New junction evidence | |||||||||||
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* | ? | NC_002947 | = 601141 | 101 (1.080) | 5 (0.060) | 4/232 | NT | 5.1% | coding (489/1137 nt) | ribD | bifunctional diaminohydroxyphosphoribosylaminopyrimidine deaminase/5‑amino‑6‑(5‑phosphoribosylamino)uracil reductase |
? | NC_002947 | = 601161 | 93 (1.070) | coding (509/1137 nt) | ribD | bifunctional diaminohydroxyphosphoribosylaminopyrimidine deaminase/5‑amino‑6‑(5‑phosphoribosylamino)uracil reductase |
Only 100 of 121 total aligned reads displayed.
GCGGCGCCTGGCCGAAGCCGGAATCGAAGTGGCCAGCGGGGTGCTCGAAGCCGAGGCCCGCGCCCTCAACCCAGGCTTCCTCAAGCGTATGGAGCACGGCCTGCCGTTCGTTCGCGCCAAGCTGGCCATGAGCCTGGACGGCCGCACCGCCATGGCCAGTGGTGAAAGCCAGTGGATCACCGGCCCGGCCGCCCGCTCAGCCGTGCAGCGCTTGCGCGCCCGCTCCAGCGTGGTGCTGACCAGCGCCGCCAGCGTGCTGGCAGACAACGCACGCATGACCGTGCGTGGTGCCGAGCTGG > NC_002947/601012‑601310 | ggcgCCTGGCCGAAGCCGGAATCGAAGTGGCCAGCGGGGTGCTCGAAGCCGAGGCCCGCGCCCTCAACCCAGGCTTCCTCAAGCGTATGGAGCACGGCCTGCCGTTCGTTCGCGCCAAGCTGGCCATGAGCCTGGACGGCCGCACCGCca < 2:2212041‑M2/150‑3 (MQ=255) cgcCTGGCCGAAGCCGGAATCGAAGTGGCCAGCGGGGTGCTCGAAGCCGAGGCCCGCGCCCTCAACCCAGGCTTCCTCAAGCGTATGGAGCACGGCCTGCCGTTCGTTCGCGCCAAGCTGGCCATGAGCCTGGACGGCCGCACCGCcatg < 2:925521‑M2/150‑5 (MQ=255) cgcCTGGCCGAAGCCGGAATCGAAGTGGCCAGCGGGGTGCTCGAAGCCGAGGCCCGCGCCCTCAACCCAGGCTTCCTCAAGCGTATGGAGCACGGCCTGCCGTTCGTTCGCGCCAAGCTGGCCATGAGCCTGGACGGCCGCACCGCcatg > 1:781768‑M2/1‑146 (MQ=255) 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1:1359100‑M2/150‑123 (MQ=255) tGGCCATGAGCCTGGACGGCCGCACCGCcatggccagcttggcgcgaacgaacggcaggccgtgctccatacgcttgaggaagcctgggttgagggcgcgggcctcggcttcgag > 2:884892‑M2/1‑28 (MQ=255) tGGCCATGAGCCTGGACGGCCGCACCGCcatggccagcttggcgcgaacgaacggcaggccgtgctccatacgcttgaggaagcctgggttgagggcgcgggcctcggcttcgag < 1:884892‑M2/115‑88 (MQ=255) tGGCCATGAGCCTGGACGGCCGCACCGCCATGGCCAGTGGTGAAAGCCAGTGGATCACCGGCCCGGCCGCCCGCTCAGCCGTGCAGCGCTTGCGCGCCCGCTCCAGCGTGGTGCTGACCAGCGCCGCCAGCGTGCTGGCAGACAacgcac < 2:2171410/150‑1 (MQ=255) gCCATGAGCCTGGACGGCCGCACCGCCATGGCCAGTGGTGAAAGCCAGTGGATCACCGGCCCGGCCGCTCGCTCAGCCGTGCAGCGCTTGCGCGCCCGCTCCAGc < 1:2300421/105‑1 (MQ=255) gCCATGAGCCTGGACGGCCGCACCGCCATGGCCAGTGGTGAAAGCCAGTGGATCACCGGCCCGGCCGCCGGCTCAGCCGTGCAGCGCTTGCGCGCCCGCTCCAGc > 2:2300421/1‑105 (MQ=255) cATGAGCCTGGACGGCCGCACCGCCATGGCCAGTGGTGAAAGCCAGTGGATCACCGGCCCGGCCGCCCGCTCAGCCGTGCAGCGCTTGCGCGCCCGCTCCAGCgtggtg < 2:1434191/109‑1 (MQ=255) cATGAGCCTGGACGGCCGCACCGCCATGGCCAGTGGTGAAAGCCAGTGGATCACCGGCCCGGCCGCCCGCTCAGCCGTGCAGCGCTTGCGCGCCCGCTCCAGCGTGGTGCTGACCAGCGCCGCCAGCGTGCTGGCAGACAACGCACGCAt > 2:715671/1‑150 (MQ=255) tGAGCCTGGACGGCCGCACCGCCATGGCCAGTGGTGAAAGCCAGTGGATCACCGGCCCGGCCGCCCGCTCAGCCGTGCAGCGCTTGCGCGCCCGCTCCAGCGTGGTGCTGACCAGCGCCGCCAGCGTGCTGGCAGACAACGCACGCATGa < 2:960498/150‑1 (MQ=255) tGAGCCTGGACGGCCGCACCGCCATGGCCAGTGGTGAAAGCCAGTGGATCACCGGCCCGGCCGCCCGCTCAGCCGTGCAGCGCTTGCGCGCCCGCTCCAGCGTGGTGCTGACCAGCGCCGCCAGCGTGCTGGCAGACAACGCACGCATGa > 2:1676894/1‑150 (MQ=255) aGCCTGGACGGCCGCACCGCCATGGCCAGTGGTGAAAGCCAGTGGATCACCGGCCCGGCCGCCCGCTCAGCCGTGCAGCGCTTGCGCGCCCGCTCCAGCGTGGTGCTGACCAGCGCCGCCAGCGTGCTGGCAGACAACGCACGCATGAcc > 2:528185/1‑150 (MQ=255) tGGACGGCCGCACCGCCATGGCCAGTGGTGAAAGGCAGTGGATCACCGGCCCGGCCGCCCGCTCAGCCGTTCAGCGCTTGCGCGCCCGCTCCAGCGTGGTGCTGACCAGCGCCGCCAGCGTGCTGGCAGACAACGCACGCATGACcgtgc > 1:763116/1‑150 (MQ=255) tGGACGGCCGCACCGCCATGGCCAGTGGTGAAAGCCAGTGGATCACCGGCCCGGccgccc < 2:1640578/60‑1 (MQ=255) tGGACGGCCGCACCGCCATGGCCAGTGGTGAAAGCCAGTGGATCACCGGCCCGGccgccc > 1:1640578/1‑60 (MQ=255) tGGACGGCCGCACCGCCATGGCCAGTGGTGAAAGCCAGTGGATCACCGGCCCGGCCGCCCGCTCAGCCGTGCAGCGCTTGCGCGCCCGCTCCAGCGTGGTGCTGACCAGCGCCGCCAGCGTGCTGGCAGACAACGCACGCATGAcc < 2:1502398/146‑1 (MQ=255) tGGACGGCCGCACCGCCATGGCCAGTGGTGAAAGCCAGTGGATCACCGGCCCGGCCGCCCGCTCAGCCGTGCAGCGCTTGCGCGCCCGCTCCAGCGTGGTGCTGACCAGCGCCGCCAGCGTGCTGGCAGACAACGCACGCATGAcc > 1:1502398/1‑146 (MQ=255) tGGACGGCCGCACCGCCATGGCCAGTGGTGAAAGCCAGTGGATCACCGGCCCGGCCGCCCGCTCAGCCGTGCAGCGCTTGCGCGCCCGCTCCAGCGTGGTGCTGACCAGCGCCGCCAGCGTGCTGGCAGACAACGCACGCATGACcgtgc > 2:1967565/1‑150 (MQ=255) gACGGCCGCACCGCCATGGCCAGTGGTGAAAGCCAGTGGATCACCGGCCCGGCCGCCCGCTCAGCCGTGCAGCGCTTGCGCGCCCGCTCCAGCTTGGTGCTGACCAGCGCCGCCAGCGTGCTGGCAGACAACGCACGCATGACcgtgcgt < 1:655609/150‑1 (MQ=255) gACGGCCGCACCGCCATGGCCAGTGGTGAAAGCCAGTGGATCACCGGCCCGGCCGCCCGCTCAGCCGTGCAGCGCTTGCGCGCCCGCTCCAGCGTGGTGCTGACCAGCGCCGCCAGCGTGCTGGCAGACAACGCACGCATGACcgtgcgt < 2:107197/150‑1 (MQ=255) ggCCGCACCGCCATGGCCAGTGGTGAAAGCCAGTGGATCACCGGCCCGGCCGCCCGCTCAGCCGTGCAGCGCTTGCGCGCCCGCTCCAGCGTGGTGCTGACCAGCGCCGCCAGCGTGCTGGCAGACAACGCACGCATGACCGTGCgtggt < 1:1657491/150‑1 (MQ=255) aCCGCCATGGCCAGTGGTGAAAGCCAGTGGATCACCGGCCCGGCCGCCCGCTCAGCCGTGCAGCGCTTGCGCGCCCGCTCCAGCGTGGTGCTGACCAGCGCCGCCAGCGTGCTGGCAGa < 2:608731/119‑1 (MQ=255) aCCGCCATGGCCAGTGGTGAAAGCCAGTGGATCACCGGCCCGGCCGCCCGCTCAGCCGTGCAGCGCTTGCGCGCCCGCTCCAGCGTGGTGCTGACCAGCGCCGCCAGCGTGCTGGCAGa > 1:608731/1‑119 (MQ=255) ccATGGCCAGTGGTGAAAGCCAGTGGATCACCGGCCCGGCCGCCCGCTCAGCCGTGCAGCGCTTGCGCGCCCGCTCCAGCGTGGTGCTGACCAGCGCCGCCAGCGTGCTGGCAGACAACGCACGCATGACCGTGCGTGGTGCCGAGCTgg < 1:2146384/150‑1 (MQ=255) | GCGGCGCCTGGCCGAAGCCGGAATCGAAGTGGCCAGCGGGGTGCTCGAAGCCGAGGCCCGCGCCCTCAACCCAGGCTTCCTCAAGCGTATGGAGCACGGCCTGCCGTTCGTTCGCGCCAAGCTGGCCATGAGCCTGGACGGCCGCACCGCCATGGCCAGTGGTGAAAGCCAGTGGATCACCGGCCCGGCCGCCCGCTCAGCCGTGCAGCGCTTGCGCGCCCGCTCCAGCGTGGTGCTGACCAGCGCCGCCAGCGTGCTGGCAGACAACGCACGCATGACCGTGCGTGGTGCCGAGCTGG > NC_002947/601012‑601310 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |