Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 4,519,494 | A→G | 8.8% | F24L (TTC→CTC) | clpA ← | ATP‑dependent serine protease |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 4,519,494 | 0 | A | G | 8.8% | 185.7 / 7.3 | 68 | F24L (TTC→CTC) | clpA | ATP‑dependent serine protease |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (33/29); new base G (4/2); total (37/31) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.81e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.58e-01 |
ACAGGGATCAACGGCGTGGTGGAGTCGATGAACTCTTGCAGGTCATGCTTGAGCTTGTCGAGATTGGCGCCACAGGCGCGCAGAACGGTCGCGGCAGCCTCATTGTCAAGGAGTGCCAGCAGCAGATGCTCGACGGTCATGAACTCATGACGCTTCGAACGGGCCTCCTTGAAGGCAAGATTGAGGGTGACTTCGAGCTCGCGGTTTAACATAGCTTCACCTCATACCCAAGTGGTCGGCGATTAACCGTCCTTCTCGATTTCACAGAGTAGCGGATGCTGGCTTTCCCTGG > NC_002947/4519352‑4519643 | aCAGGGATCAACGGCGTGGTGGAGTCGATGAACTCTTGCAGGTCATGCTTGAGCTTGTCGAGATTGGCGCCACAGGCGCGCAGAACGGTCGCGGCAGCCTCATTGTCAAGGAGTGCCAGCAGCAGATGCTCGACGGTCATGAACTCATGa > 1:1738797/1‑150 (MQ=255) aGGGATCAACGGCGTGGTGGAGTCGATGAACTCTTGCAGGTCATGCTTGAGCTTGTCGAGATTGGCGCCACAGGCGCGCAGAACGGTCGCGGCAGCCTCATTGTCATGGAGTGCCAGCAGCAGATGCTCGACGGTCATGAACTCATGACg > 2:823286/1‑150 (MQ=255) aGGGATCAACGGCGTGGTGGAGTCGATGAACTCTTGCAGGTCATGCTTGAGCTTGTCGAGATTGGCGCCACAGGCGCGCAGAACGGTCGCGGCAGCCTCATTGTCAAGGAGTGCCAGCAGCAGATGCTCGACGGTCATGAACTCa < 1:1448850/145‑1 (MQ=255) aGGGATCAACGGCGTGGTGGAGTCGATGAACTCTTGCAGGTCATGCTTGAGCTTGTCGAGATTGGCGCCACAGGCGCGCAGAACGGTCGCGGCAGCCTCATTGTCAAGGAGTGCCAGCAGCAGATGCTCGACGGTCATGAACTCa > 2:1448850/1‑145 (MQ=255) aGGGATCAACGGCGGGGTGGAGTCGATGAACTCTTGCAGGTCATGCTTGAGCTTGTCGAGATTGGCGCCACAGGCGCGCAGAACGGTCGCGGCAGCCTCATTGTCATGGAGTGCCAGCAGCCGATGCTCGACGGTCATGAACTCATGACg > 2:822401/1‑150 (MQ=255) aaCGGCGTGGTGGAGTCGATGAACTCTTGCAGGTCATGCTTGAGCTTGTCGAGCTTGGCGCCACAGGCGCGCAGAACGGTCGCGGCAGCCTCATTGTCAAGGAGTGCCAGCAGCAGATGCTCGACGGTCATGAACTCATGACGCTTCGaa > 1:888289/1‑150 (MQ=255) aaCGGCGTGGTGGAGTCGATGAACTCTTGCAGGTCATGCTTGAGCTTGTCGAGATTGGCGCCACAGGCGCGCAGAACGGTCGCGGCAGCCTCATTGTCAAGGAGTGCCAGCAGCAGATGCTCGACGGTCATGAACTCATGACGCTTCGaa > 2:493549/1‑150 (MQ=255) gAGTCGATGAACTCTTGCAGGTCATGCTTGAGCTTGTCGAGATTGGCGCCACAGGCGCGCAGAACGGTCGCGGCAGCCTCATTGTCAAGGAGTGCCAGCAGCAGATGCTCGACGGTCATGAACTCATGACGCTTCGAACGGGCCTCCTTg < 1:1372010/150‑1 (MQ=255) gAGTCGATGAACTCTTGCAGGTCATGCTTGAGCTTGTCGAGAGTGGCGCCACCGGCGCGCAGAACGGTCGCGGCAGCCTCATTGTCAAGGAGTGCCAGCAGCAGATGCTCGACGGTCATGAACTCATGCCGCTTCGAACGGGCCTCCTTg > 2:398956/1‑150 (MQ=255) gTCGATGAACTCTTGCAGGTCATGCTTGAGCTTGTCGAGATTGGCGCCACAGGCGCGCAGAACGGTCGCGGCAGCCTCATTGTCAAGGAGTGCCAGCAGCAGATGCTCGACGGTCATGAACTCATGACGCTTCGAACGGGCCTCCTTGaa > 1:296594/1‑150 (MQ=255) gTCGATGAACTCTTGCAGGTCATGCTTGAGCTTGTCGAGATTGGCGCCACAGGCGCGCAGAACGGTCGCGGCAGCCTCATTGTCAAGGAGTGCCAGCAGCAGATGCTCGACGGTCATGAACTCATGACGCTTCGAACGGGCCTCCTTGaa < 2:1440648/150‑1 (MQ=255) gTCGATGAACTCTTGCAGGTCATGCTTGAGCTTGTCGAGATTGGCGCCACAGGCGCGCAGAACGGTCGCGGCAGCCTCATTGTCAAGGAGTGCCAGCAGCAGATGCTCGACGGTCATGAACTCATGACGCTTCGAACGGGCCTCCTTGaa < 2:1283299/150‑1 (MQ=255) gTCGATGAACTCTTGCAGGTCATGCTTGAGCTTGTCGAGATTGGCACCACAGGCGCGCAGAACGGTCGCGGCAGCCTCATTGTCAAGGAGTGCCAGCAGCAGATGCTCGACGGTCATGAAATCACTGCGCTTCGAACGGGCCTCCTTGaa < 1:324202/150‑1 (MQ=255) tCGATGAACTCTTGCAGGTCATGCTTGAGCTTGTCGAGATTGGCGCCACAGGCGCGCAGAACGGTCGCGGCAGCCTCATTGTCAAGGAGTGCCAGCAGCAGATGCTCGACGGTCATGAACTCATGACGCTTCGAACGGGCCTCCTTGAAg < 1:899313/150‑1 (MQ=255) tCGATGAACTCTTGCAGGTCATGCTTGAGCTTGTCGAGATTGGCGCCACAGGCGCGCAGAACGGTCGCGGCAGCCTCATTGTCAAGGAGTGCCAGCAGCAGATGCTCGACGGTCATGAACTCATGACGCTTCGAACGGGCCTCCTTGAAg < 2:1086838/150‑1 (MQ=255) gcGATGAACTCTTCCAGGTCATGCTTGCGCTTGTCGAGTCTGTGAAGTGATTTGCGTAGAACTGTCGCGGCAGCCTCATGGTCAAGGAGTGCCAGCAGCAGATGCTCGACGGTCATGAACTCATGACGCTTCGAACGGGCCTCCTTGAAg < 2:1843045/149‑1 (MQ=255) gATGAACTCTTGCAGGTCATGCTTGAGCTTGTCGAGATTGGCGCCACAGGCGCGCAGAACGGTCGCGGCAGCCTCATTGTCAAGGAGTGCCAGCAGCAGATGCTCGACGGTCATGAACTCATGACGCTTCGAACGGGCCTCCTTGAAGGc > 1:1788371/1‑150 (MQ=255) gATGAACTCTTGCAGGTCATGCTTGAGCTTGTCGAGATTGGCGCCACAGGCGCGCAGAACGGTCGCGGCAGCCTCATTGTCAAGGAGTGCCAGCAGCAGATGCTCGACGGTCATGAACTCATGACGCTTCGAACGGGCCTCCTTGAAGGc > 1:2030418/1‑150 (MQ=255) gATGAACTCTTGCAGGTCATGCTTGAGCTTGTCGAGATTGGCGCCACAGGCGCGCAGAACGGTCGCGGCAGCCTCATTGTCAAGGAGGGCCAGCAGCAGATGCTCGACGGTCATGAACTCATGACGCTTCGAACGGGCCTCCTTGAAGGc > 2:1038540/1‑150 (MQ=255) tGAACTCTTGCAGGTCATGCTTGAGCTTGTCGAGATTGGCGCCACAGGCGCGCAGAACGGTCGCGGCAGCCTCATTGTCAAGGAGTGCCAGCAGCAGATGCTCGACGGTCATGAACTCATGACGCTTCGAACGGGCCTCCTTGAAGGCaa < 2:1738797/150‑1 (MQ=255) tctTGCAGGTCATGCTTGAGCTTGTCGAGATTGGCGCCACAGGCGCGCAGAACGGTCGCGGCAGCCTCATTGTCAAGGAGTGCCAGCAGCAGATGCTCGACGGTCATGAACTCATGACGCTTCGAACGGGCCTCCTTGAAGTCaccctca > 2:2131110/1‑144 (MQ=255) tctTGCAGGTCATGCTTGAGCTTGTCGAGATTGGCGCCACAGGCGCGCAGAACGGTCGCGGCAGCCTCATTGTCAAGGAGTGCCAGCAGCAGATGCTCGACGGTCATGAACTCATGACGCTTCGAACGGGCCTCCTTGAAGGCAAGATTg > 1:1445554/1‑150 (MQ=255) ttGCAGGTCATGCTTGAGCTTGTCGAGATTGGCGCCACAGGCGCGCAGAACGGTCGCGGCAGCCTCATTGTCAAGGAGTGCCAGCAGCAGATGCTCGACGGTCATGAACTCATGACGCTTCGAACGGGCCTCCTTGAAGGCAAGATTGAg < 1:493549/150‑1 (MQ=255) ttGCAGGTCATGCTTGAGCTTGTCGAGATTGGCGCCACAGGCGCGCAGAACGGTCGCGGCAGCCTCATTGTCAAGGAGTACCAGCAGCAGATGCTCGCCGGTCATGAACTCATGACGCTTCGAACGGGCCTCCTTGAAGGCAAGATTGAg < 1:53927/150‑1 (MQ=255) ggTCATGCTTGAGCTTGTCGAGATTGGCGCCACAGGCGCGCAGAACGGTCGCGGCAGCCTCATTGTCAAGGAGTGCCAGCAGCAGATGCTCGACGGTCATGAACTCATGACGCTTCGAACGGGCCTCCGTGAAGGCAAGATTGAGGGTGa < 2:619138/150‑1 (MQ=255) gTCATGCTTGAGCTTGTCGAGATTGGCGCCACAGGCGCGCAGAACGGTCGCGGCAGCCTCATTGTCAAGGAGTGCCAGCAGCAGATGCTCGACGGTCATGAACTCATGACGCTTCGAACGGGCCTCCTTGAAGGCAAGATTGAGGGTGAc > 2:2394474/1‑150 (MQ=255) aTGCTTGAGCTTGTCGAGATTGGCGCCACAGGCGCGCAGAACGGTCGCGGCAGCCTCATTGTCAAGGAGTGCCAGCAGCAGATGCTCGACGGTCATGAACTCATGACGCTTCGAACGGGCCTCCTTGAAGGCAAGAtt < 2:1792194/138‑1 (MQ=255) aTGCTTGAGCTTGTCGAGATTGGCGCCACAGGCGCGCAGAACGGTCGCGGCAGCCTCATTGTCAAGGAGTGCCAGCAGCAGATGCTCGACGGTCATGAACTCATGACGCTTCGAACGGGCCTCCTTGAAGGCAAGAtt > 1:1792194/1‑138 (MQ=255) gCTTGAGCTTGTCGAGATTGGCGCCACAGGCGCGCAGAACGGTCGCGGCAGCCTCATTGTCAAGGAGTGCCAGCAGCAGATGCTCGACGGTCATGAACTCATGACGCTTCGAACGGGCCTCCTTGAAGGCAAGATTGAGGGTGACTTCGa > 1:1018599/1‑150 (MQ=255) cTTGAGCTTGTCGAGATTGGCGCCACAGGCGCGCAGAACGGTCGCGGCAGCCTCATTGTCAAGGAGTGCCAGCAGCAGATGCTCGACGGTCATGAACTCATGACGCTTCGAACGGGCCTCCTTGAAGGCAAGATTGAGGGTGACTTCGAg > 1:372005/1‑150 (MQ=255) cTTGTCGAGATTGGCGCCACAGGCGCGCAGAACGGCCGCGGCAGCCTCATTGTCAAGGAGTGCCAGCAGCAGATGCTCGACGGTCATGAACTCATGACGCTTCGAACGGGCCTCCTTGAAGGCAAGATTGAGGGTGACTTCGAGCTcgcg < 2:678556/150‑1 (MQ=255) ttGTCGAGATTGGCGCCACAGGCGCGCAGAACGGTCGCGGCAGCCTCATTGTCAAGGAGTGCCAGCAGCAGATGCTCGACGGTCATGAACTCATGACGCTTCGAACGGGCCTCCTTGAAGGCAAGATTGAGGGTGACTTCGAGCTCGCgg > 2:2076167/1‑150 (MQ=255) gTCGAGATTGGCGCCACAGGCGCGCAGAACGGTCGCGGCAGCCTCATTGTCAAGGAGTGCCAGCAGCAGATGCTCGACGGTCATGAACTCATGACGCTTCGAACGGGCCTCCTTGAAGGCAAGATTGAGGGTGACTTCGAGCTCGCGGtt > 1:1660658/1‑150 (MQ=255) tCGAGATTGGCGCCACAGGCGCGCAGAACGGTCGCGGCAGCCTCATTGTCAAGGAGTGCCAGCAGCAGATGCTCGACGGTCATGAACTCATGACGCTTCGAACGGGCCTCCTTGAAGGCAAGATTGAGGGt < 2:1985956/131‑1 (MQ=255) tCGAGATTGGCGCCACAGGCGCGCAGAACGGTCGCGGCAGCCTCATTGTCAAGGAGTGCCAGCAGCAGATGCTCGACGGTCATGAACTCATGACGCTTCGAACGGGCCTCCTTGAAGGCAAGATTGAGGGt > 1:1985956/1‑131 (MQ=255) gagaTTGGCGCCACAGGCGCGCAGAACGGTCGCGGCAGCCTCATTGTCAAGGAGTGCCAGCAGCAGATGCTCGACGGTCATGAACTCATGACGCTTCGAACGGGCCTCCTTGAAGGCAAGATTGAGGGTGACTTCGAGCTCGCGGTTTaa > 2:1161164/1‑150 (MQ=255) tGGCGCCACAGGCGCGCAGAACGGTCGCGGCAGCCTCATTGTCAAGGAGTGCCAGCAGCAGATGCTCGACGGTCATGAACTCATGACGCTTCGAACGGGCCTCCTTGAAGGCAAGATTGAGGGTGACTTCGAGCTCGCGGTTTAACATAg < 2:1788371/150‑1 (MQ=255) cacaGGCGCGCAGAACGGGCGCGGCAGCCTCATTGTCAAGGAGTGCCAGCAGCAGATGCTCGACGGTCATGAACTCATGACGCTTCGAACGGGCCTCCTTGAAGGCAAGATTGAGGGTGACTTCGAGCTCGCGGTTTAACATAGCTTCAc < 2:573339/150‑1 (MQ=255) caGGCGCGCAGAACGGTCGCGGCAGCCTCATTGTCAAGGAGTGCCAGCAGCAGATGCTCGACGGTCATGAACTCATGACGCTTCGAACggg > 1:282025/1‑91 (MQ=255) caGGCGCGCAGAACGGTCGCGGCAGCCTCATTGTCAAGGAGTGCCAGCAGCAGATGCTCGACGGTCATGAACTCATGACGCTTCGAACggg < 2:282025/91‑1 (MQ=255) aGGCGCGCAGAACGGTCGCGGCAGCCTCATTGTCAAGGAGTGCCAGCAGCAGATGCTCGACGGTCATGAACTCATGACGCTTCGAACGGGCCTCCTTGAAGGCAAGATTGAGGGTGACTTCGAGCTCGCGGTTTAACATAGCTTCACCTc > 2:384993/1‑150 (MQ=255) gcgcgcAGAACGGTCGCGGCAGCCTCATTGTCAAGGAGTGCCAGCAGCAGATGCTCGACGGTCATGAACTCATGACGCTTCGAACGGGCCTCCTTGAAGGCAAGATTGAGGGTGACTTCGAGCTCGCGGTTTAACATAGCTTCACCTCAt > 1:75793/1‑150 (MQ=255) gcAGAACGGTCGCGGCAGCCTCATTGTCAAGGAGTGCCAGCAGCAGATGCTCGACGGTCATGAACTCATGACGCGTCGAACGGGCCTCCTTGAAGGCAAGATTGAGGGTGACTTCGAGCTCGCGGTTTAACATAGCTTCACCTCATAccc > 2:1001806/1‑150 (MQ=255) tCGCGGCAGCCTCATTGTCAAGGAGTGCCAGCAGCAGATGCTCGACGGTCATGAACTCATGACGCTTCGAACGGGCCTCCTTGAAGGCAAGATTGAGGGTGACTTCGAGCTCGCGGTTTAACATAGCTTCACCTCATACCCAAGTGGTCg > 1:1021833/1‑150 (MQ=255) ggCAGCCTCATTGTCAAGGAGTGCCAGCAGCAGATGCTCGACGGTCATGAACTCATGACGCTTCGAACGGGCCTCCTTGAAGGCAAGATTGAGGGTGACTTCGAGCTCGCGGTTTAACATAGCTTCACCTCATACCCAAGTGGTCGGCGa < 2:888289/150‑1 (MQ=255) gCCTCATTGTCAAGGAGTGCCAGCAGCAGATGCTCGACGGTCATGAACTCATGACGCTTCGAACGGGCCTCCTTGAAGGCAAGATTGAGGGTGACTTCGAGCTCGCGGTTTAACATAGCTTCACCTCATACCCAAGTGGTCGGCGATTaa < 2:1018599/150‑1 (MQ=255) gCCTCATTGTCAAGGAGTGCCAGCAGCAGATACTACACGGTCATGAACTCATGACGCTTCGAACGGGCCTCCTTGAAGGCAAGATTGAGGGTGACTTCGAGCTCGCGGTTTAACATAGCTTCACCTCATACCCAAGTGGCCGGCGATTaa < 1:1440738/150‑1 (MQ=255) ccTCATTGTCAAGGAGTGCCAGCAGCAGATGCTCGACGGTCATGAACTCATGACGCTTCGAACGGGCCTCCTTGAAGGCAAGATTGAGGGTGACTTCGAGCTCGCGGTTTAACATAGCtt > 2:2152275/1‑120 (MQ=255) ccTCATTGTCAAGGAGTGCCAGCAGCAGATGCTCGACGGTCATGAACTCATGACGCTTCGAACGGGCCTCCTTGAAGGCAAGATTGAGGGTGACTTCGAGCTCGCGGTTTAACATAGCtt < 1:2152275/120‑1 (MQ=255) ccTCATTGTCAAGGAGTGCCAGCAGCAGATGCTCGACGGTCATGAACTCATGACGCTTCGAACGGGCCTCCTTGAAGGCAAGATTGAGGGTGACTTCGAGCTCGCGGTTTAACATAGCTTCACCTCATACCCAAGTGGTCGGCGa < 2:2228669/145‑1 (MQ=255) ccTCATTGTCAAGGAGTGCCAGCAGCAGATGCTCGACGGTCATGAACTCATGACGCTTCGAACGGGCCTCCTTGAAGGCAAGATTGAGGGTGACTTCGAGCTCGCGGTTTAACATAGCTTCACCTCATACCCAAGTGGTCGGCGa > 1:2228669/1‑145 (MQ=255) tCATTGTCAAGGAGTGCCAGCAGCAGATGCTCGACGGTCATGAACTCATGACGCTTCGAACGGGCCTCCTTGAAGGCAAGATTGAGGGTGACTTCGAGCTCGCGGTTTAACATAGCTTCACCTCATACCCAAGTGGTCGGCGATTAACCg > 1:868709/1‑150 (MQ=255) tGTCAAGGAGTGCCAGCAGCAGATGCTCGACGGTCATGAACTCATGACGCTTCGAACGGGCCTCCTTGAAGGCAAGATTGAGGGTGACTTCGAGCTCGCGGTTTAACATAGCTTCACCTCATACCCAAGTGGTCGGCGATTAACCGTCCt < 2:2030418/150‑1 (MQ=255) aaGGAGTGCCAGCAGCAGATGCTCGACGGTCATGAACTCATGACGCTTCGAACGGGCCTCCTTGAAGGCAAGATTGAGGGTGACTTCGAGCTCGCGGTTTAACATAGCTTCACCTCATACCCAAGTGGTCGGCGATTAACCGTCCTtctc < 1:516895/150‑1 (MQ=255) agATGCTCGACGGTCATGAACTCATGACGCTTCGAACGGGCCTCCTTGAAGGCAAGATTGAGGGTGACTTCGAGCTCGCGGTTTAACATAGCTTCACCTCATACCCAAGTGGTCGGCGATTAACCGTCCTTCTCGATTTCACAGAGTAGc < 1:1065290/150‑1 (MQ=255) agATGCTCGACGGTCATGAACTCATGACGCTTCGAACGGGCCTCCTTGAAGGCAAGATTGAGGGTGACTTCGAGCTCGCGGTTTAACATAGCTTCACCTCATACCCAAGTGGTCGGCGATTAACCGTCCTTCTCGATTTCACAGAGTAGc < 1:823286/150‑1 (MQ=255) agATGCGCGACGGTCATGAACTCATGACGCTTCGAACGGGCCTCCTTGAAGGCAAGATTGAGGGTGACTTCGAGCTCGCGGTTTAACATAGCTTCACCTCATACCCAAGTGGTCGGCGATTAACCGTCCTTCTCGATTTCACAGAGTAGc < 1:822401/150‑1 (MQ=255) gATGCTCGACGGTCATGAACTCATGACGCTTCGAACGGGCCTCCTTGAAGGCAAGATTGAGGGTGACTTCGAGCTCGCGGTTTAACATAGCTTCACCTCATACCCAAGTGGTCGGCGATTAACCGTCCTTCTCGATTTCACAGAGTAGCg > 2:100219/1‑150 (MQ=255) tCGACGGTCATGAACTCATGACGCTTCGAACGGGCCTCCTTGAAGGCAAGATTGAGGGTGACTTCGAGCTCGCGGTTTAACATAGCTTCACCTCATACCCAAGTGGTCGGCGATTAACCGTCCTTCTCGATTTCACAGAGTAGCGGATGc > 2:281525/1‑150 (MQ=255) gaagcgTCATGAGTTCATGAC‑CGTCGAACGGGCCTCCTTGAAGGCAAGATTGAGGGTGACTTCGAGCTCGCGGTTTAACATAGCTTCACCTCATACCCAAGTGGTCGGCGATTAACCGTCCTTCTCGATTTCACAGAGTAGCGGATGCTg < 1:2374343/145‑1 (MQ=255) gaagcgTCATGAGTTCATGAC‑CGTCGAACGGGCCTCCTTGAAGGCAAGATTGAGGGTGACTTCGAGCTCGCGGTTTAACATAGCTTCACCTCATACCCAAGTGGTCGGCGATTAACCGTCCTTCTCGATTTCACAGAGTAGCGGATGCTg < 1:2374186/145‑1 (MQ=255) gaagcgTCATGAGTTCATGAC‑CGTCGAACGGGCCTCCTTGAAGGCAAGATTGAGGGTGACTTCGAGCTCGCGGTTTAACATAGCTTCACCTCATACCCAAGTGGTCGGCGATTAACCGTCCTTCTCGATTTCACAGAGTAGCGGATGCTg > 2:2374343/6‑150 (MQ=255) gaagcgTCATGAGTTCATGAC‑CGTCGAACGGGCCTCCTTGAAGGCAAGATTGAGGGTGACTTCGAGCTCGCGGTTTAACATAGCTTCACCTCATACCCAAGTGGTCGGCGATTAACCGTCCTTCTCGATTTCACAGAGTAGCGGATGCTg > 2:2374186/6‑150 (MQ=255) gcgTCATGAGTTCATGACGCTTCGAACGGCCCTCCTTGAAGGCAAGATTGAGGGTTACTTCGAGCTCGCGGTTTAACATAGCTTCACCTCATACCCAAGTGGGTGGCGATTAACCGTCCTTCTCGATTTCACAGAGTAGCGGATGCTGGc > 2:909995/3‑150 (MQ=255) cgTCATGAGTTCATGACGCTTCGAACGGGCCTCCTTGAAGGCAAGATTGAGGGTGACTTCGAGCTCGCGGTTTAACATAGCTTCACCTCATACCCAAGTGGTCGGCGATTAACCGTCCTTCTCGATTTCACAGAGTAGCGGATGCTGGCt > 2:2392419/2‑150 (MQ=255) tCATGAACTCATGACGCTTCGAACGGGCCTCCTTGAAGGCAAGATTGAGGGTGACTTCGAGCTCGCGGTTTAACATAGCTTCACCTCATACCCAAGTGGTc > 2:1653922/1‑101 (MQ=255) tCATGAACTCATGACGCTTCGAACGGGCCTCCTTGAAGGCAAGATTGAGGGTGACTTCGAGCTCGCGGTTTAACATAGCTTCACCTCATACCCAAGTGGTc < 1:1653922/101‑1 (MQ=255) gAACTCATGACGCTTCGAACGGGCCTCCTTGAAGGCAAGATTGAGGGTGACTTCGAGCTCGCGGTTTAACATAGCTTCACCTCATACCCAAGTGGTCGGCGATTAACCGTCCTTCTCGATTTCACAGAGTAGCGGATGCTGGCTTTCCCt > 2:2155684/1‑150 (MQ=255) aCTCATGACGCTTCGAACGGGCCTCCTTGAAGGCAAGATTGAGGGTGACTTCGAGCTCGCGGTTTAACATAGCTTCACCTCATACCCAAGTGGTCGGCGATTAACCGTCCTTCTCGATTTCACAGAGTAGCGGATGCTGGCTTTCCCTgg < 1:1038540/150‑1 (MQ=255) | ACAGGGATCAACGGCGTGGTGGAGTCGATGAACTCTTGCAGGTCATGCTTGAGCTTGTCGAGATTGGCGCCACAGGCGCGCAGAACGGTCGCGGCAGCCTCATTGTCAAGGAGTGCCAGCAGCAGATGCTCGACGGTCATGAACTCATGACGCTTCGAACGGGCCTCCTTGAAGGCAAGATTGAGGGTGACTTCGAGCTCGCGGTTTAACATAGCTTCACCTCATACCCAAGTGGTCGGCGATTAACCGTCCTTCTCGATTTCACAGAGTAGCGGATGCTGGCTTTCCCTGG > NC_002947/4519352‑4519643 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |