New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 3339160 = | 82 (0.880) | 6 (0.080) | 5/206 | NT | 9.6% | intergenic (‑119/+124) | PP_2935/ybiT | membrane protein/ABC‑F family ATPase |
? | NC_002947 | 3339248 = | 46 (0.600) | intergenic (‑207/+36) | PP_2935/ybiT | membrane protein/ABC‑F family ATPase |
Only 100 of 104 total aligned reads displayed.
GACTGGCGGGGGCTGGTTGTTGCGCGGTCATGGGCTCTTTCGCGGGCGGGCGGTTGGGCGTGGTCCCATCATGGCCGTTGCGCGAAGGAAAAGACAGCAGGCTAACGAATTATTCGTCGGGCCGTGCCGGTCGGTGGGATGGGGATGTACTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCTCCCAAGGCCCCACAAGCGTCCAATACCTGTGCGGTCCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCCGGCCATC‑CGAGATGGCCAGGCCGTCCCATCAATCAGACCAGCACACCCTGGCT > NC_002947/3339011‑3339304 | gACTGGCGGGGGCTGGTTGTTGCGCGGTCATGGGCTCTTTCGCGGGCGGGCGGTTGGGCGTGGTCCCATCATGGCCGTTGCGCGAAGGAAAAGACAGCAGGCTAACGAATTATTCGTCGGGCCGTGCCGGTCGGTGGGATGGGGATGTAc < 1:1200530/150‑1 (MQ=255) gagttcgtgtcgtcgctggccacgcgcatcatcgagctgtcggccgatggtgtggtggacttcagcggtacctacgatgactacctgcgtagccagggtgtgctggtctgattgatgggacggcctggccatctcggatggccgggcctc < 1:452107‑M1/3‑1 (MQ=255) tGGCGGGGGCTGGTTGTTGCGCGGTCATGGGCTCTTTCGCGGGCGGGCGGTTGGGCGTGGTCCCATCATGGCCGTTGCGCGAAGGAAAAGACAGCAGGCTAACGAATTATTCGTCGGGCCGTGCCGGTCGGTGGGATGGGGATGTActct < 2:1144417/150‑1 (MQ=255) tGGCGGGGGCTGGTTGTTGCGCGGTCATGGGCTCTTTCGCGGGCGGGCGGTTGGGCGTGGTCCCATCATGGCCGTTGCGCGAAGGAAAAGACAGCAGGCTAACGAATTATTCGTCGGGCCGTGCCGGTCGGTGGGATGGGGATGTActct > 1:979847/1‑150 (MQ=255) tGGCGGGGGCTGGTTGTTGCGCGGTCATGGGCTCTTTCGCGGGCGGGCGGTTGGGCGTGGTCCCATCATGGCCGTTGCGCGAAGGAAAAGACAGCAGGCTAACGAATTATTCGTCGGGCCGTGCCGGTCGGTGGGATGCAGAGGTActct > 2:1995870/1‑150 (MQ=255) cgtgtcgtcgctggccacgcgcatcatcgagctgtcggccgatggtgtggtggacttcagcggtacctacgatgactacctgcgtagccagggtgtgctggtctgattgatgggacggcctggccatctcggatggccgggcCTCTTcgc > 2:2241592‑M1/143‑150 (MQ=255) tgtcgtcgctggccacgcgcatcatcgagctgtcggccgatggtgtggtggacttcagcggtacctacgatgactacctgcgtagccagggtgtgctggtctgattgatgggacggcctggccatctcggatggccgggcCTCTTCGCgg > 2:1584271‑M1/141‑150 (MQ=255) tgtcgtcgctggccacgcgcatcatcgagctgtcggccgatggtgtggtggacttcagcggtacctacaatgactacctgcgtagccagggtgtgctggtctgattgatgggacggcctggccatctcggatggccgggcCTCTTCGCgg > 1:1036873‑M1/141‑150 (MQ=255) gggCTGGTTGTTGCGCGGTCATGGGCTCTTTCGCGGGCGGGCGGTTGGGCGTGGTCCCATCATGGCCGTTGCGCGAAGGAAAAGACAGCAGGCTAACGAATTATTCGTCGGGCCGTGCCGGTCGGTGGGATGGGGATGTACTCTTCGCgg < 1:1056800/150‑1 (MQ=255) gtcgtcgctggccacgcgcatcatcgagctgtcggccgatggtgtggtggacttcagcggtacctacgatgactacctgcgtagccagggtgtgctggtctgattgatgggacggcctggccatctcggatggccgggcCTCTTCGCggg > 2:2404999‑M1/140‑150 (MQ=255) gttgttGCGCGGTCATGGGCTCTTTCGCGGGCGGGCGGTTGGGCGTGGTCCCATCATGGCCGTTGCGCGAAGGAAAAGACAGCAGGCTAACGAATTATTCGTCGGGCCGTGCCGGTCGGTGGGATGGGGATGTACTCTTCGCGGGCTTGc > 2:1887861/1‑150 (MQ=255) gttgttGCGCGGTCATGGGCTCTTTCGCGGGCGGGCGGTTGGGCGTGGTCCCATCATGGCCGTTGCGCGAAGGAAAAGACAGCAGGCTAACGAATTATTCGTCGGGCCGTGCCGGTCGGTGGGATGGGGATGTACTCTTCGCGGGCTTGc < 1:605932/150‑1 (MQ=255) ttgttgCGCGGTCATGGGCTCTTTCGCGGGCGGGCGGTTGGGCGTGGTCCCATCATGGCCGTTGCGCGAAGGAAAAGACAGCAGGCTAACGAATTATTCGTCGGGCCGTGCCGGTCGGTGGGATGGGGATGTACTCTTCGCGGGCTTGcc < 2:860134/150‑1 (MQ=255) gctggccacgcgcatcatcgagctgtcggccgatggtgtggtggacttcagcggtacctacgatgactacctgcgtagccagggtgtgctggtctgattgatgggacggcctggccatctcggatggccgggcCTCTTCGCGGGCTTGcc > 2:1980000‑M1/134‑150 (MQ=255) gttgCGCGGTCATGGGCTCTTTCGCGGGCGGGCGGTTGGGCGTGGTCCCATCATGGCCGTTGCGCGAAGGAAAAGACAGCAGGCTAACGAATTATTCGTCGGGCCGTGCCGGTCGGTGGGATGGGGATGTACTCTTCGCGGGCTTGCCCg < 2:113474/150‑1 (MQ=255) ccacgcgcatcatcgagctgtcggccgatggtgtggtggaattcagcggtacctacgatgactacctgcgtagccagggtgtgctggtctgattgatgggacggcctggccatctcggatggccgggcCTCTTCGCGGGCTTGCCCGctc < 2:1903285‑M1/22‑1 (MQ=255) ggTCATGGGCTCTTTCGCGGGCGGGCGGTTGGGCGTGGTCCCATCATGGCCGTTGCGCGAAGGAAAAGACAGCAGGCTAACGAATTATTCGTCGGGCCGTGCCGGTCGGTGGGATGGGGATGTACTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCTccc < 1:355505/150‑1 (MQ=255) tCATGGGCTCTTTCGCGGGCGGGCGGTTGGGCGTGGTCCCATCATGGCCGTTGCGCGAAGGAAAAGACAGCAGGCTAACGAATTATTCGTCGGGCCGTGCCGGTCGGTGGGATGGGGATGTACTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCTCCCaa < 1:327775/150‑1 (MQ=255) 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ttattCGTCGGGCCGTGCCGGTCGGTGGGATGGGGATGTACTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCTCCCAAGGCCCCACAAGCGTCCAATACCTGTGCGGTCCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCCGGCCATC‑CGAGATGGCCa < 1:2199295/150‑1 (MQ=255) ttattCGTCGGGCCGTGCCGGTCGGTGGGATGGGGATGTACTCTTCGCGGGCGTGCCCGCGCTCCCAAGGCCCCACAAGCGTCCAATACCTGTGCGGTCCCCGTGGGAGCGGGCCAGCCCGCGAAGAGGCCCGGCCCTC‑CGAGATGGccc > 1:1230078/1‑149 (MQ=255) ttCGTCGGGCCGTGCCGGTCGGTGGGATGGGGATGTACTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCTCCCAAGGCCCCACAAGCGTCCAATACCTGTGCGGTCCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCCGGCCATC‑CGAGATg > 1:1801995/1‑143 (MQ=255) ttCGTCGGGCCGTGCCGGTCGGTGGGATGGGGATGTACTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCTCCCAAGGCCCCACAAGCGTCCAATACCTGTGCGGTCCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCCGGCCATC‑CGAGATg < 2:1801995/143‑1 (MQ=255) ttCGTCGGGCCGTGCCGGTCGGTGGGATGGGGATGTACTCCTCGCGGGCTTGCCCGCTCTCCCAAGGCCCCACAAGCGTCCAATACCTGTGCGGTCCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCTGGCCATCTCG‑GATGGCCGGGc < 2:1484258/150‑1 (MQ=38) ttCGACGGGCCGTGCCGGTCGGTGGGATGGGGATGTACTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCTCCCAAGGCCCCACAAGCGTCCAATACCTGTGCGGTCCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCTGGCCATC‑TCGGATGGCCGGGc < 1:1889544/150‑1 (MQ=38) tcgGGCCGTTCCGGTCGGGGGTATGGGGATGTACTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCTCCCAAGGCCCCACAAGCGTCCAATACCTGTGCGGTCCCGGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCCAGCGATC‑CGCGATGGCCAGGCCGTc > 2:1215370/1‑150 (MQ=38) tcgGGCCGTGCCGGTCGGTGGGATGGGGATGTACTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCTCCCAAGGCCCCACAAGCGTCCAATACCTGTGCGGTCCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCCGGCCATC‑CGAGATGGCCAGGCCGTc < 2:1988258/150‑1 (MQ=255) tGCCGGTCGGTGGGATGGGGATGTACTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCTCCCAAGGCCCCACAAGCGTCCAATACCTGTGCGGTCCCTGTGGGAGCGGGCaa < 1:1338828/101‑1 (MQ=255) tGCCGGTCGGTGGGATGGGGATGTACTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCTCCCAAGGCCCCACAAGCGTCCAATACCTGTGCGGTCCCTGTGGGAGCGGGCaa > 2:1338828/1‑101 (MQ=255) ccGGTCGGTGGGATGGGGATGTACTATGCGCGGGCTTGCCCGCGCTCCCAAGGCCCCACAAGCGTCCAATACCTGTGCGGTCCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCCGGCCATC‑CGAGATGGCCAGGCCGTCCCatcaatca < 1:1095322/150‑1 (MQ=255) gtcggtGGGATGGGGATGTACTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCTCCCAAGGCCCCACAAGCGTCCAATACCTGTGCGGTCCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCCGGCCATC‑CGAGATGGCCAGGCCGTCCCATCAATCAGAc < 2:2041631/150‑1 (MQ=255) gggatgTACTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCTCCCAAGGCCCCACAAGCGTCCAATAACTGTGCGGTCCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCCGGCCATC‑CGAGATGGCCAGGCCGTCCCATCAATCAGACCAGCACACCCTg < 2:2046255/150‑1 (MQ=255) ggacgTACCCTTCGCGGGCTTGCCCGCCCTCCCAAGGCCCCACAAGCGTCCAATACCTGTGCGGTCCCTGGGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCCGGCCATC‑CGAGATGGCCAGGCCGTCCCATCAATCAGACCAGCACACCCTgg < 1:839154/150‑1 (MQ=255) cgggcCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCTCCCAAGGCCCCACAAGCGTCCAATACCtgtg < 1:1280890‑M1/54‑1 (MQ=255) cgggcCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCTCCCAAGGCCCCACAAGCGTCCAATACCtgtg > 2:1280890‑M1/6‑59 (MQ=255) atgTACTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCTCCCAAGGCCCCACAAGCGTCCAATACCTGTGCGGTCCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCCGGCCATC‑CGAGATGGCCAGGCCGTCCCATCCATCAGACCAGCACACCCTGGcg > 1:1551269/1‑149 (MQ=255) | GACTGGCGGGGGCTGGTTGTTGCGCGGTCATGGGCTCTTTCGCGGGCGGGCGGTTGGGCGTGGTCCCATCATGGCCGTTGCGCGAAGGAAAAGACAGCAGGCTAACGAATTATTCGTCGGGCCGTGCCGGTCGGTGGGATGGGGATGTACTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCTCCCAAGGCCCCACAAGCGTCCAATACCTGTGCGGTCCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCCGGCCATC‑CGAGATGGCCAGGCCGTCCCATCAATCAGACCAGCACACCCTGGCT > NC_002947/3339011‑3339304 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |