| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | NC_002947 | = 5943699 | 65 (0.850) | intergenic (+51/+34) | PP_5210/PP_5211 | alcohol dehydrogenase/ChaC‑related protein | |||||
Only 100 of 168 total aligned reads displayed.
CGAGGGCAAGTTGAAGCCGCTGGTGTCGCAGACTTATCCACTGGCAGAAGCCGGGGTTGCTATCGAGAAGCTGGGGCAACGGCAGGCTGTGGGTAAGTTGGTGGTGCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTGCTCACACTTCGCGCAGATTGTGGCAACGCCTGAATCGCGCTTCCAGGTTGCGATCGGGCATCTGGTGACTGCGCAGTGCATTCAAGGTCTGCTCGA > NC_002947/5943531‑5943827 | cGAGGGCAAGTTGAAGCCGCTGGTGTCGCAGACGTATCCACTGGCAGAAGCCGGGGTTGCTATCGAGAAGCTGGGGCAACGGCACGGAGTGGGGAAGAGGGTGGTGTAGGGAAAGTGTGGCAGCAGCGGCCTCTTTGGTGGTAAACCCGc > 2:1729076/1‑150 (MQ=255) aaGTTGAAGCCGCTGGTGTCGCAGACTTATCCACTGGCAGAAGCCGGGGTTGCTATCAAGAAGCTGGGGCAACGGCAGGCTGTGGGTAAGTTGGTGGTGCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACa < 1:1594021/150‑1 (MQ=255) gTTGAAGCCGCTGGTGTCGCAGACTTATCCACTGGCAGAAGCCGGGGTTGCTATCGAGAAGCTGGGGCAACGGCAGGCTGTGGGTAAGTTGGTGGTGCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAgg > 1:2007149/1‑150 (MQ=255) 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aCTGGCAGAAGCCGGGGTTGCTATCGAGAAGCTGGGGCAACGGCAGGCTGTGGGTAAGTTGGTGGTGCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAgggtttacccgcgaagaggc > 1:515327‑M2/1‑130 (MQ=255) aCTGGCAGAAGCCGGGGTTGCTATCGAGAAGCTGGGGCAACGGCAGGCTGTGGGTAAGTTGGTGGTGCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAgggtttacccgcgaagaggc < 2:2405175‑M2/150‑21 (MQ=255) tGGCAGAAGCCGGGGTTGCTATCGAGAAGCTGGGGCAACGGCAGGCTGTGGGTAAGTTGGTGGTGCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAgggtttacccgcgaagaggccg < 1:1018958‑M2/150‑23 (MQ=255) gAAGCCGGGGTTGCTATCGAGAAGCTGGGGCAACGGCAGGCTGTGGGTAAGTTGGTGGTGCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCtgcacggtcgcctgtaggagcgggtttac > 1:1963548‑M1/1‑102 (MQ=255) gAAGCCGGGGTTGCTATCGAGAAGCTGGGGCAACGGCAGGCTGTGGGTAAGTTGGTGGTGCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCtgcacggtcgcctgtaggagcgggtttac < 2:1963548‑M1/131‑30 (MQ=255) tcaccagatgcccgatcgcaacctggaagcgcgattcaggcgttgccacaatctgcgcgaagtgtgagcaacctgttcCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTAc > 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |