| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | NC_002947 | = 284711 | 109 (1.220) | coding (740/834 nt) | atsK | alpha‑ketoglutarate‑dependent sulfonate dioxygenase | |||||
Only 100 of 139 total aligned reads displayed.
GACCAAGCTCTCCTGTCCTGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCA‑GACAGGCAACCGCTAGAAAGGTGCATCCCCAAGGATGGTCGCCCGGTGCATCACCCGCCGGTTCGGTCGGTAATCATCCACCGCAAAATGCTGGGTCACGCGGTTGTCCCAGAACGCCACGTCATTCTCCTGCCAACGCCAGCGAATGCTGAACTCCGGTCGCGTCGCATGGGCGAACAGCAGCCTCAGCAGCGCATCGCTTTCCAGTTCGCTCAGTTCATTGATGCGTGTAGTGAATCCTTCA > NC_002947/284553‑284848 | gACCAAGCTCTCCTGTCCTGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCA‑GACAGGCAACCGCTAGAAAGGTGCATCCCCAAGGATGGTCGCCCGGTGCATCACCCGCCGGTTCGGTCGGTAATCATCCACCGCAAAATGCTGGGTCa > 1:2135702/1‑150 (MQ=255) aCCAAGCTCTCCTGTCCTGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCA‑GACAGGCAACCGCTAGAAAGGTGCATCCCCAAGGATGGTCGCCCGGTGCATCACCCGCCGGTTCGGTCGGTAATCATCCACCGCAAAATGCTGGGTCAc > 1:613887/1‑150 (MQ=255) cAAGCTCTCCTGTCCTGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCA‑GACAGGCAACCGCTAGAAAGGTGCATCCCCAAGGATGGTCGCCCGGTGCATCACCCGCCGGTTCGGTCGGTAATCATCCACCGCAAAATGCTGGGTCAcgc > 1:1020528/1‑150 (MQ=255) cAAGCTCTCCTGTCCTGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCA‑GACAGGCAACCGCGAGAAAGGTGCATCCCCAAGGATGGTCGCCCGGTGCATCACCCGCCGGTTCGGTCGGTAATCATCCACCGCAAAATGCTGGGTCCcgc > 2:383312/1‑150 (MQ=255) aGCTCTCCTGTCCTGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCA‑GACAGGCAACCGCTAGAAAGGTGCATCCCCAAGGATGGTCGCCCGGTGCATCACCCGCCGGTTCGGTCGGTAATCATCCACCGCAAAATGCTGGGTCACGCgg > 2:2186744/1‑150 (MQ=255) ctctCCTGTCCTGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCA‑GACAGGCAACCGCTAGAAAGGTGCATCCCCAAGGATGGTCGCCCGGTGCATCACCCGCCGGTTCGGTCGGTAATCATCCACCGCAAAATGCTGGGTCACGCGGtt < 1:1554031/150‑1 (MQ=255) cctgtcctgGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCA‑GACAGGCAACCGCTAGAAAGGTGCATCCCCAAGGATGGTCGCCCGGTGCATCACCCGCCGGTTCGGTCGGTAATCATCCACCGCAAAATGCTGGGTCACGCGGTTGTcc > 1:919889‑M2/1‑148 (MQ=255) ctgtctggcctCTTCGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCA‑GACAGGCAACCGCTAGAAAGGTGCATCCCCAAGGATGGTCGCCCGGTGCATCACCCGCCGGTTCGGTCGGTAATCATCCACCGCAAAATGCTGGGTCACGCGGTTGTccca < 1:716540‑M2/146‑5 (MQ=255) 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tcCACCGCAAAATGCTGAGTCACGCGGTTGTCCCAGAACGCCACGTCATTCTCCTGCCAACGCCAGCGAATGCTGAACTCCGGTCGCGTCGCATGGGCGaa < 2:1572823/101‑1 (MQ=255) cACCGCAAAATGCTGGGTCACGCGGTTGTCCCAGAACGCCACGTCATTCTCCTGCCAACGCCAGCGAATGCTGAACTCCGGTCGCGTCGCATGGGCGAACAGCAGCCTCAGCAGCGCATCGCTTTCCAGTTCGCTCAGTTCCTTGATGCg > 1:1147128/1‑150 (MQ=255) aCCGCAAAATGCTGGGTCACGCGGTTGTCCCAGAACGCCACGTCATTCTCCTGCCAACGCCAGCGAATGCTGAACTCCGGTCGCGTCGCATGGGCGAACAGCAGCCTCAGCAGCGCATCGCTTTCCAGTTCGCTCAGTTCATTGATGCgt < 1:254861/150‑1 (MQ=255) aCCGCAAAATGCTGGGTCACGCGGTTGTCCCAGAACGCCACGTCATTCTCCTGCCAACGCCAGCGAATGCTGAACTCCGGTCGCGTCGCATGGGCGAACAGCAGCCTCAGCAGCGCATCGCTTTCCAGTTCGCTCAGTTCATTGATGCgt > 1:617542/1‑150 (MQ=255) aCCGCAAAATGCTGGGTCACGCGGTTGTCCCAGAACGCCACGTCATTCTCCTGCCAACGCCAGCGAATGCTGAACTCCGGTCGCGTCGCATGGGCGAACAGCAGCCTCAGCAGCGCATCGCTTTCCAGTTCGCTCAGTTCATTGATGCgt > 2:1915932/1‑150 (MQ=255) cAAAATGCTGGGTCACGCGGTTGTCCCAGAACGCCACGTCATTCTCCTGCCAACGCCAGCGAATGCTGAACTCCGGTCGCGTCGCATGGGCGAACAGCAGCCTCAGCAGCGCATCGCTTTCCAGTTCGCTCAGTTCATTGATGCGTGTAg > 2:1391777/1‑150 (MQ=255) tGCTGGGTCACGCGGTTGTcccagcattttgcggtggatgattaccgaccgaaccggcgggtgatgcaccgggcgaccatccttgg > 1:969405‑M2/1‑19 (MQ=255) tGCTGGGTCACGCGGTTGTcccagcattttgcggtggatgattaccgaccgaaccggcgggtgatgcaccgggcgaccatccttgg < 2:969405‑M2/86‑68 (MQ=255) cTGGGTCACGCGGTTGTCCCAGAACGCCACGTCATTCTCCTGCCAACGCCAGCGAATGCTGAACTCCGGTCGCGTCGAATGAGCGAACAGCAGCCTCAGCAGCGCATCGCTTTCCAGTTCGCTCAGTTCATTGATGCGTGTAGTGAATcc < 1:1993065/150‑1 (MQ=255) tGGGacaaccgcgtgacccagcattttgcggtggatgattaccgaccgaaccggcgggtgatgcaccgggcgaccatccttggggatgcacctttctagcggttgcctgtctggcctcttcgcgggcttgcccgcgaagaggccagacag < 1:716540‑M1/150‑147 (MQ=255) ggacaaccgcgtgacccagcattttgcggtggatgattaccgaccgaaccggcgggtgatgcaccgggcgaccatccttggggatgcacctttctagcggttgcctgtctggcctcttcgcgggcaagcccgcgaagaggccaggacagg > 1:919889‑M1/1‑2 (MQ=255) ggacaaccgcgtgacccagcattttgcggtggatgattaccgaccgaaccggcgggtgatgcaccgggcgaccatccttggggatgcacctttctagcggttgcctgtctggcct > 1:952099‑M1/1‑2 (MQ=255) ggacaaccgcgtgacccagcattttgcggtggatgattaccgaccgaaccggcgggtgatgcaccgggcgaccatccttggggatgcacctttctagcggttgcctgtctggcct < 2:952099‑M1/115‑114 (MQ=255) ggacaaccgcgtgacccagcattttgcggtggatgattaccgaccgaaccggcgggtgatgcaccgggcgaccatccttggggatgcacctttctagcggttgcctgtcctggcctcttcgcgggctt < 1:1394157‑M1/128‑127 (MQ=255) ggacaaccgcgtgacccagcattttgcggtggatgattaccgaccgaaccggcgggtgatgcaccgggcgaccatccttggggatgcacctttctagcggttgcctgtcctggcctcttcgcgggctt > 2:1394157‑M1/1‑2 (MQ=255) ggTCACGCGGTTGTCCCAGAACGCCACGTCATTCTCCTGCCAACGCCAGCGAATGCTGAACTCCGGTCGCGTCGCATGGGCGAACAGCAGCCTCAGCAGCGCATCGCTTTCCAGTTCGCTCAGTTCATTGATGCGTGTAGTGAATCCTTc < 2:210896/150‑1 (MQ=255) gTCACGCGGTTGTCCCAGAACGCCACGTCATTCTCGTTCCAACGCCAGCGAATGCTGAACTCCGGTCGCGTCGCATGGGCGAACAGCAGCCTCAGCAGCGCATCGCTTTCCAGTTCGCTCAGTTCATTGATGCGTGTAGTGAATCCTTCa > 1:1774380/1‑150 (MQ=255) gTCACGCGGTTGTCCCAGAACGCCACGTCATTCTCCTGCCAACGCCAGCGAATGCTGAACTCCGGTCGCGTCGCATGGGCGAACAGCAGCCTCAGCAGCGCATCGCTTTCCAGTTCGCTCAGTTCATTGATGCGTGTAGTGAATCCTTCa < 2:160278/150‑1 (MQ=255) | GACCAAGCTCTCCTGTCCTGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCA‑GACAGGCAACCGCTAGAAAGGTGCATCCCCAAGGATGGTCGCCCGGTGCATCACCCGCCGGTTCGGTCGGTAATCATCCACCGCAAAATGCTGGGTCACGCGGTTGTCCCAGAACGCCACGTCATTCTCCTGCCAACGCCAGCGAATGCTGAACTCCGGTCGCGTCGCATGGGCGAACAGCAGCCTCAGCAGCGCATCGCTTTCCAGTTCGCTCAGTTCATTGATGCGTGTAGTGAATCCTTCA > NC_002947/284553‑284848 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |