New junction evidence | |||||||||||
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? | NC_002947 | = 3840201 | 93 (1.040) | coding (1081/1158 nt) | PP_3389 | membrane protein |
Only 100 of 112 total aligned reads displayed.
GGGATGATGGATTTGCATCGTGCTGCAACTGGCTGCCGATGAAGTGCGCCGGGTGCAGTTGGATCAGTCACTTTCGTTGGCCTGTTGAGGAGTAGAGCGCTTGCGTGGTTTTTTCGCCGGCCGCTTGCCGGGCTTGAGCTGCCAGCGGTCGGCGTTGGCGAGCAGGCGTGCCTGGATTGCGGGTGGGTAGTCGCTCAGGGTTGTCACGGGTGGGACTGGCTTGCCGGGCAGGCCGGCCTCGCGGATGACCTTCGGCCAGCGCGGTCGCCAGCACAGCAGCAGGCTGAGCCAGTGGG > NC_002947/2360003‑2360298 | gcgaccgcgccggccgaaggtcatccgcgaggccggcctgcccggcaagccagtcccacccgtgacaaccctgcgcgactaccctcccgcaatccaggcacgcctgctcgccaacgccgaccgctggcagctcaagcccggcaagcggcc > 1:366356‑M1/150‑150 (MQ=255) ggATGATGGATTTGCATCGTGCTGCAACTGGCTGCCGATGAAGTGCGCTGGGTGCAGTTGGATCAGTCACTTTCGTTGTCCTGTTGAGGAGTAGAGCGCTTGCGTGGTTTTTTCGCCGGCCGCTTGCCGGGCTTGAGCTGCCAGCGGTCg < 2:1463395/150‑1 (MQ=255) gatgatGGATTTGCATCGTGCTGCAACTGGCTGCCGATGAAGTGCGCCGGGTGCAGTTGGATCAGTCACTTTCGTTGGCCTGTTGAGGAGTAGAGCGCTTGCGTGGTTTTTTCGCCGGCCGCTTGCCGGGCTTGAGCTGCCAGCGGTCgg > 1:1464706/1‑150 (MQ=255) accgcgctggccgaaggtcatccgcgaggccggcctgcccggcaagccagtcccacccgtgacaaccctgagcgactaccctcccgcaatccaggcacgcctgctcgccaacgccgaccgctggcagctcaagcccggcaagcggccggc < 1:1690065‑M1/4‑1 (MQ=255) gatgGATTTGCATCGTGCTGCAACTGGCTGCCGATGAAGTGCGCCGGGTGCAGTTGGATCAGTCACTTTCGTTGGCCTGTTGAGGAGTAGAGCGCTTGCGTGGTTTTTTCGCCGGCCGCTTGCCGGGCTTGAGCTGCCAGCGGTCGGCGt > 2:1295314/1‑150 (MQ=255) tgGATTTGCATCGTGCTGCAACTGGCTGCCGATGAAGTGCGCCGGGTGCAGTTGGATCAGTCACTTTCGTTGGCCTGTTGAGGAGTAGAGCGCTTGCGTGGTTTTTTCGCCGGCCGCTTGCCGGGCTTGAGCTGCCAGCGGTCGGCGTTg > 2:952863/1‑150 (MQ=255) tgGATTTGCATCGTGCTGCAACTGGCTGCCGATGAAGTGCGCCGGGTGCAGTTGGATCAGTCACTTTCGTTGGCCTGTTGAGGAGTAGAGCGCTTGCGTGGTTTTTTCGCCGGCCGCTTGCCGGGCTTGAGCTGCCAGCGGTCGGCGTTg > 1:373702/1‑150 (MQ=255) gATTTGCATCGTGCTGCAACTGGCTGCCGATGAAGTGCGCCGGGTGCAGTTGGATCAGTCACTTTCGTTGGCCTGTTGAGGAGTAGAGCGCTTGCGTGGTTTTTTCGCCGGCCGCTTGCCGGGCTTGAGCTGCCAGCGGTCGGCGTTGGc > 2:1428593/1‑150 (MQ=255) gCATCGTGCTGCAACTGGCTGCCGATGAAGTGCGCCGGGTGCAGTTGGATCAGTCACTTTCGTTGGCCTGTTGAGGAGTAGAGCGCTTGCGTGGTTTTTTCGCCGGCCGCTTGCCGGGCTTGAGCTGCCAGCGGTCGGCGTTGGCGAGCa < 1:117264/150‑1 (MQ=255) cATCGTGCTGCAACTGGCTGCCGATGAAGTGCGCCGGGTGCAGTTGGATCAGTCACTTTCGTTGGCCTGTTGAGGAGTAGAGCGCTTGCGTGGTTTTTTCGCCGGCCGCTTGCCGGGCTTGAGCTGCCAGCGGTCGGCGTTGGCGAGCAg < 1:154202/150‑1 (MQ=255) tgctgcAACTGGCTGCCGATGAAGTGCGCCGGGTGCAGTTGGATCAGTCACTTTCGTTGGCCTGTTGAGGAGTAGAGCGCTTGCGTGGTTTTTTCGCCGGCCGCTTGCCGGGCTTGAGCTGCCAGCGGTCGGCGTTGGCGAGCAGGCGTg > 1:228349/1‑150 (MQ=255) ctgcAACTGGCTGCCGATGAAGTGCGCCGGGTGCAGTTGGATCAGTCACTTTCGTTGGCCTGTTGAGGAGTAGAGCGCTTGCGTGGTTTTTTCGCCGGCCGCTTGCCGGGCTTGAGCTGCCAGCGGTCGGCGTTGGCGAGCAGGCGTGcc > 1:1397748/1‑150 (MQ=255) ctgcAACTGGCTGCCGATGAAGTGCGCCGGGTGCAGTTGGATCAGTCACTTTCGTTGGCCTGTTGAGGAGTAGAGCGCTTGCGTGGTTTTTTCGCCGGCCGCTTGCCGGGCTTGAGCTGCCAGCGGTCGGCGTTGGCGAGCAGGCGTGcc < 1:443294/150‑1 (MQ=255) 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< 1:434713/131‑1 (MQ=255) gggTGCAGTTGGATCAGTCACTTTCGTTGGCCTGTTGAGGAGTAGAGCGCTTGCGTGGTTTTTTCGCCGGCCGCTTGCCGGGCTTGAGCTGCCAGCGGTCGGCGTTGGCGAGCAGGCGTGCCTGGATTGCGGGTGGGTAGTCGCTCAggg < 1:616125/150‑1 (MQ=255) gTGCAGTTGGATCAGTCACTTTCGTTGGCCTGTTGAGGAGGAGAGCGCTTGAGCGGGTTGTTCCCCGGGCGCTTGGCGGGCTTGAGCTGCCAGCGGTCGGCGTTGGCGAGCAGGCGTGCCTGGATTGCGGGTGGGTAGTCGCTCAGGGtt < 2:1146488/150‑1 (MQ=21) tGCAGTTGGATCAGTCACTTTCGTTGGCCTGTTGAGGAGTAGAGCGCTTGCGTGGTTTTTTCGCCGGCCGCTTGCCGGGCTTGAGCTGCCAGCGGTCGGCGTTGGCGAGCAGGCGTGCCTGGATTGCGGGTGGGTAGTCGCTCAGGGTTg < 1:495788/150‑1 (MQ=255) tGCAGTTGGATCAGTCACTTTCGTTGGCCTGTTGAGGAGTAGAGCGCTTGCGTGGTTTTTTCGCCGGCCGCTTGCCGGGCTTGAGCTGCCAGCGGTCGGCGTTGGCGAGCAGGCGTGCCTGGATTGCGGGTGGGTAGTCGCTCAGGGTTg > 2:2330123/1‑150 (MQ=255) aGTTGGATCAGTCACTTTCGTTGGCCTGGTGAGGAGTAGAGCGCTTGCGTGGTTTTTTCGCCGGCCGCTTGCCGGGCTTGAGCTGCCAGCGGTCGGCGTTGGCGAGCAGGCGTGCCTGGATTGCGGGTGGGTAGTCGCTCAGGGTTGTCa > 2:1250165/1‑150 (MQ=255) 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caacgccgaccgctggcagctcaagcccggcaagcggcCGGCGTTGGCGAGCAGGCGTGCCTGGATTGCgggtgg > 1:1402653‑M1/39‑75 (MQ=255) caacgccgaccgctggcagctcaagcccggcaagcggcCGGCGTTGGCGAGCAGGCGTGCCTGGATTGCGGGTGGGTAGTCGCTCAGGGTTGTCACGGGTGGGACTGGc > 2:1782035‑M1/39‑109 (MQ=255) caacgccgaccgctggcagctcaagcccggcaagcggcCGGCGTTGGCGAGCAGGCGTGCCTGGATTGCGGGTGGGTAGTCGCTCAGGGTTGTCACGGGTGGGACTGGc < 1:1782035‑M1/71‑1 (MQ=255) caacgccgaccgctggcagctcaagcccggcaagcggcCGGCGTTGGCGAGCAGGCGTGCCTGGATTGCGGGAGGGTAGTCGCTCAGGGTTGTCACGGGTGGGACTGGCTTGCCGGGCAGGCCGGCCTCGCGGATGACCTTCGGCCAgcg < 1:891332‑M1/112‑1 (MQ=255) gccggccgCTTGCCGGGCTTGAGCTGCCAGCGGTCGGCGTTGGCGAGCAGGCGTGCCTGGATTGCGGGTGGGTAGTCGCTCAGGGTTGTCACGGGTGGGACTGGCTTGCCGGGCAGGCCGGCCTCGCGGATGACCTTCGGCCAGCGCGGt > 2:1711704/1‑150 (MQ=32) cgaccgctggcagctcaagcccggcaagcggcCGGCGTTGGCGAGCAGGCGTGCCTGGATTGCGGGTGGGTAGTCGCTCAGGGTTGTCACGGGTGGGACTGGCTTGCCGGGCAGGCCGGCCTCGCGGATGACCTTCGGCCAGCGCGGTCg < 2:1606046‑M1/118‑1 (MQ=255) cgaccgctggcagctcaagcccggcaagcggcCGGCGTTGGCGAGCAGGCGTGCCTGGATTGCGGGTGGGTAGTCGCTCAGGGTTGTCACGGGTGGGACTGGCTTGCCGGGCAGGCCGGCCTCGCGGATGACCTTCGGCCAGCGCGGTCg < 2:695714‑M1/118‑1 (MQ=255) accgctggcagctcaagcccggcaagcggcCGGCGTTGGCGAGCAGGCGTGCCTGGATTGCGGGTGGGTAGTCGCTCAGGGTTGTCACGGGTGGGACTGGCTTGCCGGGCAGGCCGGCCTCGCGGATGACCTTCGGCCAGCGCGGTCGcc < 2:285732‑M1/120‑1 (MQ=255) ccgctggcagctcaagcccggcaagcggtCGGCGTTGGCGAGCAGGCGTGCCTGGATTGCGGGAGGGTAGTCGCTCa < 1:612037‑M1/48‑1 (MQ=255) ccgctggcagctcaagcccggcaagcggtCGGCGTTGGCGAGCAGGCGTGCCTGGATTGCGGGAGGGTAGTCGCTCa > 2:612037‑M1/30‑77 (MQ=255) ccgCTTGCCGGGCTTGAGCTGCCAGCGGTCGGCGTTGGCGAGCAGGCGTGCCTGGATTGCGGGTGGGTAGTCGCTCAGGGTTGTCACGGGTGGGACTGGCTTGCCGGGCAGGCCGGCCTCGCGGATGACCTTCGGCCAGCGCGGTCGCca < 2:1032642/150‑1 (MQ=32) gCTTGCCGGGCTTGAGCTGCCAGCGGTCGGCGTTGGCGAGCAGGCGTGCCTGGATTGCGGGTGGGTAGTCGCTCAGGGTTGTCACgg > 1:990895/1‑87 (MQ=35) ttGCCGGGCTTGAGCTGCCAGCGGTCGGCGTTGGCGAGCAGGCGTGCCTGGATTGCGGGTGGGTAGTCGCTCAGGGTTGTCACGGGTGGGACTGGCTTGCCGGGCAGGCCGGCCTCGCGGATGACCTTCGGCCAGCGCGGTCGCcagcac > 1:2421819/1‑150 (MQ=32) gcagctcaagcccggcaagcggcCGGCGTTGACGAGCAGGCGTGCCTGGATTGCGGGTGGGTAGTCGCTCAGGGTTGTCACGGGTGGGACTGGCTTGCCGGGCAGGCCGGCCTCGCGGATGACCTTCGGCCAGCGCGGTCGCcagcacag < 2:2426774‑M1/127‑1 (MQ=255) cGGGCTTGAGCTGCCAGCGGTCGGCGTTGGCGAGCAGGCGTGCCTGGATTGCGGGTGGGTAGTCGCTCAGGGTTGTCACGGGTGGGACTGGCTTGCCGGGCAGGCCGGCCTCGCGGATGACCTTCGGCCAGCGCGGTCGCcagcacagca > 2:288787/1‑150 (MQ=32) cGGGCTTGAGCTGCCAGCGGTCGGCGTTGGCGAGCAGGCGTGCCTGGATTGCGGGTGGGTAGTCGCTCAGGGTTGTCACGGGTGGGACTGGCTTGACAGGCAGGAGAGAATCGCGGAAAGCCCGCGGCCAGCGCTGTCGCcagcacagca > 2:1840973/1‑150 (MQ=11) tcaagcccggcaagcggcCGGCGTTGGCGAGCAGGCGTGCCTGGATTGCGGGAGGGTAGTCGCTCAGGGTTGTCACGGGTGGGACTGGCTTGCCGGGCAGGCCGGCCTCGCGGATGACCTTCGGCCAGCGCGGTCGCCAGCAcagcagca > 2:891332‑M1/19‑150 (MQ=255) cTTGAGCTGCCAGCGGTCGGCGTTGGCGAGCAGGCGTGCATGGATTGCGGGTCCGTAGTCGCTCAGGGTTGTCACGGGTGGGACTGGCTTGCCGGGCAGGCCGGCCTCGCGGATGACCTTCGGCCAGCGCGGTCGCcagcacagcctgct > 1:293840/1‑145 (MQ=255) gAGCTGCCAGCGGTCGGCGTTGGCGAGCAGGCGTGCCTGGATTGCGGGTGGGTAGTCGCTCAgg > 1:1472507/1‑64 (MQ=35) gCTGCCAGCGGTCGGCGTTGGCGAGCAGGCGTGCCTGGATTGCGGGTGGGTAGTCGCTCAGGGTTGTCACGGGTGGGACTGGCTTGCCGGGCAGGCCGGCCTCGCGGATGACCTTCGGCCAGCGCGGTCGCCAGCACAGCAGCAGGCTGa < 1:952863/150‑1 (MQ=32) tGCCAGCGGTCGGCGTTGGCGAGCAGGCGTGCCTGGATTGCGGGTGGGTAGTCGCTCAGGGTTGTCACGGGTGGGACTGGCTTGCCGGGCAGGCCGGCCTCGCGGATGACCTTCGGCCAGCGCGGTCGCCAGCACAGCAGTAGGCTGAGc < 1:288787/150‑1 (MQ=17) cAGCGGTCGGCGTTGGCGAGCAGGCGTGCCTGGATTGCGGGTGGGTAGTCGCTCAGGGTTGTCACGGGTGGGACTGGCTTGCCGGGCAGGCCGGCCTCGCGGATGACCTTCGGCCAGCGCGGTCGCCAGCACAGCAGCAGGCTGAGCCAg > 1:676280/1‑150 (MQ=32) cGGTCGGCGTTGGCGAGCAGGCGTGCCTGGATTGCGGGTGGGTAGTCGCTCAGGGTTGTCACGGGTGGGACTGGCTTGCCGGGCAGGCCGGCCTCGCGGATGACCTTCGGCCAGCGCGGTCGCCAGCACAGCAGCAGGCTGAGCCAGTgg > 1:693815/1‑150 (MQ=32) ggTCGGCGTTGGCGAGCAGGCGTGCCTGGATTGCGGGTAGATAGTCGCTCAGGGTTGTCACGGGTGGGACTGGCTTGCCGGGCAGGCCGGCCTCGCGGATGACCTTCGGCCAGCGCGGTCGCCAGCACAGCAGCAGGCTGAGCCAGTggg < 1:1840973/150‑1 (MQ=17) | GGGATGATGGATTTGCATCGTGCTGCAACTGGCTGCCGATGAAGTGCGCCGGGTGCAGTTGGATCAGTCACTTTCGTTGGCCTGTTGAGGAGTAGAGCGCTTGCGTGGTTTTTTCGCCGGCCGCTTGCCGGGCTTGAGCTGCCAGCGGTCGGCGTTGGCGAGCAGGCGTGCCTGGATTGCGGGTGGGTAGTCGCTCAGGGTTGTCACGGGTGGGACTGGCTTGCCGGGCAGGCCGGCCTCGCGGATGACCTTCGGCCAGCGCGGTCGCCAGCACAGCAGCAGGCTGAGCCAGTGGG > NC_002947/2360003‑2360298 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |