| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_002947 | 2276019 = | 63 (0.680) | 8 (0.090) | 7/234 | NT | 11.2% | coding (1346/1644 nt) | PP_2006 | membrane protein |
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GTTACCCCACCCGCCACCACGCGCTCGATGATCACGTGGATGACGATGCTGACAATGGCCACCACCAACGCTGCGATGATGCCGACGATCAACGCCATCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTGCGCCCAGGATGGCTTCGGTGATGACCACCCAGGT‑‑GGCGATGTCTGTCGTGTTT‑TGGACATCCGGGTCTCCGACCATGGCATATACCATCACCTGTTCGCCCTTGTCGTTGACGCCCAGTTGCAGCGTCTGCTTGGTGACGATACGG > NC_002947/2275917‑2276210 | gTTACCCCACCCGCCACCACGCGCTCGATGATCACGTGGATGACGATGCTGACCATGGCCACCACCAACGCTACTCAGGTTCCGACGATCAACGCCATCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTgcg > 1:2122433/1‑150 (MQ=255) ttACCCCACCCGCCACCACGCGCTCGATGATCACGTGGATGACGATGCTGACAATGGCCACCACCAACGCTGCGATGATGCCGACGATCAACGCCATCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTgcgc < 1:1427892/150‑1 (MQ=255) ccccACCCGCCACCACGCGCTCGATGATCACGTGGATGACGATGCTGACAATGGCCACCACCAACGCTGCGATGATGCCGACGATCAACGCCATCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATGGCGCCCa > 2:1532479/1‑150 (MQ=255) cccACCCGCCACCACGCGCTCGATGATCACGTGGATGACGATGCTGACAATGGCCACCACCAACGCTGCGATGATGCCGACGATCAACGCCATCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTGCGCCCAg > 2:164803/1‑150 (MQ=255) cccACCCGCCACCACGCGCTCGATGATCACGTGGATGACGATGCTGACAATGGCCACCACCAACGCTGCGATGATGCCGACGATCAACGCCATCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTGCGCCCAg < 1:164803/150‑1 (MQ=255) cccACCCGCCACCACGCGCTCGATGATCACGTGGATGACGATGCTGACAATGGCCACCACCAACGCTGCGATGATGCCGACGATCAACGCCATCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTGCGCCCAg > 1:1620278/1‑150 (MQ=255) cACCCGCCACCACGCGCTCGATGATCACTTGGATGACGATGCTGACAATGGCCACCACCAACGCTGCGATGATGCCGACGATCAACGCCATCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTGCGCCCAGGa < 2:2399072/150‑1 (MQ=255) aCCCGCCACCACGCGCTCGATGATCACGTGGATGACGATGCTGACAATGGCCACCACCAACGCTGCGATGATGCCGACGATCAACGCCGTCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTGCGCCCAGGAt < 1:681424/150‑1 (MQ=255) ccGCCACCACGCGCTCGATGATCACGTGGATGACGATGCTGACAATGGCCACCACCAACGCTGCGATGATGCCGACGATCAACGCCATCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTGCGCCCAGGATgg < 2:1221335/150‑1 (MQ=255) ccGCCACCACGCGCTCGATGATCACGTGGATGACGATGCTGACAATGGCCACCACCAACGCTGCGATGATGCCGACGATCAACGCCATCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTGCGCCCAGGATgg > 2:2158302/1‑150 (MQ=255) caccacGCGCTCGATGATCACGTGGATGACGATGCTGACAATGGCCACCACCAACGCTGCGATGATGCCGACGATCAACGCCATCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTGCGCCCAGGATGGCTTc < 2:2395250/150‑1 (MQ=255) caccacGCGCTCGATGATCACGTGGATGACGATGCTGACAATGGCCACCACCAACGCTGCGATGATGCCGACGATCAACGCCATCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTGCGCCCAGGATGGCTTc > 1:2129606/1‑150 (MQ=255) accacGCGCTCGATGATCACGTGGATGACGATGCTGACAATGGCCACCACCAACGCTGCGATGATGCCGACGATCAACGCCATCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTgcgc < 2:405337/136‑1 (MQ=255) accacGCGCTCGATGATCACGTGGATGACGATGCTGACAATGGCCACCACCAACGCTGCGATGATGCCGACGATCAACGCCATCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTgcgc > 1:405337/1‑136 (MQ=255) accacGCGCTCGATGATCACGTGGATGACGATGCTGACAATGGCCACCACCAACGCTGCGATGATGCCGACGATCAACGCCATCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTGCGCCCAGGATGGCTTCg < 2:1854885/150‑1 (MQ=255) accacGCGCTCGATGATCACGTGGATGACGATGCTGACAATGGCCACCACCAACGCTGCGATGATGCCGACGATCAACGCCATCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTGCGCCCAGGATGGCTTCg < 2:251692/150‑1 (MQ=255) tCGATGATCACGTGGATGACGATGCTGACAATGGCCACCACCAACGCTGCGATGATGCCGACGATCAACGCCATCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTGCGCCCAGGATGGCTTCGGTGATGacc > 1:632370/1‑150 (MQ=255) gatgatCACGTGGATGACGATGCTGACAATGGCCACCACCAACGCTGCGATGATGCTGACGATCACGGCTATCACCTTGCCGCCCACTCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTGCGCCCAGGAGGGCGTCGGGTATTaccaa > 2:1155201/1‑149 (MQ=255) 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aTGCTGACAATGGCCACCACCAACGCTGCGATGATGCCGACGATCAACGCCATCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTGCGCCCAGGATGGCTTCGGTGATGACCACCCAGGT‑‑GGCGAtgtctgtc < 1:829329/150‑1 (MQ=255) aTGCTGACAATGGCCACCACCAACGCTGCGATGATGCCGACGATCAACGCCATCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTGCGCCCAGGATGGCTTCGGTGATGACCACCCAGGT‑‑GGCGAtgtctgtc < 2:2129606/150‑1 (MQ=255) tGACAATGGCCACCACCAACGCTGCGATGATGCCGACGATCAACGCCATCACCTTGCCGCCCACGCAACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTGCGCCCAGGATGGCTTCGGTGATGACCACCCAGGT‑‑GGCGATGTCTGTCgtgt > 2:1663189/1‑150 (MQ=255) gACAATGGCCACCACCAACGCTGCGATGATGCCGACGATCAACGCCATCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTGCGCCCAGGATGGCTTCGGTGATGACCACCCAGGT‑‑GGCGATGTCTGTCGTGtt > 1:1281557/1‑150 (MQ=255) cAATGGCCACCACCAACGCTGCGATGATGCCGACGATCAACGCCATCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTGCGCCCAGGATGGCTTCGGTGATGACCACCCAGGT‑‑GGCGATGTCTGTCGTGttt‑t < 1:816138/150‑1 (MQ=255) aaTGGCCACCACCAACGCTGCGATGATGCCGACGATCAACGCCATCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTGCGCCCAGGATGGCTTCGGTGATGACCACCCAGGT‑‑GGCGATGTCTGTCGTGTTT‑Tg > 2:350384/1‑150 (MQ=255) aaTGGCCACCACCAACGCTGCGATGATGCCGACGATCAACGCCATCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTGCGCCCAGGATGGCTTCGGTGATGACCACCCAGGT‑‑GGCGATGTCTGTCGTGTTT‑Tg < 2:2122433/150‑1 (MQ=255) aaTGGCCACCACCAACGCTGCGATGATGCCGACGATCAACGCCATCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTGCGCCCAGGATGGCTTCGGTGATGACCACCCAGGT‑‑GGCGATGTCTGTCGTGTTT‑Tg > 2:2254905/1‑150 (MQ=255) aTGGCCACCACCAACGCTGCGATGATGCCGACGATCAACGCCATCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTGCGCCCAGGATGGCTTCGGTGATGACCACCCAGGT‑‑GGCGATGTCTGTTGTGTTT‑Tgg < 1:2158302/150‑1 (MQ=255) aTGGCCACCACCAACGCTGCGATGATGCCGACGATCAACGCCATCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTGCGCCCAGGATGGCTTCGGTGATGACCACCCAGGT‑‑GGCGATGTCTGTCGTGTTT‑Tgg > 1:729779/1‑150 (MQ=255) tGGCCACCACCAACGCTGCGATGATGCCGACGATCAACGCCATCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTGCGCCCAGGATGGCTTCGGTGATGACCACCCAGGT‑‑GGCGATGTCTGTCGTGTTT‑TGGa < 1:371155/150‑1 (MQ=255) caccaccaACGCTGCGATGATGCCGACGATCAACGCCATCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTGCGCCCAGGATGGCTTCGGTGATGACCACCCAGGT‑‑GGCGATGTCTGTCGTGTTT‑TGGACATc > 1:2071848/1‑150 (MQ=255) accaccaACGCTGCGATGATGCCGACGATCAACGCCATCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTGCGCCCAGGATGGCTTCGGTGATGACCACCCAGGT‑‑GGCTAtgt < 2:1986188/130‑1 (MQ=255) accaccaACGCTGCGATGATGCCGACGATCAACGCCATCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTGCGCCCAGGATGGCTTCGGTGATGACCACCCAGGT‑‑GGCTAtgt > 1:1986188/1‑130 (MQ=255) caccaACGCTGCGATGATGCCGACGATCAACGCCATCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTGCGCCCAGGATGGCTTCGGTGATGCCCACCCAGGT‑‑GGCCATGTCTGTCGTGTTT‑TGGACATCCgg < 1:1232892/150‑1 (MQ=255) accaACGCTGCGATGATGCCGACGATCAACGCCATCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTGCGCCCAGGATGGCTTCGGTGATGACCACCCAGGT‑‑GGCGATGTCTGTCGTGTTT‑TGGACATCCggg > 2:1965984/1‑150 (MQ=255) accaACGCTGCGATGATGCCGACGATCAACGCCATCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTGCGCCCAGGATGGCTTCGGTGATGACCACCCAGGT‑‑GGCGATGTCTGTCGTGTTT‑TGGACATCCggg > 2:1653622/1‑150 (MQ=255) ccaACGCTGCGATGATGCCGACGATCAACGCCATCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTGCGGCCAGGATGGCTTAGGTGATGACCACCCAGGT‑‑GGCGATGTCTGCCGTGTTT‑TTGTCATCCGGGt < 2:1330882/150‑1 (MQ=255) cTGCGATGATGCCGACGATCAACGCCATCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTGCGCCCAGGATGGCTTCGGTGATGACCACCCAGGT‑‑GGCGATGTCTGTCGTGTTT‑TGGACATCCGGGTCTCCGa < 1:143304/150‑1 (MQ=255) cGATGATGCCGACGATCAACGCCATCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTGCGCCCAGGATGGCTTCGGTGATGACCACCCAGGT‑‑GGCGATGTCTGTCGTGTTT‑TGGACATCCGGGTCTCCGACCa < 2:1361731/150‑1 (MQ=255) atgCCGACGATCAACGCCATCACCTTGCCGCCCACGCCACCCGCCACGGCGGTGGCCACGGCGGCAATTGCGCCCAGGATGGCTTCGGt > 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |