New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_002947 | = 4573275 | 102 (1.090) | 5 (0.070) | 5/200 | NT | 5.2% | intergenic (+39/‑98) | PP_4054/glgX | hypothetical protein/glycogen debranching enzyme |
? | NC_002947 | = 4573292 | 101 (1.350) | intergenic (+56/‑81) | PP_4054/glgX | hypothetical protein/glycogen debranching enzyme |
Only 100 of 142 total aligned reads displayed.
GGCGCCTGCCGAACCCAAGGCGGCTGCCCTGCCGGGGGTTAAACCCACTGCGGTGAAAAAGCCCCGGGCGGTGAAAAAGCCTACTGCCGGTTAAGCCTGTCCGGGCCTCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTTCATCACAGGCGCATGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGTGGCCAATGCAGGACAGCACAATTCCCCTTCCATCACGGCCACTCGAGGATCGTCATGAGCCCCCGCACCCCAAAGAAAACCCGCTCGGTCGCACCATCGCGCATTCGCGAAGGCATGCCCT > NC_002947/4573143‑4573439 | gcCTGCCGAACCCAAGGCGGCTGCCCTGCCGGGGGTTAAACCCACTGCGGTGAAAAAGCCCCGGGCGGTGAAAAAGCCTACTGCCGGTTAAGCCTGTCCGGGCCTCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTTCATCACAGGCGCAtgt < 2:2305721‑M2/150‑4 (MQ=255) cTGCCGAACCCAAGGCGGCTGCCCTGCCGGGGGTTAAACCCACTGCGGTGAAAAAGCCCCGGGCGGTGAAAAAGCCTACTGCCGGTTAAGCCTGTCCGGGCCTCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTTCATCACAGGCGCAtgtag < 1:2237816‑M2/150‑6 (MQ=255) gCCGAACCCAAGGCGGCTGCCCTGCCGGGGGTTAAACCCACTGCGGTGAAAAAGCCCCGGGCGGTGAAAAAGCCTACTGCCGGTTAAGCCAGTGCAG‑CGTCACCGGCTGGGAAACCCGCTCCTACAGGTTCATCACAGGCGCAtgtagga < 2:1242633‑M2/150‑8 (MQ=255) cGAACCCAAGGCGGCTGCCCTGCCGGGGGTTAAACCCACTGCGGTGAAAAAGCCCCAGGCGGTGAAAAAGCCTACTGCAGGTTAAGCCTGTCCGGGCCTCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTTCATCACAGGCGCAtgtaggagc < 1:396556‑M2/150‑10 (MQ=255) gAACCCAAGGCGGCTGCCCTGCCGGGGGTTAAACCCACTGCGGTGAAAAAGCCCCGGGCGGTGAAAAAGCCTACTGCCGGTTAAGCCTGTCCGGGCCTCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTTCATCACAGGCGCAtgtaggagcg > 2:926193‑M2/1‑140 (MQ=255) aaCCCAAGGCGGCTGCCCTGCCGGGGGTTAAACCCACTGCGGTGAAAAAGCCCCGGGCGGTGAAAAAGCCTACTGCCGGTTAAGCCTGTCCGGGCCTCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTTCATCACAGGCGCAtgtaggagcgg > 1:1297698‑M2/1‑139 (MQ=255) aaCCCAAGGCGGCTGCCCTGCCGGGGGTTAAACCCACTGCGGTGAAAAAGCCCCGGGCGGTGAAAAAGCCTACTGCCGGTTAAGCCTGTCCGGGCCTCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTTCATCACAGGCGCAtgtaggagcgg > 2:737134‑M2/1‑139 (MQ=255) aCCCAAGGCGGCTGCCCTGCCGGGGGTTAAACCCACTGTCAAGAAAAAGCCCCGGGCGGTGAAAAAGCCTACTGCCGGTTAAGCCTGTCCGGGCCTCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTTCATCACAGGCGCAtgtaggagcggg > 1:1841040‑M2/1‑138 (MQ=255) aCCCAAGGCGGCTGCCCTGCCGGGGGTTAAACCCACTGCGGTGAAAAAGCCCCAGGCGGTGAAAAAGCCTACTGCAGGTTAAGCCTGTCCGGGCCTCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTTCATCACAGGCGCAtgtaggagcggg > 2:396556‑M2/1‑138 (MQ=255) cAAGGCGGCTGCCCTGCCGGGGGTTAAACCCACTGCGGTGAAAAAGCCCCGGGCGGTGAAAAAGCCTACTGCCGGTTAAGCCTGTCCGGGCCTCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTTCATCACAGGCGCAtgtaggagcgggttt < 1:756687‑M2/150‑16 (MQ=255) cAAGGCGGCTGCCCTGCCGGGGGTTAAACCCACTGCGGTGAAAAAGCCCCGGGCGGTGAAAAAGCCTACTGCCGGTTAAGCCTGTCCGGGCCTCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTTCATCACAGGCGCAtgtaggagcgggttt > 1:236366‑M2/1‑135 (MQ=255) ggcggcTGCCCTGCCGGGGGTTAAACCCACTGCGGTGAAAAAGCCCCGGGCGGTGAAAAAGCCTACTGCCGGTTAAGCCTGTCCGGGCCTCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTTCATCACAGGCGCAtgtaggagcgggtaaacc > 1:881041‑M2/1‑132 (MQ=255) cctgccGGGGGTTAAACCCACTGCGGTGAAAAAGCCCCGGGCGGTGAAAAAGCCTACTGCCGGTTAAGCCTGTCCGGGCCTCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTTCATCACAGGCGCATGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGTg > 1:1602038/1‑150 (MQ=255) cctgccGGGGGTTAAACCCACTGCGGTGAAAAAGCCCCGGGCGGTGAAAAAGCCTACTGCCGGTTAAGCCTGTCCGGGCCTCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTTCATCACAGGCGCATGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGTg > 2:1474216/1‑150 (MQ=255) ctgccGGGGGTTAAACCCACTGCGGTGAAAAAGCCCCGGGCGGTGAAAAAGCCTACTGCCGGTTAAGCCTGTCCGGGCCTCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTTCATCACAGGCGCATGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGTgg < 1:575013/150‑1 (MQ=255) tgccGGGGGTTAAACCCACTGCGGTGAAAAAGCCCCGGGCGGTGAAAAAGCCTACTGCCGGTTAAGCCTGTCCGGGCCTCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTTCATCACAGGCGCATGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGTGGc < 2:1602038/150‑1 (MQ=255) cGGGGGTTAAACCCACTGCGGTGAAAAAGCCCCGGGCGGTGACACTGTGTACTGCCGGTTAAGCCTGTCCGGGCCTCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTTCATCACAGGCGCATGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGTGGCCaa < 1:1453092/150‑1 (MQ=39) cGGGGGTTAAACCCACTGCGGTGAAAAAGCCCCGGGCGGTGAAAAAGCCTACTGCCGGTTAAGCCTGTCCGGGCCTCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTTCATCACAGGCGCATGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGTGGCCaa > 2:627436/1‑150 (MQ=255) 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cccACTGCGGTGAAAAAGCCCCGGGCGGTGAAAAAGCCTACTGCCGGTTAAGCCTGTCCGGGCCTCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTTCATCACAGGCGCATGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGTGGCCAATGCAGGACAGc > 1:481285/1‑150 (MQ=255) ccACTGCGGTGAAAAAGCCCCGGGCGGTGAAAAAGCCTACTGCCGGTTAAGCCTGTCCGGGCCTCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTTCATCACAGGCGCATGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGTGGCCAATGCAGGACAGca < 2:1457617/150‑1 (MQ=255) cGGTGAAACAGCCCCGGGCGGTGAAAAAGCCTACTGCCGGTTAAGCCTGTCCGGGCCTCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCATACAGGTTCATCACAGGCGCATGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGTGGCCAATGCAGGACAGCACAATTc < 1:1578440/150‑1 (MQ=255) ggTGAAAAAGCCCCGGGCGGTGAAAAAGCCTACTGCCGGTTAAGCCTGTCCGGGCCTCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTTCATCACAGGCGCATGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGTGGCCAATGCAGGACAGCACAATTcc > 2:2006332/1‑150 (MQ=255) gTGAAAAAGCCCCGGGCGGTGAAAAAGCCTACTGCCGGTTAAGCCTGTCCGGGCCTCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTTCATCACAGGCGCATGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGTGGCCAATGCAGGACAGCACAATTccc < 2:481285/150‑1 (MQ=255) 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(MQ=255) ttCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTTCATCACAGGCGCATGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGTGGCCAATGCAGGACAGCACAATTCCCCTTCCATCACGGCCACTCGa > 1:1872520/1‑113 (MQ=255) ttCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCTCATCAAGAACGCATGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGTGGCCAATGCAGGACATCACAATTCCCCTTCCATCACGGCCACTCGAGGATCGTCATGAGCCCCCGCACCCCAAAGagatcgga > 1:565064/1‑143 (MQ=38) g‑cgGGTAAACCCGCTCCTACAGGTTCATCACAGGCGCATGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGTGGCCAATGCAGGACAGCACAATTCCCCTTCCATCACGGCCACTCGAGGATc < 1:1619427/115‑1 (MQ=255) g‑cgGGTAAACCCGCTCCTACAGGTTCATCACAGGCGCATGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGTGGCCAATGCAGGACAGCACAATTCCCCTTCCATCACGGCCACTCGAGGATc > 2:1619427/1‑115 (MQ=255) gTAAACCCGCTCCTACAGGTTCATCACAGGCGCATGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGTGGCCAATGCa > 2:2162138/1‑70 (MQ=255) gTAAACCCGCTCCTACAGGTTCATCACAGGCGCATGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGTGGCCAATGCa < 1:2162138/70‑1 (MQ=255) aaCCCGCTCCTACAGGTTCATCACAGGCGCATGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGTGGCCAATGCAGGACAGCACAATTCCCCTTCCATCACGGCCACTCGAGGATCGTCATGAGCCCCCGCACCCCAAAGAAAACCCGCTCGGTCGCa < 1:896861/150‑1 (MQ=255) cccGCTCCTACAGGTTCATCACAGGCGCAtgtaggagcggg > 2:1612565‑M2/1‑29 (MQ=255) cccGCTCCTACAGGTTCATCACAGGCGCATGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGTGGCCAATGCAGGACAGCACAATTCCCCTTCCATCACGGCCACTc < 2:955938/99‑1 (MQ=255) cccGCTCCTACAGGTTCATCACAGGCGCATGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGTGGCCAATGCAGGACAGCACAATTCCCCTTCCATCACGGCCACTc > 1:955938/1‑99 (MQ=255) ccGCTCCTACAGGTTCATCACAGGCGCATGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGGAGTGGCCAATGCAGGACAGCGCAATTCCCCTTCCATCACGGCCACTCGAGGATCGTCATGAGCCCCCGCACCCCAAAGAAAACCCGGTCGTTCGCAccc > 2:1330488/1‑149 (MQ=255) ccGCTCCTACAGGTTCATCACAGGCGCATGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGTGGCCAATGCAGGACAGCACAATTCCCCTTCCATCACGGCCACTCGAGGATCGTCATGAGCCCCCGCACCCCAAAGAAAACCCGCt < 2:486137/139‑1 (MQ=255) ccGCTCCTACAGGTTCATCACAGGCGCATGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGTGGCCAATGCAGGACAGCACAATTCCCCTTCCATCACGGCCACTCGAGGATCGTCATGAGCCCCCGCACCCCAAAGAAAACCCGCt > 1:486137/1‑139 (MQ=255) ccGCTCCTACAGGTTCATCACAGGCGCATGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGTGGCCAATGCAGGACAGCACAATTCCCCTTCCATCACGGCCACTCGAGGATCGTCATGAGCCCCCGCACCCCAAACAAAACCCGCTCGGTCGCACCa > 2:1099163/1‑150 (MQ=255) gCTCCTACAGGTTCATCACAGGCGCATGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGTGGCCAATGCAg < 1:105323/63‑1 (MQ=255) tCCTACAGGTTCATCACAGGCGCATGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGTGGCCAATGCAGGACAGCACAATTCCCCTTCCATCACGGCCACTCGAGGATCGTCATGAGCCCCCGCACCCCaaa > 2:2098826/1‑124 (MQ=255) tCCTACAGGTTCATCACAGGCGCATGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGTGGCCAATGCAGGACAGCACAATTCCCCTTCCATCACGGCCACTCGAGGATCGTCATGAGCCCCCGCACCCCaaa < 1:2098826/124‑1 (MQ=255) ggTTCATCACAGGCGCATGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGTGGCCAACGCAGGACAGCACAATTCCCCTTCCATCACGGCCACTCGAGGATCGTCATGAGCCCCCGCACCCCAAAGAAAACCCGCTCGGTCGCACCATCGCGCATTcg < 1:2305721/150‑1 (MQ=255) gTTCATCACAGGCGCAtgtaggagcgggtttacccgcgaagaggcccggacaggcttaaccggca < 2:2431779‑M2/65‑50 (MQ=255) catcaCAGGCGCATGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGTGGCCAATGCAGGACAGCACCATTCCCCTTCCATCACGGCCACTCGAGGATCGTCATGAGCCCCCGCACCCCAAAGAAAACCCGCTCGGTCGCACCATCGCGCATTCGCGaa > 1:1268423/1‑150 (MQ=255) caGGCGCATGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGTGGCCAATGCAGGACAGCACAATTCCCCTTCCATCACGGCCACTCGAGGATCGTCATGAGCCCCCGCACCCCAAAGAAAACCCGCTCGGTCGCACCATCGCGCATTCGCGAAGGCAt < 2:293745/150‑1 (MQ=255) caGGCGCATGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGTGGCCAATGCAGGACAGCACAATTCCCCTTCCATCACGGCCACTCGAGGATCGTCATGAGCCCCCGCACCCCAAAGAAAACCCGCTCGGTCGCACCATCGCGCATTCGCGAAGGCAt < 2:2423484/150‑1 (MQ=255) ggCGCATGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGTGGCCAATGCAGGACAGCACAATTCCCCTTCCATCACGGCCACTCGAGGATCGTCATGAGCCCCCGCACACCAAAGAAAACCCGCTCGGTCGCACCATCGCGCATTCGCGAAGGCATGc < 2:30027/150‑1 (MQ=255) gcATGGAGTAGCGGGTTTACCCGCGAAGTGGCCAATGCAGGACAGCACAATTCCCCTTCCATCACGGCCACTCGAGGATCGTCATGAGCCCCCGCACCCCAAAGAAAACCCGCTCGGTCGCACCATCGCGCATTCGCGAAGGCATGCCCt > 2:1807209/1‑150 (MQ=255) aTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGTGGCCAATGCAGGACAGCACAATTCCCCTTCCATCACGGCCACTCGAGGATCGTCATGAGCCCCCGCACCCCAAAGAAAACCCGCTCGGTCGCACCATCGCGCATTc < 1:1604884/133‑1 (MQ=255) | GGCGCCTGCCGAACCCAAGGCGGCTGCCCTGCCGGGGGTTAAACCCACTGCGGTGAAAAAGCCCCGGGCGGTGAAAAAGCCTACTGCCGGTTAAGCCTGTCCGGGCCTCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTTCATCACAGGCGCATGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGTGGCCAATGCAGGACAGCACAATTCCCCTTCCATCACGGCCACTCGAGGATCGTCATGAGCCCCCGCACCCCAAAGAAAACCCGCTCGGTCGCACCATCGCGCATTCGCGAAGGCATGCCCT > NC_002947/4573143‑4573439 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |