New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 436353 = | 79 (0.850) | 4 (0.050) | 4/232 | NT | 5.4% | intergenic (+183/+50) | PP_0357/PP_0358 | ACT domain‑containing protein/membrane protein |
? | NC_002947 | 436386 = | 68 (0.790) | intergenic (+216/+17) | PP_0357/PP_0358 | ACT domain‑containing protein/membrane protein |
Only 100 of 112 total aligned reads displayed.
CACGGGGAAGGCCCTGTGGATAACCTGGGGGTGTACCTCTCCAGCCCAGGTATCACGTGCCTTGTACGGTTTTGCTCAAAAAATGCCCAATTATCAGCAGCTTGTGCACAAAGCGCGGGGACGAGGGTGTGGATAACCTATGGAGATGTCTCTGCAGGCCAGGCGCTACATGACCTGCAGAGTTTTGATCGTTTT‑CTGATCAGCTACGTTTGCGCAAGTTCAGCCATGCATCGACGCTGTAAATCGCCAAACCTGCCCAGATGAACATGAAGGCCGCCAGGGTGCTCGACGACAA > NC_002947/436204‑436498 | cACGGGGAAGGCCCTGTGGATAACCTGGGGGTGTACCTCTCCAGCCCAGGTATCACGTGCCTTGTACGGTTTTGCTCAAAAAATGCCCAATTATCAGCAGCTTGTGCACAAAGCGCGGGGACGAGGGTGTGGATAACCTATGGAGATGTC < 2:1363537‑M1/150‑1 (MQ=255) tgctgttgcaggccgtagtgctgttcgacgagcatttgtcgtcgagcaccctggcggccttcatgttcatctgggcaggtttggcgatttacagcgtcgatgcatggctgaacttgcgcaaacgtagctgatcagaaaacgatcaaaact > 1:994227‑M1/149‑150 (MQ=255) aagcggaaggGCCTATGGATAACCTGGGGGTGTACCTCTCCAGCCCAGGTATCACGTGCCTTGTACGGTTTTGCTCAAAAAATGCCCAATTATCAGCAGCTTGTGCACAAAGCGCGGGGACGAGGGTGTGGATAACCTATGGAGATGTCT > 2:2368233‑M1/5‑150 (MQ=255) gctgttgcaggccgtagtgctgaatgattagcagttgtcgtcgagcaccctggcggccttcatgttcatctgggcaggtttggcgatttacagcgtcgatgcatggctgaacttgcgcaaacgtagctgatcagaaaacgatcaaaactc > 2:1136322‑M1/148‑150 (MQ=255) ggggAAGGCCCTGTGGATAACCTGGGGGTGTACCTCTCCAGCCCAGGTATCACGTGCCTTGTACGGTTTTGCTCAAAAAATGCCCAATTATCAGCAGCTTGTGCACAAAGCGCGGGGACGAGGGTGTGGATAACCTATGGAGATGTCTCT > 1:888571‑M1/1‑150 (MQ=255) gttgcaggccgtagtgctgttcgacgagcatttgtcgtcgagcaccctggcggccttcatgttcatctgggcaggtttggcgatttacagcgtcgatgcatggctgaacttgcgcaaacgtagctgatcagaaaacgatcaaaaCTCTGc > 2:2122724‑M1/145‑150 (MQ=255) ttgcaggccgtagtgctgttcgacgagcatttgtcgtcgagcaccctggcggccttcatgttcatctgggcaggtttggcgatttacagcgtcgatgcatggctgaacttgcgcaaacgtagctgatcagaaaacgatcaaaaCTCTGca > 2:558330‑M1/144‑150 (MQ=255) gAAGGCCCTGTGGATAACCTGGGGGTGTACCTCTCCAGCCCAGGTATCACGTGCCTTGTACGGTTTTGCTAAAAAAATGCCCAATTATCAGCAGCTTGTGCACAAAGCGCGGGGACGAGGGTGTGGATAACCTATGGAGATATCTCTGCA > 2:131038‑M1/1‑150 (MQ=255) aGGCCCTGTGGATAACCTGGGGGTGTACCTCTCCAGCCCAGGTATCACGTGCCTTGTACGGTTTTGCTCAAAAAATGCCCAATTATCAGCAGCTTGTGCACAAAGCGCGGGGACGAGGGTGTGGATAACCTATGGAGATGTCTCTGCAGG < 1:936021‑M1/150‑1 (MQ=255) gCCCTGTGGATAACCTGGGGGTGTACCTCTCCAGCCCAGGTATCACGTGCCTTGTACGGTTTTGCTCAAAAAATGCCCAATTATCAGCAGCTTGTGCACAAAGCGCGGGGACGAGGGTGTGGATAACCTATGGAGATGTCTCTGcaggcc > 1:1112164/1‑150 (MQ=255) cccTGGGGATAACCTGGGGGTGTACCTCTCCAGCCCAGGTATCACGTGCCTTGTACGGTTTTGCTCAAAAAATGCCCAATTATCAGCAGCTTGTGCACAAAGCGCGGGGACGAGGGTGTGGATAACCTATGGAGATGTCTCTGcaggcca < 2:116744/150‑1 (MQ=255) ccTGTGGATAACCTGGGGGTGTACCTCTCCAGCCCAGGTATCACGTGCCTTGTACGGTTTTGCTCAAAAAATGCCCAATTATCAGCAGCTTGTGCACAAAGCGCGGGGACGAGGGTGTGGATAACCTATGGAGATGTCTCTGcaggccag < 1:2339296/150‑1 (MQ=255) cTGTGGATAACCTGGGGGTGTACCTCTCCAGCCCAGGTATCACGTGCCTTGTACGGTTTTGCTCAAAAAATGCCCAATTATCAGCAGCTTGTGCACAAAGCGCGGGGACGAGGGTGTGGATAACCTATGGAGATGTCTCTGcaggccagg < 2:888571/150‑1 (MQ=255) cTGTGGATAACCTGGGGGTGTACCTCTCCAGCCCAGGTATCACGTGCCTTGTACGGTTTTGCTCAAAAAATGCCCAATTATCAGCAGCTTGTGCACAAAGCGCGGGGACGAGGGTGTGGATAACCTATGGAGATGTCTCTGcaggccagg > 1:1551675/1‑150 (MQ=255) cTGTGGATAACCTGGGGGTGTACCTCTCCAGCCCAGGTATCACGTGCCTTGTACGGTTTTGCTCAAAAAATGCCCAATTATCAGCAGCTTGTGCACAAAGCGCGGGGACGAGGGTGTGGATAACCTATGGAGATGTCTCTGcaggccagg > 1:1247611/1‑150 (MQ=255) tgtgGATAACCTGGGGGTGTACCTCTCCAGCCCAGGTATCACGTGCCTTGTACGGTTTTGCTCAAAAAATGCCCAATTATCAGCAGCTTGTGCACAAAGCGCGGGGACGAGGGTGTGGATAACCTATGGAGATGTCTCTGcaggccaggc > 1:2049664/1‑150 (MQ=255) tgGATAACCTGGGGGTGTACCTCTCCAGCCCAGGTATCACGTGCCTTGTACGGTTTTGCTCAAAAAATGCCCAATTATCAGCAGCTTGTGCACAAAGCGCGGGGACGAGGGTGTGGATAACCTATGGAGATGTCTCTGCAGGCCAGgcgc < 2:426649/150‑1 (MQ=255) gATAAGGTGGGGGTGGACCTCTCCAGCCCAGGTATCACGTGCCTTGTACGGTTTTGCTCAAAAAATGCCCAATTATCAGCAGCTTGTGCACAAAGCGCGGGGACGAGGGTGTGGATAACCTATGGAGATGTCTCTGCAGGCCAGGCGCTa < 2:2353293/150‑1 (MQ=255) tAACCTGGGGGTGTACCTCTCCAGCCCAGGTATCACGTGCCTTGTACGGTTTTGCTCAAAAAATGCCCAATTATCAGCAGCTTGTGCACAAAGTGCGGGGACGAGGGTGTGGATAACCTATGGAGATGTCTCTGCAGGCCAGGCGCTACa > 1:1491922/1‑150 (MQ=255) cTGGGGGTGTACCTCTCCAGCCCAGGTATCACGTGCCTTGTACGGTTTTGCTCAAAAAATGCCCAATTATCAGCAGCTTGTGCACAAAGCGCGGGGACGAGGGTGTGGATAACCTATGGAGATGTCTCTGCAGGCCAGGCGCTACATGAc < 2:1998759‑M2/150‑2 (MQ=255) tGGGGGTGTACCTCTCCAGCCCAGGTATCCCGTGCCTTGTACGGTTTTACTCAAAAAATGCCCAATTATCAGCAGCTTGTGCACAAAGCGCGGGGACGAGGGTGTGGATAACCTATGGAGATGTCTATGCAGGCCAGGCGCTACAGGAcc < 2:168536‑M2/150‑3 (MQ=255) tACCTCTCCAGCCCAGGTATCACGTGCCTTGTACGGTTTTGCTCAAAAAATGCCCAATTATCAGCAGCTTGTGCACAAAGCGCGGGGACGAGGGTGTGGATAACCTATGGAGATGTCTCTGCAGGCCAGGCGCTACATGACCTGCAGAGt < 2:1186941/150‑1 (MQ=255) ctctCCAGCCCAGGTATCACGTGCCTTGTACGGTTTTGCTCAAAAAATGCCCAATTATCAGCAGCTTGTGCACAAAGCGCGGGGACGAGGGTGTGGATAACCTATGGAGATGTCTCTGCAGGCCAGGCGCTACATGACCTGCAGAGtttt < 2:1724861/150‑1 (MQ=255) ctctCCAGCCCAGGTATCACGTGCCTTGTACGGTTTTGCTCAAAAAATGCCCAATTATCAGCAGCTTGTGCACAAAGCGCGGGGACGAGGGTGTGGATAACCTATGGAGATGTCTCTGCAGGCCAGGCGCTACATGACCTGCAGAGtttt > 2:2308624/1‑150 (MQ=255) ctctCCAGCCCAGGTATCACGTGCCTTGTACGGTTTTGCTCAAAAAATGCCCAATTATCAGCAGCTTGTGCACAAAGCGCGGGGACGAGGGTGTGGATAACCTATGGAGATGTCTCTGCAGGCCAGGCGCTACATGACCTGCAGAGttt < 1:2251706/149‑1 (MQ=255) ctctCCAGCCCAGGTATCACGTGCCTTGTACGGTTTTGCTCAAAAAATGCCCAATTATCAGCAGCTTGTGCACAAAGCGCGGGGACGAGGGTGTGGATAACCTATGGAGATGTCTCTGCAGGCCAGGCGCTACATGACCTGCAGAGttt > 2:2251706/1‑149 (MQ=255) ctctCCAGCCCAGGTATCACGTGCCTTGTACGGTTTTGCTCAAAAAATGCCCAATTATCAGCAGCTTGTGCACAAAGCGCGGGGACGAGGGTGTGGATAACCTATGGAGATGTCTCTGCAGGCCAGGCGCTACATGACCTGCAGAGttt > 1:268083/1‑149 (MQ=255) tctcCAGCCCAGGTATCACGTGCCTTGTACGGTTTTGCTCAAAAAATGCCCAATTATCAGCAGCTTGTGCACAAAGCGCGGGGACGAGGGTGTGGATAACCTATGGAGATGTCTCTGCAGGCCAGGCGCTACATGACCTGCAGAGTTTTg > 1:1530870/1‑150 (MQ=255) tctcCAGCCCAGGTATCACGTGCCTTGTACGGTTTTGCTCAAAAAATGCCCAATTATCAGCAGCTTGTGCACAAAGCGCGGGGACGAGGGTGTGGATAACCTATGGAGATGTCTCCGCAGGCCAGGCGCTACATGACCTGCAGAGTTTTg > 2:1878169/1‑150 (MQ=255) ctcCAGCCCAGGTATCACGTGCCTTGTACGGTTTTGCTCAAAAAATGCCCAATTATCAGCAGCTTGTGCACAAAGCGCGGGGACGAGGGTGTGGATAACCTATGGAGATGTCTCTGCAGGCCAGGCGCTACATGACCTGCAGAGTTTTGa < 1:1415689/150‑1 (MQ=255) ctcCAGCCCAGGTATCACGTGCCTTGTACGGTTTTGCTCAAAAAATGCCCAATTATCAGCAGCTTGTGCACAAAGCGCGGGGACGAGGGTGTGGATAACCTATGGAGATGTCTCTGCAGGCCAGGCGCTACATGACCTGCAGAGTTTTGa < 2:2049664/150‑1 (MQ=255) ctcCAGCCCAGGTATCACGTGCCTTGTACGGTTTTGCTCAAAAAATACCTCATTATCAGCAGCTTGTGCACAAAGCGCGGGGACGAGGGTGTGGATAACCTATGGAGATGTCTCTGCAGGCCAGGCGCTACATGACCTGCAGAGTTTTGa < 1:2367835/150‑1 (MQ=255) tcCAGCCCAGGTATCACGTGCCTTGTACGGTTTTGCTCAAAAAATGCCCAATTATCAGCAGCTTGTGCACAAAGCGCGGGGACGAGGGTGTGGATAACCTATGGAGATGTCTCTGCAGGCCAGGCGCTACATGACCTGCAGAGtttt > 1:430814/1‑147 (MQ=255) tcCAGCCCAGGTATCACGTGCCTTGTACGGTTTTGCTCAAAAAATGCCCAATTATCAGCAGCTTGTGCACAAAGCGCGGGGACGAGGGTGTGGATAACCTATGGAGATGTCTCTGCAGGCCAGGCGCTACATGACCTGCAGAGtttt < 2:430814/147‑1 (MQ=255) tcCAGCCCAGGTATCACGTGCCTTGTACGGTTTTGCTCAAAAAATGCCCAATTATCAGCAGCTTGTGCACAAAGCGCGGGGACGAGGGTGTGGATAACCTATGGAGATGTCTCTGCAGGCCAGGCGCTACATGACCTGCAGAGTTTTGag > 1:109380/1‑149 (MQ=255) tcCAGCCCAGGTATCACGTGCCTTGTACGGTTTTGCTCAAAAAATGCCCAATTATCAGCAGCTTGTGCACAAAGCGCGGGGACGAGGGTGTGGATAACCTATGGAGATGTCTCTGCAGGCCAGGCGCTACATGACCTGCAGAGTTTTGAt > 1:578863/1‑150 (MQ=255) tcCAGCCCAGGTATCACGTGCCTTGTACGGTTTTGCTCAAAAAATGCCCAATTATCAGCAGCTTGTGCACAAAGCGCGGGGACGAGGGTGTGGATAACCTATGGAGATGTCTCTGCAGGCCAGGCGCTACATGACCTGCAGAGTTTTGAt > 1:1875454/1‑150 (MQ=255) tcCAGCCCAGGTATCACGTGCCTTGTACGGTTTTGCTCAAAAAATGCCCAATTAGCAGCAGCTTGTGCACAAAGCGCGGGGACGAGGGTGTGGATAACCTATGGAGATGTCTCTGCAGGCCAGGCGCTACATGACCTGCAGAGTTTTGAt < 2:873262/150‑1 (MQ=255) caccctggcggccttcatgttcatctgggcaggtttggcgatttacagcgtcgatgcatggctgaacttgcgcaaacgtagctgatcagaaaacgatcaaaaCTCTGCAGGCCAGGCGCTACATGACCTGCAGAGTTTTg > 2:1524678‑M1/103‑140 (MQ=255) aGGTATCACGTGCCTTGTACGGTTTTGCTCAAAAAATGCCCAATTATCAGCAGCTTGTGCACAAAGCGCGGGGACGAGGGTGTGGATAACCTATGGAGATGTCTCTGCAGGCCAGGCGCTACATGACCTGCAGAGTTTTGATCGTTTT‑Ct < 1:522035/150‑1 (MQ=255) gTATCACGTGCCTTGTACGGTTTTGCTCAAAAAATGCCCAATTATCAGCAGCTTGTGCACAAAGCGCGGGGACGAGGGTGTGGATAACCTATGGAGATGTCTCTGCAGGCCAGGCGCTACATGACCTGCAGAGTTTTGATCGTTTT‑CTGa < 2:1875454/150‑1 (MQ=255) tATCACGTGCCTTGTACGGTTTTGCTCAAAAAATGCCCAATTATCAGCAGCTTGTGCACAAAGCGCGGGGACGAGGGTGTGGATAACCTATGGAGATGTCTCTGCAGGCCAGGCGCTACATGACCTGCAGAGTTTTGATCGTTTT‑CTGAt < 2:314367/150‑1 (MQ=255) gTGCCTTGTACGGTTTTGCTCAAAAAATGCCCAATTATCAGCAGCTTGTGCACAAAGCGCGGGGACGAGGGTGTGGATAACCTATGGAGATGTCTCTGCAGGCCAGGCGCTACATGACCTGCAGAGTTTTGATCGTTTT‑CTGATCAGCTa > 2:800641/1‑150 (MQ=255) ccTTGTACGGTTTTGCTCAAAAAATGCCCAATTATCAGCAGCTTGTGCACAAAGCGCGGGGACGAGGGTGTGGATAACCTATGGAGATGTCTCTGC < 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ggATAACCTATGGAGATGTCTCTGCAGGCCAGGCGCTACATGACCTGCAGAGTTTTGATCGTTTT‑CTGATCAGCTACGTTTGCGCAAGTTCAGCCATGCATCGAc < 2:165749/105‑1 (MQ=255) gATAACCTATGGAGATGTCTCTGCAGGtcatgtagcgcctggcctgca > 1:208176‑M1/1‑27 (MQ=255) gATAACCTATGGAGATGTCTCTGCAGGtcatgtagcgcctggcctgca < 2:208176‑M1/48‑22 (MQ=255) gATAACCTATGGAGATGTCTCTGCAGGCCAGGCGCTACATGACCTGCAGAGTTTTGATCGTTTT‑CTGATCAGCTACGTTTGCGCAAGTTCAGCCATGCATCGACGCTGTAAATCGCCAAACCTGCCCAGATGAACATGAAGGCCGCCAgg > 1:2159877/1‑150 (MQ=255) aTAACCTATGGAGATGTCTCTGCAGGCCAGGCGCTACATGACCTGCAGAGTTTTGATCGTTTT‑CTGATCAGCTACGTTTGCGCAAGTTCAGCCATGCATCGACGCTGTAAATCGCCAAACCTGCCCAGAt > 1:811347/1‑130 (MQ=255) aTAACCTATGGAGATGTCTCTGCAGGCCAGGCGCTACATGACCTGCAGAGTTTTGATCGTTTT‑CTGATCAGCTACGTTTGCGCAAGTTCAGCCATGCATCGACGCTGTAAATCGCCAAACCTGCCCAGAt < 2:811347/130‑1 (MQ=255) aCCTATGGAGATGTCTCTGCAGGCCAGGCGCTACATGACCTGCAGAGTTTTGATCGTTTT‑CTGATCAGCTACGTTTGCGCAAGTTCAGCCATGCATCGACGCTGTAAATCGCCAAACCTGCCCAGATGAACATGAAGGCCGCCAGGGTGc > 2:137476/1‑150 (MQ=255) aCCTATGGAGATGTCTCTGCAGGCCAGGCGCTACATGACCTGCAGAGTTTTGATCGTTTT‑CTGATCAGCTACGTTTGCGCAAGTTCAGCCATGCATCGACGCTGTAAATCGCCAAACCTGCCCAGATGAACATGAAGGCCGCCAGGGTGc < 2:1651701/150‑1 (MQ=255) cTATGGAGATGTCTCTGCAGGCCAGGCGCTACATGACCTGCAGAGTTTTGATCGTTTT‑CTGATCAGCTACGTTTGCGCAAGTTCAGCCATGCATCGACGCTGTAAATCGCCAAACCTGCCCAGATGAACATGAAGGCCGCCAGGGTGCTc > 2:567962/1‑150 (MQ=255) tATGGAGATGTCTCTGCAGGCCGGGCGCTACATGATCTGCAGAGTTTTGATCGTTTT‑CTGATCAGGTACGTTTGCGCAAGTTGAGCCATGCATCGACGCTGTAAATCGCCAAACCTGCCCAGATGAAAATGAAGGGCGCCAGGGTGCTcg > 2:1277754/1‑150 (MQ=255) tATGGAGATGTCTCTGCAGGCCAGGCGCTACATGACCTGCAGAGTTTTGATCGTTTT‑CTGATCAGCTACGTTTGCGCAAGTTCAGCCATGCATCGACGCTGTAAATCGCCAAACCTGCCCAGATGAACATGAAGGCCGCCAGGGTGCTcg > 2:1447094/1‑150 (MQ=255) aTGGAGATGTCTCTGCAGGCCAGGCGCTACATGACCTGCAGAGTTTTGATCGTTTT‑CTGATCAGCTACGTTTGCGCAAGTTCAGCCATGCATCGACGCTGTAAATCGCCAAACCTGCCCAGATGAACATGAAGGCCGCCAGGGTGCTcga < 1:2167198/150‑1 (MQ=255) aTGGAGATGTAGCTGCAGGCCAGGCGCTACATGACCTGCAGAGTTTTGATCGTTTTAAGGATGA‑CTGCTGTTTCCCAAAGTCAGTCATGCATCGACGCTGTAAATCGCCAAACCTGCCCAGATTAACATGAAGGCCGCCAGGGTGCTcga < 1:168536/150‑1 (MQ=255) gagaTGTCTCTGCAGGCCAGGCGCTACATGACCTGCAGAGTTTTGATCGTTTT‑CTGATCAGCTACGTTTGCGCAAGTTCAGCCATGCATCGACGCTGTAAATCGCCAAACCTGCCCAGATGAACATGAAGGCCGCCAGGGTGCTcgacga < 1:5236/150‑1 (MQ=255) agaTGTCTCTGCAGGCCAGGCGCTACATGACCTGCAGAGTTTTGATCGTTTT‑CTGATCAGCTACGTTTGCGCAAGTTCAGCCATGCATCGACGCTGTAAATCGCCAAAc > 1:942256/1‑109 (MQ=255) gaTGTCTCTGCAGGCCAGGCGCTACATGACCTGCAGAGTTTTGATCGTTTT‑CTGATCAGCTACGTTTGCGCAAGTTCAGCCATGCATCGACGCTGTAAATCGCCAAACCTGCCCAGATGAACAt < 2:2319124/124‑1 (MQ=255) gaTGTCTCTGCAGGCCAGGCGCTACATGACCTGCAGAGTTTTGATCGTTTT‑CTGATCAGCTACGTTTGCGCAAGTTCAGCCATGCATCGACGCTGTAAATCGCCAAACCTGCCCAGATGAACAt > 1:2319124/1‑124 (MQ=255) ctctGCAGGCCAGGCGCTACATGAcctgcagagacatctccataggttatccacaccctcgtccccgcgctttgtgcacaagctgctgataattgggcatttttt < 2:483119‑M2/105‑82 (MQ=255) ctctGCAGGCCAGGCGCTACATGAcctgcagagacatctccataggttatccacaccctcgtccccgcgctttgtgcacaagctgctgataattgggcatttttt > 1:483119‑M2/1‑24 (MQ=255) | CACGGGGAAGGCCCTGTGGATAACCTGGGGGTGTACCTCTCCAGCCCAGGTATCACGTGCCTTGTACGGTTTTGCTCAAAAAATGCCCAATTATCAGCAGCTTGTGCACAAAGCGCGGGGACGAGGGTGTGGATAACCTATGGAGATGTCTCTGCAGGCCAGGCGCTACATGACCTGCAGAGTTTTGATCGTTTT‑CTGATCAGCTACGTTTGCGCAAGTTCAGCCATGCATCGACGCTGTAAATCGCCAAACCTGCCCAGATGAACATGAAGGCCGCCAGGGTGCTCGACGACAA > NC_002947/436204‑436498 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |