New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 5210282 | 54 (0.580) | 4 (0.050) | 4/218 | NT | 6.5% | intergenic (‑100/+78) | rnd/PP_4592 | ribonuclease D/metal dependent hydrolase |
? | NC_002947 | = 5210341 | 68 (0.840) | intergenic (‑159/+19) | rnd/PP_4592 | ribonuclease D/metal dependent hydrolase |
CCACTAACATTGGCGCGCAGTATATACGGCGCGGGCACTGCGGGTGAAACTGTCCCGCTTTTCGGGGGCAGTCCACCCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAATGAAGGCAACACGGTGTATGGCCCGGGTTTGCCCGGGTTCGCGGGCGTGCCCGCTCCCACAGGGCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAGGCCGGCAACCGGCAAACATGTCCAGCGACTGCTGGTAGAGCTCGGTATGTACCTGCAACAGGCCAAGCATCGAGTGGAACAGGTTGTCCTGGGACAGCGGGGC > NC_002947/5210192‑5210485 | ccACTAACATTGGCGCGCAGTATATACGGCGCGGGCACTGCGGGTGAAACTGTCCCGCTTTTCGGGGGCAGTCCACCCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAATGAAGGCAACACGGTGTATGGCCCGGGTTTGCCCGGGTTCGCGGGCGt > 1:2168018/1‑150 (MQ=255) ccACTAACATTGGCGCGCAGTATATACGGCGCGGGCACTGCGGGTGAAACTGTCCCGCTTTTCGGGGGCAGTCCACCCTGTGGGAGCGGCCGCGCCCGCGAATGAAGGCAACACGGTGTATGGCCCGGGTTTGCCCGGGTTCGCGGGCGt > 2:903349/1‑150 (MQ=255) ccACTAACACTGGCGCGCAGTATATACGGCGCGGGCACTGCGGGTGAAACTGTCCCGCTTTTCGGGGGCAGTCCACCCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAATGAAGGCAACACGGTGTATGGCCCGGGTTTGCCCGGGTTCGCGGGCGt < 1:1924756/150‑1 (MQ=255) cACTAACGTGGGCGCGCAGTATATACGGCGCGGGCACTGCGGGTGAAACTGTCCCGCTTTTCGGGGGCAGTCCACCCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAATGAAGGCAACACGGTGTATGGCCCGGGTTTGCCCGGGTTCGCGGGCGTg > 2:463884‑M2/1‑149 (MQ=255) aCTAACATTGGCGCGCAGTATATACGGCGCGGGCACTGCGGGTGAAACTGTCCCGCTTTTCGGGGGCAGTCCACCCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAATGAAGGCAACACGGTGTATGGCCCGGGTTTGCCCGGGTTCGCGGGCGTgc > 2:1612895‑M2/1‑148 (MQ=255) aCTAACATTGGCGCGCAGTATATACGGCGCGGGCACTGCGGGTGAAACTGTCCCGCTTTTCGGGGGCAGTCCACCCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAATGAAGGCAACACGGTGTATGGCCCGGGTTTGCCCGGGTTCGCGGGCGTgc > 2:1423245‑M2/1‑148 (MQ=255) aCTAACATTGGCGCGCAGTATATACGGCGCGGGCACTGCGGGTGAAACTGTCCCGCTTTTCGGGGGCAGTCCACCCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAATGAAGGCAACACGGTGTATGGCCCGGGTTTGCCCGGGTTCGCGGGCGTgc > 1:868504‑M2/1‑148 (MQ=255) tAACATTGGCGCGCAGTATATACGGCGCGGGCACTGCGGGTGAAACTGTCCCGCTTTTCGGGGGCAGTCCACCCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAATGAAGGCAACACGGTGTATGGCCCGGGTTTGCCCGGGTTCGCGGGCGTgccc > 2:973935‑M2/1‑146 (MQ=255) tAACATTGGCGCGCAGTATATACGGCGCGGGCACTGCGGGTGAAACTGTCCCGCTTTTCGGGGGCAGTCCACCCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAATGAAGGCAACACGGTGTATGGCCCGGGTTTGCCCGGGTTCGCGGGCGTgccc < 2:912799‑M2/150‑5 (MQ=255) ggCGCGCAGTATATACGGCGCGCGCACTGCGGGTGAAACTGTCCCGCTTTTCGGGGGCAGTCCACCCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAATGAAGGCAACACGGTGTATGGCCCGGGTTTGCCCGGGTTCGCGGGCGTgcccgctccca > 2:1198649‑M2/1‑139 (MQ=255) gcgcgcAGTATATACGGCGCGGGCACTGCGGGTGAAACTGTCCCGCTTTTCGGGGGCAGTCCACCCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAATGAAGGCAACACGGTGTATGGCCCGGGTTTGCCCGGGTTCGCGGGCGTgcccgctcccac < 1:1725856‑M2/150‑13 (MQ=255) cgcgcAGTATATACGGCGCGGGCACTGCGGGTGAAACTGTCCCGCTTTTCGGGGGCAGTCCACCCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAATGAAGGCAACACGGTGTATGGCCCGGGTTTGCCCGGGTTCGCGGGCGTgcccgctcccaca > 1:1560383‑M2/1‑137 (MQ=255) gcgcAGTATATACGGCGCGGGCACTGCGGGTGAAACTGGGCCACGTTTCTGGGGCAGTCCACCCTGTGGGGGCTTGCTCGCCCGCGAATGAAGGCAACACGGTGTATGGCCCGGGTTTGCCCGGGTTCGCGGGCGTgcccgctcccacag > 1:1114901‑M2/1‑136 (MQ=255) cgcAGTATATATGGCGCGGGCACTGCGGGTGAAACTGTCCCGCTTTTCGGGGGCAGTCCACCCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAATGAAGGCAACACGGTGTATGGCCCGGGTTTGCCCGGGTTCGCGGGCGTgcccgctcccanagg > 2:1508749‑M2/1‑135 (MQ=255) cgcAGTATATACGGCGCGGGCACTGCGGGTGAAACTGTCCCGCTTTTCGGGGGCAGTCCACCCTGTGGGAGCGGCCGCGCCCGCGAATGAAGGCAACACGGTGTATGGCCCGGGTTTGCCCGGGTTCGCGGGCGTgcccgctcccacagg > 1:903349‑M2/1‑135 (MQ=255) gTATATACGGCGCGGGCACTGCGGGTGAAACTGTCCCGCTTTTCGGGGGCAGTCCACCCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAATGAAGGCAACACGGTGTATGGCCCGGGTTTGCCCGGGTTCGCGGGCGTGCCCGCTCCCACAGGGCtt > 1:969241/1‑150 (MQ=255) gTATATACGGCGCGGGCACTGCGGGTGAAACTGTCCCGCTTTTCGGGGGCAGTCCACCCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAATGAAGGCAACACGGTGTATGGCCCGGGTTTGCCCGGGTTCGCGGGCGTGCCCGCTCCCACAGGGCtt > 2:404630/1‑150 (MQ=255) tatataCGGCGCGGGCACTGCGGGTGAAACTGTCCCGCTTTTCGGGGGCAGTCCACCCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAATGAAGGCAACACGGTGTATGGCCCGGGTTTGCCCGGGTTCGCGTGCGTGCCCGCTCCCACAGGGCTTc > 2:502217/1‑150 (MQ=255) 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gCCCGGGTTCGCGGGCGTGCCCGCTCCCACAGGGCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAGGCCGGCAACCGGCAAACATGTCCAGCGACTGCTGGTAGAGCTCGGTATGTACCTGCAACAGGCCAAGCATCGAGTGGAACAGGTTGTCCTg < 2:631025/150‑1 (MQ=255) cccGGGTTCGCGGGCGTGCCCGCTCCCACAGGGCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAGGCCGGCAACCGGCAAACATGTCCAGCGACTGCTGGTAGAGCTCGGTATGTACCTGCAACAGGCCAAGCATCGAGTGGAACAGGTTGTCCTgg > 2:1085809/1‑150 (MQ=255) cccGGGTTCGCGGGCGTGCCCGCTCCCACAGGGCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAGGCCGGCAACCGGCAAACATGTCCAGCGACTGCTGGTAGAGCTCGGTATGTACCTGCAACAGGCCAAGCATCGAGTGGAACAGGTTGTCCTgg < 1:1317828/150‑1 (MQ=255) ccGGGTTCGCGGGTGTGCCCGCTCCCACAGGGCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAGGCCGGCAACCGGCAAACATGTCCAGCGACTGCTGGTAGAGCTCGGTATGTACCTGCAACAg < 2:2097818/118‑1 (MQ=255) ccGGGTTCGCGGGTGTGCCCGCTCCCACAGGGCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAGGCCGGCAACCGGCAAACATGTCCAGCGACTGCTGGTAGAGCTCGGTATGTACCTGCAACAg > 1:2097818/1‑118 (MQ=255) ccGGGTTCGCGGGCGTGCCCGCTCCCACAGGGCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAGGCCGGCAACCGGCAAACATGTCCAGCGACTGCTGGTAGAGCTCgg > 2:939987/1‑102 (MQ=255) ccGGGTTCGCGGGCGTGCCCGCTCCCACAGGGCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAGGCCGGCAACCGGCAAACATGTCCAGCGACTGCTGGTAGAGCTCgg < 1:939987/102‑1 (MQ=255) ccGGGTTCGCGGGCGTGCCCGCTCCCACAGGGCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAGGCCGGCAACCGGCAAACATGTCCAGCGACTGCTGGTAGAGCTCGGTATGTAc < 2:1955411/109‑1 (MQ=255) ccGGGTTCGCGGGCGTGCCCGCTCCCACAGGGCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAGGCCGGCAACCGGCAAACATGTCCAGCGACTGCTGGTAGAGCTCGGTATGTAc > 1:1955411/1‑109 (MQ=255) ccGGGTTCGCGGGCGTGCCCGCTCCCACAGGGCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAGGCCGGCAACCGGCAAACATGTCCAGCGACTGCTGGTAGAGCTCGGTATGTACCTGCAACAGGCCAAGCATCGAGTGGAACAGGTTGTCCTggg > 2:1866290/1‑150 (MQ=255) gTTCGCGGGCGTGCCCGCTCCCACAGGGCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAGGCCGGCAACCGGCAAACATGTCCAGCGACTGCTGGTAGAGCTCGGTATGTACCTGCAACAGGCCAAGCATCGAGTGGAACAGGTTGTc < 1:2098062/141‑1 (MQ=255) gTTCGCGGGCGTGCCCGCTCCCACAGGGCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAGGCCGGCAACCGGCAAACATGTCCAGCGACTGCTGGTAGAGCTCGGTATGTACCTGCAACAGGCCAAGCATCGAGTGGAACAGGTTGTc > 2:2098062/1‑141 (MQ=255) ggagcgGGCACGCCCGCTCCCACAGGGCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAGGCCGGCAACCGGCAAACATGTCCAGCGACTGCTGGTAGAGCTCGGTATGTACCTGCAACAGGCCAAGCATCGAGTGGAACAGGTTGTCCTgg > 1:96665/4‑144 (MQ=255) gcgGGAGTGCCCGCTCCCACAGGGCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAGGCCGGCAACCGGCAAACATGTCCAGCGACTGCTGGTAGAGCTCGGTATGTACCTGCAACAGGCCAAGCATCGAGTGGAACAGGTTGTCCTGGGACAGCggg < 1:1606018/150‑1 (MQ=255) gggCGTGCCCGCTCCCACAGGGCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAGGCCGGCAACCGGCAAACATGTCCAGCGACTGCTGGTAGAGCTCGGTATGTACCTGCAACAGGCCAAGCATCGAGTGGAACAGGTTGTCCTGGGACAGCGGGGc > 2:1195477/1‑150 (MQ=255) | CCACTAACATTGGCGCGCAGTATATACGGCGCGGGCACTGCGGGTGAAACTGTCCCGCTTTTCGGGGGCAGTCCACCCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAATGAAGGCAACACGGTGTATGGCCCGGGTTTGCCCGGGTTCGCGGGCGTGCCCGCTCCCACAGGGCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAGGCCGGCAACCGGCAAACATGTCCAGCGACTGCTGGTAGAGCTCGGTATGTACCTGCAACAGGCCAAGCATCGAGTGGAACAGGTTGTCCTGGGACAGCGGGGC > NC_002947/5210192‑5210485 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |