Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 4,280,092 | C→G | 6.4% | P416P (CCC→CCG) | PP_3750 → | GntR family transcriptional regulator |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 4,280,092 | 0 | C | G | 6.4% | 296.3 / 9.8 | 94 | P416P (CCC→CCG) | PP_3750 | GntR family transcriptional regulator |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (36/52); new base G (3/3); total (39/55) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.90e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.83e-01 |
ACCTGAACAAGCACATCCGCCGCTGCCACGAGGTCTACAGCGCACGCCGCGAGCGCATCCTGGCGCGCCTGGGCGGCGATCTGGCACCGTGG‑‑TTCAGCGCCATCCCCGCCAGCGCAGGCTTCCACCTCAGTGCCTTGGCCACCCCCGGGGTGGATGTGGAGCTGTTGGCCAACCTCGCGCGTAAGGTAGAGGT‑‑‑AGGCCTGTATTCACTGGCACCCTTCTTCAGCGAGGCACCGGTACGGCCGGGGCTATTGATGGGCTTCGGCGCCATCGAACTGCTGGATATCGAC > NC_002947/4279947‑4280233 | aCCTGAACAAGCACATCCGCCGCTGCCACGAGGTCTACAGCGCACGCCGCGAGCGCATCCTGGCGCGCCTGGGCGGCGATCTGGCACCGTGG‑‑TTCAGCGCCATCCCCGCCAGCGCAGGCTTCCACCTCAGTGCCTTGGCCACCCCGgggg > 2:1047882/1‑150 (MQ=255) aCCTGAACAAGCACATCCGCCGCTGCCACGAGGTCTACAGCGCACGCCGCGAGCGCATCCTGGCGCGCCTGGGCGGCGATCTGGCACCGTGG‑‑TTCAGCGCCATCCCCGCCAGCGCAGGCTTCCACCTCAGTGCCTTGGCCACCCCCgggg < 1:1339829/150‑1 (MQ=255) ccTGAACAAGCACATCCGCCGCTGCCACGAGGTCTACAGCGCACGCCGCGAGCGCATCCTGGCGCGCCTGGGCGGCGATCTGGCACCGTGG‑‑TTCAGCGCCATCCCCGCCAGCGCAGGCTTCCACCTCAGTGCCTTGGCCACCCCCGGGGt < 1:2447885/150‑1 (MQ=255) cTGAACAAGCACATCCGCCGCTGCCACGAGGTCTACAGCGCACGCCGCGAGCGCATCCTGGCGCGCCTGGGCGGCGATCTGGCACCGTGG‑‑TTCAGCGCCATCCCCGCCAGCGCAGGCTTCCACCTCAGTGCCTTGGCCACCCCGGGGGTg < 1:1047882/150‑1 (MQ=255) tGAACAAGCACATCCGCCGCTGCCACGAGGTCTACAGCGCACGCCGCGAGCGCATCCTGGCGCGCCTGGGCGGCGATCTGGCACCGTGG‑‑TTCAGCGCCATCCCCGCCAGCGCAGGCTTCCACCTCAGTGCCTTGGCCACCCCCGGGGTgg < 2:1476290/150‑1 (MQ=255) gAACAAGCACATCCGCCGCTGCCACGAGGTCTACAGCGCACGCCGCGAGCGCATCCTGGCGCGCCTGGGCGGCGATCTGGCACCGTGG‑‑TTCAGCGCCATCCCCGCCAGCGCAGGCTTCCACCTCAGTGCCTTGGCCACCCCCGGGGTGGa < 1:2360170/150‑1 (MQ=255) aaCAAGCACATCCGCCGCTGCCACGAGGTCTACAGCGCACGCCGCGAGCGCATCCTGGCGCGCCTGGGCGGCGATCTGGCACCGTGG‑‑TTCAGCGCCATCCCCGCCAGCGCAGGCTTCCACCTCAGTGCCTTGGCCACCCCCGGGGTGGAt < 2:192922/150‑1 (MQ=255) cAAGCACATCCGCCGCTGCCACGAGGTCTACAGCGCACGCCGCGAGCGCATCCTGGCGCGCCTGGTCGGCCATCTGGCACCGTGC‑‑TTCAGCGCCATCCCCGCCAGCGCAGGCTTCCCCCTCAGTGCCTTGGCCCCCCCCGGGGTGGAtgt < 2:1149740/150‑1 (MQ=255) cAAGCACATCCGCCGCTGCCACGAGGTCTACAGCGCACGCCGCGAGCGCATCCTGGCGCGCCTGGGCGGCGATCTGGCACCGTGG‑‑TTCAGCGCCATCCCCGCCAGCGCAGGCTTCCACCTCAGTGCCTTGGCCACCCCGGGGGTggccaa < 1:827784/150‑5 (MQ=255) cAAGCACATCCGCCGCTGCCACGAGGTCTACAGCGCACGCCGCGAGCGCATCCTGGCGCGCCTGGGCGGCGATCTGGCACCGTGG‑‑TTCAGCGCCATCCCCGCCAGCGCAGGCTTCCACCTCAGTGCCTTGGCCACCCCCGGGGTGGAtgt < 2:477585/150‑1 (MQ=255) cAAGCACATCCGCCGCTGCCACGAGGTCTACAGCGCACGCCGCGAGCGCATCCTGGCGCGCCTGGGCGGCGATCTGGCACCGTGG‑‑TTCAGCGCCATCCCCGCCAGCGCAGGCTTCCACCTCAGTGCCTTGGCCACCCCCGGGGTGGAtgt < 2:1830292/150‑1 (MQ=255) cAAGCACATCCGCCGCTGCCACGAGGTCTACAGCGCACGCCGCGAGCGCATCCTGGCGCGCCTGGGCGGCGATCTGGCACCGTGG‑‑TTCAGCGCCATCCCCGCCAGCGCAGGCTTCCACCTCAGTGCCTTGGCCACCCCCGGGGTGGAtgt < 2:898024/150‑1 (MQ=255) aaGCACATCCGCCGCTGCCACGAGGTCTACAGCGCACGCCGCGAGCGCATCCTGGCTCGCCTGGGCGGCGATCTGGCACCGTGG‑‑TTCAGCGCCATCCCCGCCAGCGCAGGCTTCCACCTCAGTGCCTTGGCCACCCCCGGGGTGGAtgtg < 2:1023788/150‑1 (MQ=255) aaGCACATCCGCCGCTGCCACGAGGTCTACAGCGCACGCCGCGAGCGCATCCTGGCGCGCCTGGGCGGCGATCTGGCACCGTGG‑‑TTCAGCGCCATCCCCGCCAGCGCAGGCTTCCACCTCAGTGCCTTGGCCACCCCCGGGGTGGAtgtg > 2:528526/1‑150 (MQ=255) aaGCACATCCGCCGCTGCCACGAGGTCTACAGCGCACGCCGCGAGCGCATCCTGGCGCGCCTGGGCGGCGATCTGGCACCGTGG‑‑TTCAGCGCCATCCCCGCCAGCGCAGGCTTCCACCTCAGTGCCTTGGCCACCCCCGGGGTGGAtgtg > 2:768481/1‑150 (MQ=255) aaGCACATCCGCCGCTGATATGAGGTCTACAGCGCACGCCGCGAGCGCATCCTGGCGCGCCTGGGCGGCGATCTGGCACCGTGG‑‑TTCAGCGCCATCCCCGCCAGCGCAGGCTTCCACCTCAGTGCCTTGGCCACCCCGGGGGTggccaag < 1:1305942/150‑6 (MQ=255) gCACATCCGCCGCTGCCACGAGGTCTACAGCGCACGCCGCGAGCGCATCCTGGCGCGCCTGGGCGGCGATCTGGCACCGTGG‑‑TTCAGCGCCATCCCCGCCAGCGCAGGCTTCCACCTCAGTGCCTTGGCCACCCCCGGGGTGGATGTGGa < 2:1309340/150‑1 (MQ=255) acaTCCGCCGCTGCCACGAGGTCTACAGCGGACGCCGCGAGCGCATCCTGGCGCGCCTGGGCGGCGATCTGGCACCGTGG‑‑TTCAGCGCCATCCCCGCCAGCGCAGGCTTCCACCTCAGTGCCTTGGCCACCCCCGGGGTGGATGTGGAGc > 2:1403586/1‑150 (MQ=255) acaTCCGCCGCTGCCACGAGGTCTACAGCGCACGCCGCGAGCGCATCCTGGCGCGCCTGGGCGGCGATCTGGCACCGTGG‑‑TTCAGCGCCATCCCCGCCAGCGCAGGCTTCCACCTCAGTGCCTTGGCCACCCCCGGGGTGGAtgt < 2:293777/145‑1 (MQ=255) acaTCCGCCGCTGCCACGAGGTCTACAGCGCACGCCGCGAGCGCATCCTGGCGCGCCTGGGCGGCGATCTGGCACCGTGG‑‑TTCAGCGCCATCCCCGCCAGCGCAGGCTTCCACCTCAGTGCCTTGGCCACCCCCGGGGTGGAtgt > 1:293777/1‑145 (MQ=255) acaTCCGCCGCTGCCACGAGGTCTACAGCGCACGCCGCGAGCGCATCCTGGCGCGCCTGGGCGGCGATCTGGCACCGTGG‑‑TTCAGCGCCATCCCCGCCAGCGCAGGCTTCCACCTCAGTGCCTTGGCCACCCCCGGGGTGGATGTGGAGc > 1:105116/1‑150 (MQ=255) acaTCCGCCGCTGCCACGAGGTCTACAGCGCACGCCGCGAGCGCATCCTGGCGCGCCTGGGCGGCGATCTGGCACCGTGG‑‑TTCAGCGCCATCCCCGCCAGCGCAGGCTTCCACCTCAGTGCCTTGGCCACCCCCGGGGTGGATGTGGAGc < 1:294992/150‑1 (MQ=255) cgccgcTGCCACGAGGTCTACAGCGCACGCCGCGAGCGCATCCTGGCGCGCCTGGGCGGCGATCTGGCACCGTGG‑‑TTCAGCGCCATCCCCGCCAGCGCAGGCCTCCACCTCAGTGCCTTGGCCACCCCCGGGGTGGATGTGGAGCTGTTg < 2:1289188/150‑1 (MQ=255) gtcgcTGTCACGAGGTCTACAGCGCACGCCGCGAGCGCATCCTGGCGCGCCTGGGCGGCGATCTGGCACCGTGG‑‑TTCAGCGCCATCCCCGCCAGCGCAGGCTTCCACCTCAGTGCCTTGGCCGCCCCCGGGGTGGATGTGGAGCTGTTgg > 2:1273559/3‑150 (MQ=255) gccgcTGCCACGAGGTCTACAGCGCACGCCGCGAGCGCATCCTGGCGCGCCTGGGCGGCGATCTGGCACCGTGG‑‑TTCAGCGCCATCCCCGCCAGCGCAGGGTTCCACCTCAGTGCCTTGGCCACCCCCGGGGTGGATGTGGAGCTGTTgg < 1:712687/150‑1 (MQ=255) gccgcTGCCACGAGGTCTACAGCGCACGCCGCGAGCGCATCCTGGCGCGCCTGGGCGGCGATCTGGCACCGTGG‑‑TTCAGCGCCATCCCCGCCAGCGCAGGCTTCCACCTCAGTGCCTTGGCCACCCCCGGGGTGGATGTGGAGCTGTTgg < 2:1679248/150‑1 (MQ=255) gccgcTGCCACGAGGTCTACAGCGCACGCCGCGAGCGCATCCTGGCGCGCCTGGGCGGCGATCTGGCACCGTGG‑‑TTCAGCGCCATCCCCGCCAGCGCAGGCTTCCACCTCAGTGCCTTGGCCACCCCCGGGGTGGATGTGGAGCTGTTgg < 2:1990363/150‑1 (MQ=255) gccgcTGCCACGAGGTCTACAGCGCACGCCGCGAGCGCATCCTGGCGCGCCTGGGCGGCGATCTGGCACCGTGG‑‑TTCAGCGCCATCCCCGCCAGCGCAGGCTTCCACCTCAGTGCCTTGGCCACCCCCGGGGTGGATGTGGAGCTGTTgg < 2:387242/150‑1 (MQ=255) aCGAGGTCTACAGCGCACGCCGCGAGCGCATCCTGGCGCGCCTGGGCGGCGATCTGGCACCGTGG‑‑TTCAGCGCCATCCCCGCCAGCGCAGGCTTCCACCTCAGTGCCTTGGCCACCCCCGGGGTGGATGTGGAGCTGTTGGCCAACCTcg > 2:319780/1‑150 (MQ=255) ggTCTACAGCGCACGCCGCGAGCGCATCCTGGCGCGCCTGGGCGGCGATCTGGCACCGTGG‑‑TTCAGCGCCATCCCCGCCAGCGCAGGCTTCCACCTCAGTGCCTTGGCCACCCCCGGGGTGGATGTGGAGCTGTTGGCCAACCTcgcgcg < 2:105116/150‑1 (MQ=255) cTACAGCCCACGCCGCGAGCGCATCCTGGCGCGCCTGGGCGGCGATCTGGCACCGTGG‑‑TTCAGCGCCATCCCCGCCAGCGCAGGCTTCCCCCTCAGTGCCTTGGCCACCCCCGGGGTGGATGTGGAGCTGTTGGCCAACCTCGCGCGTaa < 2:953700/150‑1 (MQ=255) tACAGCGCACGCCGCGAGCGCATCCTGGCGCGCCTGGGCGGCGATCTGGCACCGTGG‑‑TTCAGCTCCATCCCCGCCAGCGCAGGCTTCCACATAAGTGGCATGGGCGCCGTCTGGGGGGAGAGGGAGCGCTTGGCCAACCTCGCGCGTAag > 2:1331344/1‑150 (MQ=255) tACAGCGCACGCCGCGAGCGCATCCTGGCGCGCCTGGGCGGCGATCTGGCACCGTGG‑‑TTCAGCGCCATCCCCGCCAGCGCAGGCTTCCACCTCAGTGCCTTGGCCACCCCCGGGGTGGATGTGGAGCTGTTGGCCAACCTCGCGCGTAag > 1:359085/1‑150 (MQ=255) 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aCGCCGCGAGCGCATCCTGGCGCGCCTGGGCGGCGATCTGGCACCGTAA‑‑ACGAGCGCCATCCCCGCCAGCGCAGGCTTCCACCTCAGTGCCTTGGCCACCCCCGGGGTGGATGTGGAGCTGTTGGCCAACCTCGCGCGTAaggtagaggt < 1:1331344/150‑1 (MQ=255) gccgcGAGCGCATCCTGGCGCGCCTGGGCGGCGATCTGGCACCGTGG‑‑TTCAGCGCCATCCCCGCCAGCGCAGGCTTCCACCTCAGTGCCTTGGCCACCCCCGGGGTGGATGTGGAGCTGTTGGCCAACCTCGCGCGTAaggtagaggt‑‑‑ag > 2:1121812/1‑150 (MQ=255) gccgcGAGCGCATCCTGGCGCGCCTGGGCGGCGATCTGGCACCGTGG‑‑TTCAGCGCCATCCCCGCCAGCGCAGGCTTCCACCTCAGTGCCTTGGCCACCCCCGGGGTGGATGTGGAGCTGTTGGCCAACCTCGCGCGTAaggtagaggt‑‑‑ag < 1:1121812/150‑1 (MQ=255) cgcgAGCGCATCCTGGCGCGCCTGGGCGGCGATCTGGCACCGTGG‑‑TTCAGCGCCATCCCCGCCAGCGCAGGCTTCCACCTCAGTGCCTTGGCCACCCCCGGGGTGGATGTGGAGCTGTTGGCCAACCTCGCGCGTAAGGTAGAGGT‑‑‑AGGc > 2:5624/1‑150 (MQ=255) gcgAGCGCATCCTGGCGCGCCTGGGCGGCGATCTGGCACCGTGG‑‑TTCAGCGCCATCCCCGCCAGCGCAGGCTTCCACCTCAGTGCCTTGGCCACCCCCGGGGTGGATGTGGAGCTGTTGGCCAACCTCGCGCGTAAGGTAGAGGT‑‑‑AGGcc > 1:686865/1‑150 (MQ=255) cgAGCGCATCCTGGCGCGCCTGGGCGGCGATCTGGCACCGTGG‑‑TTCAGCGCCATCCCCGCCAGCGCAGGCTTCCACCTCAGTGCCTTGGCCACCCCCGGGGTGGATGTGGAGCTGTTGGCCAACCACGCGCGTAAGGTAGAGGT‑‑‑AGGCCt < 2:1622961/150‑1 (MQ=255) gcATCCTGGCGCGCCTGGGCGGCGATCTGGCACCGTGG‑‑TTCAGCGCCATCCCCGCCAGCGCAGGCTTCCACCTCAGTGCCTTGGCCACCCCCGGGGTGGATGTGGAGCTGTTGGCCAACCTCGCGCGTAAGGTAGAGGT‑‑‑AGGCCTGTAtt < 1:779904/150‑1 (MQ=255) aTCCTGGCGCGCCTGGGCGGCGATCTGGCACCGTGG‑‑TTCAGCGCCATCCCCGCCAGCGCAGGCTTCCACCTCAGTGCCTTGGCCACCCCCGGGGTGGATGTGGAGCTGTTGGCCAACCTCGCGCGTAAGGTAGAGGT‑‑‑AGGCCTGTATTCa > 2:703713/1‑150 (MQ=255) aTCCTGGCGCGCCTGGGCGGCGATCTGGCACCGTGG‑‑TTCAGCGCCATCCCCGCCAGCGCAGGCTTCCACCTCAGTGCCTTGGCCACCCCCGGGGTGGATGTGGAGCTGTTGGCCAACCTCGCGCGTAAGGTAGAGGT‑‑‑AGGCCTGTATTCa > 1:1661331/1‑150 (MQ=255) ccTGGCGCGCCTGGGCGGCGATCTGGCACCGTGG‑‑TTCAGCGCCATCCCCGCCAGCGCAGGCTTCCACCTCAGTGCCTTGGCCACCCCCGGGGTGGATGTGGAGCTGTTGGCCAACCTCGCGCGTAAGGTAGAGGT‑‑‑AGGCCTGTATTCACt < 2:686865/150‑1 (MQ=255) tGGCGCGCCTGGGCGGCGATCTGGCACCGTGG‑‑TTCAGCGCCATCCCCGCCAGCGCAGGCTTCCACCTCAGTGCCTTGGCCACCCCCGGGGTGGATGTGGAGCTGTTGGCCAACCTCGCGCGTAAGGTAGAGGT‑‑‑AGGCCTGTATTCACTgg > 2:1895798/1‑150 (MQ=255) gcgcgcCTGGGCGGCGATCTGGCACCGTGG‑‑TTCAGCGCCATCCCCGCCAGCGCAGGCTTCCACCTCAGTGCCTTGGCCACCCCCGGGGTGGATGTGGAGCTGTTGGCCAACCTCGCGCGTAAGGTAGAGGT‑‑‑AGGCCTGTATTCACTGGCa < 2:2129155/150‑1 (MQ=255) gcgcCTGGGCGGCGATCTGGCACCGTGG‑‑TTCAGCGCCATCCCCGCCAGCGCAGGCTTCCACCTCAGTGCCTTGGCCACCCCCGGGGTGGATGTGGAGCTGTTGGCCAACCTCGCGCGTAAGGTAGAGGT‑‑‑AGGCCTGTATTCACTGGCAcc > 2:611773/1‑150 (MQ=255) gcgcCTGGGCGGCGATCTGGCACCGTGG‑‑TTCAGCGCCATCCCCGCCAGCGCAGGCTTCCACCTCAGTGCCTTGGCCACCCCCGGGGTGGATGTGGAGCTGTTGGCCAACCTCGCGCGTAAGGTAGAGGT‑‑‑AGGCCTGTATTCACTGGCAcc < 1:5624/150‑1 (MQ=255) gcgcCTGGGCGGCGATCTGGCACCGTGG‑‑TTCAGCGCCATCCCCGCCAGCGCAGGCTTACACCTCAGTGCCTTGGCCACCCCCGGGGTGGATGTGGAGCTGTTGGCCAACCTCGCGCGTAAGGTAGAGGT‑‑‑AGGCCTGTATTCACTGGCAcc > 2:1492805/1‑150 (MQ=255) cgcCTGGGCGGCGATCTGGCACCGTGG‑‑TTCAGCGCCATCCCCGCCAGCGCAGGCTTCCACCTCAGTGCCTTGGCCACCCCCGGGGTGGATGTGGAGCTGTTGGCCAACCTCGCGCGTAAGGTAGAGGT‑‑‑AGGCCTGTATTCACTGGCAccc < 1:1403586/150‑1 (MQ=255) gcCTGGGCGGCGATCTGGCACCGTGG‑‑TTCAGCGCCATCCCCGCCAGCGCAGGCTTCCACCTCAGTGCCTTGGCCACCCCCGGGGTGGATGTGGAGCTGTTGGCCAACCTCGCGCGTAAGGTAGAGGT‑‑‑AGGCCTGTATTCACTGGCACCct > 1:1626813/1‑150 (MQ=255) gcggcgATCTGGCACCGTGG‑‑TTCAGCGCCATCCCCGCCAGCGCAGGCTTCCACCTCAGTGCCTTGGCCACCCCCGGGGTGGATGTGGAGCTGTTGGCCAACCTCGCGCGTAAGGTAGAGGT‑‑‑AGGCCTGTATTCACTGGCACCCTTCTTCa < 1:1585245/150‑1 (MQ=255) gcggcgATCTGGCACCGTGG‑‑TTCAGCGCCATCCCCGCCAGCGCAGAAACCGCGCTCCGTGCCTTGGCCACCCCCGGGGTGGATGTGGAGCTGTTGGCCAACCTCGCGCGTAAGGTAGAGGT‑‑‑AGGCCTGTATTCACTGGCACCCTTCTTCa < 2:1638491/150‑1 (MQ=255) cgATCTGGCACCGTGG‑‑TTCAGCGCCATCCCCGCCAGCGCAGGCTTCCACCTCAGTGCCTTGGCCACCCCCGGGGTGGATGTGGAGCTGTTGGCCAACCTCGCGCGTAAGGTAGAGGT‑‑‑AGGCCTGTATTCACTGGCACCCTTCTTCAGCGa < 1:1882622/150‑1 (MQ=255) cgATCTGGCACCGTGG‑‑TTCAGCGCCATCCCCGCCAGCGCAGGCTTCCACCTCAGTGCCTTGGCCACCCCCGGGGTGGAGGTGGAGCTGTTGGCCAACCTCGCGCGTAAGGTAGAGGT‑‑‑AGGCCTGTATTCACTGGCACCCTTCTTCAGCGa < 1:2143117/150‑1 (MQ=255) gATCTGGCACCGTGG‑‑TTCAGCGCCATCCCCGCCAGCGCAGGCTTCCACCTCAGTGCCTTGGCCACCCCCGGGGTGGATGTGGAGCTGTTGGCCAACCTCGCGCGTAAGGTAGAGGT‑‑‑AGGCCTGTATTCACTGGCACCCTTCTTCAGCGAg < 1:1111687/150‑1 (MQ=255) tGGCACCGTGG‑‑TTCAGCGCCATCCCCGCCAGCGCAGGCTTCCACCTCAGTGCCTTGGCCACCCCCGGGGTGGATGTGGAGCTGTTGGCCAACCTCGCGCGTAAGGTAGAGGT‑‑‑AGGCCTGTATTCACTGGCACCCATCTTCAGCGAGGCAc > 2:2028988/1‑150 (MQ=255) gCACCGTGG‑‑TTCAGCGCCATCCCCGCCAGCGCAGGCTTCCACCTCAGTGCCTTGGCCACCCCCGGGGTGGATGTGGAGCTGTTGGCCAACCTCGCGCGTAAGGTAGAGGC‑‑‑AGGCCTGTATTCACTGGCACCCTTCTTCAGCGAGGCACCg > 1:607090/1‑150 (MQ=255) aCCGTGG‑‑TTCAGCGCCATCCCCGCCAGCGCAGGCTTCCACCTCAGTGCCTTGGCCACCCCCGGGGTGGATGTGGAGCTGTTGGCCAACCTCGCGCGTAAGGTAGAGGT‑‑‑AGGCCTGTATTCACTGGCACCCTTCTTCAGCGAGGCACCGGt > 2:2198426/1‑150 (MQ=255) cGTGG‑‑TTCAGCGCCATCCCCGCCAGCGCAGGCTTGCACCTCAGCGCATATCAATCCCCCGGGGTGGATTTCTATCTGTTGGCCAACCTCGCGCGTAAGGTAGAGGT‑‑‑AGGCCTGTATTCACTGGCACCCGTCTTCAGCGAGGCACCGGTAc > 1:2254304/1‑150 (MQ=255) tCAGCGCCATCCCCGCCAGCGCAGGCTTCCACCTCAGTGCCTTGGCCACCCCCGGGGTGGATGTGGAGCTGTTGGCCAACCTCGCGCGTAAGGTAGAGGT‑‑‑AGGCCTGTATTCACTGGCACCCTTCTTCAGCGAGGCACCGGTACGGCCgg < 1:2198426/150‑1 (MQ=255) aGCGCCATCCCCGCCAGCGCAGGCTTCCACCTCAGTGCCTTGGCCACCCCCGGGGTGGATGTGGAGCTGTTGGCCAACCTCGCGCGTAAGGTAGATGT‑‑‑AGGCCTGTATTCACTGGCACCCTTCTTCAGCGAGGCACCGGTACGGCCgggg > 1:2433144/1‑150 (MQ=255) aGCGCCATCCCCGCCAGCGCAGGCTTCCACCTCAGTGCCTTGGCCACCCCCGGGGTGGATGTGGAGCTGTTGGCCAACCTCGCGCGTAAGGTAGAGTT‑‑‑AGGCCTGTATTCACTGGCACCCTTCTTCAGCGAGGCACCGCTACGGCCgggg > 2:269770/1‑150 (MQ=255) aGCGCCATCCCCGCCAGCGCAGGCTTCCACCTCAGTGCCTTGGCCACCCCCGGGGTGGATGTGGAGCTGTTGGCCAACCTCGCGCGTAAGGTAGAGGT‑‑‑AGGCCTGTATTCACTGGCACCCTTTTTCAGCGAGGCACCGGTACGGCCgggg < 1:1870924/150‑1 (MQ=255) cgcCATCCCCGCCAGCGCAGGCTTCCACCTCAGTGCCTTGGCCACCCCCGGGGTGGATGTGGAGCTg > 1:218717/1‑67 (MQ=255) cgcCATCCCCGCCAGCGCAGGCTTCCACCTCAGTGCCTTGGCCACCCCCGGGGTGGATGTGGAGCTg < 2:218717/67‑1 (MQ=255) gcCATCCCCGCCAGCGCAGGCTTCCACCTCAGTGCCTTGGCCACCCCCGGGGTGGATGTGGAGGTGTTGCCCAACCGCGCGCGTAAGGTAGAGGT‑‑‑AGGCCTGTATTCACTGGCACCCTTCTTCAGCGAGGCACCGGTACGGCCGGGGCTa < 1:542489/150‑1 (MQ=255) cATCCCCGCCAGCGCAGGCTTCCACCTCAGTGCCTTGGCCACCCCCGGGGTGGATGTGGAGCTGTTGGCCAACCTCGCGCGTAAGGTAGAGGT‑‑‑AGGCCTGTATTCACTGGCACCCTTCTTCAGCGAGGCACCGGTACGGCCGGGGCTAtt > 2:515727/1‑150 (MQ=255) aTCCCCGCCAGCGCAGGCTTCCACCTCAGTGCCTTGGCCACCCCCGGGGTGGATGTGGAGCTGTTGGCCAACCTCGCGCGTAAGGTAGAGGT‑‑‑AGGCCTGTATTCACTGGCACCCTTCTTCAGCGAGGCACCGGTACGGCCGGGGCTATTg > 2:185214/1‑150 (MQ=255) aTCCCCGCCAGCGCAGGCTTCCACCTCAGTGCCTTGGCCACCCCCGGGGTGGATGTGGAGCTGTTGGCCAACCTCGCGCGTAAGGTAGAGGT‑‑‑AGGCCTGTATTCACTGGCACCCTTCTTCAGCGAGGCACCGGTACGGCCGGGGCTATTg > 1:193722/1‑150 (MQ=255) ccccGCCAGCGCAGGCTTCCACCTCAGTGCCTTGGCCACCCCCGGGGTGGATGTGGAGCTGTTGGCCAACCTCGCGCGTAAGGTAGAGGT‑‑‑AGGCCTGTATTCACTGGCACCCTTCTTCAGCGAGGCACCGGTACGGCCGGGGCTATTGAt < 1:528526/150‑1 (MQ=255) ccGCCAGCGCAGGCTTCCACCTCAGTGCCTTGGCCACCCCCGGGGTGGATGTGGAGCTGTTGGCCAACCTCGCGCGTAAGGTAGAGGT‑‑‑AGGCCTGTATTCACTGGCACCCTTCTTCAGCGAGGCACCGGTACGGCCGGGGCTATTGATgg > 2:19746/1‑150 (MQ=255) ggCTTCCACCTCAGTGCCTTGGCCACCCCCGGGGTGGATGTGGAGCTGTTGGCCAACCTCGCGCGTAAGGTAGAGGT‑‑‑AGGCCTGTATTCACTGGCACCCTTCTTCAGCGAGGCACCGGTACGGCCgggg < 2:375176/129‑1 (MQ=255) ggCTTCCACCTCAGTGCCTTGGCCACCCCCGGGGTGGATGTGGAGCTGTTGGCCAACCTCGCGCGTAAGGTAGAGGT‑‑‑AGGCCTGTATTCACTGGCACCCTTCTTCAGCGAGGCACCGGTACGGCCgggg > 1:375176/1‑129 (MQ=255) gCTTCCACCTCAGTGCCTTGGCCACCCCCGGGGTGGATGTGGAGCTGTTGGCCAACCTCGCGCGTAAGGTAGAGGTGAAAGGCC‑G‑‑TCCACTGGCACCCTTCTTCAGCGAGGCACCGGTACGGCCGGGGATAATGCTGGGCTTCGGCGCCa > 1:746560/1‑150 (MQ=255) cTTCCACCTCAGTTCCTTGGCCACCCCCGGGGTGGATGTGGAGCTGTTGGCCAGCCTCGCGCGTAAGGTAGAGGT‑‑‑AGGCCTGTATTCACTGGCACCCTTCTTCAGCGAGGCACCGGTACGGCCGGGGCTATTGATGGGCTTCGGCGCCAt < 2:1297652/150‑1 (MQ=255) ttCCACCTCAGTGCCTTGGCCACCCCCGGGGTGGATGTGGAGCTGTTGGCCAACCTCGCGCGTAAGGTAGAGGT‑‑‑AGGCCTGTATTCACTGGCACCCTTCTTCAGCGAGGCACCGGTACGGCCGGGGCTATTGATGGGCTTCGGCGCCATc > 2:661254/1‑150 (MQ=255) cACCTCAGTGCCTTGGCCACCCCCGGGGTGGATGTGGAGCTGTTGGCCAACCTCGCGCGTAAGGTAGAGGT‑‑‑AGGCCTGTATTCACTGGCACCCTTCTTCAGCGAGGCACCGGTACGGCCGGGGCTATTGATGGGCTTCGGCGCCATCGaa < 2:240806/150‑1 (MQ=255) aCCTAAGTGCCTTGGCCACCCCCGGGGTGGATGTGGAGCTGTTGGCCAACCTCGCGCGTAAGGTAGAGGT‑‑‑AGGCCTGTATTCACTGGCACCCTTCTTCAGCGAGGCACCGGTACGGCCGGGGTCATTGATGGGCTTCGGCGCCAGCGAAc > 1:1083923/1‑150 (MQ=255) tCAGTGCCTTGGCCACCCCCGGGGTGGATGTGGAGCTGTTGGCCAACCTCGCGCGTAAGGTAGAGGT‑‑‑AGGCCTGTATTCACTGGCACCCTTCTTCAGCGAGGCACCGGTACGGCCGGGGCTATTGATGGGCTTCGGCGCCATCGAActgc < 1:611773/150‑1 (MQ=255) aGTGCCTTGGCCACCCCCGGGGTGGATGTGGAGCTGTTGGCCAACCTCGCGCGTAAGGTAGAGGT‑‑‑AGGCCTGTATTCACTGGCACCCTTCTTCAGCGAGGCACCGGTACGGCCGGGGCTATTGATGGGCTTCGGCGCCATCGaa > 2:1063423/1‑144 (MQ=255) aGTGCCTTGGCCACCCCCGGGGTGGATGTGGAGCTGTTGGCCAACCTCGCGCGTAAGGTAGAGGT‑‑‑AGGCCTGTATTCACTGGCACCCTTCTTCAGCGAGGCACCGGTACGGCCGGGGCTATTGATGGGCTTCGGCGCCATCGaa < 1:1063423/144‑1 (MQ=255) aGTGCCTTGGCCACCCCCGGGGTGGATGTGGAGCTGTTGGCCAACCTCGCGCGTAAGGTAGAGGT‑‑‑AGGCCTGTATTCACTGGCACCCTTCTTCAGCGAGGCACCGGTACGGCCGGGGCTATTGATGGGCTTCGGCGCCATCGAActgctg < 2:1753046/150‑1 (MQ=255) tccacatccACCCCGGGGGTGGATGTGGAGCTGTTGGCCAACCTCGCGCGTAAGGTAGAGGT‑‑‑AGGCCTGTATTAACTGGCACCCTTCTTCAGCGCGGAACCGGGACGGCCGGGGCTATTGATGGGCTTCGGCGCCATCGAACTGCTGGat > 1:535592/8‑150 (MQ=255) ccgtGGCCACCCCCGGGGTGGATGTGGAGCTGTTGGCCAACCTCGCGCGTAAGGTAGAGGT‑‑‑AGGCCTGTATTCACTGGCACCCTTCTTCAGCGAGGCACCGGTACGGCCGGGGCTAt < 2:1688257/114‑1 (MQ=255) ccTTGGCCACCCCCGGGGTGGATGTGGAGCTGTTGGCCAACCTCGCGCGTAAGGTAGAGGT‑‑‑AGGCCTGTATTCACTGGCACCCTTCTTCAGCGAGGCACCGGTACGGCCGGGGCTAt > 1:1688257/1‑117 (MQ=255) ccTTGGCCACCCCCGGGGTGGATGTGGAGCTGTTGGCCAACCTCGCGCGTAAGGTAGAGGT‑‑‑AGGCCTGTATTCACTGGCACCCTTCTTCAGCGAGGCACCGGTACGGCCGGGGCTATTGATGGGCTTCGGCGCCATCGAACTGCTGGata < 1:185214/150‑1 (MQ=255) catccACCCCGGGGGTGGATGTGGAGCTGTTGGCCAACCTCGCGCGTAAGGTAGAGGT‑‑‑AGGCCTGTATTCACTGGCACCCTTCTTCAGCGAGGCACCGGTACGGCCGGGGCTATTGATGGGCTTCGGCGCCATCGAACTGCTGGATATCg > 1:1889962/4‑150 (MQ=255) ggCCACCCCCGGGGTGGATGTGGAGCTGTTGGCCAACCTCGCGCGTAAGGTAGAGGT‑‑‑AGGCCTGTATTCACTGGCACCCTTCTTCAGCGAGGCACCGGTACGGCCGGGGCTATTGATGGGCTTCGGCGCCATCGAACTGCTGGATATCGa < 2:1684233/150‑1 (MQ=255) gCCACCCCCGGGGTGGATGTGGAGCTGTTGGCCAACCTCGCGCGTAAGGTAGAGGT‑‑‑AGGCCTGTATTCACTGGCACCCTTCTTCAGCGAGGCACCGGTACGGCCGGGGCTATTGATGGGCTTCGGCGCCATCGAACTGCTGGATATCGAc < 1:703713/150‑1 (MQ=255) ccccGGGGTGGATGTGGAGCTGTTGGCCAACCTCGCGCGTAAGGTAGAGGT‑‑‑AGGCCTGTATTCACTGGCACCCTTCTTCAGCGAGGCACCGGTACGGCCGGGGCTAt < 1:996757/107‑1 (MQ=255) ccccGGGGTGGATGTGGAGCTGTTGGCCAACCTCGCGCGTAAGGTAGAGGT‑‑‑AGGCCTGTATTCACTGGCACCCTTCTTCAGCGAGGCACCGGTACGGCCGGGGCTAt > 2:996757/1‑107 (MQ=255) cGGGGTGGATGTGGAGCTGTTGGCCAACCTCGCGCGTAAGGTAGAGGT‑‑‑AGGCCTGTATTCACTGGCACCCTTCTTCAGCGAGGCACCGGTACGGCCGGGGCTATTGATGGGc < 1:1010834/112‑1 (MQ=255) cGGGGTGGATGTGGAGCTGTTGGCCAACCTCGCGCGTAAGGTAGAGGT‑‑‑AGGCCTGTATTCACTGGCACCCTTCTTCAGCGAGGCACCGGTACGGCCGGGGCTATTGATGGGc > 2:1010834/1‑112 (MQ=255) | ACCTGAACAAGCACATCCGCCGCTGCCACGAGGTCTACAGCGCACGCCGCGAGCGCATCCTGGCGCGCCTGGGCGGCGATCTGGCACCGTGG‑‑TTCAGCGCCATCCCCGCCAGCGCAGGCTTCCACCTCAGTGCCTTGGCCACCCCCGGGGTGGATGTGGAGCTGTTGGCCAACCTCGCGCGTAAGGTAGAGGT‑‑‑AGGCCTGTATTCACTGGCACCCTTCTTCAGCGAGGCACCGGTACGGCCGGGGCTATTGATGGGCTTCGGCGCCATCGAACTGCTGGATATCGAC > NC_002947/4279947‑4280233 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |