| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_002947 | 5,331,103 | 0 | G | A | 5.9% | 302.0 / 6.1 | 102 | A169V (GCC→GTC) | PP_4692 | aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (48/48); new base A (3/3); total (51/51) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.06e-01 | |||||||||||
Only 100 of 103 total aligned reads displayed.
CGCTCGGCGCGTCCATGCCATAGGTGAGGCCGTGGTAGATCTCGTCCACCACCAGATGGCCATGCCGCTCGTGGGTGGTTCTGGCCAGGCAGGCCAACGCCTCGCGCCCCAGCACGGTACCGGTCGGGTTGGCCGGCGAAGCGACCAGGGCACCGACGGTGTCCTTGTCCCAGTAGCGCTCAACCAGGTCGGCAGTCAGCTGATAGTTCACATCCGGGCCCACCGGTACCAATTGGGCCCCGCCCTCGACCAGGCGCAGGAAGTGGCGATTGCACGGGTAACCCGGATCGGCC > NC_002947/5330954‑5331246 | cGCTCGGCGCGTCCATGCCATAGGTGAGGCCGTGGTAGATCTCGTCCACCACCAGATGGCCATGCCGCTCGTGGGTGGTTCTGGCCAGGCAGGCCAACGCCTCGCGCCCCAGCACGGTACCGGTCGGGTTGGCCGGCGAAGCGACCAggg < 1:1130652/150‑1 (MQ=255) gCTCGGCGCGTCCATGCCATAGGTGAGGCCGTGGTAGATCTCGTCCACCACCAGATGGCCATGCCGCTCGTGGGTGGTTCTGGCCAGGCAGGCCAACGCCTCTCGCCCCAGCACGGTACCGGTCGGGTTGGCCGGCGAAGCGACCAGGGc > 1:1052806/1‑150 (MQ=255) gcgcGTCCATGCCATAGGTGAGGCCGTGGTAGATCTCGTCGACCACCAGATGGCCATGCCGCTCGTGGGTGGTTCTGGCCAGGCAGGCCAACGCCTCGCGCCCCAGCACGGTACCGGTCGGGTTGGCCGGCGAAGCTACTAGGGCACCGa > 2:1180470/1‑150 (MQ=255) 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cGAAGCGACCAGGGCACCGACGGTGTCCTTGTCCCAGTAGCGCTCAACCAGGTCGGCAGTCAGCTGATAGTTCACATCCGGGCCCACCGGTACCAATTGGGCCCCGCCCTCGACCAGGCGCAGGAAGTGGCGATTGCACGGGTAACCCgg < 1:597632/150‑1 (MQ=255) gAAGCGACCAGGGCACCGACGGTGTCCTTGTCCCAGTAGCGCTCAACCAGGTCGGCAGTCAGCTGATAGTTCACATCCggg < 2:389173/81‑1 (MQ=255) gAAGCGACCAGGGCACCGACGGTGTCCTTGTCCCAGTAGCGCTCAACCAGGTCGGCAGTCAGCTGATAGTTCACATCCggg > 1:389173/1‑81 (MQ=255) gAAGCGACCAGGGCACCGACGGTGTCCTTGTCCCAGTAGCGCTCAACCAGGTCGGCAGTCAGCTGATAGTTCACATCCGGGCCCACCGGTACCAATTGGGCCCCGCCCTCGACCAGGCGCAGGTAGTGGCGATTGCACGGGTAACCCGGa > 1:2341617/1‑150 (MQ=255) gAAGCGACCAGGGCACCGACGGTGTCCTTGTCCCAGTAGCGCTCAACCAGGTCGGCAGTCAGCTGATAGTTCACATCCGGGCCCACCGGTACCAATTGGGCCCCGCCCTCGACCAGGCGCAGGAAGTGGCGATTGCACGGGTAACCCGGa < 1:561325/150‑1 (MQ=255) aaGCGACCAGGGCACCGACGGTGTCCTTGTCCCAGTAGCGCTCAACCAGGTCGGCAGTCAGCTGATAGTTCACATCCGGGCCCACCGGTACCAATTGGGCCCCGCCCTCGACCAGGCGCAGGAAGTGGCGATTGCACGGGTAACCCGGAt < 1:2172381/150‑1 (MQ=255) aGCGACCAGGGCACCGACGGTGTCCTTGTCCCAGTAGCGCTCAACCAGGTCGGCAGTCAGCTGATAGTTCACATCCGGGCCCACCGGTACCAATTGGGCCCCGCCCTCGACCAGGCGCAGGAAGTGGCGATTGCACGGGTAACCCGGATc < 2:1052806/150‑1 (MQ=255) gCGACCAGGGCACCGACGGTGTCCTTGTCCCAGTAGCGCTCAACCAGGTCGGCAGTCAGCTGATAGTTCACATCCGGGCCCACCGGTACCAATTGGGCCCCGCCCTCGACCAGGCGCAGGAAGTGGCGATTGCACGGGTAACCCGGATCg < 1:1180470/150‑1 (MQ=255) gACCAGTGCACCGACGGTGTCCTTGTCCCAGTAGCGCTCAACCAGGTCGGCAGTCAGCTGATAGTTCACATCCGGGCCCACCGGTACCAATTGGGCCCCGCCCTCGACCAGGCGCAGGAAGTGGCGATTGCACGGGTAACCCGGATCGGc < 1:1103051/150‑1 (MQ=255) gACCAGGGCACCGACGGTGTCCTTGTCCCAGTAGCGCTCAACCAGGTCGGCAGTCAGCTGATAGTTCACATCCGGGCCCACCGGTACCAATTGGGCCCCGCCCTCGACCAGGCGCAGGAAGTGGCGATTGCACGGGTAACCCGGATCGGc < 2:367760/150‑1 (MQ=255) gACCAGGGCACCGACGGTGTCCTTGTCCCAGTAGCGCTCAACCAGGTCGGCAGTCAGCTGATAGTTCACATCCGGGCCCACCGGTACCAATTGGGCCCCGCCCTCGACCAGGCGCAGGAAGTGGCGATTGCACGGGTAACCCGGATCGGc < 2:1361096/150‑1 (MQ=255) aCCAGGGCACCGACGGTGTCCTTGTCCCAGTAGCGCTCAACCAGGTCGGCAGTCAGCTGATAGTTCACATCCGGGCCCACCGGTACCAATTGGGCCCCGCCCTCGACCAGGCGCAGGAAGTGGCGATTGCACGGGTAACCCGGATCGGcc > 2:2086860/1‑150 (MQ=255) | CGCTCGGCGCGTCCATGCCATAGGTGAGGCCGTGGTAGATCTCGTCCACCACCAGATGGCCATGCCGCTCGTGGGTGGTTCTGGCCAGGCAGGCCAACGCCTCGCGCCCCAGCACGGTACCGGTCGGGTTGGCCGGCGAAGCGACCAGGGCACCGACGGTGTCCTTGTCCCAGTAGCGCTCAACCAGGTCGGCAGTCAGCTGATAGTTCACATCCGGGCCCACCGGTACCAATTGGGCCCCGCCCTCGACCAGGCGCAGGAAGTGGCGATTGCACGGGTAACCCGGATCGGCC > NC_002947/5330954‑5331246 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |