New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_002947 | = 3472643 | 77 (0.830) | 5 (0.060) | 5/236 | NT | 5.5% | intergenic (‑69/+39) | PP_3084/PP_3085 | ferric siderophore receptor/transmembrane sensor |
? | NC_002947 | = 3472685 | 98 (1.110) | coding (963/966 nt) | PP_3085 | transmembrane sensor |
Only 100 of 116 total aligned reads displayed.
GGGTCCTGTGGGTGCAGAAATGAAGGTTCTGCACTCATCACCGGACGACGCAGGAAAAGGTATCAATCGTGCTGCCCATCGTGGGAACAACTGTCCTGCTCACACGTTGAAGCTTGGCGCGATCACCGGGAGCGTTGCCAGGGCTTCACACGTGTGGCTCCACAGTTACCCAGTAGCGGGTCATGCCCTGAATGTTCACCGGCAGGGTGTCGCTCAGCAGCCGCAGGCTGGCATCGGTGTCGGCCAGCGGGAATGCGCCAGACACCTTCAGCTCTCGCACTGCCGGGTGGCAGCGCA > NC_002947/3472537‑3472833 | gggTCCTGTGGGTGCAGAAATGAAGGTTCTGCACTCATCACCGGACGACGCAGGAAAAGGTATCAATCGTGCTGCCCATCGTGGGAACAACTGTCCTGCTCACACGTTGAAGCTTGGCGCGATCACCGGGAGCGTTGCCAGGGCTTCACa < 2:158991‑M2/150‑2 (MQ=255) ccTGTGGGTGCAGAAATGAAGGTTCTGCACTCATCACCGGACGACGCAGGAAAAGGTATCAATCGTGCTGCCCATCGTGGGAACAACTGTCCTGCTCACACGTTGAAGCTTGGCGCGATCACCGGGAGCGTTGCCAGGGCTTCACacgtg > 1:1590509‑M2/1‑145 (MQ=255) cTGTGGGTGCAGAAATGAAGGTTCTGCACTCATCACCGGACGACGCAGGAAAAGGTATCAATCGTGCTGCCCATCGTGGGAACAACTGTCCTGCTCACACGTTGAAGCTTGGCGCGATCACCGGGAGCGTTGCCAGGGCTTCACacgttg > 1:462010‑M2/1‑144 (MQ=255) 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ggAGCGTTGCCAGGGCTTCACACGTGTGGCTCCACAGTTACCCAGTAGCGGGTCATGCCCTGAATGTTCACCGGCAGGGTGTCGCTCAGCAGCCGCAGGCTGGCATCGGTGTCGGCCAGCGGGAATGCGCCAGac < 2:1267123/135‑1 (MQ=255) gTTGCCAGGGCTTCACACGTGTGGCTCCACAGTTACCCAGTAGCGGGTCATGCCCTGAATGTTCACCGGCAGGGTGTCTCTCAGCAGCCGCAGGCTGGCATCGGTGTCGGCCAGCGGGAATGCGCCa < 2:782604/127‑1 (MQ=255) gTTGCCAGGGCTTCACACGTGTGGCTCCACAGTTACCCAGTAGCGGGTCATGCCCTGAATGTTCACCGGCAGGGTGTCGCTCAGCAGCCGCAGGCTGGCATCGGTGTCGGCCAGCGGGAATGCGCCa > 1:782604/1‑127 (MQ=255) cAGGGCTTCACACGTTTGGCTCCACAGTTACCCAGTAGCGGGTCATGCCCTGAATGTTCACCGGCAGGGTGTCGCTCAGCAGCCGCAGGCTGGCATCGGTGTCGGCCAGCGGGAATGCGCCAGACACCTTCAGCTCTCGCACTGCCGGGt < 2:1996707/150‑1 (MQ=255) cAGGGCTTCACACGTGTGGCTCCACAGTTACCCAGTAGCGGGTCATGCCCTGAATGTTCACCGGCAGGGTGTCGCTCAGCAGCCGCAGGCTGGCATCGGTGTCGGCCAGCGGGAATGCGCCAGACACCTTCAGCTCTCGCACTGCCGGGt < 1:2385065/150‑1 (MQ=255) aGGGCTTCACACGTGTGGCTCCACAGTTACCCGGTAGCGGGTCATGCCCTGAATGTTCACCGGCAGGGTGTCGCTCAGCAGCCGCAGGCTGGCATCGGTGTCGGCCAGCGGGAATGCGCCAGACACCTTCAGCTCTCGCACTGCCGGGTg > 2:1349020/1‑150 (MQ=255) aGGGCTTCACACGTGTGGCTCCACAGTTACCCAGTAGCGGGTCATGCCCTGAATGTTCACCGGCAGGGTGTCGCTCAGCAGCCGCAGGCTGGCATCGGTGTCg < 2:213163/103‑1 (MQ=255) aGGGCTTCACACGTGTGGCTCCACAGTTACCCAGTAGCGGGTCATGCCCTGAATGTTCACCGGCAGGGTGTCGCTCAGCAGCCGCAGGCTGGCATCGGTGTCg > 1:213163/1‑103 (MQ=255) aGGGCTTCACACGTGTGGCTCCACAGTTACCCAGTAGCGGGTCATGCCCTGAATGTTCACCGGCAGGGTGTCGCTCAGCAGCCGCAGGCTGGCATCGGTGTCGGCCAGCGGGAATGCGCCAGACACCTTCAGCTCTCGCACTGCCGGGTg > 2:1928747/1‑150 (MQ=255) aGGGCTTCACACGTGTGGCTCCACAGTTACCCAGTAGCGGGTCATGCCCTGAATGTTCACCGGCAGGGTGTCGCTCAGCAGCCGCAGGCTGGCATCGGTGTCGGCCAGCGGGAATGCGCCAGACACCTTCAGCTCTCGCACTGCCGGGTg > 1:579725/1‑150 (MQ=255) tcTTCACACGTGTGGCTCCACAGTTACCCAGTAGCGGGTCATGCCCTGAATGTTCACCGGCAGGGTGTCGCTCAGCAGCCGCAGGCTGGCATCGGTGTCGGCCAGCTTGAATGCGCCAGACACCTTCAGCTCTCGCACTGCCGGGTGgca < 1:103859/149‑1 (MQ=255) gCTTCACACGTGTGGCTCCACAGTTACCCAGTAGCGGGTCATGCCCTGAATGTTCACCGGCAGGGTGTCGCTCAGCAGCCGCAGGCTGGCATCGGTGTCGGCCAGCGGGAATGCGCCa < 2:2304930/118‑1 (MQ=255) gCTTCACACGTGTGGCTCCACAGTTACCCAGTAGCGGGTCATGCCCTGAATGTTCACCGGCAGGGTGTCGCTCAGCAGCCGCAGGCTGGCATCGGTGTCGGCCAGCGGGAATGCGCCa > 1:2304930/1‑118 (MQ=255) gCTTCACACGTGTGGCTCCACAGTTACCCAGTAGCGGGTCATGCCCTGAATGTTCACCGGCAGGGTGTCGCTCAGCAGCCGCAGGCTGGCATCGGTGTCGGCCAGCGGGAATGCGCCAGACACCTTCAGCTCTCGCACTGCCGGGTGgca < 1:261949/150‑1 (MQ=255) ttCACACGTGTGGCTCCACAGTTACCCAGTAGCGGGTCATGCCCTGAATGTTCACCGGCAGGGTGTCGCTCAGCAGCTGGAGGCTGGCATCGGTGTCGGCCAGCGGGAATGCGCCAGACACCTTCAGCTCTCGCACTGCCGGGTGgcagc > 1:1001543/1‑150 (MQ=255) acacGTGTGGCTCCACAGTTACCCAGTAGCGGGTCATGCCCTGAATGTTCACCGGCAGGGTGTCGCTCAGCAGCCGCAGGCTGGCATCGGTGTCGGCCAGCGGGAATGCGCCAGACACCTTCAGCTCTCGCACTGCCGGGTGgcagcgca < 2:440670/150‑1 (MQ=255) | GGGTCCTGTGGGTGCAGAAATGAAGGTTCTGCACTCATCACCGGACGACGCAGGAAAAGGTATCAATCGTGCTGCCCATCGTGGGAACAACTGTCCTGCTCACACGTTGAAGCTTGGCGCGATCACCGGGAGCGTTGCCAGGGCTTCACACGTGTGGCTCCACAGTTACCCAGTAGCGGGTCATGCCCTGAATGTTCACCGGCAGGGTGTCGCTCAGCAGCCGCAGGCTGGCATCGGTGTCGGCCAGCGGGAATGCGCCAGACACCTTCAGCTCTCGCACTGCCGGGTGGCAGCGCA > NC_002947/3472537‑3472833 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |