| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_002947 | 1719958 = | 95 (1.020) | 6 (0.070) | 5/244 | NT | 6.4% | coding (95/642 nt) | PP_1515 | Transcriptional regulator, tetR family |
| ? | NC_002947 | 1720004 = | 84 (0.920) | coding (49/642 nt) | PP_1515 | Transcriptional regulator, tetR family | |||||
Only 100 of 114 total aligned reads displayed.
GTCTGCTTGTCGGTGAAGTGGCTGTAGACGGTGAGCTTTGAAACACCTGCCGCCGCAGCGACCGCATCCATGCTGGTGTTGGCGTAGCCAAGGCTGAGGAACAGGGCCTTGGCCGCTTCGAGGATCGCCTCGCGCTTGGCCAGGTCCTTGGGCCGGCCTGGGCCGATGGGTGCGTCGTTGAGCATTGTGGTCTGCATCTGGTTTAAGAATCCCCATCTTAACGGGTCAGCTGCGATACGGCTAAAACTAGCTCACATTTACCTGCGGCCTGCCAGCGTTGAGTTGATCGACAGGGTGG > NC_002947/1719856‑1720153 | ctagttttagccgtatcgcagctgacccgttaagatggggattcttaaaccagatgcagaccacaatgctcaacgacgcacccatcggcccaggccggcccaAGGGCCTTGGCCGCTTCGAGGATCGCCTCGCGCTTGGCCAGGTCCTTg > 1:1689811‑M1/103‑150 (MQ=255) gttttagccgtatcgcagctgacccgttaagatggggattcttaaaccagatgcagaccacaatgctcaacgacgcacccatcggcccaggccggcccaAGGGCCTTGGCCGCTTCGAGGATCGCCTCGCGCTTGGCCAGGTCCTTGggc > 2:1769192‑M1/100‑150 (MQ=255) gTCGGTGAAGTGGCTGTAGACGGTGAGCTTTGAAACACCTGCCGCCGCAGCGACCGCATCCATGCTGGTGTTGGCGTAGCCAAGGCTGAGGAACAGGGCCTTGGCCGCTTCGAGGATCGCCTCGCGCTTGGCCAGGTCCTTGggccggcc > 2:1601561/1‑150 (MQ=255) tCGGTGAAGTGGCTGTAGACGGTGAGCTTTGAAACACCTGCCGCCGCAGCGACCGCATCCATGCTGGTGTTGGCGTAGCCAAGGCTGAGGAACAGGGCCTTGGCCGCTTCGAGGATCGCCTCGCGCTTGGCCAGGTCCTTGGGCCGGCCt > 1:2207450/1‑150 (MQ=255) cGGTGAAGTGGCTGTAGACGGTGAGCTTTGAAACACCTGCCGCCGCAGCGACCGCATCCATGCTGGTGTTGGCGTAGCCAAGGCTGAGGAACAGGGCCTTGGCCGCTTCGAGGATCGCCTCGCGCTTGGCCAGGTCCTTGGGCCGGCCTg < 2:678209/150‑1 (MQ=255) ggTGAAGTGGCTGTAGACGGTGAGCTTTGAAACACCTGCCGCCGCAGCGACCGCATCCATGCTGGTGTTGGCGTAGCCAAGGCTGAGGAACAGGGCCTTGGCCGCTTCGAGGATCGCCTCGCGCTTGGCCAGGTCCTTGGGCCGGCCTgg < 2:1808445/150‑1 (MQ=255) ggTGAAGTGGCTGTAGACGGTGAGCTTTGAAACACCTGCCGCCGCAGCGACCGCATCCATGCTGGTGTTGGCGTAGCCAAGGCTGAGGAACAGGGCCTTGGCCGCTTCGAGGATCGCCTCGCGCTTGGCCAGGTCCTTGGGCCGGCCTgg < 1:1601561/150‑1 (MQ=255) gTGAAGTGGCTGTAGACGGTGAGCTTTGAAACACCTGCCGCCGCAGCGACCGCATCCATGCTGGTGTTGGCGTAGCCAAGGCTGAGGAACAGGGCCTTGGCCGCTTCGAGGATCGCCTCGCGCTTGGCCAGGTCCTTGGGCCGGCCTggg < 2:764511/150‑1 (MQ=255) tGAAGTGGCTGTAGACGGTGAGCTTTGAAACACCTGCCGCCGCAGCGACCGCATCCATGCTGGTGTTGGCGTAGCCAAGGCTGAGGAACAGGGCCTTGGCCGCTTCGAGGATCGCCTCGCGCTTGGCCAGGTCCTTGGGCCGGCCTGGGc < 1:370922/150‑1 (MQ=255) tGAAGTGGCTGTAGACGGTGAGCTTTGAAACACCTGCCGCCGCAGCGACCGCATCCATGCTGGTGTTGGCGTAGCCAAGGCTGAGGAACAGGGCCTTGGCCGCTTCGAGGATCGCCTCGCGCTTGGCCAGGTCCTTGGGCCGGCCTGGGc < 2:816607/150‑1 (MQ=255) gCTGTAGACGGTGAGCTTTGAAACACCTGCCGCCGCAGCGACCGCATCCATGCTGGTGTTGGCGTAGCCAAGGCTGAGGAACAGGGCCTTGGCCGCTTCGAGGATCGCCTCGCGCTTGGCCAGGTCCTTgg < 1:1267986/131‑1 (MQ=255) tGTAGACGGTGAGCTTTGAAACACCTGCCGCCGCAGCGACCGCATCCATGCTGGTGATGGCGTAGCCAAGGCTGAGGAACAGGGCCTTGGCCGCTTCGAGGATCGCCTCGCGCTTGGCCAGGTCCTTGGGCCGGCCTGGGCCGATGGGTg > 2:273665/1‑150 (MQ=255) gTAGACGGTGAGCTTTGAAACACCTGCCGCCGCAGCGACCGCATCCATGCTGGTGTTGGCGTAGCCAAGGCTGAGGAACAGGGCCTTGGCCGCTTCGAGGATCGCCTCGCGCTTGGCCAGGTCCTTGGGCCGGCCTGGGCCGATGGGTGc < 2:2177144/150‑1 (MQ=255) 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1:72122/127‑1 (MQ=255) tCGCGCTTGGCCAGGTCCTTGGGCCGGCCTGGGCCGATGGGTGCGTCGTTGAGCATTGTGGTCTGCATCTGGTTTAAGAATCCCCATCTTAACGGGTCAGCTGCGATACGGCTAAAACTAGCTCACATTTACCTGCGGCCTGCCAGCgtt > 1:2004946/1‑150 (MQ=255) gcTTGGCCAGGTCCTTGGGCCGGCCTGGGCCGATGGGTGCTTCGTTGAGCATTGTGGTCTGCATCTGGTTTAAGAATCCCCATCTTAACGGGTCAGCTGCGATACGGCTAAAACTAGCTCACATTTACCTGCGGCCTGCCAGCgttgagt < 1:1052778/150‑1 (MQ=255) gcTTGGCCAGGTCCTTGGGCCGGCCTGGGCCGATGGGTGCGTCGTTGAGCATTGTGGTCTGCATCTGGTTTAAGAATCCCCATCTTAACGGGTCAGCTGCGATACGGCTAAAACTAGCTCACATTTACCTGCGGCCTGCCAGCgttgagt > 2:1725771/1‑150 (MQ=255) gcTTGGCCAGGTCCTTGGGCCGGCCTGGGCCGATGGGTGCGTCGTTGAGCATTGTGGTCTGCATCTGGTTTAAGAATCCCCATCTTAACGGGTCAGCTGCGATACGGCTAAAACTAGCTCACATTTACCTGCGGCCTGCCAGCgttgagt < 1:2163112/150‑1 (MQ=255) ttGGCCAGGTCCTTGGGCCGGCCTGGGCCGATGGGTGCGTCGTTGAGCATTGTGGTCTGCATCTGGTTTAAGAATCCCCATCTTAACGGGTCAGc < 1:843012/95‑1 (MQ=255) ttGGCCAGGTCCTTGGGCCGGCCTGGGCCGATGGGTGCGTCGTTGAGCATTGTGGTCTGCATCTGGTTTAAGAATCCCCATCTTAACGGGTCAGc > 2:843012/1‑95 (MQ=255) ggCCAGGTCCTTGGGCCGGCCTGGGCCGATGGGTGCGTCGTTGAGCATTGTGGTCTGCATCTGGTTTAAGAATCCCCATCTTAACGGGTCAGCTGCGATACGGCTAAAACTAGCTCACATTTACCTGCGGCCTGCCAGCGTTGAGTTGAt > 2:114041/1‑150 (MQ=255) gCCAGGTCCTTGGGCCGGCCTGGGCCGATGGGTGCGTCGTTGAGCATTGTGGTCTGCATCTGGTTTAAGAATCCCCATCTTAACGGGTCAGCTGCGATACGGCTAAAACTAGCTCACATTTACCTGCGGCCTGCCAGCGTTGAGTTGATc < 1:1571150/150‑1 (MQ=255) ccAGGTCCTTGGGCCGGCCTGGGCCGATGGGTGCGTCGTTGAGCATTGTGGTCTGCATCTGGTTTAAGAATCCCCATCTTAACGGGTCAGCTGCGATACGGCTAAAACTAGCTCACATTTACCTGCGGCCTGCCAGCGTTGAGTTGATCg > 2:1426611/1‑150 (MQ=255) cAGGTCCTTGGGCCGGCCTGGGCCGATGGGTGCGTCGTTGAGCATTGTGGTCTGCATCTGGTTTAAGAATCCCCATCTTAACGGGTCAGCTGCGATACGGCTAAAACTAGCTCACATTTACCTGCGGCCTGCCAGCGTTGAGTTGATCGa > 1:473541/1‑150 (MQ=255) ggTCCTTGGGCCGGCCTGGGCCGATGGGTGCGTCGTTGAGCATTGTGGTCTGCATCTGGTTTAAGAATCCCCATCTTAACGGGTCAGCTGCGATACGGCTAAAACTAGCTCACATTTACCTGCGGCCTGCCAGCGTTGAGTTGATCGACa < 1:283412/150‑1 (MQ=255) ggTCCTTGGGCCGGCCTGGGCCGATGGGTGCGTCGTTGAGCATTGTGGTCTGCATCTGGTTTAAGAATCCCCATCTTAACGGGTCAGCTGCGATACGGCTAAAACTAGCTCACATTTACCTGCGGCCTGCCAGCGTTGAGTTGATCGACa < 1:197997/150‑1 (MQ=255) gTCCTTGGGCCGGCCTGGGCCGATGGGTGCGTCGTTGAGCATTGTGGTCTGCATCTGGTTTAAGAATCCCCATCTTAACGGGTCAGCTGCGATACGGCTAAAACTAGCTCACATTTACCTGCGGCCTGCCAGCGTTGAGTTGATCGACAg > 2:1949715/1‑150 (MQ=255) tCCTTGGGCCGGCCTGGGCCGATGGGTGCGTCGTTGAGCATTGTGGTCTGCATCTGGTTTAAGAATCCCCATCTTAACGGGTCAGCTGCGATACGGCTAAAACTAGCTCACATTTACCTGCGGCCTGCCAGCGTTGAGTTGATCGACAgg < 1:1418681/150‑1 (MQ=255) ctTGGGCCGGCCTGGGCCGATGGGTGCGTCGTTGAGCATTGTGGTCTGCATCTGGTTTAAGAATCCCCATCTTAACGGGTCAGCTGCGATACGGCTAAAACTAGCTCACATTTACCTGCGGCCTGCCAGCGTTGAGTTGATCGACAGGGt < 1:1725771‑M2/148‑1 (MQ=255) ctTGGGCCGGCCTGGGCCGATGGGTGCGTCGTTGAGCATTGTGGTCTGCATCTGGTTTAAGAATCCCCATCTTAACGGGTCAGCTGCGATACGGCTAAAACTAGCTCACATTTACCTGCGGCCTGCCAGCGTTGAGTTGATCGACAGGGt < 1:1262620‑M2/148‑1 (MQ=255) ctTGGGCCGGCCTGGGCCGATGGGTGCGTCGTTGAGCATTGTGGTCTGCATCTGGTTTAAGAATCCCCATCTTAACAGCCGATCCGCGATACGGCTAAAACTAGCTCACATTTACCTGCGGCCTGCCAGCGTTGAGTTGATCGACAGGGt > 1:1861328‑M2/3‑150 (MQ=255) tTGGGCCGGCCTGGGCCGATGGGTGCGTCGTTGAGCATTGTGGTCTGCATCTGGTTTAAGAATCCCCATCTTAACGGGTCAGCTGCGATACGGCTAAAACTAGCTCACATTTAc < 2:1025136‑M2/113‑1 (MQ=255) tTGGGCCGGCCTGGGCCGATGGGTGCGTCGTTGAGCATTGTGGTCTGCATCTGGTTTAAGAATCCCCATCTTAACGGGTCAGCTGCGATACGGCTAAAACTAGCTCACATTTAc > 1:1025136‑M2/2‑114 (MQ=255) tTGGGCCGGCCTGGGCCGATGGGTGCGTCGTTGAGCATTGTGGTCTGCATCTGGTTTAAGAATCCCCATCTTAACGGGTCAGCTGCGATACGGCTAAAACTAGCTCACATTTACCTGCGGCCTGCCAGCGTTGAGTTGATCGACAGGGTg > 1:296271‑M2/2‑150 (MQ=255) tGGGCCGGCCTGGGCCGATGGGTGCGTCGTTGAGCATTGTGGTCTGCATCTGGTTTAAGAATCCCCATCTTAACGGGTCAGCTGCGATACGGCTAAAACTAGCTCACATTTACCTGCGGCCTGCCAGCGTTGAGTTGATCGACAGGGTgg < 1:2280680/150‑1 (MQ=255) | GTCTGCTTGTCGGTGAAGTGGCTGTAGACGGTGAGCTTTGAAACACCTGCCGCCGCAGCGACCGCATCCATGCTGGTGTTGGCGTAGCCAAGGCTGAGGAACAGGGCCTTGGCCGCTTCGAGGATCGCCTCGCGCTTGGCCAGGTCCTTGGGCCGGCCTGGGCCGATGGGTGCGTCGTTGAGCATTGTGGTCTGCATCTGGTTTAAGAATCCCCATCTTAACGGGTCAGCTGCGATACGGCTAAAACTAGCTCACATTTACCTGCGGCCTGCCAGCGTTGAGTTGATCGACAGGGTGG > NC_002947/1719856‑1720153 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |