Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 4,272,822 | T→C | 6.0% | D24D (GAT→GAC) | PP_3743 → | hypothetical protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 4,272,822 | 0 | T | C | 6.0% | 351.7 / 8.0 | 116 | D24D (GAT→GAC) | PP_3743 | hypothetical protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (56/53); new base C (2/5); total (58/58) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.38e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.01e-01 |
Only 100 of 120 total aligned reads displayed.
AACTACCCCAACGCCCCCGCCGTCTTAGATACTGAGTGGTTTATTTCCCTGTGCTTCACGCTACTGGAGAACACGACATGCGCCACCTACTGCTCGCCCCTGCGCTGCTGCTCCTGATGCCTGCCGGTGCTGCCCTGGCCCGCGTCGATGCGGGCGACGTCGCCACCTCGGCCGGTATTTCCGCTTCGCTGTATTCGACCTTCAAGGACGACAAACGGATCATCCCTGCCCGTGACGAACTTTCAGCGTTCGTCGCCAGCGGCGGTACCATCCGCGGCGCCTATGTGGAGTCGGCGC > NC_002947/4272674‑4272970 | aaCTACCCCAACGCCCCCGCCGTCTTAGATACTGAGTGGTTTATTGCCCTGTGCTTCACGCTACTGGAGAACACGACATGCGCCACCTACTGATCGCCCCTGCGCTGCTGCTCCTGATGCCTGCCGGTGCTGCCCTGGCCCGCGTCGATg < 1:1965487/150‑1 (MQ=255) cTACCCCAACGCCCCCGCCGTCTTAGATACTGAGTGGTTTATTTCCCTGTGCTTCACGCTACTGGAGAACACGACATGCGCCACCTACTGCTCGCCCCTGCGCTGCTGCTCCTGATGCCTGCCGGTGCTGCCCTGGCCCGCGTCGATGCg > 2:518954/1‑150 (MQ=255) ccccAACGCCCCCGCCGTCTTAGATACTGAGTGGTTTATTTCCCTGTGCTTCACGCTACTGGAGAACACGACATGCGCCACCTACTGCTCGCCCCTGCGCTGCTGCTCCTGATGCCTGCCGGTGCTGCCCTGGCCCGCGTCGATGCGGGc > 1:1384219/1‑150 (MQ=255) cccAACGCCCCCGCCGTCTTAGATACTGAGTGGTTTATTTCCCTGTGCTTCACGCTACTGGAGAACACGACATGCGCCACCTACTGCTCGCCCCTGCGCTGCTGCTCCTGATGCCTGCCGGTGCTGCCCTGGCCCGCGTCGATGCGGGCg > 1:1102391/1‑150 (MQ=255) cccAACGCCCCCGCCGTCTTAGATACTGAGTGGTTTATTTCCCTGTGCTTCACGCTACTGGAGAACACGACATGCGCCACCTACTGCTCGCCCCTGCGCTGCTGCTCCTGATGCCTGCCGGTGCTGCCCTGGCCCGCGTCGATGCGGGCg > 1:898309/1‑150 (MQ=255) cAACGCCCCCGCCGTCTTAGATACTGAGTGGTTTATTTCCCTGTGCTTCACGCTACTGGAGAACACGACATGCGCCACCTACTGCTCGCCCCTGCGCTGCTGCTCCTGATGCCTGCCGGTGCTGCCCTGGCCCGCATCGACGCGGGccag < 2:2390261/150‑4 (MQ=255) gCCCCCGCCGTCTTAGATACTGAGTGGTTTATTTCCCTGTGCTTCACGCTACTGGAGAACACGACATGCGCCACCTACTGCTCGCCCCTGCGCTGCTGCTCCTGATGCCTGCCGGTGCTGCCCTCGCCCGCATCGACGCGGGccagggca < 2:1950916/150‑8 (MQ=255) gCCCCCGCCGTCTTAGATACAGAGTGGTTTATTTCCCTGTGCTTCACGCTACTGGAGAACACGACATGCGCCACCTACTGCTCGCCCCTGCGCTGCTGCTCCTGATGCCTGCCGGTGCTGCCCTCGCCCGCATCGACGCGGGccagggca < 2:771675/150‑8 (MQ=255) ccccGCCGTCTTAGATACTGAGTGGTTTATTTCCCTGTGCTTCACGCTACTGGAGAACACGACATGCGCCACCTACTGCTCGCCCCTGCGCTGCTGCTCCTGATGCCTGCCGGTGCTGCCCTGGCCCACGTCGATGCGGGCGACGTCGcc > 2:1199252/1‑150 (MQ=255) ttAGATACTGAGTGGTTTATTTCCCTGTGCTTCACGCTACTGGAGAACACGACCTACAACACCTACTGCTCAATTGCGCACTGCTGCTCCTGATGCCTGCCGGTGCTGCCCTGGCCCGCGTCGATGCGGGCGACGTCGCCACCTCGGCCg > 1:1485909/1‑150 (MQ=255) ttAGATACTGAGTGGTTTATTTCCCTGTGCTTCACGCTACTGGAGAACACGACATGCGCCACCTACTGCTCGCCCCTGCGCTGCTGCTCCTGATGCCTGCCGGTGCTGCCCTGGCCCGCGTCGATGCGGGCGACGTCGCCACCTCGGCCg > 2:357699/1‑150 (MQ=255) ttAGATACTGAGTGGTTTATTTCCCTGTGCTTCACGCTACTGGAGAACACGACATGCGCCACCTACTGCTCGCCCCTGCGCTGCTGCTCCTGATGCCTGCCGGTGCTGCCCTGGCCCGCGTCGATGCGGGCGACGTCGCCACCTCGGCCg > 2:358021/1‑150 (MQ=255) aGATACTGAGTGGTTTATTTCCCTGTGCTTCACGCTACTGGAGAACACGACATGCGCCACCTACTGCTCGCCCCTGCGCTGCTGCTCCTGATGCCTGCCGGTGCTGCCCTGGCCCGCGTCGAt > 1:1260287/1‑123 (MQ=255) aCTGAGTGGTTTATTTCCCTGTGCTTCACGCTACTGGAGAACACGACATGCGCCACCTACTGCTCGCCCCTGCGCTGCTGCTCCTGATGCCTGCCGGTGCTGCCCTGGCCCGCGTCGATGCGGGCGACGt > 1:276813/1‑130 (MQ=255) aCTGAGTGGTTTATTTCCCTGTGCTTCACGCTACTGGAGAACACGACATGCGCCACCTACTGCTCGCCCCTGCGCTGCTGCTCCTGATGCCTGCCGGTGCTGCCCTGGCCCGCGTCGATGCGGGCGACGt < 2:276813/130‑1 (MQ=255) aGTGGTTTATTTCCCTGTGCTTCACGCTACTGGAGAACACGACATGCGCCACCTACTGCTCGCCCCTGCGCTGCTGCTCCTGATGCCTGCCGGTGCTGCCCTGGCCCGCGTCGATGCGGGCGACGTCGCCACCTCGGCCGGTATTTCCGc < 2:1708316/150‑1 (MQ=255) aGTGGTTTATTTCCCTGTGCTTCACGCTACTGGAGAACACGACATGCGCCACCTACTGCTCGCCCCTGCGCTGCTGCTCCTGATGCCTGCCGGTGCTGCCCTGGCCCGCGTCGATGCGGGCGACGTCGCCACCTCGGCCGGTATTTCCGc > 1:1008688/1‑150 (MQ=255) tGGTTTATTTCCCTGTGCTTCACGCTACTGGAGAACACGACATGCGCCACCTACTGCTCGCCCCTGCGCTGCTGCTCCTGATGCCTGCCGGTGCTGCCCTGGCCCGCGTCGATGCGGGCGACGTCGCCACCTCGGcc > 2:1338538/1‑137 (MQ=255) gTTTATTTCCCTGTGCTTCACGCTACTGGAGAACACGACATGCGCCACCTACTGCTCGCCCCTGCGCTGCTGCTCCTGATGCCTGCCGGTGCTGCCCTGGCCCGCGTCGATGCGGGCGACGTCGCCACCTCGGCCGGTATTTCCGCTTCg > 2:1057344/1‑150 (MQ=255) gTTTATTTCCCTGTGCTTCACGCTACTGGAGAACACGACATGCGCCACCTACTGCTCGCCCCTGCGCCGCTGCTCCTGATGCCTGCCGGTGCTGCCCTGGCCCGCGTCGATGCGGGCGACGTCGCCACCTCGGCCGGTATTTCCGCTTCg > 2:771423/1‑150 (MQ=255) tttCCCTGTGCTTCACGCTACTGGAGAACACGACATGCGCCACCTACTGCTCGCCCCTGCGCTGCTGCTCCTGATGCCTGCCGGTGCTGCCCTGGCCCGCGTCGATGCGGGCGACGTCGCCACCTCGGCCGGTATTTCCGCTTCGCTGTa < 1:554928/150‑1 (MQ=255) ttCCCTGTGCTTCACGCTACTGGAGAACACGACATGCGCCACCTACTGCTCGCCCCTGCGCTGCTGCTCCTGATGCCTGCCGGTGCTGCCCTGGCCCGCGTCGATGCGGGCGACGTCGCCACCTCGGCCGGTATTTCCGCTTCGCTGTAt > 1:1656723/1‑150 (MQ=255) tgtgCTTCACGCTACTGGAGAACACGACATGCGCCACCTACTGCTCGCCCCTGCGCTGCTGCTCCTGATGCCTGCCGGTGCTGCCCTGGCCCGCGTCGATGCGGGCGACGTCGCCACCTCGGCCGGTATTTCCGCTTCGCTGTATTCGAc < 1:2057068/150‑1 (MQ=255) tgtgCTTCACGCTACTGGAGAACACGACATGCGCCACCTACTGCTCGCCCCTGCGCTGCTGCTCCTGATGCCTGCCGGTGCTGCCCTGGCCCGCGTCGATGCGGGCGACGTCGCCACCTCGGCCGGTATTTCCGCTTCGCTGTATTCGAc < 2:1448829/150‑1 (MQ=255) tgtgCTTCACGCTACTGGAGAACACGACATGCGCCACCTACTGCTCGCCCCTGCGCTGCTGCTCCTGATGCCTGCCGGTGCTGCCCTGGCCCGCGAAAATTCTGTCGACGTCGCCACCTCGGCCGGTATTTCCGCTTCGCTGTATTCGAc < 2:1797473/150‑1 (MQ=255) tgtgCTGCACGCTACTGGAGAACACGACATGCGCCACCTACTGCTCGCCCCTGCGCTGCTGCTCCTGATGCCTGCCGGTGCTGCCCTGGCCCGCGTCGATGCGGGCGACGTCGCCACCTCGGCCGGTATTTCCGCTTCGCTGTATTCGAc > 1:772956/1‑150 (MQ=255) tgCTTCACGCTACTGGAGAACACGACATGCGCCACCTACTGCTCGCCCCTGCGCTGCTGCTCCTGATGCCTGCCGGTGCTGCCCTGGCCCGCGTCGATGCGGGCGACGTCGCCACCTCGGCCGGTATTTCCGCTTCGCTGTATTCGACCt > 2:1837662/1‑150 (MQ=255) cTTCACGCTACTGGAGAACACGACATGCGCCACCTACTGCTCGCCCCTGCGCTGCTGCTCCTGATGCCTGCCGGTGCTGCCCTGGCCCGCGTCGATGCGGGCGACGTCGCCACCTCGGCCGGTATTTCCGCTTCGCTGTATTCGACCTTc > 1:897336/1‑150 (MQ=255) ttCACGCTACTGGAGAACACGACATGCGCCACCTACTGCTCGCCCCTGCGCTGCTGCTCCTGATGCCTGCCGGTGCTGCCCTGGCCCGCGTCGATGCgg > 2:41368/1‑99 (MQ=255) ttCACGCTACTGGAGAACACGACATGCGCCACCTACTGCTCGCCCCTGCGCTGCTGCTCCTGATGCCTGCCGGTGCTGCCCTGGCCCGCGTCGATGCgg < 1:41368/99‑1 (MQ=255) ttCACGCTACTGGAGAACACGACATGCGCCACCTACTGCTCGCCCCTGCGCTGCTGCTCCTGATGCCTGCCGGTGCTGCCCTGGCCCGCGTCGATGCGGGCGACGTCGCCACCTCGGCCGGTATTTCCGCTTCGCTGTATTCGACCTTCa > 1:1472568/1‑150 (MQ=255) gCTACTGGAGAACACGACATGCGCCACCTACTGCTCGCCCCTGCGCTGCTGCTCCTGATGCCTGCCGGTGCTGCCCTGGCCCGCGTCGATGCGGGCGACGTCGCCACCTCGGCCGGTATTTCCGCTTCGCTGTATTCGACCTTCAAGgac < 2:1118259/150‑1 (MQ=255) gCTACTGGAGAACACGACATGCGCCACCTACTGCTCGCCCCTGCGCTGCTGCTCCTGATGCCTGCCGGTGCTGCCCTGGCCCGCGTCGATGCGGGCGACGTCGCCACCTCGGCCGGTATTTCCGCTTCGCTGTATTCGACCTTCAAGgac > 1:1762235/1‑150 (MQ=255) gCTACTGGAGAACACGACATGCGCCACCTACTGCTCGCCCCTGCGCCGCTGCTCCTGATGCCTGCCGGTGCTGCCCTGGCCCGCGTCGATGCGGGCGACGTCGCCACCTCGGCCGGTATTTCCGCTTCGCTGTATTCGACCTTCAAGgac < 1:771423/150‑1 (MQ=255) aCTGGAGAACACGACATGCGCCACCTACTGCTCGCCCCTGCGCTGCTGCTCCTGATGCCTGCCGGTGCTGCCCTGGCCCGCGTCGATGCGGGCGACGTCGCCACCTCGGCCGGTATTTCCGCTTCGCTGTATTCGACCTTCAAGgacgac < 1:1837662/150‑1 (MQ=255) tGGAGAACACGACATGCGCCACCTACTGCTCGCCCCTGCGCTGCTGCTCCTGATGCCTGCCGGTGCTGCCCTGGCCCGCGTCGATGc < 2:2292379/87‑1 (MQ=255) tGGAGAACACGACATGCGCCACCTACTGCTCGCCCCTGCGCTGCTGCTCCTGATGCCTGCCGGTGCTGCCCTGGCCCGCGTCGATGc > 1:2292379/1‑87 (MQ=255) tGGAGAACACGACATGCGCCACCTACTGCTCGCCCCTGCGCTGCTGCTCCTGATGCCTGCCGGTGCTGCCCTGGCCCGCGTCGATGCGGGCGACGTCGCCACCTCGGCCGGTATTTCCGCTTCGCTGTATTCGACCTTCAAGGACGACaa > 2:105859/1‑150 (MQ=255) gagaACACGACATGCGCCACCTACTGCTCGCCCCTGCGCTGCTGCTCCTGTTGCCTGCCGGTGCTGCCCTGGCCCGCGTCGATGCGGGCGACGTCGCCACCTCGGCCGGTATTTCCGCTTCGCTGTATTCGACCTTCAAGGACGACAAAc < 1:743365/150‑1 (MQ=255) gagaACACGACATGCGCCACCTACTGCTCGCCCCTGCGCTGCTGCTCCTGATGCCTGCCGGTGCTGCCCTGGCCCGCGTCGATGCGGGCGACGTCGCCACCTCGGCCGGTATTTCCGCTTc > 2:1950352/1‑121 (MQ=255) gagaACACGACATGCGCCACCTACTGCTCGCCCCTGCGCTGCTGCTCCTGATGCCTGCCGGTGCTGCCCTGGCCCGCGTCGATGCGGGCGACGTCGCCACCTCGGCCGGTATTTCCGCTTCGCTGTATTCGAc > 1:1387568/1‑133 (MQ=255) gagaACACGACATGCGCCACCTACTGCTCGCCCCTGCGCTGCTGCTCCTGATGCCTGCCGGTGCTGCCCTGGCCCGCGTCGATGCGGGCGACGTCGCCACCTCGGCCGGTATTTCCGCTTCGCTGTATTCGACCTTCAAGGACGACAAAc < 2:1762235/150‑1 (MQ=255) aaCACGACATGCGCCACCTACTGCTCGCCCCTGCGCTGCTGCTCCTGATGCCTGCCGGTGCTGCCCTGGCCCGCGTCGATGCGGGCGACGTCGCCACCTCGGCCGGTATTTCCGCTTCGCTGTATTCGACCTTCAAGGACGACAAACGGa < 2:800418/150‑1 (MQ=255) acacGACATGCGCCACCTACTGCTCGCCCCTGCGCTGCTGCTCCTGATGCCTGCCGGTGCTGCCCTGGCCCGCGTCGATGCGGGCGACGTCGCCACCTCGGCCGGTATTTCCGCTTCGCTGTATTCGACCTTCAAGGACGACAAACGGat < 2:1310780/150‑1 (MQ=255) acacGACATGCGCCACCTACTGCTCGCCCCTGCGCTGCTGCTCCTGATGCCTGCCGGTGCTGCCCTGGCCCGCGTCGATGCGGGCGACGTCGCCACCTCGGCCGGTACTTCCGCTTCGCTGTATTCGACCTTCAAGGACGACAAACGGat < 2:1596799/150‑1 (MQ=255) cacGACATGCGCCACCTACTGCTCGCCCCTGCGCTGCTGCTCCTGATGCCTGCCGGTGCTGCCCTGGCCCGCGTCGATGCGGGCGACGTCGCCACCTCGGCCGGTATTTCCGCTTCGCTGTATTCGACCTTCAAGGACGACAAACGGatc < 1:583117/150‑1 (MQ=255) cacGACATGCGCCACCTACTGCTCGCCCCTGCGCTGCTGCTCCTGATGCCTGCCGGTGCTGCCCTGGCCCGCGTCGATGCGGGCGACGTCGCCACCTCGGCCGGTATTTCCGCTTCGCTGTATTCGACCTTCAAGGACGACAAACGGatc > 1:513651/1‑150 (MQ=255) gACATGCGCCACCTACTGCTCGCCCCTGCGCTGCTGCTCCTGATGCCTGCCGGTGCTGCCCTGGCCCGCGTCGATGCGGGCGACGTCGCCACCTCGGCCGGTATTTCCGCTTCGCTGTATTCGACCTTCAAGGACGACAAACGGatcatc < 1:2373984/150‑1 (MQ=255) gACATGCGCCACCTACTGCTCGCCCCTGCGCTGCTGCTCCTGATGCCTGCCGGTGCTGCCCTCGCCCGCATCGACGCGGGccag < 1:1556131/84‑4 (MQ=38) cATGCGCCACCTACTGCTCGCCCCTGCGCTGCTGCTCCTGATGCCTGCCGGTGCTGCCCTGGCCCGCGTCGATGCGGGCGACGTCGCCACCTCGGCCGGTATTTCCGCTTCGCTGTATTCGACCTTCaa < 1:1247339/129‑1 (MQ=255) cATGCGCCACCTACTGCTCGCCCCTGCGCTGCTGCTCCTGATGCCTGCCGGTGCTGCCCTGGCCCGCGTCGATGCGGGCGACGTCGCCACCTCGGCCGGTATTTCCGCTTCGCTGTATACGACCTTCaa > 2:1247339/1‑129 (MQ=255) gcCACCTACTGCTCGCCCCTGCGCTGCTGCTCCTGATGCCTGCCGGTGCTGCCCTGGCCCGCGTCGATGCGGGCGACGTCGCCACCTCGGCCGGTATTTCCGCTTCGCTGTATTCGACCTTCAAGGACGACAAACGGCTGATCCCTGccc > 1:1566710/1‑150 (MQ=255) ccACCTACTGCTCGCCCCTGCGCTGCTGCTCCTGATGCCTGCCGGTGCTGCCCTGGCCCGCGTCGATGCGGGCGACGTCGCCACCTCGGCCGGTATTTCCGCTTCGCTGTATTCGACCTTCAAGGACGACAAACGGATCATCCCTGCCCg > 2:1290536/1‑150 (MQ=255) cACCTACTGCTCGCCCCTGCGCTGCTGCTCCTGATGCCTGCCGGTGCTGCCCTGGCCCGCGTCGATGCGGGCGACGTCGCCACCTCGGCCGGTATTTCCGCTTCGCTGTATTCGACCTTCAAGGACGACAAACGGATCATCCCTGCCCGt > 2:1437881/1‑150 (MQ=255) ccTACTGCTCGCCCCTTCGCTGCTGCTCCTGATGCCTGCCGGTGCTGCCCTGGCCCGCGTCGATGCGGGCGACGTCGACACCACGGCAGCCATTCCCCCTTCGGTGTTTTCCGTCGTCAAGTACGACAAACGGATCATCCCTGCCCGTGa < 1:1749215/150‑1 (MQ=255) ccTACTGCTCGCCCCTGCGCTGCTGCTCCTGATGCCTGCCGGTGCTGCCCTGGCCCGCGTCGATGCGGGCGACGTCGCCACCTCGGCCGGTATTTCCGCTTCGCTGTATTCGACCTTCAAGgac < 2:2132374/124‑1 (MQ=255) ccTACTGCTCGCCCCTGCGCTGCTGCTCCTGATGCCTGCCGGTGCTGCCCTGGCCCGCGTCGATGCGGGCGACGTCGCCACCTCGGCCGGTATTTCCGCTTCGCTGTATTCGACCTTCAAGGACGACAAACGGATCATCCCTGCCCGTGa < 2:1472568/150‑1 (MQ=255) cTACTGCTCGCCCCTGCGCTGCTGCTCCTGATGCCTGCCGGTGCTGCCCTGGCCCGCGTCGATGCGGGCGACGTCGCCACCTCGGCCGGTATTTCCGCTTCGCTGTATTCGACCTTCAAGGACGACAAACGGATCATCCCTGCCCGTGAc < 1:1057344/150‑1 (MQ=255) cTGCTCGCCCCTGCGCTGCTGCTCCTGATGCCTGCCGGTGCTGCCCTGGCCCGCGTCGATGCGGGCGACGTCGCCACCTCGGCCGGTATTTCCGCTTCGCTGTATTCGAc < 2:1340987/110‑1 (MQ=255) cTGCTCGCCCCTGCGCTGCTGCTCCTGATGCCTGCCGGTGCTGCCCTGGCCCGCGTCGATGCGGGCGACGTCGCCACCTCGGCCGGTATTTCCGCTTCGCTGTATTCGAc > 1:1340987/1‑110 (MQ=255) cTCGCCCCTGCGCTGCTGCTCCTGATGCCTGCCGGTGCTGCCCTGGCCCGCGTCGATGCGGGCGACGTCGCCACCTCGGCCGGTATTTCCGCTTCGCTGTATTCGACCTTCAAGGACGACAAACGGa > 1:817472/1‑127 (MQ=255) cTCGCCCCTGCGCTGCTGCTCCTGATGCCTGCCGGTGCTGCCCTGGCCCGCGTCGATGCGGGCGACGTCGCCACCTCGGCCGGTATTTCCGCTTCGCTGTATTCGACCTTCAAGGACGACAAACGGa < 2:817472/127‑1 (MQ=255) cTCGCCCCTGCGCTGCTGCTCCTGATGCCTGCCGGTGCTGCCCTGGCCCGCGTCGATGCGGGCGACGTCGCCACCTCGGCCGGTATTTCCGCTTCGCTGTATTCGACCTTCAAGGACGACAAACGGa > 2:283441/1‑127 (MQ=255) gCCCCTGCGCTGCTGCTCCTGATGCCTGCCGGTGCTGCCCTGGCCCGCGTCGATGCGGGCGACGTCGCCACCTCGGCCGGTATTTCCGCTTCGCTGTATTCGACCTTCAAGGACGACAAACGGATCATCCCTGCCCGTGACGAACTTTCa < 2:1384219/150‑1 (MQ=255) gCCCCTGCGCTGCTGCTCCTGATGCCTGCCGGTGCTGCCCTGGCCCGCGTCGATGCGGGCGACGTCGCCACCTCGGCCGGTATTTCCGCTTCGCTGTATTCGACCTTCAAGGACGACAAACGGATCATCCCTGCCCGTGACGAACTTTCa > 2:2094968/1‑150 (MQ=255) cccTGCGCTGCTGCTCCTGATGCCTGCCGGTGCTGCCCTGGCCCGCGTCGATGCGGGCGACGTCGCCACCTCGGCCGGTATTTCCGCTTCGCTGTATTCGACCTTCAAGga > 1:448123/1‑111 (MQ=255) cccTGCGCTGCTGCTCCTGATGCCTGCCGGTGCTGCCCTGGCCCGCGTCGATGCGGGCGACGTCGCCACCTCGGCCGGTATTTCCGCTTCGCTGTATTCGACCTTCAAGGACGACAAACGGATCATCCCTGCCCGTGACGAACTTTCAGc < 2:1743562/150‑1 (MQ=255) gcgcTGCTGCTCCTGATGCCTGCCGGTGCTGCCCTGGCCCGCGTCGATGCGGGCGACGTCGCCACCTCGGCCGGTATTTCCGCTTCGCTGTATTCGACCTTCAAGGACGACAAACGGATCATCCCTGCCCGTGACGAACTTTCAGCGTtc < 2:405006/150‑1 (MQ=255) ctgctgctCCTGATGCCTGCCGGTGCTGCCCTGGCCCGCGTCGATGCGGGCGACGTCGCCACCTCGGCCGGTATTTCCGCTTCGCTGTATTCGACCTTCAAg < 1:2030963/102‑1 (MQ=255) ctgctgctCCTGATGCCTGCCGGTGCTGCCCTGGCCCGCGTCGATGCGGGCGACGTCGCCACCTCGGCCGGTATTTCCGCTTCGCTGTATTCGACCTTCAAg > 2:2030963/1‑102 (MQ=255) ctgctgctCCTGATGCCTGCCGGTGCTGCCCTGGCCCGCGTCGATGCGGGCGACGTCGCCACCTCGGCCGGTATTTCCGCTTCGCTGTATTCGACCTTCAAGGACGACAAACGGATCATCCCTGCCCGTGACGAACTTTCAGCGTtcgtc < 1:1544953/150‑1 (MQ=255) gctgctCCTGATGCCTGCCGGTGCTGCCCTGGCCCGCGTCGATGCGGGCGACGTCGCCACCTCGGCCGGTATTTCCGCTTCGCTGTATTCGACCTTCAAGGACGACAAACGGATCATCCCTGCCCGTGACGAACTTTCAGCGTTCGTCGc < 2:897336/150‑1 (MQ=255) gctgctCCTGATGCCTGCCGGTGCTGCCCTGGCCCGCGTCGATGCGGGCGACGTCGCCACCTCGGCCGGTATTTCCGCTTCGCTGTATTCGACCTTCAAGGACGACAAACGGATCATCCCTGCCCGTGACGAACTTTCAGCGTTCGTCGc < 1:518954/150‑1 (MQ=255) tgctCCTGATGCCTGCCGGTGCTGCCCTGGCCCGCGTCGATGCGGGCGACGTCGCCACCTCGGCCGGTATTTCCGCTTCGCTGTATTCGACCTTCAAGGACGACAAACGGATCATCCCTGCCCGTGACGAACTTTCAGCGTTCGTCGCCa > 1:801144/1‑150 (MQ=255) gctCCTGATGCCTGCCGGTGCTGCCCTGGCCCGCGTCGATGCGGGCGACGTCGCCACCTCGGCCGGTATTTCCGCTTCGCTGTATTCGACCTTCAAGGACGACAAACGGATCATCCCTGCCCGTGACGAACTTTCAGCGTTCGTCGCCAg > 2:2088464/1‑150 (MQ=255) cTGATGCCTGCCGGTGCTGCCCTGGCCCGAGTCGATGCGGGCGACGTCGCCACCTCGGCCGGTATTTCCGCTTCGCTGTATTCGACCTTCAAGGACGACAAACGGATCATCCCTGCCCGTGACGAACTTTCAGCGTTCGTCGCCAgcggc > 2:646927/1‑150 (MQ=255) tGATGCCTGCCGGTGCTGCCCTGGCCCGCGTCGATGCGGGCGACGTCGCCACCTCGGCCGGTATTTCCGCTTCGCTGTATTCGACCTTCAAGGACGACAAACGGATCATCCCTGCCCGTGACGAACTTTCAGCGTTCGTCGCCAgcggcg > 1:424777/1‑150 (MQ=255) gATGCCTGCCGGTGCTGCCCTGGCCCGCGTCGATGCGGGCGACGTCGCCACCTCGGCCGGTATTTCCGCTTCGCTGTATTCGACCTTCAAGGACGACAAACGGATCATCCCTGCCCGTGACGAACTTTCAg > 2:785421/1‑131 (MQ=255) gATGCCTGCCGGTGCTGCCCTGGCCCGCGTCGATGCGGGCGACGTCGCCACCTCGGCCGGTATTTCCGCTTCGCTGTATTCGACCTTCAAGGACGACAAACGGATCATCCCTGCCCGTGACGAACTTTCAg < 1:785421/131‑1 (MQ=255) aTGCCTGCCGGTGCTGCCCTGGCCCGCGTCGATGCGGGCGACGTCGCCACCTCGGCCGGTATTTCCGCTTCGCTGTATTCGACCTTCAAGGACGACAAACGGATCATCCCTGCCCGTGACGAACTTTCAGCGTTCGTCGCCAGCGGCGGt > 1:882289/1‑150 (MQ=255) gcctgccGGTGCTGCCCTGGCCCGCGTCGATGCGGGCGACGTCGCCACCTCGGCCGGTATTTCCGCTTCGc < 2:2376838/71‑1 (MQ=255) gcctgccGGTGCTGCCCTGGCCCGCGTCGATGCGGGCGACGTCGCCACCTCGGCCGGTATTTCCGCTTCGc > 1:2376838/1‑71 (MQ=255) acctgccGGTGCTGCCCTGGCCCGCGTCGATGCGGGCGACGTCGCCACCTCGGCCGGTATTTCCGCTTCGCTGTATTCGACCTTCAAGGACGACAAACGGATCATCCCTGCCCGTGACGAACTTTCAGCGTtc < 1:1609914/132‑1 (MQ=255) acctgccGGTGCTGCCCTGGCCCGCGTCGATGCGGGCGACGTCGCCACCTCGGCCGGTATTTCCGCTTCGCTGTATTCGACCTTCAAGGACGACAAACGGATCATCCCTGCCCGTGACGAACTTTCAGCGTtc > 2:1609914/2‑133 (MQ=255) ctgccGGTGCTGCCCTGGCCCGCGTCGATGCGGGCGACGTCGCCACCTCGGCCGGTATTTCCGCTTCGCTGTATTCGACCTTCAAGGACGACAAACGGATCATCCCTGCCCGTGACGAACTTTCAGCGTTCGTCGCCAGCGGCGGTACCa > 2:851096/1‑150 (MQ=255) tgccGGTGCTGCCCTGGCCCGCGTCGATGCGGGCGACGTCGCCACCTCGGCCGGTATTTCCGCTTCGCTGTATTCGACCTTCAAGGACGACAAACGGATCATCCCTGCCCGTGACGAACTTTCAGCGTTCGTCGCCAGCGGCGGTANCAt < 2:1509772/150‑1 (MQ=255) gccGGTGCTGCCCTGGCCCGCGTCGATGCGGGCGACGTCGCCACCTCGGCCGGTATTTCCGCTTCGCTGTATTCGACCTTCAAGGACGACAAACGGATCATCCCTGCCCGTGACGAACTTTCAGCGTTCGTCGCCAGCGGCGGTACCATc < 2:424777/150‑1 (MQ=255) gccGGTGCTGCCCTGGCCCGCGTCGATGCGGGCGACGTCGCCACCTCGGCCGGTATTTCCGCTTCGCTGTATTCGACCTTCAAGGACGACAAACGGATCATCCCTGCCCGTGACGAACTTTCAGCGTTCGTCGCCAGCGGCGGTACCATc < 1:358021/150‑1 (MQ=255) gccGGTGCTGCCCTGGCCCGCGTCGATGCGGGCGACGTCGCCACCTCGGCCGGTATTTCCGCTTCGCTGTATTCGACCTTCAAGGACGACAAACGGATCATCCCTGCCCGTGACGAACTTTCAGCGTTCGTCGCCAGCGGCGGTACCATc < 1:357699/150‑1 (MQ=255) tgcCCTGGCCCGCGTCGATGCGGGCGACGTCGCCACCTCGGACGGTGCCATCACGGCCCTGTATTCGACCTTCAAGGACGACAAACGGATCATCCCTGCCCGTGACGAACTTTCAGCGTTCGTCGCCAGCGGCGGTACCATCCGCGgcgc < 2:62976/150‑1 (MQ=255) cccTGGCCCGCGTCGATGCGGGCGACGTCGCCACCTCGGCCGGTATTTCCGCTTCGCTGTATTCGACCTTCAAGGACGACAAACGGATCATcc < 1:775062/93‑1 (MQ=255) cccTGGCCCGCGTCGATGCGGGCGACGTCGCCACCTCGGCCGGTATTTCCGCTTCGCTGTATTCGACCTTCAAGGACGACAAACGGATCATCCCTGCCCGTGACGAACTTTCAGCGTTCGTCGCCAGCGGCGGTACCATCCGCGGCGCCt > 1:2069515/1‑150 (MQ=255) tcgCCCGCATCGACGCGGGCGACGTCGCCACCTCGGCCGGTATTTCCGCTTCGCTGTATTCGACCTTCAAGGACGACAAACGGATCATCCCTGCCCGTGACGAACTTTCAGCGTTCGTCGCCAGCGGCGGTACCATCCGCGGCGCCTAtg > 2:154809/3‑150 (MQ=255) ggCCCGCGTCGATGCGGGCGACGTCGCCACCTCGGCCGGTATTTCCGCTTCGCTGTATTCGACCTTCAAGGACGACAAACGGATCATCCCTGCCCGTGACGAACTTTCAGCGTTCGTCGCCAGCGGCGGTACCATCCGCGGCGCCTAtgt < 1:2094968/150‑1 (MQ=255) gCCCGCGTCGATGCGGGCGACGTCGCCACCTCGGCCGGTATTTCCGCTTCGCTGTATTCGACCTTCAAGGACGACAAACGGATCATCCCTGCCCGTGACGAACTTTCAGCGTTCGTCGCCAGCGGCGGTACCATCCGCGGCGCCTAtgtg > 1:2202312/1‑150 (MQ=255) tCGATGCGGGCGACGTCGCCACCTCGGCCGGTATTTCCGCTTCGCTGTATTCGACCTTCAAGGACGACAAACGGATCATCCCTGCCCGTGACGAACTTTCAGCGTTCGTCGCCAGCGGCGGTACCATCCGCGGCGCCTATGTGGAGTCgg < 1:59089/150‑1 (MQ=255) aTNCGGGCGACGTCGCCACCTCGGCCGGTATTTCCGCTTCNCTGTATTCGACCTTCAAGGACGACAAACGGATCATCCCTGCCCGTGACGAACTTTCAGCGTTCGTCGCCAGCGGCGGTACCATCCGCGGCGCCTATGTGGAGTCGgcgc > 1:1792594/1‑150 (MQ=255) aTGCGGGCGACGTCGCCACCTCGGCCGGTATTTCCGCTTCGCTGTATTCGACCTTCAAGGACGACAAACGGATCATCCCTGCCCGTGACGAACTTTCAGCGTTCGTCGCCAGCGGCGGTACCATCCGCGGCGCCTATGTGGAGTCGgcgc < 2:237464/150‑1 (MQ=255) tGCGGGCGACGTCGCCACCTCGGCCGGTATTTCCGCTTCGCTGTATTCGACCTTCAAGGACGACAAACGGATCATCCCTGCCCGTGACGAACTTTCAGCGTTCGTCGc > 1:1805618/1‑108 (MQ=255) tGCGGGCGACGTCGCCACCTCGGCCGGTATTTCCGCTTCGCTGTATTCGACCTTCAAGGACGACAAACGGATCATCCCTGCCCGTGACGAACTTTCAGCGTTCGTCGc < 2:1805618/108‑1 (MQ=255) | AACTACCCCAACGCCCCCGCCGTCTTAGATACTGAGTGGTTTATTTCCCTGTGCTTCACGCTACTGGAGAACACGACATGCGCCACCTACTGCTCGCCCCTGCGCTGCTGCTCCTGATGCCTGCCGGTGCTGCCCTGGCCCGCGTCGATGCGGGCGACGTCGCCACCTCGGCCGGTATTTCCGCTTCGCTGTATTCGACCTTCAAGGACGACAAACGGATCATCCCTGCCCGTGACGAACTTTCAGCGTTCGTCGCCAGCGGCGGTACCATCCGCGGCGCCTATGTGGAGTCGGCGC > NC_002947/4272674‑4272970 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |