New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 2295812 = | 52 (0.560) | 11 (0.120) | 7/240 | NT | 14.5% | intergenic (+15/+118) | PP_5496/PP_2023 | hypothetical protein/glutathione S‑transferase family protein |
? | NC_002947 | 2295909 = | 80 (0.890) | intergenic (+112/+21) | PP_5496/PP_2023 | hypothetical protein/glutathione S‑transferase family protein |
Only 100 of 111 total aligned reads displayed.
CATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGC‑TCCGAAGCCAGCCAC‑CCCTCCAGCCAGCTCCGCACACGCGGATAAGCCGCCTCGGCGAACCACTGCGGTTCGACCCCGGCAAACTGGCGCATCAGGGGCAG > NC_002947/2295765‑2296058 | cATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCAtgtg < 1:716249/150‑1 (MQ=255) aTGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGc > 2:1342687/1‑150 (MQ=255) ccTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGa < 1:1456943/150‑1 (MQ=255) ccTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCAGGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGa < 2:57589/150‑1 (MQ=255) cTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGAt < 2:1836203/150‑1 (MQ=255) aGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGAGGtt > 1:2337249/1‑150 (MQ=255) cAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATc > 2:2262479/1‑150 (MQ=255) aaGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCa > 1:1661960/1‑150 (MQ=255) caccaccacTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCg < 2:731035/150‑1 (MQ=255) accaccacTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCgg > 2:2431152/1‑150 (MQ=255) cacTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCAt > 1:1545771/1‑120 (MQ=255) cacTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCAt < 2:1545771/120‑1 (MQ=255) cTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGa > 1:1779449/1‑150 (MQ=255) tGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGAt > 2:567313/1‑150 (MQ=255) tGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCAGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGAt > 1:541756/1‑150 (MQ=255) gATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGAtt < 2:1661960/150‑1 (MQ=255) cTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCAACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGcc < 2:1892444/150‑1 (MQ=255) ttGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGaa < 1:2243533/150‑1 (MQ=255) ttGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGaa < 2:1194155/150‑1 (MQ=255) ttGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGaa < 1:1533016/150‑1 (MQ=255) ttGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTAGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGaa > 1:155156/1‑150 (MQ=255) tgtgAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACAACGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGAGCACGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAg > 2:573670/1‑150 (MQ=255) tgAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGa > 2:541477/1‑135 (MQ=255) tgAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGa < 1:541477/135‑1 (MQ=255) 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tgtgGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGC‑TCCGAagcca < 2:1484843/150‑1 (MQ=255) gggagcgggcatgcccgcgaagcgggcaccgcggtggatggcaccggctctgccggtgttcgcgggcatgcccgctcccacaaggaccCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGC‑TCCGaa < 2:2179998‑M2/55‑1 (MQ=255) gggagcgggcatgcccgcgaagcgggcaccgcggtggatggcaccggctctgccggtgttcgcgggcatgcccgctcccacaaggaccCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGC‑TCCGaa > 1:2179998‑M2/89‑143 (MQ=255) ggAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGC‑TCCGCAgccagcca > 1:434096/1‑150 (MQ=255) gAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGA‑TCCGAAGCCAGCCAc > 2:1549389/1‑150 (MQ=255) 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gggCATGCCCGCTCCCACACGGCCCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAAC‑TCCGAAGCCAGCCAC‑CCCTCCAGCCAGCTCCGCACACGCGGATAAGCCGCCTCGGCGAACCACTGCGGTTCGAccc < 1:1342687/150‑1 (MQ=255) gggCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGC‑TCCGAAGCCAGCCAC‑CCCTCCAGCCAGCTCCGCACACGCGGATAAGCCGCCTCGGCGAACCACTGCGGTTCGAccc > 2:1890080/1‑150 (MQ=255) gCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGC‑TCCGAAGCCAGCCAC‑CCCTCCAGCCAGCTCCGCACACGCGGATAAGCCGCCTCGGCGAACCACTGCGGTTCGACCCCg < 2:256765/150‑1 (MQ=255) cccgctcccacaaggaccCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGC‑TCCGAAGCCAGCCAC‑CCCTCCAGCCAGCTCCGCACACGCGGATAAGCCGCCTCGGCGAACCACTGCGGTTCGACCCCGGCaaa > 1:167739‑M2/19‑150 (MQ=255) cccGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGC‑TCCGAAGCCAGCCAC‑CCCTCCAGCCAGCTCCGCCAACTCGGATAAGCCGCCTCGGCGAACCACTGCGGTTCGACCCCGGCaaa > 1:1454502/1‑150 (MQ=255) cGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGC‑TCCGAAGCCAGCCAC‑CCCTCCAGCCAGCTCCGcaca < 1:1962932/101‑1 (MQ=255) cGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGC‑TCCGAAGCCAGCCAC‑CCCTCCAGCCAGCTCCGcaca > 2:1962932/1‑101 (MQ=255) gCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGA‑TCCGAAGCCAGCCAC‑CCCTCCAGCCAGCTCCGCACACGCGGATAAGCCGCCTCGGCGAACCACTGCGGTTCGACCCCGGCAAACTg < 1:1549389/150‑1 (MQ=255) tCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGC‑TCCGAAGCCAGCCAC‑CCCTCCAGCCAGCTCCGCACACGCGGATAAGCCGCCTCGGCGAACCACTGCGGTTCGACCCCGGCAAACTGgc < 2:1626559/150‑1 (MQ=255) tCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGC‑TCCGAA‑CCAACCGCTCCTTCCAGCCAGCTCCGCACACGCGGATAAGCCGCCTCGGCGAACCACTGCGGTTCGACCCCGGCAAACTGgc < 2:1776168/150‑1 (MQ=255) acacGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGC‑TCCGAAGCCAGCCAC‑CCCTCCAGCCAGCTCCGCACACGCGGATAAGCCGCCTCGGCGAACCACTGCGGTTCGACCCCGGCAAACTGGCGCAt > 2:1779192/1‑150 (MQ=255) acacGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGC‑TCCGAAGCCAGCCAC‑CCCTCCAGCCAGCTCCGCACACGCGGATAAGCCGCCTCGGCGAACCACTGCGGTTCGACCCCGGCAAACTGGCGCAt > 2:1743144/1‑150 (MQ=255) acacGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGC‑TCCGAAGCCAGCCAC‑CCCTCCAGCCAGCTCCGCACACGCGGATAAGCCGCCTCGGCGAACCACTGCGGTTCGACCCCGGCAAACTGGCGCAt > 1:2119093/1‑150 (MQ=255) acacGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATACGAGGCCTCAGCATCAGATATACAGC‑TCCGAAGCCAGCCAC‑CCCTCCAGCCAGCTCCGCACACGCGGATAAGCCGCCTCGGCGAACCACTGCGGTTCGACCCCGGCAAACTGGCGCAt > 1:1003203/1‑150 (MQ=255) accgaccCATGTGCAGCCCTATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGC‑TCCGAAGCCAGCCAC‑CCCTCCAGCCATCTCCGCACACGCGGATAAGCCGCCTCGTCGAACCACTGCGGTTCGACCCCGGCAAACTTGCGCATCa < 2:1132251‑M2/143‑1 (MQ=255) acGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGC‑TCCGAAGCCAGCCAC‑CCCTCCAGCCAGCTcc < 2:2194982/87‑1 (MQ=255) ggaccCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGC‑TCCGAAGCCAGCCAC‑CCCTCCAGCCAGCTCCGCGCAGGCGGATAAGCCGCCTCGGCGAACCACTGCGGTTCGACCCCGGCAAACTGGCGCATCAgg < 2:1157603‑M2/145‑1 (MQ=255) ggaccCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGC‑TCCGAAGCCAGCCAC‑CCCTCCAGCCAGCTCCGCACACGCGGATAAGCCGCCTCGGCGAACCACTGCGGTTCGACCCCGGCAAACTGGCGCATCAgg < 1:1190482‑M2/145‑1 (MQ=255) accCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGC‑TCCGAAGCCAGCCAC‑CCCTCCAGCCAGCTCCGCACACGCGGATAAGCCGCCTCGGCGAACCACTGCGGTTCGACCCCGGCAAACTGGCGCATCAgggg > 1:938968‑M2/4‑150 (MQ=255) accCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGC‑TCCGAAGCCAGCCAC‑CCCTCCAGCCAGCTCCGCACACGCGGATAAGCCGCCTCGGCGAACCACTGCGGTTCGACCCCGGCAAACTGGCGCATCAgggg < 1:567313‑M2/147‑1 (MQ=255) cCATGTGCAGCCCGATGTTTAATAAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGC‑TCCGAAGCCAGCCAC‑CCCTCCAGGCAGCTCCGCACACGCGGATAAGCCGCCTCGGCGAACCACTGCGGTTCGACCCCGGCAAACTGGCGCATCAGCGGCa > 2:1190062‑M2/2‑150 (MQ=255) cATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGC‑TCCGAAGCCAGCCAC‑CCCTCCAGCCAGCTCCGCACACGCGGATAAGCCGCCTCGGCGAACCACTGCGGTTCGACCCCGGCAAACTGGCGCATCAGGGgcag < 2:541756/150‑1 (MQ=255) | CATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGC‑TCCGAAGCCAGCCAC‑CCCTCCAGCCAGCTCCGCACACGCGGATAAGCCGCCTCGGCGAACCACTGCGGTTCGACCCCGGCAAACTGGCGCATCAGGGGCAG > NC_002947/2295765‑2296058 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |