| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 4398703 = | 80 (0.860) | 6 (0.070) | 6/236 | NT | 7.2% | coding (198/1314 nt) | PP_3877 | hypothetical protein |
| ? | NC_002947 | 4398746 = | 78 (0.890) | coding (155/1314 nt) | PP_3877 | hypothetical protein | |||||
CGGCTGCCTGCTGATCGCCGCGGGAAGCGGCCAGCACGCGGACCATCTGCGCCATGTTGGCACCCGGCACCGGCTTGGCCGTGTATGGGCCGCTGATGCTGCCGGGCGGGCCGTTCAGGCCTTGAGCACCTTCATTCACGGGGACCGCACTCGCGGTCGCCATACGCTCGGCCGCTTCGGCGCGCGCGAGTTTCTCCGTCAGCTGGTTGAACTGGGTGCTGAGCTGCTCGAACTGTGAGAGCTGCTCCGCGCTGAGCGCAGTACCAGCGGCCTCCAGCTGGGCCAGGGACTGGATCT > NC_002947/4398555‑4398851 | tcgtaactcaattgcgtagcgaacgcgccactatcaatggtcagatccagtccctggcccagctggaggccgctggtactgcgctcagcgcggagcagctctcacagttcgagcagctcagcacccagttcaaccagctgacggagaaAc > 2:2297185‑M1/149‑150 (MQ=255) ggCTGCCTGCTGATCGACGCGGGAAGCGGCCAGCACGCGGACCATCTACGCCATGTTGGCACCCGGCACCGGCTTGGCCGTGTATGGGCCGCTGATGCTGTCGGGCGGGCCGTTCAGGCCTTGAGCACCTTCATTCACGGGGCCCGCACt > 2:1226666/1‑150 (MQ=255) tgcctgcTGATCGCCGCGGGAAGCGGCCAGTACGCGGACCATCTGCGCCATGTTGGCACCCGGCACCGGCTTGGCCGTGTATGGGCCGCTGATGCTGCCGGGCGGGCCGTTCAGGCCTTGAGCACCTTCATTCACGGGGACCGCACTcgc > 2:139544/1‑150 (MQ=255) aactcaattgcgtagcgaacgcgccactatcaatggtcagatccagtccctggcccagctggaggccgctggtactgcgctcagcgcggagcagctctcacagttcgagcagctcagcacccagttcaaccagctgacggagaaACTcgc > 1:967087‑M1/145‑150 (MQ=255) aactcaattgcgtagcgaacgcgccactatcaatggtcagatccagtccctggcccagctggaggccgctggtactgcgctcagcgcggagcagctctcacagttcgagcagctcagcacccagttcaaccaactgacggagaaACTcgc > 1:190313‑M1/145‑150 (MQ=255) gcctgcTGATCGCCGCGGGAAGCGGCCAGCACGCGGACCATCTGCGCCATGTTGGCACCCGGCACCGGCTTGGCCGTGTATGGGCCGCTGATGCTGCCGGGCGGGCCGTTCAGGCCTTGAGCACCTTCATTCACGGGGACCGCACTcgcg < 1:330493/150‑1 (MQ=255) actcaattgcgtagcgaacgcgccactatcaatggtcagatccagtccctggcccagctggaggccgctggtactgcgctcagcgcggagcagctctcacagttcgagcagctcagcacccagttcaaccagctgacggagaaACTcgcg < 1:409911‑M1/7‑1 (MQ=255) ctgctgATCGCCGCGGGAAGCGGCCAGCACGCGGACCATCTGCGCCATGTTGGCACCCGGCACCGGCTTGGCCGTGTATGGGCCGCTGATGCTGCCGGGCGGGCCGTTCAGGCCTTGAGCACCTTCATTCACGGGGACCGCACTCGCGGt < 2:996871/150‑1 (MQ=255) ctgctgATCGCCGCGGGAAGCGGCCAGCACGCGGACCATCTGCGCCATGTTGGCACCCGGCACCGGCTTGGCCGTGTATGGGCCGCTGATGCTGCCGGGCGGGCCGTTCAGGCCTTGAGCACCTTCATTCACGGGGACCGCACTCGCGGt < 2:1541924/150‑1 (MQ=255) ctgATCGCCGCGGGAAGCGGCCAGCACGCGGACCATCTGCGCCATGTTGGCACCGGGCACCGGCTTGGCCGTGTATGGGCCGCTGATGCTGCCGGGCGGGCCGTTCAGGCCTTAACTACCTTCATTCACGGGGACCGCACTCGCGGTCGc > 1:1193485/1‑150 (MQ=255) ctgATCGCCGCGGGAAGCGGCCAGCACGCGGACCATCTGCGCCATGTTGGCACCCGGCACCGGCTTGGCCGTGTATGGGCCGCTGATGCTGCCGGGCGGGCCGTTCAGGCCTTGAGCACCTTCATTCACGGGGACCGCACTCGCGGTCGc > 2:815814/1‑150 (MQ=255) gATCGCCGCGGGAAGCGGCCAGCACGCGGACCATCTGCGCCATGTTGGCACCCGGCACCGGCTTGGCCGTGTATGGGCCGCTGATGCTGCCGGGCGGGCCGTTCAGGCCTTGAGCACCTTCATTCACGGGGACCGCACTCGCGGTCGCCa < 2:1646411/150‑1 (MQ=255) ccgcGGGAAGCGGCCAGCACGCGGACCATCTGCGCCATGTTGGCACCCGGCACCGGCTTGGCCGTGTATGGGCCGCTGATGCTGCCGGGCGGGCCGTTCAGGCCTTGAGCACCTTCATTCACGGGGACCGCACTCGCGGTCGCCCTACGc > 1:95416/1‑150 (MQ=255) gAAGCGGCCAGCACGCGGACCATCTGCGCCATGTTGGCACCCGGCACCGGCTTGGCCGTGTATGGGCCGCTGATGCTGCCGGGCGGGCCGTTCAGGCCTTGAGCACCTTCATTCACGGGGACCGCACTCGCGGTCGCCATACGCTCGGcc > 2:405/1‑150 (MQ=255) gAAGCGGCCAGCACGCGGACCATCTGCGCCATGTTGGCACCCGGCACCGGCTTGGCCGTGTATGGGCCGCTGATGCTGCCGGGCGGGCCGTTCAGGCCTTGAGCACCTTCATTCACGGGGACCGCACTCGCGGTCGCCATACGCTCGGcc > 2:690638/1‑150 (MQ=255) aGCGGCCAGCACGCGGACCATCTGCGCCATGTTGGCACCCGGCACCGGCTTGGCCGTGTATGGGCCGCTGATGCTGCCGGGCGGGCCGTTCAGGCCTTGAGCACCTTCATTCACGGGGACCGCACTCGCGGTCGCCATACGCTCGGCCGc < 2:2073818/150‑1 (MQ=255) cGGCCAGCACGCGGACCATCTGCGCCATGTTGGCACCGGGCACCGGCTTGGCCGTGTATGGGCCGCTGATGCTGCCGGGCGGGCCGTTCCGGACTTGAGCACCTTCATTCACGGGGACCGCACTCGCGGTCGCCATACGCTCGGCCGCtt > 2:2155976/1‑150 (MQ=255) gCCAGCACGCGGACCATCTGCGCCATGTTGGCACCCGGCACCGGCTTGGCCGTGTATGGGCCGCTGATGCTGCCGGGCGGGCCGTTCAGGCCTTGAGCACCTTCATTCACGGGGACCGCACTCGCGGTCGCCATACGCTCGGCCGCTTCg < 1:2407649/150‑1 (MQ=255) 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ctggcccagctggaggccgctggtactgcgctcagcgcggagcagctctcacagttcgagcagctcagcacccagttcaaccagctgacggagaaACTCGCGGTCGCCATACGCTCGGCCGCTTCGGCGCGCGCGAGTTtctc < 1:711486‑M1/48‑1 (MQ=255) ctggcccagctggaggccgctggtactgcgctcagcgcggagcagctctcacagttcgagcagctcagcacccagttcaaccagctgacggagaaACTCGCGGTCGCCATACGCTCGGCCGCTTCGGCGCGCGCGAGTTtctc > 2:711486‑M1/96‑143 (MQ=255) aTGTTGGCACCCGGCACCGGCTTGGCCGTGTATGGGCCGCTGATGCTGCCGGGCGGGCCGTTCAGGCCTTGAGCACCTTCATTCACGGGGACCGCACTCGCGGTCGCCATACGCTCGGCCGCTTCGGCGCGCGCGa < 2:1925050/136‑1 (MQ=255) aTGTTGGCACCCGGCACCGGCTTGGCCGTGTATGGGCCGCTGATGCTGCCGGGCGGGCCGTTCAGGCCTTGAGCACCTTCATTCACGGGGACCGCACTCGCGGTCGCCATACGCTCGGCCGCTTCGGCGCGCGCGa > 1:1925050/1‑136 (MQ=255) ggtGGCACCCGGCACCGGCTTGGCCGTGTATGGGCCGCTGATGCTGCCGGGCGGGCCGTTCAGGCCTTGAGCACCTTCATTCACGGGGACCGCACTCGCGGTCGCCATACGCTCGGCCGCTTCGGCGCGCGCGAGTTTCTCCGTCAGCTg < 2:727738/148‑1 (MQ=255) 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ttCAGGCCTTGAGCACCTTCATTCACGGGGACCGCACTCGCGGTCGCCATACGCTCGGCCGCTTCGGCGCGCGCGAGTTTCTCCGTCAGCTGGTTGAACTGGGTGCTGAGCTGCTCGAACTGTGAGAGCTGCTCCGCGCTGAGCGCAGTa < 2:2199167/150‑1 (MQ=255) ttCAGGCCTTGAGCACCTTCATTCACGGGGACCGCACTCGCGGTCGCCATACGCTCGGCCGCTTCGGCGCGCGCGAGTTTCTCCGTCAGCTGGTTGAACTGGGTGCTGAGCTGCTCGAACTGTGAGAGCTGCTCCGCGCTGAGCGCAGTa < 2:2281869/150‑1 (MQ=255) ttCAGGCCTTGAGCACCTTCATTCACGGGGACCGCACTCGCGGTCGCCATACGCTCGGCCGCTTCGGCGCGCGCGAGTTTCTCCGTCAGCTGGTTGAACTGGGTGCTGAGCTGCTCGAACTGTGAGAGCTGCTCCGCGCTGAGCGCAGTa < 1:984720/150‑1 (MQ=255) cTTGAGCACCTTCATTCACGGGGACCGCACTCGCGGTCGCCATACGCTCGGACGCTTCGGCGCGTGCGAGTTTCTTCGTCAGCTGGTTGAACTGGGTGCTTAGCTGCTCGAACTGTGAGAGCTGCTCCGCGCTGAGCGCAGTACCAGCgg < 1:1226666/150‑1 (MQ=255) ttGAGCACCTTCATTCACGGGGACCGCACTCGCGGTCGCCATACGCTCGGCCGCTTCGGCGCGCGCGAGTTTCTCCGTCAGCTGGTTGAACTGGGTGCTGAGCTGCTCGAACTGTGAGAGCTGCTCCGCGCTGAGCGCAGTACCAGCGGc < 1:815814/150‑1 (MQ=255) gAGCACCTTCATTCACGGGGACCGCACTCGCGGTCGCCATACGCTCGGCCGCTTCGGCGCGCGCGAGTTTCTCCGTCAGCTGGTTGAACTGGGTGCTGAGCTGCTCGAACTGTGAGAGCTGCTCCGCGCTGAGCGCAGTACCAGCGGCCt > 1:2085165/1‑150 (MQ=255) aCCTTCATTCACGGGGACCGCACTCGCGGTCGCCATACGCTCGGCCGCTTCGGCGCGCGCGAGTTTCTCCGTCAGCTGGTTGAACTGGGTGCTGAGCTGCTCGAACTGTGAGAGCTGCTCCGCGCTGAGCGCAGTACCAGCGGCCTCCAg < 2:1767402/150‑1 (MQ=255) ccTTCATTCACGGGGACCGCACTCGCGGTCGCCATACGCTCGGCCGCTTCGGCGCGCGCGAGTTTCTCCGTCAGCTGGTTGAACTGGGTGCTGAGCTGCTCGAACTGTGAGAGCTGCTCCGCGCTGAGCGCAGTACCAGCGGCCTCCAGc < 2:104230/150‑1 (MQ=255) cTTCATTCACGGGGACCGCACTCGCGGTCGCCATACGCTCGGCCGCTTCGGCGCGCGCGAGTTTCTCCGTCAGCTGGTTGAACTGGGTGCTGAGCTGCTCGAACTGTGAGAGCTGCTCCGCGCTGAGCGCAGTACCAGCGGCCTCCAGCt > 2:314676/1‑150 (MQ=255) cTTCATTCACGGCGCCACCACTCGCGGTCGCCATACGCTCGGCCGCTTCGGCGCGCGCGAGTTTCTCCGTCAGCTGGTTGAACTGGGTGCTGAGCTGCTCGAACTGTGAGAGCTGCTCCGCGCTGAGCGCAGTACCAGCGGCCTCCAGCt > 2:1920335/1‑150 (MQ=255) tcattcaCGGGGACCGCACTCGCGGTCGCCATACGCTCGGCCGCTTCGGCGCGCGCGAGTTTCTCCGTCAGCTGGTTGAACTGGGTGCTGAGCTGCTCGAACTGTGAGAGCTGCTCCGCGCTGAGCGCAGTACCAGCGGCCTCCAGCTgg < 2:639534/150‑1 (MQ=255) ttcaCGGGGACCGCACTCGCGGTCGCCATACGCTCGGCCGCTTCGGCGCGCGCGAGTTTCTCCGTCAGCTGGTTGAACTGGGTGCTGAGCTGCTCGAACTGTGAGAGCTGCTCCGCGCTGAgcg > 1:255687/1‑124 (MQ=255) ttcaCGGGGACCGCACTCGCGGTCGCCATACGCTCGGCCGCTTCGGCGCGCGCGAGTTTCTCCGTCAGCTGGTTGAACTGGGTGCTGAGCTGCTCGAACTGTGAGAGCTGCTCCGCGCTGAgcg < 2:255687/124‑1 (MQ=255) ttcaCGGGGACCGCACTCGCGGTCGCCATACGCTCGGCCGCTTCGGCGCGCGCGAGTTTCTCCGTCAGCTGGTTGAACTGGGTGCTGAGCTGCTCGAACTGTGAGAGCTGCTCCGCGCTGAGCGCAGTACCAGCGGCCTCCAGCTGGGcc > 2:1922482/1‑150 (MQ=255) ggACCGCACTCGCGGTCGCCATACGCTCGGCCGCTTCGGCGCGCGCGAGTTTCTCCGTCAGCTGGTTGAACTGGGTGCTGAGCTGCTCGAACTGTGAGAGCTGCTCCGCGCTGAGCGCAGTACCAGCGGCCTCCAGCTGGGCCAGGGACt < 2:1193485/150‑1 (MQ=255) ggACCGCACTCGCGGTCGCCATACGCTCGGCCGCTTCGGCGCGCGCGAGTTTCTCCGTCAGCTGGTTGAACTGGGTGCTGAGCTGCTCGAACTGTGAGAGCTGCTCCGCGCTGAGCGCAGTACCAGCGGCCTCCAGCTGGGCCAGGGACt > 1:2310864/1‑150 (MQ=255) ggACCGCACTCGCGGTCGCCATACGCTCGGCCGCTTCGGCGCGCGCGAGTTTCTCCGTCAGCTGGTTGAACTGGGTGCTGAGCTGCTCGAAATGTGAGGATTTCTCCGCGCTGAGCGCAGTACCAGCGGCCTCCAGCTGGGCCAGGGACt > 2:1881096/1‑150 (MQ=255) ccGCACTCGCGGTCGCCATACGCTCGGCCGCTTCGGCGCGCGCGAGTTTCTCCGTCAGCTGGTTGAACTGGGTGCTGAGCTGCTCGAACTGTGAGAGCTGCTCCGCGCTGAGCGCAGTa > 1:1419654/1‑119 (MQ=255) ccGCACTCGCGGTCGCCATACGCTCGGCCGCTTCGGCGCGCGCGAGTTTCTCCGTCAGCTGGTTGAACTGGGTGCTGAGCTGCTCGAACTGTGAGAGCTGCTCCGCGCTGAGCGCAGTa < 2:1419654/119‑1 (MQ=255) ccGCACTCGCGGTCGCCATACGCTCGGCCGCTTCGGCGCGCGCGAGTTTCTCCGTCAGCTGGTTGAACTGGGTGCTGAGCTGCTCGAACTGTGAGAGCTGCTCCGCGCTGAGCGCAGTACCAGCGGCCTCCAGCTGGGCCAGGGACTGGa < 1:279367/150‑1 (MQ=255) ccGCACTCGCGGTCGCCATACGCTCGGCCGCTTCGGCGCGCGCGAGTTTCTCCGTCAGCTGGTTGAACTGGGTGCTGAGCTGCTCGAACTGTGAGAGCTGCTCCGCGCTGAGCGCAGTACCAGCGGCCTCCAGCTGGGCCAGGGACTGGa > 2:409911/1‑150 (MQ=255) cACTCGCGGTCGCCATACGCTCGGCCGCTTCGGCGCGCGCGAGTTTCTCCGTCAGCTGGTTGAACTGGGTGCTGAGCTGCTCGAACTGTGAGAGCTGCTCCGCGCTGAGCGCAGTACCAGCGGCCTCCAGCTGGGCCAGGGACTGGATCt > 1:836462/1‑150 (MQ=255) cACTCGCGGTCGCCATACGCTCGGCCGCTTCGGCGCGCGCGAGTTTCTCCGTCAGCTGGTTGAACTGGGTGCTGAGCTGCTCGAACTGTGAGAGCTGCTCCGCGCTGAGCGCAGTACCAGCGGCCTCCAGCTGGGCCAGGGACTGGATCt > 1:292124/1‑150 (MQ=255) cACTCGCGGTCGCCATACGCTCGGCCGCTTCGGCGCGCGCGAGTTTCTCCGTCAGCTGGTTGAACTGGGTGCTGAGCTGCTCGAACTGTGAGAGCTGCTCCGCGCTGAGCGCAGTACCAGCGGCCTCCAGCTGGGCCAGGGACTGGATCt < 2:1955410/150‑1 (MQ=255) | CGGCTGCCTGCTGATCGCCGCGGGAAGCGGCCAGCACGCGGACCATCTGCGCCATGTTGGCACCCGGCACCGGCTTGGCCGTGTATGGGCCGCTGATGCTGCCGGGCGGGCCGTTCAGGCCTTGAGCACCTTCATTCACGGGGACCGCACTCGCGGTCGCCATACGCTCGGCCGCTTCGGCGCGCGCGAGTTTCTCCGTCAGCTGGTTGAACTGGGTGCTGAGCTGCTCGAACTGTGAGAGCTGCTCCGCGCTGAGCGCAGTACCAGCGGCCTCCAGCTGGGCCAGGGACTGGATCT > NC_002947/4398555‑4398851 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |