New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 359677 = | 100 (1.070) | 25 (0.280) | 17/236 | NT | 22.6% | intergenic (+34/+86) | gbdR/PP_0299 | AraC family transcriptional regulator/hypothetical protein |
? | NC_002947 | 359721 = | 77 (0.870) | intergenic (+78/+42) | gbdR/PP_0299 | AraC family transcriptional regulator/hypothetical protein |
Only 100 of 156 total aligned reads displayed.
AGCAGGTGGCCATGATGCCGATTCCGCAGGCCATGACCCTGTCGCCGCACAGCGGGCCGATGGCGGCCCTGAGCCAGGCGCGCAATGAGTCGACATTTGC‑CAGTGTAAGGCT‑CTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGCCAGCGGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTGGGTAAATGGATTACGCGCGTTTGTTGAACTGCGCCAACGCTGGCAACAGTTGCTTGTCGATGGCCTGGCGTACT > NC_002947/359528‑359826 | gtggagcagatgtacaccggcagtgcgacgatcctgccggcagtacgccaggccatcgacaagcaactgttgccagcgttggcgcagttcaacaaacgcgcgtaatccatttacccaggaccggccccttcgcggaacaagcccgccccc < 1:1161166‑M1/3‑1 (MQ=255) tGGCCATGATGCCGATTCCGCAGGCCATGACCCTGTCGCCGCACAGCGGGCCGATGGCGGCCCTGAGCCAGGCGCGCAATGAGTCGACATTTGC‑CAGTGTAAGGCT‑CTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCcaccg > 1:636037/1‑148 (MQ=255) tGGCCATGATGCCGATTCCGCAGGCCATGACCCTGTCGCCGCACAGCGGGCCGATGGCGGCCCTGAGCCAGGCGCGCAATGAGTCGACATTTGC‑CAGTGTAAGGCT‑CTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAg < 1:1882177/150‑1 (MQ=255) tGGCCATGATGCCGATTCCGCAGGCCATGACCCTGTCGCCGCACAGCGGGCCGATGGCGGCCCTGAGCCAGGCGCGCAATGAGTCGACAACAGG‑CTTTGTACCGCC‑ATGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCCCCCACAg < 2:1902081/150‑1 (MQ=255) gagcagatgtacaccggcagtgcgacgatcctgacggcagtacgccaggccatcgacaagcaactgttgccagcgttggcgcagttcaacaaacgcgcgtaatccatttacccaggaccggccccttcgcggaacaagcccgccCCcaca < 1:787474‑M1/6‑1 (MQ=255) atgatgCCGATTCCGCAGGCCATGACCCTGTCGCCGCACAGCGGGCCGATGGCGGCCCTGAGCCAGGCGCGCAATGAGTCGACATTTGC‑CAGTGTAAGGCT‑CTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCCCCCACAGATCAc < 2:111819/150‑1 (MQ=255) atgtacaccggcagtgcgacgatcctgccggcagtacgccaggccatcgacaagcaactgttgccagcgttggcgcagttcaacaaacgcgcgtaatccatttacccaggaccggccccttcgcggaacaagcccgcccc > 2:302071‑M1/139‑140 (MQ=255) atgtacaccggcagtgcgacgatcctgccggcagtacgccaggccatcgacaagcaactgttgccagcgttggcgcagttcaacaaacgcgcgtaatccatttacccaggaccggccccttcgcggaacaagcccgcccc < 1:302071‑M1/2‑1 (MQ=255) cGATTCCGCAGGCCATGACCCTGTCGCCGCACAGCGGGCCGATGGCGGCCCTGAGCCAGGCGCGCAATGAGTCGACATTTGC‑CAGTGTAAGGCT‑CTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGTGCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCTGa < 1:2001931/150‑1 (MQ=255) cGATTCCGCAGGCCATGACCCTGTCGCCGCACAGCGGGCCGATGGCGGCCCTGAGCCAGGCGCGCAATGAGTCGACATTTGC‑CAGTGTAAGGCT‑CTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCTGa > 2:2438181/1‑150 (MQ=255) gCAGGCCATGACCCTGTCGCCGCACAGCGGGCCGATGGCGGCCCTGAGCCAGGCGCGCAATGAGTCGACATTTGC‑CAGTGTAAGGCT‑CTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAg < 2:1069730/150‑1 (MQ=255) gCAGGCCATGACCCTGTCGCCGCACAGCGGGCCGATGGCGGCCCTGAGCCAGGCGCGCAATGAGTCGACATTTGC‑CAGTGTAAGGCT‑CTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAg < 1:2250687/150‑1 (MQ=255) gacgatcctgccggcagtacgccaggccatcgacaagcaactgttgccagcgttggcgcagttcaacaaacgcgcgtaatccatttacccaggaccggccccttcgcggaacaagcccgccCCCACGGGTCACCCGCTGAGCTTGAGCCa < 2:1759952‑M1/29‑1 (MQ=255) cATGACCCTGTTGCCGCACAGCGGGCCGATGGCGGCCCTGAGCCAGGCGCGCGCTCGGGCG‑GATATCCGCGGACTTATGCT‑CTGACACCTTGCCGGCATCTTCGCGGGCACGCTCGCTTCCACATGTCACCCGCTGAGCTTGAGCCAGCg < 1:544462/150‑1 (MQ=255) gatcctgccggcagtacgccaggccatcgacaagcaactgttgccagcgttggcgcagttcaacaaacgcgcgtaatccatttacccaggaccggccccttcgcggaacaagcccgccCCCACAGATCACCCGCTGAGCTTGAGCCAGCg > 2:2063863‑M1/119‑150 (MQ=255) aCCCTGTCGCCGCACAGCGGGCCGATGGCGGCCCTGAGCCAGGCGCGCAATGAGTCGACATTTGC‑CAGTGTAAGGCT‑CTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCACTGAGCTTGAGCCAGCGGTGa > 1:856561/1‑150 (MQ=255) cctgccggcagtacgcccggccaacgacaagcaactgttgccagcgttggcgcagttcaacaaacgcgcgtaatccatttacccaggaccggccccttcgcggaacaagcccgccCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGCCAGCGGTg > 2:1133202‑M1/116‑150 (MQ=255) ccTGTCGCCGCACAGCGGGCCGATGGCGGCCCTGAGCCAGGCGCGCAATGAGTCGACATTTGC‑CAGTGTAAGGCT‑CTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGCCAGCGGTGATc > 1:1653078/1‑150 (MQ=255) ccTGTCGCCGCACAGCGGGCCGATGGCGGCCCTGAGCCAGGCGCGCAATGAGTCGACATTTGC‑CAGTGTAAGGCT‑CTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGCCAGCGGTGATc > 1:670703/1‑150 (MQ=255) tgccggcagtacgccaggccatcgacaagcaactgttgccagcgttggcgcagttcaacaaacgcgcgtaatccatttacccaggaccggccccttcgcggaacaagcccgccCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGCCAGCGGTg < 1:1385219‑M1/35‑1 (MQ=255) tgccggcagtacgccaggccatcgacaagcaactgttgccagcgttggcgcagttcaacaaacgcgcgtaatccatttacccaggaccggccccttcgcggaacaagcccgccCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGCCAGCGGTg > 2:1385219‑M1/114‑148 (MQ=255) cTGTCGCCGCACAGCGGGCCGATGGCGGCCCTGAGCCATTCGCGCAATGAGTCGACATTTGC‑CAGTGTTCGCCG‑CTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGCCAGCGGTGATCt < 1:1002073/150‑1 (MQ=39) cTGTCGCCGCACAGCGGGCCGATGGCGGCCCTGAGCCAGGCGCGCAATGAGTCGACATTTGC‑AAGT‑TATCACTGCTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGCCAGCGGTGATCt < 1:1002148/150‑1 (MQ=38) tgccggcagtacgccaggccatcgacaagcaactgttgccagcgttggcgcagttcaacaaacgcgcgtaatccatttacccaggaccggcctcttcgcgggcacgcccgctCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGCCAGCGGTGATc < 2:80984‑M1/38‑1 (MQ=255) gccggcagtacgccaggccatcgacaagcaactgttgccagcgttggcgcagttcaacaaacgcgcgtaatccatttacccaggaccggcctcttcgcgggcacgcccgctCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGCCAGCGGTGATCt > 1:80984‑M1/112‑150 (MQ=255) tCGCCGCACAGCGGGCCGATGGCGGCCCTGAGCCAGGCGCGCAATGAGTCGACATTTGC‑CAGTGTAAGGCT‑CTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGCCAGCGGTGATCtgtg < 1:1619755/150‑1 (MQ=255) ggcagtacgccaggccatcgacaagcaactgttgccagcgttggcgcagttcaacaaacgcgcgtaatccatttacccaggaccggccccttcgcggaacaagcccgccCCCACAGATCACCCGCTGAGCTTGAGCCAGCGGTGATCtgt > 1:979949‑M1/110‑150 (MQ=255) cggcagtacgccaggccatcgacaagcaactgttgccagcgttggcgcagttcaacaaacgcgcgtaatccatttacccaggaccggcctcttcgcgggcacgcccgctCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGCCAGCGGTGATCtgt > 2:885355‑M1/110‑150 (MQ=255) cggcagtacgccaggccatcgacaagcaactgttgccagcgttggcgcagttcaacaaacgcgcgtaatccatttacccaggaccggccccttcgcgggcacgcccgctCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGCCAGCGGTGATCtgt > 2:41735‑M1/110‑150 (MQ=255) cgccgcACAGCGGGCCGATGGCGGCCCTGAGCCAGGCGCGCAATGAGTCGACATTTGC‑CAGTGTAAGGCT‑CTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGCCAGCGGTGATCTGTgg < 2:1557523/150‑1 (MQ=255) cgccgcACAGCGGGCCGATGGCGGCCCTGAGCCAGGCGCGCAATGAGTCCACATTTGC‑CAGTGTAAGGCT‑CTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGCCAGCGGTGATCTGTgg < 1:1106093/150‑1 (MQ=255) gcagtacgccaggccatcgacaagcaactgttgccagcgttggcgcagttcaacaaacgcgcgtaatccatttacccaggaccggccccttcgcggaacaagcccgctCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGCGCCAGCGGTGATCtgt > 1:2300215‑M1/109‑149 (MQ=255) gcagtacgccaggccatcgacaagcaactgttgccagcgttggcgcagttcaacaaacgcgcgtaatccatttacccaggaccggccccttcgcggaacaagcccgctCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGCCAGCGGTGATCtgt < 2:2300215‑M1/41‑1 (MQ=255) gcagtacgccaggccatcgacaagcaactgttgccagcgttggcgcagttcaacaaacgcgcgtaatccatttacccaggaccggccccttcgcggaacaagcccgccCCCACGGGTCACCCGCTGAGCTTGAGCCAGCGGTGATCtgtg > 1:1759952‑M1/109‑150 (MQ=255) cagtacgccaggccatcgacaagcaactgttgccagcgttggcgcagttcaacaaacgcgcgtaatccatttacccaggaccggccccttcgcggaacaagcccgccCCCACAGATCACC‑GCTGAGCTTGAGCCAGCGGTGATCTGTggg > 1:1801172‑M1/108‑150 (MQ=255) gcACAGCGGGCCGATGGCGGCCCTGAGCCAGGCGCGCAATGAGTCGACATTTGC‑CAGTGTAAGGCT‑CTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCt > 1:834888/1‑120 (MQ=255) acaGCGGGCCGATGGCGGCCCTGAGCCAGGCGCGCAATGAGTCGACATTTGC‑CAGTGTAAGGCT‑CTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGCCAGCGGTGATCTGTGGgggcgg < 1:1083011/150‑1 (MQ=255) acaGCGGGCCGATGGCGGCCCTGAGCCAGGCGCGCAATGAGTCGACATTTGC‑CAGTGTAAGGCT‑CTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGCCAGCGGTGATCTGTGGgggcgg > 2:986359/1‑150 (MQ=255) acaGCGGGCCGATGGCGGCCCTGAGCCAGGCGCGCAATGAGTCGACATTTGC‑CAGTGTAAGGCT‑CTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGCCAGCGGTGATCTGTGGgggcgg < 1:825816/150‑1 (MQ=255) gccaggccatcgacaagcaactgttgccagcgttggcgcagttcaacaaacgcgcgtaatccatttacccaggaccggccccttcgcggaacaagcccgccCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGCCAGCGGTGATCTGTggg > 2:1166306‑M1/102‑145 (MQ=255) gCGGGCCGATGGCGGCCCTGAGCCAGGCGCGCAATGAGTCGACATTTGC‑CAGTGTAAGGCT‑CTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGCCAGCGGTGCTCTGTGGGGGCGGCCt < 2:636037/150‑1 (MQ=255) ccGATGGCGGCCCTGAGCCAGGCGCGCAATGAGTCGACATTTGC‑CAGTGTAAGGCT‑CTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGCCAg < 2:236461/123‑1 (MQ=255) ccGATGGCGGCCCTGAGCCAGGCGCGCAATGAGTCGACATTTGC‑CAGTGTAAGGCT‑CTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGCCAg > 1:236461/1‑123 (MQ=255) ccatcgacaagcaactgttgccagcgttggcgcagttcaacaaacgcgcgtaatccatttacccaggaccggccccttcgcgggcacgcccgctCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGCCAGCGGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGtt > 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1:986359/150‑1 (MQ=255) ggCCTCTTAGCGGACCAGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGCCAGCGGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTGGGTAAATGGATTACGCGCGTTTGTTGAACTGCGCCAACGCTGGCAACAGt > 2:2434315/1‑150 (MQ=255) gCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGCCAGCGGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTccgcgaaggggccggtgcggtgtcagagccttacactggcaaatgtcgactcattgcgcgcctggctcagg < 2:1950405‑M2/150‑72 (MQ=255) gCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGCCAGCGGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTGGGTAAATGGATTACGCGCGTTTGTTGAACTGCGCCAACGCTGGCAACAGtt > 1:360419/1‑150 (MQ=255) gCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGCCAGCGGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTGGGTAAATGGATTACGCGCGTTTGTTGAACTGCGCCAACGCTGGCAACAGtt > 1:1733132/1‑150 (MQ=255) ccTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGCCAGCGGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTGGGTAAATGGATTACGCGCGTTTGTTGAACTGCGCCAACGCTGGCAACAGTTg < 2:1295603/150‑1 (MQ=255) ccTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGCCAGCGGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTGGGTAAATGGATTACGCGCGTTTGTTGAACTGCGCCAACGCTGGCAACAGTTg > 1:891487/1‑150 (MQ=255) ctctTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGCCAGCGGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTGGGTAAATGGATTACGCGCGTttgttg > 2:2336987/1‑123 (MQ=255) ctctTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGCCAGCGGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTGGGTAAATGGATTACGCGCGTttgttg < 1:2336987/123‑1 (MQ=255) ctTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGCCAGCGGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTGGGTAAATGGATTACGCGCGTTTGTTGAACTGCGCCAACGCTGGCAACAGTTGCtt < 2:2046354/150‑1 (MQ=255) ttCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGCCAGCGGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTGGGTAAATGGATTACGCGCGTTTGTTGAACTGCGCCAACGCTGGCAACAGTTGCTTg > 1:1421845/1‑150 (MQ=255) ttCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGCCAGCGGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTGGGTAAATGGATTACGCGCGTTTGTTGAACTGCGCCAACGCTGGCAACAGTTGCTTg > 2:787474/1‑150 (MQ=255) gggCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGCCAGCGGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTccgcgaaggggccggcgcggtgtcagagc < 1:1490849‑M2/98‑30 (MQ=255) gggCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGCCAGCGGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTccgcgaaggggccggcgcggtgtcagagc > 2:1490849‑M2/1‑69 (MQ=255) gggCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGCCAGCGGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTGGGTAAATGGATTACGCGCGTTTGTTGAACTGCGCCAACGCTGGCAACAGTTGCTTGTCGAt < 1:2280213/150‑1 (MQ=255) gggCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGCCAGCGGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTGGGTAAATGGATTACGCGCGTTTGTTGAACTGCGCCAACGCTGGCAACAGTTGCTTGTCGAt > 2:2280213/1‑150 (MQ=255) gggCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGCCAGCGGTGATCTGGGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTGGGTAAATGGATTACGCGCGTTTGTTGAACTGCGCCAACGCTGGCAACAGTTGCTTGTCGAt < 1:1072788/150‑1 (MQ=255) aCGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGCCAGCGGTGATCTGTGGGAGCGGGCGTGCcgcgaagaggccggcgcggtgtcagagccttacactggcaaatgtcgactcattgcgcgcctggctcagggcagccatcttcccg < 2:1995744‑M2/150‑86 (MQ=255) cGCCCGATCGCACTTGGCACCCGCTGAGCTTGAGCCAGCGGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTGGGTAAATGGATTACGCGCGTTTGTTGAACTGCGCCAACGCTGGCAACAGTTGCTTGTCGATGGCCt < 2:1995516/150‑1 (MQ=255) cccGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGCCAGCGGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTccgcgaa < 2:427866‑M2/69‑8 (MQ=255) cccGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGCCAGCGGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTccgcgaa > 1:427866‑M2/1‑62 (MQ=255) ccGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGCCAGCGGTGATCTGTGGGAGCGGGCGTGCcgcgaagaggccggcgcggtgtcagagccttacactggcaaatgtcgactcattgcgcgcctggctcagggccgccatcggcccgctgt < 1:541402‑M2/150‑90 (MQ=255) cTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGCCAGCGGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTGGGTAAATGGATTACGCGCGTTTGTTGAACTGCGCCAACGCTGGCAACAGTTGCTTGTCGATGGCCTGGCGTa < 2:1633249/150‑1 (MQ=255) | AGCAGGTGGCCATGATGCCGATTCCGCAGGCCATGACCCTGTCGCCGCACAGCGGGCCGATGGCGGCCCTGAGCCAGGCGCGCAATGAGTCGACATTTGC‑CAGTGTAAGGCT‑CTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGCCAGCGGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTGGGTAAATGGATTACGCGCGTTTGTTGAACTGCGCCAACGCTGGCAACAGTTGCTTGTCGATGGCCTGGCGTACT > NC_002947/359528‑359826 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |