| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 4586063 = | 11 (0.120) | 9 (0.140) | 8/174 | NT | 62.8% | intergenic (+102/+115) | PP_4061/PP_4063 | hypothetical protein/long‑chain fatty acid‑‑CoA ligase |
| ? | NC_002947 | 4586167 = | 3 (0.050) | intergenic (+206/+11) | PP_4061/PP_4063 | hypothetical protein/long‑chain fatty acid‑‑CoA ligase | |||||
TCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATGCGGCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACTTCTGCACCTTGCCGGTCACGGTCATCGGGTACTCGTCGACAAAACGTATATACCGCGGCACCTTGAAGTGTGCGATG > NC_002947/4586071‑4586310 | TCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATGCGGCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCa < 1:1337508‑M1/150‑1 (MQ=255) CGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATGCGGCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATg < 2:2049264‑M1/150‑1 (MQ=255) GGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATGCGGCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGc > 1:2049264‑M1/1‑150 (MQ=255) ccgctcctaccaggggcagcgccgcattcaaggccggcacggtccctggtaggagcgggtttacccgcgaagaggccggccGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACTTc > 1:968204‑M2/82‑150 (MQ=255) CCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATGCGGCGCTGCCCCTGGTATGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCAGTCGGAACTTc < 1:1565516‑M1/150‑1 (MQ=255) CCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATGCGGCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACTTc < 1:1918623‑M1/150‑1 (MQ=255) CCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATGCGGCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACTTc < 1:545264‑M1/150‑1 (MQ=255) CCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGACCTTGAATGCGGCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACTTc < 2:78730‑M1/150‑1 (MQ=255) cctaccaggggcagcgccgcattcaaggccggcacggtccctggtaggagcgggtttacccgcgaagaggccggccGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACTTCTGCAc > 1:1657247‑M2/77‑150 (MQ=255) ctaccaggggcagcgccgcattcaaggccggcacggtccctggtaggagcgggtttacccgcgaagaggccggccGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACTTCTGCAcc > 2:862136‑M2/76‑150 (MQ=255) ctaccaggggcagcgccgcattcaaggccggcacggtccctggtaggagcgggtttacccgcgaagaggccggccGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACTTCTGCAcc > 1:1988563‑M2/76‑150 (MQ=255) TACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATGCGGCGCTGCCCCTGGGAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACTTCTGAACCt < 2:1184270‑M1/150‑1 (MQ=255) CAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATGCGGCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACTTCTGCACCTTGc > 2:545264‑M1/1‑150 (MQ=255) gggcagcgccgcattcaaggccggcacggtccctggtaggagcgggtttacccgagacgaggccggccGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACTTCTGCACCTTGCcgg > 1:888177‑M2/69‑150 (MQ=255) ggcagcgccgcattcaaggccggcacggtccctggtaggagcgggtttaccggcgaagaggccggccGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACTTCTGCACCTTGCcggt > 1:2272253‑M2/68‑150 (MQ=255) gcgccgcattcaaggccggcacggtccctggtaggagcgggtttacccgcgaagaggccggccGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACTTCTGCACCTTGCcggtcacg < 2:968204‑M2/87‑1 (MQ=255) gcgccgcattcaaggccggcacggtccctggtaggagcgggtttacccgcgaagaggccggccGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACTTCTGCACCTTGCcggtcacg > 1:934234‑M2/64‑150 (MQ=255) ggCCTTGAATGCGGCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACTTCTGCACCTTGCCGGTCACGGTCAt > 1:2173519/1‑150 (MQ=255) cTTGAATGCGGCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACTTCTGCACCTTGCCGGTCACGGTCATCgg > 1:685271/1‑150 (MQ=255) ggcacggtccctggtaggagcgggtttacccgcgaagaggccggccGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACTTCTGCACCTTGCCGGTCACGGTCATCGGGTACtcgtc < 2:1657247‑M2/104‑1 (MQ=255) gcgcTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACTTCTGCACCTTGCCGGTCACGGTCATCGGGTACtcgtcg > 2:1622285/1‑150 (MQ=255) gcTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACTTCTGCACCTTGCCGGTCACGGTCATCGGGTACTCGTCGAc < 2:1337508/150‑1 (MQ=255) ccctggtaggagcgggtttacccgcgaagaggccggccGCGCCAGcac < 2:2109608‑M2/10‑1 (MQ=255) ccctggtaggagcgggtttacccgcgaagaggccggccGCGCCAGcac > 1:2109608‑M2/39‑48 (MQ=255) cctggtaggagcgggtttacccgcgaagaggccggccGCGCCAGcac > 2:1601971‑M2/38‑47 (MQ=255) cctggtaggagcgggtttacccgcgaagaggccggccGCGCCAGcac < 1:1601971‑M2/10‑1 (MQ=255) ctggtaggagcgggtttacccgcgaagaggccggccGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCTGAACTGCTGCACCTTGCCGGTCACGGGCATCGGGTACTCTTCGACAAAACGt > 2:1706623‑M2/37‑150 (MQ=255) tggtaggagcgggtttacccgcgaagaggccggccGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCAc > 1:2020898‑M2/36‑90 (MQ=255) tggtaggagcgggtttacccgcgaagaggccggccGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCAc < 2:2020898‑M2/55‑1 (MQ=255) tggtaggagcgggtttacccgcgaagaggccggccGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACTTCTGCACCTTGCCGGTCACGGTCATCGGGTACTCGTCGACAAAACGta < 2:2173519‑M2/115‑1 (MQ=255) aggagcgggtttacccgcgaagaggccggccGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACTTCTGCACCTTGCCGGTCACGGTCATCGGGTACTCGTCGACAAAACGtatata > 2:2130618‑M2/32‑150 (MQ=255) gcgggtttacccgcgaagaggccggccGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACTTCTGCACCTTGCCGGTCACGGTCATCGGGTACTCGTCGACAAAACGTATATACcgc < 1:1622285‑M2/123‑1 (MQ=255) gcgggtttacccgcgaagaggccggccGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACTTCTGCACCTTGCCGGTCACGGTCATCGGGTACTCGTCGACAAAACGTATATACcgc > 2:843808‑M2/28‑150 (MQ=255) acccgcgaagaggccggccGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACTTCTGCACCTTGCCGGTCACGGTCATCGGGTACTCGTCGACAAAACGTATATACCGCGGCACCtt < 1:78730‑M2/131‑1 (MQ=255) ccgcgaagaggccggccGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACTTCTGCACCTTGCCGGTCACGGTCATCGGGTACtc < 2:1990726‑M2/101‑1 (MQ=255) ccgcgaagaggccggccGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACTTCTGCACCTTGCCGGTCACGGTCATCGGGTACtc > 1:1990726‑M2/18‑118 (MQ=255) ccgcgaagaggccggccGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACTTCTGCACCTTGCCGGTCACGGTCATCGGGTACTCGTCGACAAAACGTATATACCGCGGCACCTTGa > 2:2111464‑M2/18‑150 (MQ=255) ccgcgaagaggccggccGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACTTCTGCACCTTGCCGGTCACGGTCATCGGGTACTCGTCGACAAAACGTATATACCGCGGCACCTTGa > 1:1443656‑M2/18‑150 (MQ=255) gcgaagaggccggccGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACTTCTGCACCTTGCCGGTCACGGTCATCGGGTACTCGTCGACAAAACGTATATACCGCGGCACCTTGAAg < 1:862136‑M2/135‑1 (MQ=255) agaggccggccGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACTTCTGCACCTTGCCGGTCACGGTCATCGGGTACTCGTCGACAAAACGTATATACCGCGGCACCTTGAAGtgtg < 2:934234‑M2/139‑1 (MQ=255) aggccggccGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACTTCTGCACCTTGCCGGTCACGGTCATCGGGTACTCGTCGACAAAACGTATATACCGCGGCACCTTGAAGTGTGCg > 1:48850‑M2/10‑150 (MQ=255) gccggccGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAAt < 2:2197891‑M2/35‑1 (MQ=255) gccggccGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAAt > 1:2197891‑M2/8‑42 (MQ=255) ccggccGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACTTCTGCACCTTGCCGGTCACGGTCATCGGGTACTCGTCGACAAAACGTATATACCGCGGCACCTTGAAGTGTGCGATg > 1:2129395‑M2/7‑150 (MQ=255) ccggccGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACTTCTGCACCTTGCCGGTCACGGTCATCGGGTACTCGTCGACAAAACGTATATACCGCGGCACCTTGAAGTGTGCGATg > 1:1267875‑M2/7‑150 (MQ=255) | TCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATGCGGCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACTTCTGCACCTTGCCGGTCACGGTCATCGGGTACTCGTCGACAAAACGTATATACCGCGGCACCTTGAAGTGTGCGATG > NC_002947/4586071‑4586310 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |