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gtaAAGCGGC‑AG‑GCTCTCGCCGCAATGAGTGCCGTTGACCGCCAACTGGACCTGATGGCCTTCGCGCACCAGGCGTTCGGCGATACCGGGGCCGATCCAGTCACAGCGCCAGTCGATCACCAGCACCGAACGCCCCGGGTGCACTTCAtt > 1:1563932/1‑150 (MQ=255) gcggcgagagcctgccgctttacgtacgtgaccaactggccggcgagctgcatcgcctgggtatccctgtcaccccatacgcacgcctgtacggcagcgacgacaacacggtgtacctgcagcacaccgccagcggcgatccgatgatct > 1:1728805‑M1/1‑5 (MQ=255) gcggcgagagcctgccgctttacgtacgtgaccaactggccggcgagctgcatcgcctgggtatccctgtcaccccatacgcacgcctgtacggcagcgacgacaacacggtgtacctgcagcacaccgccagcggcgatccgatgatct < 1:310242‑M1/150‑146 (MQ=255) ggC‑AG‑GCTCTCGCCGCAATGAGTGCCGTTGACCGCCAACTGGACCTGATGGCCTTCGCGCACCAGGCGTTCGGCGATACCGGGGCCGATCCAGTCACAGCGCCAGTCTATCACCAGCACCGAACGCCCAAGTTTCACTTCATTGCgcagc < 1:676197/150‑1 (MQ=255) cgagagcctgccgctttacgtacgtgaccaactggccggcgagctgcatcgcctgggtatccctgtcaccccatacgcacgcctgtacggcagcgacgacaacacggtgtacctgcagcacaccgccagcggcgatccgatgatcttcga > 1:1294109‑M1/1‑1 (MQ=255) | CGATGCCTTCGAAGATCATCGGATCGCCGCTGGCGGTGTGCTGCAGGTACACCGTGTTGTCGTCGCTGCCGTACAGGCGTGCGTATGGGGTGACAGGGATACCCAGGCGATGCAGCTCGCCGGCCAGTTGGTCACGTACGTAAAGCGGC‑AG‑GCTCTCGCCGCAATGAGTGCCGTTGACCGCCAACTGGACCTGATGGCCTTCGCGCACCAGGCGTTCGGCGATACCGGGGCCGATCCAGTCACAGCGCCAGTCGATCACCAGCACCGAACGCCCCGGTTTCACTTCATTGCGCAGC > NC_002947/3270330‑3270625 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |