGAAGTAGGGCTGCAGGCGCGCGCTACCGATG‑TCGAACATCGGTCGGTTCTCGGCATCCATGATc < 2:1275268/99‑1 (MQ=255) ttGATGGTGTCAGCCATGGCCAGCAGGATATCTTCGAAGTAGGGCTGCAGGCGCGCGCTACCGATG‑TCGAACATCGGTCGGTTCTCGGCATCCATGATc > 1:1275268/1‑99 (MQ=255) aTGGTGTCAGCCATGGCCAGCAGGATATCTTCGAAGTAGGGCTGCAGGCGCGCGCTACCGATG‑TCGAACATCGGTCGGTTCTCGGCATCCATGATCTGGATACGCAg < 1:666841/107‑1 (MQ=255) aTGGTGTCAGCCATGGCCAGCAGGATATCTTCGAAGTAGGGCTGCAGGCGCGCGCTACCGATG‑TCGAACATCGGTCGGTTCTCGGCATCCATGATCTGGATACGCAg > 2:1268062/1‑107 (MQ=255) aTGGTGTCAGCCATGGCCAGCAGGATATCTTCGAAGTAGGGCTGCAGGCGCGCGCTACCGATG‑TCGAACATCGGTCGGTTCTCGGCATCCATGATCTGGATACGCAg < 1:1268062/107‑1 (MQ=255) aTGGTGTCAGCCATGGCCAGCAGGATATCTTCGAAGTAGGGCTGCAGGCGCGCGCTACCGATG‑TCGAACATCGGTCGGTTCTCGGCATCCATGATCTGGATACGCAg > 2:666841/1‑107 (MQ=255) aTGGTGTCAGCCATGGCCAGCAGGATATCTTCGAAGTAGGGCTGCAGGCGCGCGCTACCGATG‑TCGAACATCGGTCGGTTCTCGGCATCCATGATCTGGATACGCAGGCCGTCCTGAGTGATCTCGAACAGGATCTGGTCCTTGAACTTc > 2:149399/1‑150 (MQ=255) tggtggCAGCCATGGCCAGCAGGATATCTTCGAAGTAGGGCTGCAGGCGCGCGCTACCGATG‑TCGAACATCGGTCGGTTCTCGGCATCCATGATCTGGATACGCAGGCCGTCCTGAGTGATCTCGAACAGGATCTGGTCCTTGAACTTCt < 2:119383/150‑1 (MQ=255) gtgtCAGCCATGGCCAGCAGGATATCTTCGAAGTAGGGCTGCAGGCGCGCGCTACCGATG‑TCGAACATCGGTCGGTTCTCGGCATCCATGATCTGGATACGCAGGCCGTCCTGAGTGATCTCGAACAGGATCTGGTCCTTGAACTTCt < 2:55445/148‑1 (MQ=255) gtgtCAGCCATGGCCAGCAGGATATCTTCGAAGTAGGGCTGCAGGCGCGCGCTACCGATG‑TCGAACATCGGTCGGTTCTCGGCATCCATGATCTGGATACGCAGGCCGTCCTGAGTGATCTCGAACAGGATCTGGTCCTTGAACTTCt > 1:55445/1‑148 (MQ=255) tCAGCCATGGCCAGCAGGATATCTTCGAAGTAGGGCTGCAGGCGCGCGCTACCGATG‑TCGAACATCGGTCGGTTCTCGGCATCCATGATCTGGATACGCAGGCCGTCCTGa > 1:47584/1‑111 (MQ=255) tCAGCCATGGCCAGCAGGATATCTTCGAAGTAGGGCTGCAGGCGCGCGCTACCGATG‑TCGAACATCGGTCGGTTCTCGGCATCCATGATCTGGATACGCAGGCCGTCCTGa < 2:47584/111‑1 (MQ=255) ccATGGCCAGCAGGATATCTTCGAAGTAGGGCTGAAGGGGCGCGCTACCGATG‑TCGAACATCGGTCGGTTCTCGGCATCCATGATCTGGATACGCAGGCCGTCCTGAGTGATCTCGAACAGGATCTGGTCCTTGAACTTCTGCAGCTGCg > 1:1378578/1‑150 (MQ=255) ggCCAGCAGGATATCTTCGAAGTAGGGCTGCAGGCGCGCGCTACCGATG‑TCGAACATCGGTCGGTTCTCGGCATCCATGATCTGGATACGCAGGCCGTCCTGAGTGATCTCGAACAGGATCTGGTCCTTGAACTTCTGCAGCTGCGGGtt < 2:2369483/150‑1 (MQ=255) ggCCAGCAGGATATCTTCGAAGTAGGGCTGCAGGCGCGCGCTACCGATG‑TCGAACATCGGTCGGTTCTCGGCATCCATGATCTGGATACGCAGGCCGTCCTGAGTGATCTCGAACAGGATCTGGTCCTTGAACTTCTGCAGCTGCGGGtt < 2:1136782/150‑1 (MQ=255) cagcagGATATCTTCGAAGTAGGGCTGCAGGCGCGCGCTACCGATG‑TCGAACATCGGTCGGTTCTCGGCATCCATGATCTGGATACGCAGGCCGTCCTGAGTGATCTCGAACAGGATCTGGTCCTTGAACTTCTGCAGCTGCGGGTtctc > 2:825122/1‑150 (MQ=255) gcagGATATCTTCGAAGTAGGGCTGCAGGCGCGCGCTACCGATG‑TCGAACATCGGTCGGTTCTCGGCATCCATGATCTGGATACGCAGGCCGTCCTGAGTGATCTCGAACAGGATCTGGTCCTTGAACTTCTGCAGCTGCggg < 2:2192021/143‑1 (MQ=255) gcagGATATCTTCGAAGTAGGGCTGCAGGCGCGCGCTACCGATG‑TCGAACATCGGTCGGTTCTCGGCATCCATGATCTGGATACGCAGGCCGTCCTGAGTGATCTCGAACAGGATCTGGTCCTTGAACTTCTGCAGCTGCggg > 1:2192021/1‑143 (MQ=255) cagGATATCTTCGAAGTAGGGCTGCAGGCGCGCGCTACCGATG‑TCGAACATCGGTCGGTTCTCGGCATCCATGATCTGGATACGCAGGCCGTCCTGAGTGATCTCGAACAGGATCTGGTCCTTGAACTTCTGCAGCTGCGGGTTCTCTTc > 2:931093/1‑150 (MQ=255) cagGATATCTTCGAAGTAGGGCTGCAGGCGCGACTTACCGTTG‑TCGAACATCGGTCGGTTCTCGGCATCCATGATCTGGATACGCAGGCCGTCCTGAGTGATCTCGAACAGGATCTGGTCCTTGAACTTCTGCAGCTGCGGGTTCTCTTc < 2:2016510/150‑1 (MQ=255) atatCTTCGAAGTAGGGCTGCAGGCGCGCGCTACCGATG‑TCGAACATCGGTCGGTTCTCGGCATCCATGATCTGGATACGCAGGCCGTCCTGAGTGATCTCGAACAGGATCTGGTCCTTGAACTTCTGCAGCTGCGGGTTATATaccacc < 2:1274816/150‑1 (MQ=255) cTTCGAAGTAGGGCTGCAGGCGCGCGCTACCGATG‑TCGAACATCGGTCGGTTCTCGGCATCCATGATCTGGATACGCAGGCCGTCCTGAGTGATCTCGaa < 1:1898937/100‑1 (MQ=255) cTTCGAAGTAGGGCTGCAGGCGCGCGCTACCGATG‑TCGAACATCGGTCGGTTCTCGGCATCCATGATCTGGATACGCAGGCCGTCCTGAGTGATCTCGaa > 2:1898937/1‑100 (MQ=255) aGTAGGGCTGCAGGCGCGCGCTACCGATG‑TCGAACATCGGTCGGTTCTCGGCATCCATGATCTGGATACGCAGGCCGTCCTGAGTGATCTCGAACAGGATCTGGTCCTTGAACTTCTGCAGCTGCGGGTTCTCTTCCACCTTGTTCTGCa < 1:873318/150‑1 (MQ=255) gggCTGCAGGCGCGCGCTACCGATG‑TCGAACATCGGTCGGTTCTCGGCATCCATGATCTGGATACGCAGGCCGTCCTGAGTGATCTCGAACAGGATCTGGTCCTTGAACTTCTGCAGCTGCGGGTTCTCTTCCACCTTGTTCTGAAGTTc < 2:821048/150‑1 (MQ=255) gggCTGCAGGCGCGCGCTACCGATG‑TCGAACATCGGTCGGTTCTCGGCATCCATGATCTGGATACGCAGGCCGTCCTGAGTGATCTCGAACAGGATCTGGTCCCTGAACTTCTGCAGCTGCGGGTTCTCTTCCACCTTGTTCTGCAggaa < 1:51776/150‑4 (MQ=255) cTGCAGGCGCGCGCTACCGATG‑TCGAACACCGGTCGGTTGTTGCTATTCATGATCTGGATACGCAGGCCGTCCTGGTTGATCTCGAACAGGATCTGGTCCTTGAACTTCTGCAGCTGCGGGTTCTCTTCCACCTTGTTCTGCAGTTCCTg < 1:1342478/150‑1 (MQ=255) agacAGGCGCGCGCTACCGATG‑TCGAACATCGGTCGGTTCTCGGCATCCATGATCTGGATACGCAGGCCGTCCTGAGTGATCTCGAACAGGATCTGGTCCTTGAACTTCTGCAGCTGCGGGTTCTCTTCCACCTTGTTCTGCAGTTCCTg > 1:684233/4‑150 (MQ=255) tGCAGGCGCGCGCTACCGATG‑TCGAACATCGGTCGGTTCTCGGCATCCATGATCTGGATACGCAGGCCGTCCTGAGTGATCTCGAACAGGATCTGGTCCTTGAACTTCTGCAGCTGCGGGTTCTCTTCCACCTTGTTCTGCAGTTCCTgc < 1:464019/150‑1 (MQ=255) cgcgcTCCCGATG‑TCGAACATCGGTCGGTTCTCGGCATCCATGATCTGGATACGCAGGCCGTCCTGAGTGATCTCGAACAGGATCTGGTCCTTGAACTTCTGCAGCTGCGGGTTCTCTTCCACCTTGTTCTGCAGGAACTgcagaacaag < 2:2399684/150‑7 (MQ=255) cgaCCGATGTTCG‑ACATCGGTCGGTTCTCGGCATCCATGATCTGGATACGCAGGCCGTCCTGAGTGATCTCGAACTTCATCTGGTCCTTGAACTTCTGCAGCTGCGCGCATCCCTCCACCTTGGTCTGCAGTTCCTGCAGCAACAGCTcc > 1:532981/3‑150 (MQ=255) tACCGATG‑TCGAACATCGGTCGGTTCTCGGCATCCATGATCTGGATACGCAGGCCGTCCTGAGTGATCTCGAACAGGATCTGGTCCTTGAACTTCt > 1:1677380/1‑96 (MQ=255) tACCGATG‑TCGAACATCGGTCGGTTCTCGGCATCCATGATCTGGATACGCAGGCCGTCCTGAGTGATCTCGAACAGGATCTGGTCCTTGAACTTCt < 2:1677380/96‑1 (MQ=255) gaCCGATG‑TTCGACATCGGTCGGTTCTCGGCATCCATGATCTGGATACGCAGGCCGTCCTGAGTGATCTCGAACAGGATCTGGTCCTTGAACTTCTGCAGCTGCGGGTTCTCTTCCACCTTGTTCTGCAGTTCCTGCAGCAACAGCTCCa > 2:833829/2‑150 (MQ=255) ccGATG‑TCGAACATCGGTCGGTTCTCGGCATCCATGATCTGGATACGCAGGCCGTCCTGa > 1:2362793/1‑60 (MQ=255) ccGATG‑TCGAACATCGGTCGGTTCTCGGCATCCATGATCTGGATACGCAGGCCGTCCTGa < 2:2362793/60‑1 (MQ=255) cGATG‑TCGAACATCGGTCGGTTCTCGGCATCCATGATCTGGATACGCAGGCCGTCCTGAGTGATCTCGAACAGGATCTGGTCCTTGAACTTCTGCAGCTGCGGGTTCTCTTCCACCTTGTTCTGCATTTCCTGCAGCAACAGCTCCAGAc > 2:76943/1‑150 (MQ=255) cGATG‑TCGAACATCGGTCGGTTCTCGGCATCCATGATCTGGATACGCAGGCCGTCCTGAGTGATCTCGAACAGGATCTGGTCCTTGAACTTCTGCAGCTGCGGGTTCTCTTCCACCTTGTTCTGCAGTTCCTGCAGCAACAGCTCCAGAc < 1:825122/150‑1 (MQ=255) gATG‑TCGAACATCGGTCGGTTCTCGGCATCCATGATCTGGATACGCAGGCCGTCCTGAGTGATCTCGAACAGGATCTGGTCCTTGAACTTCTGCAGCTGCGGGTTCTCTTCCACCTTGTTCTGCAGTTCCTGCAGCAACAGCTc < 2:724070/144‑1 (MQ=255) gATG‑TCGAACATCGGTCGGTTCTCGGCATCCATGATCTGGATACGCAGGCCGTCCTGAGTGATCTCGAACAGGATCTGGTCCTTGAACTTCTGCAGCTGCGGGTTCTCTTCCACCGTGTTCTGCAGTTCCTGCAGCAACAGCTc > 1:724070/1‑144 (MQ=255) | CCCAGTTACCGTATTCGCCAGTGCCGGCATACGGCTTGGCATCGGTATGGCCGCTGATGCTGACCTTGTTCGGCACCGCCTTGATGGTGTCAGCCATGGCCAGCAGGATATCTTCGAAGTAGGGCTGCAGGCGCGCGCTACCGATG‑TCGAACATCGGTCGGTTCTCGGCATCCATGATCTGGATACGCAGGCCGTCCTGAGTGATCTCGAACAGGATCTGGTCCTTGAACTTCTGCAGCTGCGGGTTCTCTTCCACCTTGTTCTGCAGTTCCTGCAGCAACAGCTCCAGAC > NC_002947/5574693‑5574983 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |