| New junction evidence | |||||||||||
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GCCCGCTCAACATCCAGCGCTCGCCCCAGGGGCAGCCGGTGATCTTCCAGGCGGGCGATTCCGAACAAGGCCGAGCGCTCGGGGCCGCCACGGCTGATGTGGTGTTCACCCACGCCGCCAGCATCGAGCAGGGCCAGGCCTTCTACCGCGACATCAAGCGCCGCGCCGCGCGCCTGGGTCGCGACCCGGAGCAGTTGCTGGTATTGCCCGGCGCGGAGATCTACGTGGGTGACAACGACGCCCACGCCCGTGAGATCGAGCGCCATTACCATCAGGCCGACCACAGTTTCGAA > NC_002947/3652759‑3653051 | gCCCGCTCAACATCCAGCGCTCGCCCCAGGGGCAGCCGGTGATCTTCCAGGCGGGCGATTCCGAACAAGGCCGAGCGCTCGGGGCCGCCACGGCTGATGTGGTGTTCACCCACGCCGCCAGCATCGAGCAGGGCCAGGCCTTCTACcgcg > 1:736834/1‑150 (MQ=255)gCCCGCTCAACATCCAGCGCTCGCCCCAGGGGCAGCCGGTGATCTTCCAGGCGGGCGATTCCGAACAAGGCCGAGCGCTCGGGGCCGCCACGGCTGATGTGGTGTTCACCCACGCCGCCAGCATCGAGCAGGGCCAGGCCTTCTACcgcg > 2:2230013/1‑150 (MQ=255) cccGCTCAACATCCAGCGCTCGCCCCAGGGGCAGCCGGTGATCTTCCAGGCGGGCGATTCCGAACAAGGCCGAGCGCTCGGGGCCGCCACGGCTGATGTGGTGTTCACCCACGCCGCCAGCATCGAGCAGGGCCAGGCCTTCTACCGCGa > 2:1916594/1‑150 (MQ=255) ccGCTCAACATCCAGCGCTCGCCCCAGGGGCAGCCGGTGATCTTCCAGGCGGGCGATTCCGAACAAGGCCGAGCGCTCGGGGCCGCCACGGCTGATGTGGTGTTCACCCACGCCGCCAGCATCGAGCAGGGCCAGGCCTTCTACCGCGAc > 1:1765500/1‑150 (MQ=255) cGCTCAACATCCAGCGCTCGCCCCAGGGGCAGCCGGTGATCTTCCAGGCGGGCGATTCCGAACAAGGCCGAGCGCTCGGGGCCGCCACGGCTGATGTGGTGTTCACCCACGCCGCCAGCATCGAGCAGGCTAAGGCCTTCTACCGCGACa > 1:722657/1‑150 (MQ=255) aCATCCAGCGCTCGCCCCAGGGGCAGCCGGTGATCTTCCAGGCGGGCGATTCCGAACAAGGCCGAGCGCTCGGGGCCGCCACGGCTGATGTGGTGTTCACCCACGCCGCCAGCATCGAGCAGGGCCAGGCCTTCTACCGCGACATCAAgc > 1:2302467/1‑150 (MQ=255) ccgaattccttcaacgccagttcgaaactgtggtcggcctgatggtaatggcgctcgatctcacgggcgtgggcgtcgttgtcacccacgtagatctccgcgccgggcaataccagcaactgctccgggtCGCGACATCAAgcgccgcgc < 2:119273‑M1/20‑1 (MQ=255) gCCCCAGGGGCAGCCGGTGATCTTCCAGGCGGGCGATTCCGAACAAGGCCGAGCGCTCGGGGCCGCCACGGCTGATGTGGTGTTCACCCACGCCGCCAGCATCGAGCAGGGTTATGCCTTCTACCGCGACATCAAGCGCCGCGCcgcgcg > 1:123402/1‑150 (MQ=255) cccAGGGGCAGCCGGTGATCTTCCAGGCGGGCGATTCCGAACAAGGCCGAGCGCTCGGGGCCGCCACGGCTGATGTGGTGTTCACCCACGCCGCCAGCATCGAGCAGGGCCAGGCCTTCTACCGCGACATCAAGCGCCGCGCCGCGCGcc > 2:95261/1‑150 (MQ=255) cccAGGGGCAGCCGGTGATCTTCCAGGCGGGCGATTCCGAACAAGGCCGAGCGCTCGGGGCCGCCACGGCTGATGTGGTGTTCACCCACGCCGCCAGCATCGAGCAGGGCCAGGCCTTCTACCGCGACATCAAGCGCCGCGCCGCGCGcc > 2:1420200/1‑150 (MQ=255) cAGGGGCAGCCGGTGATCTTCCAGGCGGGCGATTCCGAACAAGGCCGAGCGCTCGGGGCCGCCACGGCTGATGTGGTGTTCACCCACGCCGCCAGCATCGAGCAGGGCCAGGCCTTCTACCGCGACATCAAGCGCCGCGCCGCGCGCCTg < 2:579559/150‑1 (MQ=255) aGGGGCAGCCGGTGATCTTCCAGGCGGGCGATTCCGAACAAGGCCGAGCGCTCGGGGCCGCCACGGCTGATGTGGTGTTCACCCACGCCGCCAGCATCGAGCAGGGCCAGGCCTTCTACCGCGACATCAAGCGCCGCGCCGCGCGCCTgg < 2:243981/150‑1 (MQ=255) aGGGGCAGCCGGTGATCTTCCAGGCGGGCGATTCCGAACAAGGCCGAGCGCTCGGGGCCGCCACGGCTGATGTGGTGTTCACCCACGCCGCCAGCATCGAGCAGGGCCAGGCCTTCTACCGCGACATCAAGCGCCGCGCCGCGCGCCTgg < 2:29835/150‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |