| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_002947 | 5943657 = | 67 (0.720) | 7 (0.090) | 6/206 | NT | 10.4% | intergenic (+9/+76) | PP_5210/PP_5211 | alcohol dehydrogenase/ChaC‑related protein |
| ? | NC_002947 | 5943722 = | 65 (0.850) | intergenic (+74/+11) | PP_5210/PP_5211 | alcohol dehydrogenase/ChaC‑related protein | |||||
Only 100 of 154 total aligned reads displayed.
CACCAGCTGTTTGCCTGGCATGCCGAGGGCAAGTTGAAGCCGCTGGTGTCGCAGACTTATCCACTGGCAGAAGCCGGGGTTGCTATCGAGAAGCTGGGGCAACGGCAGGCTGTGGGTAAGTTGGTGGTGCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTGCTCACACTTCGCGCAGATTGTGGCAACGCCTGAATCGCGCTTCCAGGTTGCGATCGGGCATCTGGTGACTGCGCA > NC_002947/5943508‑5943806 | ctggccagtgccaaggggcgttatggcaccacgcgggagtatgtcgagcagaccttgaatgcactgcgcagtcaccagatgcccgatcgcaacctggaagcgcgattcaggcgttgccacaatctgcgcgaagtgtgagcaccctgttcc < 2:471178‑M1/1‑1 (MQ=255) caGCTGTTTGCCTGGCATGCCGAGGGCAAGTTGAAGCCGCTGGTGTCGCAGACTTATCCACTGGCAGAAGCCGGGGTTGCTATCGAGAAGCTGGGGCAACGGCAGGCTGTGGGTAAGTTGGTGGTGCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGC < 1:840740‑M1/150‑1 (MQ=255) gCTGTTTGCCTGGCATGCCGAGGGCAAGTTGAAGCCGCTGGTGTCGCAGACTTATCCACTGGCAGAAGCCGGGGTTGCTATCGAGAAGCTGGGGCAACGGCAGGCTGTGGGTAAGTTGGTGGTGCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCT > 1:2000207‑M1/1‑150 (MQ=255) cagtgccaaggggcgttatggcaccacgcgggagtatgtcgagcagaccttgaatgcactgcgcagtcaccagatgcccgatcgcaacctggaagcgcgattcaggcgttgccacaatctgcgcgaagtgtgagcaacctgttcCGGCct < 1:1019225‑M1/6‑1 (MQ=255) caaggggcgttatggcaccacgcgtgagtatgtcgagcagaccttgaatgcactgcgcagtcaccagatgcccgatcgccacctggaagcgcgattccggcgttgccacaatcttctcggaggcttatcatcctgttcCGGCCTCTTcgc > 2:1207025‑M1/139‑150 (MQ=255) caaggggcgttatggcaccacgcgggagtatgtcgagcagaccttgaatgcactgcgcagtcaccagatgcccgatcgcaacctggaagcgcgattcaggcgttgccacaatctgcgcgaagtgtgagcaacctgttcCGGCCTCTTcgc < 2:2166753‑M1/12‑1 (MQ=255) caaggggcgttatggcaccacgcgggagtatgtcgagcagaccttgaatgcactgcgcagtcaccagatgcccgatcgcaacctggaagcgcgattcaggcgttgccacaatctgcgcgaagcgtgagcaacctgttcCGGCCTCTTcgc > 2:1837381‑M1/139‑150 (MQ=255) aaggggcgttatggcaccacgcgggagtatgtcgagcagaccttgaatgcactgcgcagtcaccagatgcccgatcgcaacctggaagcgcgattcaggcgttgccacaatctgcgcgaagtgtgagcaacctgttcCGGCCTCTTcgcg < 2:735543‑M1/13‑1 (MQ=255) ccTGGCCAGGCGAGGGCAAGTTGAAGCCGCTGGTGTCGCAGACTTATCCACTGGCAGAAGCCGGGGTTGCTATCGAGAAGCTGGGGGAACGGCAGGCTGTGGGTAAGTTGGTGGTGCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCGCGG < 1:100513‑M1/150‑1 (MQ=255) ccTGGCATGCCGAGGGCAAGTTGAAGCCGCTGGTGTCGCAGACTTATCCACTGGCAGAAGCCGGGGTTGCTATCGAGAAGCTGGGGCAACGGCAGGCTGTGGGTAAGTTGGTGGTGCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCGCGG > 1:1186654‑M1/1‑150 (MQ=255) ccTGGCATGCCGAGGGCAAGTTGAAGCCGCTGGTGTCGCAGACTTATCCACTGGCAGAAGCCGGGGTTGCTATCGAGAAGCTGGGGCAACGGCAGGCTGTGGGTAAGTTGGTGGTGCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCGCGG > 1:184584‑M1/1‑150 (MQ=255) ccTGGCATGCCGAGGGCAAGTTGAAGCCGCTGGTGTCGCAGACTTATCCACTGGCAGAAGCCGGGGTTGCTATCGAGAAGCTGGGGCAACGGCAGGCTGTGGGTAAGTTGGTGGTGCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCGCGG < 2:1186654‑M1/150‑1 (MQ=255) aggggcgttatggcaccacgcgggagtatgtcgagcagaccttgaatgcactgcgcagtcaccagatgcccgatcgcaacctggaagcgcgattcaggcgttgccacaatctgcgcgaagtgtgagcaacctgttcCGGCCTCTTCGCgg < 2:681617‑M1/14‑1 (MQ=255) 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(MQ=255) ggCAGGCTGTGGGTAAGTTGGTGGTGCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTGCTCACACTTCGCGCAGATTGTGGCAACGc < 2:359371/150‑1 (MQ=255) gCAGGCTGTGGGTAAGTTGGTGGTGCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTGCTCACACTTCGCGCAGATTGTGGCAACGcc < 2:1332206/150‑1 (MQ=255) tgtgGGTAAGTTGGTGGTGCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAgggtttacccgcgaagaggccg > 1:443380‑M2/1‑82 (MQ=255) tgtgGGTAAGTTGGTGGTGCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTGCTCACACTTCGCGCAGATTGTGGCAACGCCTGAATc > 1:1212492/1‑150 (MQ=255) gTTGGTGGTGCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTGCTCACACTTCGCGCAGATTGTGGCAACGCCTGAATCGCGCTTCCa > 1:1951501/1‑150 (MQ=255) gTTGGTGGTGCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTGCTCACACTTCGCGCAGATTGTGGCAACGCCTGAATCGCGCTTCCa < 2:1012857/150‑1 (MQ=255) ttGGTGGTGCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTGCTCACACTTCGCGCAGATTGTGGCAACGCCTGAATCGCGCTTCCAg > 1:2217362/1‑150 (MQ=255) tggtgCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCGGTGGGAGACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGACGAGGCCGGAACAGGTTGCTCACACTTCGCGCAGATTGTGGCAACGCCTGAATCGCGCTTCCAGGTTg > 1:788159/1‑150 (MQ=255) tggtgCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTGCTCACACTTCGCGCAGATTGTGGCAACGCCTGAATCGCGCTTCCAGGTTg > 1:681773/1‑150 (MQ=255) tgCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTGCTCACACTTCGCGCAGATTGTGGCAACGCCTGAATCGCGCTTCCAGGTTGCGa < 2:1691761/150‑1 (MQ=255) ggCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTGCTCACACTTCGCGCAGATTGTGGCAACGCCTGAATCGCGCTTCCAGGTTGCGATCgg < 2:759459/150‑1 (MQ=255) cAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTGCTCACACTTCGCGCAGATTGTGGCAACGCCTGAATCGCGCTTCCAGGtt > 1:1431753/1‑139 (MQ=255) tAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAGTGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTGCTCACACTTCGCGCAGATTGTGGCAACGCCTGAATCGCGCTTCCAGGTTGCGATCGGGCATCTg < 2:189538/150‑1 (MQ=255) tAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTGCTCACACTTCGCGCAGATTGTGGCAACGCCTGAATCGCGCTTCCAGGTTGCGATCGGGCATCTg > 1:2166753/1‑150 (MQ=255) aGGCAGTAGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTGCTCACACTTCGCGCAGATTGTGGCAAc > 2:68712/1‑111 (MQ=255) gCAGTAGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTGCTCACACTTCGCGCAGATTGTGGCAACGCCTGAATc > 1:1310085/1‑118 (MQ=255) gCAGTAGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTACTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTGCTCACTCTTCGCGCAGATTGTGGCAACGCCTGAATCGCGCTTCCAGGTTGCGATCGGGCATCTGGTGa < 1:916245/150‑1 (MQ=255) cAGTAGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTGCTCACACTTCGCGCAGATTGTGGCAACGCCTGAATCGCGCTTCCAGGTTGCGATCGGGCATCTGGTGAc > 1:1162125/1‑150 (MQ=255) cGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCtgcacggtcgcctgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccgctactgccttacctggccagcaccaccaacttacccacagcctgccgttgccccagcttctcgatagcaaccccggcttctgcca < 1:1018958‑M1/150‑129 (MQ=255) cGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCtgcacggtcgcctgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccgctactgccttacctggccagcaccaccaacttacccaca < 2:443380‑M1/104‑83 (MQ=255) cGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCtgcacggtcgcctgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccgctactgccttacctggccagcaccaccaacttacccaca > 1:443380‑M1/1‑22 (MQ=255) CGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTGCTCACACTTCGCGCAGATTGTGGCAACGCCTGAATCGCGCTTCCAGGTTGCGATCGGGCATCTGGTGACTGCGCa < 2:2283251‑M1/150‑1 (MQ=255) | CACCAGCTGTTTGCCTGGCATGCCGAGGGCAAGTTGAAGCCGCTGGTGTCGCAGACTTATCCACTGGCAGAAGCCGGGGTTGCTATCGAGAAGCTGGGGCAACGGCAGGCTGTGGGTAAGTTGGTGGTGCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTGCTCACACTTCGCGCAGATTGTGGCAACGCCTGAATCGCGCTTCCAGGTTGCGATCGGGCATCTGGTGACTGCGCA > NC_002947/5943508‑5943806 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |