| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | NC_002947 | = 4588104 | 103 (1.240) | intergenic (‑244/‑78) | PP_4063/ivd | long‑chain fatty acid‑‑CoA ligase/isovaleryl‑CoA dehydrogenase | |||||
Only 100 of 138 total aligned reads displayed.
TGAAGCAAGCGGGAATACTCTGGCGCAGATTTACGTTTACGTAAAGGTGACGAGTGGATTGACAGTGACCCTCATGCAGGTTTACGTTAACGTAAAGGTGATGAACGACACCCACTTGAGGCGCCACGCCGCCCTCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAATGCGACCAATCAGGTAATGACGGTGACCCTGCTGACGTATTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGGGCGGGGCCGGATCCCAAGCTATGGTGTAACCCAATTTCAAGAACAAGAAGGTGCCCCAGCATGCATTACCC > NC_002947/4587895‑4588192 | tGAAGCAAGCGGGAATACTCTGGCGCAGATTTACGTTTACGTACAGGTGACGAGTGGATTGACAGTGACCCTCATGCAGGTTTACGTTAACGTAAAGGTGATGAACGACACCCACTTGAGGCGCCACGCCGCCCTCTGTGGGAGCGGGCt > 2:89287/1‑150 (MQ=255) agcaagcGGGAATACTCTGGCGCAGATTTACGTTTACGTAAAGGTGACGAGTGGATTGACAGTGACCCTCATGCAGGTTTACGTTAACGTAAAGGTGATGAACGACACCCACTTGAGGCGCCACGCCGCCCTCTGTGGGAGCGGGCTTGc < 1:131396/150‑1 (MQ=255) agcaagcGGGAATACTCTGGCGCAGATTTACGTTTACGTAAAGGTGACGAGTGGATTGACAGTGACCCTCATGCAGGTTTACGTTAACGTAAAGGTGATGAACGACACCCACTTGAGGCGCCACGCCGCCCTCTGTGGGAGCGGGCTTGc < 1:249783/150‑1 (MQ=255) agcaagcGGGAATACTCTGGCGCACATTTACGTTTACGTAAAGGTGACGAGTGCATTGACAGTGACCCTCATGCAGCTTTACGTTAACCTAAAGGTGATGAACGACACCCACTTGAGGCGCCACGCCGCCCTCTGTGGGAGCGGGCTTGc < 1:1504117/150‑1 (MQ=255) aagcGGGAATACTCTGGCGCAGATTTACGTTTACGTAAAGGTGACGAGTGGATTGACAGTGACCCTCATGCAGGTTTACGTTAACGTAAAGGTGATGAACGACACCCACTTGAGGCGCCACGCCGCCCTCTGTGGGAGCGGGCTTGCCcg > 1:1678337/1‑150 (MQ=255) aTACTCTGGCGCAGATTTACGTTTACGTAAAGGTGACGAGTGGATTGACAGTGACCCTCATGCAGGTTTACGTTAACGTAAAGGTGATGAACGACACCCACTTGAGGCGCCACGCCGCCCTCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAATGCg > 2:454104/1‑150 (MQ=255) tACTCTGGCGCAGATTTACGTTTACGTAAAGGTGACGAGTGGATTGACAGTGATCCTCATGCAGGTTTACGTTAACGTAAAGGTGATGAACGACACCCACTTGAGGCGCCACGCCGCCCTCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAATGCGa < 2:1299944/150‑1 (MQ=255) tctGGCGCAGATTTACGTTTACGTAAAGGTGACGAGTGGATTGACAGTGACCCTCATGCAGGTTTACGTTAACGTAAAGGTGATGAACGACACCCACTTGAGGCGCCACGCCGCCCTCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAATGCGACCa > 1:598964/1‑150 (MQ=255) 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ggAGCGGGCatgcccgcgaatacgtcagcagggtcaccgtcattacctgattggtcgcattcgcgggcaagcccgctcccacagagggcggcgtggcgcctcaagtgggtgtcgttcatcacctttacgttaacgtaaacctgcatgagg < 1:1470888‑M1/150‑142 (MQ=255) ggAGCGGGCatgcccgcgaatacgtcagcagggtcaccgtcattacctgattggtcgcattcgcgggcaagcccgctcccacagagggcggcgtggcgcctcaagtgggtgtcgttcatcacctttacgttaacgtaaacctgcatgagg < 1:1470900‑M1/150‑142 (MQ=255) ggAGCGGGCatgcccgcgaatacgtcagcagggtcaccgtcattacctgattggtcgcattcgcgggcaagcccgctcccacagagggcggcgtggcgcctcaagtgggtgtcgttcatcacctttacgttaacgtaaacctgcatgagg < 1:2012084‑M1/150‑142 (MQ=255) gCGGGCatgcccgcgaatacgtcagcagggtcaccgtcattacctgattggtcgcattcgcgggcaagcccgctcccacagagggcggcgtggcgcctcaagtgggtgtcgttcatcacctttacgttaacgtaaacctgcatgagggtc > 2:1688664‑M1/1‑6 (MQ=255) gggCatgcccgcgaatacgtcagcagggtcaccgtcattacctcattggtcgcattcgcgggcaagcccgctcccacagagggcggcgtggcgcctcaagtgggtgtcgttcatcacctttacgttaacgtaaacctgcatgagggtcac < 1:856687‑M1/150‑147 (MQ=255) ggCTTGCCCGCGAATGCGACCAATCAGGTAATGACGGTGACCCTGCTGACGTATTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGGGCGGGGCCGGATCCCAAGCTATGGTGTAACCCAATTTCAAGAACAAGAAGGTGCCCCAGCATGCATTAc < 1:67075/150‑1 (MQ=255) ggCTTGCCCGCGAATGCGACCAATCAGGTAATGACGGTGACCCTGCTGACGTATTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGGGCGGGGCCGGATCCCAAGCTATGGTGTAACCCAATTTCAAGAACAAGAAGGTGCCCCAGCATGCATTAc < 1:67145/150‑1 (MQ=255) gCatgcccgcgaatacgtcagcagggtcaccgtcattacctgattggtcgcattcgcgggcaagcccgctcccacagagggcggcgtggcgcctcaagtgggtgtcgttcatcacctttacgttaacgtaaacctgcatgagggtcactg > 1:448104‑M1/1‑2 (MQ=255) catgcccgcgaatacgtcagcagggtcaccgtcattacctgattggtcgcattcgcgggcaagcccgctcccacagagggcggcgtggcgcctcaagtgggtgtcgttcatcacctttacgttaacgtaaacctgcatgagggtcactgt < 1:14561‑M1/150‑150 (MQ=255) catgcccgcgaatacgtcagcagggtcaccgtcattacctgattggtcgcattcgcgggcaagcccgctcccacagagggcggcgtggcgcctcaagtgggtgtcgttcatcacctttacgttaacgtaaacctgcatgagggtcactgt < 1:924008‑M1/150‑150 (MQ=255) | TGAAGCAAGCGGGAATACTCTGGCGCAGATTTACGTTTACGTAAAGGTGACGAGTGGATTGACAGTGACCCTCATGCAGGTTTACGTTAACGTAAAGGTGATGAACGACACCCACTTGAGGCGCCACGCCGCCCTCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAATGCGACCAATCAGGTAATGACGGTGACCCTGCTGACGTATTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGGGCGGGGCCGGATCCCAAGCTATGGTGTAACCCAATTTCAAGAACAAGAAGGTGCCCCAGCATGCATTACCC > NC_002947/4587895‑4588192 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |