| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | NC_002947 | = 4601464 | 90 (1.020) | coding (474/633 nt) | PP_4073 | hypothetical protein | |||||
Only 100 of 117 total aligned reads displayed.
GCCTCGACATCAGCTACCAGCGACATGTCTTGCGAGCCTCGTCGATAAGCGGGTCCAGCCCCTGAGCGTCAAAAACGAGTCCATCAACGGCAGGGTTGTCGCTCTCTACGTGAATGCGATGGGCCCCGATCAATTGCTTGATCTGCTCGATACCCGGCAGGCCTCTGCCGGCGTCGAGCACTTGGCCGTTTTCCATCACTTGCCACGGTGTGGGTACAGTAGCGCCCCGCTCCCCTCTCAACCGCACCTGCACTCGGCTGGCATCGACGGGTTGGGCGGTGACCAGTTGCAACCTCGAG > NC_002947/4601292‑4601590 | gcCTCGACATCAGCTACCAGCGACATGTCTTGCGAGCCTCGTCGATAAGCGGGTCCAGCCCCTGAGCGTCAAAAACGAGTCCATCAACGGCAGGGTTGTCGCTCTCTACGTGAATGCGATGGGCCCCGATCAATTGCTTGATCTGCTCGA < 2:2233979‑M1/150‑1 (MQ=255)gcCTCGACATCAGCTACCAGCGACATGTCTTGCGAGCCTCGTCGATAAGCGGGTCCAGCCCCTGAGCGTCAAAAACGAGTCCATCAACGGCAGGGTTGTCGCTCTCTACGTGAATGCGATGGGCCCCGATCAATTGCTTGATCTGCTCGA > 1:880007‑M1/1‑150 (MQ=255) cTCGACATCAGCTACCAGCGACATGTCTTGCGAGCCTCGTCGATAAGCGGGTCCAGCCCCTGAGCGTCAAAAACGAGTCCCTCAACGGCAGGGTTGTCGCTCTCTACGTGAATGCGATGGGCCCCGATCAATTGCTTGATCTGCTCGAtg > 1:1164537/1‑149 (MQ=255) tCGACATCAGCTACCAGCGACATGTCTTGCGAGCCTCGTCGATAAGCGGGTCCAGCCCCTGAGCGTCAAAAACGAGTCCATCAACGGCAGGGTTGTCGCTCTCTACGTGAATGCGATGGGCCCGGATCAATTGCTTGATCTGCTCGATAc > 2:496962/1‑150 (MQ=255) cGACATCAGCTACCAGCGACATGTCTTGCGAGCCTCGTCGATAAGCGGGTCCAGCCCCTGAGCGTCAAAAACGAGTCCATCAACGGCAGGGTTGTCGCTCTCTACGTGAATGCGATGGGCCCCGATCAATTGCTTGATCTGCTCGATAcc < 1:1095665/150‑1 (MQ=255) cGACATCAGCTACCAGCGACATGTCTTGCGAGCCTCGTCGATAAGCGGGTCCAGCCCCTGAGCGTCAAAAACGAGTCCATCAACGGCAGGGTTGTCGCTCTCTACGTGAATGCGATGGGCCCCGATCAATTGCTTGATCTGCTCGATAcc < 2:505249/150‑1 (MQ=255) gACATCAGCTACCAGCGACATGTCTTGCGAGCCTCGTCGATAAGCGGGTCCAGCCCCTGAGCGTCAAAAACGAGTCCATCAACGGCAGGGTTGTCGCTCTCTACGTGAATGCGATGGGCCCCGATCAATTGCTTGATCTGCTCGATAccc < 1:937077/150‑1 (MQ=255) aTCAGCTACCAGCGACATGTCTTGCGAGCCTCGTCGATAAGCGGGTCCAGCCCCTGAGCGTCAAAAACGAGTCCATCAACGGCAGGGTTGTCGCTCTCTACGTGAATGCGATGGGCCCCGATCAATTGCTTGATCTGCTCGATACCCGGc > 1:2347919/1‑150 (MQ=255) tCAGCTACCAGCGACATGTCTTGCGAGCCTCGTCGATAAGCGGGTCCAGCCCCTGAGCGTCAAAAACGAGTCCATCAACGGCAGGGTTGTCGCTCTCTACGTGAATGCGATGGGCCCCGATCAATTGCTTGATCTGCTCGATACCCGGCa > 1:1703657/1‑150 (MQ=255) tACCAGCGACATGTCTTGCGAGCCTCGTCGATAAGCGGGTCCAGCCCCTGAGCGTCAAAAACGAGTCCATCAACGGCAGGGTTGTCGCTCTCTACGTGAATGCGATGGGCCCCGATCAATTGCTTGATCTGCTCGATACCCGGCAGGCct > 2:772387/1‑150 (MQ=255) cAGCGACATGTCTTGCGAGCCTCGTCGATAAGCGGGTCCAGCCCCTGAGCGTCAAAAACGAGTCCATCAACGGCAGGGTTGTCGCTCTCTACGTGAATGCGATGGGCCCCGATCAATTGCTTGATCTGCTCGATACCCGGCAGGc > 1:681784/1‑145 (MQ=255) cAGCGACATGTCTTGCGAGCCTCGTCGATAAGCGGGTCCAGCCCCTGAGCGTCAAAAACGAGTCCATCAACGGCAGGGTTGTCGCTCTCTACGTGAATGCGATGGGCCCCGATCAATTGCTTGATCTGCTCGATACCCGGCAGGc < 2:681784/145‑1 (MQ=255) gCGACATGTCTTGCGAGCCTCGTCGATACGCGGGCCCAGCCCCTGAGCGTCAAAAGCGAGTCAATCAACGGCAGGGTCGTCGCTCTCTACGTGAATGCGCTGGGCCCCGATCAATTGCTTGATCTGCTCGATACCCGGCAGGCCTCTGcc > 2:729464/1‑150 (MQ=255) 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2:902953‑M1/150‑147 (MQ=255) tCGATACCCGGCAGGCCTCTGCCGGCGtcgagcagatcaagcaattgattgagtcccatcgcattcacgtagagagcgacaaccctgccgttgatggactcgtttttgacgctcaggggctggacccgcttatcgacgaggctcgcaaga < 1:298719‑M2/150‑124 (MQ=255) tCGATACCCGGCAGGCCTCTGCCGGCGTCGAGCACTTGGCCGTTTTCCATCACTTGCCACGGTGTGGGTACAGTAGCGCCCCGCTCCCCTCTCAACCGCACCTGCACTCGGCTGGCATCGACGGGTTGGGCGGTGACCAGTTGCAACCTc > 1:1866205/1‑150 (MQ=255) tCGATACCCGGCAGGCCTCTGCCGACGTCGAGCACTTGGCCGTTTTCCATCACTTGCCACGGTGTGGGTACAGTAGCGCCCCGCTCCCCTCTCAACCGCACCTGCACTCGGCTGGCATCGACGGGTTGGGCGGTGACCAGTTGCAACCTc > 2:1625151/1‑150 (MQ=255) gATACCCGGCAGGCCTCTGCCGGCGTCGAGCACTTGGCCGTTTTCCATCACTTGCCACGGTGTGGGTACAGTAGCGCCCCGCTCCCCTCTCAACCGCACCTGCACTCGGCTGGCATCGACGGGTTGGGCGGTGACCAGTTGCAACCTCga < 1:1450990/150‑1 (MQ=255) gATACCCGGCAGGCCTCTGCCGGCGTCGAGCACTTGGCCGTTTTCCATCACTTGCCACGGTGTGGGTACAGTAGCGCCCCGCTCCCCTCTCAACCGCACCTGCACTCGGCTGGCATCGACGGGTTGGGCGGTGACCAGTTGCAACCTCga > 2:1493264/1‑150 (MQ=255) gATACCCGGCAGGCCTCTGCCGGCGTCGAGCACTTGGCCGTTTTCCATCACTTGCCACGGTGTGGGTACAGTAGCGCCCCGCTCCCCTCTCAACCGCACCTGCACTCGGCTGGCATCGACGGGTTGGGCGGTGACCAGTTGCAACCTCga < 1:17508/150‑1 (MQ=255) gATACCCGGCAGGCCTCTGCCGGCGTCGAGCACTTGGCCGTTTTCCATCACTTGCCACGGTGTGGGTACAGTAGCGCCCCGCTCCCCTCTCAACCGCACCTGCACTCGGCTGGCATCGACGGGTTGGGCGGTGACCAGTTGCAACCTCga < 1:902953/150‑1 (MQ=255) gATACCCGGCAGGCCTCTGCCGGCGTCGAGCACTTGGCCGTTTTCCATCACTTGCCACGGTGTGGGTACAGTAGCGCCCCGCTCCCCTCTCAACCGCACCTGCACTCGGCTGGCATCGACGGGTTGGGCGGTGACCAGTTGCAACCTCga > 1:1184802/1‑150 (MQ=255) acgccggcagaggcctgccgggtatcgagcagatcaagcaattgatcggggcccatcgcattcacgtagagagcgacaaccctgccgttgatggactcgtttttgacgcccaggggctggacccgcttatcgacgaggctcgcaagacat > 2:2228316‑M1/1‑1 (MQ=255) | GCCTCGACATCAGCTACCAGCGACATGTCTTGCGAGCCTCGTCGATAAGCGGGTCCAGCCCCTGAGCGTCAAAAACGAGTCCATCAACGGCAGGGTTGTCGCTCTCTACGTGAATGCGATGGGCCCCGATCAATTGCTTGATCTGCTCGATACCCGGCAGGCCTCTGCCGGCGTCGAGCACTTGGCCGTTTTCCATCACTTGCCACGGTGTGGGTACAGTAGCGCCCCGCTCCCCTCTCAACCGCACCTGCACTCGGCTGGCATCGACGGGTTGGGCGGTGACCAGTTGCAACCTCGAG > NC_002947/4601292‑4601590 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |