| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 5,230,082 | G→C | 5.3% | P61A (CCG→GCG) ‡ | PP_4607 ← | transmembrane sensor |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,230,082 | 0 | G | C | 5.3% | 299.7 / 6.1 | 95 | P61A (CCG→GCG) ‡ | PP_4607 | transmembrane sensor |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (46/44); new base C (3/2); total (49/46) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.44e-01 | |||||||||||
CACCAGCGACGCCCACGGCCAGCACCAGGCAGGCTGCCAACGCCAGGCCTGCCACCCGCCGCCAGCCACCACGCGCCGGTGGTCTGGCCATGGCATCGAGGTAGCGCTGCAGGGCGTCCTGCTCTTCGTCCGCCAGCCGCGCCGCCGGGGCGGCGCTTTTCTGCCAAAGCACCTGGGCCTGGTCGTAGGCTGCGCGGTGTGCGGGGTCGGCCAGCAACCAGCGCTTGAATGCCGCCCCTTCGGCTTGCCCGGGTTGCTCGTTGATCCGGTTGAACCATTGCAGGGCAGCCTGGAA > NC_002947/5229935‑5230229 | caccaGCGACGCCCACGGCCAGCACCAGGCAGGCTGCCAACGCCAGGCCTGCCACCCGCCGCCAGCCACCACGCGCCGGTGGTCTGGCCATGGCATCGAGGTAGCGCTGCAGGGCGTCCTGCTCTTCGTCCGCCAGCCGCGCCGCCgggg > 2:451725/1‑150 (MQ=255) caGCGACGCCCACGGCCAGCACCAGGCAGGCTGCCAACGCCAGGCCTGCCACCCGCCGCCAGCCACCACGCGCCGGTGGTCTGGCCATGGCATCGAGGTAGCGCTGCAGGGCGTCCTGCTCTTCGTCCGCCAGCCGCGCCGCCGGggcgg > 1:1936666/1‑150 (MQ=255) gCGACGCCCACGGCCAGCACCAGGCAGGCTGCCAACGCCAGGCCTGCCACCCGCCGCCAGCCACCACGCGCCGGTGGTCTGGCCATGGCATCGAGGTAGCGCTGCAGGGCGTCCTGCTCTTCGTCCGCCAGCCGCGCCGCCGGGgcggcg > 2:1950737/1‑150 (MQ=255) gCGACGCCCACGGCCAGCACCACGCAGGCTGCAAACGCCAGGCCTGCCACCCGCCGCCAGCCACCACGCGCCGGTGGTCTGGCCATGGCATCGAGGTAGCGCTGCAGGGCGTCCTGCTCTTCGTCCGCCAGCCGCGCCGCCGGGgcggcg < 2:1197450/150‑1 (MQ=255) gACGCCCACGGCCAGCACCAGGCAGGCTGCCAACGCCAGGCCTGCCACCCGCCGCCAGCCACCACGCGCCGGTGGTCTGGCCATGGCATCGAGGTAGCGCTGCAGGGCGTCCTGCTCTTCGTCCGCACCACCCGCCGCCGGGGCGGCGCt > 1:1945024/1‑150 (MQ=255) aCGCCCACGGCGAGCACCAGGCAGGCTGCCAACGCCAGGCCTGCCACCCGCCGCCAGCCACCACGCGCCGGTGGTCTGGCCATGGCATCGAGGTAGCGCTGCAGGGCGTCCTGCTCTTCGTCCGCCAGCCGCGCCGCCCCGGCGgcgcgg < 1:65178/150‑3 (MQ=255) aCGCCCACGGCCAGCACCAGGCAGGCTGCCAACGCCAGGCCTGCCACCCGCCGCCAGCCACCACGCGCCGGTGGTCTGGCCATGGCATCGAGGTAGCGCTGCAGGGCGTCCTGCTCTTCGTCCGCCAGCCGCGCCGCCGGGGCGGCGCtt > 2:1857062/1‑150 (MQ=255) cACGGCCAGCACCAGGCAGGCTGCCAACGCCAGGCCTGCCACCCGCCGCCAGCCACCACGCGCCGGTGGTCTGGCCATGGCATCGAGGTAGCGCTGCAGGGCGTCCTGCTCTTCGTCCGCCAGCCGCGCCGGCCGGGCGGCGCTGTTCTg > 2:1130975/1‑150 (MQ=255) cACGGCCAGCACCAGGCAGGCTGCCAACGCCAGGCCTGCCACCCGCCGCCAGCCACCACGCGCCGGTGGTCTGGCCATGGCATCGAGGTAGCGCTGCAGGGCGTCCTGCTCTTCGTCCGCCAGCCGCGCCGCCGGGGCGGCGCTTTTCTg > 2:1055471/1‑150 (MQ=255) cACGGCCAGCACCAGGCAGGCTGCCAACGCCAGGCCTGCCACCCGCCGCCAGCCACCACGCGCCGGTGGTCTGGCCATGGCATCGAGGTAGCGCTGCAGGGCGTCCTGCTCTTCGTCCGCCAGCCGCGCCGCCGGGGCGGCGCTTTTCTg < 2:761025/150‑1 (MQ=255) cACCAGGCAGGCTGCCAACGCCAGGCCTGCCACCCGCCGCCAGCCACCACGCGCCGGTGGTCTGGCCATGGCATCGAGGTAGCGCTGCAGGGCGTCCTGCTCTTCGTCCGCCAGCCGCGCCGCCGGGGCGGCGCTTTTCTGCCAAAGCAc > 2:1963881/1‑150 (MQ=255) aCCAGGCAGGCTGACAGCGCCAGGCCTGCCACCCGCCGCCAGCCACCACGCGCCGGTGGTCTGGCCATGGCATCGAGGTAGCGCTGCAGGGCGTCCTGCTCTTCGTCCGCCAGCCGCGCCGCCGGGGCGGCGCTTTTCTGCCCAAGCAcc > 2:79/1‑150 (MQ=255) aggcaggcTGCCAACGCCAGGCCTGCCACCCGCCGCCAGCCACCACGCGCCGGTGGTCTGGCCATGGCATCGAGGTAGCGCTGCAGGGCGTCCTGCTCTTCGTCCGCCAGCCGCGCCGCCGGGGCGGCGCTTTTCTGCCAAAGCACCTgg < 2:748549/150‑1 (MQ=255) gcaggcTGCCAACGCCAGGCCTGCCACCCGCCGCCAGCCACCACGCGCCGGTGGTCTGGCCATGGCATCGAGGTAGCGCTGCAGGGCGTCCTGCTCTTCGTCCGCCAGCCGCGCCGCCGGGGCGGCGCTTTTCTGCCAAAGCACCTGGGc > 1:821374/1‑150 (MQ=255) aggcTGCCAACGCCAGGCCTGCCACCCGCCGCCAGCCACCACGCGCCGGTGGTCTGGCCATGGCATCGAGGTAGCGCTGCAGGGCGTCCTGCTCTTCGTCCGCCAGCCGCGCCGCCGGGGCGGCGCTTTTCTGCCAAAGCACCTGGGCCt > 2:495116/1‑150 (MQ=255) cTGCCAACGCCAGGCCTGCCACCCGCCGCCAGCCACCACGCGCCGGTGGTCTGGCCATGGCATCGAGGTAGCGCTGCAGGGCGTCCTGCTCTTCGTCCGCCAGCCGCGCCGCCGGGGCGGCGCTTTTCTGCCAAAGCACCTGGGCCTGGt > 2:387795/1‑150 (MQ=255) tGCCAACGCCAGGCCTGCCACCCGCCGCCAGCCACCACGCGCCGGTGGTCTGGCCATGGCATCGAGGTAGCGCTGCAGGGCGTCCTGCTCTTCGTCCGCCAGCCGCGCCGCCGGGGCGGCGCTTTTCTGCCAAAGCACCTGGGCCTGGTc < 1:1404381/150‑1 (MQ=255) cAACGCCAGGCCTGCCACCCGCCGCCAGCCACCACGCGCCGGTGGTCTGGCCATGGCATCGAGGTAGCGCTGCAGGGCGTCCTGCTCTTCGTCCGCCAGCCGCGCCGCCGGGGCGGCGCTTTTCTGCCAAAGCACCTGGGCCTGGTCGTa < 1:1192603/150‑1 (MQ=255) cAACGCCAGGCCTGCCACCCGCCGCCAGCCACCACGCGCCGGTGGTCTGGCCATGGCATCGAGGTAGCGCTGCAGGGCGTCCTGCTCTTCGTCCGCCAGCCGCGCCGCCGGGGCGGCGCTTTTCTGCCAAAGCACCTGGGCCTGGTCGTa > 1:2192616/1‑150 (MQ=255) aaCGCCAGGCCTGCCACCCGCCGCCAGCCACCACGCGCCGGTGGTCTGGCCATGGCATCGAGGTAGCGCTGCAGGGCGTCCTGCTCTTCGTCCGCCAGCCGCGCCGCCGGGGCGGCGCTTTTCTGCCAAAGCACCTGGGCCTGGTCGTAg < 2:1544485/150‑1 (MQ=255) aaCGCCAGGCCTGCCACCCGCCGCCAGCCACCACGCGCCGGTGGTCTGGCCATGGCATCGAGGTAGCGCTGCAGGGCGTCCTGCTCTTCGTCCGCCAGCCGCGCCGCCGGGGCGGCGCTTTTCTGCCAAAGCACCTGGGCCTGGTCGTAg < 2:621418/150‑1 (MQ=255) aCGCCAGGCCTGCCACCCGCCGCCAGCCACCACGCGCCGGTGGTCTGGCCATGGCATCGAGGTAGCGCTGCAGGGCGTCCTGCTCTTCGTCCGCCAGCCGCGCCGCCGGGGCGGCGCTTTTCTGCCAAAGCACCTGGGCCTGGTCGTAgg < 1:1209487/150‑1 (MQ=255) gCCAGGCCTGCCACCCGCCGCCAGCCACCACGCGCCGGTGGTCTGGCCATGGCATCGAGGTAGCGCTGCAGTGCGTCCTGCTCTTCGTCCGCCAGCCGCGCCGCCGGGGCGGCGCTTTTCTGCCAAAGCACCTGGGCCTGGTCGTAGGCt > 2:1103034/1‑150 (MQ=255) gCCAGGCCTGCCACCCGCCGCCAGCCACCACGCGCCGGTGGTCTGGCCATGGCATCGAGGTAGCGCTGCAGGGCGTCCTGCTCTTCGTCCGCCAGCCGCGCCGCCGGGGCGGCGCt > 1:1893875/1‑116 (MQ=255) gCCAGGCCTGCCACCCGCCGCCAGCCACCACGCGCCGGTGGTCTGGCCATGGCATCGAGGTAGCGCTGCAGGGCGTCCTGCTCTTCGTCCGCCAGCCGCGCCGCCGGGGCGGCGCt < 2:1893875/116‑1 (MQ=255) gCCAGGCCTGCCACCCGCCGCCAGCCACCACGCGCCGGTGGTCTGGCCATGGCATCGAGGTAGCGCTGCAGGGCGTCCTGCTCTTCGTCCGCCAGCCGCGCCGCCGGGGCGGCGCTTTTCTGCCAAAGCACCTGGGCCTGGTCGTAGGCt < 2:821374/150‑1 (MQ=255) gCCAGGCCTGCCACCCGCCGCCAGCCACCACGCGCCGGTGGTCTGGCCATGGCATCGAGGTAGCGCTGCAGGGCGTCCTGCTCTTCGTCCGCCAGCCGCGCCGCCGGGGCGGCGCTTTTCTGCCAAAGCACCTGGGCCTGGTCGTAGGCt > 1:981512/1‑150 (MQ=255) gCCAGGCCTGCCACCCGCCGCCAGCCACCACGCGCCGGTGGTCTGGCCATGGCATCGAGGTAGCGCTGCAGGGCGTCCTGCTCTTCGTCCGCCAGCCGCGCCGCCGGGGCGGCGCTTTTCTGCCAAAGCACCTGGGCCTGGTCGTAGGCt > 2:223385/1‑150 (MQ=255) gCCTGCCACCCGCCGCCAGCCACCACGCGCCGGTGGTCTGGCCATGGCATCGAGGTAGCGCTGCAGGGCGTCCTGCTCTTCGTCCGCCAGCCGCGCCGCCGGGGCGGCGCTTTTCTGCCAAAGCACCTGGGCCTGGTCGTAGGCTGcgcg > 1:586164/1‑150 (MQ=255) cTGCCACCCGCCGCCAGCCACCACGCGCCGGTGGTCTGGCCATGGCATCGAGGTAGCGCTGCAGGGCGTCCTGCTCTTCGTCCGCCAGCCGCGCCGCCGGGGCGGCGCTTTTCTGCCAAAGCACCTGGGCCTGGTCGTAGGCTGCGCGgt < 1:484701/150‑1 (MQ=255) tGCCACCCGCCGCCAGCCACCACGCGCCGGTGGTCTGGCCATGGCATCGAGGTAGCGCTGCAGGGCGTCCTGCTCTTCGTCCGCCAGCCGCGCCGCCGGGGCGGCGCTTTTCTGCCAAAGCACCTGGGCCTGGTCGTAGGCTGCGCGgt > 1:302327/1‑149 (MQ=255) tGCCACCCGCCGCCAGCCACCACGCGCCGGTGGTCTGGCCATGGCATCGAGGTAGCGCTGCAGGGCGTCCTGCTCTTCGTCCGCCAGCCGCGCCGCCGGGGCGGCGCTTTTCTGCCAAAGCACCTGGGCCTGGTCGTAGGCTGCGCGgt < 2:302327/149‑1 (MQ=255) cACCCGCCGCCAGCCACCACGCGCCGGTGGTCTGGCCATGGCATCGAGGTAGCGCTGCAGGGCGTCCTGCTCTTCGTCCGCCAGCCGCGCCGCCCCGGCGgcgc > 1:2358355/1‑104 (MQ=255) cACCCGCCGCCAGCCACCACGCGCCGGTGGTCTGGCCATGGCATCGAGGTAGCGCTGCAGGGCGTCCTGCTCTTCGTCCGCCAGCCGCGCCGCCCCGGCGgcgc < 2:2358355/104‑1 (MQ=255) aCCCGCCGCCAGCCACCACGCGCCGGTGGTCTGGCCATGGCATCGAGGTAGCGCTGCAGGGCGTCCTGCTCTTCGTCCGCCAGCCGCGCCGCCGGGGCGGCGCTTTTCTGCCAAAGCACCTGGGCCTGGTCGTAGGCTGCGCGGTGTGCg > 1:2404410/1‑150 (MQ=255) 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cagccaCCACGCGCCGGTGGTCTGGCCATGGCATCGAGGTAGCGCTGCAGGGCGTCCTGCTCTTCGTCCGCCAGCCGCGCCGCCGGGGCGGCGCTTTTCTGCCAAAGCACCTGGGCCTGGTc < 2:1997152/122‑1 (MQ=255) cagccaCCACGCGCCGGTGGTCTGGCCATGGCATCGAGGTAGCGCTGCAGGGCGTCCTGCTCTTCGTCCGCCAGCCGCGCCGCCGGGGCGGCGCTTTTCTGCCAAAGCACCTGGGCCTGGTCGTAg > 2:1313482/1‑126 (MQ=255) cagccaCCACGCGCCGGTGGTCTGGCCATGGCATCGAGGTAGCGCTGCAGGGCGTCCTGCTCTTCGTCCGCCAGCCGCGCCGCCGGGGCGGCGCTTTTCTGCCAAAGCACCTGGGCCTGGTCGTAg < 1:1313482/126‑1 (MQ=255) agccaCCACGCGCCGGTGGTCTGGCCATGGCATCGAGGTAGCGCTGCAGGGCGTCCTGCTCTTCGTCCGCCAGCCGCGCCGCCGGGGCGGCGCTTTTCTGCCAAAGCACCTGGGCCTGGTCGTAGGCTGCGCGGTGTGCGGGGTCGGCCa < 2:114367/150‑1 (MQ=255) agccaCCACGCGCCGGTGGTCTGGCCATGGCATCGAGGTAGCGCTGCAGGGCGTCCTGCTCTTCGTCCGCCAGCCGCGCCGCCGGGGCGGCGCTTTTCTGCCAAAGCACCTGGGCCTGGTCGTAGGCTGCGCGGTGTGCGGGGTCGGCCa > 2:2224569/1‑150 (MQ=255) accacGCGCCGGGGGTCTGGCCATGGCATCGAGGTAGCGCTGCAGGGCGTCCTGCTCTTCGTCCGCCAGCCGCGCCGCCGGGGCGGCGCTTTTCTGCCAAAGCACCTGGGCCTGGTCGTAGGCTGCGCGGTGTGCGGGGTCGGCCAGCaa > 1:577262/1‑150 (MQ=255) 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ggtCTGGCCATGGCATCGAGGTAGCGCTGCAGGGCGTCCTGCGCTTCGTCCGCCAGCCGCGCCGCCGGGGCGGCGCTTTTCTGCCAAAGCACCTGGGCCTGGTCGTAGGCTGCGCTGTGTGCGGGGTCGGCCAGCAACCAGCGCTTGAAt < 2:2335436/150‑1 (MQ=255) cTGGCCATGGCATCGAGGTAGCGCTGCAGGGCGTCCTGCTCTTCGTCCGCCAGCCGCGCCGCCGGGGCGGCGCTTTTCTGCCAAAGCACCTGGGCCTGGTCGTAGGCTGCGCGGTGTGCGGGGTCGGCCAGCAACCAGCGCTTGAATgcc < 1:2230201/150‑1 (MQ=255) tGGCCATGGCATCGAGGTAGCGCTGCAGGGCGTCCTGCTCTTCGTCCGCCAGCCGCGCCGCCGGGGCGGCGCTTTTCTGCCAAAGCACCTGGGCCTGGTCGTAGGCTGCGCGgt < 2:657631/114‑1 (MQ=255) tGGCCATGGCATCGAGGTAGCGCTGCAGGGCGTCCTGCTCTTCGTCCGCCAGCCGCGCCGCCGGGGCGGCGCTTTTCTGCCAAAGCACCTGGGCCTGGTCGTAGGCTGCGCGgt > 1:657631/1‑114 (MQ=255) ggCCATGGCATCGAGGTAGCGCTGCAGTGCGTCCTGCTCTTCGTCCGCCAGCCGCGCCGCCGGGGCGGCGCTTTTCTGCCAAAGCACCTGGGCCTGGTCGTAGGCTGCGCGGTGTGCGGGGTCGGCCAGCAACCAGCGCTTGAATgccgc < 1:1103034/150‑1 (MQ=255) cATGGCATCGAGGTAGCGCTGCAGGGCGTCCTGCTCTTCGTCCGCCAGCCGCGCCGCCGGGGCGGCGCTTTTCTGCCAAAGCACCTGGGCCTGGTCGTAGGCTGCGCGGTGTGCGGGGTCGGCCAGCAACCAGCGCTTGAATgccatggc > 1:422945/1‑145 (MQ=255) 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(MQ=255) cTGCAGGGCGTCCTGCTCTTCGTCCGCCAGCCGCGCCGCCGGGGCGGCGCTTTTCTGCCAAAGCACCTGGGCCTGGTCGTAGGCTGCGCGGTGTGCGGGGTCGGCCAGCAGCCGGCGCTTGAATGCCGCCCCTTCGGCTTGCCCGGGTTg > 1:1706881/1‑150 (MQ=255) cAGGGCGTCCTGCTCTTCGTCCGCCAGCCGCGCCGCCGGGGCGGCGCTTTTCTGCCAAAGCACCTGGGCCTGGTCGTAGGCTGCGCGGTGTGCGGGGTCGGCCAGCAACCAGCGCTTGAATGCCGCCCCTTCGGCTTGCCCGGGTTGCTc < 2:1945024/150‑1 (MQ=255) aGGGCGTCCTGCTCTTCGTCCGCCAGCCGCGCCGCCGGGGCGGCGCTTTTCTGCCAAAGCACCTGGGCCTGGTCGTAGGCTGCGCGGTGTGCGGGGTCGTCCTGCAACCAGCGCTTGAATGCCGCCCCTTCGGCTTGCCCGGGTTGCTCg < 1:1879137/150‑1 (MQ=255) gggCGTCCTGCTCTTCGTCCGCCAGCCGCGCCGCCGGGGCGGCGCTTTTCTGCCAAAGCACCTGGGCCTGGTCTTAGGCTACGCGGTGTGAGGGGTCGTCCAGCAACCAGCGCTTGAATGCCGCCCCTTCGGCTTGCCCGGGTTGCTCGt > 1:877130/1‑150 (MQ=255) gggCGTCCTGCTCTTCGTCCGCCAGCCGCGCCGCCGGGGCGGCGCTTTTCTGCCAAAGCACCTGGGCCTGGTCGTAGGCTGCGCGGTGTGCGGGGTCGGCCAGCAACCAGCGCTTGAATGCCGCCCCTTCGGCTTGCCCGGGTTGCTCGt > 1:681379/1‑150 (MQ=255) 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gTCCGCCAGCCGCGCCGCCGGGGCGGCGCTTTTCTGCCAAAGCACCTGGGCCTGGTCGTAGGCTGCGCGGTGTGCGGGGTCGGCCAGCAAc > 2:2067120/1‑91 (MQ=255) gTCCGCCAGCCGCGCCGCCGGGGCGGCGCTTTTCTGCCAAAGCACCTGGGCCTGGTCGTAGGCTGCGCGGTGTGCGGGGTCGGCCAGCAAc < 1:2067120/91‑1 (MQ=255) gTCCGCCAGCCGCGCCGCCGGGGCGGCGCTTTTCTGCCAAAGCACCTGGGCCTGGTCGTAGGCTGCGCGGTGTGCGGGGTCGGCCAGCAACCAGCGCTTGAATGCCGCCCCTTCGGCTTGCCCGGGTTGCTCGTTGATCCGGTTGAACCa < 1:38034/150‑1 (MQ=255) tCCGCCAGCCGCGCCGCCGGGGCGGCGCTTTTCTGCCAAAGCACCTGGGCCTGGTCGTAGGCTGCGCGGTGTGCGGGGTCGGCCAGCAACCAGCGCTTGAATGCCGCCCCTTCGGCTTGCCCGGGTTGCTCGTTGATCCGGTTGAACCAt > 2:558783/1‑150 (MQ=255) gCCAGCCGCGCCGCCGGGGCGGCGCTTTTCTGACAAAGCACCTGGGCCTGGTCGTAGGCTGCGCGGTGTGCGGGGTCGGCCAGCAACCAGCGCTTGAATGCCGCCCCTTCGGCTTGCCCGGGTTGCTCGTTGATCCGGTTGAACCATTGc > 2:1075187/1‑150 (MQ=255) gccgcgccgcCGGGGCGGCGCTTTTCTGCCAAAGCACCt > 2:823444/1‑39 (MQ=255) gccgcgccgcCGGGGCGGCGCTTTTCTGCCAAAGCACCt < 1:823444/39‑1 (MQ=255) gccgcgccgcCGGGGCGGCGCTTTTCTGCCAAAGCACCTTGGCCTGGTCGTAGGCTGCGCGGTGTGCGGGGTCGGCCAGCAACCAGCGCTTGAATGCCGCCCCTTCGGCTTGCCCGGGTTGCTCGTTGATCCGGTTGAACCATTGCAggg > 2:2125355/1‑150 (MQ=255) aaagcgccgcCCCGGCGGCGCTTTTCTGCCAAAGCACCTGGGCCTGGTCGTAGGCTGCGCGGTGTGCGGGGTCGGCCAGCAACCAGCGCTTGAATGCCGCCCCTTCGGCTTGCCCGGGTTGCTCGTTGATCCGGTTGACCCATTGCAggg > 2:56342/4‑150 (MQ=255) cgcgccgcCGGGGCGGCGCTTTTCTGCCACAGCCCCTGGGCCTGGTCGTAGGCTGCGCGGTGTGCGGGGTCGGCCAGCAACCAGCGCTTGAATGCCGCCCCTTCGGCTTGCCCGGGTTGCTCGTTGATCCGGTTGAACCATTGCAGGGCa < 1:1542684/150‑1 (MQ=255) cgcgccgcCGGGGCGGCGCTTTTCTGCCAAAGCACCTGGGCCTGGTCGTAGGCTGCGCGGTGTGCGGGGTCGGCCAGCAACCAGCGCTTGAATGCCGCCCCTTCGGCTTGCCCGGGTTGCTCGTTGATCCGGTTGAACCATTGCAGGGCa < 2:1521255/150‑1 (MQ=255) cgcgccgcCGGGGCGGCGCTTTTCTGCCAAAGCACCTGGGCCTGGTCGTAGGCTGCGCGGTGTGCGGGGTCGGCCAGCAACCAGCGCTTGAATGCCGCCCCTTCGGCTTGCCCGGGTTGCTCGTTGATCCGGTTGAACCATTGCAGGGCa < 2:1024690/150‑1 (MQ=255) gcgccgcCCCGGCGGCGCTTTTCTGCCAAAGCACCTGGGCCTGGTCGTAGGCTGCGCGGTGTGCGGGGTCGGCCAGCAACCAGCGCTTGAATGCCGCCCCTTCGGCTTGACCGGGTTGCTCGTTGATCCGGTTGAACCATTGCAGGGCAg > 2:227086/1‑150 (MQ=255) cgccgcCGGGGCGGCGCTTTTCTGCCAAAGCACCTGGGCCTGGTCGTAGGCTGCGCGGTGTGCGGGGTCGGCCAGCAACCAGCGCTTGAATGCCGCCCCTTCGGCTTGCCCGGGTTGCTCGTTGATCCGGTTGAACCATTGCAGGGCAGc < 1:1055471/150‑1 (MQ=255) ccgGGGCGGCGCTTTTCTGCCAAAGCACCTGGGCCTGGTCGTAGGCTGCGCGGTGTGCGGGGTCGGCCAGCAACCAGCGCTTGAATGCCGCCCCTTCGGCTTGCCCGGGt < 2:1021737/110‑1 (MQ=255) ccgGGGCGGCGCTTTTCTGCCAAAGCACCTGGGCCTGGTCGTAGGCTGCGCGGTGTGCGGGGTCGGCCAGCAACCAGCGCTTGAATGCCGCCCCTTCGGCTTGCCCGGGt > 1:1021737/1‑110 (MQ=255) cgGGGCGGCGCTTTTCTGCCAAAGCACCTGGGCCTGGTCGTAGGCTGCGCGGTGTGCGGGGTCGGCCAGCAACCAGCGCTTGAATGCCGCCCCTTCGGCTTGCCCGGGTTGCTCGTTGATCCGGTTGAACCATTGCAGGGCAGCCTGGaa > 1:1686982/1‑150 (MQ=255) | CACCAGCGACGCCCACGGCCAGCACCAGGCAGGCTGCCAACGCCAGGCCTGCCACCCGCCGCCAGCCACCACGCGCCGGTGGTCTGGCCATGGCATCGAGGTAGCGCTGCAGGGCGTCCTGCTCTTCGTCCGCCAGCCGCGCCGCCGGGGCGGCGCTTTTCTGCCAAAGCACCTGGGCCTGGTCGTAGGCTGCGCGGTGTGCGGGGTCGGCCAGCAACCAGCGCTTGAATGCCGCCCCTTCGGCTTGCCCGGGTTGCTCGTTGATCCGGTTGAACCATTGCAGGGCAGCCTGGAA > NC_002947/5229935‑5230229 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |