New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 4884432 | 96 (1.030) | 17 (0.200) | 11/224 | NT | 17.3% | intergenic (+53/+76) | PP_4293/yedI | hypothetical protein/inner membrane protein |
? | NC_002947 | = 4884469 | 76 (0.910) | intergenic (+90/+39) | PP_4293/yedI | hypothetical protein/inner membrane protein |
GTGGGTGTGGAGTATGACTACTGGAAGAACAAGTACGGCATCAAGGACAGCGATGCCTTCACTACCGACCAGAACACCATGAGCTTCTTGGTCAAGGTTCACTTCTGACCTGAGTTAGCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTAC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_002947/4884272‑4884432 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑aacccgctcctacCAGGTACCGCGTTTGCCTTGAACCCGGCGCGTCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCGCTAACTCAGGTCAGAAGTGAACCTTGACCAAGAAGCTCATGGTGTTCTGGTCGGTAGTGAAGGCATCGC < NC_002947/4884469‑4884321 GTGGGTGTGGAGTATGACTACTGGAAGAACAAGTACGGCATCAAGGACAGCGATGCCTTCACTACCGACCAGCACACCAAGAGCTTCTCGTTAAATGTTTACTTCTTACCTGAGTTAGCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTAAA < 1:887282/150‑1 TGTGGAGTATGACTACTGGAAGAACAAGTACGGCATCAAGGACAGCGATGCCTTCACTACCGACCAGAACACCATGAGCTTCTTGGTCAAGGTTCACTTCTGACCTGAGTTAGCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTAAACCCGC < 1:2073410/150‑1 AGTATGACTACTGGAAGAACAAGTACGGCATCAAGGACAGCGATGAACACTGATCCGACCAGAACACCATGAGCTTCTTGGTCAAGGTTCACTTCTGACCTGAGTTAGCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTA < 1:1970100/150‑1 CTACTGGAAGAACAAGTACGGCATCAAGGACAGCGATGCCTTCACTACCGACCAGAACACCATGAGCTTCTTGGTCAAGGTTCACTTCTGACCTGAGTTAGCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGTA > 1:2260056/1‑150 TACTGGAAGAACAAGTACGGCATCAAGGACAGCGATGCCTTCACTACCGACCAGAACACCATGAGCTTCTTGGTCAAGGTTCACTTCTGACCTGAGTTAGCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCT < 1:2327763/141‑1 TACTGGAAGAACAAGTACGGCATCAAGGACAGCGATGCCTTCACTACCGACCAGAACACCATGAGCTTCTTGGTCAAGGTTCACTTCTGACCTGAGTTAGCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCT > 2:2327763/1‑141 AAGTACGGCATCAAGGACAGCGATGCCTTCACTACCGACCAGAACACCATGAGCTTCTTGGTCAAGGTTCACTTCTGACCTGAGTTAGCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGTACCGCGTTTGCCTT > 2:214710/1‑150 ATGCCTTCACTACCGACCAGAACACCATGAGCTTCTTGGTCAAGGTTCACTTCTGACCTGAGTTAGCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGTACCGCGTTTGCCTTGAACCCGGCGCGTCCCCTGTAG < 2:214241/150‑1 CTTCACTACCGACCAGAACACCATGAGCTTCTTGGTCAAGGTTCACTTCTGACCTGAGTTAGCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGTACCGCGTTTGCCTTGAACCCGGCGCGTCCCCTGTAGGAGC < 2:43793/150‑1 CTTCACTACCGACCAGAACACCATGAGCTTCTTGGTCAAGGTTCACTTCTGACCTGAGTTAGCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGTACCGCGTTTGCCTTGAACCCGGCGCGTCCCCTGTAGGAGC < 1:214710/150‑1 TTCACTACCGACCAGAACACCATGAGCTTCTTGGTCAAGGTTCACTTCTGACCTGAGTTAGCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGTACCGCGTTTGCCTTGAACCCGGCGCGTCCCCTGTA < 2:126867/144‑1 TTCACTACCGACCAGAACACCATGAGCTTCTTGGTCAAGGTTCACTTCTGACCTGAGTTAGCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGTACCGCGTTTGCCTTGAACCCGGCGCGTCCCCTGTA > 1:126867/1‑144 TCACTACCGACCAGAACACCATGAGCTTCTTGGTCAAGGTTCACTTCTGACCTGAGTTAGCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGTACCGCGTTTGCCTTGAACCCGGCGCGTCCCCTGTAGGAGCGG < 2:2260056/150‑1 CCATGCGCTTCTTGGTCAAGGTTCACTTCTGACCTGAGTTAGCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGTACCGCGTTTGCCTTGAACCCGGCGCGTCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGGGC < 2:2377452/150‑1 TTCTTGGTCAAGGTTCACTTCTGACCTGAGTTAGCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGTACCGCGTTTGCCTTGAACCCGGCGCGTCCCCTGTAGGAGC > 2:694142/1‑122 TTCTTGGTCAAGGTTCACTTCTGACCTGAGTTAGCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGTACCGCGTTTGCCTTGAACCCGGCGCGTCCCCTGTAGGAGC < 1:694142/122‑1 GTCAAGGTTCACTTCTGACCTGAGTTAGCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGTACCGCGTTTGCCTTGAACCCGGCGCGTCCCCTGTA > 2:427532/1‑111 GTCAAGGTTCACTTCTGACCTGAGTTAGCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGTACCGCGTTTGCCTTGAACCCGGCGCGTCCCCTGTA < 1:427532/111‑1 CTTCTGACCTGAGTTAGCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACCAGGTACCGCGTTTGCCTTGAACCCGGCGCGTCCCCTGTA > 2:977172/1‑100 CTTCTGACCTGAGTTAGCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACCAGGTACCGCGTTTGCCTTGAACCCGGCGCGTCCCCTGTA < 1:977172/100‑1 gaGCGGGTTCACCCGCTCCTACCAGGTACCGCGTTTGCCTTGAACCCGGCGCGTCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCGCTAACTCAGGTCAG > 2:376268/3‑116 gaGCGGGTTCACCCGCTCCTACCAGGTACCGCGTTTGCCTTGAACCCGGCGCGTCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCGCTAACTCAGGTCAG < 1:376268/114‑1 ACCCGCTCCTACCAGGTACCGCGTTTGCCTTGAACCCGGCGCGTCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCGCTAACTCAGGTCAGAAGTGAACCTTGACCAAGAAGCTCATGGTGTTCTGGTCGGTAGT > 1:1098125/1‑150 CCCGCTCCTACCAGGTACCGCGTTTGCCTTGAACCCGGCGCGTCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCTGCTAACTCAGGTCAGAAGTGAACCTTGACCAAGAAGCTCATGGTGTTCTGGTCGGTAGTG > 2:1752511/1‑150 CCCGCTCCTACCAGGTACCGCGTTTGCCTTGAACCCGGCGCGTCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCGCTAACTCAGGTCAGAAGTGAACCTTGACCAAGAAGCTCATGGTGTTCTGGTCGGTAGTG > 1:1480497/1‑150 CCCGCTCCTACCAGGTACCGCGTTTGCCTTGAACCCGGCGCGTCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACGGGCCGCAAAGCGGCCCCGCTAACTCAGGTCAGAAGTGAACCTTGACCAAGAAGCTCATG > 2:1864889/1‑132 CCCGCTCCTACCAGGTACCGCGTTTGCCTTGAACCCGGCGCGTCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACGGGCCGCAAAGCGGCCCCGCTAACTCAGGTCAGAAGTGAACCTTGACCAAGAAGCTCATG < 1:1864889/132‑1 CCGCTCCTACCAGGTACCGCGTTTGCCTTGAACCCGGCGCGTCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCGCTAACTCAGGTCAGAAGTGAACCTTGACCAAGAAGCTCATGGTGTTCTGGTCGGTAGTGA > 2:638813/1‑150 CCGCTCCTACCAGGTACCGCGTTTGCCTTGAACCCGGCGCGTCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCGCTAACTCAGGTCAGAAGTGAACCTTGACCAAGAAGCTCATGGTGTTCTGGTCGGTAGTGA > 2:149655/1‑150 CGCTCCTACCAGGTACCGCGTTTGCCTTGAACCCGGCGCGTCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCGCTAACTCAGGTCAGAAGTGAACCTTGACCAAGAAGCTCATGGTGTTCTGGTCGGTAGTGAA < 1:2089506/150‑1 GCTCCTACCAGGTACCGCGTTTGCCTTGAACCCGGCGCGTCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCGCTAACTCAGGTCAGAAGTGAACCTTGACCAAGAAGCTCATGGTGTTCTGGTC < 1:1261545/140‑1 GCTCCTACCAGGTACCGCGTTTGCCTTGAACCCGGCGCGTCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCGCTAACTCAGGTCAGAAGTGAACCTTGACCAAGAAGCTCATGGTATTCTGGac > 2:1261545/1‑138 GCTCCTACCAGGTACCGCGTTTGCCTTGAACCCGGCGCGTCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCGCTAACTCAGGTAAGAAGTGAACCTTGACCAAGAAGCTCATGGTGTTCTGGTCGGTAGTGAAG < 1:234896/150‑1 TCCTACCAGGTACCGCGTTTGCCTTGAACCCGGCGCGTCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGGGCCGCAAATCGGCCCCGCTAACTCAGGTCAGAAGTGAACCTTGACCAAGAAGCTCATGGTGTTCTGGTCGGTAGTGAAGGC < 1:1470641/150‑1 CTACCAGGTACCGCGTTTGCCTTGAACCCGGCGCGTCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCGCTAACTCAGGTCAGAAGTGAACCTTGACCAAGAA > 2:20679/1‑118 CTACCAGGTACCGCGTTTGCCTTGAACCCGGCGCGTCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCGCTAACTCAGGTCAGAAGTGAACCTTGACCAAGAA < 1:20679/118‑1 CTACCAGGTACCGCGTTTGCCTTGAACCCGGCGCGTCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCGCTAACTCAGGTCAGAAGTGAACCTT < 1:1925467/109‑1 CTACCAGGTACCGCGTTTGCCTTGAACCCGGCGCGTCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCGCTAACTCAGGTCAGAAGTGAACCTT > 2:1925467/1‑109 cACCAGGCACCGAGTCTGCCTTGAACCCGGCGCGGCCCCGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCGCTAACTCAGGTCAGAAGTGAACCTTGACCAAGAAGCTCATGGTGTTCTGGTCGGTAGTGAAGGCATC < 2:1098125/149‑1 TACCAGGTACCGCGTTTGCCTTGAACCCGGCGCGTCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCGCTAACTCAGGTCAGAAGTGAACCTTGACCAAGAAGCTCATGGTGTTCTGGTCGGTAGTGAAGGCATC > 1:1350304/1‑150 TACCAGGTACCGCGTTTGCCTTGAACCCGGCGCGTCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCGCTAACTCAGGTCAGAAGTGAACCTTGACCAAGAAGCTCATGGTGTTCTGGTCGGTAGTGAAGGCATC < 2:790383/150‑1 TACCAGGTACCGCGTTTGCCTTGAACCCGGCGCGTCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCGCTAACTCAGGTCAGAAGTGAACCT > 2:1016342/1‑107 TACCAGGTACCGCGTTTGCCTTGAACCCGGCGCGTCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCGCTAACTCAGGTCAGAAGTGAACCT < 1:1016342/107‑1 CCAGGTACCGCGTTTGCCTTGAACCCGGCGCGTCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCGCTAACTCAGGTCAGAAGTGAACCTTGACCAAGAAGCTCATGGTGTTCTGGTCGGTAGTGAAGGCATCGC > 2:13972/1‑150 GTGGGTGTGGAGTATGACTACTGGAAGAACAAGTACGGCATCAAGGACAGCGATGCCTTCACTACCGACCAGAACACCATGAGCTTCTTGGTCAAGGTTCACTTCTGACCTGAGTTAGCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTAC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_002947/4884272‑4884432 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑aacccgctcctacCAGGTACCGCGTTTGCCTTGAACCCGGCGCGTCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCGCTAACTCAGGTCAGAAGTGAACCTTGACCAAGAAGCTCATGGTGTTCTGGTCGGTAGTGAAGGCATCGC < NC_002947/4884469‑4884321 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |