New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_002947 | 4920849 = | 101 (1.080) | 6 (0.070) | 5/238 | NT | 5.9% | coding (1213/2682 nt) | PP_4330 | toxin‑like protein |
? | NC_002947 | 4920867 = | 94 (1.060) | coding (1231/2682 nt) | PP_4330 | toxin‑like protein |
Only 100 of 120 total aligned reads displayed.
GCTATGACGATGCCGATTTTGTCATCACCACCGACAGCCAGGTTACCAAAGCCAAATGGCGAGGCTACCTCACCAATACGCTCAACCTGCTAGCGCCACTGTGCCTGGTGGTGCCGGGGCTGGCGCCACTGCTGGCGCTCGGTGGCATTGCCCAGTTGGGCCTGGGCCTGGATCAGGTGATCAACGGCCACAGCCTGAAAGCCAAACAGGAGGGGGTGGGCGACATCGCCTGGGGGCTGTTCAACGCCGTACCGCTGGCAACGGAGGGCACAGCAGGCATCAAGGCCCTGTTCGA > NC_002947/4920700‑4920994 | acaaaaccgtcgcttttgaactcgaacagggccttgatgcctgctgtgccctccgttgccagcggtacggcgttgaacagcccccaggcgatgtcgcccaccccctcctgtttggctttcaggctgtggccgttgatcacctgatccagg < 2:20248‑M1/1‑1 (MQ=255) tATGACGATGCCGATTTTGTCATCACCACCGACAGCCAGGTTACCAAAGCCAAATGGCGAGGCTACCTCACCAATACGCTCAACCTGCTAGCGCCACTGTGCCTGGTGGTGCCGGGGCTGGCGCCACTGCTGGCGCTCGGTGGCATTGcc < 1:502684/150‑1 (MQ=255) aaccgtcgcttttgaactcgaacagggccttgatgcctgctgtgccctccgttgccagcggtacggcgttgaacagcccccaggcgatgtcgcccaccccctcctgtttggctttcaggctgtggccgttgatcacctgatccagGCCCa < 2:434524‑M1/5‑1 (MQ=255) cGATGCCGATTTTGTCATCACCACCGACAGCCAGGTTACCAAAGCCAAATGGCGAGGCTACCTCACCAATACGCTCAACCTGCTAGCGCCACTGTGCCTGGTGGTGCCGGGGCTGGCGCCACTGCTGGCGCTCGGTGGCATTGCCCAGtt < 2:978504/150‑1 (MQ=255) tGCCGATTTTGTCATCACCACCGACAGCCAGGTTACCAAAGCCAAATGGCGAGGCTACCTCACCAATACGCTCAACCTGCTAGCGCCACTGTGCCTGGTGGTGCCGGGGCTGGCGCCACTGCTGGCGCTCGGTGGCATTGCCCa < 1:1625183/144‑1 (MQ=255) tGCCGATTTTGTCATCACCACCGACAGCCAGGTTACCAAAGCCAAATGGCGAGGCTACCTCACCAATACGCTCAACCTGCTAGCGCCACTGTGCCTGGTGGTGCCGGGGCTGGCGCCACTGCTGGCGCTCGGTGGCATTGCCCa > 2:1625183/1‑144 (MQ=255) gCCGATTTTGTCATCACCACCGACAGCCAGGTTACCAAAGCCAAATGGCGAGGCTACCTCACCAATACGCTCAACCTGCTAGCGCCACTGTGCCTGGTGGTGCCGGGGCTGGCGCCACTGCTGGCGCTCGGTGGCATTGCCCAGTtgggc > 1:1528884/1‑150 (MQ=255) tcgaacagggccttgatgcctgctgtgccctccgttgccagcggtacggcgttgaacagcccccaggcgatgtcgcccaccccctcctgtttggctttcaggctgtggccgttgatcacctgatccagGCCCAGTTgggcctgggcct < 2:77536‑M1/20‑1 (MQ=255) tcgaacagggccttgatgcctgctgtgccctccgttgccagcggtacggcgttgaacagcccccaggcgatgtcgcccaccccctcctgtttggctttcaggctgtggccgttgatcacctgatccagGCCCAGTTgggcctgggcct > 1:77536‑M1/129‑148 (MQ=255) tcatcaCCACCGACAGCCAGGTTACCAAAGCCAAATGGCGAGGCTACCTCACCAATACGCTCAACCTGCTAGCGCCACTGTGCCTGGTGGTGCCGGGGCTGGCGCCACTGCTGGCGCTCGGTGGCATTGCCCAGTtggg > 1:485290/1‑139 (MQ=255) atcaCCACCGACAGCCAGGTTACCAAAGCCAAATGGCGAGGCTACCTCACCAATACGCTCAACCTGCTAGCGCCACTGTGCCTGGTGGTGCCGGGGCTGGCGCCACTGCTGGCGCTCGGTGGCATTGCCCAGTTGGGCCTGGGCCTGGAt < 2:850888/150‑1 (MQ=255) tcaCCACCGACAGCCAGGTTACCAAAGCCAAATGGCGCGGCTACCTCACCAATACGCTCAACCTGCTAGCGCCGCTGTGCCTGCTGGTGCCGGGGCTGGCGCCACTGCTGGCGCTCGGTGGCCTTGCCCAGGTGGGCCTGGGCCTGGATc > 2:794763/1‑150 (MQ=255) tcaCCACCGACAGCCAGGTTACCAAAGCCAAATGGCGAGGCTACCTCACCAATACGCTCAACCTGCTAGCGCCACTGTGCCTGGTGGTGCCGGGGCTGGCGCCACTGCTGGCGCTCGGTGGCATTGCCCAGTTGGGCCTGGGCCTGGATc > 1:314593/1‑150 (MQ=255) cGACAGCCAGGTTACCAAAGCCAAATGGCGAGGCTACCTCACCAATACGCTCAACCTGCTAGCGCCACTGTGCCTGGTGGTGCCGGGGCTGGCGCCACTGCTGGCGCTCGGTGGCATTGCCCAGTtgggcctgg < 1:675564/134‑1 (MQ=255) cGACAGCCAGGTTACCAAAGCCAAATGGCGAGGCTACCTCACCAATACGCTCAACCTGCTAGCGCCACTGTGCCTGGTGGTGCCGGGGCTGGCGCCACTGCTGGCGCTCGGTGGCATTGCCCAGTtgggcctgg > 2:675564/1‑134 (MQ=255) cGACAGCCAGGTTACCAAAGCCAAATGGCGAGGCTACCTCACCAATACGCTCAACCTGCTAGCGCCACTGTGCCTGGTGGTGCCGGGGCTGGCGCCACTGCTGGCGCTCGGTGGCATTGCCCAGTTGGGCCTGGGCCTGGATCAGGTGAt < 1:551985/150‑1 (MQ=255) aGCCAGGTTACCAAAGCCAAATGGCGAGGCTACCTCACCAATACGCTCAACCTGCTAGCGCCACTGTGCCTGGTGGTGCCGGGGCTGGCGCCACTGCTGGCGCTCGGTGGCATTGCCCAGTTGGGCCTGGGCCTGGATCAGGTGATCAAc > 2:396138/1‑150 (MQ=255) aGCCAGGTTACCAAAGCCAAATGGCGAGGCTACCTCACCAATACGCTCAACCTGCTAGCGCCACTGTGCCTGGTGGTGCCGGGGCTGGCGCCACTGCTGGCGCTCGGTGGCATTGCCCAGTTGGGCCTGGGCCTGGATCAGGTGATCAAc < 2:347406/150‑1 (MQ=255) 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gCTACCTCACCAATACGCTCAACCTGCTAGCGCCACTGTGCCTGGTGGTGCCGGGGCTGGCGCCACTGCTGGCGCTCGGTGGCATTGCCCAGTTGGGCCTGGGCCTGGATCAGGTGATCAACGGCCACAGCCTGAAAGCCAAACaggagg < 1:1064899/150‑1 (MQ=255) tACCTCACCAATACGCTCAACCTGCTAGCGCCACTGTGCCTGGTGGTGCCGGGGCTGGCGCCACTGCTGGCGCTCGGTGGCATTGCCCAGTTGGGCCTGGGCCTGGATCAGGTGATCAACGGCCACAGCCTGAAAGCCAAACAGGAgggg < 2:1524594/150‑1 (MQ=255) ccTCACCAATACGCTCAACCTGCTAGCGCCACTGTGCCTGGTGGTGCCGGGGCTGGCGCCACTGCTGGCGCTCGGTGGCATTGCCCAGTTGGGCCTGGGCCTGGATCAGGTGATCAACGGCCACAGCCTGAAAGCCAAACAGGAGGGGGt > 2:2392002/1‑150 (MQ=255) tCACCAATCCGCTCAACCTGCTAGCGCCACTGTGCCTGGTGGTGCCGGGGCTGGCGCCACTGCTGGCGCTCGGTGGCATTGCCCAGTTGGGCCTGGGCCTGGATCAGGTGATCAACGGCCACAGCCTGAAAGCCAAACAGGAGGGGGTgg > 1:804757/1‑150 (MQ=255) cACCAATACGCTCAACCTGCTAGCGCCACTGTGCCTGGTGGTGCCGGGGCTGGCGCCACTGCTGGCGCTCGGTGGCATTGCCCAGTTGGGCCTGGGCCTGGATCAGGTGATCAACGGCCACAGCCTGAAAGCCAAACAGGAGGGGGTggg > 1:20248/1‑150 (MQ=255) 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gCTGGCGCCACTGCTGGCGCTCGGTGGCATTGCCCAGTTGGGCCTGGGCCTGGATCAGGTGATCAACGGCCACAGCCTGAATGCCAAACAGGAGGGGGTGGGCGACATCGCCTGGGGGCTGTTCAACGCCGTACCGCTGGCAACGGAggg < 2:1374796/150‑1 (MQ=255) gcgcCACTGCTGGCGCTCGGTGGCATTGCCCAGTTGGGCCTGGGCCTGGATCAGGTGATCAACGGCCACAGCCTGAAAGCCAAACAGGAGGGGGTGGGCGACATCGCCTGGGGGCTGTTCAACGCCGTACCGCTGGCAACGGAGGGcaca > 1:2188083/1‑150 (MQ=255) gcCACTGCTGGCGCTCGGTGGCATTGCCCAGTTGGGACTAGGCCTGGATCAGGTGATCAACGGCCACAGCCTGAAAGCCAAACAGGAGGGGGTGGGCGACATCGCCTGGGGGCTGTTCAACGCCGTACCGCTGGCAACGGAGGGCAcagc > 1:2132971/1‑150 (MQ=255) ggctgGCCCTCGGTGGCATTGCCCAGTTGGGCCTGGGCCTGGATCAGGTGATCAACGGCCACAGCCTGAAAGCCAAACAGGAGGGGGTGGGCGACATCGCCTGGGGGCTGTTCAACGCCGTACCGCTGGCAACGGAGGGCACAGCAGGCa < 1:949591/149‑1 (MQ=255) cgttgatcacctgatccagGCCCAGGCCCAACTGGGCCTGGATCAGGTGATCAACGGCCACAGCCTGAAAGCCAAACAGGAGGGGGTGGGCGACATCGCCTGGGGGCTGTTCAACGCCGTACCGCTgg < 2:2078788‑M1/109‑1 (MQ=255) cgttgatcacctgatccagGCCCAGGCCCAACTGGGCCTGGATCAGGTGATCAACGGCCACAGCCTGAAAGCCAAACAGGAGGGGGTGGGCGACATCGCCTGGGGGCTGTTCAACGCCGTACCGCTgg > 1:2078788‑M1/20‑128 (MQ=255) cgttgatcacctgatccagGCCCAGGCCCAACTGGGCCTGGATCAGGTGATCAACGGCCACAGCCTGAAAGCCAAACAGGAGGGGGTGGGCGACATCGCCTGGGGGCTGTTCAACGCCGTACCGCTGGCAACGGAggg > 2:1402190‑M1/20‑138 (MQ=255) cgttgatcacctgatccagGCCCAGGCCCAACTGGGCCTGGATCAGGTGATCAACGGCCACAGCCTGAAAGCCAAACAGGAGGGGGTGGGCGACATCGCCTGGGGGCTGTTCAACGCCGTACCGCTGGCAACGGAggg < 1:1402190‑M1/119‑1 (MQ=255) tgGCGCTCGGTGGCATTGCCCAGTTGGGCCTGGGCCTGGATCAGGTGATCAACGGCCACAGCCTGAAAGCCAAACAGGAGGGGGTGGGCGACATCGCCTGGGGGCTGTTCAACGCCGTACCGCTGGCAACGGAGGGCACAGCAGGCATCa > 2:2068985/1‑150 (MQ=255) gcgcTCGGTGGCATTGCCCAGTTGGGCCTGGGCCTGGATCAGGTGATCAACGGCCACAGCCTGAAAGCCAAACAGGAGGGGGTGGGCGACATCGCCTGGGGGCTGTTCAACGCCGTACCGCTGGCAACGGAGGGCACAGCAGGCATCAAg < 2:804757/150‑1 (MQ=255) gcgcTCGGTGGCATTGCCCAGTTGGGCCTGGGCCTGGATCAGGTGATCAACGGCCACAGCCTGAAAGCCAAACAGGAGGGGGTGGGCGACATCGCCTGGGGGCTGTTCAACGCCGTACCGCTGGCAACGGAGGGCACAGCAGGCATCAAg > 1:1799227/1‑150 (MQ=255) gcTCGGTGGCATTGCCCAGTTGGGCCTGGGCCTGGATCAGGTGATCAACGGCCACAGCCTGAAAGCCAAACAGGAGGGGGTGGGCGACATCGCCTGGGGGCTGTTCAACGCCGTACCGCTGGCAACGGAGGGCACAGCAGGCATCAAGGc > 1:1585065/1‑150 (MQ=255) ggTGGCATTGCCCAGTTGGGCCTGGGCCTGGATCAGGTGATCAACGGCCACAGCCTGAAAGCCAAACAGGAGGGGGTGGGCGACATCGCCTGGGGGCTGTTCAACGCCGTACCGCTGGCAACGGAGGGCACAGCAGGCATCAAGGCCCTg > 2:1118573/1‑150 (MQ=255) tGGCATTGCCCAGTTGGGCCTGGGCCTGGATCAGGTGATCAACGGCCACAGCCTGAAAGCCAAACAGGAGGGGGTGGGCGACATCGCCTGGGGGCTGTTCAACGCCGTACCGCTGGCAACGGAGGGCACAGCAGGCATCAAGGCCCTGtt > 1:705086/1‑150 (MQ=255) ggCATTGCCCAGTTGGGCCTGGGCCTGGATCAGGTGATCAACGGCCACAGCCTGAAAGCCAAACAGGAGGGGGTGGGCGACATCGCCTGGGGGCTGTTCAACGCCGTACCGCt < 1:2052083/113‑1 (MQ=255) ggCATTGCCCAGTTGGGCCTGGGCCTGGATCAGGTGATCAACGGCCACAGCCTGAAAGCCAAACAGGAGGGGGTGGGCGACATCGCCTGGGGGCTGTTCAACGCCGTACCGCt > 2:2052083/1‑113 (MQ=255) gCATTGCCCAGTTGGGCCGGGGCCTGGATCAGGTGATCAACGGCCACAGCCTGAAAGCCAAACAGGAGGGGGGGGGCGACATCGCCTGGGGGCTGTTCAACGCCGTACCGCTGGCAACGGAGGGCACAGCAGGCATCAAGGCCCTGTTCg > 2:695295/1‑150 (MQ=255) cATTGGCCAGGTGGGCCTGGGCCTGGATCAGGGGACCAACGGCCACGGCCGGAAAGCCAAACAGGAGGGGGTGGGCGACATCGCCTGGGGGCTGTTCAACGCCGTACCGCTGGCAACGGAGGGCACAGCAGGCATCAAGGCCCTGTTCGa < 2:1007945/150‑1 (MQ=255) cATTGCCCAGTTGGGCCTGGGCCTGGATCAGGTGATCAACGGCCACAGCCTGAAAGCCAAACAGGAGGGGGTGGGCGACATCGCCTGGGGGCTGTTCAACGCCGTACCGCTGGCAACGGAGGGCACAGCAGGCATCAAGGCCCTGTTCGa < 1:2308967/150‑1 (MQ=255) cATTGCCCAGTTGGGCCTGGGCCTGGATCAGGTGATCAACGGCCACAGCCTGAAAGCCAAACAGGAGGGGGTGGGCGACATCGCCTGGGGGCTGTTCAACGCCGTACCGCTGGCAACGGAGGGCACAGCAGGCATCAAGGCCCTGTTCGa < 1:873921/150‑1 (MQ=255) cATTGCCCAGTTGGGCCTGGGCCTGGATCAGGTGATCAACGGCCACAGCCTGAAAGCCAAACAGGAGGGGGTGGGCGACATCGCCTGGGGGCTGTTCAACGCCGTACCGCTGGCAACGGAGGGCACAGCAGGCATCAAGGCCCTGTTCGa < 2:1861765/150‑1 (MQ=255) aTTGCCCAGTTGGGCCTGGGCCTGGATCAGGTGATCAACGGCCACAGCCTGAAAGCCAAACAGGAGGGGGTGGGCGACATCGCCTGGGGGCTGTTCAACGCCGTACCGCTGGCAACGGAggg > 2:766595/1‑122 (MQ=255) | GCTATGACGATGCCGATTTTGTCATCACCACCGACAGCCAGGTTACCAAAGCCAAATGGCGAGGCTACCTCACCAATACGCTCAACCTGCTAGCGCCACTGTGCCTGGTGGTGCCGGGGCTGGCGCCACTGCTGGCGCTCGGTGGCATTGCCCAGTTGGGCCTGGGCCTGGATCAGGTGATCAACGGCCACAGCCTGAAAGCCAAACAGGAGGGGGTGGGCGACATCGCCTGGGGGCTGTTCAACGCCGTACCGCTGGCAACGGAGGGCACAGCAGGCATCAAGGCCCTGTTCGA > NC_002947/4920700‑4920994 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |