New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 86765 | 85 (0.910) | 8 (0.100) | 8/218 | NT | 10.2% | intergenic (‑48/+97) | PP_0075/PP_0076 | choline sulfate transporter/choline betaine‑binding protein |
? | NC_002947 | = 86824 | 66 (0.810) | intergenic (‑107/+38) | PP_0075/PP_0076 | choline sulfate transporter/choline betaine‑binding protein |
Only 100 of 153 total aligned reads displayed.
GCGCCGCTCAGGCCTACCAGCAGGTCCTGGCGCAGGCTGCGGCCCGATTGGCGGGGAAGCCAGGTGAGGAAGGGCAGCAGTAAAGAGAGGCGATGCATGGGTTATCCACAATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATTACAGTTTGGCTTTGACGGCCTCCAGGGCATCCCCATCGGCCTTGGTGGT > NC_002947/86620‑86912 | tCAGGCCTACCAGCAGGTCCTGGCGCAGGCTGCGGCCCGATTGGCGGGGAAGCCAGGTGAGGAAGGGCAGCAGTAAAGAGAGGCGATGCATGGGTTATCCACAATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCcgctcc < 2:934627/150‑4 (MQ=255) gCCTACCAGCAGGTCCTGGCGCAGGCTGCGGCCCGATTGGCGGGGAAGCCAGGTGAGGAAGGGCAGCAGTAAAGAGAGGCGATGCATGGGTTATCCACAATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAg > 1:2270218/1‑150 (MQ=255) tACCAGCAGGTCCTGGCGCAGGCTGCGGCCCGATTGGCGGGGAAGCCAGGTGAGGAAGGGCAGCAGTAAAGAGAGGCGATGCATGGGTTATCCACAATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCa > 1:36355/1‑150 (MQ=255) ccAGCAGGTCCTGGCGCAGGCTGCGGCCCGATTGGCGGGGAAGCCAGGTGAGGAAGGGCAGCAGTAAAGAGAGGCGATGCATGGGTTATCCACAATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAAc > 1:1504317/1‑150 (MQ=255) gcagGTCCTGGCGCAGGCTGCGGCCCGATTGGCGGGGAAGCCAGGGGAGGAAGGGCAGCAGTAAAGAGAGGCGATGCATGGGTTATCCACAATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCgcgcccgcgaacaccggcaaagc > 2:778370‑M1/1‑127 (MQ=255) cagGTCCTGGCGCAGGCTGCGGCCCGATTGGCGGGGAAGCCAGGTGAGGAAGGGCAGCAGTAAAGAGAGGCGATGCATGGGTTATCCACAATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGt < 1:340894/150‑1 (MQ=255) gcatcctgaacggttggatgggtggttggccggagttaccaccaaggccgatggggatgccctggaggccgtcaaagccaaactgtaatctcacaaagcaacacaccaaCCCTGTGGGAGCGGGc < 1:252151‑M1/16‑1 (MQ=255) gcatcctgaacggttggatgggtggttggccggagttaccaccaaggccgatggggatgccctggaggccgtcaaagccaaactgtaatctcacaaagcaacacaccaaCCCTGTGGGAGCGGGc > 2:252151‑M1/110‑125 (MQ=255) cctgaacggttggatgggtggttggccggagttaccaccaaggccgatggggatgccctggaggccgtcaaagccaaactgtaatctcacaaagcaacacaccaaCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCtt > 1:505307‑M1/106‑150 (MQ=255) cTGGCGCAGGCTGCGGCCCGATTGGCGGGGAAGCCAGGTGAGGAAGGGCAGCAGTAAAGAGAGGCGATGCATGGGTTATCCACAATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGNTTg < 2:1504317/150‑1 (MQ=255) cTGGCGCAGGCTGCGGCCCGATTGGCGGGGAAGCCAGGTGAGGAAGGGCAGCAGTAAAGAGAGGCGATGCATGGGTTATCCACAATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTg > 2:2267657/1‑150 (MQ=255) tGGCGCAGGCTGCGGCCCGATTGGCGGGGAAGCCAGGTGAGGAAGGGCAGCAGTAAAGAGAGGCGATGCATGGGTTATCCACAATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTgg > 1:1591769/1‑150 (MQ=255) gcgcAGGCTGCGGCCCGATTGGCGGGGAAGCCAGGTGAGGAAGGGCAGCAGTAAAGAGAGGCGATGCATGGGTTATCCACAATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCa < 2:1129199/150‑1 (MQ=255) gcAGGCTGCGGCCCGATTGGCGGGGAAGCCAGGTGAGGAAGGGCAGCAGTAAAGAGAGGCGATGCATGGGTTATCCACAATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCAcc > 2:1989532/1‑150 (MQ=255) cAGGCTGCGGCCCGATTGGCGGGGAAGCCAGGTGAGGAAGGGCAGCAGTAAAGAGAGGCGATGCATGGGTTATCCACAATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCg > 2:1928959/1‑150 (MQ=255) tGCGGCCCGATTGGCGGGGAAGCCAGGTGAGGAAGGGCAGCAGTAAAGAGAGGCGATGCATGGGTTATCCACAATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCttt < 1:113785/150‑1 (MQ=255) tGCGGCCCGATTGGCGGGGAAGCCAGGTGAGGAAGGGCAGCAGTAAAGAGAGGCGATGCATGGGTTATCCACAATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCttt < 2:1709686/150‑1 (MQ=255) gCGGCCCGATTGGCGGGGAAGCCAGGTGAGGAAGGGCAGCAGTAAAGAGAGGCGATGCATGGGTTATCCACAATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGCGCGGGCATGCCCCCGCAAAAGCCAACGCGTTGGTTGGCCCCGGCTTTg > 1:2406791/1‑150 (MQ=255) gCCCGATTGGCGGGGAAGCCAGGTGAGGAAGGGCAGCAGTAAAGAGAGGCGATGCATGGGTTATCCACAATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCg < 2:36355/150‑1 (MQ=255) ccGATTGGCGGGGAAGCCAGGTGAGGAAGGGCAGCAGTAAAGAGAGGCGATGCATGGGTTATCCACAATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGgt > 1:303885/1‑150 (MQ=255) ccGATTGGCGGGGAAGCCAGGTGAGGAAGGGCAGCAGTAAAGAGAGGCGATGCATGGGTTATCCACAATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCATTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGgt < 2:1627445/150‑1 (MQ=255) gATTGGCGGGGAAGACAGGTGAGGAAGGGCAGCAGTAAAGAGAGGCGATGCATGGGTTATCCACAATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGaaaaa > 2:1542649/1‑115 (MQ=255) aTTGGCGGGGAAGCCAGGTGAGGAAGGGCAGCAGTAAAGAGAGGCGATGCATGGGTTATCCACAATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGaaaaa > 2:2232240/1‑114 (MQ=255) ggCGGGGAAGCCAGGTGAGGAAGGGCAGCAGTAAAGAGAGGCGATGCATGGGTTATCCACAATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCgcgcccgcgaacaccggcaaagccggtgccaagcaacgcgttggctttttcgc < 1:1765778‑M1/150‑54 (MQ=255) cggagttaccaccaaggccgatggggatgccctggaggccgtcaaagccaaactgtaatctcacaaagcaacacaccaagCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTcgcg > 1:1190275‑M1/81‑150 (MQ=255) cGGGGAAGCCAGGTGAGGAAGGGCAGCAGTAAAGAGAGGCGATGCATGGGTTATCCACAATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCgg < 2:483983/150‑1 (MQ=255) ttaccaccaaggccgatggggatgccctggaggccgtcaaagccaaactgtaatctcacaaagcaacacaccaaCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCTGGTGTTCGCGGgcgcg > 1:164575‑M1/75‑150 (MQ=255) gCCAGGTGAGGAAGGGCAGCAGTAAAGAGAGGCGATGCATGGGTTATCCACAATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCgcc < 2:47328‑M2/150‑4 (MQ=255) ccAGGTGAGGAAGGGCAGCAGTAAAGAGAGGCGATGCATGGGTTATCCACAATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTACCGGTGTTCGCGGGCGCgccc < 2:1207922‑M2/150‑5 (MQ=255) aGGTGAGGAAGGGCAGCAGTAAAGAGAGGCGATGCATGGGTTATCCACAATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCtt > 2:1049413/1‑114 (MQ=255) gTGAGGAAGGGCAGCAGTAAAGAGAGGCGATGCATGGGTTATCCACAATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCgcccgctc < 2:2214338‑M2/150‑9 (MQ=255) ggAAGGGCAGCAGTAAAGAGAGGCGATGCATGGGTTATCCACAATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCgcccgctcccac < 1:2161534‑M2/150‑13 (MQ=255) gAAGGGCAGCAGTAAAGAGAGGCGATGCATGGGTTATCCACAATCCTTAAGGGGTCGCCAAACCCTGTGGGAGCGGGCgcgcccgcgaacaccggcaaagccggtgccaagcaacgcgttggctttttcgcgggcatgcccgctcccaca > 1:188803‑M1/1‑78 (MQ=255) aGGGCAGCAGTAAAGAGAGGCGATGCATGGGTTATCCACAATCCTTGAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGAACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCgcccgctcccacagg > 1:1495322‑M2/1‑135 (MQ=255) gggCAGCAGTAAAGAGAGGCGATGCATGGGTTATCCACAATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCgcccgctcccacaggg < 2:2219407‑M2/150‑17 (MQ=255) cagTAAAGAGAGGCGATGCATGGGTTATCCACAATCCTTAAGGGGTCGCCAAACCCTGTGGGAGCGGGCgcgcccgcgaacaccggcaaagccggtgccaagcaacgcgttggctttttcgcgggcatgcccgctcccacagggcttggc < 2:188803‑M1/150‑82 (MQ=255) gagGCGATGCATGGGTTATCCACAATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCgcccgc > 2:1668417‑M2/1‑119 (MQ=255) gagGCGATGCATGGGTTATCCACAATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCgcccgc < 1:1668417‑M2/125‑7 (MQ=255) ggCGATGCATGGGTTATCCACAATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGGTGGTGTGTTGCTTtgt > 1:1672313/1‑150 (MQ=255) ggCGATGCATGGGTTATCCACAATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTCGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTTtgt > 2:1148722/1‑150 (MQ=255) gCGATGCATGGGTTATCCACAATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTTtgtg > 1:2131496/1‑150 (MQ=255) gCGATGCATGGGTTATCCACAATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTATGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGgtgtgt < 2:1584221/141‑1 (MQ=255) gCGATGCATGGGTTATCCACAATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTATGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGgtgtgt > 1:1584221/1‑141 (MQ=255) aTGGGTTATCCACAATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGTCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATTAc > 1:1048462/1‑150 (MQ=255) aTGGGTTATCCACAATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCCGGGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATTAc > 1:626325/1‑150 (MQ=255) tGGGTTATCCACAATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATTACa < 1:2399202/150‑1 (MQ=255) 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gtgGGAGCGGGCgcgcccgcgaacaccggcaaagccggtgccaagcaacgcgttggctttttcgcgggcatgcccgctcccacagggcttggcgaccccttaaggattgtggataacccatgcatcgcctctctttactgctgcccttcc < 1:247981‑M1/150‑139 (MQ=255) TGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATTACAGTTTGGCTTTGACGGCCTCCAgg > 2:2337104‑M1/1‑135 (MQ=255) GGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATTACAGTTTGGCTTTGACGGCCTCCAGGGCATCCCCATCGGCCt > 1:2190947‑M1/1‑150 (MQ=255) gAGCGGGCgcgcccgcgaacaccggcaaagccggtgccaagcaacgcgttggctttttcgcgggcatgcccgctcccacagggcttggcgaccccttaaggattgtggataacccatgcatcgcctctctttactgctgcccttcctcac < 2:2214338‑M1/150‑143 (MQ=255) gAGCGGGCgcgcccgcgaacaccggcaaagccggtgccaagcaacgcgttggctttttcgcgggcatgcccgctcccacagggcttggcgaccccttaaggattg < 2:17032‑M1/105‑98 (MQ=255) GAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATTACAGTTTGGCTTTGACGGCCTCCAGGGCATCCCCATCGGCCTtg > 1:1989532‑M1/1‑150 (MQ=255) AGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATTACAGTTTGGCTTTGACGGCCTCCAGGGCATCCCCATCGGCCTtgg > 1:1723416‑M1/1‑150 (MQ=255) gCGGGCgcgcccgcgaacaccggcaaagccggtgccaagcaacgcgttggctttttcgcgggcatgcccgctcccacagggcttggcgaccccttaaggattgtggataacccatgcatcgcctctctttactgctgcccttcctcacct < 2:1198638‑M1/150‑145 (MQ=255) cGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCgcccgctcccacagggcttggcgaccccttaaggattgtggataacccatgcatcgcctctctttactgctgcccttcctcacctg < 1:2415559‑M2/150‑87 (MQ=255) gggCgcgcccgcgaacaccggtaaagccggtgccaagcaacgcgttggctttttcgcgggcatgcccgctcccacagggcttggcgaccccttaaggattgtggataacccatgcatcgcctctctttactgctgcccttcctcacctgg < 2:1207922‑M1/150‑147 (MQ=255) gggCgcgcccgcgaacaccggcaaagccggtgccaagcaacgcgttggctttttcgcgggcatgcccgctcccacagggcttggcgaccccttaaggattgtggataacccatgcatcgcctctctttactgctgcccttcctcacctgg < 1:1571670‑M1/150‑147 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |