| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,798,204:1 | +C | 6.3% | coding (85/1128 nt) | lpxB → | lipid‑A‑disaccharide synthase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,798,204 | 1 | . | C | 6.3% | 380.9 / 19.0 | 95 | coding (85/1128 nt) | lpxB | lipid‑A‑disaccharide synthase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (50/39); new base C (3/3); total (53/42) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.35e-01 | |||||||||||
ACACCCTGAGGTCGAGCTGTTCCGTCAGTCGATCCTGAGCTCCGCTCGCGGCATCACGCGCTGATATGGCCCAGCTTTGCGTAGCGCTGGTCGCCGGTGAGGCCAGTGGCGATATCCTTGGTTCAGGCTTGATGCGTGCCCTCAAGGCGC‑GCCA‑CCCCGACGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATGGAGCGCCTGGCCGTCATGGGGCTAGTCGAGGTACTGGGGCGCCTGCGCGAACTGCTCAAGCGCCGCAAG > NC_002947/1798055‑1798350 | acacCCTGAGGTCGAGCTGTTCCGTCAGTCGATCCTGAGCTCCGCTCGCGGCATCACGCGCTGATATGGCCCAGCTTTGCGTAGCGCTGGTCGCCGGTGAGGCCAGTGGCGATATCCTTGGTTCAGGCTTGATGCGTGCCCTCAAGgcgc < 2:2268694/150‑1 (MQ=255) ccTGAGGTCGAGCTGTTCCGTCAGTCGATCCTGAGCTCCGCTCGCGGCATCACGCGCTGATATGGCCCAGCTTTGCGTAGCGCTGGTCGCCGGTGAGGCCAGTGGCGATATCCTTGGTTCAGGCTTGATGCGTGCCCTCAAGGCGC‑GCCa > 1:35057/1‑150 (MQ=255) tGAGGTCGAGCTGTTCCGTCAGTCGATCCTGAGCTCCGCTCGCGGCATCACGCGCTGATATGGCCCAGCTTTGCGTAGCGCTGGTCGCCGGTGAGGCCAGTGGCGATATCCTTGGTTCAGGCTTGATGCGTGCCCTCAAGGCGC‑GCCA‑cc < 2:1588621/150‑1 (MQ=255) tGAGGTCGAGCTGTTCCGTCAGTCGATCCTGAGCTCCGCTCGCGGCATCACGCGCTGATATGGCCCAGCTTTGCGTAGCGCTGGTCGCCGGTGAGGCCAGTGGCGATATCCTTGGTTCAGGCTTGATGCGTGCCCTCAAGGCGC‑GCCA‑cc > 2:444884/1‑150 (MQ=255) gAGCTGTTCCGTCAGTCGATCCTGAGCTCCGCTCGCGNCATCACGCGNTGATATGGCCCAGCTTTGCGTAGCGCGGGTACCCGGCGAGGCCAGTGGCGATATCCTTATCTGCTGCGCGATGCGTGCCCTCCAGGCTC‑GCCA‑CCACGACGt > 1:367440/1‑150 (MQ=255) aGCTGTTCCGTCAGTCGATCCTGAGCTCCGCTCGCGGCATCACGCGCTGATATGGCCCAGCTTTGCGTAGCGCTGGTCGCCGGTGAGGCCAGTGGCGATATCCTTGGTTCAGGCTTGATGCGTGCCCTCAAGGCGC‑GCCA‑CCCCGACGTg > 2:1918494/1‑150 (MQ=255) gCTGTCCCGTCAGTCGATCCTGAGCTCCGCTCGCGGCATCACGCGCTGATATGGCCCAGCTTTGCGTAGCGCTGGTCGCCGGTGAGGCCAGTGGCGATATCCTTGGTTCAGGCTTGATGCGTGCCCTCAAGGCGC‑GCCA‑CCCCGACGTGc < 1:557164/150‑1 (MQ=255) ccGTCAGTCGATCCTGAGCTCCGCTCGCGGCATCACGCGCTGATATGGCCCAGCTTTGCGTAGCGCTGGTCGCCGGTGAGGCCAGTGGCGATATCCTTGGTTCAGGCTTGATGCGTGCCATCAAGGCGC‑GCCA‑CCCCGACGTGCGTTTCa > 2:780596/1‑150 (MQ=255) gTCAGTCGATCCTGAGCTCCGCTCGCGGCATCACGCGCTGATATGGCCCAGCTTTGCGTAGCGCTGGTCGCCGGTGAGGCCAGTGGCGATATCCTTGGTTCAGGCTTGATGCGTGCCCTCAAGGCGC‑GCCA‑CCCCGACGt > 2:2250867/1‑140 (MQ=255) gTCAGTCGATCCTGAGCTCCGCTCGCGGCATCACGCGCTGATATGGCCCAGCTTTGCGTAGCGCTGGTCGCCGGTGAGGCCAGTGGCGATATCCTTGGTTCAGGCTTGATGCGTGCCCTCAAGGCGC‑GCCA‑CCCCGACGt < 1:2250867/140‑1 (MQ=255) aGTCGATCCTGAGCTCCGCTCGCGGCATCACGCGCTGATATGGCCCAGCTTTGCGTAGCGCTGGTCGCCGGTGAGGCCAGTGGCGATATCCTTGGTTCAGGCTTGATGCGTGCCCTCAAGGCGC‑GCCA‑CCCCGACGTGCGTTTCATCggg < 2:621425/150‑1 (MQ=255) aGTCGATCCTGAGCTCCGCTCGCGGCATCACGCGCTGATATGGCCCAGCTTTGCGTAGCGCTGGTCGCCGGTGAGGCCAGTGGCGATATCCTTGGTTCAGGCTTGATGCGTGCCCTCAAGGCGC‑GCCA‑CCCCGACGTGCGTTTCATCggg < 2:1767527/150‑1 (MQ=255) aGTCGATCCTGAGCTCCGCTCGCGGCATCACGCGCTGATATGGCCCAGCTTTGCGTAGCGCTGGTCGCCGGTGAGGCCAGTGGCGATATCCTTGGTTCAGGCTTGATGCGTGCCCTCAAGGCGC‑GACA‑CCCCGACGTGCGTTTCATCggg < 2:2342670/150‑1 (MQ=255) tCGATCCTGAGCTCCGCTCGCGGCATCACGCGCTGATATGGCCCAGCTTTGCGTAGCGCTGGTCGCCGGTGAGGCCAGTGGCGATATCCTTGGTTCAGGCTTGATGCGTGCCCTCAAGGCGC‑GCCA‑CCCCGACGTGCGTTTCATCGGGGt > 1:958431/1‑150 (MQ=255) gatcagcagcttgcggcgcttgagcagttcgcgcaggcgccccagtaccgcgactagccccatgacggccaggcgctccatggggaaataggattgcaggccctcggcctcccTCAAGGCGC‑GCCA‑CCCCGACGTGCGTTTCATCGGGGt < 2:334724‑M1/37‑1 (MQ=255) gATCCTGAGCTCCGCTCGCGGCATCACGCGCTGATATGGCCCAGCTTTGCGTAGCGCTGGTCGCCGGTGAGGCCAGTGGCGATATTCTTGGTTCAGGCGTTATTCTATCCCTCAAGGCGC‑GCCA‑CCCCGACGTGCGTTTCATCGGGGTTg > 1:876577/1‑150 (MQ=255) aTCCTGAGCTCCGCTCGCGGCATCACGCGCTGATATGGCCCAGCTTTGCGTAGCGCTGGTCGCCGGTGAGGCCAGTGGCGATATCCTTGGTTCAGGCTTGATGCGTGCCCTCAAGGCGC‑GCCG‑CCCCGACGTGCGTTTCATCGGGGTTgg > 2:1787270/1‑150 (MQ=255) aGCTCCGCTCGCGGCATCACGCGCTGATATGGCCCAGCTTTGCGTAGCGCTGGTCGCCGGTGAGGCCAGTGGCGATATCCTTGGTTCAGGCTTGATGCGTGCCCTCAAGGCGC‑GCCA‑CCCCGACGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGccc > 1:781669/1‑150 (MQ=255) gCTCCGCTCGCGGCATCACGCGCTGATATGGCCCAGCTTTGCGTAGCGCTGGTCGCCGGTGAGGCCAGTGGCGATATCCTTGGTTCAGGCTTGATGCGTGCCCTCAAGGCGC‑GCCA‑CCCCGACGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGcccc > 2:1161073/1‑150 (MQ=255) cTCGCGGCATCACGCGCTGATATGGCCCAGCTTTGCGTAGCGCTGGTCGCTGGTGAGGCCAGTGGCGATATCCTTGGTTCAGGCTTGATGCGTGCCCTCAAGGCGC‑GCCA‑CCCCGACGTGCGCTTCCTCCGGGTCGGAGGcgcccgggag > 2:1320527/1‑144 (MQ=255) cTCGCGGCATCACGCGCTGATATGGCCCAGCTTTGCGTAGCGCTGGTCGCCGGTGAGGCCAGTGGCGATATCCTTGGTTCAGGCTTGATGCGTGCCCTCAAGGCGC‑GCCA‑CCCCGACGTGCGTTTCCTCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATg > 2:2254735/1‑150 (MQ=255) cTCGCGGCATCACGCGCTGATATGGCCCAGCTTTGCGTAGCGCTGGTCGCCGGTGAGGCCAGTGGCGATATCCTTGGTTCAGGCTTGATGCGTGCCCTCAAGGCGC‑GCCA‑CCCCGACGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATg > 1:1429226/1‑150 (MQ=255) gcttgagcagttcgcgcaggcgccccagtacctcgactagccccatgacggccaggcgctccatggggaaataggattgcaggccctcggcctcccTCAAGGCGC‑GCCA‑CCCCGACGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATgg > 1:334724‑M1/97‑150 (MQ=255) cgGCATCACGCGCTGATATGGCCCAGCTTTGCGTAGCGCTGGTCGCCGGTGAGGCCAGTGGCGATATCCTTGGTTCAGGCTTGATGCGTGCCCTCAAGGCGC‑GCCA‑CCCCGACGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAgg < 2:2218026/150‑1 (MQ=255) tCACGCGCTGATATGGCCCAGCTTTGCGTAGCGCTGGTCGCCGGTGAGGCCAGTGGCGATATCCTTGGTTCAGGCTTGATGCGTGCCCTCAAGGCGC‑GCCA‑CCCCGACGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAg < 2:1049855/150‑1 (MQ=255) aCGCGCTGATATGGCCCAGCTTTGCGTAGCGCTGGTCGCCGGTGAGGCCAGTGGCGATATCCTTGGTTCAGGCTTGATGCGTGCCCTCAAGGCGC‑GCCA‑CCCCGACGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAggg > 1:2063155/1‑150 (MQ=255) gcTGATATGGCCCAGCTTTGCGTAGCGCTGGTCGCCGGTGAGGCCAGTGGCGATATCCTTGGTTCAGGCTTGATGCGTGCCCTCAAGGCGC‑GCCA‑CCCCGACGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTg < 2:781669/150‑1 (MQ=255) gcTGATATGGCCCAGCTTTGCGTAGCGCTGGTCGCCGGTGAGGCCAGTGGCGATATCCTTGGTTCAGGCTTGATGCGTGCCCTCAAGGCGC‑GCCA‑CCCCGACGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTg > 2:1356124/1‑150 (MQ=255) tGGCCCAGCTTTGCGTAGCGCTGGTCGCCGGTGAGGCCAGTGGCGATATCCTTGGTTCAGGCTTGATGCGTGCCCTCAAGGCGC‑GCCA‑CCCCGACGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCt < 2:35057/150‑1 (MQ=255) gCCCAGCTTTGCGTAGCGCTGGTCGCCGGTGAGGCCAGTGGCGATATCCTTGGTTCAGGCTTGATGCGTGCCCTCAAGGCGC‑GCCA‑CCCCGACGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTAt < 2:2063155/150‑1 (MQ=255) cccAGCTTTGCGTAGCGCTGGTCGCCGGTGAGGCCAGTGGCGATATCCTGGGTTCAGGCTTGATGCGTGCCCTCAAGGCGC‑GCCA‑CCCCGACGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGCTGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTAtt > 2:86304/1‑150 (MQ=255) ccagtacctcgactagccccatgacggccaggcgctccatggggaaataggattgcaggccctcggcctccaTCAAGGCGC‑GCCA‑CCCCGACGTGCGTTTCATCGGGGTTgg > 2:1313665‑M1/73‑112 (MQ=255) ccagtacctcgactagccccatgacggccaggcgctccatggggaaataggattgcaggccctcggcctccaTCAAGGCGC‑GCCA‑CCCCGACGTGCGTTTCATCGGGGTTgg < 1:1313665‑M1/40‑1 (MQ=255) ccAGCTTTGCGTAGCGCTGGTCGCCGGTGAGGCCAGTGGCGATATCCTTGGTTCAGGCTTGATGCGTGCCCTCAAGGCGC‑GCCA‑CCCCGACGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTAttt > 1:2370748/1‑150 (MQ=255) ccAGCTTTGCGTAGCGCTGGTCGCCGGTGAGGCCAGTGGCGATATCCTTGGTTCAGGCTTGATGCGTGCCCTCAAGGCGC‑GCCA‑CCCCGACGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTAttt > 1:1930805/1‑150 (MQ=255) tGCGTAGCGCTGGTCGCCGGTGAGGCCAGTGGCGATATCCTTGGTTCAGGCTTGATGCGTGCCCTCAAGGCGC‑GCCA‑CCCCGACGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATg < 1:2290347/150‑1 (MQ=255) tGCGTAGCGCTGGTCGCCGGTGAGGCCAGTGGCGATATCCTTGGTTCAGGCTTGATGCGTGCCCTCAAGGCGC‑GCCA‑CCCCGACGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATg < 1:1288857/150‑1 (MQ=255) gTAGCGCTGGTCGCCGGTGAGGCCAGTGGCGATATCCTTGGTTCAGGCTTGATGCGTGCCCTCAAGGCGC‑GCCA‑CCCCGACGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAgg > 2:563055/1‑118 (MQ=255) gTAGCGCTGGTCGCCGGTGAGGCCAGTGGCGATATCCTTGGTTCAGGCTTGATGCGTGCCCTCAAGGCGC‑GCCA‑CCCCGACGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAgg < 1:563055/118‑1 (MQ=255) gTAGCGCTGGTCGCCGGTGAGGCCAGTGGCGATATCCTTGGTTCAGGCTTGATGCGTGCCCTCAAGGCGC‑GCCA‑CCCCGACGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCt < 1:691652/128‑1 (MQ=255) gTAGCGCTGGTCGCCGGTGAGGCCAGTGGCGATATCCTTGGTTCAGGCTTGATGCGTGCCCTCAAGGCGC‑GCCA‑CCCCGACGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCt > 2:691652/1‑128 (MQ=255) ctagccccatgacggccaggcgctccatggggaaataggattgcaggccctcggcctccaTCAAGGCGC‑GCCA‑CCCCGACGTGCGTTTCATCGGGGTTgg > 2:2404094‑M1/61‑100 (MQ=255) ctagccccatgacggccaggcgctccatggggaaataggattgcaggccctcggcctccaTCAAGGCGC‑GCCA‑CCCCGACGTGCGTTTCATCGGGGTTgg < 1:2404094‑M1/40‑1 (MQ=255) aGCGCTGGTCGCCGGTGAGGCCAGTGGCGATATCCTTGGTTCAGGCTTGATGCGTGCCCTCAAGGCGC‑GCCA‑CCCCGACGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATGGAgcg > 2:1968280/1‑150 (MQ=255) gcgcTGGTCGCCGGTGAGGCCAGTGGCGATATCCTTGGTTCAGGCTTGATGCGTGCCCTCAAGGCGC‑GCCA‑CCCCGACGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATGGAgcgc < 1:828278/150‑1 (MQ=255) cTGGTCGCCGGTGAGGCCAGTGGCGATATCCTTGGTTCAGGCTTGATGCGTGCCCTCAAGGCGC‑GCCA‑CCCCGACGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATGGAGCGCCTg < 1:444884/150‑1 (MQ=255) tGGTCGCCGGTGAGGCCAGTGGCGATATCCTTGGTTCAGGCTTGATGCGTGCCCTCAAGGCGC‑GCCA‑CCCCGACGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATGGAGCGCCTgg < 1:1320527/150‑1 (MQ=255) ccatgacggccaggcgctccatggggaaataggattgcaggccctcggcctccaTCAAGGGGCCGCCAACCCCGACGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGccc < 2:96540‑M1/48‑1 (MQ=255) ccatgacggccaggcgctccatggggaaataggattgcaggccctcggcctccaTCAAGGGGCCGCCAACCCCGACGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGccc > 1:96540‑M1/55‑102 (MQ=255) gTCGCCGGTGAGGCCAGTGGCGATATCCTTGGTTCAGGCTTGATGCGTGCCCTCAAGGCGC‑GCCA‑CCCCGACGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATGGAGCGCCTGGcc < 2:876577/150‑1 (MQ=255) tCGCCGGTGAGGCCAGTGGCGATATCCTTGGTCCAGCACCAGTCAGCCCAGTTAAGGCGC‑GCCA‑CCCCGACGGGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATGGAGCGCCTGGCCg > 1:1616704/1‑150 (MQ=255) ggTGAGGCCAGTGGCGATATCCTTGGTTCAGGCTTGATGCGTGCCCTCAAGGCGC‑GCCA‑CCCCGACGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATGGAGCGCCTGGCCGTCATg < 2:1725402/150‑1 (MQ=255) ggTGAGGCCAGTGGCGATATCCTTGGTTCAGGCTTGATGCGTGCCCTCAAGGCGC‑GCCA‑CCCCGACGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATGGAGCGCCTGGCCGTCATg > 2:88675/1‑150 (MQ=255) gTGAGGCCAGTGGCGATATCCTTGGTTCAGGCTTGATGCGTGCCCTCAAGGCGC‑GCCA‑CCCCGACGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCGATGGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATGGAGCGCCTGGCCGTCATgg > 1:1595257/1‑150 (MQ=255) gTGAGGCCAGTGGCGATATCCTTGGTTCAGGCTTGATGCGTGCCCTCAAGGCGC‑GCCA‑CCCCGACGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATGGAGCGCCTGGCCGTCATgg < 1:1918494/150‑1 (MQ=255) gTGAGGCCAGTGGCGATATCCTTGGTTCAGGCTTGATGCGTGCCCTCAAGGCGC‑GCCA‑CCCCGACGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATGGAGCGCCTGGCCGTCATgg < 1:88675/150‑1 (MQ=255) gTGAGGCCAGTGGCGATATCCTTGGTTCAGGCTTGATGCGTGCCCTCAAGGCGC‑GCCA‑CCCCGACGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATGGAGCGCCTGGCCGTCATgg < 2:1429226/150‑1 (MQ=255) 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ccAGTGGCGATATCCTTGGTTCAGGCTTGATGCGTGCCCTCAAGGCGC‑GCCA‑CCCCGACGTGCGt < 1:1086851/65‑1 (MQ=255) cAGTGGCGATATCCTTGGTTCAGGCTTGATGCGTGCCCTCAAGGCGC‑GCCA‑CCCCGACGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATGGAGCGCCTGGCCGTCATGGGGCTAGt > 1:782126/1‑150 (MQ=255) gTGGCGATATCCTTGGTTCAGGCTTGATGCGTGCCCTCAAGGCGC‑GCCA‑CCCCGACGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATGGAGCGCCTGGCCGTCATGGGGCTAGTCg > 1:326920/1‑150 (MQ=255) gTGGCGATATCCTTGGTTCAGGCTTGATGCGTGCCCTCAAGGCGC‑GCCA‑CCCCGACGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATGGAGCGCCTGGCCGTCATGGGGCTAGTCg > 2:1584207/1‑150 (MQ=255) ggCGATATCCTTGGTTCAGGCTTGATGCGTGCCCTCAAGGCGC‑GCCA‑CCCCGACGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATGGAGCGCCTGGCCGTCATGGGGCTAGTCGAg < 1:775078/150‑1 (MQ=255) gATATCCTTGGTTCAGGCTTGATGCGTGCCCTCAAGGCGC‑GCCA‑CCCCGACGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCGTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATGGAGCGCCTGGCCGTCATGGGGCTAGTCGAGGTa > 2:1042930/1‑150 (MQ=255) ccTTGGTTCAGGCTTGATGCGTGCCCTCAAGGCGC‑GCCA‑CCCCGACGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATGGAGCGCCTGGCCGTCATGGGGCTAGTCGAGGTACTggg > 2:359142/1‑150 (MQ=255) cTTGGTTCAGGCTTGATGCGTGCCCTCAAGGCGC‑GCCA‑CCCCGACGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGGTGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATGGAGCGCCTGGCCGTCATGGGGCTAGTCGAGGTACTgggg > 1:1380501/1‑150 (MQ=255) cTTGGTTCAGGCTTGATGCGTGCCCTCAAGGCGC‑GCCA‑CCCCGACGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATg < 2:2217928/111‑1 (MQ=255) cTTGGTTCAGGCTTGATGCGTGCCCTCAAGGCGC‑GCCA‑CCCCGACGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATg > 1:2217928/1‑111 (MQ=255) cTTGGTTCAGGCTTGATGCGTGCCCTCAAGGCGC‑GCCA‑CCCCGACGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATGGAGCGCCTGGCCGTCATgg > 2:2224627/1‑130 (MQ=255) cTTGGTTCAGGCTTGATGCGTGCCCTCAAGGCGC‑GCCA‑CCCCGACGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATGGAGCGCCTGGCCGTCATgg < 1:2224627/130‑1 (MQ=255) cTTGGTTCAGGCTTAATGCGTGCCCTCAAGGCGC‑GCCA‑CCCCGACGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATGGAGCGCCTGGCCGTCATGGGGCTAGTCGAGGTACTgggg > 2:1890045/1‑150 (MQ=255) ttGGTTCAGGCTTGATGCGTGCCCTCAAGGCGC‑GCCA‑CCCCGACGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATGGAGCGCCTGGCCGTCATGGGGCTAGTCGAGGTACTGGGgc > 2:1964411/1‑150 (MQ=255) ttGGTTCAGGCTTGATGCGTGCCCTCAAGGCGC‑GCCA‑CCCCGACGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAGGGACGGCAATCCTATTTCCCCAGGGAGCGCCTGGCCGTCATGGGGCTAGTCGAAGCACTGGGgc > 2:851654/1‑150 (MQ=255) ttCAGGCTTGATGCGTGCCCTCAAGGCGC‑GCCA‑CCCCGACGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATGGAGCGCCTGGCCGTCATGGGGCTAGTCGAGGTACTGGGGCGCCt > 1:997210/1‑150 (MQ=255) aGGCTTGATGCGTGCCCTCAAGGCGC‑GCCA‑CCCCGACGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATGGAGCGCCTGGCCGTCATGGGGCTAGTCGAGGCACTGGGGCGCCTgcg > 2:1120633/1‑150 (MQ=255) ggCTTGATGCGTGCCCTCAAGGCGC‑GCCA‑CCCCGACGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATGGAGCGCCTGGCCGTCATGGGGCTAGTCGAGGTACTGGGGCGCCTgcgc > 2:1580025/1‑150 (MQ=255) ttGATGCGTGCCCTCAAGGCGC‑GCCA‑CCCCGACGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATGGAGCGCCTGGCCGTCATGGGGCTAGTCGAGGTACTGGGGCGCCTGCGCGaa < 1:1584207/150‑1 (MQ=255) tGATGCGTGCCCTCAGGGCGC‑GCCA‑CCCCGACGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTcc < 2:2448733/93‑1 (MQ=255) tGATGCGTGCCCTCAGGGCGC‑GCCA‑CCCCGACGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTcc > 1:2448733/1‑93 (MQ=255) tGATGCGTGCCCTCAAGGCGC‑GCCA‑CCCCGACGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTcc < 2:1178829/93‑1 (MQ=255) tGATGCGTGCCCTCAAGGCGC‑GCCA‑CCCCGACGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTcc > 1:1178829/1‑93 (MQ=255) tGCGTGCCCTCAAGGCGC‑GCCA‑CCCCGACGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATGGAGCGCCTGGCCGTCATGGGGCTAGTCGAGGTACTGGGGCGCCTGCGCGAACTGc < 1:1445949/150‑1 (MQ=255) cGTGCCCTCAAGGCGC‑GCCA‑CCCCGACGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATGGAGCGCCTGGCCGTCATGGGGCTAGTCGAGGTACTGGGGCGCCTGCGCGAACTGCTc < 1:1890045/150‑1 (MQ=255) tgccaTCAAGGCGC‑GCCA‑CCACGACGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTCGACGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATAGAGCGCCTGGCCGTCATGGGGCTAGTCGAGGTACTGGGGCGCCTGCGCGAACTGGTCaa > 2:367440‑M1/6‑150 (MQ=255) tGCCCTCAAGGCGC‑GCCA‑CCCCGACGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATGGAGCGCCTGGCCGTCATGGGGCTAGTCGAGGTACTGGGGCGCCTGCGCGAACTGCTCaa < 2:958431/150‑1 (MQ=255) cccTCAAGGCGC‑GCCA‑CCCCGACGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATGGAGCGCCTGGCCGTCATGGGGCTAGTCGAGGTACTGGGGCGCCTGCGCGAACTGCTCAAgc < 1:28102/150‑1 (MQ=255) cTCAAGGCGC‑GCCA‑CCCCGACGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATGGAGCGCCTGGCCGTCATGGGGCTAGTCGAGGTACTGGGGCGCCTGCGCGAACTGCTCAAgcgc > 1:2140138/1‑150 (MQ=255) cTCAAGGCGC‑GCCA‑CCCCGACGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATGGAGCGCCTGGCCGTCATGGGGCAAGTCGAGGTACTGGGGCGCCTGCGCGAACTGCTCAAgcgc > 2:1485628/1‑150 (MQ=255) TCAAGGCGC‑GCCA‑CCCCGACGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAAGCGGAGGTAGGTTAAGCCTACTTTAACATGGAGCGCCTGGCCGTCATGGGGCTAGTCGAGGTACTGGGGCGCCTGCGCGAACTGCTCAAGcgcc > 1:1356124‑M1/1‑150 (MQ=255) GCGC‑GCCA‑CCCCGACGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATGGAGCGCCTGGCCGTCATGGGGCTAGTCGAGGTACTGGGGCGCCTGCGCGAACTGCTCAAGCGCCGCAAg < 2:589152‑M1/150‑1 (MQ=255) | ACACCCTGAGGTCGAGCTGTTCCGTCAGTCGATCCTGAGCTCCGCTCGCGGCATCACGCGCTGATATGGCCCAGCTTTGCGTAGCGCTGGTCGCCGGTGAGGCCAGTGGCGATATCCTTGGTTCAGGCTTGATGCGTGCCCTCAAGGCGC‑GCCA‑CCCCGACGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATGGAGCGCCTGGCCGTCATGGGGCTAGTCGAGGTACTGGGGCGCCTGCGCGAACTGCTCAAGCGCCGCAAG > NC_002947/1798055‑1798350 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |