| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 4,768,094 | T→A | 10.2% | M255L (ATG→TTG) | PP_4218 ← | lipase/esterase family protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 4,768,094 | 0 | T | A | 10.2% | 312.4 / 22.2 | 108 | M255L (ATG→TTG) | PP_4218 | lipase/esterase family protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (50/46); new base A (4/7); total (55/53) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.59e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.15e-01 | |||||||||||
Only 100 of 113 total aligned reads displayed.
ATCGGCCTCCTCGATGATCGAACCCATACGCATGAAGTCATGGGTCACTCCCGGGATCACCGCAAGCTGCACCGCCACCCCGGCTTGCTCCAAGTGCCGTGCATAAGCGACACCCTGGTCATGCAGCGGGTCGCACTCGGCAATCAGCATCAGTGCAGGTGCACTGTTGCTGGCGACGCTGCCCAGCAACGGTGAAAAACGCGGATCGTGACGGTCTGCCGGCACCGTGGCGTATTGCTGGTAGAACCACTCCAGGGTCTGCGCTTCAAGCAGGTAACCGCTGCCATAGCGCTGCACC > NC_002947/4767945‑4768242 | aTCGGCCTCCTCGATGATCGAACCCATACGCATGAAGTCATGGGTCACCCCCAGGATCACCGCAAGCTGCACCGCCACCCCGGCTTGCTCCAAGTGCCGTGCATAAGCGACACCCTGGTCATGCAGCGGGTCGCACTCGGCAATCAGCAt > 1:1239687/1‑150 (MQ=255) cctcGATGATCGAACCCATACGCATGAAGTCATGGGTCACTCCCGGGATCACCGCAAGCTGCACCGCCACCCCGGCTTGCTCCAAGTGCCGTGCATAAGCGACACCCTGGTCATGCAGCGGGTCGCACTCGGCAATCAGCAACAGTGCac < 1:1780013/150‑2 (MQ=255) tcGATGATCGAACCCATACGCATGAAGTCGTGGGTCACTCCCGGGATCACCGCAAGCTGCACCGCCACCCCGGCTTGCTCCAAGTGCCGTGCATAAGCGACACCCTGGTCATGCAGCGGGTCGCACTCGGCAATCAGCATCAGTGCAggg > 1:601621/1‑149 (MQ=255) atgatCGAACCCATACGCATGAAGTCATGGGTCACTCCCGGGATCACCGCAAGCTGCACCGCCACCCCGGCTTGCTCCAAGTGCCGTGCATAAGCGACACCCTGGTCATGCAGCGGGTCGCACTCGGCAATCAGCATCAGTGCAGGTGCa < 1:87859/150‑1 (MQ=255) aaCCCATACGCATGAAGTCATGGGTCACTCCCGGGATCACCGCAAGCTGCACCGCCACCCCGGCTTGCTCCAAGTGCCGTGCATAAGCGACACCCTGGTCATGCAGCGGGTCGCACTCGGCAATCAGCAACAGTGCACCTGCACTGATGc < 2:548064/150‑1 (MQ=255) aaCCCATACGCATGAAGTCATGGGTCACTCCCGGGACCACCGCAAGCTGCACCGCCACCCCGGCTTGCTCCAAGTGCCGTGCATAAGCGACACCCTGGTCATGCAGCGGGTCGCACTCGGCAATCAGCATCAGTGCAGGTGCACTGTTGc < 1:2343198/150‑1 (MQ=255) aCCCATACGCATGAAGTCATGGGTCACTCCCGGGCTCACCGCAAGCTGCACCGCCACCCCGGCTTGCTCCAAGTGCCGTGCATAAGCGACACCCTGGTCATGCAGCGGGTCGCACTCGGCAATCAGCATCAGTGCAGGTGCACTGTTGCt < 2:2364667/150‑1 (MQ=255) cccATACGCATGAAGTCATGGGTCACTCCCGGGATCACCGCAAGCTGCACCGCCACCCCGGCTTGCTCCAAGTGCCGTGCATAAGCGACACCCTGGTCATGCAGCGGGTCGCACTCGGCAATCAGCATCAGTGCAGGTGCACTGTTGCTg < 1:47250/150‑1 (MQ=255) ccATACGCATGAAGTCATGGGTCACTCCCGGGATCACCGCAAGCTGCACCGCCACCCCGGCTTGCTCCAAGTGCCGTGCATAAGCGACACCCTGGTCATGCAGCGGGTCACACTCGGCAATCAGCATCAGTGCAGGTGCACTGTTGCTgg > 1:799346/1‑150 (MQ=255) aTACGCATGAAGTCATGGGTCACTCCCGGGATCACCGCAAGCTGCACCGCCACCCCGGCTTGCTCCAAGTGCCGTGCATAAGCGACACCCTGGTCATGCAGCGGGTCGCACTCGGCAATCAGCAACAGTGCACCTGCACTGATGCTgatt < 1:1259618/150‑4 (MQ=255) cATGAAGTCATGGGTCACTCCCGGGATCACCGCAAGCTGCACCGCCACCCCGGCTTGCTCCAAGTGCCGTGCATAAGCGACACCCTGGTCATGCAGCGGGTCGCACTCGGCAATCAGCATCAGTGCAGGTGCACTGTTGCTGGCGACGCt > 2:1420927/1‑150 (MQ=255) aTGAAGTCATGGGTCACTCCCGGGATCACCGCAAGCTGCACCGCCACCCCGGCTTGCTCCAAGTGCCGTGCATAAGCGACACCCTGGTCATGCAGCGGGTCGCACTCGGCAATCAGCATCAGTGCAGGTGCACTGTTGCTGGCGACGCTg > 2:71541/1‑150 (MQ=255) tGAAGTCATGGGTCACTCCCGGGATCACCGCAAGCTGCACCGCCACCCCGGCTTGCTCCAAGTGCCGTGCATAAGCGACACCCTGGTCATGCAGCGGGTCGCACTCGGCAATCAGCATCAGTGCAGGTGCACTGTTGCTGGCGACGCTGc > 2:2135414/1‑150 (MQ=255) gAAGTCATGGGTCACTCCCGGGATCACCGCAAGCTGCACCGCCACCCCGGCTTGCTCCAAGTGCCGTGCATAAGCGACACCCTGGTCATGCAGCGGGTCGCACTCGGCAATCAGCATCAGTGCAGGTg < 2:2215220/128‑1 (MQ=255) gAAGTCATGGGTCACTCCCGGGATCACCGCAAGCTGCACCGCCACCCCGGCTTGCTCCAAGTGCCGTGCATAAGCGACACCCTGGTCATGCAGCGGGTCGCACTCGGCAATCAGCATCAGTGCAGGTg > 1:2215220/1‑128 (MQ=255) gTCATGGGTCACTCCCGGGATCACCGCAAGCTGCACCGCCACCCCGGCTTGCTCCAAGTGCCGTGCATAAGCGACACCCTGGTCATGCAGCGGGTCGCACTCGGCAATCAGCATCAGTGCAGGTGCACTGTTGCTGGCGACGCTGCCCAg > 2:825822/1‑150 (MQ=255) aTGGGTCACTCCCGGGATCACCGCAAGCTGCACCGCCACCCCGGCTTGCTCCAAGTGCCGTGCATAAGCGACACCCTGGTCATGCAGCGGGTCGCACTCGGCAATCAGCATCAGTGCAGGTGCACTGTTGCTGGCGACGCTGCCCAGCaa < 1:1886025/150‑1 (MQ=255) tGGGTCACTCCCGGGATCACCGCAAGCTGCACCGCCACCCCGGCTTGCTCCAAGTGCCGTGCATAAGCGACACCCTGGTCATGCAGCGGGTCGCACTCGGCAATCAGCATCAGTGCAGGTGCACTGTTGCTGGCGACGCTGCCCAGCAAc < 1:1055866/150‑1 (MQ=255) tGGGTCACTCCCGGGATCACCGCAAGCTGCACCGCCACCCCGGCTTGCTCCAAGTGCCGTGCATAAGCGACACCCTGGTCATGCAGCGGGTCGCACTCGGCAATCAGCATCAGTGCAGGTGCACTGTTGCTGGCGACGCTGCCCAGCAAc < 2:881577/150‑1 (MQ=255) gggTCACTCCCGGGATCACCGCAAGCTGCACCGCCACCCCGGCTTGCTCCAAGTGCCGTGCATAAGCGACACCCTGGTCATGCAGCGGGTCGCACTCGGCAATCAGCAt < 1:731380/109‑1 (MQ=255) gggTCACTCCCGGGATCACCGCAAGCTGCACCGCCACCCCGGCTTGCTCCAAGTGCCGTGCATAAGCGACACCCTGGTCATGCAGCGGGTCGCACTCGGCAATCAGCAt > 2:731380/1‑109 (MQ=255) gTCACTCCCGGGATCACCGCAAGCTGCACCGCCACCCCGGCTTGCTCCAAGTGCCGTGCATAAGCGACACCCTGGTCATGCAGCGGGTCGCACTCGGCAATCAGCATCAGTGCAGGTGCACTGTTGCTGGCGACGCTGCCCAGCAACGGt < 2:814428/150‑1 (MQ=255) tCACTCCCGGGATCACCGCAAGCTGCACCGCCACCCCGGCTTGCTCCAAGTGCCGTGCATAAGCGACACCCTGGTCATGCAGCGGGTCGCACTCGGCAATCAGCAt < 2:2417768/106‑1 (MQ=255) tCACTCCCGGGATCACCGCAAGCTGCACCGCCACCCCGGCTTGCTCCAAGTGCCGTGCATAAGCGACACCCTGGTCATGCAGCGGGTCGCACTCGGCAATCAGCAt > 1:2417768/1‑106 (MQ=255) ccGGGATCACCGCAAGCTGCACCGCCACCCCGGCTTGCTCCAAGTGCCGTGCATAAGCGACACCCTGGTCATGCAGCGGGTCGCACTCGGCAATCAGCATCAGTGCAGGTGCACTGTTGCTGGCGACGCTGCCCAGCAACGGTGAAAAAc > 1:792034/1‑150 (MQ=255) ccGGGATCACCGCAAGCTGCACCGCCACCCCGGCTTGCTCCAAGTGCCGTGCATAAGCGACACCCTGGTCATGCAGCGGGTCGCACTCGGCAATCAGCATCAGTGCAGGTGCACTGTTGCTGGCGACGCTGCCCAGCAACGGTGAAAAAc > 2:1293408/1‑150 (MQ=255) ccGGGATCACCGCAAGCTGCACCGCCACCCCGGCTTGCTCCAAGTGCCGTGCATAAGCGACACCCTGGTCATGCAGCGGGTCGCACTCGGCAATCAGCATCAGTGCAGGTGCACTGTTGCTGGCGACGCTGCCCAGCAACGGTGAAAAAc > 1:1626508/1‑150 (MQ=255) gggATCACCGCAAGCTGCACCGCCACCCCGGCTTGCTCCAAGTGCCGTGCAATATGGACACCCTGATCATGCAGCGTGTCGCACTCGGCAATCAGCATCAGTGCAGGTGCACTGTTGCTGGCGACGCTGCCCAGCAACGGTGAAAAAcgc < 2:1775209/150‑1 (MQ=255) gATCACCGCAAGCTGCACCGCCACCCCGGCTTGCTCCAAGTGCCGTGCATAAGCGACACCCTGGTCATGCAGCGGGTCGCACTCGGCAATCAGCATCAGTGCAGGTGCACTGTTGCTGGCGACGCTGCCCAGCAACGGTGAAAAACGCgg < 2:1626508/150‑1 (MQ=255) cACCGCAAGCTGCACCGCCACCCCGGCTTGCTCCAAGTGCCGTGCATAAGCGACACCCTGGTCATGCAGCGGGTCGCACTCGGCAATCAGCATCAGTGCAGGTGCACTGTTGCTGGCGACGCTGCCCAGCAACGGTGAAAAACGCGGATc < 2:725904/150‑1 (MQ=255) aCCGCAAGCTGCACCGCCACCCCGGCTTGCTCCAAGTGCCGTGCATAAGCGACACCCTGGTCATGCAGCGGGTCGCACTCGGCAATCAGCATCAGTGCAGGTGCACTTTTGCTGGCGACGCTGCCCAGCAACGGGGAAAAACGCggctag > 2:2343538/1‑146 (MQ=255) aCCGCAAGCTGCACCGCCACCCCGGCTTGCTCCAAGTGCCGTGCATAAGCGACACCCTGGTCATGCAGCGGGTCGCACTCGGCAATCAGCATCAGTGCAGGTGCACTGTTGCTGGCGACGCTGCCCAGCAACGGt > 1:657089/1‑135 (MQ=255) ccGCAAGCTGCACCGCCACCCCGGCTTGCTCCAAGTGCCGTGCATAAGCGACACCCTGGTCATGCAGCGGGTCGCACTCGGCAATCAGCATCAGTGCAGGTGCACTGTTGCTGGCGACGCTGCCCAGCAACGGTGAAAAACGCGGATCGt > 2:2424709/1‑150 (MQ=255) cGCAAGCTGCACCGCCACCCCGGCTTGCTCCAAGTGCCGTGCATAAGCGACACCCTGGTCATGCAGCGGGTCGCACTCGGCAATCAGCATCAGTGCAGGTGCACTGTTGCTGGCGACGCTGCCCAGCAACGGTGAAAAACGCGGATCGTg > 2:2161776/1‑150 (MQ=255) gCAAGCTGCACCGCCACCCCGGCTTGCTCCAAGTGCCGTGCATAAGCGACACCCTGGTCATGCAGCGGGTCGCACTCGGCAATCAGCATCAGTGCAGGTGCACTGTTGCTGGCGACGCTGCCCAGCAACGGTGAAAAACGCGGATCGTGa < 2:2219732/150‑1 (MQ=255) gCAAGCTGCACCGCCACCCCGGCTTGCTCCAAGTGCCGTGCATAAGCGACACCCTGGTCATGCAGCGGGTCGCACTCGGCAATCAGCATCAGTGCAGGTGCACTGTTGCTGGCGACGCTGCCCAGCAACGGTGAAAAACGCGGATCGTGa < 2:2440597/150‑1 (MQ=255) aaGCTGCACCGCCACCCCGGCTTGCTCCAAGTGCCGTGCATAAGCGACACCCTGGTCATGCAGCGGGTCGCACTCGGCAATCAGCATCAGTGCAGGTGCACTGTTGCTGGCGACGCTGCCCAGCAACGGTGAAAAACGCGGATCGTGACg > 2:1635014/1‑150 (MQ=255) tGCACCGCCACCCCGGCTTGCTCCAAGTGCCGTGCATAAGCGACACCCTGGTCATGCAGCGGGTCGCACTCGGCAATCAGCAACAGTGCACCTGCACTgatg > 1:1260605/1‑99 (MQ=255) tGCACCGCCACCCCGGCTTGCTCCAAGTGCCGTGCATAAGCGACACCCTGGTCATGCAGCGGGTCGCACTCGGCAATCAGCAACAGTGCACCTGCACTGATg < 2:1260605/102‑1 (MQ=255) gCACCGCCACCCCGGCTTGCTCCAAGTGCCGTGCATAAGCGACACCCTGGTCATGCAGCGGGTCGCACTCGGCAATCAGCATCAGTGCAGGTGCACTGTTGCt > 2:638918/1‑103 (MQ=255) gCACCGCCACCCCGGCTTGCTCCAAGTGCCGTGCATAAGCGACACCCTGGTCATGCAGCGGGTCGCACTCGGCAATCAGCATCAGTGCAGGTGCACTGTTGCt < 1:638918/103‑1 (MQ=255) gCACCGCCACCCCGGCTTGCTCCAAGTGCCGTGCATAAGCGACACCCTGGTCATGCAGCGGGTCGCACTCGGCAATCAGCATCAGTGCAGGTGCACTGTTGCTGGCGACGCTGCCCAGCAACGGTGAAAAAcgcg > 2:1683245/1‑135 (MQ=255) gCACCGCCACCCCGGCTTGCTCCAAGTGCCGTGCATAAGCGACACCCTGGTCATGCAGCGGGTCGCACTCGGCAATCAGCATCAGTGCAGGTGCACTGTTGCTGGCGACGCTGCCCAGCAACGGTGAAAAAcgcg < 1:1683245/135‑1 (MQ=255) aCCGCCACCCCGGCTTGCTCCAAGTGCCGTGCATAAGCGACACCCTGGTCATGCAGCGGGTCGCACTCGGCAATCAGCATCAGTGCAGGTGCACTGTTGCTGGCGACGCTGCCCAGCAACGGTGAAAAACGCGGATCGTGACGGTCTGcc < 1:1293408/150‑1 (MQ=255) aCCGCCACCCCGGCTTGCTCCAAGTGCCGTGCATAAGCGACACCCTGGTCATGCAGCGGGTCGCACTCGGCAATCAGCAACAGTGCACCTGCACTGATGc > 1:1000431/1‑100 (MQ=38) cccGGCTTGCTCCAAGTGCCGTGCATAAGCGACACCCTGGTCATGCAGCGGGTCGCACTCGGCAATCAGCATCAGTGCAGGTGCACTGTTGCTGGCGACGCTGCCCAGCAACGGTGAAAAACGCGGATCGTGACGGTCTGc < 1:1688561/141‑1 (MQ=255) cccGGCTTGCTCCAAGTGCCGTGCATAAGCGACACCCTGGTCATGCAGCGGGTCGCACTCGGCAATCAGCATCAGTGCAGGTGCACTGTTGCTGGCGACGCTGCCCAGCAACGGAGAAAAACGCGGATCGTGACGGTCTGc > 2:1688561/1‑141 (MQ=255) ccGGCTTGCTCCAAGTGCCGTGCATAAGCGACACCCTGGTCATGCAGCGGGTCGCACTCGGCAATCAGCATCAGTGCAGGTGCACTGTTGCTGGCGACGCTGCCCAGCAACGGTGAAAAACGCGGATCGTGACGGTCTGCCGGCACCGTg < 2:480385/150‑1 (MQ=255) ggCTTGCTCCAAGTGCCGTGCATAAGCGACACCCTGGTCATGCAGCGGGTCGCACTCGGCAATCAGCATCAGTGCAGGTGCACTGTTGCTGGCGACGCTGCCCAGCAACGGTGAAAAACGCGGATCGTGACGGTCTGCCGGCACCGTGGc < 2:1113452/150‑1 (MQ=255) cTTGCTCCAAGTGCCGTGCATAAGCGACACCCTGGTCATGCAGCGGGTCGCACTCGGCAATCAGCACCAGTGCAGGTGCACTGTTGCTGGCGACGCTGCCCAGCAACGGTGAAAAACGCGGATCGTGACGGTCTGCCGGCACCGTGGCGt > 2:515491/1‑150 (MQ=255) gCTCCAAGCGCCGTGCATAAGCGACACCCTGGTCATGCAGCGGGTCGCACTCGGCAATCAGCATCAGTGCAGGTGCACTGTTGCTGGCGACGCTGCCCAGCAACGGTGAAAAACGCGGATCGTGACGGTCTGCCGGCACCGTGGCGTAtt < 1:18628/150‑1 (MQ=255) tCCAAGTGCCGTGCATAAGCGACACCCTGGTCATGCAGCGGGTCGCACTCGGCAATCAGCATCAGTGCAGGTGCACTGTTGCTGGCGACGCTGCCCAGCAACGGTGAAAAACGCGGATCGTGACGGTCTGcc < 1:748377/132‑1 (MQ=255) tCCAAGTGCCGTGCATAAGCGACACCCTGGTCATGCAGCGGGTCGCACTCGGCAATCAGCATCAGTGCAGGTGCACTGTTGCTGGCGACGCTGCCCAGCAACGGTGAAAAACGCGGATCGTGACGGTCTGcc > 2:748377/1‑132 (MQ=255) tCCAAGTGCCGTGCATAAGCGACACCCTGGTCATGCAGCGGGTCGCACTCGGCAATCAGCATCAGTGCAGGTGCACTGTTGCTGGCGACGCTGCCCAGCAACGGTGAAAAACGCGGATCGTGACGGTCTGCCGGCCCCGTGGCGTATTGc > 1:973782/1‑150 (MQ=255) tCCAAGTGCCGTGCATAAGCGACACCCTGGTCATGCAGCGGGTCGCACTCGGCAATCAGCATCAGTGCAGGTGCACTGTTGCTGGCGACGCTGCCCAGCAACGGTGAAAAACGCGGATCGTGACGGTCTGCCGGCACCGTGGc > 1:952291/1‑143 (MQ=255) tCCAAGTGCCGTGCATAAGCGACACCCTGGTCATGCAGCGGGTCGCACTCGGCAATCAGCATCAGTGCAGGTGCACTGTTGCTGGCGACGCTGCCCAGCAACGGTGAAAAACGCGGATCGTGACGGTCTGCCGGCACCGTGGCGTATTGc > 1:752887/1‑150 (MQ=255) tCCAAGTGCCGTGCATAAGCGACACCCTGGTCATGCAGCGGGTCGCACTCGGCAATCAGCATCAGTGCAGGTGCACTGTTGCTGGCGACGCTGCCCAGCAACGGTGAAAAACGCGGATCGGGACGGTGTGCCGGCACCGTGGCGTATTGc > 2:29881/1‑150 (MQ=255) ccAAGTGCCGTGCATAAGCGACACCCTGGTCATGCAGCGGGTCGCACTCGGCAATCAGCATCAGTGCAGGTGCACTGTTGCTGGCGACGCTGCCCAGCAACGGTGAAAAACGCGGATCGTGACGGTCTGCCGGCACCGTGGCGTATTGCt < 1:1635014/150‑1 (MQ=255) cAAGTGCCGTGCATAAGCGACACCCTGGTCATGCAGCGGGTCGCACTTGGCAATCAGCATCAGTGCAGGTGCACTGTTGCTGGCGACGCTGCCCAGCAACGGTGAAAAACGCGGATCGTGACGGTCTGCCGGCACCGTGGCGTATTGCTg < 2:601621/150‑1 (MQ=255) aaGTGCCGTGCATAAGCGACACCCTGGTCATGCAGCGGGTCGCACTCGGCAATCAGCATCAGTGCAGGTGCACTGTTGCTGGCGACGCTGCCCAGCAACGGTGAAAAACGCGGATCGTGACGGTCTGCCGGCACCGTGGCGTATTGCTgg < 1:2111390/150‑1 (MQ=255) aaGTGCCGTGCATAAGCGACACCCTGGTCATGCAGCGGGTCGCACTCGGCAATCAGCATCAGTGCAGGTGCACTGTTGCTGGCGACGCTGCCCAGCAACGGTGAAAAACGCGGATCGTGACGGTCTGCCGGCACCGTGGCGTATTGCTgg < 2:2124532/150‑1 (MQ=255) ccGTGCATAAGCGACACCCTGGTCATGCAGCGGGTCACACTCGGCAATCAGCATCAGTGCAGGTGCACTGTTGCTGGCGACGCTGCCCAGCAACGGTGAAAAACGCGGATCGTGACGGTCTGCCGGCACCGTGGCGTATTGCTGGTAGaa < 2:799346/150‑1 (MQ=255) cGTGCATAAGCGACACCCTGGTCATGCAGCGGGTCGCACTCGGCAATCAGCATCAGTGCAGGTGCACTGTTGCTGGCGACGCTGCCCAGCAACGGTGAAAAACGCGGATCGTGACGGTCTGCCGGCACCGTGGCGTATTGCTGGTAGAAc < 1:1385218/150‑1 (MQ=255) tGCATAAGCGACACCCTGGTCATGCAGCGGGTCGCACTCGGCAATCAGCATCAGTGCAGGTGCACTGTTGCTGGCGACGCTGCCCAGCAACGGTGAAAAACGCGGATCGTGACGGTCTGCCGGCACCGTGGCGTATTGCTGGTAGAACCa > 2:661561/1‑150 (MQ=255) gCATAAGCGACACCCTGGTGATGCAGGGGGTCGCACTCGGCAATCAGGATCAGTGCAGGTGCACTGTTGCTGGCGACGCTGCCCAGCAACGGTGAGAAACGCGGATCGTGACGGTCTGCCGGCACCGTGGCTTATTGCTGGTAGAACCAc < 2:826269/150‑1 (MQ=255) aTAAGCGACACCCTGGTCATGCAGCGGGTCGCACTCGGCAATCAGCATCAGTGCAGGTGCACTGTTGCTGGCGACGCTGCCCAGCAACGGTGAAAAACGCGGATCGTGACGGTCTGCCGGCACCGTGGCGTATTGCTGGTAGatcggaag > 1:1717338/1‑143 (MQ=255) tAAGCGACACCCTGGTCATGCAGCGGGTCGCACTCGGCAATCAGCATCAGTGCAGGTGCACTGTTGCTGGCGACGCTGCCCAGCAACGGTGAAAAACGCGGATCGTGACGGTCTGCCGGCACCGTGGCGTATTGCTGGTAGAACCACTcc > 1:987359/1‑150 (MQ=255) gCGACACCCTGGTCATGCAGCGGGTCGCATTCGGCGCCCGGCTTCAGTGTATGTGCACTGTTGCTGGCGCAGTATTCTAGCAACGGTGAAAAACGCGGATCGTGACGGTCTGCCGGCACCGTGGCGTATTGCTGGTAGAACCACTCCAgg < 1:532504/150‑1 (MQ=255) gCGACACCCTGGTCATGCAGCGGGTCGCACTCGGCAATCAGCATCAGTGCAGGTGCACTGTTGCTGGCGACGCTGCCCAGCAACGGTGAAAAACGCGGATCGTGACGGTCTGCCGGCACCGTGGCGTATTGCTGGTAGAACCACTCCAgg > 2:1125/1‑150 (MQ=255) gACACCCTGGTCATGCAGCGGGTCGCACTCGGCAATCAGCATCAGTGCAGGTGCACTGTTGCTGGCGACGCTGCCCAGCAACGGTGAAAAACGCGGATCGTGACGGTCTGCCGGCACCGTGGCGTATTGCTGGTAGAACCACTCCAGGGt > 1:1031466/1‑150 (MQ=255) acacCCTGGTCATGCAGCGGGTCGCACTCGGCAATCAGCATCAGTGCAGGTGCACTGTTGCTGGCGACGCTGccc < 1:1797858/75‑1 (MQ=255) acacCCTGGTCATGCAGCGGGTCGCACTCGGCAATCAGCATCAGTGCAGGTGCACTGTTGCTGGCGACGCTGCCCAGCAACGGTGAAAAACGCGGATCGTGACGGTCTGCCGGCACCGTGGCGTATTGCTGGTAGAACCACTCCAGGGTc < 1:1543961/150‑1 (MQ=255) acacCCTGGTCATGACGCGGGTCGCACTCGGCAATCAGCATCAGTGCAGGTGCACTGTTGCTGGCGACGCTGccc > 2:1797858/1‑75 (MQ=255) acCCTGGTCATGCAGCGGGTCGCACTCGGCAATCAGCATCAGTGCAGGTGCACTGTTGCTGGCGACGCTGCCCAGCAACGGTGAAAAACGCGGATCGTGACGGTCTGCCGGCACCGTGGCGTATTg < 2:902311/126‑1 (MQ=255) acCCTGGTCATGCAGCGGGTCGCACTCGGCAATCAGCATCAGTGCAGGTGCACTGTTGCTGGCGACGCTGCCCAGCAACGGTGAAAAACGCGGATCGTGACGGTCTGCCGGCACCGTGGCGTATTg > 1:902311/1‑126 (MQ=255) ccTGGTCATGCAGCGGGTCGCACTCGGCAATCAGCATCAGTGCAGGTGCACTGtt > 1:2251268/1‑55 (MQ=255) ccTGGTCATGCAGCGGGTCGCACTCGGCAATCAGCATCAGTGCAGGTGCACTGtt < 2:2251268/55‑1 (MQ=255) ccTGGTCATGCAGCGGGTCGCACTCGGCAATCAGCATCAGTGCAGGTGCACTGTTGCTGGCGACGCTGCCCAGCAACGGTGAAAAACGCGGATCGTGACGGTCTGCCGGCACCGTGGCGTATTGCTGGTAGAACCACTCCAGGGTCTgcg < 2:752887/150‑1 (MQ=255) ccTGGTCATGCAGCGGGTCGCACTCGGCAATCAGCATCAGTGCAGGTGCACTGTTGCTGGCGACGCTGCCCAGCAACGGTGAAAAACGCGGATCGTGACGGTCTGCCGGCACCGTGGCGTATTGCTGGTAGAACCACTCCAGGGTCTgcg > 2:385193/1‑150 (MQ=255) cTGGTCATGCAGCGGGTCGCACTCGGCAATCAGCATCAGTGCAGGTGCACTGTTGCTGGCGACGCTGCCCAGCAACGGTGAAAAACGCGGATCGTGACGGTCTGCCGGCACCGTGGCGTATTGCTgg > 2:831866/1‑127 (MQ=255) cTGGTCATGCAGCGGGTCGCACTCGGCAATCAGCATCAGTGCAGGTGCACTGTTGCTGGCGACGCTGCCCAGCAACGGTGAAAAACGCGGATCGTGACGGTCTGCCGGCACCGTGGCGTATTGCTgg < 1:831866/127‑1 (MQ=255) gTCATGCAGCGGGTCGCACTCGGCAATCAGCATCAGTGGAGGTGCACTGTTGCTGGCGACGCTGCCCAGCAACGGTGAAAAACGCGGATCGTGACGGTCTGCCGGCACCGTGGCGTATTGCTGGTAGAACCACTCCAGGGTCTGCGCTTc < 1:2343538/150‑1 (MQ=255) gTCATGCAGCGGGTCGCACTCGGCAATCAGCATCAGTGCAGGTGCACTGTTGCTGGCGACGCTGCCCAGCAACGGTGAAAAACGCGGATCGTGACGGTCTGCCGGCACCGTGGCGTATTGCTGGTAGaa > 1:2109134/1‑129 (MQ=255) aTGCAGCGGGACCCACCCGGCATTCAGCATCAGTGCAGGTGCACTGTTGCTGGCGACGCTGCCCAGCAACGGTGAAAAACGCGGATCGTGACGGTCTGCCGGCACCGTGGCGTATTGCTGGTAGAACCACTCCAGGGTCTGCGCTTCAAg > 2:2112276/1‑150 (MQ=255) cAGCGGGTCGCACTCGGCAATCAGCATCAGTGCAGGTGCACTGTTGCTGGCGACGCTGCCCAGCAACGGTGAAAAACGCGGATCGTGACGGTCTGCCGGCACCGTGGCGTATTGCTGGTAGAACCACTCCAGGGTCTGCGCTTCAAGCAg < 1:2161776/150‑1 (MQ=255) gCACTCGGCAATCAGCATCAGTGCAGGTGCGCTGTTGCTGGCGACGCTGCCCAGCAACGGTGAAAAACGCGGATCGTGACGGTCTGCCGGCACCGTGGCGTATTGCTGGTAGAACCACTCCAGGGTCTGCGCTTCAAGCAGGTAACCGCt > 2:77970/1‑150 (MQ=255) tCGGCAATCAGCATCAGTGCAGGTGCACTGTTGCTGGCGACGCTGCCCAGCAACGGTGAAAAACGCGGATCGTGACGGTCTGCCGGCACCGTGGCGTATTGCTGGTAGAACCACTCCAGGGTCTGCGCTTCAAGCAGGTAACCGCTGCCa > 2:890322/1‑150 (MQ=255) tCGGCAATCAGCATCAGTGCAGGTGCACTGTTGCTGGCGACGCTGCCCAGCAACGGTGAAAAACGCGGATCGTGACGGTCTGCCGGCACCGTGGCGTATTGCTGGTAGAACCACTCCAGGGTCTGCGCTTCAAGCAGGTAACCGCTGCCa > 2:1124438/1‑150 (MQ=255) tCGGCAATCAGCATCAGTGCAGGTGCACTGTTGCTGGCGACGCTGCCCAGCAACGGGGAAAAACGCGGAGCGTGACGGTCAGGAGGCACCTTGGCTTATTGCTGGTAGAACCACTCCAGGGTCTGCGCTTCAAGCAGGTAGCCGCTGCCa > 1:1750394/1‑150 (MQ=255) gCAATCAGCATCAGTGCAGGTGCACTGTTGCTGGCGACGCTGCCCAGCAACGGTGAAAAACGCGGATCGTGACGGTCTGCCGGCACCGTGGCGTATTGCTGGTAGAACCACTCCAGGGTCTGCGCTTCAAGCAGGTAACCGCTGCCATAg > 2:520186/1‑150 (MQ=255) gCAATCAGCATCAGTGCAGGTGCACTGTTGCTGGCGACGCTGCCCAGCAACGGTGAAAAACGCGGATCGTGACGGTCTGCCGGCACCGTGGCGTATTGCTGGTAGAACCACTCCAGGGTCTGCGCTTCAAGCAGGTAACCGCTGCCATAg > 2:520878/1‑150 (MQ=255) tCAGCATCAGTGCAGGTGCACTGTTGCTGGCGACGCTGCCCAGCAACGGTGAAAAACGCGGATCGTGACGGTCTGCCGGCACCGTGGCGTATTGCTGGTAGAACCACTCCAGGGTCTGCGCTTCAAGCAGGTAACCGCTGCCATAGCGCt > 2:1758436/1‑150 (MQ=255) ccAGCAACAGTGCACCTGCACTGATGCTGGCGACGCTGCCCAGCAACGGTGAAAAACGCGGATCGTGACGGTCTGCCGGCACCGTGGCGTATTGCTGGTAGAACCACTCCAGGGTCTGCGCTTCAAGc < 1:2396069/127‑1 (MQ=255) ccAGCAACAGTGCACCTGCACTGATGCTGGCGACGCTGCCCAGCAACGGTGAAAAACGCGGATCGTGACGGTCTGCCGGCACCGTGGCGTATTGCTGGTAGAACCACTCCAGGGTCTGCGCTTCAAGc > 2:2396069/2‑128 (MQ=255) aGCATCAGTGCAGGTGCACTGTTGCTGGCGACGCTGCCCAGCAACGGTGAAAAACGCGGATc < 1:1974471/62‑1 (MQ=255) aGCATCAGTGCAGGTGCACTGTTGCTGGCGACGCTGCCCAGCAACGGTGAAAAACGCGGATc > 2:1974471/1‑62 (MQ=255) aGCAACAGTGCACCTGCACTGATGCTGGCGACGCTGCCCAGCAACGGTGAAAAACGCGGATCGTGACGGTCTGCCGGCACCGTGGCGTATTGCTGGTAGAACCACTCCAGGGTCTGCGCTTCaa < 1:1304754/124‑1 (MQ=255) aGCAACAGTGCACCTGCACTGATGCTGGCGACGCTGCCCAGCAACGGTGAAAAACGCGGATCGTGACGGTCTGCCGGCACCGAGGCGTATTGCTGGGAGAACCACTCCAGGGTCTGCGCTTCaa > 2:1304754/1‑124 (MQ=255) cATCAGTGCAGGTGCACTGTTGCTGGCGACGCTGCCCAGCAACGGTGAAAAACGCGGATCGTGACGGTCTGCCGGCACCGTGGCGTATTGCTGGTAGAACCACTCCAGGGTCTGCGCTTCAAGCAGGTAACCGCTGCCATAGCGCTGCAc < 1:2135414/150‑1 (MQ=255) aTCAGTGCAGGTGCACTGTTGCTGGCGACGCTGCCCAGCAACGGTGAAAAACGCGGATCGTGACGGTCTGCCGGCACCGTGGCGTATTGCTGGTAGAACCACTCCAGGGTCTGCGCTTCAAGCAGGTAACCGCTGCCATAGCGCTGCAcc > 2:2233327/1‑150 (MQ=255) | ATCGGCCTCCTCGATGATCGAACCCATACGCATGAAGTCATGGGTCACTCCCGGGATCACCGCAAGCTGCACCGCCACCCCGGCTTGCTCCAAGTGCCGTGCATAAGCGACACCCTGGTCATGCAGCGGGTCGCACTCGGCAATCAGCATCAGTGCAGGTGCACTGTTGCTGGCGACGCTGCCCAGCAACGGTGAAAAACGCGGATCGTGACGGTCTGCCGGCACCGTGGCGTATTGCTGGTAGAACCACTCCAGGGTCTGCGCTTCAAGCAGGTAACCGCTGCCATAGCGCTGCACC > NC_002947/4767945‑4768242 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |