New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 2056021 | 82 (0.880) | 4 (0.050) | 4/218 | NT | 6.0% | intergenic (+27/‑116) | aroC/PP_1831 | chorismate synthase/membrane protein |
? | NC_002947 | = 2056095 | 54 (0.660) | intergenic (+101/‑42) | aroC/PP_1831 | chorismate synthase/membrane protein |
AGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTG‑CCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCAGCTTCTACCTGTTCTATTTCGCCCTGCTGGGCTCCACCGCACCGTTCCTGGCGCTGTACTTCGACCACCT > NC_002947/2055948‑2056237 | aGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTG‑CCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCac < 2:769983‑M2/150‑3 (MQ=255) aGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGTGGGATATCACTG‑CCCTCAGGTGCAGGGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCac > 2:638686‑M2/1‑148 (MQ=255) aTGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTG‑CCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCacccgcgaaga > 1:354184‑M2/1‑139 (MQ=255) gtgCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTG‑CCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCacccgcgaagagg > 1:2081849‑M2/1‑137 (MQ=255) gTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTG‑CCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAggccggcc > 2:1925666/1‑150 (MQ=255) aaTACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTG‑CCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAg > 2:2052532/1‑150 (MQ=255) aaTACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTG‑CCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAg < 2:1157940/150‑1 (MQ=255) aaTACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTG‑CCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAg < 2:2211880/150‑1 (MQ=255) aaTACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTG‑CCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAg < 2:1892176/150‑1 (MQ=255) aaTACCCCGGTGCTGGGACAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTACGAGGGCAAACACGCTCCTACTGTCGGAAATC‑CTGCCCCTCAGGTGTAGTGGCAGGGTGAAAGCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAg < 2:1463817/150‑1 (MQ=255) aTACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTG‑CCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAgg < 1:2052532/150‑1 (MQ=255) aCCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTG‑CCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCacccgcgaagaggc > 2:922242‑M2/1‑125 (MQ=255) aCCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTG‑CCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCacccgcgaagaggc < 1:922242‑M2/139‑15 (MQ=255) cccGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTG‑CCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTccc > 2:808862/1‑150 (MQ=255) cccGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTG‑CCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTccc < 2:542459/150‑1 (MQ=255) cccGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCGCCTACATTGGGATATCACTG‑CCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTccc > 1:2038751/1‑150 (MQ=255) cGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTG‑CCCTCAGGTGCAGTAACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCca < 2:2038751/150‑1 (MQ=255) gCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTG‑CCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAg < 1:1191249/150‑1 (MQ=255) cTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTG‑CCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAgg < 1:1479347/150‑1 (MQ=255) tGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTG‑CCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGc > 1:2423809/1‑150 (MQ=255) ccAGCGCTGACCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTG‑CCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCTCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCAcc < 1:1028447/150‑1 (MQ=255) gATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTG‑CCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCaa < 2:1694015/150‑1 (MQ=255) cAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTG‑CCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCacccgcgaagaggc > 2:1273416‑M2/1‑99 (MQ=255) cAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTG‑CCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCacccgcgaagaggc < 1:1273416‑M2/113‑15 (MQ=255) aaCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTG‑CCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATccccga > 1:2434110/1‑148 (MQ=255) aCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTG‑CCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTAc < 1:2236611/150‑1 (MQ=255) gCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTG‑CCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGCAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTACTgg > 2:239895/1‑150 (MQ=255) ttCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTG‑CCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTACTGGCGCCt > 1:408063/1‑150 (MQ=255) cgGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCAATG‑ACCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCacccgcgaagaggccgttgcagttggatcagcgctggcccagcaccggggtattcacttgcacatcggcat < 1:1045525‑M2/150‑72 (MQ=255) tAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTG‑CCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCAGCt < 1:808862/150‑1 (MQ=255) cccGCTCCTACATTGGGATATCACTG‑CCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCGGTTGATGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCAGCTTCTa < 1:626349/150‑1 (MQ=255) ccGCTCCTACATTGGGATATCACTG‑CCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCAGCTTCTAc < 2:2095884/150‑1 (MQ=255) cGCTCCTACATTGGGATATCACTG‑CCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCacccgcgaagaggccgttgcagttggatcagcgctggcccagcaccggggtattcacttgcacatcggcagtctgcgcacg < 2:1147916‑M2/150‑82 (MQ=255) cGCTCCTACATTGGGATATCACTG‑CCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCacccgcgaa > 2:2020835‑M2/1‑69 (MQ=255) cGCTCCTACATTGGGATATCACTG‑CCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCacccgcgaa < 1:2020835‑M2/78‑10 (MQ=255) gCTCCTACATTGGGATATCACTG‑CCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACaa < 1:1382264/100‑1 (MQ=255) gCTCCTACATTGGGATATCACTG‑CCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACaa > 2:1382264/1‑100 (MQ=255) gCTCCTACATTGGGATATCACTG‑CCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCAGCTTCTACCt < 1:272667/150‑1 (MQ=255) tCCTACATTGGGATATCACTG‑CCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAAc < 2:1979445/114‑1 (MQ=255) tCCTACATTGGGATATCACTG‑CCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAAc > 1:1979445/1‑114 (MQ=255) cATTGGGATATCACTG‑CCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCAccc > 1:606399/1‑101 (MQ=255) cATTGGGATATCACTG‑CCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCAccc < 2:606399/101‑1 (MQ=255) aTTGGGATATCACTG‑CCGTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAACTCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAAGCCGGCTCAGGTCCACACAAGGCCAACACATGCAAACCATCCCCTACTGGCGACTGTCTAGCTTCTCCCTGATGTAtt > 2:816030/1‑150 (MQ=255) gggATATCACTG‑CCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCATCCCATGCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCAGCTTCTACCTGTTCTATTTCg > 2:868116/1‑150 (MQ=255) gATATCACTG‑CCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCAGCTTCTACCTGTTCTATTTCGcc > 2:540614/1‑150 (MQ=255) gATATCACTG‑CCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCAGCTTCTACCTGTTCTATTTCGcc > 1:337622/1‑150 (MQ=255) atatCACTG‑CCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACaa > 1:2261545/1‑86 (MQ=255) atatCACTG‑CCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACaa < 2:2261545/86‑1 (MQ=255) tatCACTG‑CCCTCAGTTTCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCacccgcgaagaggccgttgcagttcgatcagcgctggcccagcaccggggtattcacttgcacatcggcattctgcgcacggtggcgcagcaggtgg > 2:1045525‑M2/1‑53 (MQ=255) cACTG‑CCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCAGCTTCTACCTGTTCTATTTCGCCctgct > 2:925068/1‑150 (MQ=255) ccTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCAGCTTCTACCTGt < 2:1384050/128‑1 (MQ=255) ccTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCAGCTTCTACCTGt > 1:1384050/1‑128 (MQ=255) ccTCAGGCGCAGTGACACGGTCAAATCCGCGCAGGAGCGGTTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCCTCCCCTACTGGCGCCTGTCCAGCTTCTACCTGTTCTATTTCGCCCTGCTGGGCTc < 1:1840075/150‑1 (MQ=255) cAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGCAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGTCCACCCCATGCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCAGCTTCTACCTGTTCTATTTCGCCCTGCTGGGCTCcac < 2:1460967/150‑1 (MQ=255) cAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTCCAACAGCGACGACGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCAGCTTCTACCTGTTCTATTTCGCCCTGCTGGGCTCcac < 2:1461344/150‑1 (MQ=255) aGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCAGCTTCTACCTGTTCTATTTCGCCCTGCTGGGCTCcaccgcaccg > 1:504203/1‑150 (MQ=255) tGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTc < 2:1491707/102‑1 (MQ=255) tGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTc > 1:1491707/1‑102 (MQ=255) aCAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCAGCTTCTACCTGTTCTATTTc > 2:1624726/1‑122 (MQ=255) aCAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCAGCTTCTACCTGTTCTATTTc < 1:1624726/122‑1 (MQ=255) aCAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCAGCTTCTACCTGTTCTATTTCGCCCTGCTGGGCTCCACCGCACCGTTcc > 2:1777841/1‑150 (MQ=255) ggTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCAGCTTCTACCTGTTCTATTTCGCCCTGCTGGGCTCCACCGCACCGTTCCTGgc < 1:239895/150‑1 (MQ=255) tGAACTCCGCGTAGGAGCGGGTTCacccgcgaagaggccgttgcagttggatcagcgctggcccagcaccggggtattcacttgcacatcggcattctgcgcacggtggcgcagcaggtggtccagcaacgcaatggccatcatcgcctc > 1:1147916‑M2/1‑24 (MQ=255) tGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCAGCTTCTACCTGTTCTATTTCGCCCTGCTGGGCTCCACCGCACCGTTCCTGgcgc < 1:1925666/150‑1 (MQ=255) tGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCAGCTTCTACCTGTTCTATTTCGCCCTGCTGGGCTCCACCGCACCGTTCCTGgcgc > 2:902887/1‑150 (MQ=255) aTCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCATGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTTCTGGCGCCTGTCCAGCTTCTACCTGTTCTa < 1:306985/108‑1 (MQ=255) aTCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCAGCTTCTACCTGTTCTa > 2:306985/1‑108 (MQ=255) gAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCAGCTTCTACCTGTTCTATTTCGCCCTGCTGGGCTCCACCGCACCGTTCCTGGCGCTGTACTTCGaccac < 1:1777841/150‑1 (MQ=255) gCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCAGCTTCTACCTGTTCTATTTCGCCCTGCTGGGCTCCACCGCACCGTTCCTGGCGCTGTACTTCGACCACCt > 1:1190356/1‑150 (MQ=255) | AGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTG‑CCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCAGCTTCTACCTGTTCTATTTCGCCCTGCTGGGCTCCACCGCACCGTTCCTGGCGCTGTACTTCGACCACCT > NC_002947/2055948‑2056237 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |