Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
JC | NC_002947 | 1,844,516 | Δ70 bp | 100% | coding (251‑320/2754 nt) | gacS ← | sensor protein GacS |
New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 1844515 | 1 (0.010) | 87 (0.960) | 65/244 | NT | 98.9% | coding (321/2754 nt) | gacS | sensor protein GacS |
? | NC_002947 | 1844586 = | 1 (0.010) | coding (250/2754 nt) | gacS | sensor protein GacS |
Only 100 of 102 total aligned reads displayed.
CAGCTCGATCTCTACCCAGCCCAGCAGGCGCTCGGCTTCGGCCGGCACGGCGTCGGTGGCCAGGTCGCGGTGGTGGCCGAAAACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGA‑GTTGGGTGCCGGTACCGCCGCTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_002947/1844365‑1844515 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ctgCGCGCACATCGGCCTGCTCCAGGGTTTGTGCGGCAATTCTCTCCAGTTGCGCAGGCGCGAGCCGGGCCATGGCGGGTGCGGCCAGGGGCGCCAGTTGTTCGGCGATCATCTTGCCGCGCTGCAGCAGCTGGGTGCGCAGGTCGTTCTGT > NC_002947/1844586‑1844734 CAGNTCGATCTCTACCCAGCCCAGCAGGCGCTCGGCTTCGGCCGGCACGGCGTCGGTGGCCAGGTCGCGGTGGTGGCCGAAAACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGA‑GTTGGGTGCCGGTACCGCCGCT > 2:1516035/1‑150 GCTCGATCTCTACCCAGCCCAGCAGGCGCTCGGCTTCGGCCGGCACGGCGTCGGTGGCCAGGTCGCGGTGGTGGCCGAAAACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGA‑GTTGGGTGCCGGTACCGCCGCTGC < 1:1983533/150‑1 cCGATCTCTACCCAGCTACGCAGGCGCTCGGCTTCGGCCGGCACGGCGTCGGTGGCCAGGTCGCGGTGGTGGCCGAAAACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGA‑GTTGGGTGCCGGTACCGCCGCTGCGC < 2:1945932/149‑1 TCGATCTCTACCCAGCCCAGCAGGCGCTCGGCTTCGGCCGGCACGGCGTCGGTGGCCAGGTCGCGGTGGTGGCCGAAAACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGA‑GTTGGGTGCCGGTACCGCCGCTGCGC < 1:2030387/150‑1 TCGATCTCTACCCAGCCCAGCAGGCGCTCGGCTTCGGCCGGCACGGCGTCGGTGGCCAGGTCGCGGTGGTGGCCGAAAACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGA‑GTTGGGTGCCGGTACCGCCGCTGCGC > 2:70489/1‑150 CGATCGCTACCCAGCCCAGCAGGCGCTCGGCTTCGGCCGGCACGGCGTCGGTGGCCAGGTCGCGGTGGTGGCCGAAAACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGA‑GTTGGGTGCCGGTACCGCCGCTGCGCG > 2:149205/1‑150 TCTACCCAGCCCAGCAGGCGCTCGGCTTCGGCCGGCACGGCGTCGGTGGCCAGGTCGCGGTGGTGGCCGAAAACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGA‑GTTGGGTGCCGGTACCGCCGCTGCGC < 2:2361207/144‑1 TCTACCCAGCCCAGCAGGCGCTCGGCTTCGGCCGGCACGGCGTCGGTGGCCAGGTCGCGGTGGTGGCCGAAAACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGA‑GTTGGGTGCCGGTACCGCCGCTGCGC > 1:2361207/1‑144 TACCCAGCCCAGCAGGCGCTCGGCTTCGGCCGGCACGGCGTCGGTGGCCAGGTCGCGGTGGTGGCCGAAAACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGA‑GTTGGGTGCCGGTACCGCCGCTGCGCGCACATgg > 2:1875728/1‑148 TACCCAGCCCAGCAGGCGCTCGGCTTCGGCCGGCACGGCGTCGGTGGCCAGGTCGCGGTGGTGGCCGAAAACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGA‑GTTGGGTGCCGGTACCGCCGCTGCGCGCACATCG > 1:1713710/1‑150 CCCAGCCCAGCAGGCGCTCGGCTTCGGCCGGCACGGCGTCGGTGGCCAGGTCGCGGTGGTGGCCGAAAACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGA‑GTTGGGTGCCGGTACCGCCGCTGCGCGCACATCGGC > 2:112297/1‑150 CCCAGCCCAGCAGGCGCTCGGCTTCGGCCGGCACGGCGTCGGTGGCCAGGTCGCGGTGGTGGCCGAAAACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGA‑GTTGGGTGCCGGTACCGCCGCTGCGCGCACATCGGC > 1:369402/1‑150 CCAGCCCAGCAGGCGCTCGGCTTCGGCCGGCACGGCGTCGGTGGCCAGGTCGCGGTGGTGGCCGAAAACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGA‑GTTGGGTGCCGGTACCGCCGCTGCGCGCACATCGGCC > 2:1139980/1‑150 CCAGCCCAGCAGGCGCTCGGCTTCGGCCGGCACGGCGTCGGTGGCCAGGTCGCGGTGGTGGCCGAAAACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGA‑GTTGGGTGCCGGTACCGCCGCTGCGCGCACATCGGCC < 1:1228724/150‑1 AGCCCAGCAGGCGCTCGGCTTCGGCCGGCACGGCGTCGGTGGCCAGGTCGCGGTGGTGGCCGAAAACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGA‑GTTGGGTGCCGGTACCGCCGCTGCGCGCACATCGGCCTG > 2:290275/1‑150 GCAGGCGCTCGGCTTCGGCCGGCACGGCGTCGGTGGCCAGGTCGCGGTGGTGGCCGAAAACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGA‑GTTGGGTGCCGGTACCGCCGCTGCGCGCACATCGGCCTGCTCCAG < 1:1516035/150‑1 GCAGGCGCTCGGCTTCGGCCGGCACGGCGTCGGTGGCCAGGTCGCGGTGGTGGCCGAAAACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGA‑GTTGGGTGCCGGTACCGCCGCTGCGCGCACATCGGCCTGCTCCAG < 2:1374259/150‑1 GCAGGCGCTCGGCTTCGGCCGGCACGGCGTCGGTGGCCAGGTCGCGGTGGTGGCCGAAAACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGA‑GTTGGGTGCCGGTACCGCCGCTGCGCGCACATCGGCCTGCTCCAG < 1:1791554/150‑1 GCAGGCGCTCGGCTTCGGCCGGCACGGCGTCGGTGGCCAGGTCGCGGTGGTGGCCGAAAACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGA‑GTTGGGTGCCGGTACCGCCGCTGCGCGCACATCGGCCTGCTCCAG < 1:893398/150‑1 GCAGGCGCTAGGAATCGGCCGGCACGGCGTCGGTGGCCAGGTCGCGGTGGTGGCCGAAAACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGA‑GTTGGGTGCCGGTACCGCCGCTGCGCGCACATCGGCCTGCTCCAt > 2:586010/1‑149 CAGGCGCTCGGCTTCGGCCGGCACGGCGTCGGTGGCCAGGTCGCGGTGGTGGCCGAAAACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGA‑GTTGGGTGCCGGTACCGCCGCTGCGCGCACATCGGCCTGCTCCAGG > 2:516580/1‑150 CAGGCGCTCGGCTTCGGCCGGCACGGCGTCGGTGGCCAGGTCGCGGTGGTGGCCGAAAACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGA‑GTTGGGTGCCGGTACCGCCGCTGCGCGCACATCGGCCTGCTCCAGG < 2:1432686/150‑1 cGGCGCTCGGCTTCGGTCGGCACGGCGTCGGTGGCCAGGTCGCGGTGGTGGCCGAAAACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGA‑GTTGGGTGCCGGTACCGCCGCTGCGCGCACATCGGCCTGCTCCAGGG < 2:805826/149‑1 GCTCGGCTTCGGCCGGCACGGCGTCGGTGGCCAGGTCGCGGTGGTGGCCGAAAACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGA‑GTTGGGTGCCGGTACCGCCGCTGCGCGCACATCGGCCTGCTCCAGGGTTTG > 1:346901/1‑150 GCTCGGCTGCGGCCGGCACGGGGTCGGTGGCCAGGTCGCGGTGGTGGCCGAAAACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGA‑GTTGGGTGCCGGTACCGCCGCTGCGCGCACATCGGCCTGCTCCAGGGTTTG < 2:2247955/150‑1 TCGGCTTCGGCCGGCACGGCGTCGGTGGCCAGGTCGCGGTGGTGGCCGAAAACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGA‑GTTGGGTGCCGGTACCGCCGCTGCGCGCACATCGGCCTGCTCCAGGGTTTGTG < 2:1713710/150‑1 TCGGCTTCGGCCGGCACGGCGTCGGTGGCCAGGTCGCGGTGGTGGCCGAAAACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGA‑GTTGGGTGCCGGTACCGCCGCTGCGCGCACATCGGCCTGCTCCAGGGTTTGTG < 1:1677077/150‑1 CGGCTTCGGCCGGCACGGCGTCGGTGGCCAGGTCGCGGTGGTGGCCGAAAACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGA‑GTTGGGTGCCGGTACCGCCGCTGAGCGTACATCGGCCTGCTCCAGGGTTTGTGC < 1:2277707/150‑1 gcCTTCGGCCGGCACGGCGTCGGTCGCCAGGTCGCGGTGGTGGCCGAAAACTGGCTATGGGTAGCGGGTGGGTTCGTTGCCACTGCGCTTCAGGA‑GTTGGGTGCCGGTACCGCCGCTGCGCGTACATCGGCCTGCTCCTGGGTTTGTGCG < 1:626729/148‑1 GCTTCGGCCGGCACGGCGTCGGTGGCCAGGTCGCGGTGGTGGCCGAAAACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGA‑GTTGGGTGCCGGTACCGCCGCTGCGGGCACATCGGCCTGCTCCAGGGTTTGTGCGG > 2:247956/1‑150 TTCGGCCGGCACGGCGTCGGTGGCCAGGTCGCGGTGGTGGCCGAAAACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGA‑GTTGGGTGCCGGTACCGCCGCTGCGCGCACATCGGCCTGCTCCAGGGTTTGTGCGGCA > 1:479985/1‑150 TCGGCCGGCACGGCGTCGGTGGCCAGGTCGCGGTGGTGGCCGAAAACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGA‑GTTGGGTGCCGGTACCGCCGCTGCGCGCACATCGGCCTGCTCCAGGGTTTGTGCGGCAA > 2:793257/1‑150 CGGCACGGCGTCGGTGGCCAGGTCGCGGTGGTGGCCGAAAACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGA‑GTTGGGTGCCGGTACCGCCGCTGCGCGCACATCGGCCTGCTCCAGGGTTTGTGCGGCAATTCTC < 1:516580/150‑1 GGCACGGCGTCGGTGGCCAGGTCGCGGTGGTGGCCGAAAACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGA‑GTTGGGTGCCGGTACCGCCGCTGCGCGCACATCGGCCTGCTCCAGGGTTTGTGCGGCAATTCTCT > 1:635685/1‑150 GCGTCGGTGGCCAGGTCGCGGTGGTGGCCGAAAACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGA‑GTTGGGTGCCGGTACCGCCGCTGCGCGCACATCGGCCTGCTCCAGGGTTTGTGCGGCAATTCTCTCCAGTT < 2:346901/150‑1 CGTCGGTGGCCAGGTCGCGGTGGTGGCCGAAAACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGA‑GTTGGGTGCCGGTACCGCCGCTGCG > 2:106354/1‑103 CGTCGGTGGCCAGGTCGCGGTGGTGGCCGAAAACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGA‑GTTGGGTGCCGGTACCGCCGCTGCG < 1:106354/103‑1 GTCGGTGGCCAGGTCGCGGTGGTGGCCGAAAACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGAGCTGCCGTA‑GCTGGGTGCCGGCACCTCCTCTGCGCGCACATCGGCCTGCTCCAGGGTTTGTGCGGCAATTCTCTCCAGTTGC < 1:290275/150‑1 CGGTGGCCAGGTCGCGGTGGTGGCCGAAAACTGGCATCAGGTAGCGGGCGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGATGTTGGG‑GCCGATACCGCCGCTGCGCGCACATCGGCCTGCTCCAGGGTTTGTGCGGCAATTCTCTCCAGTTGCGC > 2:1465124/1‑150 GGCCAGGTCGCGGTGGTGGCCGAAAACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGA‑GTTGGGTGCCGGTACCGCCGCTGCGCGCACATCGGCCTGCTCCAGGGTTTGTGCGGCAATTCTCTCCAGTTGCGCAGGC < 1:2327731/150‑1 CCAGGTCGCGGTGGTGGCCGAAAACTGGCATCAGGTAGCGCGCGGCCTCGTTGCCACTGCGCGGCAGGA‑GTGGGGTGCCGGGACCGCCGCTGCGCGCACATCGGCCTGCTCCAGGGTTTGTGCGGCAATTCTCTCCAGTTGCGCAGGCGC < 2:267704/150‑1 CAGGTCGCGGTGGTGGCCGAAAACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGA‑GTTGGGTGCCGGTACCGCCGCTGCGCGCACATCGGCCTGCTCCAGGGTTTGTGCGGCAATTCTCTCCAGTTGCGCAGGCGCG > 1:1554327/1‑150 AGGTCGCGGTGGTGGCCGAAAACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGA‑GTTGGGTGCCGGTACCGCCGCTGCGCGCACATCGGCCTGCTCCATGGTTTGTGCGGCAATTCTCTCCAGTTGCGCAGGCGCGA < 1:586010/150‑1 GGTCGCGGTGGTGGCCAAAAACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGA‑GTTGGGTGCCGGTACCGCCGCTGCGCGCACATCGGCCTGCTCCAGGGTTTGTGCGGCAATTCTCTCCAGTTGCGCAGGCGCGAG > 1:385030/1‑150 GTCGCGGAGGTGGCCGAAAACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGA‑GTTGGGTGCCGGTACCGCCGCTGCGCGCACATCGGCCTGCTCCAGGGTTTGTGCGGCAATTCTCTCCAGTTGCGCAGGCGCGAGC > 1:2354542/1‑150 GCGGTGGTGGCCGAAAACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGA‑TTTTGGTTCCTTTACCGCCGCTGCGCGCACATCGGCCTGCTCCAGGGTTTGTGCGGCAATTCTCTCCAGTTGCGCAGGCGCGAGCCGG < 1:1476435/150‑1 GCGGTGGTGGCCGAAAACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGA‑GTTGGGTGCCGGTACCGCCGCTGCGCGCACATCGGCCTGCTCCAGGGTTTGTGCGGCAATTCTCTCCAGTTGCGCAGGCGCGCGCAGG < 2:635685/150‑1 GCGGTGGTGGCCGAAAACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGA‑GTTGGGTGCCGGTACCGCCGCTGCGCGCACATCGGCCTGCTCCAGGGTTTGTGCGGCAATTCTCTCCAGTTGCGCAGGCGCGAGCCGG < 1:2023181/150‑1 GTGGTGGCCGAAAACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGA‑GTTGGGTGCCGGTACCGCCGCTGCGCGCACATCGGCCTGCTCCAGGGTTTGTGCGG > 2:1065366/1‑115 GTGGTGGCCGAAAACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGA‑GTTGGGTGCCGGTACCGCCGCTGCGCGCACATCGGCCTGCTCCAGGGTTTGTGCGG < 1:1065366/115‑1 GGTGGCCGAAAACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGA‑GTTGGGTGCCGGTACCGCCGCTGCGCGCACATCGGCCTGCTCCAGGGTTTGTGCGGCAATTCTCTCCAGTTGCGCAGGCGCGAGCCGGGCCAT < 1:793257/150‑1 GGTGGCCGAAAACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGA‑GTTGGGTGCCGGTACCGCCGCTGCGCGCACATCGGCCTGCTCCAGGGTTTGTGCGGCAATTCTCTCCAGTTGCGCAGGCGCGAGCCGGGCCAT > 2:2010327/1‑150 CCGAAAACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGA‑GTTGGGTGCCGGTACCGCCGCTGCGCGCACATCGGCCTGCTCCAGGGTTTGTGCGGCAATTCTCTCCAGTTGCGCAGGCGCGAGCCGGGCCATGGCGG < 2:1432970/150‑1 CGAAAACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGA‑GTTGGGTGCCGGTACCGCCGCTGCGCGCACATCGGCCTGCTCCAGGGTTTGTGCGGCAATTCTCTCCAGTTGCGCAGGCGCGAGCCGGGCCATGGCG < 2:298766/148‑1 CGAAAACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGA‑GTTGGGTGCCGGTACCGCCGCTGCGCGCACATCGGCCTGCTCCAGGGTTTGTGCGGCAATTCTCTCCAGTTGCGCAGGCGCGAGCCGGGCCATGGCG > 1:298766/1‑148 CGAAAACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGA‑GTTGGGTGCCGGTACCGCCGCTGCGCGCACATCGGCCTGCTCCAGGGTTTGTGCGGCAATTCTCTCCAGTTGCGCAGGCGCGAGCCGGGCCAT > 1:1062820/1‑144 CGAAAACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGA‑GTTGGGTGCCGGTACCGCCGCTGCGCGCACATCGGCCTGCTCCAGGGTTTGTGCGG < 2:157287/107‑1 CGAAAACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGA‑GTTGGGTGCCGGTACCGCCGCTGAGCGCACATCGGCCTGCTCCAGGGTTTGTGCGG > 1:157287/1‑107 AAAACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGA‑GTTGGGTGCCGGTACCGCCGCTGCGCGCACATCGGCCTGCTCCAGGGTTTGTGCGGCAATTCTCTCCAGTTGCGCAGGCGCGAGCCGGGCCATGGCGGGTG > 1:2443045/1‑150 GCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGA‑GTTGGGTGCCGGTACCGCCGCTGCGCGCACATCGGCCTGCTCCAGGGTTTGTGCGG > 1:1801524/1‑98 GCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGA‑GTTGGGTGCCGGTACCGCCGCTGCGCGCACATCGGCCTGCTCCAGGGTTTGTGCGG < 2:1801524/98‑1 ATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGA‑GTTGGGTGCCGGTACCGCCGCTGCGCGCACATCGGCCTGCTCCAGGGTTTGTGCGGCAATTCTCTCCAGTTGCGCAGGCGCGAGCCGGGCCATGGCGGGTGCGGCCAGGG > 1:13785/1‑150 ATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGA‑GTTGGGTGCCGGTACCGCCGCTGCGCGCACATCGGCCTGCTCCAGGGTTTGTGCGGCAATTCTCTCCAGTTGCGCAGGCGCGAGCCGGGCCATGGCGGGTGCGGCAAGat > 1:2063023/1‑148 TCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGA‑GTTGGGTGCCGGTACCGCCGCTGCGCGCACATCGGCCTGCTCCAGGGTTTGTGCGGCAATTCTCTCCAGTTGCGCAGGC > 1:603593/1‑118 TCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGA‑GTTGGGTGCCGGTACCGCCGCTGCGCGCACATCGGCCTGCTCCAGGGTTTGTGCGGCAATTCTCTCCAGTTGCGCAGGC < 2:603593/118‑1 TCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGA‑GTTGGGTGCCGGTACCGCCGCTGCGCGCACATCGGCCTGCTCCAGGGTTTGTGCGGCAATT < 2:653924/100‑1 TCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGA‑GTTGGGTGCCGGTACCGCCGCTGCGCGCACATCGGCCTGCTCCAGGGTTTGTGCGGCAATT > 1:653924/1‑100 TCAGGTAGCGGGTGGCGTCGGTGCCACTGCGCTGCAGGA‑GTTGGGTGCCGGGACCGCCGCTGCGCGCACATCGGCCTGCTCCAGGGTTTGTGCGGCAATTCTCTCCAGTTGCGCAGGCGCGAGCCGGGCCATGGCGGGTGCGGCCtgttg < 2:888985/150‑6 GGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGA‑GTTGGGTGCCGGTACCGCCGCTGCGCGCACATCGGCCTGCTCCAGGGTTTGTGCGGCAATTCTCTCCAGTTGCGCAGGC < 1:379509/115‑1 GGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGA‑GTTGGGTGCCGGTACCGCCGCTGCGCGCACATCGGCCTGCTCCAGGGTTTGTGCGGCAATTCTCTCCAGTTGCGCAGGC > 2:379509/1‑115 GTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGA‑GTTGGGTGCCGGTACCGCCGCTGCGCGCACATCGGCCTGCTCCAGGGTTTGTGCGGCAATTCTCTCCAGTTGCGCAGGCGCGAGCCGG < 1:1069174/123‑1 GTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGA‑GTTGGGTGCCGGTACCGCCGCTGCGCGCACATCGGCCTGCTCCAGGGTTTGTGCGGCAATTCTCTCCAGTTGCGCAGGCGCGAGCCGG > 2:1069174/1‑123 GTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGA‑GTTGGGTGCCGGTACCGCCGCTGCGCGCACATCGGC < 2:1639766/71‑1 GTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGA‑GTTGGGTGCCGGTACCGCCGCTGCGCGCACATCGGC > 1:1639766/1‑71 GGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGA‑GTTGGGTGCCGGTACCGCCGCTGCGCGCACATCGGCCTGCTCCAGGGTTTGTGCGGCAATTCTCTCCAGTTGCGCAGGCGCGAGCCGGGCCATGGCGGGTGCGGCCAGGGGCGCCAGTTG < 1:986513/150‑1 GGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGA‑GTTGGGTGCCGGTACCGCCGCTGCGCGCACATCGGCCTGCTCCAGGGTTTGTGCGGCAATTCTCTCCAGTTGCGCAGGCGCGAGCCGGGCCATGGCGGGTGCGGCCAGGGGCGCCAGTTG < 1:1360694/150‑1 GGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGA‑GTTGGGTGCCGGTACCGCCGCTGCGCGCACATCGGCCTGCTCCAGGGTTTGTGCGGCAATTCTCTCCAGTTGCGCAGGCGCGAGCCGGGCCATGGCGGGTGCGGCCAGGGG < 2:223811/141‑1 GGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGA‑GTTGGGTGCCGGTACCGCCGCTGCGCGCACATCGGCCTGCTCCAGGGTTTGTGCGGCAATTCTCTCCAGTTGCGCAGGCGCGAGCCGGGCCATGGCGGGTGCGGCCAGGGG > 1:223811/1‑141 GTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGA‑GTTGGGTGCCGGTACCGCCGCTGCGCGCACATCGGCCTGCTCCAGGGTTTGTGCGGCAATTCTCTCCAGTTGCGCAGGCGCGAGCCGGGCCATGGCGGGTGCGGCCAGGGGCGCCAGTTGTT < 2:1471319/150‑1 CGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGA‑GTTGGTTGCCGGTACCGCCGCTGCGCGCACATCGGCCTGCTCCAGGGTTTGTGCGGCAATTCTCTCCAGTTGCGCAGGCGCGAGCCGGGCCATGGCGGGTGCGGCCAGGGGCGCCAGTTGTTCGGC < 2:734403/150‑1 GTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGA‑GTTGGGTGCCGGTACCGCCGCTGCGCGCACATCGGCCTGCTCCAGGGTTTGTGCGGCAATTCTCTCCAGTTGCGCAGGCGCGAGCCGGGCCATGGCGGGTGCGGCCAGGGGCGCCAGTTGTTCGGCG > 2:1767800/1‑150 GTTGCCACTGCGCTGCAGGA‑GTTGGGTGCCGGTACCGCCGCTGCGCGCACATCGGCCTGCTCCAGGGTTTGTGCGGCAATTCTCTCCAGTTGCGCAGGCGCGAGCCGGGCCATGGCGGGTGCGGCCAGGGGCGCCAGTTGTTCGGCGATC > 2:1613494/1‑150 TTGCCACTGCGCTGCAGGA‑GTTGGGTGCCGGTACCGCCGCTGCGCGCACATCGGCCTGCTCCAGGGTTTGTGCGGAAAGTCTCTCCAGTTGCGCAGGCGCGAGCCGGGCCATGGCGGGTGCGGCCAGGGGCGCCAGTTGTTCGGCGATCA > 1:287353/1‑150 TGCGCTGCAGGA‑GTTGGGTGCCGGTACCGCCGCTGCGCGCACATCGGCCTGCTCCAGGGTTTGTGCGGCAATTCTCTCCAGTTGCGCAGGCGCGAGCCGGGCCATGGCGGGTGCGGCCAGGGGCGCCAGTTGT < 1:1278425/133‑1 TGCGCTGCAGGA‑GTTGGGTGCCGGTACCGCCGCTGAGCGCACATCGGCCTGCTCCAGGGTTTGTGCGGCAATTCTCTCCAGTTGCGCAGGCGCGAGCCGGGCCATGGCGGGTGCGGCCAGGGGCGCCAGTTGT > 2:1278425/1‑133 TGCAGGA‑GTTGGGTGCCGGTACCGCCGCTGCGCGCACATCGGCCTGCTCCAGGGTTTGTGCGGCAATTCTCTCCAGTTGCGCAGGCGCGAGCCGGGCCATGGCGGGTGCGGCCAGGGGCGCCAGTTGTTCGGCGATCATCTTGCCGCGCT > 2:783150/1‑150 CAGGA‑GTTGGGTGCCGGTACCGCCGCTGCGCGCACATCGGCCTGCTCCAGGGTTTGTGCGGCAATTCTCTCCAGTTGCGCAGGCGCGAGCCGGGCCATGGCGGGTTTTGCCAGGGGCGCCAGTTGTTCGGCGATCATCTTGCCGCGCTGC > 1:258028/1‑150 GGA‑GTTGGGTGCCGGTACCGCCGCTGCGCGCACATCGGCCTGCTCCAGGGTTTGTGCGGCAATTCTCTCCAGTTGCGCAGGCGCGAGCCGGGCCATGGCGGGTGCGGCCAGGGGCGCCAGTTGTTCGGCGATCATCTTGCCGCGCTGCAG > 1:2098503/1‑150 GTTGGGTGCCGGTACCGCCGCTGCGCGCACATCGGCCTGCTCCAGGGTTTGTGCGGCAATTCTCTCCAGTTGCGCAGGCGCGAGCCGGG > 1:2055719/1‑89 GTTGGGTGCCGGTACCGCCGCTGCGCGCACATCGGCCTGCTCCAGGGTTTGTGCGGCAATTCTCTCCAGTTGCGCAGGCGCGAGCCGGG < 2:2055719/89‑1 TTGGGTGCCGGTACCGCCGCTGCGCGCACATCGGCCTGCTCCAGGGTTTGTGCGGCAATTCTCTCCAGTTGCGCAGGCGCGAGCCGGGCCATGGCGGGTGCGGCCAGGGGCGCCAGTTGTTCGGCGATCATCTTGCCGCGCTGCAGCAGC > 2:2175207/1‑150 GGTGCCGGTACCGCCGCTGCGCGCACATCGGCCTGCTCCAGGGTTTGTGCGGCAATTCTCTCCAGTTGCGCAGGCGCGAGCCGGGCCATGGCGGGTGCGGCCAGGGGCGCCAGTTGTTCGGCGATCATCTTGCCGCGCTGCAGCAGCTGG < 2:1554327/150‑1 GGTGCCGGTACCGCCGCTGCGCGCACATCGGCCTGCTCCAGGGTTTGTGCGGCAATTCTCTCCAGTTGCGCAGGCGCGAGCCGGGCCATGGCGGGTGCGGCCAGGGGCGCCAGTTGTTCGGCGATCATCTTGCCGCGCTGCAGCAGCTGG < 2:385030/150‑1 CGGTACCGCCGCTGCGCGCACATCGGCCTGCTCCAGGGTTTGTGCGGCAATTCTCTCCAGTTGCGCAGGCGCGAGCCGGGCCATGGCGGGTGCGGCCAGGGGCGCCAG < 2:736385/108‑1 CGGTACCGCCGCTGCGCGCACATCGGCCTGCTCCAGGGTTTGTGCGGCAATTCTCTCCAGTTGCGCAGGCGCGAGCCGGGCCATGGCGGGTGCGGCCAGGGGCGCCAG > 1:736385/1‑108 GCCGCTGCGCGCACATCGGCCTGCTCCAGGGTTTGTGCGGCAATTCTCTCCAGTTGCGCAGGCGCGAGCCGGGCCATGGCGGGTGCGGCCAGGGGCGCCAGTTGTTCGGCGATCATCTTGCCGCGCTGCAGCAGCTGGGTGCGCAGGTCG > 1:1077317/1‑150 GCCGCTGCGCGCACATCGGCCTGCTCCAGGGTTTGTGCGGCAATTCTCTCCAGTTGCGCAGGCGCGAGCCGGGCCATGGCGGGTGCGGCCAGGGGCGCCAGTTGTTCGGCGATCATCTTGCCGCGCTGCAGCAGCTGGGTGCGCAGGTCG > 1:1519134/1‑150 GCTGCGCGCACATCGGCCTGCTCCAGGGTTTGTGCGGCAATTCTCTCCAGTTGCGCAGGCGCGAGCCGGGCCATGGCGGGTGCGGCCAGGGGCGCCAGTTGTTCGGCGATCATCTTGCCGCGCTGCAGCAGCTGGGTGCGCAGGTCGTTC < 2:1519134/150‑1 TGCGCGCACATCGGCCTGCTCCAGGGTTTGTGCGGGAATTGTCTCCAGTTGCGCAGGCGCGAGCCGGGCCATGGCGGGTGCGGCCAGGGGCGCTAGTTGTTCGGCGATCATCTTGCCGCGCTGCAGCAGCTGGGTGCGCAGGTCGTTCTG < 2:741207/150‑1 GCGCGCACATCGGCCTGCTCCAGGGTTTGTGCGGCAATTCTCTCCAGTTGCGCAGGCGCGAGCCGGGCCATGGCGGGTGCGGCCAGGGGCGCCAGTTGTTCGGCGATCATCTTGCCGCGCTGCAGCAGCTGGGTGCGCAGGTCGTTCTGT < 2:1749804/150‑1 CAGCTCGATCTCTACCCAGCCCAGCAGGCGCTCGGCTTCGGCCGGCACGGCGTCGGTGGCCAGGTCGCGGTGGTGGCCGAAAACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGA‑GTTGGGTGCCGGTACCGCCGCTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_002947/1844365‑1844515 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ctgCGCGCACATCGGCCTGCTCCAGGGTTTGTGCGGCAATTCTCTCCAGTTGCGCAGGCGCGAGCCGGGCCATGGCGGGTGCGGCCAGGGGCGCCAGTTGTTCGGCGATCATCTTGCCGCGCTGCAGCAGCTGGGTGCGCAGGTCGTTCTGT > NC_002947/1844586‑1844734 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |