New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 3036028 = | 89 (0.950) | 6 (0.070) | 5/242 | NT | 6.9% | coding (426/930 nt) | PP_2648 | universal stress protein family protein |
? | NC_002947 | 3036056 = | 77 (0.850) | coding (398/930 nt) | PP_2648 | universal stress protein family protein |
AAACGGACGAAAAATCGACTGGCACCAGCACGGTGCGGTAGGCATCACGAGGGGCCGGCTTGACCACCAGCAAAGGGCAGGGCATGCGGTTGAGCAGTTTCTGCACGGTCGAACCCAGCAGCAGGCGCCGCGCTACGCTCTGGCCCCTGGCCCCACACACCAGCAGGTCGCTGTGCTTGTCCTGCACCACCCGGTTGATCTCCGTGATCACCGAGCCGCTGGCGACCT‑GCACGCCAGCGGAGATACCGTAACGCTGGAACAGCAGCGCTGCCAGTGCGTGGGTTTTCTCGCCTGCGCTA > NC_002947/3035907‑3036205 | cagcgctgctgttccagcgttacggtatctccgctggcgtgcaggtcgccagcggctcggtgatcacggagatcaaccgggtggtgcaggacaagcacagcgacctgctggtgtgtggggcCAGGCGCCGCGCTACGCTctggcccctgg > 2:1138619‑M1/122‑150 (MQ=255) aaCGGACGAAAAATCGACTGGCACCAGCACGGTGCGGTAGGCATCACGAGGGGCCGGCTTGACCACCAGCAAAGGGCAGGGCATGCGGTTGAGCAGTTTCTGCACGGTCGAACCCAGCAGCAGGCGCCGCGCTACGCTctggcccctggc > 2:2077485/1‑150 (MQ=255) cGGACGAAAAATCGATTGGCACCATCACGGTGCAGTAGGCATCACGAGGGGCCGGCTTGACCACTATCAAAGGGCAGGGCATGCGGTTGAGCAGTTTCTGCACGGTCGAACCCAGCAGCAGGCGCCGCGCTACGCTctggcccctggccc < 1:713424/150‑1 (MQ=255) gAAAAATCGACTGGCACCAGCACGGTGCGGTAGGCATCACGAGGGGCCGGCTTGACCACCAGCAAAGGGCAGGGCATGCGGTTGAGCAGTTTCTGCACGGTCGAACCCAGCAGCAGGCGCCGCGCTACGCTCTGGCCCCTGGCCCcacac > 1:27673/1‑150 (MQ=255) gAAAAATCGACTGGCACCAGCACGGTGCGGTAGGCATCACGAGGGGCCGGCTTGACCACCAGCAAAGGGCAGGGCATGCGGTTGAGCAGTTTCTGCACGGTCGAACCCAGCAGCAGGCGCCGCGCTAAGCTCTCGACCCTGTCCCcacac > 2:1879209/1‑150 (MQ=255) aaaTCGACTGGCACCAGCACGGTGCGGTAGGCATCACGATGGGCCGGCTTGACCACCAGCAAAGGGCAGGGCAGGCGGTTGAGCAGTTTCTGCACGGTCGAACCCAGCAGCAGGCGCCGCGCTACGCTCTGGCCCCTGGCCCCACACAcc > 1:342535/1‑150 (MQ=255) aaTCGACTGGCACCAGCACGGTGCGGTAGGCATCACGAGGGGCCGGCTTGACCACCAGCAAAGGGCAGGGCATGCGGTTGAGCAGTTTCTGCACGGTCGAACCCAGCAGCAGGCGCCGCGCTACGCTCTGGCCCCTGGCCCCACACACca > 1:2150524/1‑150 (MQ=255) cTGGCACCAGCACGGTGCGGTAGGCATCACGAGGGGCCGGCTTGACCACCAGCAAAGGGCAGGGCATGCGGTTGAGCAGTTTCTGCACGGTCGAACCCAGCAGCAGGCGCCGCGCTACGCTCTGGCCCCTGGCCCCACACACCAGCAGGt > 1:387803/1‑150 (MQ=255) cTGGCACCAGCACGGTGCGGTAGGCATCACGAGGGGCCGGCTTGACCACCAGCAAAGGGCAGGGCATGCGGTTGAGCAGTTTCTGCACGGTCGAACCCAGCAGCAGGCGCCGCGCTACGCTCTGGCCCCTGGCCCCACACACCAGCAGGt < 2:2155516/150‑1 (MQ=255) cTGGCACCAGCACGGTGCGGTAGGCATCACGAGGGGCCGGCTTGACCACCAGCAAAGGGCAGGGCATGCGGTTGAGCAGTTTCTGCACGGTCGAACCCAGCAGCAGGCGCCGCGCTACGCTCTGGCCCCTGGCCCCACACACCAGCAGGt > 1:387843/1‑150 (MQ=255) tGGCACCAGCACGGTGCGGTAGGCATCACGAGGGGCCGGCTTGACCACCAGCAAAGGGCAGGGCATGCGGTTGAGCAGTTTCTGCACGGTCGAACCCAGCAGCAGGCGCCGCGCTACGCTCTGGCCCCTGGCCCCACACACCAGCAGGTc > 1:1710427/1‑150 (MQ=255) gCACCAGCACGGTGCGGTAGGCATCACGAGGGGCCGGCTTGACCACCAGCAAAGGGCAGGGCATGCGGTTGAGCAGTTTCTGCACGGTCGAACCCAGCAGCAGGCGCCGCGCTACGCTCTGGCCCCTGGCCCCACACACCAGCAGGTCGc > 2:615816/1‑150 (MQ=255) gCACCAGCACGGTGCGGTAGGCATCACGAGGGGCCGGCTTGACCACCAGCAAAGGGCAGGGCATGCGGTTGAGCAGTTTCTGCACGGTCGAACCCAGCAGCAGGCGCCGCGCTACGCTCTGGCCCCTGGCCCCACACACCAGCAGGTCGc > 1:2115861/1‑150 (MQ=255) cACCAGCACGGTGCGGTAGGCATCACGAGGGGACGGCTTGACCACCAGCAAAGGGCAGGGCATGCGGTTGAGCAGTTTCTGCACGGTCGAACCCAGCAGCAGGCGCCGCGCTACGCTCTGGCCCCTGGCCCCACACACCAGCAGGTCGCt < 2:1772653/150‑1 (MQ=255) aCCAGCACGGTGCGGTAGGCATCACGAGGGGCCGGCTTGACCACCAGCAAAGGGCAGGGCATGCGGTTGAGCAGTTTCTGCACGGTCGAACCCAGCAGCAGGCGCCGCGCTACGCTCTGGCCCCTGGCCCCACACACCAGCAGGTCGCtg > 1:567233/1‑150 (MQ=255) aCCAGCACGGTGCGGTAGGCATCACGAGGGGCCGGCTTGACCACCAGCAAAGGGCAGGGCATGCGGTTGAGCAGTTTCTGCACGGTCGAACCCAGCAGCAGGCGCCGCGCTACGCTCTGGCCCCTGGCCCCACACACCAGCAGGTCGCtg > 2:2244254/1‑150 (MQ=255) gcAGCACGGGGCGGTAGGCATCACGAGGGGCCGGCTTGACCACCAGCAAAGGGCAGGGCATGCGGTTGAGCAGTTTCTGCACGGTCGAACCCAGCAGCAGGCGCCGCGCTACGCTCTGGCCCCTGGCCCCACACCCCAACCGGTccccgt < 2:33643/149‑6 (MQ=255) cAGCACGGTGCGGTAGGCATCACGAGGGGCCGGCTTGACCACCAGCAAAGGGCAGGGCATGCGGTTGAGCAGTTTCTGCACGGTCGAACCCAGCAGCAGGCGCCGCGCTACGCTCTGGCCCCTGGCCCCACACACCAGCAGGTCGCtgtg > 1:1698741/1‑150 (MQ=255) 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cgctggcgtgcaggtcgccagcggctcggtgatcacggagatcaaccgggtggtgcaggacaagcacagcgacctgctggtgtgtggggcCAGGCGCCGCGCTACGCTctggcccctgg > 2:870250‑M1/91‑119 (MQ=255) gCGGTAGGCATCACGAGGGGCCGGCTTGACCACCAGCAAAGGGCAGGGCATGCGGTTGAGCAGTTTCTGCACGGTCGAACCCAGCAGCAGGCGCCGCGCTACGCCCTGGCCCCTGGCCCCACACACCAGCAGGTCGCTGTGCTTGTCCTg < 2:1080525/150‑1 (MQ=255) cGGTAGGCATCACGAGGGGCCGGCTTGACCACCAGCAAAGGGCAGGGCATGCGGTTGAGCAGTTTCTGCACGGTCGAACCCAGCAGCAGGCGCCGCGCTACGCTCTGGCCCCTGGCCCCACACACCAGCAGGTCGCTGTGCTTGTCCTGc < 1:2244254/150‑1 (MQ=255) cATCACGAGGGGCCGGCTTGACCACCAGCAAAGGGCAGGGCATGCGGTTGAGCAGTTTCTGCACGGTCGAACCCAGCAGCAGGCGCCGCGCTACGCTATGGCACCTGGCCCCACACACCAGCAGGTCGCTGTGCTTGTCCTGCACCAccc > 1:2338349/1‑150 (MQ=255) aTCACGAGGGGCCGGCTTGACCACCAGCAAAGGGCAGGGCATGCGGTTGAGCAGTTTCTGCACGGTCGAACCCAGCAGCAGGCGCCGCGCTACGCTCTGGCCCCTGGCCCCacacac < 2:2235992/117‑1 (MQ=255) aTCACGAGGGGCCGGCTTGACCACCAGCAAAGGGCAGGGCATGCGGTTGAGCAGTTTCTGCACGGTCGAACCCAGCAGCAGGCGCCGCGCTACGCTCTGGCCCCTGGCCCCacacac > 1:2235992/1‑117 (MQ=255) aTCACGAGGGGCCGGCTTGACCACCAGCAAAGGGCAGGGCATGCGGTTGAGCAGTTTCTGCACGGTCGAACCCAGCAGCAGGCGCCGCGCTACGCTCTGGCCCCTGGCCCCACACACCAGCAGGTCGCTGTGCTTGTCCTGCACCACCCg > 2:872764/1‑150 (MQ=255) aTCACGAGGGGCCGGCTTGACCACCAGCAAAGGGCAGGGCATGCGGTTGAGCAGTTTCTGCACGGTCGAACCCAGCAGCAGGCGCCGCGCTACGCTCTGGCCCCTGGCCCCACACACCAGCAGGTCGCTGTGCTTGTCCTGCACCACCCg > 1:1019010/1‑150 (MQ=255) tCAGGAGGGGCCGGCCTGCCCCCCCGCAACGGGCAGGGCATGCGGGTGAGCAGTTTCTGCACGGTCGAACCCAGCAGCCGGCGCCGCGCTCCGCTCGGGCCCCTGGCCCCCCACACCAGCAGGTCGCTGTGCTTGTCCTGCACCACCCgg < 2:153856/150‑1 (MQ=255) cACGAGGGGCCGGCTTGACCACCAGCAAAGGGCAGGGCATGCGGTTGAGCAGTTTCTGCACGGTCGAACCCAGCAGCAGGCGCCGCGCTACGCTCTGGCCCCTGGCCCCACACACCAGCAGGTCGCTGTGCTTGTCCTGCACCACCCGGt > 1:260075/1‑150 (MQ=255) aCGAGGGGCCGGCTTGACCACCAGCAAAGGGCAGGGCATGCGGTTGAGCAGTTTCTGCACGGTCGAACCCAGCAGCAGGCGCCGCGCTACGCTCTGGCCCCTGGCCCCACACACCAGCAGGTCGCTGTGCTTGTCCTGCACCACCCGGtt < 2:1422355/150‑1 (MQ=255) 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cgccgcGCTACGCTCTGGCCCCTGGCCCCACACACCAGCAGGTCGCTGTGCTTGTCCTGCACCACCCGGTTGATCTCCGTGATCACCGAGCCGCTGGCGACCT‑GCACGCCAGCGGAGATACCGTAACGCTGGAACAGCAGCGCTGCCAGt < 2:1780911/150‑1 (MQ=255) ccgcGCTACGCTCTGCCCCCTGGCCCCACACACCAGCAGGTCGCTGTGCTTGTCCTGCACCACCCGGTTGATCTCCGTGATCACCGAGCCGCTGGCGACCT‑GCACGCCAGCGGAGATACCGTAACGCTGGAACAGCAGCGCTGCCAGTGc < 1:2047618/150‑1 (MQ=255) gcTACGCTCTGGCCCCTGGCCCCACACACCAGCAGGTCGCTGTGCTTGTCCTGCACCACCCGGTTGATCTCCGTGATCACCGAGCCGCTGGCGACCT‑GCACGCCAGCGGAGATACCGTAACGCTGGAACAGCAGCGCTGCCAGtcgattt < 2:342535/150‑7 (MQ=255) cTACGCTCTGGCCCCTGGCCCCACACACCAGCAGGTCGCTGTGCTTGTCCTGCACCACCCGGTTGATCTCCGTGATCACCGAGCCGCTGGCGACCT‑GCACGCCAGCGGAGATAc < 2:1963950/114‑1 (MQ=255) cTACGCTCTGGCCCCTGGCCCCACACACCAGCAGGTCGCTGTGCTTGTCCTGCACCACCCGGTTGATCTCCGTGATCACCGAGCCGCTGGCGACCT‑GCACGCCAGCGGAGATAc > 1:1963950/1‑114 (MQ=255) cTACGCTCTGGCCCCTGGCCCCACACACCAGCAGGTCGCTGTGCTTGTCCTGCACCACCCGGTTGATCTCCGTGATCACCGAGCCGCTGGCGACCT‑GCACGCCAGCGGAGATACCGTAACGCTGGAACAGCAGCGCTGCCAGTGCGTggg > 1:1539022/1‑150 (MQ=255) ctctGGCCCCTGGCCCCACACACCAGCAGGTCGCTGTGCTTGTCCTGCACCACCCGGTTGATCTCCGTGATCACCGAGCCGCTGGCGACCT‑GCACGCCAGCGGAGATACCGTAACGCTGGAACAGCAGCGCTGCCAGTGCGTGGGTTTtc < 1:421846/150‑1 (MQ=255) ctctGGCCCCTGGCCCCACACACCAGCAGGTCGCTGTGCTTGTCCTGCACCACCCGGTTGATCTCCGTGATCACCGAGCCGCTGGCGACCT‑GCACGCCAGCGGAGATACCGTAACGCTGGAACAGCAGCGCTGCCAGTGCGTGGGTTTtc < 2:387843/150‑1 (MQ=255) ctctGGCCCCTGGCCCCACACACCAGCAGGTCGCTGTGCTTGTCCTGCACCACCCGGTTGATCTCCGTGATCACCGAGCCGCTGGCGACCT‑GCACGCCAGCGGAGATACCGTAACGCTGGAACAGCAGCGCTGCCAGTGCGTGGGTTTtc < 2:387803/150‑1 (MQ=255) ctggcccctggcccCACACACCAGCAGGTCGCTGTGCTTGTCCTGCACCACCCGGTTGATCTCCGTGATCACCGAGCCGCTGGCGACCT‑GCACGCCAGCGGAGATACCGTAACGCTGGAACAGCAGCGCTGCCAGTGCGTGGGTTTtctc < 1:529064/150‑1 (MQ=255) ctggaccctggtgcCACACACCGGCAGGTCGCGGTGCTTGTCCTGCACCACCCGGTTGATCTCCGTGATCACCGAGCCGCTGGCGACCT‑GCACGCCAGCGGAGATACCGTAACGCTGGAACAGCAGCGCTGCCAGTGCGTGGGTTTtctc < 2:1093172/150‑1 (MQ=255) gcccctggccccAGACACCAGCAGGTCGCTGTGCTTGTCCTGCACCACCCGGTTGATCTCCGTGATCACCGAGCCGCTGGCGACCT‑GCACGCCAGCGGAGATACCGTAACGCTGGAACAGCAGCGCTGCCAGTGCGTGGGTTTTCTCGcc < 2:1294108/150‑1 (MQ=255) cccctggccccACACACCAGCAGGTCGCTGTGCTTGTCCTGCACCACCCGGTTGATCTCCGTGATCACCGAGCCGCTGGCGACCT‑GCACGCCAGCGGAGATACCGTAACGCTGGAACAGCAGCGCTGCCAGTGCGTGGGTTTTCTCGCCt < 1:872764/150‑1 (MQ=255) ccctggccccACACACCAGCAGGTCGCTGTGCTTGTCCTGCACCACCCGGTTGATCTCCGTGATCACCGAGCCGCTGGCGACCT‑GCACGCCAGCGGAGATACCGTAACGCTGGAACAGCAGCGCTGCCAGTGCGTGGGTTTTCTCGCCTg > 2:2442228/1‑150 (MQ=255) ccctggccccACACACCAGCAGGTCGCTGTGCTTGTCCTGCACCACCCGGTTGATCTCCGTGATCACCGAGCCGCTGGCGACCT‑GCACGCCAGCGGAGATACCGTAACGCTGGAACAGCAGCGCTGCCAGTGCGTGGGTTTTCTCGCCTg > 1:2280063/1‑150 (MQ=255) ctgGCCCCACACACCAGCAGGTCGCTGTGCTTGTCCTGCACCACCCGGTTGATCTCCGTGATCACCGAGGCGCTGGC‑ACATGGCGCACCATCTTATATACCGTAACGCTGGAACAGCAGCGCTGCCAGTGCGTGGGTTTTCTCGCCTgcg > 1:542392‑M2/4‑150 (MQ=255) ctgGCCCCACACACCAGCAGGTCGCTGTGCTTGTCCTGCACCACCCGGTTGATCTCCGTGATCACCGAGCCGCTGGCGCCAT‑GCGCTCGATTGTAGATACCGGAACGCTGGAACAGCAGCGCTGCCAGTGCGTGGGTTTTCTCGCCTgcg > 1:542567‑M2/4‑150 (MQ=255) gccccACACACCAGCAGGTCGCTGTGCTTGTCCTGCACCACCCGGTTGATCTCCGTGATCACCGAGCCGCTGGCGACCT‑GCACGCCAGCGGAGATACCGTAACGCTGGAACAGCAGCGCTGCCAGTGCGTGGGTTTTCTCGCCTGCGCTa < 1:919047/150‑1 (MQ=255) | AAACGGACGAAAAATCGACTGGCACCAGCACGGTGCGGTAGGCATCACGAGGGGCCGGCTTGACCACCAGCAAAGGGCAGGGCATGCGGTTGAGCAGTTTCTGCACGGTCGAACCCAGCAGCAGGCGCCGCGCTACGCTCTGGCCCCTGGCCCCACACACCAGCAGGTCGCTGTGCTTGTCCTGCACCACCCGGTTGATCTCCGTGATCACCGAGCCGCTGGCGACCT‑GCACGCCAGCGGAGATACCGTAACGCTGGAACAGCAGCGCTGCCAGTGCGTGGGTTTTCTCGCCTGCGCTA > NC_002947/3035907‑3036205 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |