New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 3963855 = | 68 (0.730) | 5 (0.060) | 5/240 | NT | 6.6% | coding (193/933 nt) | PP_3493 | LysR family transcriptional regulator |
? | NC_002947 | 3963900 = | 76 (0.850) | coding (148/933 nt) | PP_3493 | LysR family transcriptional regulator |
TGTAGCCGGCCACCAGCGGCATCAGCAACAGCCCCATGCCGTGCGGGCAGTGCAAACGCAGATGGCCGCGAGGCGTAAGGTGCGCCCCTCGCGCCTCGCCCACGGCTTCTTCGGTCAGCAGCATGATCTGCCGCGCACG‑CTCCAGAAACCGCTC‑ACCCGCCTCGCTCATGCGCAGGCGCCGGGTGGTGCGGTGCAGCAGGCGGGTCTGCAGCTGGTTCTCCAGCTCGGCGACGATGCGCGAAACCTGCGCTGCAGAAATATCCAGAGCATTGGCAGCTGCAGCGAAGCTGCCACATT > NC_002947/3963708‑3964004 | atggcatgcagcatgtccatgcgtaccttcacccgggtggtggaatgtggcagcttcgctgcagctgccaatgctctggatatttctgcagcgcaggtttcgcgcatcgtcgccgagctggagaaccagctgcagacccgcctgctgcAc < 2:1829542‑M1/2‑1 (MQ=255) atggacatgctgcatgccatgcgtaccttcacccgggtggtggaatgtggcagcttcgctgcagctgccaatgctctggatatttctgcagcgcaggtttcgcgcatcgtcgccgagctggagaaccagctgcagacccgcctgctgcAc > 2:55600‑M1/149‑150 (MQ=255) gtAGCCGGCCACCAGCGGCATCAGCAACAGCCCCATGCCGTGCGGGCAGTGCAAACGCAGATGGCCGCGAGGCGTAAGGTGCGCCCCTCGCGCCTCGCCCACGGCTTCTTCGGTCAGCAGCATGATCTGCCGCGCACG‑CTCCAGAAACCg > 2:1899575/1‑150 (MQ=255) gtAGCCGGCCACCAGCGGCATCAGCAACAGCCCCATGCCGTGCGGGCAGTGCAAACGCAGATGGCCGCGAGGCGTAAGGTGCGCCCCTAGCGCCTCGCCCACGGCTTCTTCGGTCAGCAGCATGATCTGCCGCGCACG‑CTCCAGAAACCg < 2:1576059/150‑1 (MQ=255) tAGCCGGCCACCAGCGGCATCAGCAACAGCCCCATGCCGTGCGGGCAGTGCAAACGCAGATGGCCGCGAGGCGTAAGGTGCGCCCCTCGCGCCTCGCCCACGGCTTCTTCGGTCAGCAGCATGATCTGCCGCGCACG‑CTCCATAAACCGc > 1:824835/1‑150 (MQ=255) ccGGCCACCAGCGGCATCAGCAACAGCCCCATGCCGAGCGGGCAGTGCAAACGCAGATGGCCGCGAGGCGTAAGGTGCGCCCCTCGCGCCTCGCCCCCCGCCCCTTCGGTCCGCAGCCTCATCTGCCGCGTATG‑CTCCATAAACCGCTC‑a < 2:1728497/150‑1 (MQ=255) cGGCCACCAGCGGCATCAGCAACAGCCCCATGCCGTGCGGGCAGTGCAAACGCAGATGGCCGCGAGGCGTAAGGTGCGCCCCTCGCGCCTCGCCCACGGCTTCTTCGGTCAGCAGCATGATCTGCCGCGCACG‑CTCCAGAAACCGCTC‑Ac > 1:396184/1‑150 (MQ=255) tCAGCATCAGCCCCATGCCGTGCGGGCAGTGCAAACGCAGATGGCCGCGAGGCGTAAGGTGCGCCCCTCGCGCCTCGCCCACGGCTTCTTCGGTCAGCAGCATGATCTGCCGCGCACG‑CTCCAGAAACCGCTC‑ACCCGCCTCGCTCATgc < 1:804732/150‑1 (MQ=255) tCAGCAACAGCCCCATGCCGTGCGGGCAGTGCAAACGCAGATGGCCGCGAGGCGTAAGGTGCGCCCCTCGCGCCTCGCCCACGGCTTCTTCGGTCAGCAGCATGATCTGCCGCGCACG‑CTCCAGAAACCGCTC‑ACCCGCCTCGCTCATgc > 1:423068/1‑150 (MQ=255) aGCAACAGCCCCATGCCGTGCGGGCAGTGCAAACGCAGATGGCCGCGAGGCGTAAGGTGCGCCCCTCGCGCCTCGCCCACGGCTTCTTCGGTCAGCAGCATGATCTGCCGCGCACG‑CTCCAGAAACCGCTC‑ACCCGCCTCGCTCATgcgc > 1:1334830/1‑150 (MQ=255) cATGCCGTGCGGGCAGTGCAAACGCAGATGGCCGCGAGGCGTAAGGTGCGCCCCTCGCGCCTCGCCCACGGCTTCTTCGGTCAGCAGCATGATCTGCCGCGCACG‑CTCCAGAAACCGCTC‑ACCCGCCTCGCTCATGCGCAGGCGCCGggt > 2:481721/1‑150 (MQ=255) aTGCCGTGCGGGCAGTGCAAACGCAGATGGCCGCGAGGCGTAAGGTGCGCCCCTCGCGCCTCGCCCACGGCTTCTTCGGTCAGCAGCATGATCTGCCGCGCACG‑CTCCAGAAACCGCTC‑ACCCGCCTCGCTCATGCGCAGGCGCCGggtg > 1:2105469/1‑150 (MQ=255) gtggtggaatgtggcagcttcgctgcagctgccaatgctctggatatttctgcagcgcaggtttcgcgcatcgtcgccgagctggagaaccagctgcagacccgcctgctgcACCGCACCACCCGCCTCGCTCATGCGCAGGCGCCGggt > 1:850203‑M1/113‑150 (MQ=255) gCCGTGCGGGCAGTGCAAACGCAGATGGCCGCGAGGCGTAAGGTGCGCCCCTCGCGCCTCGCCCACGGCTTCTTCGGTCAGCAGCATGATCTGCCGC‑TACGACGCCAGAAACCGCTC‑ACCCGCCTCGCTCATGCGCAGGCGCCGggtggt < 1:2274910/150‑1 (MQ=255) cGTGCGGGCAGTGCAAACGCAGATGGCCGCGAGGCGTAAGGTGCGCCCCTCGCGCCTCGCCCACGGCTTCTTCGGTCAGCAGCATGATCTGCCGCGCACG‑CTCCAGAAACCGCTC‑ACCCGCCTCGCTCATGCGCAGGCGCCGGGTggtgc < 1:27301/150‑1 (MQ=255) tggaatgtggcagcttcgctgcagctgccaatgctctggatatttctgcagcgcaggtttcgcgcatcgtcgccgagctggagaaccagctgcagacccgcctgctgcACCGCTC‑ACCCGCCTCGCTCATGCGCAGGCGCCGggtggt < 2:406782‑M1/40‑1 (MQ=255) tggaatgtggcagcttcgctgcagctgccaatgctctggatatttctgcagcgcaggtttcgcgcatcgtcgccgagctggagaaccagctgcagacccgcctgctgcACCGCTC‑ACCCGCCTCGCTCATGCGCAGGCGCCGggtggt > 1:406782‑M1/109‑148 (MQ=255) ggaatgtggcagcttcgctgcagctgccaatgctctggatatttctgcagcgcaggtttcgcgcatcgtcgccgagctggagaaccagctgcagacccgcctgctgcACCGCACCACCCGCCTCGCTCATGCGCAGGCGCCGGGTggtgc > 2:157181‑M1/108‑150 (MQ=255) gaatgtggcagcttcgctgcagctgccaatgctctggatatttctgcagcgcaggtttcgcgcatcgtcgccgagctggagaaccagctgcagacccgcctgctgcACCGCTC‑ACCCGCCTCGCTCATGCGCAGGCGCCGGGTggtgcgg > 2:1522389‑M1/107‑150 (MQ=255) ggCAGTGCAAACGCAGATGGCCGCGAGGCGTAAGGTGCGCCCCTCGCGCCTCGCCCACGGCTTCTTCGGTCCGCAGCATGATCTGCCGCGCACG‑CTCCAGAAACCGCTC‑ACCCGCCTCGCTCATGCGCAGGCGCCGGGTGGTGCGGTgca < 1:1345612/150‑1 (MQ=255) ggCAGTGCAAACGCAGATGGCCGCGAGGCGTAAGGTGCGCCCCTCGCGCCTCGCCCACGGCTTCTTCGGTCAGCAGCATGATCTGCCGCGCACG‑CTCCAGAAACCGCTC‑ACCCGCCTCGCTCATGCGCAGGCGCCGGGTGGTGCGGTgca < 2:1792362/150‑1 (MQ=255) aaaCGCAGATGGCCGCGAGGCGTAAGGTGCGCCCCTCGCGCCTCGCCCACGGCTTCTTCGGTCAGCAGCATGATCTGCCGCGCACG‑CTCCAGAAACCGCTC‑ACCCGCCTCGCTCATGCGCAGGCGCCGGGTGGTGCGGTGCAGCAGGCgg < 2:1443831/150‑1 (MQ=255) aaaCGCAGATGGCCGCGAGGCGTAAGGTGCGCCCCTCGCGCCTCGCCCACGGCTTCTTCGGTCAGCAGCATGATCTGCCGCGCACG‑CTCCAGAAACCGCTC‑ACCCGCCTCGCTCATGCGCAGGCGCCGGGTGGTGCGGTGCAGCAGGCgg < 1:1837660/150‑1 (MQ=255) aaaCGCAGATGGCCGCGAGGCGTAAGGTGCGCCCCTCGCGCCTCGCCCACGGCTTCTTCGGTCAGCAGCATGATCTGCCGCGCACG‑CTCCAGAAACCGCTC‑ACCCGCCTCGCTCATGCGCAGGCGCCGGGTGGTGCGGTGCAGCAGGCgg < 2:796457/150‑1 (MQ=255) aaaCGCAGATGGCCGCGAGGCGTAAGGTGCGCCCCTCGCGCCTCGCCAACGGCTTCTTCGGTCAGCAGCATGATCTGCCGCGCACG‑CTCCAGAAACCGCTC‑ACCCGCCTCGCTCATGCGCAGGCGCCGGGTGGTGCGGTGCAGCAGGCgg < 1:2365681/150‑1 (MQ=255) aaCGCAGATGGCCGCGAGGCGTAAGGTGCGCCCCTCGCGCCTCGCCCACGGCTTCTTCGGTCAGCAGCATGATCTGCCGCGCACG‑CTCCAGAAACCGCTC‑ACCCGCCTCGCTCATGCGCAGGCGCCGggtg > 1:1626838/1‑131 (MQ=255) aaCGCAGATGGCCGCGAGGCGTAAGGTGCGCCCCTCGCGCCTCGCCCACGGCTTCTTCGGTCAGCAGCATGATCTGCCGCGCACG‑CTCCAGAAACCGCTC‑ACCCGCCTCGCTCATGCGCAGGCGCCGggtg < 2:1626838/131‑1 (MQ=255) aCGCAGATGGCCGCGAGGCGTAAGGTGCGCCCCTCGCGCCTCGCCCACGGCTTCTTCGGTCAGCAGCATGATCTGCCGCGCACG‑CTCCAGAAACCGCTC‑ACCCGCCTCGCTCATGCGCAGGCGCCGGGTGGTGCGGTGCAGCAGGCGGGt > 1:1734508/1‑150 (MQ=255) cgAGGCGTAAGGTGCGCCCCTCGCGCCTCGCCCACGGCTTCTTCTGTCAGCAGCATGATCTGCCGCGCACG‑CTCCAGAAACCGCTC‑ACCCGCCTCGCTCATGCGCAGGCGCCGGGTGGTGCGGTGCAGCAGGCGGGTCTGCAGCTGGTtc < 1:156564/150‑1 (MQ=255) gAGGCGTAAGGTGCGCCCCTCGCGCCTCGCCCACGGCTTCTTCGGTCAGCAGCATGATCTGCCGCGCACG‑CTCCAGAAACCGCTC‑ACCCGCCTCGCTCATGCGCAGGCGCCGGGAGGTGCGGTGCAGCAGGCGGGTCTGCAGCTGGTtct > 1:1829542/1‑150 (MQ=255) aGGCGTAAGGTGCGCCCCTCGCGCCTCGCCCACGGCTTCTTCGGTCAGCAGCATGATCTGCCGCGCACG‑CTCCAGAAACCGCTC‑ACCCGCCTCGCTCATGCGCAGGCGCCGGGTGGTGCGGTGCAGCAGGCGGGTCTGCAGCTGGTtctc < 2:549797/150‑1 (MQ=255) gTAAGGTGCGCCCCTCGCGCCTCGCCCACGGCTTCTTCGGTCAGCAGCATGATCTGCCGCGCACG‑CTCCAGAAACCGCTC‑ACCCGCCTCGCTCATGCGCAGGCGCCGGGTGGTGCGGTGCAGCAGGCGGGTCTGCAGCTGGTTCTCCAGc > 1:910586/1‑150 (MQ=255) gTAAGGTGCGCCCCTCGCGCCTCGCCCACGGCTTCTTCGGTCAGCAGCATGATCTGCCGCGCACG‑CTCCAGAAACCGCTC‑ACCCGCCTCGCTCATGCGCAGGCGCCGGGTGGTGCGGTGCAGCAGGCGGGTCTGCAGCTGGTTCTCCAGc < 2:423068/150‑1 (MQ=255) tAAGGTGCGCCCCTCGCGCCTCGCCCACGGCTTCTTCGGTCAGCAGCATGATCTGCCGCGCACG‑CTCCAGAAACCGCTC‑ACCCGCCTCGCTCATGCGCAGGCGCCGGGTGGTGCGGTGCAGCAGGCGGGTCTGCAGCTGGTTCTCCAGCt > 2:112264/1‑150 (MQ=255) cTCGCGCCTCGCCCACGGCTTCTTCGGTCAGCAGCATGATCTGCCGCGCACG‑CTCCAGAAACCGCTC‑ACCCGCCTCGCTCATGCGCAGGCGCCGGGTGGTGCGGTGCAGCAGGCGGGTCTGCAGCTGGTTCTCCAGCTCGGCGACGATgc < 2:2261738/150‑1 (MQ=255) cTCGCGCCTCGCCCACGGCTTCTTCGGTCAGCAGCATGATCTGCCGCGCACG‑CTCCAGAAACCGCTC‑ACCCGCCTCGCTCATGCGCAGGCGCCGGGTGGTGCGGTGCAGCAGGCGGGTCTGCAGCTGGTTCTCCAGCTCGGCGACGATgc > 2:2406242/1‑150 (MQ=255) cTCGCGCCTCGCCCACGGCTTCTTCGGTCAGCAGCATGATACGCCGCGCACC‑CGCCAGAATCCGCTC‑ACCCGCCTCGCTCATGCGCAGGCGCCGGGTGGTGCGGTGCAGCAGGCGGGTCTGCAGCTGGTTCTCCAGCTCGGCGACGATgc < 1:2380281/150‑1 (MQ=255) cgcgCCTCGCCCACGGCTTCTTCGGTCAGCAGCATGATCTGCCGCGCACG‑CTCCATAAACCGCTC‑ACCCGCCTCGCTCATGCGCAGGCGCCGGGTGGTGCGGTGCAGCAGGCGGGTCTGCAGCTGGTTCTCCAGCTCGGCGACGATgcgc < 2:824835/150‑1 (MQ=255) cgcgCCTCGCCCACGGCTTCTTCGGTCAGCAGCATGATCTGCCGCGCACG‑CTCCAGAAACCGCTC‑ACCCGCCTCGCTCATGCGCAGGCGCCGGGTGGTGCGGTGCAGCAGGCGGGTCTGCAGCTGGTTCTCCAGCTCGGCGACGATgcgc < 2:1334830/150‑1 (MQ=255) cgcgCCTCGCCCACGGCTTCTGCGGTCAGCAGCATGATCTGCCGCTCACG‑CTCCAGAATCCGCTC‑ACCCGCCTCGCTCATGCTCAGGCGCCGGGTGGTGCGGTGCAGCAGGCGGGTCTGCAGCTGGTTCTCCAGCTCGGCGACGATgcgc < 2:1181132/150‑1 (MQ=255) gcgcCTCGCCCACGGCTTCTTCGGTCAGCAGCATGATCTGCCGCGCACG‑CTCCAGAAACCGCTC‑ACCCGCCTCGCTCATGCGCAGGCGCCGggtg > 1:2049075/1‑95 (MQ=255) gcgcCTCGCCCACGGCTTCTTCGGTCAGCAGCATGATCTGCCGCGCACG‑CTCCAGAAACCGCTC‑ACCCGCCTCGCTCATGCGCAGGCGCCGggtg < 2:2049075/95‑1 (MQ=255) cTCGCCCACGGCTTCTTCGGTCAGCAGCATGATCTGCCGCGCACG‑CTCCAGAAACCGCTC‑ACCCGCCTCGCTCATg < 2:1215192/76‑1 (MQ=255) cTCGCCCACGGCTTCTTCGGTCAGCAGCATGATCTGCCGCGCACG‑CTCCAGAAACCGCTC‑ACCCGCCTCGCTCATg > 1:1215192/1‑76 (MQ=255) cTCGCCCACGGCTTCTTCGGTCAGCAGCATGATCTGCCGCGCACG‑CTCCAGAAACCGCTC‑ACCCGCCTCGCTCATGCGCAGGCGCCGGGTGGTGCGGTGCAGCAGGCGGGTCTGCAGCTGGTTCTCCAGCTCGGCGACGATGCGCGAAAc > 1:1528793/1‑150 (MQ=255) cccACGGCTTCTTCGGTCAGCAGCATGATCTGCCGCGCACG‑CTCCAGAAACCGCTC‑ACCCGCCTCGCTCATGCGCAGGCGCCGGGTGGTGCGGTGCAGCAGGCGGGTCTGCAGCTGGTTCTCCCGCTCGGCGACGACGCGCCACACCTgc > 2:136247/1‑150 (MQ=255) ccACGGCTTCTTCGGTCAGCAGCATGATCTGCCGCGCACG‑CTCCAGAAACCGCTC‑ACCCGCCTCGCTCATGCGCAGGCGCCGGGTGGTGCGGTGCAGCAGGCGGGTCTGCAGCTGGTTCTCCAGCTCGGCGACGATGCGCGAAACCTgcg > 1:1601/1‑150 (MQ=255) ccACGGCTTCTTCGGTCAGCAGCATGATCTGCCGCGCACG‑CTCCAGAAACCGCTC‑ACCCGCCTCGCTCATGCGCAGGCGCCGGGTGGTGCGGTGCAGCAGGCGGGTCTGCAGCTGGTTCTCCAGCTCGGCGACGATGCGCGAAACCTgcg > 2:406511/1‑150 (MQ=255) aCGGCTTCTTCGGTCAGCAGCATGATCTGCCGCGCACG‑CTCCAGAAACCGCTC‑ACCCGCCTCGCTCATGCGCAGGCGCCGGGTGGTGCGGTGCAGCAGGCGGGTCTGCAGCTgg < 1:2451458/114‑1 (MQ=255) aCGGCTTCTTCGGTCAGCAGCATGATCTGCCGCGCACG‑CTCCAGAAACCGCTC‑ACCCGCCTCGCTCATGCGCAGGCGCCGGGTGGTGCGGTGCAGCAGGCGGGTCTGCAGCTgg > 2:2451458/1‑114 (MQ=255) aCGGCTTCTTCGGTCAGCAGCATGATCTGCCGCGCACG‑CTCCAGAAACCGCTC‑ACCCGCCTCGCTCATGCGCAGGCGCCGGGTGGTGCGGTGCAGCAGGCGGGTCTGCAGCTGGTTCTCCAGCTCGGCGACGATgcgc > 1:1466428/1‑138 (MQ=255) aCGGCTTCTTCGGTCAGCAGCATGATCTGCCGCGCACG‑CTCCAGAAACCGCTC‑ACCCGCCTCGCTCATGCGCAGGCGCCGGGTGGTGCGGTGCAGCAGGCGGGTCTGCAGCTGGTTCTCCAGCTCGGCGACGATgcgc < 2:1466428/138‑1 (MQ=255) gCTTCTTCGGTCAGCAGCATGATCTGCCGCGCACG‑CTCCAGAAACCGCTC‑ACCCGCCTCGCTCATGCGCAGGCGCCGGGTGGTGCGGTGCAGCAGGCGGGTCTGCAGCTGGTTCTCCAGCTCGGCGACGATGCGCGAAACCTGCGCTGCa < 2:543072/150‑1 (MQ=255) gCTTCTTCGGTCAGCAGCATGATCTGCCGCGCACG‑CTCCAGAAACCGCTC‑ACCCGCCTCGCTCATGCGCAGGCGCCGGGTGGTGCGGTGCAGCAGGCGGGTCTGCAGCTGGTTCTCCAGCTCGGCGACGATGCGCGAAACCTGCGCTGCa < 1:481721/150‑1 (MQ=255) ttcGGTCAGCAGCATGATCTGCCGCGCACG‑CTCCAGAAACCGCTC‑ACCCGCCTCGCTCATGCGCAGGCGCCGGGTGGTGCGGTGCAGCAGGCgg > 2:358440/1‑94 (MQ=255) ttcGGTCAGCAGCATGATCTGCCGCGCACG‑CTCCAGAAACCGCTC‑ACCCGCCTCGCTCATGCGCAGGCGCCGGGTGGTGCGGTGCAGCAGGCgg < 1:358440/94‑1 (MQ=255) ttcGGTCAGCAGCATGATCTGCCGCGCACG‑CTCCAGAAACCGCTC‑ACCCGCCTCGCTCATGCGCAGGCGCCGGGTGGTGCGGTGCAGCAGGCGGGTCTGCAGCTGGTTCTCCAGCTCGGCGACGATGCGCGAAACCTGCGCTGCAGAAat > 1:2386112/1‑150 (MQ=255) ggTCAGCAGCATGATCTGCCGCGCACG‑CTCCAGAAACCGCTC‑ACCCGCCTCGCTCATGCGCAGGCGCCGGGTGGTGCGGTGCAGCAGGCGGGTCTGCAGCTGGTTCTCCAGCTCGGCGACGATGCGCGAAACCTGCGCTGCAGAAATATc < 1:2406242/150‑1 (MQ=255) gTCAGCAGCATGATCTGCCGCGCACG‑CTCCAGAAACCGCTC‑ACCCGCCTCGCTCATGCGCAGGCGCCGGGTGGTGCGGTGCAGCAGGCGGGTCTGCAGCTGGTTCTCCAGCTCGGCGACGATGCGCGAAACCTGCGCTGCAGAAATATcc < 1:1251962/150‑1 (MQ=255) gTCAGCAGCATGATCTGCCGCGCACG‑CTCCAGAAACCGCTC‑ACCCGCCTCGCTCATGCGCAGGCGCCGGGTGGTGCGGTGCAGCAGGCGGGTCTGCAGCTGGTTCTCCAGCTCGGCGACGATGCGCGAAACCTGCGCTGCAGAAATATcc < 1:406511/150‑1 (MQ=255) tCAGCAGCATGATCTGCCGCGCACG‑CTCCAGAAACCGCTC‑ACCCGCCTCGCTCATGCGCAGGCGCCGGGTGGTGCGGTGCAGCAGGCGGGTCTGCAGCTGGTTCTCCAGCTCGGCGACGATGCGCGAAACCTGCGCTGCAGAAATATCCa > 2:1733697/1‑150 (MQ=255) gcagcaTGATCTGCCGCGCACG‑CTCCAGAAACCGCTC‑ACCCGCCTCGCTCATGCGCAGGCGCCGGGTGGTGCGGTGCAGCAGGCGGGTCTGCAGCTGGTTCTCCAGCTCGGCGACGATGCGCGaaa < 1:2095261/126‑1 (MQ=255) gcagcaTGATCTGCCGCGCACG‑CTCCAGAAACCGCTC‑ACCCGCCTCGCTCATGCGCAGGCGCCGGGTGGTGCGGTGCAGCAGGCGGGTCTGCAGCTGGTTCTCCAGCTCGGCGACGATGCGCGaaa > 2:2095261/1‑126 (MQ=255) gcagcaTGATCTGCCGCGCACG‑CTCCAGAAACCGCTC‑ACCCGCCTCGCTCATGCGCAGGCGCCGGGTGGTGCGGTGCAGCAGGCGGGTCTGCAGCTGGTTCTCCAGCTCGGCGACGATGCGCGaaa > 2:2095293/1‑126 (MQ=255) gcagcaTGATCTGCCGCGCACG‑CTCCAGAAACCGCTC‑ACCCGCCTCGCTCATGCGCAGGCGCCGGGTGGTGCGGTGCAGCAGGCGGGTCTGCAGCTGGTTCTCCAGCTCGGCGACGATGCGCGaaa < 1:2095293/126‑1 (MQ=255) gcagcaTGATCTGCCGCGCACG‑CTCCAGAAACCGCTC‑ACCCGCCTCGCTCATGCGCAGGCGCCGGGTGGTGCGGTGCAGCAGGCGGGTCTGCAGCTGGTTCTCCAGCTCGGCGACGATGCGCGAAACCTGCGCTGCAGAAATATCCa > 1:162495/1‑147 (MQ=255) gcagcaTGATCTGCCGCGCACG‑CTCCAGAAACCGCTC‑ACCCGCCTCGCTCATGCGCAGGCGCCGGGTGGTGCGGTGCAGCAGGCGGGTCTGCAGCTGGTTCTCCAGCTCGGCGACGATGCGCGAAACCTGCGCTGCAGAAATATCCa < 2:162495/147‑1 (MQ=255) cagcaTGATCTGCCGCGCACG‑CTCCAGAAACCGCTC‑ACCCGCCTCGCTCATGCGCAGGCGCCGGGTGGTGCGGTGCAGCAGGCGGGTCTGCAGCTGGTTCTCCAGCTCGGCGACGATGCGCGAAACCTGCGCTGCAGAAATATCCAGAGc > 2:2113859/1‑150 (MQ=255) caTGATCTGCCGCGCACG‑CTCCAGAAACCGCTC‑ACCCGCCTCGCTCATGCGCAGGCGCCGGGTGGTGCGGTGCAGCAGGCGGGTCTGCAGCTGGTTCTCCAGCTCGGCGACGATGCGCGAAACCTGCGCTGCAGAAATATCCAGAGCAtt < 1:1657667/150‑1 (MQ=255) caTGATCTGCCGCGCACG‑CTCCAGAAACCGCTC‑ACCCGCCTCGCTCATGCGCAGGCGCCGGGTGGTGCGGTGCAGCAGGCGGGTCTGCAGCTGCTCCGCCAGCGCGGCGACGATGCGCGAAACCTGCGCTGCAGAAATATCCAGAGCAtt < 2:333792/150‑1 (MQ=255) cTGCCGCGCACG‑CTCCAGACACCGCTC‑ACCCGCCTCGCTCATGCGCAGGCGCCGGGTGGTGCGGTGCAGCAGGCGGGTCTGCAGCTGGTTCTCCAGCTCGGCGACGATGCGCGAAACCTGCGCTGCAGAAATATCCAGAGCATTGGCAGc < 1:112264/150‑1 (MQ=255) tGCCGCGCACG‑CTCCAGAAACCGCTC‑ACCCGCCTCGCTCATGCGCAGGCGCCGGGTGGTGCGGTGCAGCAGGCGGGTCTGCAGCTGGTTCTCCAGCTCGGCGACGATgc > 2:1977576/1‑109 (MQ=255) tGCCGCGCACG‑CTCCAGAAACCGCTC‑ACCCGCCTCGCTCATGCGCAGGCGCCGGGTGGTGCGGTGCAGCAGGCGGGTCTGCAGCTGGTTCTCCAGCTCGGCGACGATgc < 1:1977576/109‑1 (MQ=255) tGCCGCGCACG‑CTCCAGAAACCGCTC‑ACCCGCCTCGCTCATGCGCAGGCGCCGGGTGGTGCGGTGCAGCAGGCGGGTCTGCAGCTGGTTCTCCAGCTCGGCGACGATGCGCGAAACCTGCGCTGCAGAAATATCCAGAGCATTGGCAGCt > 2:1996667/1‑150 (MQ=255) aCG‑CTCCAGAAACCGCTC‑ACCCGCCTCGCTCATGCGCAGGCGCCGGGTGGTGCGGTGCAGCAGGCGGGTCTGCAGCTGGTTCTCCAGCTCGGCGACGATGCGCGAAACCTGCGCTGCAGAAATATCCAGAGCATTGGCAGCTGCAGCGaa < 2:1528793/150‑1 (MQ=255) g‑CTCCAGAAACCGCTC‑ACCCGCCTCGCTCATGCGCAGGCGCCGGGTGGTGCGGTGCAGCAGGCGGGTCTGCAGCTGGTTCTCCAGCTCGGCGACGATGCGCGAAACCTGCGCTGCAGAAATATCCAGAGCATTGGCAGCTGCAGCGaa < 1:1812896/148‑1 (MQ=255) g‑CTCCAGAAACCGCTC‑ACCCGCCTCGCTCATGCGCAGGCGCCGGGTGGTGCGGTGCAGCAGGCGGGTCTGCAGCTGGTTCTCCAGCTCGGCGACGATGCGCGAAACCTGCGCTGCAGAAATATCCAGAGCATTGGCAGCTGCAGCGaa > 2:1812896/1‑148 (MQ=255) g‑CTCCAGAAACCGCTC‑ACCCGCCTCGCTCATGCGCAGGCGCCGGGTGGTGCGGTGCAGCAGGCGGGTCTGCAGCTGGTTCTCCAGCTCGGCGACGATGCGCGAAACCTGCGCTGCAGAAATATCCAGAGCATTGGCAGCTGCAGCGAAGc > 1:1481708/1‑150 (MQ=255) cAGAAACCGCTC‑ACCCGCCTCGCTCATGCGCAGGCGCCGGGTGGTGCGGTGCAGCAGGCGGGTCTGCAGCTGGTTCTCCAGCTCGGCGACGATGCGCGAAACCTGCGCTGCAGAAATATCCAGAGCATTGGCAGCTGCAGCGAAGCTGcc > 1:2451972/1‑150 (MQ=255) cAGAAACCGCTC‑ACCCGCCTCGCTCATGCGCAGGCGCCGGGTGGTGCGGTGCAGCAGGCGGGTCTGCAGCTGGTTCTCCAGCTCGGCGACGATGCGCGAAACCTGCGCTGCAGAAATATCCAGAGCATTGGCAGCTGCAGCGAAGCTGcc > 2:1455082/1‑150 (MQ=255) aGAAACCGCTC‑ACCCGCCTCGCTCATGCGCAGGCGCCGGGTGGTGCGGTGCAGCAGGCGGGTCTGCAGCTGGTTCTCCAGCTCGGCGACGATGCGCGAAACCTGCGCTGCAGAAATATCCAGAGCATTGGCAGCTGCAGCGAAGCTGCca > 2:195443/1‑150 (MQ=255) ACCGCTC‑ACCCGCCTCGCTCATGCGCAGGCGCCGGGTGGTGCGGTGCAGCAGGCGGGTCTGCAGCTGGTTCTCCAGCTCGGCGACGATGCGCGAAACCTGCGCTGCAGAAATATCCAGAGCATTGGCAGCTGCAGCGAAGCTGCCACAtt < 2:429579‑M1/150‑1 (MQ=255) | TGTAGCCGGCCACCAGCGGCATCAGCAACAGCCCCATGCCGTGCGGGCAGTGCAAACGCAGATGGCCGCGAGGCGTAAGGTGCGCCCCTCGCGCCTCGCCCACGGCTTCTTCGGTCAGCAGCATGATCTGCCGCGCACG‑CTCCAGAAACCGCTC‑ACCCGCCTCGCTCATGCGCAGGCGCCGGGTGGTGCGGTGCAGCAGGCGGGTCTGCAGCTGGTTCTCCAGCTCGGCGACGATGCGCGAAACCTGCGCTGCAGAAATATCCAGAGCATTGGCAGCTGCAGCGAAGCTGCCACATT > NC_002947/3963708‑3964004 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |