New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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? | NC_002947 | = 5743432 | 99 (1.180) | intergenic (‑209/+38) | fbp/glgP | class 1 fructose‑1,6‑bisphosphatase/glycogen phosphorylase |
Only 100 of 152 total aligned reads displayed.
GGCTAGCGAGTGATGAGACTCGCCACGGCTCTCAGACGGCACAATAGGTCGGTAGTTCAGCCTTCGCCAGGCCGGTGGTCTGGTTGTGTGTCCATTCGCGGGCGCGCTCGCTCCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTCGCGAATGGTGCGGTCCGACGAGAACCAGCCCATCCGTGCCGTGTTCAATACCGCCTTGCGCCACCACTCCTGC > NC_002947/5743284‑5743578 | gCTAGCGAGTGATGAGACTCGCCACGGCTCTCAGACGGCACAATAGGTCGGTAGTTCAGCCTTCGCCAGGCCGGTGGTCTGGTTGTGTGTCCATTCGCGGGCGCGCTCGCTCCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACac < 1:2164623‑M2/150‑3 (MQ=255) gCGAGTGATGAGACTCGCCACGGCTCTCAGGCGGCACAATAGGTCGGTAGTTCAGCCTTCGCCAGGCCGGTGGTCTGGTTGTGTGTCCATTCGCGGGCGCGCTCGCTCCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACacctgt < 1:1638569‑M2/150‑7 (MQ=255) cacggcacggatgggctggttctcgtcggaccgcaccattcgcgaatatgccaccgagatctggaaggcattggattgaggtgaggccaTTCGCGGGCGCGCTCGCTCCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACACCtgt > 1:1989997‑M1/90‑150 (MQ=255) 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cTCGCCACGGCTCTCAGACGGCACAATAGGTCGGTAGTTCAGCCTTCGCCAGGCCGGTGGTCTGGTTGTGTGTCCATTCGCGGGCGCGCTCGCTCCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTg > 2:163966/1‑150 (MQ=255) ccACGGCTCTCAGACGGCACAATAGGTCGGTAGTTCAGCCTTCGCCAGGCCGGTGGTCTGGTTGTGTGTCCATTCGCGGGCGCGCTCGCTCCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACacctgtg > 1:2266755‑M2/1‑127 (MQ=255) ccACGGCTCTCAGACGGCACAATAGGTCGGTAGTTCAGCCTTCGCCAGGCCGGTGGTCTGGTTGTGTGTCCATTCGCGGGCGCGCTCGCTCCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCcg < 1:1524935/150‑1 (MQ=255) aCGGCTCTCAGACGGCACAATAGGTCGGTAGTTCAGCCTTCGCCAGGCCGGTGGTCTGGTTGTGTGTCCATTCGCGGGCGCGCTCGCTCCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCcgcg > 2:202666/1‑150 (MQ=255) tctcAGACGGCACAATAGGTCGGTAGTTCAGCCTTCGCCAGGCCGGTGGTCTGGTTGTGTGTCCATTCGCGGGCGCGCTCGCTCCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACACCTGTGGTAGCGGGCGTGCCCGCGAACg < 1:1208577/149‑1 (MQ=255) 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acaGGTACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaatggacacacaaccagaccaccggcctggcgacggctgaactaccgacctattgtgccgtctgaga > 2:1728795‑M2/1‑34 (MQ=255) acaGGTACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaatggacacacaaccagaccaccggcctggcgaaggctgaactaccgacctattgtgccgtctgaga < 1:1728795‑M2/126‑93 (MQ=255) acaGGTACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACacctgtgggagcgggcacgcccgctc > 2:1801294‑M2/1‑34 (MQ=255) acaGGTACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACacctgtgggagcgggcacgcccgctc < 1:1801294‑M2/60‑27 (MQ=255) acaGGTACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACacctgtgggagcgagcgcgcccgcgaatggacacacaaccagaccaccggcctggcgaaggctgaactaccgacctattgtgccgtctgagagccgtggcgagtctcatcactcgc < 1:303703‑M2/150‑117 (MQ=255) caGGTACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTg < 2:868822/98‑1 (MQ=255) ggTACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTCGCGAATGGTGCGGTCCGACGAGAACCAGCCCATCCGTGCCGTGTTc < 1:1572865/150‑1 (MQ=255) gTACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGGGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTCGCGAATGGTGCGGTCCGACGAGAACCAGCCCATCCGTGCCGTGTTCa < 1:1674396/150‑1 (MQ=255) gTACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACacctgtgggagcgagcgcgcccgcgaatggacacacaaccagaccaccggcctggcgaag > 1:659068‑M2/1‑30 (MQ=255) aCAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCCTCCAGATCTCGGTGGGACGTGCGGGAATGGTGCGGTCCGACGAGAACCAGCCCATCCGTGCCGTGTTCAAt > 2:1883192/1‑150 (MQ=255) aGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTcgc < 2:1507377/101‑1 (MQ=255) aGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTcgc > 1:1507377/1‑101 (MQ=255) aGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTCGCGAATGGTGCGGTCCGACGAGAACCAGCCCATCCGTGCCGTGTTCAATAc < 1:852059/150‑1 (MQ=255) aaGCCTTGAAGCTTGCGAGACacctgtgggagcgagcgcgcccgcgaatggacacacaaccagaccaccggcctggcgaaggctgaactaccgacctattgtgccgtctgagagccgtggcgagtctcatcactcgctagcccgtcactc < 2:344921‑M2/150‑130 (MQ=255) aGCCTTGAAGCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTCGCGAATGGTGCGGTCCGACGAGAACCAGCCCATCCGTGCCGTGTTCAATACCGCCtt < 2:2394948/150‑1 (MQ=255) cTTGAAGCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTCGCGaa > 1:2026180/1‑95 (MQ=255) cTTGAAGCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTCGCGAATGGTGCGGTCcgac < 1:1823098/109‑1 (MQ=255) cTTGAAGCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATACAATGCCTTCCAGATTTAGATGGAGAATGAAATATTGGTGCGGTCCGACGAGAACCAGCCCATCCGTGCCGTGTTCAAGACCGCCTTgcg > 1:543632/1‑150 (MQ=255) ttGAAGCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTCGCGAATGGTGCGGTCCGACGAGAACCAGCCCATCCGTGCCGTGTTCAATACCGCCTTgcgc > 1:2242781/1‑150 (MQ=255) aaGCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTCGCGAATGGTGCGGTCCGACGAGAACCAGCCCATCCGTGCCGTGTTCAATACCGCCTTGCGccac < 1:2348806/150‑1 (MQ=255) cTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTCGCGAATGGTGCGGTCcgac < 2:154944/102‑1 (MQ=255) cGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTCGCGAATGGTGCGGTCCGACGAGAACCAGCCCATCCGTGCCGTGTTCAATACCGCCTTGCGCCACCACTCCt < 1:2421351/150‑1 (MQ=255) gagaCacctgtgggagcgggcgcgcccgcgaatggacacacaaccagaccaccggcctggcgaaggctgaactaccgacctattgtgccgtctgagagccgtggcgagtctcatcactcgctagcccgtcagtcagccggtaaactgcgt > 2:1281731‑M2/1‑5 (MQ=255) gagaCacctgtgggagcgagcgcgcccgcgaatggacacacaaccagaccaccggcctggcgaaggctgaactaccgacctattgtgccgtctgagagccgtggcgagtctcatcactcgctagcccgtcactctccctgtaaactgcgt > 2:303703‑M2/1‑5 (MQ=255) | GGCTAGCGAGTGATGAGACTCGCCACGGCTCTCAGACGGCACAATAGGTCGGTAGTTCAGCCTTCGCCAGGCCGGTGGTCTGGTTGTGTGTCCATTCGCGGGCGCGCTCGCTCCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTCGCGAATGGTGCGGTCCGACGAGAACCAGCCCATCCGTGCCGTGTTCAATACCGCCTTGCGCCACCACTCCTGC > NC_002947/5743284‑5743578 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |