New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_002947 | 5544518 = | 77 (0.830) | 9 (0.100) | 6/240 | NT | 10.1% | coding (391/426 nt) | rpsF | 30S ribosomal protein S6 |
? | NC_002947 | 5544547 = | 86 (0.960) | coding (362/426 nt) | rpsF | 30S ribosomal protein S6 |
GGTGTTGAGATCTTTGAAGTCGATCTCTTTCACGTCTTCAGCAGTGAAGCGGCAGAATTTACGACGACGGAAGAAACGTGCCATTTAATAGGCTCCTCTAAAGGTCCGTGGATTACTCGTCAGCGTTATCGCTG‑GAGTCGCTGTCATTGCTGTCGTCGCCTTCGGCGGAGTCAGCATGCTCAGGACGCTCGCGACGCTCACGGCGCTCGCTGCGGTTCTCTTCAGCCTTCAGCATCTCGGACTGGCCGGTAACGGCTTCGTCGCGACGGATGACCAGGTTACGGATAACGGCA > NC_002947/5544371‑5544663 | ccgagctggaagacaacttccgctacaacgatgccgttatccgtaacctggtcatccgtcgcgacgaagccgttaccggccagtccgagatgctgaaggctgaagagaaccgcagcgagcgccgtgagcgtcgcgagcgtcctgagcaTg < 2:1947991‑M1/2‑1 (MQ=255) gtgtTGAGATCTTTGAAGTCGATCTCTTTCACGTCTTCAGCAGTGAAGCGGCAGAATTTACGACGACGGAAGAAACGTGCCATTTAATAGGCTCCTCTAAAGGTCCGTGGATTACTCGTCAGCGTTATCGCTG‑GAGTCGCTGTCATTGCt < 2:1551951/150‑1 (MQ=255) gagctggaagacaacttccgctacaacgatgccgttatccgtaacctggtcatccgtcgcgacgaagccgttaccggccagtccgagatgctgaaggctgaagagaaccgcagcgagcgccgtgagcgtcgcgagcgtcctgagcaTGCt > 1:1632895‑M1/147‑150 (MQ=255) 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aGTCGATCTCTTTCACGTCTTCAGCAGTGAAGCGGCAGAATTTACGACGACGGAAGAAACGTGCCATTTAATAGGCTCCTCTAAAGGTCCGTGGATTACTCGTCAGCGTTATCGCTG‑GAGTCGCTGTCATTGCTGTCGTCGCCTTcggcg < 2:2323258/150‑1 (MQ=255) aGTCGATCTCTTTCACGTCTTCAGCAGTGAAGCGGCAGAATTTACGACGACGGAAGAAACGTGCCATTTAATAGGCTCCTCTAAAGGTCCGTGGATTACTCGTCAGCGTTATCGCTG‑GAGTCGCTGTCATTGCTGTCGTCGCCTTcggcg < 1:1549298/150‑1 (MQ=255) tCGATCTCTTTCACGTCTTCGGCAGTGAAGCGGCAGAATATACGACGACGGAAGAAACGTGCCATTTAATAGGCTCCTCTAAAGGTCCGTGGATTACTCGTCAGCGTTATCGCTG‑GAGTCGCTGTCATTGCTGTCGTCGCCTTCGGCGGa < 2:1300757/150‑1 (MQ=255) tCGATCTCTTTCACGTCTTCAGCAGTGAAGCGGCAGAATTTACGACGACGGAAGAAACGTGCCATTTAATAGGCTCCTCTAAAGGTCCGTGGATTACTCGTCAGCGTTATCGCTG‑GAGTCGCTGTCTTTGCTGTCGTCGCCTTCGGCGGa < 2:1196637/150‑1 (MQ=255) gATCTCTTTCACGTCTTCAGCAGTGAAGCGGCAGAATTTACGACGACGGAAGAAACGTGCCATTTAATAGGCTCCTCTAAAGGTCCGTGGATTACTCGTCAGCGTTAT‑GCTATTAGGCGCTGTCATTGCTGTCGTCGCCTTCGGCGGAGt > 1:1946447/1‑150 (MQ=255) 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gTTATCGCTG‑GAGTCGCTGTCATTGCTGTCGTCGCCTTCGGCGGAGTCAGCATGCTCAGGACGCTCGCGACGCTCACGGCGCTCGCTGCGGTTCTCTTCAGCCTTCAGCATCTCGGACTGGCCGGTAACGGCTTCGTCGCGACGGATGAc > 1:184200/1‑150 (MQ=255) aTCGCTG‑GAGTCGCTGTCATTGCTGTCGTCGCCTTCGGCGGAGTCAGCATGCTCAGGACGCTCGCGACGCTCACGGCGCTCGCTGCGGTTCTCTTCAGCCTTCAGCATCTCGGACTGGCCGGTAACGGCTTCGTCGCGACGGATGACCAg < 2:396103/150‑1 (MQ=255) tCGCTG‑GAGTCGCTGTCATTGCTGTCGTCGCCTTCGGCGGAGTCAGCATGCTCAGGACGCTCGCGACGCTCACGGCGCTCGCTGCGGTTCTCTTCAGCCTTCAGCATCTCGGACTGGCCg < 1:1820315/120‑1 (MQ=255) tCGCTG‑GAGTCGCTGTCATTGCTGTCGTCGCCTTCGGCGGAGTCAGCATGCTCAGGACGCTCGCGACGCTCACGGCGCTCGCTGCGGTTCTCTTCAGCCTTCAGCATCTCGGACTGGCCg > 2:1820315/1‑120 (MQ=255) tG‑GAGTCGCTGTCATTGCTGTCGTCGCCTTCGGCGGAGTCAGCATGCTCAGGACGCTCGCGACGCTCACGGCGCTCGCTGCGGTTCTCTTCAGCCTTCAGCATCTCGGACTGGCCGGTAACGGCTTCGTCGCGACGGATGACCAGGTTAc < 2:26946/150‑1 (MQ=255) tG‑GAGTCGCTGTCATTGCTGGCGTCGCCTTCGGCGGAGTCAGCATGCGCAGGACGCTCGCGACGCTCACGGCGCTCGCTGCGGTTCTCTTCAGCCTTCAGCATCTCGGACTGGCCGGTAACGGCTTCGTCGCGACGGATGACCAGGTTAc < 1:1070702/150‑1 (MQ=255) g‑gAGTCGCTGTCATTGCTGTCGTCGCCTTCGGCGGAGTCAGCATGCTCAGGACGCTCGCGTCGCTCGCTGCGCTGGCTGCGGTTCTCTTCAGCCTTCCGCCTCTCGGCCTGGCCGGCAACGGCTTCGTCGCGACGGATGACCAGGTTACg < 1:1750656/150‑1 (MQ=255) g‑gAGTCGCTGTCATTGCTGTCGTCGCCTTCGGCGGAGTCAGCATGCTCAGGACGCTCGCGACGCTCACGGCGCTCGCTGCGGTTCTCTTCAGCCTTCAGCATCTCGGACTGGCCGGTAACGGCTTCGTCGCGACGGATGACCAGGTTACg < 1:1468299/150‑1 (MQ=255) gAGTCGCTGTCATTGCTGTCGTCGCCTTCGGCGGAGTCAGCATGCTCAGGACGCTCGCGACGCTCACGGCGCTCGCTGCGGTTCTCTTCAGCCTTCAGCATCTCGGACTGGCCGGTAACGGCTTCGTCGCGACGGATGACCAGGTTACgg > 1:454693/1‑150 (MQ=255) tCGCTGTCATTGCTGTCGTCGCCTTCGGCGGAGTCAGCATGCTCAGGACGCTCGCGACGCTCACGGCGCTCGCTGCGGTTCTCTTCAGCCTTCAGCATCTCGGACTGGCCGGTAACGGCTTCGTCGCGACGGATGACCAGGTTACGGATa > 1:1365616/1‑150 (MQ=255) tCGCTGTCATTGCTGTCGTCGCCTTCGGCGGAGTCAGCATGCTCAGGACGCAAAAGAAGCTCACGGCGATAGTGGTAGTTCGCTGCAGCCTTCAGCATCTCGGACTGGCCGGTAACGGCTTCGTCGCGACGGATGACCAGGTTACGGATa > 1:2123098/1‑150 (MQ=255) gCTGTCATTGCTGTCGTCGCCTTCGGCGGAGTCAGCATGCTCAGGACGCTCGCGACGCTCACGGCGCTCGCTGCGGTTCTCTTCAGCCTTCAGCATCTCGGACTGGCCg < 2:2358695/109‑1 (MQ=255) gCTGTCATTGCTGTCGTCGCCTTCGGCGGAGTCAGCATGCTCAGGACGCTCGCGACGCTCACGGCGCTCGCTGCGGTTCTCTTCAGCCTTCAGCATCTCGGACTGGCCg > 1:2358695/1‑109 (MQ=255) gCTGTCATCGCTGTCGTCGCCTTCGGCGGAGTCAGCATGCTCAGGACGCTCGCGACGCTCACGGCGCTCGCTGCGGTTCTCTTCAGCCTTCAGCATCTCGGACTGGCCGGTAACGGCTTCGTCGCGACGGATGACCAGGTTACGGATAAc > 1:794643/1‑150 (MQ=255) cTGTCATTGCTGTCGTCGCCTTCGGCGGAGTCAGCATGCTCAGGACGCTCGCGACGCTCACGGCGCTCGCTGCGGTTCTCTTCAGCCTTCAGCATCTCGGACTGGCCGGTAACGGCTTCGTCGCGACGGATGACCAg < 2:2243987/137‑1 (MQ=255) cTGTCATTGCTGTCGTCGCCTTCGGCGGAGTCAGCATGCTCAGGACGCTCGCGACGCTCACGGCGCTCGCTGCGGTTCTCTTCAGCCTTCAGCATCTCGGACTGGCCGGTAACGGCTTCGTCGCGACGGATGACCAg > 1:2243987/1‑137 (MQ=255) tGTCATTGCTGTCGTCGCCTTCGGCGGAGTCAGCATGCTCAGGACGCTCGCGACGCTCACGGCGCTCGCTGCGGTTCTcttcagccttcag > 2:1836828/1‑91 (MQ=255) tGTCATTGCTGTCGTCGCCTTCGGCGGAGTCAGCATGCTCAGGACGCTCGCGACGCTCACGGCGCTCGCTGCGGTTCTcttcagccttcag < 1:1836828/91‑1 (MQ=255) tCATTGCTGTCGTCGCCTTCGGCGGAGTCAGCATGCTCAGGACGCTCGCGACGCTCACGGCGCTCGCTGCGGTTCTCTTCAGCCTTCAGCATCTCGGACTGGCCGGTAACGGCTTCGTCGCGACGGATGACCAGGTTACGGATAACGGCa > 2:293252/1‑150 (MQ=255) aTTGCTGTCGTCGCCTTCGGCGGAGTCAGCATGCTCAGGACGCTCGCGACGCTCACGGCGCTCGCTGCGGTTCTCTTCAGCCTTCAGCATCTCGGACTGGCCGGTAACGGCTTCGTCGCGACGGATGACCAGGTTACg < 2:536647/138‑1 (MQ=255) aTTGCTGTCGTCGCCTTCGGCGGAGTCAGCATGCTCAGGACGCTCGCGACGCTCACGGCGCTCGCTGCGGTTCTCTTCAGCCTTCAGCATCTCGGACTGGCCGGTAACGGCTTCGTCGCGACGGATGACCAGGTTACg > 1:536647/1‑138 (MQ=255) | GGTGTTGAGATCTTTGAAGTCGATCTCTTTCACGTCTTCAGCAGTGAAGCGGCAGAATTTACGACGACGGAAGAAACGTGCCATTTAATAGGCTCCTCTAAAGGTCCGTGGATTACTCGTCAGCGTTATCGCTG‑GAGTCGCTGTCATTGCTGTCGTCGCCTTCGGCGGAGTCAGCATGCTCAGGACGCTCGCGACGCTCACGGCGCTCGCTGCGGTTCTCTTCAGCCTTCAGCATCTCGGACTGGCCGGTAACGGCTTCGTCGCGACGGATGACCAGGTTACGGATAACGGCA > NC_002947/5544371‑5544663 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |