New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 31361 = | 203 (2.180) | 13 (0.150) | 10/228 | NT | 6.7% | intergenic (+25/‑43) | PP_0026/PP_0027 | cobalt/cadmium/zinc exporter/membrane protein |
? | NC_002947 | 31389 = | 179 (2.100) | intergenic (+53/‑15) | PP_0026/PP_0027 | cobalt/cadmium/zinc exporter/membrane protein |
Only 100 of 255 total aligned reads displayed.
CGTGGATGCTGTCAGCGATGCATTCGAAATCCATCACTGCACCATCCAGATCGAGCGGGCAGCTTTCCACGAGAGCGTTCCCTCACCCTCGCACTGACCGATCGGTAAACACCATGCAAACACATCACCCTCCTGGCTGAGGGTGATGTTGC‑AAAAAAAATGCGGTGAGGGATGCCGTAAACGGCAGGAGCGCTTCAAGGGGGTTGGTGAATGGCTTCGCCTGCCCTCGTCAACAACCTCCAGAAGGCTCAGCGATGGCCTGGATCATCACGAAGTACCTACTCACTGCCGGTATAGT > NC_002947/31240‑31537 | aTGCTGTCAGCGATGCATTCGAAATCCATCACTGCACCATCCAGATCGAGCGGGCAGCTTTCCACGAGAGCGTTCCATCACCGTCAAACTGACCGATCGGTAAACACCATGCAAACACATCACCCTCCTGGCTGAGGGTGATGTTGC‑aaa > 1:1860362/1‑150 (MQ=255) gcaaTGCATAAGAAATCAATAACTGCACCATCCAGATCGAGCTGGCAGCTTTCCACGAGAGCGTTCCCTCACCCTCGCACTGACCGATCGGTAAACACCATGCAAACACATCACCCTCCTGGCTGAGGGTGATGTTGC‑AAAAAAAATGCg < 2:1099708/147‑1 (MQ=255) gCGATGCATTCGAAATCCATCACTGCACCATCCAGATCGAGCGGGCAGCTTTCCACGAGAGCGTTCCCTCACCCTCGCACTGACCGATCGGTAAACACCATGCAAACACATCACCCTCCTGGCTGAGGGTGATGTTGC‑AAAAAAAATGCg > 1:2208828/1‑150 (MQ=255) gATGCATTCGAAATCCATCACTGCACCATCCAGATCGAGCGGGCAGCTTTCCACGAGAGCGTTCCCTCACCCTCGCACTGACCGATCGGTAAACACCATGCAAACACATCACCCTCCTGGCTGAGGGTGATGTTGC‑AAAAAAAATGCg < 2:581659/148‑1 (MQ=255) gATGCATTCGAAATCCATCACTGCACCATCCAGATCGAGCGGGCAGCTTTCCACGAGAGCGTTCCCTCACCCTCGCACTGACCGATCGGTAAACACCATGCAAACACATCACCCTCCTGGCTGAGGGTGATGTTGC‑AAAAAAAATGCGGt > 1:2442207/1‑150 (MQ=255) tGCATTCGACATCCATCACTGCACCATCCAGATCGAGCGGGCAGCTTTCCACGAGCGCGTTCCCTCACCCTCGCACTGACCGATCGGTAATCACCATGCAAACACATCACCCTCCTGGCTGAGGGTGATGTTGC‑AAAAAAAATGCGGTGa < 1:264351/150‑1 (MQ=255) gCATTCGAAATCCATCACTGCACCATCCAGATCGAGCGGGCAGCTTTCCACGAGAGCGTTCCCTCACCCTCGCACTGACCGATCGGTAAACACCATGCAAACACATCACCCTCCTGGCTGAGGGTGATGTTGC‑AAAAAAAATGCGGTGAg > 1:1412482/1‑150 (MQ=255) aTTCGAATTCCATCACTGCACCATCCAGATCGAGCGGGCAGCTTTCCACGAGAGCGTTCCCTCACCCTCGCACTGACCGATCGGTAAACACCATGCAAACACATCACCCTCCTGGCTGAGGGTGATGTTGC‑AAAAAAAATGCGGTGa > 1:1369552/1‑147 (MQ=255) aTTCGAAATCCATCACTGCACCATCCAGATCGAGCGGGCAGCTTTCCACGAGAGCGTTCCCTCACCCTCGCACTGACCGATCGGTAAACACAATGCACCCACATCACCCTCCTGGCTGAGGGTGATGTTGC‑AAAAAAAATGCGGTTAgtg < 1:1356511/150‑3 (MQ=255) aTTCGAAATCCATCACTGCACCATCCAAATCGAGCGGGCAGCTTTCCACNAGAGCGTTCCCTCACCCTCGCACTGACCGATCGGTCACCACCATGCACACACAACCCACTCCTGGCTGAGGGTGATGTTGC‑ACCAACACTGCGGTGAggg > 1:321082/1‑150 (MQ=255) ttCGAAATCCATCACTGCACCATCCAGATCGAGCGGTCAGCTTTCCACGAGAGCGTTCCCTCACCCTCGCACTGACCGATCGGTAAACACCATGCAAACACATCACCCTCCTGGCTGAGGGTGATGTTGC‑AAAAAAAATGCGGTGAGGGa > 1:1772523/1‑150 (MQ=255) ttCGAAATCCATCACTGCACCATCCAGATCGAGCGGGCAGCTTTCCACGAGAGCGTTCCCTCACCCTCGCACTGACCGATCGGTAAACACCATGCAAACACATCACCCTCCTGGCTGAGGGTGATGTTGC‑AAAAAAAATGCGGTGAGGGa > 1:847493/1‑150 (MQ=255) gAAATCCATCACTGCACCATCCAGATCGAGCGGGCAGCTTTCCACGAGAGCGTTCCCTCACCCTCGCACCGACCGGTCGGTAAACACCATGCAAACACATCACCCTCCTGGCTGAGGGTGATGTTGC‑AAAAAAAATGCGGTGAGGGATGc < 1:2120253/150‑1 (MQ=255) aaaTCCATCACTGCACCATCCAGATCGAGCGGGCAGCTTTCCACGAGAGCGTTCCCTCACCCTCGCACTGACCGATCGGTAAACACCATGCAAACACATCACCCTCCTGGCTGAGGGTGATGTTGC‑AAAAAAAATGCGGTGAGGGATGcc > 2:350117/1‑150 (MQ=255) cATCACTGCACCATCCAGATCGAGCGGGCAGCTTTCCACGAGAGCGTTCCCTCACCCTCGCACTGACCGATCGGTAAACACCATGCAAACACATCACCCTCCTGGCTGAGGGTGATGTTGC‑AAAAAAAATGCGGTGAGGGATGCCGTaaa > 1:84250/1‑150 (MQ=255) aTCACTGCACCATCCAGATCGAGCGGGCAGCTTTCCACGAGAGCGTTCCCTCACCCTCGCACTGACCGATCGGTAAACACCATGCAAACACATCACCCTCCTGGCTGAGGGTGATGTTGC‑AAAAAAAATGCGGTGAGGGATGCCGTAAAc > 1:307448/1‑150 (MQ=255) aTCACTGCACCATCCAGATCGAGCGGGCAGCTTTCCACGAGAGCGTTCCCTCACCCTCGCACTGACCGATCGGTAAACACCATGCAAACACATCACCCTCCTGGCTGAGGGTGATGTTGC‑AAAAAAAATGCGGTGAGGGATGCCGTAAAc > 2:2399461/1‑150 (MQ=255) cTGCACCATCCAGATCGAGCGGGCAGCTTTCCACGAGAGCGTTCCCTCACCCTCGCACTGACCGATCGGTAAACACCATGCAAACACATCACCCTCCTGGCTGAGGGTGATGTTGC‑AAAAAAAATGCGGTGAGGGATGCCGTAAACNGCa < 2:1499485/150‑1 (MQ=255) 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cGAGCGGGCAGCTTTCCACGAGAGCGTTCCCTCACCCTCGCACTGACCGATCGGTAAACACCATGCAAACACATCACCCTCCTGGCTGAGGGTGATGTTGC‑AAAAAAAATGCGGTGAGGGATGCCGTAAACGGCAGGAGCGCTTCAAggg < 1:1510064/150‑1 (MQ=255) agccattcaccaacccccttgaagcgctcctgccgtttacggcatccctcaccgcattttttttgcaacatcaccctcctggctgagggtgatgtTGC‑aaa < 1:2020285‑M2/6‑1 (MQ=255) agccattcaccaacccccttgaagcgctcctgccgtttacggcatccctcaccgcattttttttgcaACATCACACTCCTGGCTGAGGGTGATGTTGC‑aaa < 2:2020285‑M1/34‑1 (MQ=255) aGCTTTCCACGAGAGCGTTCCCTCACCCTCGCACTGACCGATCGGTAAACACAATGCAAACACATCACCCTCCCGGCGGAGGGGGATGTTGC‑AAAAAAAATGCGGTGGGGGATGCCGTAAACGGCCGGAGCGCTTCAAGGGGGTTGGTGa > 1:760196/1‑150 (MQ=255) ttttCCACGAGAGCGTTCACTCACCCTCGCACTGACCGATCGGTAAACACCATGCAAACACATCACCCTCCTGGCTGAGGGTGATGTTGC‑AAAAAAAATGCGGTGAGGGATGCCGTAAACGGCAGGAGCGCTTCAAGGGGGTTGGTGAAt < 2:914440/149‑1 (MQ=255) cTTTCCACGAGAGCGTTCCCTCACCCTCGCACTGACCGATCGGTAAACACCATGCACACACATCACCCTCCTGGCTGAGGGTGATGTTGC‑AAAAAAAATGCGGTGAGGGATGCCGTAAACGGCAGGAGCGCTTCAAGGGGGTTGGTGAAt > 2:1522892/1‑150 (MQ=255) cTTTCCACGAGAGCGTTCCCTCACCCTCGCACTGACCGATCGGTAAACACCATGCAAACACATCACCCTCCTGGCTGAGGGTGATGTTGC‑AAAAAAAATGCGGTGAgg > 1:2299559/1‑108 (MQ=255) cTTTCCACGAGAGCGTTCCCTCACCCTCGCACTGACCGATCGGTAAACACCATGCAAACACATCACCCTCCTGGCTGAGGGTGATGTTGC‑AAAAAAAATGCGGTGAgg < 2:2299559/108‑1 (MQ=255) cTTTCCACGAGAGCGTTCCCTCACCCTCGCACTGACCGATCGGTAAACACCATGCAAACACATCACCCTCCTGGCTGAGGGTGATGTTGC‑AAAAAAAATGCGGTGAGGGATGCCGTAAACGGCAGGAGCGCTTCAAgggg > 1:1526558/1‑140 (MQ=255) cTTTCCACGAGAGCGTTCCCTCACCCTCGCACTGACCGATCGGTAAACACCATGCAAACACATCACCCTCCTGGCTGAGGGTGATGTTGC‑AAAAAAAATGCGGTGAGGGATGCCGTAAACGGCAGGAGCGCTTCAAGGGGGTTGGTGAAt < 1:1193045/150‑1 (MQ=255) tttCCACGAGAGCGTTCCCTCACCCTCGCACTGACCGATCGGTAAACACCATGCAAACACATCACCCTCCTGGCTGAGGGTGATGTTGC‑AAAAAAAATGCGGTGAGGGATGCCGTAAACGGCAGGAGCGCTTCAAGGGGGTTg < 2:1450313/143‑1 (MQ=255) ttCCACGAGAGCGTTCCCTCACCCTCGCACTGACCGATCGGTAAACACCATGCAAACACATCACCCTCCTGGCTGAGGGTGATGTTGC‑AAAAAAAATGCGGTGAGGGATGCCGTAAACGGCAGGAGCGCTTCAAGGGGGTTGGTGAATgg < 2:2159064/150‑1 (MQ=255) ccccttgaagcgctcctgccgtttacggcatccctcaccgcattttttttgcaACATCACCCTCCTGGCTGAGGGTGATGtt > 2:1353298‑M1/54‑82 (MQ=255) aCGAGAGCGTTCCCTCACCCTCGCACTGACCGATCGGTAAACACCATGCAAACACATCACCCTCCCGGCTGAGGGTGATGTTGC‑AAAAAAAATGCGGTGAGGGATGCCGTAAACGGCAGGAGCGCTTCAAggg < 2:1461406/133‑1 (MQ=255) cGTTCCCTCACCCTCGCACTGACCGATCGGTAAACACCATGCAAACACATCACCCTCCTGGCTGAGGGTGATGTTGC‑AAAAAAAATGCGGTGAGGGATGCCGTAAACGGCAGGAGCGCTTCAAGGGGGTTGGTGAATGGCTTCGCCTGcc < 2:1971278/150‑1 (MQ=255) gTTCCCTCACCCTCGCACTGACCGATCGGTAAACACCATGCAAACACATCACCCTCCTGGCTGAGGGTGATGTTGC‑AAAAAAAATGCGGTGAGGGATGCCGTAAACGGCAGGAGCGCTTGAAGGGGGTTGGTGAATGGCTTCGCCTGccc > 2:1276309/1‑150 (MQ=255) ttCCCTCACCCTCGCACTGACCGATCGGTAAACACCATGCAAACACATCACCCTCCTGGCTGAGGGTGATGTTGC‑AAAAAAAATGCGGTGAGGGATGCCGTAAACGGCAGGAGCGCTTCAAGGGGGTTGGTGAATGGCTTCGCCTGCCCt > 1:1938353/1‑150 (MQ=255) ccTCACCCTCGCACTGACCGATCGGTAAACACCATGCAAACACATCACCCTCCTGGCTGAGGGTGATGTTGC‑AAAAAAAATGCGGTGAGGGATGCCGTAAACGGCAGGAGCGCTTCAAGGGGGTTGGTGAATGGCTTCGCCTGCCCTCGt < 1:2159433/150‑1 (MQ=255) 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1:2325405‑M1/78‑1 (MQ=255) TCCTGGCTGAGGGTGATGTTGC‑AAAAAAAATGCGGTGAGGGATGCCGTAAACGGCAGGAGCGCTTCAAGGGGGTTGGTGAATGGCTTCGCCTGCCCTCGTCAACAACCTCCAGAAGGCTCAGCGATGGCCTGGATCATCACGAAGTACCt < 1:2309335‑M1/150‑1 (MQ=255) TCCTGGCTGAGGGTGATGTTGC‑AAAAAAAATGCGGTGAGGGATGCCGTAAACGGCAGGAGCGCTTCAAGGGGGTTGGTGAATGGCTTCGCCTGCCCTCGTCAACAACCTCCAGAAGGCTCAGCGATGGCCTGGATCATCACGAAGTACCt < 1:13410‑M1/150‑1 (MQ=255) CCTGGCTGAGGGTGATGTTGC‑AAAAAAAATGCGGTGAGGGATGCCGTAAACGGCAGGAGCGCTTCAAGGGGGTTGGTGAATGGCTTCGCCTGCCCTCGTCAACAACCTCCAGAAGGCTCAGCGATGGCCTGGATCATCACGAAGTACCTa > 1:411636‑M1/1‑150 (MQ=255) ctGGCTGAGGGTGATGTTGC‑AAAAAAAATGCGGTGAGGGATGCCGTAAACGGCAGGAGCGCTTCAAGGGGGTTGGTGAATGGCTTCGCCTGCCCTCGTCAACAACCTCCAGAAGGCTCAGCGATgg > 2:702686/1‑126 (MQ=255) ctGGCTGAGGGTGATGTTGC‑AAAAAAAATGCGGTGAGGGATGCCGTAAACGGCAGGAGCGCTTCAAGGGGGTTGGTGAATGGCTTCGCCTGCCCTCGTCAACAACCTCCAGAAGGCTCAGCGATgg < 1:702686/126‑1 (MQ=255) ctGGCTGAGGGTGATGTTGC‑AAAAAAAATGCGGTGAGGGATGCCGTAAACGGCAGGAGCGCTTCAAGGGGGTTGGTGAATGGCTTCGCCTGCCCTCGTCAACAACCTCCAGAAGGCTCAGCGATGGCCTGGATCATCACGAAGTACCTAc < 2:606590/150‑1 (MQ=255) gCTGAGGGTGATGTTGC‑AAAAAAAATGCGGTGAGGGATGCCGTAAACGGCAGGAGCGCTTCAAGGGGGTTGGTGAATGGCTTCGCCTGCCCTCGTCAACAACCTCCAGAAGGCTCAGCGATGGCCTGGATCATCACGAAGt < 2:2266472/141‑1 (MQ=255) ggtgatgtTGC‑AAAAAAAATGCGGTGAGGGATGCCGTAAACGGCAGGAGCGCTTCAAGGGGGTTGGTGAATGGCTTCGCCTGCCCTCGTCAACAACCTCCAGAAGGCTCAGCGATGGCCTGGATCATCACGAAGTACCTACTCACTGCCg > 2:1810555‑M2/9‑150 (MQ=255) ggtgatgtTGC‑AAAAAAAATGCGGTGAGGGATGCCGTAAACGGCAGAAGTGTGGCAAGGGGGTTGGTGAATGGCTTCGCCTGCCCTCGTCAACAACCTCCAGAAGGCTCAGCGATGGCCTGGATCATCACGAAGTACCTACTCACTGCCg < 1:145354‑M2/142‑1 (MQ=255) ggtgatgtTGA‑AAAAAAAATGCGGTGAGGGATGCCGTAAACGGCAGGAGCGCTTCAAGGGGGTTGGTGAATGGCTTCGCCTGCCCTCGTCAACCACCTCCAGAAGGCTCAGCGATGGCCTGGATCATCACGAAGTACCTACTCACTGCCg < 2:1262260‑M2/142‑1 (MQ=255) gtgatgtTGC‑AAAAAAAATGCGGTGAGGGATGCCGTAAACGGCAGGAGCGCTTCAAGGGGGTTGGTGAATGGCTTCGCCTGCCCTCGTCAACAACCTCCAGAAGGCTCAGCGATGGCCTGGatcatc < 1:1804658‑M2/120‑1 (MQ=255) tgatgtTGC‑AAAAAAAATGCGGTGAGGGATGCCGTAAACGGCAGGAGCGCTCCAAGGGGGTTGGTGAATGGCTTCGCCTGCCCTCGTCAACAACCTCCAGAAGGCTCAGCGATGGCCTGGATCATCACGAAGTACCTACTCACTGCCGGt > 2:839500‑M2/7‑150 (MQ=255) atgtTGC‑AAAACGAAAGCGGTGAGCGATGCCGTAAACGGCAGGAGCGCTTCAAGGGGGTTGGTGAATGGCTTCGCCTGCCCTCGTCAACAACCTCCAGAAGGCTCAGCGATGGCCTGGATCATCACGAAGTACCTACTCACTGCCGGtat < 1:490609‑M2/146‑1 (MQ=255) gtTGC‑AAAAAAAATGCGGTGAGGGATGCCGTAAACGGCAGGAGCGCTTCAAGGGGGTTGGTGAATGGCTTCGCCTGCCCTCGTCAACAACCTCCAGAAGGCTCAGCGATGGCCTGGATCATCACGAAGTACCTACTCACTGCCGGTATAg < 1:2352237‑M2/148‑1 (MQ=255) tTGC‑AAAAAAAATGCGGTGAGGGATGCCGTAAACGGCAGGAGCGCTTCAAGGGGGTTGGTGAATGGc > 1:173629‑M2/2‑67 (MQ=255) tTGC‑AAAAAAAATGCGGTGAGGGATGCCGTAAACGGCAGGAGCGCTTCAAGGGGGTTGGTGAATGGc < 2:173629‑M2/66‑1 (MQ=255) tTGC‑AAAAAAAATGCGGTGAGGGATGCCGTAAACGGCAGGAGCGCTTCAAGGGGGTTGGTGAATGGCTTCGCCTGCCCTCGTCAACAACCTCCAGAAGGCTCAGCGATGGCCTGGATCATCACGAAGTACCTACTCACTGCCGGTATAGt < 2:1750686‑M2/149‑1 (MQ=255) tTGC‑AAAAAAAATGCGGTGAGGGATGCCGTAAACGGCAGGAGCGCTTCAAGGGGGTTGGTGAATGGCTTCGCCTGCCCTCGTCAACAACCTCCAGAAGGCTCAGCGATGGCCTGGATCATCACGAAGTACCTACTCACTGCCGGTATAGt > 1:961757‑M2/2‑150 (MQ=255) tTGC‑AAAAAAAATGCGGTGAGGGATGCCGTAAACGGCAGGAGCGCTTCAAGGGGGTTGGTGAATGGCTTCGCCTGCCCTCGTCAACAACCTCCAGAAGGCTCAGCGATGGCCTGGATCATCACGAAGTACCTACTCACTGCCGGTATAGt < 2:2309335‑M2/149‑1 (MQ=255) | CGTGGATGCTGTCAGCGATGCATTCGAAATCCATCACTGCACCATCCAGATCGAGCGGGCAGCTTTCCACGAGAGCGTTCCCTCACCCTCGCACTGACCGATCGGTAAACACCATGCAAACACATCACCCTCCTGGCTGAGGGTGATGTTGC‑AAAAAAAATGCGGTGAGGGATGCCGTAAACGGCAGGAGCGCTTCAAGGGGGTTGGTGAATGGCTTCGCCTGCCCTCGTCAACAACCTCCAGAAGGCTCAGCGATGGCCTGGATCATCACGAAGTACCTACTCACTGCCGGTATAGT > NC_002947/31240‑31537 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |