| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 2028004 = | 75 (0.800) | 4 (0.050) | 4/238 | NT | 5.4% | coding (751/1005 nt) | wbpL | glycosyl transferase WbpL |
| ? | NC_002947 | 2028039 = | 68 (0.770) | coding (786/1005 nt) | wbpL | glycosyl transferase WbpL | |||||
CCCCCGCACGTATTTTTATGGGCGATGCCGGCAGTGGCTTTCTGGGTATCGTGCTAGGGCTGCTGGCATTAGTGGCAGGCTGGGTAAACCCGCTATTATTCTGGGGGTGGTTAATACTTTCGGGTGTATTCGTGGTTGATGCCACGTTTACCTTGGCGCGGCGCCTGCTGCGCGGTGACAAGGTTTATCAGGCGCATCGCAGCCATGCTTATCAGTATGCGGCTCGCCGGCATGGTCACCATCGACCGGTGAGCCTGGCCGTGGCGGCTATTAACCTGGTCTGGCTACTACCGGTGGCC > NC_002947/2027855‑2028153 | gtgcgccatcgaggttcaacagcactaccgccagggccaccggtagtagccagaccaggttaatagccgccacggccaggctcaccggtcgatggtgaccatgccggcgagccgcatactgataagcatggctgcgatgcgcctgataaa > 1:2286566‑M1/150‑150 (MQ=255)gtgcgccatcgaggttcaacagcactaccgccagggccaccggtagtagccagaccaggttaatagccgccacggccaggctcaccggtcgatggtgaccatgccggcgagccgcatactgataagcatggctgcgatgcgcctgataaa < 2:317602‑M1/1‑1 (MQ=255) tgcgccatcgaggttcaacagcactaccgccagggccaccggtagtagccagaccaggttaatagccgccacggccaggctcaccggtcgatggtgaccatgccggcgagccgcatactgataagcatggctgcgatgcgcctgataaAc > 2:1332496‑M1/149‑150 (MQ=255) tgcgacatcgaggttcaacagcactaccgctagggccaccggtagtagccagaccaggttaatagcctccacgtccagcctcaccggtcgatgttgaccatgccggcgagccgcatactgataagcatggctgcgatgcgcctgataaAc > 2:338859‑M1/149‑150 (MQ=255) gccatcgaggttcaacagcactaccgccagggccaccggtagtagccagaccaggttaatagccgccacggccaggctcaccggtcgatggtgaccatgccggcgagccgcatactgataagcatggctgcgatgcgcctgataaACCtt < 1:1782419‑M1/5‑1 (MQ=255) cGCACGTATTTTTATGGGCGATGCCGGCAGTGGCTTTCTGGGTATCGTGCTAGGGCTGCTGGCATTAGTGGCAGGCTGGGTAAACCCGCTATTATTCTGGGGGTGGTTAATACTTTCGGGTGTATTCGTGGTTGATGCCACGTTTACCtt < 2:10843/150‑1 (MQ=255) cGCACGTATTTTTATGGGCGATGCCGGCAGTGGCTTTCTGGGTATCGTGCTAGGGCTGCTGGCATTAGTGGCAGGCTGGGTAAACCCGCTATTATTCTGGGGGTGGTTAATACTTTCGGGTGTATTCGTGGTTGATGCCACGTTTACCtt > 2:590042/1‑150 (MQ=255) cGCACGTATTTTTATGGGCGATGCCGGCAGTGGCTTTCTGGGTATCGTGCTAGGGCTGCTGGCATTAGTGGCAGGCTGGGTAAACCCGCTATTATTCTGGGGGTGGTTAATACTTTCGGGTGTATTCGTGGTTGATGCCACGTTTACCtt < 1:161978/150‑1 (MQ=255) gCACGTATTTTTATGGGCGATGCCGGCAGTGGCTTTCTGGGTATCGTGCTAGGGCTGCTGGCATTAGTGGCAGGCTGGGTAAACCCGCTATTATTCTGGGGGTGGTTAATACTTTCGGGTGTATTCGTGGTTGATGCCACGTTTACCTTg < 2:702408/150‑1 (MQ=255) gCACGTATTTTTATGGGCGATGCCGGCAGTGGCTTTCTGGGTATCGTGCTAGGGCTGCTGGCATTAGTGGCAGGCTGGGTAAACCCGCTATTATTCTGGGGGTGGTTAATACTTTCGGGTGTATTCGTGGTTGATGCCACGTTTACCTTg < 2:538717/150‑1 (MQ=255) gCACGTAGTTTTATGGGCGATGCCGGCAGTGGCTTTCTGGGTATCGGGCTAGGGCTGCTGGCATTAGGGGCAGGCTGGGTAAACCCGCGATTATTCTGGGGGTGGTTAATACTTTCGGGTGTATTCGTGGTTGATGCCACGTTTACCTTg < 2:236764/150‑1 (MQ=255) ccatcgaggttcaacagcactaccgccagggccaccggtagtagccagaccaggttaatagccgccacggccaggctcaccggtcgatggtgaccatgccggcgagccgcatactgataagcatggctgcgatgcgcctgataaACCTTg < 1:1179077‑M1/6‑1 (MQ=255) gTATTTTTATGGGCGATGCCGGCAGTGGCTTTCTGGGTATCGTGCTAGGGCTGCTGGCATTAGTGGCAGGCTGGGTAAACCCGCTATTATTCTGGGGGTGGTTAATACTTTCGGGTGTATTCGTGGTTGATGCCACGTTTACCTTggcgc < 1:1744738/150‑1 (MQ=255) gTATTTTTATGGGCGATGCCGGCAGTGGCTTTCTGGGGATCGTGCTAGGGCTGCTGGCATTAGTGGCAGGCTGGGTAAACCCGCTATTATTCTGGGGGTGGTTAATACTTTCGGGTGTATTCGTGGTTGATGCCACGTTTACCTTggcgc > 2:264711/1‑150 (MQ=255) aTTTTTATGGGCGATGCCGGCAGTGGCTTTCTGGGTATCGTGCTAGGGCTGCTGGCATTAGTGGCAGGCTGGGTAACCCCGCTATTATTCTGGGGGTGGTTAATACTTTCGGGTGTATTCGTGGTTGATGCCACGTTTACCTTggcgcgg < 1:1662450/150‑1 (MQ=255) aTTTTTATGGGCGATGCCGGCAGTGGCTTTCTGGGTATCGTGCTAGGGCTGCTGGCATTAGTGGCAGGCTGGGTAAACCCGCTATTATTCTGGGGGTGGTTAATACTTTCGGGTGTATTCGTGGTTGATGCCACGTTTACCTTggcgcgg < 1:1662439/150‑1 (MQ=255) tttttATGGGCGATGCCGGCAGTGGCTTTCTGGGTATCGTGCTAGGGCTGCTGGCATTAGTGGCAGGCTGGGTAAACCCGCTATTATTCTGGGGGTGGTTACTACTTTCGGGTGTATTCGTGGTTGATGCCACGTTTACCTTggcgcggc < 2:1026278/150‑1 (MQ=255) aTGCCGGCAGTGGCTTTCTGGGTATCGTGCTAGGGCTGCTGGCATTAGTGGCAGGCTGGGTAAACCCGCTATTATTCTGGGGGTGGTTAATACTTTCGGGTGTATTCGTGGTTGATGCCACGTTTACCTTGGCGCGGCGCCTGCTGcgcg < 2:1660289/150‑1 (MQ=255) cGGCAGTGGCTTTCTGGGTATCGTGCTAGGGCTGCTGGCATTAGTGGCAGGCTGGGTAAACCCGCTATTATTCTGGGGGTGGTTAATACTTTCGGGTGTATTCGTGGTTGATGCCACGTTTACCTTGGCGCGGCGCCTGCTGCGCGGTGa < 2:2413956/150‑1 (MQ=255) cGGCAGTGGCTTTCTGGGTATCGTGCTAGGGCTGCTGGCATTAGTGGCAGGCTGGGTAAACCCGCTATTATTCTGGGGGTGGTTAATACTTTCGGGTGTATTCGTGGTTGATGCCACGTTTACCTTGGCGCGGCGCCTGCTGCGCGGTGa > 2:1320474/1‑150 (MQ=255) cGGCAGTGGCTTTCTGGGTATCGTGCTAGGGCTGCTGGCATTAGTGGCAGGCTGGGTAAACCCGCTATTATTCTGGGGGTGGTTAATACTTTCGGGTGTATTCGTGGTTGACGCCACGTTTACCTTGGCGCGGCGCCTGCTGCGCGGTGa < 1:787643/150‑1 (MQ=255) gTGGCTTTCTGGGTATCGTGCTAGGGCTGCTGGCATTAGTGGCAGGCTGGGTAAACCCGCTATTATTCTGGGGGTGGTTAATACTTTCGGGTGTATTCGTGGTTGATGCCACGTTTACCTTGGCGCGGCGCCTGCTGCGCGGTGACAAgg < 1:83847/150‑1 (MQ=255) tGGCTTTCTGGGTATCGTGCTAGGGCTGCTGGCATTAGTGGCAGGCTGGGTAAACCCGCTATTATTCTGGGGGTGGTTAATACTTTCGGGTGTATTCGTGGTTGATGCCACGTTTACCTTGGCGCGGCGCCTGCTGCGCGGTGACAAGGt < 2:765273/150‑1 (MQ=255) tttCTGGGTATCGTGCTAGGGCTGCTGGCATTAGTGGCAGGCTGGGTAAACCCGCTATTATTCTGGGGGTGGTTAATACTTTCGGGTGTATTCGTGGTTGATGCCACGTTTACCTTGGCGCGGCGCCTGCTGCGCGGTGACAAGGTTTAt > 2:2182784/1‑150 (MQ=255) ttCTGGGTATCGTGCTAGGGCTGCTGGCATTAGTGGCAGGCTGGGTAAACCCGCTATTATTCTGGGGGTGGTTAATACTTTCGGGTGTATTCGTGGTTGATGCCACGTTTACCTTGGCGCGGCGCCTGCTGCGCGGTGACAAGGTTTATc < 1:1694268/150‑1 (MQ=255) tGGGTATCGTGCTAGGGCTGCTGGCATTAGTGGCAGGCTGGGTAAACCCGCTATTATTCTGGGGGTGGTTAATACTTTCGGGTGTATTCGTGGTTGATGCCACGTTTACCTTGGCGCGGCGCCTGCTGCGCGGTGACAAGGTTTATCAgg < 1:2452719/150‑1 (MQ=255) tGGGTATCGTGCTAGGGCTGCTGGCATTAGTGGCAGGCTGGGTAAACCCGCTATTATTCTGGGGGTGGTTAATACTTTCGGGTGTATTCGTGGTTGATGCCACGTTTACCTTGGCGCGGCGCCTGCTGCGCGGTGACAAGGTTTATCAgg < 2:560359/150‑1 (MQ=255) tCGTGCTAGGGCTGCTGGCATTAGTGGCAGGCTGGGTAAACCCGCTATTATTCTGGGGGTGGTTAATACTTTCGGGTGTATTCGTGGTTGATGCCACGTTTACCTTGGCGCGGCGCCTGCTGCGCGGTGACAAGGTTTATCAGGCGCATc > 2:1885534/1‑150 (MQ=255) accaggttaatagccgccacggccaggctcaccggtcgatggtgaccatgccggcgagccgcatactgataagcatggctgcgatgcgcctgataaACCTTGGCGCGGCGCCTGCTGCGCGGTGACAAg < 1:1291496‑M1/33‑1 (MQ=255) accaggttaatagccgccacggccaggctcaccggtcgatggtgaccatgccggcgagccgcatactgataagcatggctgcgatgcgcctgataaACCTTGGCGCGGCGCCTGCTGCGCGGTGACAAg > 2:1291496‑M1/97‑129 (MQ=255) gggCTGCTGGCATTAGTGGCAGGCTGGGTAAACCCGCTATTATTCTGGGGGTGGTTAATACTTTCGGGTGTATTCGTGGTTGATGCCACGTTTACCTTGGCGCGGCGCCTGCTGCGCGGTGACAAGGTTTATCAGGCGCATCGCAGCCAt > 2:1786683/1‑150 (MQ=255) ggCTGCTGGCATTAGTGGCAGGCTGGGTAAACCCGCTATTATTCTGGGGGTGGTTAATACTTTCGGGTGTATTCGTGGTTGATGCCACGTTTACCTTGGCGCGGCGCCTGCTGCGCGGTGAAAAGGTATATCGGGCGCAACGCATCCATg > 2:1959994/1‑150 (MQ=255) tgctgGCATTAGTGGCAGGCTGGGTAAACCCGCTATTATTCTGGGGGTGGTTAATACTTTCGGGTGTATTCGTGGTTGATGCCACGTTTACCTTGGCGCGGCGCCTGCTGCGCGGTGACAAGGTTTATCAGGCGCATCGCAGCCATGCtt > 2:1120731/1‑150 (MQ=255) aatagccgccacggccaggctcaccggtcgatggtgaccatgccggcgagccgcatactgataagcatggctgcgatgcgcctgataaACCTTGGCGCGGCGCCTGCTGCGCGGTGACAAgg > 2:2216515‑M1/89‑122 (MQ=255) aatagccgccacggccaggctcaccggtcgatggtgaccatgccggcgagccgcatactgataagcatggctgcgatgcgcctgataaACCTTGGCGCGGCGCCTGCTGCGCGGTGACAAgg < 1:2216515‑M1/34‑1 (MQ=255) aggCATTAGTGGCAGGCTGGGTAAACCCGCTATTATTCTGGGGGTGGTTAATACTTTCGGGTGTATTCGTGGTTGATGCCACGTTTACCTTGGCGCGGCGCCTGCTGCGCGGTGACAAGGTTTATCAGGCGCATCGCAGCCATGCTTATc > 1:1902389/2‑150 (MQ=255) ggCATTAGTGGCAGGCTGGGTAACCCCGCTATTATTCTGGGGGTGGTTAATACTTTCGCGTGTATTCGTGGTTGATGCCACGTCTGCCTTGGCGCGGCTCCTGCTTCGCGGTTACAAGGTTTATCATGCCCATCGCCATCAGGCTTATCa < 2:873469/150‑1 (MQ=255) ggCATTAGTGGCAGGCTGGGTAAACCCGCTATTATTCTGGGGGTGGTTAATACTTTCGGGTGTATTCGTGGTTGATGCCACGTTTACCTTGGCGCGGCGCCTGCTGCGCGGTGACAAGGTTTATCAGGCGCATCGCAGCCATGCTTATCa < 1:1959994/150‑1 (MQ=255) ggCATTAGTGGCAGGCTGGGTAAACCCGCTATTATTCTGGGGGTGGTTAATACTTTCGGGTGTATTCGTGGTTGATGCCACGTTTACCTTGGCGCGGCGCCTGCTGCGCGGTGACAAGGTTTATCAGGCGCATCGCAGCCATGCTTATCa < 1:1369510/150‑1 (MQ=255) ggCATTAGTGGCAGGCTGGGTAAACCCGCTATTATTCTGGGGGTGGTTAATACTTTCGGGTGTATTCGTGGTTGATGCCACGTTTACCTTGGCGCGGCGCCTGCTGCGCGGTGACAAGGTCTATCAGGCGCATCGCAGCCATGCTTATCa < 1:1320474/150‑1 (MQ=255) aTTAGTGGCAGGCTGGGTAAACCCGCTATTATTCTGGGGGTGGTTAATACTTTCGGGTGTATTCGTGGTTGATGCCACGTTTACCTTGGCGCGGCGCCTGCTGCGCGGTGACAAGGTTTATCAGGCGCATCGCAGCCATGCTTATCAGTa > 1:2372671/1‑150 (MQ=255) ttAGTGGCAGGCTGGGTAAACCCGCTATTATTCTGGGGGTGGTTAATACTTTCGGGTGTATTCGTGGTTGATGCCACGTTTACCTTGGCGCGGCGCCGGCTGCGCGGTGACAAGGTTTATCAGGCGCATCGCAGCCATGCTTATCAGTAt < 2:1902389/150‑1 (MQ=255) tAGTGGCAGGCTGGGTAAACCCGCTATTATTCTGGGGGTGGTTAATACTTTCGGGTGTATTCGTGGTTGATGCCACGTTTACCTTGGCGCGGCGCCTGCTGCGCGGTGACAAGGTTTATCAGGCGCATCGCAGCCATGCTTATCAGTATg < 1:1885534/150‑1 (MQ=255) gTGGCAGGCTGGGTAAACCCGCTATTATTCTGGGGGTGGTTAATACTTTCGGGTGTATTCGTGGTTGATGCCACGTTTACCTTGGCGCGGCGCCTGCTGCGCGGTGACAAGGTTTATCAGGCGCATCGCa < 1:275703/130‑1 (MQ=255) gTGGCAGGCTGGGTAAACCCGCTATTATTCTGGGGGTGGTTAATACTTTCGGGTGTATTCGTGGTTGATGCCACGTTTACCTTGGCGCGGCGCCTGCTGCGCGGTGACAAGGTTTATCAGGCGCATCGCa > 2:275703/1‑130 (MQ=255) tGGCAGGCTGGGTAAACCCGCTATTATTCTGGGGGTGGTTAATACTTTCGGGTGTATTCGTGGTTGATGCCACGTTTACCTTGGCGCGGCGCCTGCTGCGCGGTGACAAGGTTTATCAGGCGCATCGCAGCCAt > 2:2266708/1‑134 (MQ=255) tGGCAGGCTGGGTAAACCCGCTATTATTCTGGGGGTGGTTAATACTTTCGGGTGTATTCGTGGTTGATGCCACGTTTACCTTGGCGCGGCGCCTGCTGCGCGGTGACAAGGTTTATCAGGCGCATCGCAGCCAt < 1:2266708/134‑1 (MQ=255) tGGCAGGCTGGGTAAACCCGCTATTATTCTGGGGGTGGTTAATACTTTCGGGTGTATTCGTGGTTGATGCCACGTTTACCTTGGCGCGGCGCCTGCTGCGCGGTGACAAGGTTTATCAGGCGCATCGCAGCCATGCTTATCAGTATGCgg < 1:157707/150‑1 (MQ=255) ggCAGGCTGGGTAAACCCGCTATTATTCTGGGGGTGGTTAATACTTTCGGGTGTATTCGTGGTTGATGCCACGTTTACCTTGGCGCGGCGCCTGCTGCGCGGTGACAAGGTTTATCAGGCGCATCGCAGCCATGCTTATCAGTATGCGGc < 1:2182784/150‑1 (MQ=255) cAGGCTGGGTAAACCCGCTATTATTCTGGGGGTGGTTAATACTTTCGGGTGTATTCGTGGTTGATGCCACGTTTACCTTGGCGCGGCGCCTGCTGCGCGGTGACAAGGTTTATCAGGCGCATCGCAGCCATGCTTATCAGTATGCGGCTc < 1:264711/150‑1 (MQ=255) aGGCTGGGTAAACCCGCTATTATTCTGGGGGTGGTTAATACTTTCGGGTGTATTCGTGGTTGATGCCACGTTTACCTTGGCGCGGCGCCTGCTGCGCGGTGACAAGGTTTATCAGGCGCATCGCAGCCATGCTTATCAGTATGCGGCTCg > 1:454537/1‑150 (MQ=255) aGGCTGGGTAAACCCGCTATTATTCTGGGGGTGGTTAATACTTTCGGGTGTATTCGTGGTTGATGCCACGTTTACCTTGGCGCGGCGCCTGCTGCGCGGTGACAAGGTTTATCAGGCGCATCGCAGCCATGCTTATCAGTATGCGGCTCg > 2:1338829/1‑150 (MQ=255) gCTGGGTAAACCCGCTATTATTCTGGGGGTGGTTAATACTTTCGGGTGTATTCGTGGTTGATGCCACGTTTACCTTGGCGCGGCGCCTGCTGCGCGGTGACAAGGTTTATCAGGCGCATCGCAGCCATGCTTATCAGTATGCGGCTCGcc > 2:1681220/1‑150 (MQ=255) ggTAAACCCGCTATTATTCTGGGGGTGGTTAATACTTTCGGGTGTATTCGTGGTTGATGCCACGTTTACCTTGGCGTGGCGCCTGCTGCGCGGGGACAAGGTTTATCAGGCGCATCGCAGCCATGCTTATCAGTATGCGGCTCGCCGGCa > 2:1036283/1‑150 (MQ=255) tAAACCCGCTATTATTCTGGGGGTGGTTAATACTTTCGGGTGTATTCGTGGTTGATGCCACGTTTACCTTGGCGCGGCGCCTGCTGCGCGGTGACAAGGTTTATCAGGCGCATCGCAGCCATGCTTATCAGTATGCGGATCGCCGGCATg > 2:1467396/1‑150 (MQ=255) 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cTATTATTCTGGGGGTGGTTAATACTTTCGGGTGTATGCGTGGTTGATGCCACGTTTACCTTGGCGCGGCGCCTGCTGCGCCGTGACAAGGTTTATCAGGCGCATCGCAGCCATGCTTATCAGTATGCGGCTCGCCGGCATGGTCACCAt < 2:1376979/150‑1 (MQ=255) ttCTGGGGGTGGTTAATACTTTCGGGTGTATTCGTGGTTGATGCCACGTTTACCTTGGCGCGGCGCCTGCTGCGCGGTGACAAGGTTTATCAGGCGCATCGCAGCCATGCTTATCAGTATGCGGCTCGCCGGCATGGTCACCATCGACCg > 2:1875232/1‑150 (MQ=255) ttCTGGGGGTGGATAAGAGTTTCGGGTGTATTCGTGGTTGATGCCACGTTTACCTTGGCGCGGCGCCTGCTGCGCGGTGACAAGGTTTATCAGGCGCATCGCAGCCATGCTTATCAGTATGCGGCTCGCCGGCATGGTCACCATCGACCg > 2:2368525/1‑150 (MQ=255) tGGGGGTGGTTAATACTTTCGGGTGTATTCGTGGTTGATGCCACGTTTACCTTGGCGCGGCGCCTGCTGCGCGGTGACAAGGTTTATCAGGCGCATCGCAGCCATGCTTATCAGTATGCGGCTCGCCGGCATGGTCACCATCGACCGGTg > 2:1782419/1‑150 (MQ=255) gggggTGGTTAATACTTTCGGGTGTATTCGTTGTTGATGCCACGTTTACCTTGGCGCGGCGCCTGCTGCGCGGTGACAAGGTTTATCAGGCGCATCGCAGCCATGCTTATCAGTATGCGGCTCGCCGGCATGGTCACCATCGACCGGTGa < 2:88011/150‑1 (MQ=255) 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CCCCCGCACGTATTTTTATGGGCGATGCCGGCAGTGGCTTTCTGGGTATCGTGCTAGGGCTGCTGGCATTAGTGGCAGGCTGGGTAAACCCGCTATTATTCTGGGGGTGGTTAATACTTTCGGGTGTATTCGTGGTTGATGCCACGTTTACCTTGGCGCGGCGCCTGCTGCGCGGTGACAAGGTTTATCAGGCGCATCGCAGCCATGCTTATCAGTATGCGGCTCGCCGGCATGGTCACCATCGACCGGTGAGCCTGGCCGTGGCGGCTATTAACCTGGTCTGGCTACTACCGGTGGCC > NC_002947/2027855‑2028153 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |