| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 4350173 = | 67 (0.720) | 7 (0.090) | 6/216 | NT | 12.0% | intergenic (‑181/+56) | galU/PP_3822 | UTP‑glucose‑1‑phosphate uridylyltransferase/cytochrome c family protein |
| ? | NC_002947 | 4350224 = | 45 (0.560) | intergenic (‑232/+5) | galU/PP_3822 | UTP‑glucose‑1‑phosphate uridylyltransferase/cytochrome c family protein | |||||
TAGAGGGATCCATCGAGAAGACGCGGGTGAAGTTTCATGCCAATGATGGGGTTAACCTGTATGGTAAGCAGGTTGATGGGGTGCTGATCGGACAAGGGACGGGTAGCTGAGGTAAGCCGGTGGCGGCCTCTTGGCGCGTGAGCCCGTCGAAGAGGCCGCCACCGGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_002947/4350338‑4350173‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑aagaggccgccaccggcTTACCTCAGCTACCCGTCCCTTGTCCGATCAGCACCCCATCAACCTGCTTACCATACAGGTTAACCCCATCATTGGCATGAAACTTCACCCGCGTCTTCTCGATGGATCCCTCTACCAACCGCGGGTCCTGTGGCCGCTCGTGGCGGT > NC_002947/4350224‑4350371 TAGAGGGATCCATCGAGAAGACGCGGGTGAAGTTTCATGCCAATGATGGGGTTAACCTGTATGGTAAGCAGGTTGATGGGGTGCTGATCGGACAAGGGACGGGTAGCTGAGGTAAGCCGGTGGCGGCCTCTTGGCGCGTGAGCCCGTCGA > 2:2139617/1‑150TAGAGGGATCCATCGAGAAGACGCGGGTGAAGTTTCATGCCAATGATGGGGTTAACCTGTATGGTAAGCAGGTTGATGGGGTGCTGATCGGACAAGGGACGGGTAGCTGAGGTAAGCCGGTGGCGGCCTCTTGGCGCGTGAGCCCGTCGA > 2:1112960/1‑150 ATCGAGAAGACGCGGGTGAAGTTTCATGCCAATGATGGGGTTAACCTGTATGGTAAGCAGGTTGATGGGGTGCTGCTCGTACAAGGGACGGGTAGCTGAGGTAAGCCCGAGTCGGCCTCTTGGCGCGTGAGCCCGTCGAAGAGGCCGCCc > 1:756331/1‑149 ATCGAGAAGACGCGGGTGAAGTTTCATGCCAATGATGGGGTTAACCTGTATGGTAAGCAGGTTGATGGGGTGCTGATCGGACAAGGGACGGGTAGCTGAGGTAAGCCGGTGGCGGCCTCTTGGCGCGTGAGCCCGTCGAAGAGGCCGCCA > 2:446051/1‑150 ATCGAGAAGACGCGGGTGAAGTTTCATGCCAATGATGGGGTTAACCTGTATGGTAAGCAGGTTGATGGGGTGCTGATCGGACAAGGGACGGGTAGCTGAGGTAAGCCGGTGGCGGCCTCTTGGCGCGTGAGCCCGTCGAAGAGGCCGCCA > 2:1577353/1‑150 TCGAGAAGACGCGGGTGAAGTTTCATGCCAATGATGGGGTTAACCTGTATGGTAAGCAGGTTGATGGGGTGCTGATCGGACAAGGGACGGGTAGCTGAGGTAAGCCGGTGGCGGCCTCTTGGCGCGTGAGCCCGTCGAAGAGGCCGCCAC > 1:825029/1‑150 TCGAGAAGACGCGCGCAGAGTTTCATGCCAATGATGGGGTTAACCGGTATGGTAAGCAGGTTGATGGGGTGCTGATCGGACAAGGGACGGGTAGCTGAGGTAAGCCGGTGGCGGCCTCTTGGCGCGTGAGCCCGTCGAAGAGGCCGCCAC > 1:1263402/1‑150 GTATGGTAAGCAGGTTGATGGGGTGCTGATCGGACAAGGGACGGGTAGCTGAGGTAAGCCGGTGGCGGCCTCTTGGCGCGTGAGCCCGTCGAAGAGGCCGCCAC > 2:1358787/1‑104 GTATGGTAAGCAGGTTGATGGGGTGCTGATCGGACAAGGGACGGGTAGCTGAGGTAAGCCGGTGGCGGCCTCTTGGCGCGTGAGCCCGTCGAAGAGGCCGCCAC < 1:1358787/104‑1 GGCCTCTTGGCGCGTGAGCCCGTCGAAGAGGCCGCCACCGGCTTACCTCAGCTACCCGTCCCTTGTCCGATCAGCACCCCAT > 2:2205884/1‑82 GGCCTCTTGGCGCGTGAGCCCGTCGAAGAGGCCGCCACCGGCTTACCTCAGCTACCCGTCCCTTGTCCGATCAGCACCCCAT < 1:2205884/82‑1 GGCCTCTTGGCGCGTGAGCCCGTCGAAGAGGCCGCCACCGGCTTACCTCAGCTACCCGTCCCTTGTCCGATCACCTGCTCATCAACCTGATTACCATACAGGTACCGCCGATGATTTGCAGGAAACTTCACCCGCGTCTTCTCGATGGAT > 1:1115919/1‑150 GCCTCTTGGCGCGTGAGCCCGTCGAAGAGGCCGCCACCGGCTTACCTCAGCTACCCGTCCCTTGTCCGATCAGCACCCCATCAACCTGCTTACCATACAGGTTAACCCCATCATTGGCATGAAACTTCACCCGCGTCTTCTCGATGGATC > 2:1971961/1‑150 CTCTTGGCGCGTGAGCCCGTCGAAGAGGCCGCCACCGGCTTACCTCAGCTACCCGTCCCTTGTCCGATCAGCACCCCATCAACCTGCTTACCATACAGGTTAACCCCATCATTGGCATGAAACTTCACCCGCGTCTTCTCGATGGATCCC > 1:2306836/1‑150 TTGGCGCGTGAGCCCGTCGAAGAGGCCGCCACCGGCTTACCTCAGCTACCCGTCCCTTGTCCGATCAGCACCCCATCAACCTGCTTACCATACAG > 2:464806/1‑95 TTGGCGCGTGAGCCCGTCGAAGAGGCCGCCACCGGCTTACCTCAGCTACCCGTCCCTTGTCCGATCAGCACCCCATCAACCTGCTTACCATACAG < 1:464806/95‑1 GAGGCCGCCACCGGCTTACCTCAGCTACCCGTCCCTTGTCCGATCAGCACCCCATCAACCTGCTTACCATACAGGTTAACCCCATCATTGGCATGAAACTTCACCCGCGTCTTCTCGATGGATCCCTCTACCAACCGCGGGTCCTGTGGC < 2:1837497/150‑1 AGGCCGCCACCGGCTTACCTCAGCTACCCGTCCCTTGTCCGAACCGCGTGTTGAGGGGCTGCTTACCATACAGGTTAACCCCATCATTGGCATGAAACTTCACCCGCGTCTTCTCGATGGATCCCTCTACCAACCGCGGGTCCTGTGGCC < 2:1881595/150‑1 GCCACCGGCTTACCTCAGCTACCCGGCCCTTGTCCGATCAGCACCCCATCAACCTGCTTACCATACAGGTTAACCCCATCATTGTCATGAAACTTCACCCGCGTCTTCTCGATGGATCCCTCTACCAACCGCGGGTCCTGTGGTCGCACG > 2:274760/1‑150 CCACCGGCTTACCTCAGCTACCCGTCCCTTGTCCGATCAGCACCCCATCAACCTGCTTACCATACAGGTTAACCCCATCATTGGCATGAAACTTCACCCGCGTCTTCTCGATGGATCCCTCTACCAACCGCGGGTCCTGT > 2:38641/1‑140 CCACCGGCTTACCTCAGCTACCCGTCCCTTGTCCGATCAGCACCCCATCAACCTGCTTACCATACAGGTTAACCCCATCATTGGCATGAAACTTCACCCGCGTCTTCTCGATGGATCCCTCTACCAACCGCGGGTCCTGT < 1:38641/140‑1 CACCGGCTTACCTCAGCTACCCGTCCCTTGTCCGATCAGCACCCCATCAACCTGCTTACCATACAGGTTAACCCCATCATTGGCATGAAACTTCACCCGCGTCTTCT > 2:1399792/1‑107 CACCGGCTTACCTCAGCTACCCGTCCCTTGTCCGATCAGCACCCCATCAACCTGCTTACCATACAGGTTAACCCCATCATTGGCATGAAACTTCACCCGCGTCTTCT < 1:1399792/107‑1 ACCGGCTTACCTCAGCTACCCGTCCCTTGTCCGATCAGCACCCCATCAACCTGCTTACCATACAG < 1:327155/65‑1 ACCGGCTTACCTCAGCTACCCGTCCCTTGTCCGATCAGCACCCCATCAACCTGCTTACCATACAG > 2:327155/1‑65 GCTTACCTCAGCTACCCGTCCCTTGTCCGATCAGCACCCCATCAACCTGCTTACCATACAGGTTAACCCCATCATTGGCATGAAACTTCACCCGCGTCTTCTCGATGGATCCCTCTACCAACCGCGGGTCCTGTGGCCGCTCGTGGCGGT > 1:482577/1‑150 TAGAGGGATCCATCGAGAAGACGCGGGTGAAGTTTCATGCCAATGATGGGGTTAACCTGTATGGTAAGCAGGTTGATGGGGTGCTGATCGGACAAGGGACGGGTAGCTGAGGTAAGCCGGTGGCGGCCTCTTGGCGCGTGAGCCCGTCGAAGAGGCCGCCACCGGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_002947/4350338‑4350173‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑aagaggccgccaccggcTTACCTCAGCTACCCGTCCCTTGTCCGATCAGCACCCCATCAACCTGCTTACCATACAGGTTAACCCCATCATTGGCATGAAACTTCACCCGCGTCTTCTCGATGGATCCCTCTACCAACCGCGGGTCCTGTGGCCGCTCGTGGCGGT > NC_002947/4350224‑4350371 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |