| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 3,536,330 | T→A | 8.0% | intergenic (+1/‑76) | PP_3124 → / → PP_3125 | short chain fatty acid transporter/Cro/CI family transcriptional regulator |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 3,536,330 | 0 | T | A | 8.0% | 257.3 / 11.9 | 88 | intergenic (+1/‑76) | PP_3124/PP_3125 | short chain fatty acid transporter/Cro/CI family transcriptional regulator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (37/43); new base A (2/5); total (39/49) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.52e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.64e-01 | |||||||||||
TGCTGCCGTTGCTGGGCGTGCTGGGGCTCAAGGCGCGCGACCTGATCGGTTTCTCGTTCGTGCAATTGCTGGTGCATGTGCCGTTGGTGCTGGTGTTGCTGTGGGCGCTGGGTACAACGCTGCAGTACGTGCCGCCAGTGATGCCTTGATTCAAGGCCCCTGGAGGCTTGGCGTCAGCTTTCAGACGCGTATCATGGCTGCCTCAGCCTGGGAAACTCGCGTCACATGTCTATCCGATTGAAACTGCTGCGTAAGAAACTGGGGATGACCCTGGAAATGCTGGCCGAAAAGACTGGCAT > NC_002947/3536181‑3536479 | tgctgcCGTTGCTGGGAGTGATGGGCGGCCCGAGGCTCGACCTGGTCTGTTTCTCGTTCGTGCAATTGCTGGTGCATGTGCCGTTGGTGCTGGTGTTGCTGTGGGCGCTGGGTACAACGCTGCAGTACGTGCCGCCAGTGATGCCTTGAt < 2:2091359/150‑1 (MQ=255) tgcCGTTGCTGGGCGTGCTGGGGCTCAAGGCGCGCGACCTGATCGGTTTCTCGTTCGTGCAATTGCTGGTGCATGTGCCGTTGGTGCTGGTGTTGCTGTGGGCGCTGGGTACAACGCTGCAGTACGTGCCGCCAGTGATGCCTTGATTCa > 1:2143515/1‑150 (MQ=255) gcCGTTGCTGGGCGTGCTGGGGCTCAAGGCGCGCGACCTGATCGGTTTCTCGTTCGTGCAATTGCTGGTGCATGTGCCGTTGGTGCTGGTGTTGCTGTGGGCGCTGGGTACAACGCTGCAGTACGTGCCGCCAGTGATGCCTTGATTCaa < 1:1598325/150‑1 (MQ=255) ccGTTGCTGGGCGTGCTGGGGCTCAAGGCGCGCGACCTGATCGGTTTCTCGTTCGTGCAATTGCTGGTGCATGTGCCGTTGGTGCTGGTGTTGCTGTGGGCGCTGGGTACAACGCTGCAGTACGTGCCGCCAGTGATGCCTTGATTCAAg < 1:67626/150‑1 (MQ=255) ccGTTGCTGGGCGTGCTGGGGCTCAAGGCGCGCGACCTGATCGGTTTCTCGTTCGTGCAATTGCTGGTGCATGTGCCGTTGGTGCTGGTGTTGCTGTGGGCGCTGGGTACAACGCTGCAGTACGTGCCGCCAGTGATGCCTTGATTCAAg > 2:1829238/1‑150 (MQ=255) gTTGCTGGGCGTGCTGGGGCTCAAGGCGCGCGACCTGATCGGTTTCTCGTTCGTGCAATTGCTGGTGCATGTGCCGTTGGTGCTGGTGTTGCTGTGGGCGCTGGGTACAACGCTGCAGTACGTGCCGCCAGGG‑‑GCCTTGAATCAAGGcat < 2:139972/150‑3 (MQ=255) tGCTGGGCGTGCTGGGGCTCAAGGCGCGCGACCTTATCGGTTTCTCGTTCGTGCAATTGCTGGTGCATGTGCCGTTGGTGCTGGTGTTGCTGTGGGCGCTGGGTACAACGCTGCAGTACGTGCCGCCAGTGATGCCTTGAATCAAGGcat < 1:217167/150‑3 (MQ=255) tGCTGGGCGTGCTGGGGCTCAAGGCGCGCGACCTGATCGGTTTCTCGTTCGTGCAATTGCTGGTGCATGTGCCGTTGGTGCTGGTGTTGCTGTGGGCGCTGGGTACAACGCTGCAGTACGTGCCGCCAGTGATGCCTTGATTCAAGGccc < 1:1371430/150‑1 (MQ=255) gCTGGGCGTGCTGGGGCTCAAGGCGCGCGACCTGATCGGTTTCTCGTTCGTGCAATTGCTGGTGCATGTGCCGTTGGTGCTGGTGTTGCTGTGGGCGCTGGGTACAACGCTGCAGTACGTGCCGCCAGTGATGCCTTGAATCAAGGcatc < 1:1679153/150‑4 (MQ=255) tGGGCGTGCTGGGGCTCAAGGCGCGCGACCTGATCGGTTTCTCGTTCGTGCAATTGCTGGTGCATGTGCCGTTGGTGCTGGTGTTGCTGTGGGCGCTGGGTACAACGCTGCAGTACGTGCCGCCAGTGATGCCTTGATTCAAGGCCCCTg > 2:379874/1‑150 (MQ=255) ggCGTGCTGGGGCTCAAGGCGCGCGACCTGATCGGTTTCTCGTTCGTGCAATTGCTGGTGCATGTGCCGTTGGTGCTGGTGTTGCTGTGGGCGCTGGGTACAACGCTGCAGTACGTGCCGCCAGTGATGCCTTGAATCAAGGcatcactg < 1:2148659/150‑8 (MQ=255) cTGGGGCTCAAGGCGCGCGACCTGATCGGTTTCTCGTTCGTGCAATTGCTGGTGCATGTGCCGTTGGTGCTGGTGTTGCTGTGGGCGCTGGGTACAACGCTGCAGTACGTGCCGCCAGTGATGCCTTGATTCAAGGCCCCTGGAGGCTTg < 1:347176/150‑1 (MQ=255) tGGGGCTCAAGGCGCGCGACCTGATCGGTTTCTCGTTCGTGCAATTGCTGGTGCATGTGCCGTTGGTGCTGGTGTTGCTGTGGGCGCTGGGTACAACGCTGCAGTACGTGCCGCCAGTGATGCCTTGATTCAAGGCCCCTGGAGGCTTgg > 1:1547241/1‑150 (MQ=255) cTCAAGGCGCGCGACCTGATCGGTTTCTCGTTCGTGCAATTGCTGGTGCATGTGCCGTTGGTGCTGGTGTTGCTGTGGGCGCTGGGTACAACGCTGCAGTACGTGCCGCCAGTGATGCCTTGATTCAAGGCCCCTGGAGGCTTGGCGTCa < 1:310237/150‑1 (MQ=255) aaGGCGCGCGACCTGATCGGTTTCTCGTTCGTGCAATTGCTGGTGCATGTGCCGTTGGTGCTGGTGTTGCTGTGGGCGCTGGGTACAACGCTGCAGTACGTGCCGCCAGTGATGCCTTGATTCAAGGCCCCTGGAGGCTTGGCGTCAGCt > 1:269864/1‑150 (MQ=255) aaGGCGCGCGACCTGATCGGTTTCTCGTTCGTGCAATTGCTGGTGCATGTGCCGTTGGTGCTGGTGTTGCTGTGGGCGCTGGGTACAACGCTGCAGTACGTGCCGCCAGTGATGCCTTGATTCAAGGCCCCTGGAGGCTTGGCGTCAGCt > 2:1861894/1‑150 (MQ=255) ggCGCGCGACCTGATCGGTTTCTCGTTCGTGCAATTGCTGGTGCATGTGCCGTTGGTGCTGGTGTTGCTGTGGGCGCTGGGTACAACGCTGCAGTACGTGCCGCCAGTGATGCCTTGATTCAAGGCCCCTGGAGGCTTGGCGTCAGCttt < 2:1413402/150‑1 (MQ=255) gcgcgcGACCTGATCGGTTTCTCGTTCGTGCAATTGCTGGTGCATGTGCCGTTGGTGCTGGTGTTGCTGTGGGCGCTGGGTACAACGCTGCAGTACGTGCCGCCAGTGATGCCTTGATTCAAGGCCCCTGGAGGCTTGGCGTCAGCTTTc < 1:1434226/150‑1 (MQ=255) gcgcgcGACCTGATCGGTTTCTCGTTCGTGCAATTGCTGGTGCATGTGCCGTTGGTGCTGGTGTTGCTGTGGGCGCTGGGTACAACGCTGCAGTACGTGCCGCCAGTGATGCCTTGATTCAAGGCCCCTGGAGGCTTGGCGTCAGCTTTc > 2:1340369/1‑150 (MQ=255) gcgcgcGACCTGATCGGTTTCTCGTTCGTGCAATTGCTGGTGCATGTGACGTTGGTGCTGGTGTTGCTGTGGGCGCTGGGTACAACGCTGCAGTACGTGCCGCCAGTGATGCCTTGATTCAAGGCCCCTGGAGGCTTGGCGTCAGCTTTc < 1:1729306/150‑1 (MQ=255) cgcgcgACCTGATCGGTTTCTCGTTCGTGCAATTGCTGGTGCATGTGCCGTTGGTGCTGGTGTTGCTGTGGGCGCTGGGTACAACGCTGCAGTACGTGCCGCCAGTGATGCCTTGATTCAAGGCCCCTGGAGGCTTGGCGTCAGCTTTCa < 1:1340369/150‑1 (MQ=255) gACCTGATCGGTTTCTCGTTCGTGCAATTGCTGGTGCATGTGCCGTTGGTGCTGGTGTTGCTGTGGGCGCTGGGTACAACGCTGCAGTACGTGCCGCCAGTGATGCCTTGATTCAAGGCCCCTGGAGGCTTGGCGTCAGCTTTCAGAcgc < 1:890225/150‑1 (MQ=255) gATCGGTTTCTCGTTCGTGCAATTGCTGGTGCATGTGCCGTTGGTGCTGGTGTTGCTGTGGGCGCTGGGTACAACGCTGCAGTACGTGCCGCCAGTGATGCCTTGATTCAAGGCCCCTGGAGGCTTGGCGTCAGCTTTCAGACGCGTATc > 2:593106/1‑150 (MQ=255) gATCGGTTTCTCGTTCGTGCAATTGCTGGTGCATGTGCCGTTGGTGCTGGTGTTGCTGTGGGCGCTGGGTACAACGCTGCAGTACGTGCCGCCAGTGATGCCTTGATTCAAGGCCCCTGGAGGCTTGGCGTCAGCTTTCAGACGCGTATc < 2:1038098/150‑1 (MQ=255) aTCGGTTTCTCGTTCGTGCAATTGCTGGTGCATGTGCCGTTGGTGCTGGTGTTGCTGTGGGCGCTGGGTACAACGCTGCAGTACGTGCCGCCAGTGATGCCTTGATTCAAGGCCCCTGGAGGCTTGGCGTCAGCTTTCAGACGCGTATCa < 1:2306266/150‑1 (MQ=255) tCGGTTTCTCGTTCGTGCAATTGCTGGTGCATGTGCCGTTGGTGCTGGTGTTGCTGTGGGCGCTGGGTACAACGCTGCAGTACGTGCCGCCAGTGATGCCTTGATTCAAGGCCCCTGGAGGCTTGGCGTCAGCTTTCAGACGCGTATCAt < 1:1829238/150‑1 (MQ=255) tCGGTTTCTCGTTCGTGCAATTGCTGGTGCATGTGCCGTTGGTGCTGGTGTTGCTGTGGGCGCTGGGTACAACGCTGCAGTACGTGCCGCCAGTGATGCCTTGATTCAAGGCCCCTGGAGGCTTGGCGTCAGCTTTCAGACGCGTATCAt > 2:738100/1‑150 (MQ=255) tCGGTTTCTCGTTCGTGCAATTGCTGGTGCATGTGCCGTTGGTGCTGGTGTTGCTGTGGGCGCTGGGTACAACGCTGCAGTACGTGCCGCCAGTGATGCCTTGAATCACGGcat > 2:2075953/1‑112 (MQ=255) tCGGTTTCTCGTTCGTGCAATTGCTGGTGCATGTGCCGTTGGTGCTGGTGTTGCTGTGGGCGCTGGGTACAACGCTGCAGTACGTGCCGCCAGTGATGCCTTGAATCACGGcat < 1:2075953/114‑3 (MQ=255) cGGTTTCTCGTTCGTGCAATTGCTGGTGCATGTGCCGTTGGTGCTGGTGTTGCTGTGGGCGCTGGGTACAACGCTGCAGTACGTGCCGCCAGCGATGCCTTGATTCAAGGCCCCTGGAGGCTTGGCGTCAGCTTTCAGACGCGTATCATg < 1:1369771/150‑1 (MQ=255) tctcGTTCGTGCAATTGCTGGTGCATGTGCCGTTGGTGCTGGTGTTGCTGTGGGCGCTGGGTACAACGCTGCAGTACGTGCCGCCAGTGATGCCTTGATTCAAGGCCCCTGGAGGCTTGGCGTCAGCTTTCAGACGCGTATCATGGCTGc < 1:182727/150‑1 (MQ=255) ctcGTTCGTGCAATTGCTGGTGCATGTGCCGTTGGTGCTGGTGTTGCTGTGGGCGCTGGGTACAACGCTGCAGTACGTGCCGCCAGTGATGCCTTGATTCAAGGCCCCTGGAGGCTTGGCGTCAGCTTTCAGACGCGTATCATGGCTGcc < 1:802057/150‑1 (MQ=255) tcgttcgtGCAATTGCTGGTGCATGTGCCGTTGGTGCTGGTGTTGCTGTGGGCGCTGGGTACAACGCTGCAGTACGTGCCGCCAGTGATGCCTTGATTCAAGGCCCTTGGAGGCTTGGCGTCAGCTTTCAGACGCGTATCATGGCTGCCt > 2:1351718/1‑150 (MQ=255) gttcgtGCAATTGCTGGTGCATGTGCCGTTGGTGCTGGTGTTGCTGTGGGCGCTGGGTACAACGCTGCAGTACGTGCCGCCAGTGATGCCTTGATTCAAGGCCCCTGGAg < 2:179638/110‑1 (MQ=255) gttcgtGCAATTGCTGGTGCATGTGCCGTTGGTGCTGGTGTTGCTGTGGGCGCTGGGTACAACGCTGCAGTACGTGCCGCCAGTGATGCCTTGATTCAAGGCCCCTGGAg > 1:179638/1‑110 (MQ=255) tGCAATTGCTGGTGCATGTGCCGTTGGTGCTGGTGTTGCTGTGGGCGCTGGGTACAACGCTGCAGTACGTGCCGCCAGTGATGCCTTGATTCAAGGCCCCTGGAGGCTTGGCGTCAGCTTTCAGACGCGTATCATGGCTGCCTCAGCCTg < 2:467123/150‑1 (MQ=255) tGCAATTGCTGGTGCATGTGCCGTTGGTGCTGGTGTTGCTGTGGGCGCTGGGTACAACGCTGCAGTACGTGCCGCCAGTGATGCCTTGATTCAAGGCCCCTGGAGGCTTGGCGTCAGCTTTCAGACGCGTATCATGGCTGCCTCAGCCTg < 1:1327605/150‑1 (MQ=255) tGCAATTGCTGGTGCATGTGCCGTTGGTGCTGGTGTTGCTGTGGGCGCTGGGTACAACGCTGCAGTACGTGCCGCCAGTGATGCCTTGATTCAAGGCCCCTGGAGGCTTGGCGTCAGCTTTCAGACGCGTATCATGGCTGCCTCAGCCTg < 1:379874/150‑1 (MQ=255) tGCAATTGCTGGTGCATGTGCCGTTGGTGCTGGTGTTGCTGTGGGCGCTGGGTACAACGCTGCAGTACGTGCCGCCAGTGATGCCTTGATTCAAGGCCCCTGGAGGCTTGGCGTCAGCTTTCAGACGCGTATCATGGCTGCCTCAGCCTg > 2:738505/1‑150 (MQ=255) aaTTGCTGGTGCATGTGCCGTTGGTGCTGGTGTTGCTGTGTGCGCTGGGTACAACGCTGCAGTACGTGCCGCCAGTGATGCCTTGATTCAAGGCCCCTGGAGGCTTGGCGTCAGCTTTCAGACGCGTATCATGGCTGCCTCAGCCTGGGa > 2:702366/1‑150 (MQ=255) ggTGCATGTGCCGTTGGTGCTGGTGTTGCTGTGGGCGCTGGGTACAACGCTGCAGTACGTGCCGCCAGTGATGCCTTGATTCAAGGCCCCTGGAGGCTTGGCGTCAGCTTTCAGACGCGTATCATgg > 2:1184042/1‑127 (MQ=255) ggTGCATGTGCCGTTGGTGCTGGTGTTGCTGTGGGCGCTGGGTACAACGCTGCAGTACGTGCCGCCAGTGATGCCTTGATTCAAGGCCCCTGGAGGCTTGGCGTCAGCTTTCAGACGCGTATCATgg < 1:1184042/127‑1 (MQ=255) gTGCATGTGCCGTTGGTGCTGGTGTTGCTGTGGGCGCTGGGTACAACGCTGCAGTACGTGCCGCCAGTGATGCCTTGATTCAAGGCCCCTGGAGGCTTGGCGTCAGCTTTCAGACGCGTATCATGGCTGCCTCAGCCTGGGAAACTcgcg > 1:1273617/1‑150 (MQ=255) tGCATGTGCCGTTGGTGCTGGTGTTGCTGTGGGCGCTGGGTACAACGCTGCAGTACGTGGCGCCAGTGATGCCTTGAGTCAAGGCCCCTGGAGGCTTGGCGTCAGCTTTCAGACGCGTATCATGGCTGCCTCAGCCTGGGAAACTCGCGt < 1:805425/150‑1 (MQ=255) tGCATGTGCCGTTGGTGCTGGTGTTGCTGTGGGCGCTGGGTACAACGCTGCAGTACGTGCCGCCAGTGATGCCTTGATTCAAGGCCCCTGGAGGCTTGGCGTCAGCTTTCAGACGCGTATCATGGCTGCCTCAGCCTGGGAAACTCGCGt < 2:2143515/150‑1 (MQ=255) gCATGTGCCGTTGGTGCTGGTGTTGCTGTGGGCGCTGGGTACAACGCTGCAGTACGTGCCGCCAGTGATGCCTTGATTCAAGGCCCCTGGAGGCTTGGCGTCAGCTTTCAGACGCGTATCATGGCTGCCTCAGCCTGGGAAACTCGCGTc < 1:1568604/150‑1 (MQ=255) gtgCCGTTGGTGCTGGTGTTGCTGCGGGCGCGGGGCACGGCGCTGCAGTACGTGCCGCCAGTGGTGCCATGATTCAAGGCCGCTGGAGGCTTGGCGGCAGCTTTCAGATTCGAATCAAAGCTGCCTCAGCCTGGGAAACTCGCGTCACAt > 2:812612/1‑150 (MQ=255) tgCCGTTGGTGCTGGTGTTGCTGTGGGCGCTGGGTACAACGCTGCAGTACGTGCCGCCAGTGATGCCTTGATTCAAg < 1:1291165/77‑1 (MQ=255) tgCCGTTGGTGCTGGTGTTGCTGTGGGCGCTGGGTACAACGCTGCAGTACGTGCCGCCAGTGATGCCTTGATTCAAg > 2:1291165/1‑77 (MQ=255) tgCCGTTGGTGCTGGTGTTGCTGTGGGCGCTGGGTACAACGCTGCAGTACGTGCCGCCAGTGATGCCTTGATTCAAGGCCCCTGGAGGCTTgg < 2:1036626/93‑1 (MQ=255) tgCCGTTGGTGCTGGTGTTGCTGTGGGCGCTGGGTACAACGCTGCAGTACGTGCCGCCAGTGATGCCTTGATTCAAGGCCCCTGGAGGCTTgg > 1:1036626/1‑93 (MQ=255) gCCGTTGGTGCTGGTGTTGCTGTGGGCGCTGGGTACAACGCTGCAGTACGTGCCGCCAGTGATGCCTTGATTCAAGGCCCCTGGAGGCTTGGCGTCAGCTTTCAGACGCGTATCATGGCTGCCTCAGCCTGGGAAACTCGCGTCACAt < 1:174618/148‑1 (MQ=255) gCCGTTGGTGCTGGTGTTGCTGTGGGCGCTGGGTACAACGCTGCAGTACGTGCCGCCAGTGATGCCTTGATTCAAGGCCCCTGGAGGCTTGGCGTCAGCTTTCAGACGCGTATCATGGCTGCCTCAGCCTGGGAAACTCGCGTCACAt > 2:174618/1‑148 (MQ=255) gCCGTTGGTGCTGGTGTTGCTGTGGGCGCTGGGTACAACGCTGCAGTACGTGCCGCCAGTGATGCCTTGATTCAAGGCCCCTGGAGGCTTGGCGTCAGCTTTCAGACGCGTATCATGGCTGCCTCAGCCTGGGAAACTCGCGTCACATGt < 1:1185891/150‑1 (MQ=255) ccGTTGGTGCTGGTGTTGCTGTGGGCGCTGGGTACAACGCTGCAGTACGTGCCGCCAGTGATGCCTTGATTCAAGGCCCCTGGAGGCTTGGCGTCAGCTTTCAGACGCGTATCATGGCTGCCTCAGCCTGGGAAACTCGCGTCACATGTc < 2:269864/150‑1 (MQ=255) tGGTGCTGGTGTTGCTGTGGGCGCTGGGTACAACGCTGCAGTACGTGCCGCCAGTGATGCCTTGATTCAAGGCCCCTGGAGGCTTGGCGTCAGCTTTCAGACGCGTATCATGGCTGCCTCAGCCTGGGAAACTCGCGTCACATGTCTATc < 1:738505/150‑1 (MQ=255) gCTGGTGTTGCTGTGGGCGCTGGGTACAACGCTGCAGTACGTGCCGCCAGTGATGCCTTGATTCAAGGCCCTTGGAGGCTTGGCGTCAGCTTTCAGACGCGTATCATGGCTGCCTCAGCCTGGGAAACTCGCGTCACATGTCTATCCGAt < 1:1351718/150‑1 (MQ=255) cTGGTGTTGCTGTGGGCGCTGGGTACAACGCTGCAGTACGTGCCGCCAGTGATGCCTTGATTCAAGGCCCCTGGAGGCTTGGCGTCAGCTTTCAGACGCGTATCATGGCTGCCTCAGCCTGGGAAACTCGCGTCACATGTCTATCCGAtt < 1:1755420/150‑1 (MQ=255) gCTGTGGGCGCTGGGTACAACGCTGCAGTACGTGCCGCCAGTGATGCCTTGATTCAAGGCCCCTGGAGGCTTGGCGTCAGCTTTCAGACGCGTATCATGGCTGCCTCAGCCTGGGAAACTCGCGTCACATGTCTATCCGATTGAAActgc > 1:1985800/1‑150 (MQ=255) tgtgGGCGCTGGGTACAACGCTGCAGTACGTGCCGCCAGTGATGCCTTGATTCAAGGCCCCTGGAGGCTTGGCGACAGCTTTCAGACGCGTATCATGGCTGCCTCAGCCTGGGAAACTCGCGTCACATGTCTATCCGATTGAAActgctg > 1:882705/1‑150 (MQ=255) gtgGGCGCTGGGTACAACGCTGCAGTACGTGCCGCCAGTGATGCCTTGATTCAAGGCCCCTGGAGGCTTGGCGTCAGCTTTCAGACGCGTATCATGGCTGCCTCAGCCTGGGAAACTCGCGTCACATGTCTATCCGATTGAAACtgctgc < 1:1869048/150‑1 (MQ=255) tACAACGCTGCAGTACGTGCCGCCAGTGATGCCTTGATTCAAGGCCCCTGGAGGCTTGGCGTCAGCTTTCAGACGCGTATCATGGCTGCCTCAGCCTGGGAAACTCGCGTCACATGTCTATCCGATTGAAACTGCTGCGTAAGAAACTgg > 2:2397492/1‑150 (MQ=255) tACAACGCTGCAGTACGTGCCGCCAGTGATGCCTTGATTCAAGGCCCCTGGAGGCTTGGCGTCAGCTTTCAGACGCGTATCATGGCTGCCTCAGCCTGGGAAACTCGCGTCACATGTCTATCCGATTGAAACTGCTGCGTAAGAAACTgg > 1:238327/1‑150 (MQ=255) tACAACGCTGCAGTACGTGCCGCCAGTGATGCCTTGATTCAAGGCCCCTGGAGGCTTGGCGTCAGCTTTCAGACGCGTATCATGGCTGCCTCAGCCTGGGAAACTCGCGTCACATGTCTATCCGATTGAAACTGCTGCGTAAGAAACTgg > 1:536246/1‑150 (MQ=255) tACAACGCTGCAGTACGTGCCGCCAGTGATGCCTTGATTCAAGGCCCCTGGAGGCTTGGCGTCAGCTTTCAGACGCGTATCATGACTGCCTCAGCCTGGGAAACTCGCGTCACATGTCTATCCGATTGAAACTGCTGCGTAAGAAACTgg < 2:1547241/150‑1 (MQ=255) aCAACGCTGCAGTACGTGCCGCCAGTGATGCCTTGATTCAAGGAACATGGAGGCTTGGCGTCAGCTTTCAGACGCGTATCATGGCTGCCTCAGCCTGGGAAACTCGCGTCACATGTCTATCCGATTGAAACTGCTGCGTAAGAAACTggg < 1:2090081/150‑1 (MQ=255) cAACGCTGCCGTACGTGCCGCCAGTGATGCCTTGATTCAAGGCCGCTGGTGGCGTGGGGTCAGCTTTCAGACGCGTATCATGGCTGCCTCAGCCTGGGAAACTCGCGTCACATGTCTATCCGATTGAAACTGCTGCGTAAGAAACTgggg < 2:1884184/150‑1 (MQ=255) cAACGCTGCAGTACGTGCCGCCAGTGATGCCTTGATTCAAGGCCCCTGGAGGCTTGGCGTCAGCTTTCAGACGCGTATCATGGCTGCCTCAGCCTGGGAAACTCGCGTCACATGTCTATCCGATTGAAACTGCTGCGTAAGAAACTgggg < 1:738100/150‑1 (MQ=255) 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ccAGTGATGCCTTGATTCAAGGCCCCTGGAGGCTTGGCGTCAGCTTTCAGACGCGTATCATGGCTGCCTCAGCCTGGGAAACTCGCGTCACATGTCTATCCGATTGAAACTGCTGCGTAAGAAACTGGGGATGACCCTGGAAATGCTGGc > 2:2021425/1‑150 (MQ=255) tccaggggCCTTGAATCAAGGCCCCTGGAGGCTTGGCGTCAGCTTTCAGACGCGTATCATGGCTGCCTCAGCCTGGGAAACTCGCGTCACATGTCTATCCGATTGAAACTGCTGCGTAAGAAACTGGGGATGACCCTGGAAATGCTGGcc > 1:1202835/8‑150 (MQ=255) cTTGATTCAAGGCCCCTGGGGGCTTGGCGTCAGCTTTCAGACGCGTATCATGGCTGCCTCAGCCTCTAAAGCGCGCGTCACATGTCTATCCGATTGAAACTGCTGCGTAAGAAACTGGGGATGACCCTGGAAATGCTGGCCGAAAAGACt < 1:747583/150‑1 (MQ=255) cTTGATTCAAGGCCCCTGGAGGCTTGGCGTCAGCTTTCAGACGCGTATCATGGCTGCCTCAGCCTGGGAAACTCGCGTCACATGTCTATCCGATTGAAACTGCTGCGTAAGAAACTGGGGATGACCCTGGAAATGCTGGCCGAAAAGACt > 2:1834341/1‑150 (MQ=255) cTTGATTCAAGGCCCCTGGAGGCTTGGCGTCAGCTTTCAGACGCGTATCATGGCTGCCTCAGCCTGGGAAACTCGCGTCACATGTCTATCCGATTGAAACTGCTGCGTAAGAAACTGGGGATGACCCTGGAAATGCTGGCCGAAAAGACt < 2:238327/150‑1 (MQ=255) cTTGATTCAAGGCCCCTGGAGGCTTGGCGTCAGCTTTCAGACGCGTATCATGGCTGCCTCAGCCTGGGAAACTCGCGTCACATGTCCATCCGATTGAAACTGCTGCGTAAGAAACTGGGGATGACCCTGGAAATGCTGGCCGAAAAGACt > 1:1071175/1‑150 (MQ=255) ttGATTCAAGGCCCCTGGAGGCTTGGCGTCAGCTTTCAGACGCGTATCATGGCTGCCTCAGCCTGGGAAACTCGCGTCACATGTCTATCCGATTGAAACTGCTGCGTAAGTAACTGGGGATGACCCTGGAAATGCTGGCCGAAAAGACTg > 2:1408928/1‑150 (MQ=255) ttGATTCAAGGCCCCTGGAGGCTTGGCGTCAGCTTTCAGACGCGTATCATGGCTGCCTCAGCCTGGGAAACTCGCGTCACATGTCTATCCGATTGAAACTGCTGCGTAAGAAACTGGGGATGACCCTGGAAATGCTGGCCGAAAAGACTg > 2:307737/1‑150 (MQ=255) ttGATTCAAGGCCCCTGGAGGCTTGGCGTCAGCTTTCAGACGCGTATCATGGCTGCCTCAGCCTGGGAAACTCGCGTCACATGTCTATCCGATTGAAACTGCTGCGTAAGAAACTGGGGATGACCCTGGAAATGCTGGCCGAAAAGACTg > 1:1419530/1‑150 (MQ=255) ttGATTCAAGGCCCCTGGAGGCTTGGCGTCAGCTTTCAGACGCGTATCATGGCTGCCTCAGCCTGGGAAACTCGCGTCACATGTCTATCCGATTGAAACTGCTGCGTAAGAAACTGGGGATGACCCTGGAAATGCTGGCCGAAAAGACTg > 2:2297941/1‑150 (MQ=255) ttGATTCAAGGCCCCTGGAGGCTTGGCGTCAGCTTTCAGACGCGTATCATGGCTGCCTCAGCCTGGGAAACTCGCGTCACATGTCTATCCGATTGAAACTGCTGCGTAAGAAACTGGGGATGACCCTGGAAATGCTGGCCGAAAAGACTg > 2:1414518/1‑150 (MQ=255) ttCAAGGCCCCTGGAGGCTTGGCGTCAGCTTTCAGACGCGTATCATGGCTGCCTCAGCCTGGGAAACTCGCGTCACATGTCTATCCGATTGAAACTGCTGCGTAAGAAACTAGGCATGACCCTGGAAACGCTGGCCGAAAAGACTGGCAt > 2:602047/1‑150 (MQ=255) | TGCTGCCGTTGCTGGGCGTGCTGGGGCTCAAGGCGCGCGACCTGATCGGTTTCTCGTTCGTGCAATTGCTGGTGCATGTGCCGTTGGTGCTGGTGTTGCTGTGGGCGCTGGGTACAACGCTGCAGTACGTGCCGCCAGTGATGCCTTGATTCAAGGCCCCTGGAGGCTTGGCGTCAGCTTTCAGACGCGTATCATGGCTGCCTCAGCCTGGGAAACTCGCGTCACATGTCTATCCGATTGAAACTGCTGCGTAAGAAACTGGGGATGACCCTGGAAATGCTGGCCGAAAAGACTGGCAT > NC_002947/3536181‑3536479 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |