| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_002947 | 4861173 = | 61 (0.650) | 10 (0.130) | 7/200 | NT | 16.8% | intergenic (‑79/+158) | ligA/PP_4275 | DNA ligase/cell division protein ZipA |
| ? | NC_002947 | 4861264 = | 50 (0.670) | intergenic (‑170/+67) | ligA/PP_4275 | DNA ligase/cell division protein ZipA | |||||
Only 100 of 168 total aligned reads displayed.
GCACGTAGTAGCGATAATTGTGCTGATCGAGCTCGGCACGCAGTTCGAGGATACGGGTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTC‑T‑GTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTC > NC_002947/4861025‑4861322 | gCACGTAGTAGCGATAATTGTGCTGATCGAGCTCGGCACGCAGTTCGAGGATACGGGTTTAGGCGGTTTTGGGAGTCGTCCCCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGCTCCAGGTGTC‑T‑GTTGACTGTGCCAGC < 1:168095‑M1/150‑1 (MQ=255) aCGTAGTAGCGATAATTGTGCTGATCGAGCTCGGCACGCAGTTCGAGGATACGGGTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTC‑T‑GTTGACTGTGCCAGCCT < 1:1785864‑M1/150‑1 (MQ=255) ctgaccgcccagaccatcgagcactaccgccagcgtatcgtcgagttcgagcgccgtgcgctaacccagaagcgctgacagatccagacgaaagagcagcctgagggcgtgctggccggttcgggtatcgtcgttgcctgtgccgGCctc < 1:1099867‑M1/5‑1 (MQ=255) tgaccgcccagaccatcgagcactaccgccagcgtatcgtcgagttcgagcgccgtgcgctaacccagaagcgctgacagatccagacgaaagagcagcctgagggcgtgctggccggttcgggtatcgtcgttgcctgtgccgGCctct < 1:2144156‑M1/6‑1 (MQ=255) tagCGATAATTGTGCTGATCGAGCTCGGCACGCAGTTCGAGGATACGGGTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTC‑T‑GTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGC > 1:2108429‑M1/1‑150 (MQ=255) cgcccagaccatcgagcactaccgccagcgtatcgtcgagttcgagcgccgtgcgctaacccagaagcgctgacagatccagacgaaagagcagcctgagggcgtgctggccggtttgggtatcgtcgttgcctgtgccgGCCTCTTcgc < 2:1637429‑M1/10‑1 (MQ=255) cccagaccatcgagcactacctccagcgtatcgtcgagttcgagcgccgtgcgctaacccagacgcgctgacagatccagacgaaagagcagcctgagggcgtgctggccggttcgggtatcgtcgttgcctgtgccgGCCTCTTCGCgg > 1:806567‑M1/139‑150 (MQ=255) cccagaccatcgagcactaccgccagcgtatcgtcgagttcgagcgccgtgcgctaacccagaagcgctgacagatccaggcgaaagagcagcctgagggcgtgctggccggttcgggtatcgtcgttgcctgtgccgGCCTCTTCGCgg < 1:1802213‑M1/12‑1 (MQ=255) cccagaccatcgagcactaccgccagcgtatcgtcgagttcgagcgccgtgcgctaacccagaagcgctgacagatccagacgaaagagcagcctgagggcgtgctggccggttcgggtatcgtcgttgcctgtgccgGCCTCTTCGCgg > 1:1246993‑M1/139‑150 (MQ=255) cccagaccatcgagcactaccgccagcgtatcgtcgagttcgagcgccgtgcgctaacccagaagcgctgacagatccagacgaaagagcagcctgagggcgtgctggccggttcgggtatcgtcgttgcctgtgccgGCCTCTTCGCgg > 2:200562‑M1/139‑150 (MQ=255) ccagaccatcgagcactaccgccagcgtatcgtcgagttcgagcgccgtgcgctaacccagaagcgctgacagatccagacgaaagagcagcctgagggcgtgctggccggttcgggtatcgtcgttgcctgtgccgGCCTCTTCGCggg < 2:167872‑M1/13‑1 (MQ=255) ccagaccatcgagcactaccgccagcgtatcgtcgagttcgagcgccgtgcgctaacccagaagcgctgacagatccagacgaaagagcagcctgagggcgtgctggccggttcgggtatcgtcgttgcctgtgccgGCCTCTTCGCggg < 1:1065648‑M1/13‑1 (MQ=255) ccagaccatcgagcactaccgccagcgtatcgtcgagttcgagcgccgtgcgctaacccagaagcgctgacagatccagacgaaagagcagcctgagggcgtgctggccggttcggggatcggcggtgcctgtgccgGCATCTTCGCggg < 2:391966‑M1/13‑1 (MQ=255) 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t‑GTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGCAGCGGGTATACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAg > 1:877413/1‑150 (MQ=255) gTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCtacaggtacatcaccgccctagggcatgtgacgcccttgtgggagcgg < 2:2256856‑M1/86‑49 (MQ=255) gTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCtacaggtacatcaccgccctagggcatgtgacgcccttgtgggagcgg > 1:2256856‑M1/1‑38 (MQ=255) gTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAgg > 2:2144156/1‑150 (MQ=255) ttGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAggagcggg > 2:250232‑M2/1‑78 (MQ=255) ttGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAggagcggg < 1:250232‑M2/86‑9 (MQ=255) ccAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTCGGCGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACCGGCAACGACGATACCCGACCCGGCCAGCACGCCCTCCGGCTGCTCTTTc > 2:71776/1‑150 (MQ=39) ccAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTc < 2:1015700/150‑1 (MQ=255) ccAGCCCCTTCGCGGGAACACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACACGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCtttt < 2:1308603/150‑2 (MQ=255) cAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGGTACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCg > 1:391966/1‑150 (MQ=255) cAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCg > 2:1931695/1‑150 (MQ=255) gCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCtacaggtacatcaccgccctagggcatgtgacgcccttgtgggagcgggtttacccgcgaagaggctggcacagtcaacagacacctggaaccccacgcaccaccccaagctgctcttttgcttt < 1:2077255‑M1/150‑126 (MQ=255) gCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCtacaggtacatcaccgccctagggcatgtgacgcccttgtgggagcggggttacccgcgaagaggctggcccagtcaacagacacctggaaccccacgcaccaccccaagctgctcttttgcttt > 2:1805145‑M1/1‑25 (MQ=255) GCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTc < 1:471997‑M1/150‑1 (MQ=255) | GCACGTAGTAGCGATAATTGTGCTGATCGAGCTCGGCACGCAGTTCGAGGATACGGGTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTC‑T‑GTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTC > NC_002947/4861025‑4861322 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |