| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 5783618 | 85 (0.910) | 6 (0.070) | 5/228 | NT | 7.1% | coding (2037/3309 nt) | kefA | intermediate mechanosensitive channel protein |
| ? | NC_002947 | = 5783629 | 80 (0.940) | coding (2048/3309 nt) | kefA | intermediate mechanosensitive channel protein | |||||
Only 100 of 101 total aligned reads displayed.
CCAGCCTTCGGCACTGGCAGACGACGTGTTGGGCATCGGCGTGGTGCTGACCTGCTATGCGCTAATGGCCTGGCTGCTCAGCCGTCTGCTGCTCAGCAGCCCGGCACACCGTGACACCTCGCTG‑‑TTCCGCAGGGCGGTGGGGGTAGCGTTCACCGCCCTGCCCATCGCCCTGTTCGTCGCCGTGTGCTTCGGCTACTACTACACGGCACTGAAGCTTACCGATCGACTCATCTACACCCTGTACCTGCTGCTGTTCTGGTTGGTGATCGAAGCCGCCTTCGTGCGCGGCCTGTCGGTG > NC_002947/5783480‑5783777 | ccAGCCTTCGGCACTGGCAGACGACGTGTTGGGCATCGGCGTGGTGCTGACCTGCTATGCGCTAATGGCCTGGCTGCTCAGCCGTCTGCTGCTCAGCAGCCCGGCACACCGTGACACCTCGCTG‑‑TTCCGCAGGGCGGTGGGGGTAGCGtt > 1:2399993/1‑150 (MQ=255) cAGCCTTCGGCACTGGCAGACGACGTGTTGGGCATCGGCGTGGTGCTGACCTGCTATGCGCTAATGGCCTGGCTGCTCAGCCGTCTGCTGCTCAGCAGCCCGGCACACCGTGACACCTCGCTG‑‑TTCCGCAGGGCGGTGGGGGTAGCGTTc < 2:549645‑M2/150‑2 (MQ=255) cAGCCTTCGGCACTGGCAGACGACGTGTTGGGCATCGGCGTGGTGCTGACCTGCTATGCGCTAATGGCCTGGCTGCTCAGCCGTCTGCTGCTCAGCAGCCCGGCACACCGTGACACCTCGCTG‑‑TTCCGCAGGGCGGTGGGGGTAGCGTTc < 1:2423485‑M2/150‑2 (MQ=255) cAGCCTTCGGCACTGGCAGACGACGTGTTGGGCATCGGCGTGGTGCTGACCTGCTATGCGCTAATGGCCTGGCTGCTCAGCCGTCTGCTGCTCAGCAGCCCGGCACACCGTGACACCTCGCTG‑‑TTCCGCAGGGCGGTGGGGGTAGCGTTc < 1:1646898‑M2/150‑2 (MQ=255) ggcCTTCGGCACTGGCAGACGACGTGTTGGGCATCGGCGTGGTGCTGACCTGCTATGCGCTAATGGCCTGGCTGCTCAGCCGTCTGCTGCTCAGCAGCCCGGCACACCGTGACACCTCGCTG‑‑TTCCGCAGGGCGGTGGGGGTAGCGTTca > 2:263604‑M2/2‑148 (MQ=255) ccTTCGGCACTGGCAGACGACGTGTTGGGCATCGGCGTGGTGCTGACCTGCTATGCGCTAATGGCCTGGCTGCTCAGCCGTCTGCTGCTCAGCAGCCCGGCACACCGTGACACCTCGCTG‑‑TTCCGCAGGGCGGTGGGGGTAGCGTTcacc < 2:1387396‑M2/150‑5 (MQ=255) tCGGCACTGGCAGACGACGTGTTGGGCATNGGCGTGGTGCTGACNTGCTNTGCGCTAATGGCCTGGATGCTCAGCCGTCTGCTGCTCAGCAGCCCGGCACACCGTGACACCTCGCTG‑‑TTCCGCAGGGCGGTGGGGGTAGCGTTaaccgca < 1:589907‑M2/150‑8 (MQ=255) ggCACTGGCAGACGACGTGTTGGGCATCGGCGTGGTGCTGACCTGCTATGCGCTAATGGCCTGGCTGCTCAGCCGTCTGCTGCTCAGCAGCCCGGCACACCGTGACACCTCGCTG‑‑TTCCGCAGGGCGGTGGGGGTAGCGTTcaccgccct > 2:2218008‑M2/1‑141 (MQ=255) gCACTGGCAGACGACGTGTTGGGCATCGGCGTGGTGCTGACCTGCTATGCGCTAATGGCCTGGCTGCTCAGCCGTCTGCTGCTCAGCAGCCCGGCACACCGTGACACCTCGCTG‑‑TTCCGCAGGGCGGTGGGGGTAGCGTTcaccgccctg < 1:99103‑M2/150‑11 (MQ=255) cACTGGCAGACGACGTGTTGGGCATCGGCGTGGTGCTGACCTGCTATGCGCTAATGGCCTGGCTGCTCAGCCGTCTGCTGCTCAGCAGCCCGGCACACCGTGACACCTCGCTG‑‑TTCCGCAGGGCGGTGGGGGTAGCGTTcaccgccctgc < 2:1165748‑M2/150‑12 (MQ=255) gCAGACGACGTGTTGGGCATCGGCGTGGTGCTGACCTGCTATGCGCTAATGGCCTGGCTGCTCAGCCGTCTGCTGCTCAGCAGCCCGGCACACCGTGACACCTCGCTG‑‑TTCCGCAGGGCGGTGGGGGTAGCGTTCACCGCCCTGCCCATc > 2:1399567/1‑150 (MQ=255) aaGACGACGTGTAGGGAATGAGCGTAGAGCAGACCGTCTATGCTCTAATGGCCTGGCTGCTCAGCCGTCTGCTGCTCAGCAGCCCGGCACACCGTGACACCTCGCTG‑‑TTCCGCAGGGCGGTGGGGGTAGCGTTCACCGCCCTGCCCATCg < 2:1098074/149‑1 (MQ=255) aGACGACGTGTTGGGCATCGGCGTGGTGCTGACCTGCTATGCGCTAATGGCCTGGCTGCTCAGCCGTCTGCTGCTCAGCAGCCCGGCCCACGGTG‑‑GCCGAGCTGGACACCGCAGTGCGGTGGGGGTAGCGTTCACCGCCCTGCCCCTCGc > 2:664029/1‑150 (MQ=255) aGACGACGTGTTGGGCATCGGCGTGGTGCTGACCTGCTATGCGCTAATGGCCTGGCTGCTCAGCCGTCTGCTGCTCAGCAGCCCGGCACACCGTGACACCTCGCTG‑‑TTCCGCAGGGCGGTGGGGGTAGCGTTCACCGCCCTGCCCATCGc < 1:1165748/150‑1 (MQ=255) gacgTGTTGGGCATCGGCGTGGTGCTGACCTGCTATGCGCTAATGGCCTGGCTGCTCAGCCGTCTGCTGCTCAGCAGCCCGGCACACCGTGACACCTCGCTG‑‑TTCCGCAGGGCGGTGGGGGTAGCGTTCACCGCCCTGCCCATCGCCCTg > 1:667187/1‑150 (MQ=255) ttGGGCATCGGCGTGGTGCTGACCTGCTATGCGCTAATGGCCTGGCTGCTCAGCCGTCTGCTGCTCAGCAGCCCGGCACACCGTGACACCTCGCTG‑‑TTCCGCAGGGCGGTGGGGGTAGCGTTCACCGCCCTACCCATCGCCCTGTtcgtc < 1:549645/150‑1 (MQ=255) gggCATCGGCGTGGTGCTGACCTGCTATGCGCTAATGGCCTGGCTGCTCAGCCGTCTGCTGCTCAGCAGCCCGGCACACCGTGACACCTCGCTG‑‑TTCCGCAGGGCGGTGGGGGTAGCGTTCACCGCCCTGCCCATCGCCCTGTTCGTCGc > 2:1575988/1‑150 (MQ=255) ggCATCGGCGTGGTGCTGACCTGCTATGCGCTAATGGCCTGGCTGCTCAGCCGTCTGCTGCTCAGCAGCCCGGCACACCGTGACACCTCGCTG‑‑TTCCGCAGGGCGGTGGTGGTAGCGTTCACCGCCCTGCCCATCGCCCTGTTCGTCGcc < 2:1438312/150‑1 (MQ=255) 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gtgCTGACCTGCTATGCGCTAATGGCCTGGCTGCTCAGCCGTCTGCTGCTCAGCAGCCCGGCACACCGTGACACCTCGCTG‑‑TTCCGCAGGGCGGTGGGGGTAGCGTTCACCGCCCTGCCCATCGCCCTGTTCGTCGCCGTGTGCTTCGGc < 1:1266371/150‑1 (MQ=255) tgCTGACCTGCTATGCGCTAATGGCCTGGCTGCTCAGCCGTCTGCTGCTCAGCAGCCCGGCACACCGTGACACCTCGCTG‑‑TTCCGCAGGGCGGTGGGGGTAGCGTTCACCGCCCTGCCCATCGCCCTGTTCGTCGCCGTGTGCTTCGGct > 2:2398911/1‑150 (MQ=255) aCCTGCTATGCGCTAATGGCCTGGCTGCTCAGCCGTCTGCTGCTCAGCAGCCCGGCACACCGTGACACCTCGCTG‑‑TTCCGCAGGGCGGTGGGGGTAGCGTTCACCGCCCTGCCCATCGCCCTGTTCGTCGCCGTGTGCTTCGGctactac > 1:71210/1‑150 (MQ=255) ccTGCTATGCGCTAATGGCCTGGCTGCTCAGCCGTCTGCTGCTCAGCAGCCCGGCACACCGTGACACCTCGCTG‑‑TTCCGCAGGGCGGTGGGGGTAGCGTTCACCGCCCTGCCCATCGCCCTGTTCGTCGCCGTGTGCTTCGGctactact > 1:488399/1‑150 (MQ=255) aTGCGCTAATGGCCTGGCTGCTCAGCCGTCTGCTGCTCAGCAGCCCGGCACACCGTGACACCTCGCTG‑‑TTCCGCAGGGCGGTGGGGGTAGCGTTCACCGCCCTGCCCATCGCCCTGTTCGTCGCCGTGTGCTTCGGCTACTACTACACgg < 2:1051876/150‑1 (MQ=255) gcTAATGGACTAGCTGCTCAGCCGTCTGCTGCTCAGCAGCCCGGCACACCGTTACACCTCGCTG‑‑TTCCGCAGGGCGGTGGGGGTAGCGTTCACCGCCCTGCCCATCGCCCTGTTCGTCGCCGTGTGCTTCGGCTACTACTACACGGCACt > 2:1910581/1‑150 (MQ=255) tAATGGCCTGGCTGCTCAGCCGTCTGCTGCTCAGCAGCCCGGCACACCGTGACACCTCGCTG‑‑TTCCGCAGGGCGGTGGGGGTAGCGTTCACCGCCCTGCCCATCGCCCTGTTCGTCGCCGTGTGCTTCGGCTACTACTACACGGCACTGa > 2:1867533/1‑150 (MQ=255) tAATGGCCTGGCTGCTCAGCCGTCTGCTGCTCAGCAGCCCGGCACACCGTGACACCTCGCTG‑‑TTCCGCAGGGCGGTGGGGGTAGCGTTCACCGCCCTGCCCATCGCCCTGTTCGTCGCCGTGTGCTTCGGCTACTACTACACGGCACTGa < 1:1867533/150‑1 (MQ=255) aTGGCCTGGCTGCTCAGCCGTCTGCTGCTCAGCAGCCCGGCACACCGTGACACCTCGCTG‑‑TTCCGCAGGGCGGTGGGGGTAGCGTTCACCGCCCTGCCCATCGCCCTGTTCGTCGCCGTGTGCTTCGGCTACTACTACACGGCACTGAAg < 1:2398911/150‑1 (MQ=255) tGGCTGCTCAGCCGTCTGCTGCTCAGCAGCCCGGCACACCGTGACACCTCGCTG‑‑TTCCGCAGGGCGGTGGGGGTAGCGTTCACCGCCCTGCCCATCGCCCTGTTCGTCGCCGTGTGCTTCGGCTACTACTACACGGCACTGAAGCTTAcc > 2:2070359/1‑150 (MQ=255) 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(MQ=255) tCGCTG‑‑TTCCGCAGGGCGGTGGGGGTAGCGTTCACCGCCCTGCCCATCGCCCTGTTCGTCGCCg < 1:702781/64‑1 (MQ=255) tCGCTG‑‑TTCCGCAGGGCGGTGGGGGTAGCGTTCACCGCCCTGCCCATCGCCCTGTTCGTCGCCGTGTGCTTCGGCTACTACTACACGGCACTGAAGCTTACCGATCGACTCATCTACACCCTGTACCTGCTGCTGTTCTGGTTGGTGATc > 2:794612/1‑150 (MQ=255) cTG‑‑TTCCGCAGGGCGGTGGGGGTAGCGTTCACCGCCCTGCCCATCGCCCTGTTCGTCGCCGTGTGCTTCGGCTACTACTACACGGCACTGAAGCTTACCGATCGACTCATCTACACCCTGTACCTGCTGCTGTTCTGGTTGGTGATCGaa < 1:781442/150‑1 (MQ=255) tG‑‑TTCCGCAGGGCGGTGGGGGTAGCGTTCACCGCCCTGCCCATCGCCCTGTTCGTCGCCGTGTGCTTCGGCTACTACTACACGGCACTGAAGCTTACCGATCGACTc > 2:2134567/1‑107 (MQ=255) tG‑‑TTCCGCAGGGCGGTGGGGGTAGCGTTCACCGCCCTGCCCATCGCCCTGTTCGTCGCCGTGTGCTTCGGCTACTACTACACGGCACTGAAGCTTACCGATCGACTc < 1:2134567/107‑1 (MQ=255) tG‑‑TTCCGCAGGGCGGTGGGGGTAGCGTTCACCGCCCTGCCCATCGCCCTGTTCGTCGCCGTGTGCTTCGGCTACTACTACACGGCACTGAAGCTTACCGATCGACTCATCTACACCCTGTACCTGCTGCTGTTCTGGTTGGTGATCGAAg < 1:2070359/150‑1 (MQ=255) tG‑‑TTCCGCAGGGCGGTGGGGGTAGCGTTCACCGCCCTGCCCATCGCCCTGTTCGTCGCCGTGTGCTTCGGCTACTACTACACGGCACTGAAGCTTACCGATCGACTCATCTACACCCTGTACCTGCTGCTGTTCTGGTTGGTGATCGAAg < 1:244151/150‑1 (MQ=255) tG‑‑TTCCGCAGGGCGGTGGGGGTAGCGTTCACCGCCCTGCCCAGCGCCCTGTTCGTCGCCGTGTGCTTCGGCTACTCCTACGCGGCTCTGAAGCTTACCGATCGACTCATCTACACCCTGTACCTGCTGCTGTTCTGGTTGGTGATCGAAg < 2:667187/150‑1 (MQ=255) gCAGGGCGGTGGGGGTAGCGTTCACCGCCCTGCCCCTCGCCCTGTTCGTCGCCGTGTGCTTCGGCTACTACTACACGGCACTGAAGCTTACCGATCGACTCATCTACACCCTGTACCTGCTGATGTTCTGTATGGTGATCTAAGCCGCCt > 2:1098602/1‑150 (MQ=255) gCAGGGCGGTGGGGGTAGCGTTCACCGCCCTGCCCATCGCCCTGTTCGTCGCCGTGTGCTTCGGCTACTACTACACGGCACTGAAGCTTACCGATCGACTCATCTACACCCTGTACCTGCTGCTGTTCTGGTTGGTGATCGAAGCCGCCt < 2:71210/150‑1 (MQ=255) cAGGGCGGTGGGGGTAGCGTTCACCGCCCTGCCCATCGCCCTGTTCGTCGCCGTGTGCTTCGGCTACTACTACACGGCACTGAAGCTTACCGATCGACTCATCTACACCCTGTACCTGCTGTTGTTCTGGTTGGTGATCGAAGCCGCCtt > 1:1567937/1‑150 (MQ=255) aGGGCGGTGGGGGTAGCGTTcaccgccctgcggaacagcgaggtgtcacggtgtgccgggctgctgagcagcagacggctgagcagccaggccattagcgcatagcaggtcagcaccacgccgatgcccaacacgtcgtctgccagtgcc < 2:2241986‑M2/150‑131 (MQ=255) aGGGCGGTGGGGGTAGCGTTcaccgccctgcggaacagcgaggtgtcacggtgtgccgggctgctgagcagcagacggctgagcagccaggccattagcgcatagcaggtcagcaccacgccgatgcccaacacgtcgtctgccagtgcc < 2:1586628‑M2/150‑131 (MQ=255) gggCGGTGGGGGTAGCGTTcaccgccctgcggaacagcgaggtgtcacggtgtgccgggctgctgagcagcagacggctga < 1:725595‑M2/81‑63 (MQ=255) gggCGGTGGGGGTAGCGTTcaccgccctgcggaacagcgaggtgtcacggtgtgccgggctgctgagcagcagacggctga > 2:725595‑M2/1‑19 (MQ=255) ggCGGTGGGGGTAGCGTTcaccgccctgcggaacagcgaggtgtcacgg > 2:639710‑M2/1‑18 (MQ=255) ggCGGTGGGGGTAGCGTTcaccgccctgcggaacagcgaggtgtcacgg < 1:639710‑M2/49‑32 (MQ=255) ggCGGTGGGGGTAGCGTTCACCGCCCTGCCCATCGCCCTGTTCGTCGCCGTGTGCTTCGGCTACTACTACACGGCACTGAAGCTTACCGATCGACTCATCTACACCCTGTACCTGCTGCTGTTCTGGTTGGTGATCGAAGCCGCCTTCGt < 2:2259677/150‑1 (MQ=255) ggtgTAGCGTTCACCGTCCTGCCCATCGCCCTGTTCGTCGCCGTGTGCTTCGGCTACTACTACTCGGAACTGAAGGTTACCGATCGACTCATCTACACCCTGTACCTGCTGCTGTTCTGGTTGGTGATCGAAGCCGCCTTCGTGCGCGGc < 2:589907/147‑1 (MQ=255) ttCNCCGCCCTGCCCATCGCCCTGTTCGTCGCCGTGTGCTTCGGCTACTACTACACGGCACTGAAGCTTACCGATCGACTCATCTACACCCTGTACCTGCTGCTGTTCTGGTTGGTGATCGAAGCCGCCTTCGTGCGCGGCCTGTCGGTg > 2:1501620/1‑150 (MQ=255) ttCACGGCCCTGCCCATCGCCCTGTTCGTCGCCGTGTGCTTCGGCTACTACTATACGGTTCTGGAGCTTGCCGATCGACTCATCTACACCCTGTACCTGCTGCTGTTCTGGTTGGTGATCGAAGCCGCCTTCGTGCGCGGCCTGTCGGTg < 2:651275/150‑1 (MQ=255) | CCAGCCTTCGGCACTGGCAGACGACGTGTTGGGCATCGGCGTGGTGCTGACCTGCTATGCGCTAATGGCCTGGCTGCTCAGCCGTCTGCTGCTCAGCAGCCCGGCACACCGTGACACCTCGCTG‑‑TTCCGCAGGGCGGTGGGGGTAGCGTTCACCGCCCTGCCCATCGCCCTGTTCGTCGCCGTGTGCTTCGGCTACTACTACACGGCACTGAAGCTTACCGATCGACTCATCTACACCCTGTACCTGCTGCTGTTCTGGTTGGTGATCGAAGCCGCCTTCGTGCGCGGCCTGTCGGTG > NC_002947/5783480‑5783777 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |