New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_002947 | 1798196 = | 78 (0.840) | 12 (0.140) | 9/238 | NT | 14.0% | coding (77/1128 nt) | lpxB | lipid‑A‑disaccharide synthase |
? | NC_002947 | 1798247 = | 73 (0.820) | coding (128/1128 nt) | lpxB | lipid‑A‑disaccharide synthase |
Only 100 of 107 total aligned reads displayed.
GCCACGCAACACCCTGAGGTCGAGCTGTTCCGTCAGTCGATCCTGAGCTCCGCTCGCGGCATCACGCGCTGATATGGCCCAGCTTTGCGTAGCGCTGGTCGCCGGTGAGGCCAGTGGCGATATCCTTGGTTCAGGCTTGATGCGTGCCCTCAAGGCGC‑GCCA‑CCCCGACGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATGGAGCGCCTGGCCGTCATGGGGCTAGTCGAGGTACTGGGGCGCCTGCGCGAACTGCTCAAGCGCC > NC_002947/1798047‑1798345 | gatgaatacgtcgggcttttcttcgatcagggtctggatcagttgagcaggttgcaggagcagttcgcgcactcgccccagtacctcgactagccccatgacggccaggcgctccatggggaaataggattgcaggccctcgtcctccat < 1:2254735‑M1/1‑1 (MQ=255) aCGCAACACCCTGAGGTCGAGCTGTTCCGTCAGTCGATCCTGAGCTCCGCTCGCGGCATCACGCGCTGATATGGCCCAGCTTTGCGTAGCGCTGGTCGCCGGTGAGGCCAGTGGCGATATCCTTGGTTCAGGCTTGATGCGTGCCCTCaa < 2:2176850/150‑1 (MQ=255) cGCAACACCCTGAGGTCGAGCTGTTCCGTCAGTCGATCCTGAGCTCCGCTCGCGGCATCACGCGCTGATATGGCCCAGCTTTGCGTAGCGCTGGTCGCCGGTGAGGCCAGTGGCGATATCCTTGGTTCAGGCTTGATGCGTGCCCTCAAg < 2:1440741/150‑1 (MQ=255) cGCAACACCCTGAGGTCGAGCTGTTCCGTCAGTCGATCCTGAGCTCCGCTCGCGGCATCACGCGCTGATATGGCCCAGCTTTGCGTAGCGCTGGTCGCCGGTGAGGCCAGTGGCGATATCCTTGGTTCAGGCTTGATGCGTGCCCTCAAg < 1:2370613/150‑1 (MQ=255) cGCAACACCCTGAGGTCGAGCTGTTCCGTCAGTCGATCCTGAGCTCCGCTCGCGGCATCACGCGCTGATATGGCCCAGCTTTGCGTAGCGCTGGTCGCCGGTGAGGCCAGTGGCGATATCCTTGGTTCAGGCTTGATGCGTGCCCTCAAg < 1:805708/150‑1 (MQ=255) gCAACACCCTGAGGTCGAGCTGTTCCGTCAGTCGATCCTGAGCTCCGCTCGCGGCATCACGCGCTGATATGGCCCAGCTTTGCGTAGCGCTGGTCGCCGGTGAGGCCAGTGGCGATATCCTTGGTTCAGGCTTGATGCGTGCCCTCAAgg > 2:1195503/1‑150 (MQ=255) acacCCTGAGGTCGAGCTGTTCCGTCAGTCGATCCTGAGCTCCGCTCGCGGCATCACGCGCTGATATGGCCCAGCTTTGCGTAGCGCTGGTCGCCGGTGAGGCCAGTGGCGATATCCTTGGTTCAGGCTTGATGCGTGCCCTCAAGgcgc < 2:2268694/150‑1 (MQ=255) ccTGAGGTCGAGCTGTTCCGTCAGTCGATCCTGAGCTCCGCTCGCGGCATCACGCGCTGATATGGCCCAGCTTTGCGTAGCGCTGGTCGCCGGTGAGGCCAGTGGCGATATCCTTGGTTCAGGCTTGATGCGTGCCCTCAAGGCGC‑GCCa > 1:35057/1‑150 (MQ=255) tGAGGTCGAGCTGTTCCGTCAGTCGATCCTGAGCTCCGCTCGCGGCATCACGCGCTGATATGGCCCAGCTTTGCGTAGCGCTGGTCGCCGGTGAGGCCAGTGGCGATATCCTTGGTTCAGGCTTGATGCGTGCCCTCAAGGCGC‑GCCA‑cc > 2:444884/1‑150 (MQ=255) tGAGGTCGAGCTGTTCCGTCAGTCGATCCTGAGCTCCGCTCGCGGCATCACGCGCTGATATGGCCCAGCTTTGCGTAGCGCTGGTCGCCGGTGAGGCCAGTGGCGATATCCTTGGTTCAGGCTTGATGCGTGCCCTCAAGGCGC‑GCCA‑cc < 2:1588621/150‑1 (MQ=255) gAGCTGTTCCGTCAGTCGATCCTGAGCTCCGCTCGCGNCATCACGCGNTGATATGGCCCAGCTTTGCGTAGCGCGGGTACCCGGCGAGGCCAGTGGCGATATCCTTATCTGCTGCGCGATGCGTGCCCTCCAGGCTC‑GCCA‑CCACGACGt > 1:367440/1‑150 (MQ=255) aGCTGTTCCGTCAGTCGATCCTGAGCTCCGCTCGCGGCATCACGCGCTGATATGGCCCAGCTTTGCGTAGCGCTGGTCGCCGGTGAGGCCAGTGGCGATATCCTTGGTTCAGGCTTGATGCGTGCCCTCAAGGCGC‑GCCA‑CCCCGACGTg > 2:1918494/1‑150 (MQ=255) gCTGTCCCGTCAGTCGATCCTGAGCTCCGCTCGCGGCATCACGCGCTGATATGGCCCAGCTTTGCGTAGCGCTGGTCGCCGGTGAGGCCAGTGGCGATATCCTTGGTTCAGGCTTGATGCGTGCCCTCAAGGCGC‑GCCA‑CCCCGACGTGc < 1:557164/150‑1 (MQ=255) ttCCGTCAGTCGATCCTGAGCTCCGCTCGCGGCATCACGCGCTGATATGGCCCAGCTTTGCGTAGCGCTGGTCGCCGGTGAGGCCAGTGGCGATATCCTTGGTTCAGGCTTGATGCGTGCCCTCaa > 1:1214098/1‑126 (MQ=255) ttCCGTCAGTCGATCCTGAGCTCCGCTCGCGGCATCACGCGCTGATATGGCCCAGCTTTGCGTAGCGCTGGTCGCCGGTGAGGCCAGTGGCGATATCCTTGGTTCAGGCTTGATGCGTGCCCTCaa < 2:1214098/126‑1 (MQ=255) ccGTCAGTCGATCCTGAGCTCCGCTCGCGGCATCACGCGCTGATATGGCCCAGCTTTGCGTAGCGCTGGTCGCCGGTGAGGCCAGTGGCGATATCCTTGGTTCAGGCTTGATGCGTGCCATCAAGGCGC‑GCCA‑CCCCGACGTGCGTTTCa > 2:780596/1‑150 (MQ=255) gTCAGTCGATCCTGAGCTCCGCTCGCGGCATCACGCGCTGATATGGCCCAGCTTTGCGTAGCGCTGGTCGCCGGTGAGGCCAGTGGCGATATCCTTGGTTCAGGCTTGATGCGTGCCCTCAAGGCGC‑GCCA‑CCCCGACGt < 1:2250867/140‑1 (MQ=255) gTCAGTCGATCCTGAGCTCCGCTCGCGGCATCACGCGCTGATATGGCCCAGCTTTGCGTAGCGCTGGTCGCCGGTGAGGCCAGTGGCGATATCCTTGGTTCAGGCTTGATGCGTGCCCTCAAGGCGC‑GCCA‑CCCCGACGt > 2:2250867/1‑140 (MQ=255) aGTCGATCCTGAGCTCCGCTCGCGGCATCACGCGCTGATATGGCCCAGCTTTGCGTAGCGCTGGTCGCCGGTGAGGCCAGTGGCGATATCCTTGGTTCAGGCTTGATGCGTGCCCTCAAGGCGC‑GCCA‑CCCCGACGTGCGTTTCATCggg < 2:1767527/150‑1 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aCGCGCTGATATGGCCCAGCTTTGCGTAGCGCTGGTCGCCGGTGAGGCCAGTGGCGATATCCTTGGTTCAGGCTTGATGCGTGCCCTCAAGGCGC‑GCCA‑CCCCGACGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAggg > 1:2063155/1‑150 (MQ=255) cgcTGATATGGCCCAGCTTTGCGTAGCGCTGGTCGCCGGTGAGGCCAGTGGCGATATCCTTGGTTCAGGCTTGATGCGTGCCCTCaa < 1:1626225/87‑1 (MQ=255) cgcTGATATGGCCCAGCTTTGCGTAGCGCTGGTCGCCGGTGAGGCCAGTGGCGATATCCTTGGTTCAGGCTTGATGCGTGCCCTCaa > 2:1626225/1‑87 (MQ=255) gcTGATATGGCCCAGCTTTGCGTAGCGCTGGTCGCCGGTGAGGCCAGTGGCGATATCCTTGGTTCAGGCTTGATGCGTGCCCTCAAGGCGC‑GCCA‑CCCCGACGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTg < 2:781669/150‑1 (MQ=255) tGGCCCAGCTTTGCGTAGCGCTGGTCGCCGGTGAGGCCAGTGGCGATATCCTTGGTTCAGGCTTGATGCGTGCCCTCAAGGCGC‑GCCA‑CCCCGACGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCt < 2:35057/150‑1 (MQ=255) gCCCAGCTTTGCGTAGCGCTGGTCGCCGGTGAGGCCAGTGGCGATATCCTTGGTTCAGGCTTGATGCGTGCCCTCAAGGCGC‑GCCA‑CCCCGACGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTAt < 2:2063155/150‑1 (MQ=255) 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gATATCCTTGGTTCAGGCTTGATGCGTGCCCTCAAGGCGC‑GCCA‑CCCCGACGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCGTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATGGAGCGCCTGGCCGTCATGGGGCTAGTCGAGGTa > 2:1042930/1‑150 (MQ=255) cTTGGTTCAGGCTTGATGCGTGCCCTCAAGGCGC‑GCCA‑CCCCGACGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGGTGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATGGAGCGCCTGGCCGTCATGGGGCTAGTCGAGGTACTgggg > 1:1380501/1‑150 (MQ=255) cTTGGTTCAGGCTTGATGCGTGCCCTCAAGGCGC‑GCCA‑CCCCGACGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATg < 2:2217928/111‑1 (MQ=255) cTTGGTTCAGGCTTGATGCGTGCCCTCAAGGCGC‑GCCA‑CCCCGACGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATg > 1:2217928/1‑111 (MQ=255) cTTGGTTCAGGCTTGATGCGTGCCCTCAAGGCGC‑GCCA‑CCCCGACGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATGGAGCGCCTGGCCGTCATgg > 2:2224627/1‑130 (MQ=255) cTTGGTTCAGGCTTGATGCGTGCCCTCAAGGCGC‑GCCA‑CCCCGACGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATGGAGCGCCTGGCCGTCATgg < 1:2224627/130‑1 (MQ=255) cTTGGTTCAGGCTTAATGCGTGCCCTCAAGGCGC‑GCCA‑CCCCGACGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATGGAGCGCCTGGCCGTCATGGGGCTAGTCGAGGTACTgggg > 2:1890045/1‑150 (MQ=255) ttGGTTCAGGCTTGATGCGTGCCCTCAAGGCGC‑GCCA‑CCCCGACGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAGGGACGGCAATCCTATTTCCCCAGGGAGCGCCTGGCCGTCATGGGGCTAGTCGAAGCACTGGGgc > 2:851654/1‑150 (MQ=255) ttCAGGCTTGATGCGTGCCCTCAAGGCGC‑GCCA‑CCCCGACGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATGGAGCGCCTGGCCGTCATGGGGCTAGTCGAGGTACTGGGGCGCCt > 1:997210/1‑150 (MQ=255) aGGCTTGATGCGTGCCCTCAAGGCGC‑GCCA‑CCCCGACGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATGGAGCGCCTGGCCGTCATGGGGCTAGTCGAGGCACTGGGGCGCCTgcg > 2:1120633/1‑150 (MQ=255) ggCTTGATGCGTGCCCTCAAGGCGC‑GCCA‑CCCCGACGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATGGAGCGCCTGGCCGTCATGGGGCTAGTCGAGGTACTGGGGCGCCTgcgc > 2:1580025/1‑150 (MQ=255) ttGATGCGTGCCCTCAAGGCGC‑GCCA‑CCCCGACGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATGGAGCGCCTGGCCGTCATGGGGCTAGTCGAGGTACTGGGGCGCCTGCGCGaa < 1:1584207/150‑1 (MQ=255) tGATGCGTGCCCTCAGGGCGC‑GCCA‑CCCCGACGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTcc < 2:2448733/93‑1 (MQ=255) tGATGCGTGCCCTCAGGGCGC‑GCCA‑CCCCGACGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTcc > 1:2448733/1‑93 (MQ=255) tGATGCGTGCCCTCAAGGCGC‑GCCA‑CCCCGACGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTcc > 1:1178829/1‑93 (MQ=255) tGATGCGTGCCCTCAAGGCGC‑GCCA‑CCCCGACGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTcc < 2:1178829/93‑1 (MQ=255) tGCGTGCCCTCAAGGCGC‑GCCA‑CCCCGACGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATGGAGCGCCTGGCCGTCATGGGGCTAGTCGAGGTACTGGGGCGCCTGCGCGAACTGc < 1:1445949/150‑1 (MQ=255) cGTGCCCTCAAGGCGC‑GCCA‑CCCCGACGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATGGAGCGCCTGGCCGTCATGGGGCTAGTCGAGGTACTGGGGCGCCTGCGCGAACTGCTc < 1:1890045/150‑1 (MQ=255) tgccaTCAAGGCGC‑GCCA‑CCACGACGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTCGACGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATAGAGCGCCTGGCCGTCATGGGGCTAGTCGAGGTACTGGGGCGCCTGCGCGAACTGGTCaa > 2:367440‑M1/6‑150 (MQ=255) tGCCCTCAAGGCGC‑GCCA‑CCCCGACGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATGGAGCGCCTGGCCGTCATGGGGCTAGTCGAGGTACTGGGGCGCCTGCGCGAACTGCTCaa < 2:958431/150‑1 (MQ=255) cTCAAGGCGC‑GCCA‑CCCCGACGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATGGAGCGCCTGGCCGTCATGGGGCTAGTCGAGGTACTGGGGCGCCTGCGCGAACTGCTCAAgcgc > 1:2140138/1‑150 (MQ=255) cTCAAGGCGC‑GCCA‑CCCCGACGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATGGAGCGCCTGGCCGTCATGGGGCAAGTCGAGGTACTGGGGCGCCTGCGCGAACTGCTCAAgcgc > 2:1485628/1‑150 (MQ=255) TCAAGGCGC‑GCCA‑CCCCGACGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAAGCGGAGGTAGGTTAAGCCTACTTTAACATGGAGCGCCTGGCCGTCATGGGGCTAGTCGAGGTACTGGGGCGCCTGCGCGAACTGCTCAAGcgcc > 1:1356124‑M1/1‑150 (MQ=255) | GCCACGCAACACCCTGAGGTCGAGCTGTTCCGTCAGTCGATCCTGAGCTCCGCTCGCGGCATCACGCGCTGATATGGCCCAGCTTTGCGTAGCGCTGGTCGCCGGTGAGGCCAGTGGCGATATCCTTGGTTCAGGCTTGATGCGTGCCCTCAAGGCGC‑GCCA‑CCCCGACGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATGGAGCGCCTGGCCGTCATGGGGCTAGTCGAGGTACTGGGGCGCCTGCGCGAACTGCTCAAGCGCC > NC_002947/1798047‑1798345 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |