| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,447,098:1 | +A | 10.0% | coding (444/1011 nt) | nagZ → | beta‑N‑acetylglucosaminidase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,447,098 | 1 | . | A | 10.0% | 245.9 / 23.9 | 70 | coding (444/1011 nt) | nagZ | beta‑N‑acetylglucosaminidase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (36/27); new base A (5/2); total (41/29) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.91e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.28e-01 | |||||||||||
CAGTGCGGCTGGCTGATGGCGACCGAGGTGCTGGCGGTTGGCCTGGACCTCAGCTTCGCTCCGGTGCTCGACCTGGACCACCAGCGTAGCGCCGTGGTGGGCAGCCGCGCGTTCGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCC‑GGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAGCATTTCCCGGGGCATGGCTGGGCCGAAGCCGATTCGCACGTGGCCATCCCCACTGATGAACGCAGCCTGGAACAACTGCGCCAGTCCGACCTGGTGCC > NC_002947/2446952‑2447247 | cAGTGCGGCTGGCTGATGGCGACCGAGGTGCTGGCGGTTGGCCTGGACCTCAGCTTCGCTCCGGTGCTCGACCTGGACCACCAGCGTAGCGCCGTGGTGGGCAGCCGCGCGTTCGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCC‑Ggc < 1:1138674/150‑1 (MQ=255)cAGTGCGGCTGGCTGATGGCGACCGAGGTGACGGTGTTTTGCCTGGACCTCAGCTTCGGTCCGGTGCTCGACCTGGACCACCAGCGTAGCGCCGTGGTGGGCAGCCGCGCGTTCGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCC‑Ggc < 2:564855/150‑1 (MQ=255) tggctgATGGCGACCGAGGTGCTGGCGGTTGGCCTGGACCTCAGCTTCGCTCCGGTGCTCGACCTGGACCACCAGCGTAGCGCCGTGGTGGGCAGCCGCGCGTTCGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCC‑GGCGCGTTCATc > 2:603655/1‑150 (MQ=255) tggctgATGGCGACCGAGGTGCTGGCGGTTGGCCTGGACCTCAGCTTCGCTCCGGTGCTCGACCTGGACCACCAGCGTAGCGCCGTGGTGGGCAGCCGCGCGTTCGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCC‑GGCGCGTTCATc > 2:528989/1‑150 (MQ=255) tgATGGCGACCGAGGTGCTGGCGGTTGGCCTGGACCTCAGCTTCGCTCCGGTGCTCGACCTGGACCACCAGCGTAGCGCCGTGGTGGGCAGCCGCGCGTTCGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCC‑GGCGCGTTCATCCGTg > 2:2120443/1‑150 (MQ=255) ggCGACCGAGGTGCTGGCGGTTGGCCTGGACCTCAGCTTCGCTCCGGTGCTCGACCTGGACCACCAGCGTAGCGCCGTGGTGGGCAGCCGCGCGTTCGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCC‑GGCGCGTTCATCCGTGGCAt < 1:2089053/150‑1 (MQ=255) gCGACCGAGGTGCTGGCGGTTGGCCTGGACCTCAGCTTCGCTCCGGTGCTCGACCTGGACCACCAGCGTAGCGCCGTGGTGGGCAGCCGCGCGTTCGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCC‑GGCGCGTTCATCCGTGGCATg > 2:2141884/1‑150 (MQ=255) aCCGAGGTGCTGGCGGTTGGCCTGGACCTCAGCTTCGCTGCGGTCCGCGACCTGGACCACCGTCGTAGCGCCGTGGTGGGCAGCCGCGCGTTCGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCC‑GGCGCGTTCATCCGTGCCAtcact > 2:694354/1‑146 (MQ=255) aCCGAGGTGCTGGCGGTTGGCCTGGACCTCAGCTTCGCTCCGGTGCTCGACCTGGACCACCAGCGTAGCGCCGTGGTGGGCAGCCGCGCGTTCGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCC‑GGTGCGTTCATCCGTGGCATGAAt > 2:440044/1‑150 (MQ=255) aCCGAGGTGCTGGCGGTTGGCCTGGACCTCAGCTTCGCTCCGGTGCTCGACCTGGACCACCAGCGTAGCGCCGTGGTGGGCAGCCGCGCGTTCGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCC‑GGCGCGTTCATCCGTGGCATGAAt < 2:1448707/150‑1 (MQ=255) ccGAGGTGCTGGCGGTTGGCCTGGACCTCAGCTTCGCTCCGGTGCTCGACCTGGACCACCAGCGTAGCGCCGTGGTGGGCAGCCGCGCGTTCGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCC‑GGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATg > 2:1576560/1‑150 (MQ=255) gTGCTGGCGGTTGGCCTGGACCTCAGCTTCGCTCCGGTGCTCGACCTGGACCACCAGCGTAGCGCCGTGGTGGGCAGCGCAGCGGGGGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCC‑GGCGCGTTAATCCGTAGCATTAATgcggcg > 1:1332281/1‑150 (MQ=255) tGCTGGCGGTTGGCCTGGACCTCAGCTTCGCTCCGGTGCTCGACCTGGACCACCAGCGTAGCGCCGTGGTGGGCAGCCGCGCGTTCGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCC‑GGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGcggcgg < 1:1053847/150‑1 (MQ=255) tGCTGGCGGTTGGCCTGGACCTCAGCTTCGCTCCGGTGCTCGACCTGGACCACCAGCGTAGCGCCGTGGTGGGCAGCCGCGCGTTCGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCC‑GGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGcggcgg < 1:434308/150‑1 (MQ=255) gCGGTTGGCCTGGACCTCAGCTTCGCTCCGGTGCTCGACCTGGACCACCAGCGTAGCGCCGTGGTGGGCAGCCGCGCGTTCGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCC‑GGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATg < 1:1792286/150‑1 (MQ=255) gCCTGGACCTCAGCTTCGCTCCGGTGCTCGACCTGGACCACCAGCGTAGCGCCGTGGTGGGCAGCCGCGCGTTCAAGTCCGGCCTGCGGCGTGCAACGCGCCTGGCC‑GGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCt > 2:1380633/1‑150 (MQ=255) cTGGACCTCAGCTTCGCTCCGGTGCTCGACCTGGACCACCAGCGTAGCGCCGTGGTGGGCAGCCGCGCGTTCGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCC‑GGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCtgt > 2:594071/1‑150 (MQ=255) cTGGACCTCAGCTTCGCTCCGGTGCTCGACCTGGACCACCAGCGTAGCGCCGTGGTGGGCAGCCGCGCGTTCGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCC‑GGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCtgt > 2:737448/1‑150 (MQ=255) cTGGACCTCAGCTTCGCTCCGGTGCTCGACCTGGACCACCAGCGTAGCGCCGTGGTGGGCAGCCGCGCGTTCGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCC‑GGCCAGGCGCGttgca > 1:1894851/1‑113 (MQ=255) cTGGACCTCAGCTTCGCTCCGGTGCTCGACCTGGACCACCAGCGTAGCGCCGTGGTGGGCAGCCGCGCGTTCGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCC‑GGCCAGGCGCGttgca > 1:1899420/1‑113 (MQ=255) cTGGACCTCAGCTTCGCTCCGGTGCTCGACCTGGACCACCAGCGTAGCGCCGTGGTGGGCAGCCGCGCGTTCGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCC‑GGCCAGGCGCGttgca < 2:1899420/116‑4 (MQ=255) cTGGACCTCAGCTTCGCTCCGGTGCTCGACCTGGACCACCAGCGTAGCGCCGTGGTGGGCAGCCGCGCGTTCGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCC‑GGCCAGGCGCGttgca < 2:1894851/116‑4 (MQ=255) tGGACCTCAGCTTCGCTCCGGTGCTCGACCTGGACCACCAGCGTAGCGCCGTGGTGGGCAGCCGCGCGTTCGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCC‑GGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCtgtg > 2:290730/1‑150 (MQ=255) ggACCTCAGCTTCGTCCCGGTGCTCGACCTGGACCACCAGCGTAGACCCCTGGTGGGCAGCCGCGCGTTCGAGGGTGCCCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCC‑GGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTgg < 1:1453957/150‑1 (MQ=255) cAGCTTCGCTCCGGTGCTCGACCTGGACCACCAGCGTAGCGCCGTGGTGGGCAGCCGCGCGTTCGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCC‑GGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAGCa > 2:1989677/1‑150 (MQ=255) cTTCGCTCCGGTGCTCGACCTGGACCACCAGCGTAGCGCCGTGGTGGGCAGCCGCGCGTTCGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCC‑GGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAGCAttt > 1:1457606/1‑150 (MQ=255) ttCGCTGCGGGGCGCGACCTGGACCACCAGCGTAGCGCCGTGGTGGGCAGCCGCGCGTTCGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCC‑GGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAGCATTTc > 2:1172732/1‑150 (MQ=255) cTCCGGTGCTCGACCTGGACCACCAGCGTAGCGCCGTGGTGGGCAGCCGCGCGTTCGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCC‑GGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAGCATTTCCCgg < 1:737448/150‑1 (MQ=255) cTCCGGTGCTCGACCTGGACCACCAGCGTAGCGCCGTGGTGGGAAGCCGCGCGTTCGAGGTTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCC‑GGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAGCATTTCCCgg < 2:2099467/150‑1 (MQ=255) tCCGGTGCTCGACCTGGACCACCGGCGTAGCGCCGTGGTGGGCAGCCGCGCGTTCGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCC‑GGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGACCGCCTGTGGCAAGCATTTCACggg > 2:1191040/1‑150 (MQ=255) ccGGTGCTCGACCTGGACCACCAGCGTAGCGCCGTGGTGGGCAGCCGCGCGTTCGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCC‑GGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAGCATTTCCCgggg < 1:2141884/150‑1 (MQ=255) tCGACCTGGACCACCAGCGTAGCGCCGTGGTGGGCAGCCGCGCGTTCGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCC‑GGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAGCATTTCCCGGGGCATGGCt > 2:2379944/1‑150 (MQ=255) ccTGGACCACCAGCGTAGCGCCGTGGTGGGCAGCCGCGCGTTCGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCC‑GGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAGCATTTCCCGGGGCATGGCTGGGc > 1:1246941/1‑150 (MQ=255) ccTGGACCACCAGCGTAGCGCCGTGGTGGGCAGCCGCGCGTTCGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGAGCATGCGT‑GGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAGCATTTCCCGGGGCATGGCTGGGc < 1:2120443/150‑1 (MQ=255) cTGGACCACCAGCGTAGCGCCGTGGTGGGCAGCCGCGCGTTCGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCC‑GGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAGCATTTCCCGGGGCATGGCTGGGcc < 1:1576560/150‑1 (MQ=255) ggACCACCAGCGTAGCGCCGTGGTGGGCAGCCGCGCGTTCGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCC‑GGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAGCATTTCCCGGGGCATGGCTGGGCCGa > 2:2289176/1‑150 (MQ=255) ggACCACCAGCGTAGCGCCGTGGTGGGCAGCCGCGCGTTCGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCC‑GGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAGCATTTCCCGGGGCATGGCTGGGCCGa > 1:879119/1‑150 (MQ=255) gACCACCAGCGTAGCGCCGTGGTGGGCAGCCGCGCGTTCGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTCGAC‑GGCAGGTTCATCCGTGGTGGGAAGGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAGCATTTCCCGGGGCATGGCTGGGCCGaa < 1:290730/150‑1 (MQ=255) ccaGCGTAGCGCCGTGGTGGGCAGCCGCGCGTTCGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCC‑GGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAGCATTTCCCGGGGCATGGCTGGGCCGAAGCCGa > 2:104460/1‑150 (MQ=255) ccaGCGTAGCGCCGTGGTGGGCAGCCGCGCGTTCGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCC‑GGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAGCATTTCCCGGGGCATGGCTGGGCCGAAGCCGa > 1:2326967/1‑150 (MQ=255) ccaGCGTAGCGCCGTGGTGGGCAGCCGCGCGTTCGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCC‑GGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAGCATTTCCCGGGGCATGGCTGGGCCGAAGCCGa > 2:2041138/1‑150 (MQ=255) caGCGTAGCGCCGTGGTGGGCAGCCGCGCGTTCGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCC‑GGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAGCATTTCCCGGGGCATGGCTGGGCCGAAGCCGAt > 1:1212562/1‑150 (MQ=255) caGCGTAGCGCCGTGGTGGGCAGCCGCGCGTTCGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCC‑GGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAGCATTTCCCGGGGCATGGCTGGGCCGAAGCCGAt > 1:211505/1‑150 (MQ=255) aGCGTAGCGCCGTGGTGGGCAGCCGGGACTGCGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCC‑GGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAGCATTTCCCGGGGCATGGCTGGGCCGAAGCCGAtt < 1:603655/150‑1 (MQ=255) ccGTGGTGGGCAGCCGCGCGTTCGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCC‑GGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAGCATTTCCCGGGGCATGGCTGGGCCGAAGCCGATTCGCACGTgg > 1:75422/1‑150 (MQ=255) tggtggGCAGCCGCGCGTTCGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCC‑GGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAGCATTGGCCGGGGCATGGCTGGGCCGAAGCCGATTCGCACGTGGCCa > 1:391705/1‑150 (MQ=255) gCCGCGCGTTCGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCC‑GGTGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAGCATTTCCCGGGGCATGGCTGGGCCGAAGCCGATTCGCACGTGGCCATCCCCACtg < 1:440044/150‑1 (MQ=255) ccGCGCGTTCGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCC‑GGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAGCATTTCCCGGGGCATGGCTGGGCCGAAGCCGATTCGCACGTGGCCATCCCCACtga < 2:1457606/150‑1 (MQ=255) cgcgcgTTCGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCC‑GGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAGCATTTCCCGGGGCATGGCTGGGCCGAAGCCGATTCGCACGTGGCCATCCCCACtgat < 1:2041138/150‑1 (MQ=255) cgTTCGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCC‑GGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAGCATTTCCCGGGGCATGGCTGGGCCGAAGCCGATTCGCACGTGGCCATCCCCACTGATGAAc < 1:2257466/150‑1 (MQ=255) tCGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCC‑GGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAGCATTTCCCGGGGCATGGCTGGGCCGAAGCCGATTCGCACGTGGCCATCCCCACTGATGAACGCa > 2:319607/1‑150 (MQ=255) gAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCC‑GGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAGCATTTCCCGGGGCATGGCTGGGCCGAAGCCGATTCGCACGTGGCCATCCCCACTGATGAACGCAGc > 2:714198/1‑150 (MQ=255) ggTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCC‑GGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAGCATTTCCCGGGGCATGGCTGGGCCGAAGCCGATTCGCACGTGGCCATCCCCACTGATGAACGCAGCCTg > 1:1854247/1‑150 (MQ=255) gACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCC‑GGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAGCATTTCCCGGGGCATGGCTGGGCCGAAGCCGATTCGCACGTGGCCATCCCCACTGATGAACGCAGCCTGGaa < 1:1989677/150‑1 (MQ=255) cccGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCC‑GGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAGCATTTCCCGGGGCATGGCTGGGCCGAAGCCGATTCGCACGTGGCCATCCCCACTGATGAACGCAGCCTGGaaca > 2:2129714/1‑150 (MQ=255) ccGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCC‑GGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAGCATTTCCCGTGGCATGGCTGGGCCGAAGCCGATTCGCACGTGGCCATCCCCACTGATGAACGCAGCCTGGaacaa > 2:462096/1‑150 (MQ=255) ccGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCC‑GGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAGCATTTCCCGGGGCATGGCTGGGCCGAAGCCGATTCGCACGTGGCCATCCCCACTGATGAACGCAGCCTGGaacaa > 1:2094405/1‑150 (MQ=255) ccGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCC‑GGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAGCATTTCCCGGGGCATGGCTGGGCCGAAGCCGATTCGCACGTGGCCATCCCCACTGATGAACGCAGCCTGGaacaa > 2:914185/1‑150 (MQ=255) tgctTGCAACGCGCCTGGCC‑GGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAGCATTTCCCGGGGCATGGCTGGGCCGAAGCCGATTCGCACGTGGCCATCCCCACTGATGAACGCAGCCTGGAACAACTgc < 1:1172732/150‑1 (MQ=255) ctTGCAACGCGCCTGGCC‑GGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAGCATTTCCCGGGGCATGGCTGGGCCGAAGCCGATTCGCACGTGGCCATCCCCACTGATGAACGCAGCCTGGAACAACTgcgc < 1:2379944/150‑1 (MQ=255) ctTGCAACGCGCCTGGCC‑GGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAGCATTTCCCGGGGCATGGCTGGGCCGAAGCCGATTCGCACGTGGCCATCCCCACTGATGAACGCAGCCTGGAACAACTgcgc < 1:2329682/150‑1 (MQ=255) ttGCAACGCGCCTGGCC‑GGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTgg < 1:217391/64‑1 (MQ=255) ttGCAACGCGCCTGGCC‑GGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTgg > 2:217391/1‑64 (MQ=255) ggCAACTCGCCTGGCC‑GGCGCCTTCATCAGTGGCATGCATGCGGTGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAGCATTTCCCGGGGCATGGCTGGGCCGAAGCCGATTCGCACGTGGCCATCCCCACTGATGAACGCAGCCTGGAACAACTGCGCCa < 2:391705/149‑1 (MQ=255) gCAACGCGCCTGGCC‑GGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAGCATTTCCCGGGGCATGGCTGGGCCGAAGCCGATTCGCACGTGGCCATCCCCACTGATGAACGCAGCCTGGAACAACTGCGCCAg > 2:467435/1‑150 (MQ=255) gaaCGCGCC‑GGCCAGGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAGCATTTCCCGGGGCATGGCTGGGCCGAAGCCGATTCGCACGTGGCCATCCCCACTGATGAACGCAGCCTGGAACAACTGCGCCAGt > 1:1597095/2‑150 (MQ=255) aCGCGCC‑GGCCAGGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAGCATTTCCCGGGGCATGGCTGGGCCGAAGCCGATTCGCACGTGGCCATCCCCACTGATGAACGCAGCCTGGAACAACTGCGCCAGTcc > 2:1464382/1‑150 (MQ=255) aCGCGCC‑GGCCAGGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAGCATTTCCCGGGGCATGGCTGGGCCGAAGCCGATTCGCACGTGGCCATCCCCACTGATGAACGCAGCCTGGAACAACTGCGCCAGTcc > 1:2450974/1‑150 (MQ=255) ggCC‑GGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAGCATTTCCCGGGGCATGGCTGGGCCGAAGCCGATTCGCACGTGGCCATCCCCACTGATGAACGCAGCCTGGAACAACTGCGCCAGTCCGACCTGGt < 2:2326967/150‑1 (MQ=255) gCC‑GGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAGCATTTCCCGGGGCATGGCTGGGCCGAAGCCGATTCGCACGTGGCCATCCCCACTGATGAACGCAGCCTGGAACAACTGCGCCAGTCCGACCTGGTg < 1:528989/150‑1 (MQ=255) cc‑GGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAGCATTTCCCGGGGCATGGCTGGGCCGAAGCCGATTCGCACGTGGCCATCCCCACTGATGAACGCAGCCTGGAACAACTGCGCCAGTCCGACCTGGTGc < 2:1854247/150‑1 (MQ=255) c‑GGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAGCATTTCCCGGGGCATGGCTGGGCCGAAGCCGATTCGCACGTGGCCATCCCCACTGATGAACGCAGCCTGGAACAACTGCGCCAGTCCGACCTGGTGcc > 1:613676/1‑150 (MQ=255) c‑GGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAGCATTTCCCGGGGCATGGCTGGGCCGAAGCCGATTCGCACGTGGCCATCCCCACTGATGAACGCAGCCTGGAACAACTGCGCCAGTCCGACCTGGTGcc < 2:75422/150‑1 (MQ=255) | CAGTGCGGCTGGCTGATGGCGACCGAGGTGCTGGCGGTTGGCCTGGACCTCAGCTTCGCTCCGGTGCTCGACCTGGACCACCAGCGTAGCGCCGTGGTGGGCAGCCGCGCGTTCGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCC‑GGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAGCATTTCCCGGGGCATGGCTGGGCCGAAGCCGATTCGCACGTGGCCATCCCCACTGATGAACGCAGCCTGGAACAACTGCGCCAGTCCGACCTGGTGCC > NC_002947/2446952‑2447247 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |