New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 55316 | 70 (0.750) | 57 (0.610) | 51/250 | NT | 44.9% | coding (298/324 nt) | PP_0048 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | = 3971692 | NA (NA) | intergenic (+31/‑349) | PP_3501/PP_3502 | transposase/transposase |
GCGCGTATGAATGGGCATGATCCGTATGCCTATCTCAAAGATGTGCTAACTCGGTTGCCAACACAGCGGGCCAGTGAGATCGGGCAGCTGCTGCCACATCAGTGGGTGCCTGCCTAACTTACGCAAGGTGAGTTGGGCGGACGCTTACTTCCTATGTTCAAAAAAGCAGCTAGACAGTGTGGGCGAGTCCATACATAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTAGCCGCGACAATGGTGAACGGCAGGTGGACATTGGCTAGTAGGCCCGGCTCTTTCGCGGGTAAACCCGCTTGTA > NC_002947/3971545‑3971841 | gcgcGTATGAATGGGCATGATCCGTATGCCTATCTCAAAGATGTGCTAACTCGGTTGCCAACACAGCGGGCCAGTGAGATCGGGCAGCTGCTGCCACATCAGTGGGTGCCTGCCTAACTTACGCAAGGTGAGTTGGGCGGACGCTTACtt > 2:1701783/1‑150 (MQ=11) ggCATGATCCGTATGCCTATCTCAAAGATGTGCTAACTCGGTTGCCAACACAGCGGGCCAGTGAGATCGGGCAGCTGCTGCCACATCAGTGGGTGCCTGCCTAACTTACGCAAGGTGAGTTGGGCGGACGCTTACTTCCTATGTTCaaaa < 1:1228325/150‑1 (MQ=40) aTGATCCGTATGCCTATCTCAAAGATGTGCTAACTCGGTTGCCAACACAGCGGGCCAGTGAGATCGGGCAGCTGCTGCCACATCAGTGGGTGCCTGCCTAACTTACGCAAGGTGAGTTGGGCGGACGCTTACTTCCTATGTTCAAAAAag > 1:2355561/1‑150 (MQ=255) gATCCATATGCCTATCTCAAAGATGTGCTAACTCGGTTGCCAACACAGCGGGCCAGTGAGATCGGGCAGCTGCTGCCACATCAGTGGGTGCCTGCCTAACTTACGCAAGGTGAGTTGGGCGGACGCTTACTTCCTATGTTCAAAAAagca > 1:535046/1‑150 (MQ=255) aTCCGTATGCCTATCTCAAAGATGTGCTAACTCGGTTGCCAACACAGCGGGCCAGTGAGATCGGGCAGCTGCTGCCACATCAGTGGGTGCCTGCCTAACTTACGCAAGGTGAGTTGGGCGGACGCTTACTTCCTATGTTCAAAAAagcag < 2:52468/150‑1 (MQ=255) tCCGTATGCCTATCTCAAAGATGTGCTAACTCGGTTGCCAACACAGCGGGCCAGTGAGATCGGGCAGCTGCTGCCACATCAGTGGGTGCCTGCCTAACTTACGCAAGGTGAGTTGGGCGGACGCTTACTTCCTATGTTCAAAAAagcagc < 1:2349306/150‑1 (MQ=255) cTATCTCAAAGATGTGCTAACTCGGTTGCCAACACAGCGGGCCAGTGAGATCGGGCAGCTGCTGCCACATCAGTGGGTGCCTGCCTAACTTACGCAAGGTGAGTTGGGCGGACGCTTACTTCCt > 2:50486/1‑124 (MQ=33) cTATCTCAAAGATGTGCTAACTCGGTTGCCAACACAGCGGGCCAGTGAGATCGGGCAGCTGCTGCCACATCAGTGGGTGCCTGCCTAACTTACGCAAGGTGAGTTGGGCGGACGCTTACTTCCt < 1:50486/124‑1 (MQ=33) aaaGATGTGCTAACTCGGTTGCCAACACAGCGGGCCAGTGAGATCGGGCAGCTGCTGCCACATCAGTGGGTGCCTGCCTAACTTACGCAAGGTGAGTTGGGCGGACGCTTACTTCCTATGTTCAAAAAAGCAGCTAGACAGTGTGGGCGa < 2:535046/150‑1 (MQ=255) aaaGATGTGCTAACTCGGTTGCCAACACAGCGGGCCAGTGAGATCGGGCAGCTGCTGCCACATCAGTGGGTGCCTGCCTAACTTACGCAAGGTGAGTTGGGCGGACGCTTACTTCCTATGTTCAAAAAAGCAGCTAGACAGTGTGGGCGa < 2:1643028/150‑1 (MQ=255) aaaGATGTGCTAACTCGGTTGCCAACACAGCGGGCCAGTGAGATCGGGCAGCTGCTGCCACATCAGTGGGTGCCTGCCTAACTTACGCAAGGTGAGTTGGGCGGACGCTTACTTCCTATGTTCAAAAAAGCAGCTAGACAGTGTGGGCGa < 1:665548/150‑1 (MQ=255) aaaGATGTGCTAACTCGGTTGCCAACACAGCGGGCCAGTGAGATCGGGCAGCTGCTGCCACATCAGTGGGTGCCTGCCTAACTTACGCAAGGTGAGTTGGGCGGACGCTTACTTCCTATGTTCAAAAAAGCAGCTAGACAGTGTGGGCGa > 1:162245/1‑150 (MQ=255) aGATGTGCTAACTCGGTTGCCAACACAGCGGGCCAGTGAGATCGGGCAGCTGCTGCCACATCAGTGGGTGCCTGCCTAACTTACGCAAGGTGAGTTGGGCGGACGCTTACTTCCTATGTTCAAAAAAGCAGCTAGACAGTGTgggggctg > 1:2063381/1‑145 (MQ=255) aTGTGCTAACTCGGTTGCCAACACAGCGGGCCAGTGAGATCGGGCAGCTGCTGCCACATCAGTGGGTGCCTGCCTAACTTACGCAAGGTGAGTTGGGCGGACGCTTACTTCCTATGTTCAGAAGAGCAGCTAGACAGTGTGGGCGAGTcc < 1:2277169/150‑1 (MQ=255) aTGTGCTAACTCGGTTGCCAACACAGCGGGCCAGTGAGATCGGGCAGCTGCTGCCACATCAGTGGGTGCCTGCCTAACTTACGCAAGGTGAGTTGGGCGGACGCTTACTTCCTATGTTCAAAAAAGCAGCTAGACAGTGTGGGCGAGTcc > 2:995715/1‑150 (MQ=255) aTGTGCTAACTCGGTTGCCAACACAGCGGGCCAGTGAGATCGGGCAGCTGCTGCCACATCAGTGGGTGCCTGCCTAACTTACGCAAGGTGAGTTGGGCGGACGCTTACTTCCTATGTTCAAAAAAGCAGATAGAAAGTGAGGGCGAGGcc < 2:1107731/150‑1 (MQ=255) tgCTAACTCGGTTGCCAACACAGCGGGCCAGTGAGATCGGGCAGCTGCTGCCACATCAGTGGGTGCCTGCCTAACTTACGCAAGGTGAGTTGGGCGGACGCTTACTTCCTATGTTCAAAAAAGCAGCTAGACAGTGTGGGCGAGTCcata < 1:1186715/150‑1 (MQ=255) cTAACTCGGTTGCCAACACAGCGGGCCAGTGAGATCGGGCAGCTGCTGCCACATCAGTGGGTGCCTGCCTAACTTACGCAAGGTGAGTTGGGCGGACGCTTACTTCCTATGTTCAAAAAAGCAGCTAGACAGTGTGGGCGAGTc > 1:1358885/1‑144 (MQ=255) cTAACTCGGTTGCCAACACAGCGGGCCAGTGAGATCGGGCAGCTGCTGCCACATCAGTGGGTGCCTGCCTAACTTACGCAAGGTGAGTTGGGCGGACGCTTACTTCCTATGTTCAAAAAAGCAGCTAGACAGTGTGGGCGAGTc < 2:1358885/144‑1 (MQ=255) 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ttACGCAAGGTGAGTTGGGCGGACGCTTACTTCCTATGTTCAAAAAAGCAGCTAGACAGTGTGGGCGAGTCCATACATAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTAGCCGCGACAATGGTGAACGGCAGGTg < 1:1386876/132‑1 (MQ=255) ttACGCAAGGTGAGTTGGGCGGACGCTTACTTCCTATGTTCAAAAAAGCAGCTAGACAGTGTGGGCGAGTCCATACATAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTAGCCGCGACAATGGTGAACGGCAGGTg > 2:1386876/1‑132 (MQ=255) tACGCAAGGTGAGTTGGGCGGACGCTTACTTCCTATGTTCAAAAAAGCAGCTAGACAGTGTGGGCGAGTCCATACATAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTAGCCGCGACAATGGTGAACGGCAGGTGGACATTGGCTAGTAGGccc < 2:2202648/150‑1 (MQ=255) gCAAGGTGAGTTGGGCGGACGCTTACTTCCTAAGTTCATTAAAGCAGCTAGACAGTGTGGGCGAGTCCATACATAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTAGCCGCGACAATGGTGAACGGCAGGTGGACATTGGCTAGTAGGCCCGGc < 1:2375891/150‑1 (MQ=255) aaGGTGAGTTGGGCGGACGCTTACTTCCTATGTTCAAAAAAGCAGCTAGACAGTGTGGGCGAGTCCATACATAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTAGCCGCGACAATGGTGAACGGCAGGTGGACATTGGCTAGTAGGCCCGGctc > 2:1547274/1‑150 (MQ=255) tGAGTTGGGCGGACGCTTACTTCCTATGTTCAAAAAAGCAGCTAGACAGTGTGGGCGAGTCCATACATAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTAGCCGCGACAATGGTGAACGGCAGGTGGACATTGGCTAGTAGGCCCGGCTCTTTc < 1:160582/150‑1 (MQ=255) gAGTTGGGCGGACGCTTACTTCCTATGTTCAAAAAAGCAGCTAGACAGTGTGGGCGAGTCCATACATAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTAGCCGCGACAATGGTGAACGGCAGGTGGACATTGGCTAGTAGGCCCGGCTCTTTcg > 1:537057/1‑150 (MQ=255) gTTGGGCGGACGCTTACTTCCTATGTTCAAAAAAGCAGCTAGACAGTGTGGGCGAGTCCATACATAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTAGCCGCGACAATGGTGAACGGCAGGTGGACATTGGCTAGTAGGCCCGGCTCTTTcgcg > 1:1943996/1‑150 (MQ=255) gTTGGGCGGACGCTTACTTCCTATGTTCAAAAAAGCAGCTAGACAGTGTGGGCGAGTCCATACATAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTAGCCGCGACAATGGTGAACGGCAGGTGGACATTGGCTAGTAGGCCCGGCTCTTTcgcg < 1:803346/150‑1 (MQ=255) ttGGGCGGACGCTTACTTCCTATGTTCAAAAAAGCAGCTAGACAGTGTGGGCGAGTCCATACATAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTAGCCGCGACAATGGTGAACGGCAGGTGGACATTGGCTAGTAGGCCCGGCTCTTTCGCgg > 2:1757272/1‑150 (MQ=255) ttGGGCGGACGCTTACTTCCTATGTTCAAAAAAGCAGCTAGACAGTGTGGGCGAGTCCATACATAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTAGCCGCGACAATGGTGAACGGCAGGTGGACATTGGCTAGTAGGCCCGGCTCTTTCGCgg < 1:1757272/150‑1 (MQ=255) gACGCTTACTTCCTATGTTCAAAAAAGCAGCTAGACAGTGTGGGCGAGTCCATACATAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTAGCCGCGACAATGGTGAACGGCAGGTGGACATTGGCTAGTAGGCCCGGCTCTTTCGCGGGTAAAcc > 1:1806405/1‑150 (MQ=255) cGCTTACTTCCTATGTTCAAAAAAGCAGCTAGACAGTGTGGGCGAGTCCATACATAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTAGCCGCGACAATGGTGAACGGCAGGTGGACATTGGCTAGTAGGCCCGGCTCTTTCGCGGGTAAACCCg > 1:234398/1‑150 (MQ=255) gCTTACTTCCTATGTTCAAAAAAGCAGCTAGACAGTGTGGGCGAGTCCATACATAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTAGCCGCGACAATGGTGAACGGCAGGTGGACATTGGCTAGTAGGCCCGGCTCTTTCGCGGGTAAACCCGc < 2:156907/150‑1 (MQ=255) ttANTTCCTATGTTCAAAAAAGCAGCTAGACAGTGTGGGCGAGTCCATACATAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTAGCCGCGACAATGGTGAACGGCAGGTGGACATTGGCTAGTAGGCCCGGCTCTTTCGCGGGTAAACCCGCtt > 2:1512902/1‑150 (MQ=255) ttACTTCCTATGTTCAAAAAAGCAGCTAGACAGTGTGGGCGAGTCCATACATAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTAGCCGCGACAATGGTGAACGGCAGGTGGACATTGGCTAGTAGGCCCGGCTCTTTCGCGGGTAAACCCGCtt > 2:193475/1‑150 (MQ=255) cTTCCTATGTTCAAAAAAGCAGCTAGACAGTGTGGGCGAGTCCATACATAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTAGCCGCGACAATGGTGAACGGCAGGTGGACATTGGCTAGTAGGCCCGGCTCTTTCGCGGGTAAACCCGCTTGTa < 1:826963/150‑1 (MQ=255) | GCGCGTATGAATGGGCATGATCCGTATGCCTATCTCAAAGATGTGCTAACTCGGTTGCCAACACAGCGGGCCAGTGAGATCGGGCAGCTGCTGCCACATCAGTGGGTGCCTGCCTAACTTACGCAAGGTGAGTTGGGCGGACGCTTACTTCCTATGTTCAAAAAAGCAGCTAGACAGTGTGGGCGAGTCCATACATAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTAGCCGCGACAATGGTGAACGGCAGGTGGACATTGGCTAGTAGGCCCGGCTCTTTCGCGGGTAAACCCGCTTGTA > NC_002947/3971545‑3971841 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |