New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 967853 = | 102 (1.090) | 7 (0.090) | 5/220 | NT | 7.2% | intergenic (‑29/+139) | PP_0830/PP_0831 | acetyltransferase/hypothetical protein |
? | NC_002947 | 967944 = | 90 (1.100) | intergenic (‑120/+48) | PP_0830/PP_0831 | acetyltransferase/hypothetical protein |
Only 100 of 139 total aligned reads displayed.
TGGCCGGATGGGGCGGTGGGTCAGGTGCATGGCAGGTCCTTCTCGCGTTGGCTGGCAGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCCCCCACAGGTACTGCACAAGGCTCAAATCCTGTGCAGGCCCTGTAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCAGCCTCACATCATAGGCCGCTTTCCATCCAACACCGCGCCCCGATTCACGGTTTGGCGGCCACCGCCACGTAGCCTTTGACCGCAGCCGGTGCCTTGGGCTTGGCCTTGTGCGCCAGCAGGTACTGATAGCGTCGCCATTCCTTGTC > NC_002947/967795‑968093 | tGGCCGGATGGGGCGGTGGGTCAGGTGCATGGCAGGTCCTTCTCGCGTTGGCTGGCAGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCCCCCACAGGTACTGCACAAGGCTCAAATCCTGTGCAGGCCCTGTAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCa < 2:726887/150‑1 (MQ=255) gCCGGATGGGGCGGTGGGTCAGGTGCATGGCAGGTCCTTCTCGCGTTGGCTGGCAGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCCCCCACAGGTACTGCACAAGGCTCAAATCCTGTGCAGGCCCTGTAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATc > 2:76645/1‑150 (MQ=255) ggATGGGGCGGTGGGTCAGGTGCAAGGCAGGTCCTTCTCGCGTTGGATGGCAGGGCCTCTTCGCGGGTGAGCCCGCACACACAGGTACTGCACAAGGCTCAAATCCTGTGCAGGCCCTGTAGCGGGGTTACCCGCGAAGAGGCCATCAGc > 2:916797/1‑150 (MQ=255) ggCGGTGGGTCAGGTGCATGGCAGGTCCTTCTCGCGTTGGCTGGCAGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCCCCCACAGGTACTGCACAAGGCTCAAATCCTGTGCAGGCCCTGTAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCAGCCTcaca > 1:101325/1‑150 (MQ=255) gTGGGTCAGGTGCATGGCAGGTCCTTCTCGCGTTGGCTGGCAGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCCCCCACAGGTACTGCACAAGGCTCCACTGGTATCCATCTGCTTTAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCAGCCTCAcatcat > 2:62760/1‑150 (MQ=255) tGGGTCAGGTGCATGGCAGGTCCTTCTCGCGTTGGCTGGCAGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCCCCCACAGGTACTGCACAAGGCTCAAATCCTGTGCAGGCCCTGTAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCAGCCTCACATCATa < 1:76645/150‑1 (MQ=255) aGGTGCATGGCAGGTCCTTCTCGCGTTGGCTGGCAGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCCCCCACAGGTACTGCACAAGGCTCAAATCCTGTGCAGGCCCTGTAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCAGCCTCACATCATAGGCCGc > 1:1941902/1‑150 (MQ=255) aGGTGCATGGCAGGTCCTTCTCGCGTTGGCTGGCAGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCCCCCACAGGTACTGCACAAGGCTCAAATCCTGTGCAGGCCCTGTAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCAGCCTCACATCATAGGCCGc > 1:1942311/1‑150 (MQ=255) gTGCATGGCAGGTCCTTCTCGCGTTGGCTGGCAGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCCCCCACAGGGACTGCACAAGGCTCAAATCCTGTGCAGGCCCTGTAGCGGGTGTACCCGCGAAGATGCCATCAGCCTCACATCATAagcagcat > 2:1086277/1‑148 (MQ=255) tGCATGGCAGGTCCTTCTCGCGTTGGCTGGCAGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCCCCCACAGGTACTGCACAAGGCTCAAATCCTGTGCAGGCCCTGTAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCAGCCTCACATCATAGGCCGCttt > 1:1511392/1‑150 (MQ=255) tGCATGGCAGGTCCTTCTCGCGTTGGCTGGCAGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCCCCCACAGGTACTGCACAAGGCTCAAATCCTGTGCAGGCCCTGTAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCAGCCTCACATCATAGGCCGCttt < 2:2113044/150‑1 (MQ=255) gCATGGCAGGTCCTTCTCGCGTTGGCTGGCAGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCCCCCACAGGTACTGCACAAGGCTCAAATCCTGTGCAGGCCCTGTAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCAGCCTCACATCATAGGCCGCTTtc < 1:2447877/150‑1 (MQ=255) cATGGCAGGTCCTTCTCGCGTTGGCTGGCAGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCCCCCACAGGTACTGCACAAGGCTCAAATCCTGTGCAGGCCCTGTAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCAGCCTCACATCATAGGCCGCTTtcc < 2:1471955/150‑1 (MQ=255) cATGGCAGGTCCTTCTCGCGTTGGCTGGCAGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCCCCCACAGGTACTGCACAAGGCTCAAATCCTGTGCAGGCCCTGTAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCAGCCTCACATCATAGGCCGCTTtcc > 2:804823/1‑150 (MQ=255) aTGGCAGGTCCTTCTCGCGTTGGCTGGCAGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCCCCCACAGGTACTGCACAAGGCTCAAATCCTGTGCAGGCCCTGTAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCAGCCTCACATCATAGGCCGCTTtcca < 1:1314180/150‑1 (MQ=255) ggTCCTTCTCGCGTTGGCTGGCAGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCCCCCACAGGTACTGCACAAGGCTCAAATCCTGTGCAGGCCCTGTAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCAGCCTCACATCATAGGCCGCTTTCCATCCAac > 2:1493138/1‑150 (MQ=255) gTCCTTCTCGCGTTGGCTGGCAGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCCCCCACAGGTACTGCACAAGGCTCAAATCCTGTGCAGGCCCTGTAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCAGCCTCACATCATAGGCCGCTTTCCATCCAaca > 1:1039335/1‑150 (MQ=255) cTTCTCGCGTTGGCTGGCAGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCCCCCACAGGTACTGCACAAGGCTCAAATCCTGTGCAGGCCCTGTAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCAGCCTCACATCATAGGCCGCTTTCCATCCAACACcg > 1:2366110/1‑150 (MQ=255) tcGCGTTGGCTGGCAGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCCCCCACAGGTACTGCACAAGGCTCAAATCCTGTGCAGGCCCTGTAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCAGCCTCACATCATAGGCCGCTTtccatc < 1:1700594/138‑1 (MQ=255) tcGCGTTGGCTGGCAGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCCCCCACAGGTACTGCACAAGGCTCAAATCCTGTGCAGGCCCTGTAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCAGCCTCACATCATAGGCCGCTTtccatc > 2:1700594/1‑138 (MQ=255) tggcAGGGACTCTTCGCGGGTGGACCCGCCCCCACAGGTACTGCACAAGGCTCAAATCCTGTGCAGGCCCTGTAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCAGCCTCACATCATAGGCCGCTTTCCATCCAACACCGCGCCCCGATTCACg > 2:148037/1‑150 (MQ=255) gcAGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCCCCCACAGGTACTGCACAAGGCTCAAATCCTGTGCAGGCCCTGTAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCAGCCTCACATCATAGGCCGCTTTCCATCCAACACCGCGCCCCGATTCACGGt > 2:766882/1‑150 (MQ=255) gcAGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCCCCCACAGGTACTGCACAAGGCTCAAATCCTGTGCAGGCCCTGTAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCAGCCTCACATCATAGGCCGCTTTCCATCCAACACCGCGCCCCGATTCACGGt > 2:812216/1‑150 (MQ=255) GCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCCCCCACAGGTACTGCACAAGGCTCAAATCCTGTGCAGGCCCTGTAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCAGCCTCACATCATAg > 1:932176‑M1/1‑108 (MQ=255) CCTCTTCGCGGGTGAACCCGCCCCCACAGGTACTGCACAAGGCTCAAATCCTGTGCAGGCCCTGTAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATc > 1:926897‑M1/1‑92 (MQ=255) CCTCTTCGCGGGTGAACCCGCCCCCACAGGTACTGCACAAGGCTCAAATCCTGTGCAGGCCCTGTAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATc < 2:926897‑M1/92‑1 (MQ=255) CTCTTCGCGGGTGAACCCGCCCCCACAGGTACTGCACAAGGCTCAAATCCTGTGCAGGCCCTGTAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCAGCCTCACATCATAGGCCGCTTTCCATCCAACACCGCGCCCCGATTCACGGTTTggcgg < 1:386529‑M1/150‑1 (MQ=255) TCTTCGCGGGTGAACCCGCCCCCACAGGTACTGCACAAGGCTCAAATCCTGTGCAGGCCCTGTAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCAGCCTCACATCATAGGCCGCTTTCCATCCAACACCGCGCCCCGATTCACGGTTTggcggc < 2:1823121‑M1/150‑1 (MQ=255) TTCGCGGGTGAACCCGCCCCCACAGGTACTGCACAAGGCTCAAATCCTGTGCAGGCCCTGTAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCAGCCTCACATCATAGGCCGCTTTCCATCCAACACCGCGCCCCGATTCACGGTTTGGCGGCCa < 1:60056‑M1/150‑1 (MQ=255) gtaaacccgctacagggcctgcacaggatttgagccttgtgcagtacctgtgggggcgggttcacccgcgaagaggccATCAGCCTCACATCATAGGCCGCTTTCCATCCAACACCGCGCCCCGATTCACGGTTTGGCGGCCACCGCCAc > 2:2314827‑M2/79‑150 (MQ=255) 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cGCCCCCACAGGTACTGCACAAGGCTCAAATCCTGTGCAGGCCCTGTAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCAGCCTCACATCATAGGCCGCTTTCCATCCAACACCGCGCCCCGATTCACGGTTTGGCGGCCACCGCCACGTAGCCt > 2:2261549/1‑150 (MQ=255) ctacagggcctgcacaggatttgagccttgtgcagtacctgtgggggcgggttcacccgcgaagaggccATCAGCCTCACATCATAGGCCGCTTTCCATCCAACACCGCGCCCCGATTCACGGTTTGGCGGCCACCGCCACGTAGCCttt < 1:2314827‑M2/81‑1 (MQ=255) ctacagggcctgcacaggatttgagccttgtgcagtacctgtgggggcgggttcacccgcgaagaggccATCAGCCTCACATCATAGGCCGCTTTCCATCCAACACCGCGCCCCGATTCACGGTTTGGCGGCCACCGCCACGTAGCCttt > 1:1889818‑M2/70‑150 (MQ=255) cccccACAGGTACTGCACAAGGCTCAAATCCTGTGCAGGCCCTGTAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCAGCCTCACATCATAGGCCGCTTTCCATCCAACACCGCGCCCCGATTCACGGTTTGGCGGCCACCGCCACGTAGCCttt < 2:2109600/150‑1 (MQ=255) cccACAGGTACTGCACAAGGCTCAAATCCTGTGCAGGCCCTGTAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCAGCCTCACATCATAGGCCGCTTTCCATCCAACACCGCGCCCCGATTCACGGTTTGGCGGCCACCGCCACGTAGCCTTTGa < 1:432771/150‑1 (MQ=255) 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tACCCGCGAAGAGGCCATCAGCCTCACATCCTAGGCCGCTTTCCATCCAACACCGCGCCCCGATTCACGGTTTGGCGGCCACCGCCACGTAGCCTTTGACCGCAGCCGGTGCCTGGGGCTTGGCCTTGTGCGCCAGCAGGTACTGATAGc < 2:1275745/150‑1 (MQ=255) tACCCGCGAAGAGGCCATCAGCCTCACATCATAGGCCGCTTTCCATCCAACACCGCGCCCCGATTCACGGTTTGGCGGCCACCGCCACGTAGCCTTTGACCGCAGCCGGTGCCTTGGGCTTGGCCTTGTGCGCCAGCAGGTACTGATAGc < 1:2358119/150‑1 (MQ=255) tACCCGCGAAGAGGCCATCAGCCTCACATCATAGGCCGCTTTCCATCCAACACCGCGCCCCGATTCACGGTTTGGCGGCCACCGCCACGTAGCCTTTGACCGCAGCCGGTGCCTTGGGCTTGGCCTTGTGCGCCAGCAGGTACTGATAGc < 2:1944195/150‑1 (MQ=255) ccgngaagaggccATCAGCCTCACATCATAGGCCGCTTTCCATCCAACACCGCGCCCCGATTCACGGTTTGGCGGCCACCGCCACGTAGCCTTTGACCGCAGCCGGTGCCTTGGGCTTGGCCTTGTGCGCCAGCAGGTACTGATAGCGTc > 2:1506545‑M2/14‑150 (MQ=255) ccgcgaagaggccATCAGCCTCACATCATAGGCCGCTTTCCATCCAACACCGCGCCCCGATTCACGGTTTGGCGGCCACCGCCACGTAGCCTTTGACCGCAGCCGGTGCCTTGGGCtt < 2:403007‑M2/105‑1 (MQ=255) ccgcgaagaggccATCAGCCTCACATCATAGGCCGCTTTCCATCCAACACCGCGCCCCGATTCACGGTTTGGCGGCCACCGCCACGTAGCCTTTGACCGCAGCCGGTGCCTTGGGCTTGGCCTTGTGCGCCAGCAGGTACTGATAGCGTc > 2:269336‑M2/14‑150 (MQ=255) ccgcgaagaggccATCAGCCTCACATCATAGGCCGCTTTCCATCCAACACCGCGCCCCGATTCACGGTTTGGCGGCCACCGCCACGTAGCCTTTGACCGCAGCCGGTGCCTTGGGCTTGGCCTTGTGCGCCAGCAGGTACTGATAGCGTc > 2:820517‑M2/14‑150 (MQ=255) ccgcgaagaggccATCAGCCTCACATCATAGGCCGCTTTCCATCCAACACCGCGCCCCGATTCACGGTTTGGCGGCCACCGCCACGTAGCCTTTGACCGCAGCCGGTGCCTTGGGCTTGGCCTTGTGCGCCAGCAGGTACTGATAGCGTc > 1:2067045‑M2/14‑150 (MQ=255) ccgcgaagaggccATCAGCCTCACATCATAGGCCGCTTTCCATCCAACACCGCGCCCCGATTCACGGTTTGGCGGCCACCGCCACGTAGCCTTTGACCGCAGCCGGTGCCTTGCGCTTGGCCGTGTGCGGCGCCGTGGACTGATAGCGTc > 2:2358967‑M2/14‑150 (MQ=255) ccgcgaagaggccATCAGCCTCACATAATAGGCCGCTTTCCATCCAACACCGCGCCCCGATTCACGGTTTGGCGGCCACCGCCACGTAGCCTTTGACCGCAGCCGGTGCCTTGGGCTTGGCCTTGTGCGCCAGCAGGTACTGATAGCGTc > 2:382275‑M2/14‑150 (MQ=255) gcgaagaggccATCAGCCTCACATCATAGGCCGCTTtccatcc < 1:811271‑M2/32‑1 (MQ=255) gcgaagaggccATCAGCCTCACATCATAGGCCGCTTtccatcc > 2:811271‑M2/12‑43 (MQ=255) gcgaagaggccATCAGCCTCACATCATAGGCCGCTTTCCATCCAACACCGCGCCCCGATTCACGGTTTGGCGGCCACCGCCACGTAGCCTTTGACCGCAGCCGGTGCCTTGGGCTTGGCCTTGTGCGCca > 1:332843‑M2/12‑130 (MQ=255) gcgaagaggccATCAGCCTCACATCATAGGCCGCTTTCCATCCAACACCGCGCCCCGATTCACGGTTTGGCGGCCACCGCCACGTAGCCTTTGACCGCAGCCGGTGCCTTGGGCTTGGCCTTGTGCGCCAGCAGGTACTGATAGCGTCGc < 1:1753778‑M2/139‑1 (MQ=255) cgaagaggccATCAGCCTCACATCATAGGCCGCTTTCCATCCAACACCGCGCCCCGATTCACGGTTTGGCGGCCACCGCCACGTAGCCTTTGACCGCAGCCGGTGCCTTGGGCTTGGCCTTGTGCGCCAGCAGGTACTGATAGCGTCGcc < 1:820517‑M2/140‑1 (MQ=255) gccATCAGCCTCACATCATAGGCCGCTTTCCATCCAACACCGCGCCCCGATTCACGGTTTGGCGGCCACCGCCACGTAGCCTTTGACCGCAGCCGGTGCCTTGGGCTTGGCCTTGTGCGCCAGCAGGTACTGATAGCGTCGCCATTCCtt < 2:1990755‑M2/147‑1 (MQ=255) gccATCAGCCTCACATCATAGGCCGCTTTCCATCCAACACCGCGCCCCGATTCACGGTTTGGCGGCCACCGCCACGTAGCCTTTGACCGCAGCCGGTGCCTTGGGCTTGGCCTTGTGCGCCAGCAGGTACTGATAGCGTCGCCATTCCtt > 1:1651162‑M2/4‑150 (MQ=255) gccATCAGCCTCACATCATAGGCCGCTTTCCATCCAACACCGCGCCCCGATTCACGGTTTGGCGGCCACCGCCACGTAGCCTTTGACCGCAGCCGGTGCCTTGGGCTTGGCCTTGTGCGCCAGCAGGTACTGATAGCGTCGCCATTCCtt > 1:879629‑M2/4‑150 (MQ=255) ccATCAGCCTCACATCATAGGCCGCTTTCCATCCAACACCGCGCCCCGATTCACGGTTTGGCGGCCACCGCCACGTAGCCTTTGACCGCAGCCGGTGCCTTGGGCTTGGCCTTGTGCGCCAGCAGGTACTGATAGCGTCGCCATTCCTTg < 2:2277273‑M2/148‑1 (MQ=255) aTCAGCCTCACATCATAGGCCGCTTTCCATCCAACACCGCGCCCCGATTCACGGTTTGGCGGCCACCGCCACGTAGCCTTTGACCGCAGCCGGTGCCTTGGGCTTGGCCTTGTGCGCCAGCAGGTACTGATAGCGTCGCCATTCCTTGTc > 1:1556398/1‑150 (MQ=255) | TGGCCGGATGGGGCGGTGGGTCAGGTGCATGGCAGGTCCTTCTCGCGTTGGCTGGCAGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCCCCCACAGGTACTGCACAAGGCTCAAATCCTGTGCAGGCCCTGTAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCAGCCTCACATCATAGGCCGCTTTCCATCCAACACCGCGCCCCGATTCACGGTTTGGCGGCCACCGCCACGTAGCCTTTGACCGCAGCCGGTGCCTTGGGCTTGGCCTTGTGCGCCAGCAGGTACTGATAGCGTCGCCATTCCTTGTC > NC_002947/967795‑968093 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |